单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 28126 篇文献，本页显示第 141 - 160 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 141 | 2025-05-24 |
Identification of common hub genes and construction of immune regulatory networks in aplastic anemia, myelodysplastic syndromes, and acute myeloid leukemia
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1547289
PMID:40406144
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研究论文 | 本研究旨在识别再生障碍性贫血(AA)、骨髓增生异常综合征(MDS)和急性髓系白血病(AML)的共同枢纽基因，并构建免疫调控网络 | 首次发现POLG和MAP2K7作为AA、MDS和AML的共同枢纽基因，并揭示了它们通过MIF介导的细胞通讯调控20多条免疫调控通路的作用机制 | 枢纽基因对细胞增殖和迁移的影响不显著，体外验证结果有限 | 探索AA、MDS和AML的共同发病机制，为预防疾病进展提供理论基础 | 再生障碍性贫血(AA)、骨髓增生异常综合征(MDS)和急性髓系白血病(AML)患者样本 | 生物信息学 | 血液系统疾病 | 基因表达差异分析、基因集富集分析、加权基因共表达网络分析、免疫浸润分析、单细胞测序、细胞通讯分析、孟德尔随机化、RT-qPCR、ELISA、细胞增殖实验 | NA | 基因表达数据 | 来自GEO数据库的相关数据集（具体数量未说明） |
| 142 | 2025-05-24 |
Single-cell RNA sequencing reveals adrb1 as a sympathetic nerve-regulated immune checkpoint driving T cell exhaustion and impacting immunotherapy in esophageal squamous cell carcinoma
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1520766
PMID:40406147
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示ADRB1作为交感神经调节的免疫检查点，驱动T细胞耗竭并影响食管鳞状细胞癌的免疫治疗 | 首次发现ADRB1在T细胞中的表达与免疫治疗后的预后相关，并提出了ADRB1作为潜在的预后生物标志物和治疗靶点 | 研究主要基于单细胞RNA测序和TCGA数据分析，需要进一步的实验验证和临床研究 | 探索肾上腺素受体信号在食管鳞状细胞癌中的作用，特别是对T细胞耗竭和免疫治疗的影响 | 食管鳞状细胞癌（ESCC）患者样本中的T细胞和其他免疫细胞 | 数字病理 | 食管鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、荧光激活细胞分选（FACS）、拷贝数变异（CNV）分析 | NA | RNA测序数据、免疫荧光数据 | 未明确提及具体样本数量，但使用了TCGA数据和患者样本 |
| 143 | 2025-05-24 |
Single-Cell RNA-Seq Recognized Key Genes for Metastasis and Macrophage Infiltration in Colorectal Cancer
2025, Human mutation
IF:3.3Q2
DOI:10.1155/humu/9488531
PMID:40406545
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术识别结直肠癌转移和巨噬细胞浸润的关键基因 | 利用单细胞RNA测序数据识别了结直肠癌转移和巨噬细胞浸润的关键基因ZFAND2A，并验证了其在癌细胞活动和巨噬细胞极化中的功能 | 研究主要基于体外实验，需要进一步的体内实验验证 | 探索结直肠癌转移和免疫细胞浸润的分子机制 | 结直肠癌组织和巨噬细胞 | 数字病理 | 结直肠癌 | scRNA-seq, qRT-PCR, WB分析, CCK-8, transwell实验, ELISA, 流式细胞术 | lasso回归 | 基因表达数据 | GSE261012和GSE234804数据集中的样本，具体数量未明确说明 |
| 144 | 2025-05-24 |
Erratum: Integrated Analysis of Single-Cell RNA-Seq and Bulk RNA-Seq Combined with Multiple Machine Learning Identified a Novel Immune Signature in Diabetic Nephropathy [Corrigendum]
2025, Diabetes, metabolic syndrome and obesity : targets and therapy
DOI:10.2147/DMSO.S540734
PMID:40406633
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correction | 该文章是对先前发表的一篇关于糖尿病肾病免疫特征的论文的更正 | NA | NA | NA | NA | NA | diabetic nephropathy | NA | NA | NA | NA |
