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当前共找到 41240 篇文献，本页显示第 141 - 160 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 141 | 2026-07-04 |
Artificial Intelligence in single-cell and spatial transcriptomics data analyses
2026, Progress in molecular biology and translational science
DOI:10.1016/bs.pmbts.2026.01.011
PMID:41986013
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综述 | 探讨人工智能在单细胞和空间转录组学数据分析中的应用 | 系统综述了AI方法（如CNN、GNN和VAE）在预处理、降维、细胞分类、整合多组学及推断细胞轨迹中的应用，并聚焦于癌症生物学、免疫学和神经科学领域 | 存在可扩展性、可解释性和数据标准一致性不足的挑战 | 提供AI推动单细胞和空间转录组学数据解析的全面指南 | 单细胞和空间转录组学数据集及AI分析方法 | 机器学习 | 癌症、免疫疾病、神经疾病 | 单细胞转录组测序、空间转录组测序 | 卷积神经网络、图神经网络、变分自编码器 | 基因表达数据、空间转录数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq、空间转录组学 | NA | NA |
| 142 | 2026-07-04 |
AI-driven gene-sets, networks, pathways, and interactions analyses of multi-omics data
2026, Progress in molecular biology and translational science
DOI:10.1016/bs.pmbts.2026.01.023
PMID:41986006
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研究论文 | 介绍了PAGER 3.0知识生态系统，用于分析多组学数据中的基因集、网络、通路和相互作用 | PAGER 3.0在PAGER知识生态系统中实现了重大进步，提供扩展且精心策划的通路、注释基因列表和基因签名(PAGs)集合、本体感知的知识导航、加权富集分析和结构化基于网络的优先级排序工具 | NA | 介绍PAGER 3.0的概念基础、架构和分析工作流程，并通过白血病单细胞转录组学案例研究证明其实用性 | 多组学数据中的基因集、通路、网络和相互作用 | 生物信息学 | 白血病 | 单细胞转录组学 | NA | 组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 143 | 2026-07-04 |
Identification of sepsis pyroptosis-related genes based on single-cell sequencing technology and experimental verification
2025-12-05, BMC immunology
IF:2.9Q3
DOI:10.1186/s12865-025-00785-6
PMID:41350624
|
研究论文 | 基于单细胞测序技术鉴定脓毒症焦亡相关基因并进行实验验证 | 结合单细胞测序技术与多种机器学习方法（随机森林、SVM、Lasso回归）联合识别核心基因，并通过孟德尔随机化分析探讨基因表达与疾病风险的因果关系 | 未提及研究的具体局限性 | 筛选脓毒症的新型生物标志物 | 脓毒症患者和健康志愿者的外周血样本 | 机器学习 | 脓毒症 | RNA-seq, 单细胞测序 | 随机森林, SVM, Lasso回归 | 基因表达数据 | 23名脓毒症患者和10名健康志愿者 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 144 | 2026-07-04 |
Single-cell RNA sequencing reveals immune cell dysfunction and rewired interaction networks in the peripheral blood of active tuberculosis patients
2025-11-28, BMC immunology
IF:2.9Q3
DOI:10.1186/s12865-025-00780-x
PMID:41315935
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析活动性肺结核患者外周血中免疫细胞功能障碍和网络交互重编程 | 首次利用单细胞RNA测序全面解析活动性肺结核患者外周血免疫细胞功能障碍和配体-受体交互网络的重编程，揭示RNA代谢失调和TGF-β介导的免疫抑制为关键机制 | 依赖于外周血样本，样本量小，缺乏蛋白质水平的验证 | 探索活动性肺结核的免疫机制，为结核病免疫病理学研究和治疗开发提供见解 | 活动性肺结核患者和健康对照者的外周血单核细胞 | 机器学习 | 结核病 | 单细胞RNA测序 | 细胞通信分析（CellChat） | 单细胞转录组数据 | 3名活动性肺结核患者和2名健康对照者的外周血单核细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 145 | 2026-07-04 |