| 145 | 2025-05-24 |
CD9 expression rivals IDH mutation as a prognostic marker in glioma: a novel nomogram approach
2025, Frontiers in neurology
IF:2.7Q3
DOI:10.3389/fneur.2025.1507443
PMID:40406701
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research paper | 本研究评估了四跨膜蛋白CD9在胶质瘤中的预后意义和功能机制，以确立其临床相关性并确定治疗策略 | 开发了一个基于CD9的列线图，显示出高预后准确性，并通过单细胞RNA测序揭示了CD9驱动的NPC-to-OPC转分化 | 研究依赖于TCGA和CGGA队列的数据，可能受到样本选择和批次效应的影响 | 评估CD9在胶质瘤中的预后意义和功能机制，以确立其临床相关性并确定治疗策略 | 1,033个胶质瘤样本 | digital pathology | glioma | multi-omics analyses, single-cell RNA sequencing, Mendelian randomization, KEGG enrichment analysis, PPI networks | nomogram, Cox regression | genomic data, RNA-seq data | 1,033 glioma samples from TCGA and CGGA cohorts, 20 glioblastoma cases for single-cell RNA sequencing |
| 146 | 2025-05-24 |
Microglial polarization pathways and therapeutic drugs targeting activated microglia in traumatic brain injury
2024-Dec-07, Neural regeneration research
IF:5.9Q1
DOI:10.4103/NRR.NRR-D-24-00810
PMID:39665832
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综述 | 本文综述了创伤性脑损伤中微胶质细胞的极化途径及靶向活化微胶质细胞的治疗药物 | 阐明了促炎和抗炎微胶质细胞涉及的信号通路，并综述了基于这些通路的药物和细胞替代治疗策略 | 药物和间充质干细胞治疗策略的应用仍面临许多挑战 | 探讨创伤性脑损伤中微胶质细胞的极化途径及治疗策略 | 微胶质细胞及其在创伤性脑损伤中的作用 | 神经科学 | 创伤性脑损伤 | 单细胞RNA测序、转录组分析 | NA | NA | NA |
| 147 | 2025-05-24 |
A cross-disease resource of living human microglia identifies disease-enriched subsets and tool compounds recapitulating microglial states
2024-Dec, Nature neuroscience
IF:21.2Q1
DOI:10.1038/s41593-024-01764-7
PMID:39406950
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研究论文 | 该研究通过单细胞RNA测序分析了来自74名捐赠者的215,680个活体人类小胶质细胞，揭示了小胶质细胞的异质性及其在不同神经系统疾病中的作用 | 首次大规模跨疾病分析人类小胶质细胞异质性，发现与神经退行性疾病相关的特定亚群，并验证了能够模拟这些亚群状态的化合物 | 研究主要基于转录组数据，可能未能完全捕捉小胶质细胞的功能状态 | 揭示人类小胶质细胞的异质性及其在神经系统疾病中的作用，为靶向治疗开发提供依据 | 人类小胶质细胞 | 神经科学 | 神经退行性疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq), RNAscope免疫荧光, MERFISH | NA | 单细胞转录组数据 | 215,680个活体人类小胶质细胞，来自74名捐赠者 |
| 148 | 2025-05-24 |
SPI1+CD68+ macrophages as a biomarker for gastric cancer metastasis: a rationale for combined antiangiogenic and immunotherapy strategies
2024-Oct-24, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2024-009983
PMID:39455096
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研究论文 | 本研究探讨了SPI1+CD68+肿瘤相关巨噬细胞在胃癌转移中的作用及其作为生物标志物的潜力 | 首次揭示了SPI1+CD68+巨噬细胞亚群在胃癌中的特异性作用机制及其与抗血管生成和免疫治疗联合策略的相关性 | 研究主要基于实验室模型和小鼠腹膜转移模型，临床样本验证仍需进一步扩大 | 评估SPI1+CD68+肿瘤相关巨噬细胞在胃癌中的作用及其临床意义 | 胃癌组织和相关巨噬细胞 | 肿瘤免疫学 | 胃癌 | 免疫组化、免疫荧光、流式细胞术、单细胞转录组分析、染色质免疫沉淀 | 小鼠腹膜转移模型 | 基因表达数据、蛋白质表达数据 | 未明确说明具体样本数量，包含体外实验、动物模型和临床组织样本 |
| 149 | 2025-05-24 |