Cleanet: Robust Doublet Detection in Cytometry Data Based on Protein Expression Patterns
2025-11, Cytometry. Part A : the journal of the International Society for Analytical Cytology
DOI:10.1002/cyto.a.24961
PMID:41065042
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研究论文 | 提出Cleanet方法，基于蛋白表达模式自动检测流式和质谱流式细胞术数据中的双细胞事件，并验证其有效性 | 首次将单细胞转录组学中的双细胞检测方法应用于细胞术领域，并利用模拟双细胞事件基于蛋白表达模式进行识别，可自动检测同型和异型双细胞，还能根据组成细胞类型对双细胞进行分类，挖掘细胞间相互作用信息 | 文中未明确提及，但可能包括对双细胞模拟的准确性依赖、在复杂样本中的泛化能力等（根据上下文推测） | 自动化细胞术数据中的双细胞检测与分类，提高大规模研究的数据分析效率并准确表征免疫细胞群体和细胞间相互作用 | 流式细胞术和质谱流式细胞术数据中的单细胞与双细胞事件 | 计算生物学，数字病理学 | NA | 流式细胞术，质谱流式细胞术 | Cleanet（基于模拟双细胞事件和蛋白表达相似性识别的方法） | 蛋白表达数据 | 验证使用质谱和流式细胞术获取的数据集，并利用ImageStream和Discover A8仪器的成像流式细胞术数据验证，具体样本规模未提及 | NA | 流式细胞术，质谱流式细胞术，成像流式细胞术 | ImageStream，Discover A8 | ImageStream成像流式细胞仪，Discover A8仪器 |
| 146 | 2026-07-04 |
Single-cell transcriptomics of cervical lymph node tuberculosis reveals cellular heterogeneity and enhanced cellular communication
2025-10-21, BMC immunology
IF:2.9Q3
DOI:10.1186/s12865-025-00763-y
PMID:41120826
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研究论文 | 利用单细胞转录组学分析宫颈淋巴结结核，揭示免疫细胞异质性和增强的细胞间通讯 | 首次对活动性结核感染淋巴结进行配对单细胞RNA测序，揭示细胞类型特异性转录重编程和细胞间相互作用网络 | 样本量较小（5例患者），缺乏功能验证实验，未探讨治疗干预效果 | 解析结核分枝杆菌感染宫颈淋巴结的局部免疫微环境及细胞间通讯机制 | 5例宫颈淋巴结结核患者的结核阳性肿大淋巴结和邻近正常淋巴结 | 单细胞转录组学 | 结核病 | 单细胞RNA测序 | CellChat | 基因表达数据 | 5例患者的配对淋巴结样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 147 | 2026-07-04 |
Current concepts in the pathogenesis and clinical management of lymphangioleiomyomatosis
2025-09-01, Current opinion in pulmonary medicine
IF:2.8Q2
DOI:10.1097/MCP.0000000000001185
PMID:40501369
|
综述 | 综述了淋巴管平滑肌瘤病在发病机制和临床管理方面的最新进展，包括激素通路、免疫系统相互作用、mTOR信号抑制和肿瘤微环境等 | 整合了单细胞RNA测序、空间转录组学和人工智能等新技术在该罕见病诊断和治疗开发中的应用潜力 | 未明确讨论当前研究的局限性，可能受限于罕见病的样本量小和研究数据有限 | 总结淋巴管平滑肌瘤病的发病机制和治疗管理的最新研究进展，为未来诊断和治疗策略提供方向 | 淋巴管平滑肌瘤病（LAM）及其相关细胞和分子机制 | 机器学习 | 淋巴管平滑肌瘤病 | 单细胞RNA测序， 空间转录组学， 人工智能 | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 148 | 2026-07-04 |
Taming renal inflammation: signaling pathways and therapeutic advances in lupus nephritis
2025-09-01, BMC nephrology
IF:2.2Q2
DOI:10.1186/s12882-025-04434-3
PMID:40890617
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综述 | 本文综述了狼疮性肾炎的免疫发病机制、信号通路及治疗进展，强调了单细胞转录组学和多组学平台在个性化治疗中的应用 | 整合新兴的单细胞转录组学与多组学平台，重点介绍CD19靶向CAR-T细胞疗法在狼疮性肾炎中诱导无药缓解的突破性进展 | 未提供定量数据或荟萃分析结果，主要基于已有研究的定性总结 | 总结狼疮性肾炎的免疫病理机制及新兴治疗策略，推动精准医学应用 | 狼疮性肾炎患者的肾脏组织及免疫细胞 | 生物信息学, 数字病理学 | 狼疮性肾炎 | 单细胞转录组学, 多组学分析 | NA | 转录组数据, 信号通路数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 多组学 | NA | NA |
| 149 | 2026-07-04 |