scAI-SNP: a method for inferring ancestry from single-cell data
2024-May-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.05.14.594208
PMID:38798590
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research paper | 介绍了一种名为scAI-SNP的工具，用于直接从单细胞基因组数据推断供体的祖先信息 | 开发了一种新工具scAI-SNP，能够直接从单细胞数据中推断祖先信息，解决了自我报告种族和民族信息的偏差和缺失问题 | 未提及具体局限性 | 确保单细胞图谱能代表人类遗传多样性，通过推断供体祖先信息 | 单细胞基因组数据 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | 单细胞基因组数据 | 1000 Genomes Project数据集中的3201个个体，来自26个人群群体 |
| 150 | 2025-05-24 |
A phase 2 randomized trial with autologous polyclonal expanded regulatory T cells in children with new-onset type 1 diabetes
2024-05-08, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.adn2404
PMID:38718135
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研究论文 | 该研究探讨了自体多克隆扩增调节性T细胞（expT）在新发1型糖尿病儿童中的安全性和有效性 | 首次在儿童和青少年中进行自体多克隆扩增调节性T细胞的随机二期临床试验，并评估其安全性和对β细胞功能的影响 | 单次剂量的expT未能显著阻止β细胞功能的下降，且治疗效果与T细胞的质量相关 | 评估自体多克隆扩增调节性T细胞在1型糖尿病治疗中的安全性和有效性 | 新发1型糖尿病的儿童和青少年 | 临床医学 | 1型糖尿病 | 流式细胞术、批量RNA测序、单细胞RNA测序 | NA | 临床数据、RNA测序数据 | 110名儿童和青少年患者 |
| 151 | 2025-05-24 |
Library-based single-cell analysis of CAR signaling reveals drivers of in vivo persistence
2024-May-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.04.29.591541
PMID:38746119
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research paper | 该研究通过单细胞测序技术，探索了不同细胞内信号域（ICD）结构如何影响CAR-T细胞的功能，特别是在分子水平上 | 首次系统性地研究了不同ICD结构如何通过信号传导影响CAR-T细胞的转录输出和功能，并发现了一种与持久性相关的独特信号特征 | 研究发现这种持久性信号特征仅适用于液体肿瘤，对实体瘤无效 | 解码CAR信号传导的设计原则，为下一代优化ICD结构的合理设计提供依据 | 表达嵌合抗原受体（CARs）的工程化T细胞 | 免疫治疗 | 肿瘤 | 单细胞测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA |
| 152 | 2025-05-24 |
Targeting of epigenetic co-dependencies enhances anti-AML efficacy of Menin inhibitor in AML with MLL1-r or mutant NPM1
2023-04-13, Blood cancer journal
IF:12.9Q1
DOI:10.1038/s41408-023-00826-6
PMID:37055414
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研究论文 | 本研究探讨了Menin抑制剂（MI）在携带MLL1-r或mtNPM1的AML患者中的抗白血病效果，并通过联合靶向表观遗传共依赖性增强其疗效 | 发现MI与BET、MOZ、LSD1或CBP/p300抑制剂联合使用可协同降低AML细胞的存活率，并在体内模型中显示出显著优越的疗效 | 研究主要基于临床前模型，尚未在临床试验中验证其效果 | 增强Menin抑制剂在AML治疗中的疗效，防止AML干细胞/祖细胞逃逸 | 携带MLL1-r或mtNPM1的AML细胞 | 肿瘤学 | 急性髓系白血病（AML） | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq）、染色质免疫沉淀测序（ChiP-Seq）、ATAC-Seq、RNA测序（RNA-Seq）、反向蛋白质阵列（RPPA）、质谱流式细胞术（CyTOF） | CRISPR-Cas9筛选 | 基因组数据、转录组数据、蛋白质数据 | 临床前研究中的AML细胞系和异种移植模型 |
| 153 | 2025-05-24 |
Cellular and Molecular Atlas of Peripheral Blood Mononuclear Cells from a Pregnant Woman After Recovery from COVID-19
2023-Apr, Maternal-fetal medicine (Wolters Kluwer Health, Inc.)