Immune checkpoint inhibitor-associated pneumonitis: focus on diagnosis and underlying mechanisms
2025-07-01, Current opinion in pulmonary medicine
IF:2.8Q2
DOI:10.1097/MCP.0000000000001175
PMID:40265506
|
综述 | 本文综述了免疫检查点抑制剂相关性肺炎的诊断、危险因素和治疗策略，特别强调了其潜在的病理生理机制 | 重点介绍了支气管肺泡灌洗液单细胞RNA测序和自身抗体等生物标志物的最新进展，揭示了细胞介导和体液机制在ICI相关性肺炎病理生理中的共同作用 | 信息未明确提供 | 提供免疫检查点抑制剂相关性肺炎诊断、风险因素和治疗策略的最新概述，特别关注其病理生理学 | 免疫检查点抑制剂相关性肺炎患者 | 医学 | 肺炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 支气管肺泡灌洗液单细胞RNA测序 |
| 150 | 2026-07-04 |
Identifying condition-related cell-cell communication events using supervised tensor analysis
2025-Jun-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.12.15.571918
PMID:38168391
|
研究论文 | 提出一种基于监督张量分析的细胞间通讯事件识别方法STACCato | 首次采用张量回归模型识别与生物学条件相关的细胞间通讯事件，同时调整混杂因素并考虑事件间的依赖性 | 未提及具体局限性 | 开发能够清晰解释细胞间通讯事件与生物学条件关系并调整混杂因素的分析工具 | 单细胞RNA测序数据中的细胞间通讯事件 | 机器学习 | 自身免疫疾病, 神经发育疾病 | 单细胞RNA测序 | 张量回归模型 | 单细胞基因表达数据 | 系统性红斑狼疮和自闭症的单细胞RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 151 | 2026-07-04 |
Endothelial Cell Phenotypic Plasticity in Cardiovascular Physiology and Disease: Mechanisms and Therapeutic Prospects
2025-06-16, American journal of hypertension
IF:3.2Q2
DOI:10.1093/ajh/hpaf027
PMID:39989120
|
综述 | 本文综述了内皮细胞在心血管生理和疾病中的表型可塑性，包括内皮-间质转化等过程的机制及治疗前景 | 系统阐述了内皮细胞多种表型转变（EndMT、EndHT、EndOT、EndICLT）及其在心血管疾病中的作用，并总结了基于单细胞RNA测序技术的新见解和潜在治疗策略 | 未涉及具体临床验证数据，部分机制和治疗的临床转化仍需进一步研究 | 探讨内皮细胞表型可塑性在心血管生理和疾病中的机制及治疗潜力 | 内皮细胞及其表型转变过程 | 机器学习 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 文本 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 单细胞RNA测序技术用于分析内皮细胞异质性 |
| 152 | 2026-07-04 |
Quantitative molecular cartography of emergency myelopoiesis reveals conserved modules of hematopoietic activation
2025-May-29, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.28.656712
PMID:40501607
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序对紧急髓系造血进行定量分子图谱分析，揭示造血激活的保守模块 | 开发了通用化细胞注释方法HemaScribe和精炼的造血分化定量模型HemaScape，并揭示多种紧急髓系造血诱导策略及共享与独特的转录响应模块 | NA | 阐明不同紧急髓系造血诱导物如何通过共享或独特的分子机制调控造血干细胞和祖细胞 | 造血干细胞和祖细胞（HSPC） | 数字病理学 | 急性髓系白血病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 多项紧急髓系造血模式样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 153 | 2026-07-04 |
Tumor-colonizing Pseudoalteromonas elyakovii metabolically reprograms the tumor microenvironment and promotes breast ductal carcinoma
2025-05-14, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mbio.03873-24
PMID:40192290
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研究论文 | 研究肿瘤定殖的Pseudoalteromonas elyakovii通过代谢重编程肿瘤微环境促进乳腺导管癌的机制 | 首次在物种水平上揭示乳腺导管癌内微生物动态变化，并结合双免疫荧光、SweAMI探针杂交和单细胞RNA测序深入分析瘤内微生物与肿瘤免疫的关系 | 研究样本量为102例，相对较小，且仅关注乳腺导管癌，可能限制结论的普适性 | 探究瘤内微生物群在乳腺癌发展和进展中的作用及其潜在的临床应用价值 | 乳腺导管癌患者的肿瘤组织及癌旁正常组织中的微生物组成和肿瘤免疫微环境 | 数字病理学 | 乳腺癌 | qRT-PCR, 双免疫荧光染色, SweAMI探针杂交, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据, 微生物组数据, 免疫荧光图像 | 102份乳腺导管癌患者样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序平台 |
| 154 | 2026-07-04 |
Single-cell sequencing in diabetic retinopathy: progress and prospects
2025-Jan-13, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-024-06066-x
PMID:39806376
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综述 | 综述单细胞测序在糖尿病视网膜病变研究中的进展与前景 | 全面总结了单细胞测序及其多组学、空间转录组技术解析视网膜异质性及病理机制的最新应用 | 未提供具体实验数据及定量比较分析，主要集中在技术潜力的讨论上 | 探讨单细胞测序技术如何促进对糖尿病视网膜病变发病机制的理解及新治疗策略的开发 | 糖尿病视网膜病变的视网膜细胞、视网膜类器官及单细胞外囊泡 | 数字病理学， 单细胞组学 | 糖尿病视网膜病变 | 单细胞RNA测序， 单细胞多组学测序， 立体测序 | NA | 转录组数据， 多组学数据， 空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq， 单细胞多组学， 空间转录组学 | NA | NA |
| 155 | 2026-07-04 |
Efficient Predictor for Immunotherapy Efficacy: Detecting Pan-Clones Effector Tumor Antigen-Specific T Cells in Blood by Nanoparticles Loading Whole Tumor Antigens
2025-01, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202409913
PMID:39498880
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研究论文 | 利用负载全肿瘤抗原的纳米颗粒检测血液中泛克隆效应肿瘤抗原特异性T细胞，以预测免疫治疗效果 | 提出一种基于纳米颗粒负载全细胞肿瘤抗原的方法，可高效激活并检测泛克隆效应肿瘤抗原特异性T细胞，将ETASTs与其他T细胞的差异转化为激活与非激活状态，并通过测量激活状态和细胞毒性功能标志物进行区分 | NA | 开发一种高效、非侵入性的生物标志物，用于预测肺癌及其他癌症的免疫治疗效果 | 肺癌患者、健康个体及良性肺结节患者血液中的效应肿瘤抗原特异性T细胞 | 机器学习 | 肺癌 | 纳米颗粒负载全肿瘤抗原、单细胞测序 | NA | 生物标志物数据 | 肺癌患者、健康个体及良性肺结节患者样本 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 156 | 2026-07-04 |
Deficiency of FABP7 Triggers Premature Neural Differentiation in Idiopathic Normocephalic Autism Organoids
2025-01, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202406849
PMID:39556706
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研究论文 | 通过正常头围自闭症患者类器官模型，发现FABP7缺乏引发神经干细胞过早分化，并揭示FABP7/MEK通路在自闭症发病中的作用 | 首次在正常头围自闭症患者的脑类器官模型中鉴定出FABP7表达下调及其通过MEK通路调控神经干细胞过早分化的分子机制 | 主要基于体外类器官模型和动物实验，需要进一步在人体组织中验证FABP7/MEK通路的临床相关性 | 探究正常头围自闭症患者神经干细胞异常分化的分子机制 | 来自前瞻性出生队列的正常头围自闭症患者诱导多能干细胞来源的脑类器官 | 数字病理学 | 自闭症谱系障碍 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据、组织形态学数据 | 多个细胞系和时间序列样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'试剂盒进行scRNA-seq |
| 157 | 2026-07-04 |
Spatial differences in gene expression across the dorsal raphe nucleus in a model of early Alzheimer's disease
2025-01, Journal of Alzheimer's disease : JAD
DOI:10.1177/13872877241299119
PMID:39584353