DOI:10.1097/FM9.0000000000000190
PMID:40406392
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析，研究一名康复的COVID-19孕妇的外周血单个核细胞的免疫反应 | 首次在单细胞水平上描绘了COVID-19康复孕妇的PBMCs免疫基因表达图谱，并发现CD16单核细胞和MAIT细胞在母体免疫反应中的关键作用 | 样本量有限，仅研究了一名患者，结果可能需要更大样本验证 | 探究COVID-19康复孕妇的免疫反应机制 | 孕妇外周血单个核细胞(PBMCs) | 免疫学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 1名COVID-19康复孕妇的PBMCs样本，并与已发表的健康孕妇单细胞RNA测序数据集进行对比 |
| 154 | 2025-05-24 |
Integrated Analysis of Single-Cell RNA-Seq and Bulk RNA-Seq Combined with Multiple Machine Learning Identified a Novel Immune Signature in Diabetic Nephropathy
2023, Diabetes, metabolic syndrome and obesity : targets and therapy
DOI:10.2147/DMSO.S413569
PMID:37312900
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和大块RNA测序数据，结合多种机器学习方法，识别了糖尿病肾病中的新型免疫特征 | 首次从免疫学角度揭示了糖尿病肾病进展的关键免疫相关基因和潜在药物靶点 | 研究主要基于生物信息学分析，需要进一步实验验证 | 探索糖尿病肾病中免疫调节的潜在治疗靶点和分子机制 | 糖尿病肾病患者的基因表达数据和免疫相关基因 | 生物信息学 | 糖尿病肾病 | 单细胞RNA测序, 大块RNA测序, WGCNA, CIBERSORT算法 | 随机森林(RF), 支持向量机(SVM), AdaBoost, KNN | 基因表达数据 | 来自GEO数据库的多个数据集，包括GSE142025等 |
| 155 | 2025-05-24 |
Lysyl oxidase promotes anaplastic thyroid carcinoma cell proliferation and metastasis mediated via BMP1
2022-Jan, Gland surgery
IF:1.5Q3
DOI:10.21037/gs-21-908
PMID:35242686
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研究论文 | 本文研究了赖氨酰氧化酶（LOX）和骨形态发生蛋白-1（BMP1）在促进未分化甲状腺癌（ATC）细胞增殖和转移中的作用 | 揭示了LOX/BMP1轴在ATC恶性进展中的关键作用，为基于该轴的靶向治疗提供了新思路 | 研究主要基于体外实验和生物信息学分析，缺乏体内实验验证 | 探索ATC的新型治疗靶点 | 未分化甲状腺癌细胞 | 癌症研究 | 甲状腺癌 | 单细胞RNA测序、微阵列分析、定量实时PCR、Western blot、siRNA敲低、CCK-8实验、克隆形成实验、伤口愈合实验、Transwell实验 | NA | 基因表达数据、蛋白质表达数据 | ATC组织和细胞系 |
| 156 | 2025-05-23 |
A multimorphic variant in ThPOK causes an inborn error of immunity with T cell defects and fibrosis
2025-Aug-04, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20241174
PMID:40392549
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研究论文 | 本文报道了由ThPOK基因变异引起的首例人类疾病，该变异导致CD4+ T细胞缺陷和纤维化等多种症状 | 首次发现ThPOK基因变异导致的人类疾病，揭示了ThPOK在CD4+ T细胞发育、TCR激活和纤维化调控中的新作用 | 研究仅基于一个患者案例，样本量较小 | 探究ThPOK基因变异对人类免疫系统和纤维化途径的影响 | 一名携带ThPOKK360N变异的患者及其细胞模型 | 免疫学 | 免疫缺陷病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因测序数据 | 1名患者 |
| 157 | 2025-05-23 |