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研究论文 | 利用空间基因表达技术研究早期阿尔茨海默病模型中背侧缝核的基因表达差异 | 首次在早期阿尔茨海默病的小鼠模型中应用空间转录组学技术，发现背侧缝核内不同亚区域对tau蛋白病理性损害的差异性易感，并鉴定了相关长链非编码RNA Map2k3os的可能调控作用 | 需要进一步研究Map2k3os的相互作用机制，并强调汇聚数据验证以克服空间转录组学技术的局限性 | 识别5-羟色胺神经元对阿尔茨海默病病理性损害的易感或抵抗的潜在遗传因素 | 过表达人tau蛋白的htau小鼠的背侧缝核 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 空间转录组学、RNAscope、免疫组化 | NA | 基因表达数据、图像 | htau小鼠（早期阿尔茨海默病临床前模型）的背侧缝核组织样本 | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | Visium空间基因表达平台 |
| 158 | 2026-07-04 |
Dysregulated Treg repair responses lead to chronic rejection after heart transplantation
2024-12-02, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI173593
PMID:39621314
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序和转基因小鼠模型，揭示心脏移植后IL-33+成纤维细胞与受体Treg之间的失调修复反应导致慢性排斥的机制 | 首次发现Treg分泌的双调蛋白（Areg）在慢性排斥反应中促进成纤维细胞增殖和纤维化，颠覆了传统认为Treg修复功能有益的观点 | 主要基于MHC-II不匹配小鼠模型，人类样本验证规模有限，且未涉及其他免疫抑制方案的影响 | 阐明心脏移植后慢性排斥反应中IL-33/Areg通路介导的失调修复机制 | MHC-II不匹配心脏移植小鼠模型、临床心脏移植患者样本 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | MHC-II不匹配小鼠心脏移植模型（IL-33缺陷供体/Treg特异性Areg缺陷受体）及临床心脏移植患者样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 159 | 2026-07-04 |
Early concentrate starter introduction induces rumen epithelial parakeratosis by blocking keratinocyte differentiation with excessive ruminal butyrate accumulation
2024-12, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2023.12.016
PMID:38128723
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研究论文 | 研究了早期引入高浓度精料导致羔羊瘤胃上皮角化不全的机制，发现瘤胃丁酸过度积累通过阻断角质形成细胞分化引发该病 | 首次通过单细胞RNA测序揭示早期断奶羔羊瘤胃上皮从分化角质细胞到终末分化角质细胞的转变受阻，并利用瘤胃类器官模型验证高剂量丁酸直接导致角化不全 | 未提及具体限制，但模型仅针对新生羔羊且局限于短期观察 | 阐明瘤胃上皮角化过程及其影响因素，特别是早期营养干预策略对瘤胃健康的影响 | 新生羔羊瘤胃上皮组织及类器官 | 机器学习和单细胞组学 | 反刍动物消化系统疾病 | 单细胞RNA测序, 免疫荧光, 实时定量PCR, 代谢组学分析 | NA | 单细胞转录组数据, 代谢组数据, 组织切片图像 | 24只14日龄羔羊，分为三组（母乳、母乳+苜蓿干草、母乳+玉米大豆精料启动） | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' 试剂盒 |
| 160 | 2026-07-04 |
Insulin-like growth factor 2 drives fibroblast-mediated tumor immunoevasion and confers resistance to immunotherapy
2024-11-15, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI183366
PMID:39545420
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研究论文 | 揭示胰岛素样生长因子2驱动成纤维细胞介导的肿瘤免疫逃逸并导致免疫治疗耐药性 | 首次揭示IGF2在免疫排斥肿瘤中主要由癌症相关成纤维细胞分泌，并通过CXCL12和PD-L1促进CAF与T细胞相互作用，证明IGF2缺陷可增强CD8+ T细胞浸润和细胞毒性 | 未明确说明 | 研究胰岛素样生长因子2在肿瘤免疫排斥和免疫治疗耐药中的作用机制 | 免疫排斥肿瘤中癌症相关成纤维细胞和T细胞 | 机器学习 | 泛癌种 | 空间转录组学、单细胞RNA测序 | 不适用 | 空间和单细胞转录组数据 | 使用系统性或成纤维细胞特异性IGF2敲除小鼠模型 | 10x Genomics | 空间转录组学、单细胞RNA测序 | 10x Visium、10x Chromium | 10x Visium用于空间转录组学，10x Chromium用于单细胞RNA测序 |