Mendelian randomization combined with single-cell sequencing data analysis of chemokines and chemokine receptors and key genes and molecular mechanisms associated with epilepsy
2025-Jun-04, Neuroreport
IF:1.6Q4
DOI:10.1097/WNR.0000000000002168
PMID:40298633
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研究论文 | 结合孟德尔随机化和单细胞测序数据分析趋化因子及其受体在癫痫中的作用及分子机制 | 首次结合孟德尔随机化和单细胞RNA测序技术，识别出与癫痫相关的关键基因和免疫细胞 | 研究结果需要进一步的实验验证，样本来源和数量未明确说明 | 探索趋化因子及其受体相关基因在癫痫中的功能和潜在调控机制 | 趋化因子及其受体相关基因、癫痫 | 生物信息学 | 癫痫 | 孟德尔随机化分析、单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | NA |
| 158 | 2025-05-23 |
Insights of immune cell heterogeneity, tumor-initiated subtype transformation, drug resistance, treatment and detecting technologies in glioma microenvironment
2025-Jun, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2024.07.033
PMID:39097088
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review | 本文全面综述了胶质瘤微环境中四种主要免疫细胞（中性粒细胞、巨噬细胞、淋巴细胞、髓源性抑制细胞）的异质性、亚型转化机制及其对化疗耐药和治疗策略的影响 | 系统总结了胶质瘤诱导免疫细胞亚型转化的确切机制，并探讨了单细胞测序技术在探索免疫细胞亚型中的应用 | NA | 深入理解胶质瘤微环境中免疫细胞的异质性及其在肿瘤进展和治疗中的作用 | 胶质瘤微环境中的免疫细胞（中性粒细胞、巨噬细胞、淋巴细胞、髓源性抑制细胞等） | digital pathology | glioma | 单细胞测序 | NA | NA | NA |
| 159 | 2025-05-23 |
Single-cell atlas of human gingiva unveils a NETs-related neutrophil subpopulation regulating periodontal immunity
2025-Jun, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2024.07.028
PMID:39084404
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示牙龈组织中与NETs相关的中性粒细胞亚群及其在牙周免疫中的作用 | 首次构建了牙周微环境的单细胞图谱，并发现了与NETs相关的中性粒细胞亚群(NrNeu)，揭示了牙龈成纤维细胞通过MIF-CD74/CXCR4轴激活NETs的具体调控关系 | 动物模型的结果可能无法完全反映人类牙周炎的复杂情况，NETs抑制剂的作用机制仍需进一步研究 | 阐明NETs在牙周免疫病理中的具体功能和机制 | 健康个体和牙周炎患者的牙龈组织 | 数字病理 | 牙周炎 | 单细胞RNA测序，高维加权基因共表达网络分析，伪时间分析 | 六种机器学习方法构建的预测模型 | RNA测序数据 | 健康个体和牙周炎患者的牙龈组织样本 |
| 160 | 2025-05-23 |
RNA modification gene WDR4 facilitates tumor progression and immunotherapy resistance in breast cancer
2025-Jun, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2024.06.029
PMID:38960276
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研究论文 | 该研究基于RNA修饰相关基因开发了一种预测乳腺癌患者治疗反应和生存结果的策略 | 提出了一个包含九个基因的签名RMscore，用于预测乳腺癌患者的预后和治疗反应，并发现WDR4通过m7G修饰调节细胞周期和mTORC1信号通路 | 缺乏对乳腺癌中各种RNA修饰临床价值的全面阐述 | 预测乳腺癌患者的治疗反应和生存结果 | 乳腺癌患者 | 癌症研究 | 乳腺癌 | 批量转录组、单细胞转录组和基因组学分析、流式细胞术、免疫组织化学和免疫荧光染色 | NA | 转录组数据、基因组数据 | NA |