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当前共找到 40449 篇文献，本页显示第 141 - 160 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 141 | 2026-06-14 |
Integrative Transcriptomics and Machine Learning Identify Macrophage-Associated Biomarkers in Hypertrophic Cardiomyopathy
2026-Jun-04, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms27115102
PMID:42278626
|
研究论文 | 通过整合转录组学和机器学习，在单细胞水平上分析巨噬细胞相关基因在肥厚型心肌病中的表达，识别出三个核心基因并构建诊断模型 | 首次利用单细胞RNA测序结合机器学习方法系统鉴定肥厚型心肌病中巨噬细胞相关的生物标志物并建立诊断模型 | 基于公开数据集，结果需进一步在独立队列中验证；样本量有限，可能影响模型泛化性 | 探究肥厚型心肌病的分子机制，识别巨噬细胞相关的生物标志物并构建诊断模型 | 肥厚型心肌病患者的心肌组织细胞，包括巨噬细胞在内的免疫细胞亚群 | 机器学习 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序，批量RNA测序，LASSO回归 | LASSO回归模型，机器学习 | 基因表达数据 | 多个公开数据集（GSE181764、GSE161921、GSE249925），具体样本量未明确 | NA | 单细胞RNA测序，批量RNA测序 | NA | NA |
| 142 | 2026-06-14 |
SpatioCell: deep integration of histology and spatial transcriptomics for profiling the cellular microenvironment at single-cell level
2026-Jun-03, Science bulletin
IF:18.8Q1
DOI:10.1016/j.scib.2026.06.006
PMID:42285802
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研究论文 | 提出了SpatioCell算法，通过整合组织学与空间转录组学数据，以单细胞分辨率自动提取细胞类型和表达信息 | 创新性地通过动态规划结合形态与转录组信息，实现确定性单细胞空间重构，纠正去卷积错误并揭示被忽视的微环境特征 | NA | 开发一种计算算法，将空间转录组数据提升至单细胞分辨率，以深入理解细胞空间组织 | 三阴性乳腺癌组织样本中的空间转录组数据 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 空间转录组学 | 动态规划 | 图像， 转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 143 | 2026-06-14 |
Integrated Single-Cell RNA-Seq and Machine Learning to Construct an EMT Infiltration Scoring Model for Prostate Cancer
2026-Jun-02, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms27115017
PMID:42278541
|
研究论文 | 利用单细胞RNA测序和机器学习构建前列腺癌上皮-间充质转化浸润评分模型 | 首次在单细胞水平系统描绘前列腺癌中EMT的细胞异质性，并整合机器学习构建一个稳健的EMT浸润评分模型，用于预后预测和治疗指导 | 未提及明显的局限性 | 探索前列腺癌中EMT的细胞异质性及其临床意义，构建预后预测模型 | 前列腺癌细胞，包括恶性上皮细胞 | 机器学习 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序 | LASSO回归 | 单细胞转录组数据、批量转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 144 | 2026-06-14 |
Multi-Dimensional Transcriptomics Reveals the Prominent Role of Neuroinflammation in Alzheimer's Disease
2026-Jun-02, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms27115020
PMID:42278544
|
综述 | 本文综述了单细胞RNA测序和空间转录组学在阿尔茨海默病神经炎症研究中的应用，揭示了细胞异质性和区域异质性 | 通过整合单细胞和空间转录组技术，首次系统描绘了阿尔茨海默病中神经炎症的细胞状态转换和区域特异性微环境特征 | 作为综述未提供新的实验数据，且不同研究平台间的数据整合仍存在挑战 | 阐明阿尔茨海默病中神经炎症的细胞和分子机制，总结单细胞和空间组学技术的应用进展 | 阿尔茨海默病动物模型和人类脑组织中的小胶质细胞、星形胶质细胞及神经炎症相关基因表达 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | 10x Chromium,10x Visium | 10x Chromium Single Cell 3', 10x Visium FFPE |
| 145 | 2026-06-14 |
Beyond Molecular Classification in Metastatic Triple-Negative Breast Cancer: Toward Subtype-Guided Precision Oncology
2026-Jun-02, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms27115040
PMID:42278564
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综述 | 本文综述了转移性三阴性乳腺癌的分子分类及其在精准肿瘤学中的应用 | 系统整合了mTNBC的基因组、转录组、表观遗传、免疫、基质及生物力学维度的肿瘤异质性，并介绍了新兴工具如单细胞RNA测序、空间转录组学和循环肿瘤DNA分析在患者分层中的潜力 | 临床实施需要更高的方法学标准化、经过验证的预测性生物标志物、可及的诊断平台以及能够捕捉治疗压力下亚型演变的动态监测策略 | 探索mTNBC的分子分类和亚型导向的精准治疗策略 | 转移性三阴性乳腺癌及其分子亚型（BL1、BL2、M、MSL、IM、LAR） | 机器学习， 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序， 空间转录组学， 循环肿瘤DNA分析， 长链非编码RNA分析， 免疫组化 | NA | 基因表达数据， 表观遗传数据， 免疫组化数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序， 空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | 单细胞RNA测序和空间转录组学技术 |
| 146 | 2026-06-14 |
Effects of Ripasudil on Mouse Subconjunctival Immune Cell Motility Activated by Monocyte Chemoattractant Protein-1
2026-Jun-01, Investigative ophthalmology & visual science
IF:5.0Q1
DOI:10.1167/iovs.67.6.20
PMID:42274198
|
研究论文 | 探讨Rho激酶抑制剂ripasudil对单核细胞趋化蛋白-1激活的小鼠结膜下免疫细胞运动的影响 | 首次在体内和体外实验中证明ripasudil能够抑制MCP-1激活的巨噬细胞运动，为青光眼滤过手术后伤口愈合调控提供新思路 | 仅使用小鼠模型和细胞系，临床相关性需进一步验证；且细胞数量变化不显著，机制研究有限 | 研究ripasudil对MCP-1激活的免疫细胞运动的影响及其在青光眼滤过手术后伤口愈合中的潜在治疗价值 | 小鼠结膜下的LysM阳性细胞（巨噬细胞）以及THP-1和RAW264.7细胞系 | 机器学习 | 青光眼 | 单细胞RNA测序、免疫细胞化学、多光子显微镜成像、Boyden室实验 | NA | 图像、基因表达数据 | LysM-eGFP敲入小鼠及THP-1/RAW264.7细胞系，样本量未明确 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 147 | 2026-06-14 |
Spatially resolved single-cell analyses of human meningioma identify novel cell states influencing tumor microenvironment and progression
2026-Jun, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-026-02615-w
PMID:42265312
|
研究论文 | 通过单细胞分辨率和空间转录组学分析人脑膜瘤，发现影响肿瘤微环境和进展的新型细胞状态 | 首次在单细胞水平结合空间转录组学，大规模刻画脑膜瘤中非肿瘤细胞状态的异质性及其与肿瘤进展的关联 | 未明确提及，可能包括样本量有限或技术局限性 | 理解脑膜瘤的肿瘤内在异质性，为潜在治疗途径提供信息 | 人脑膜瘤组织中的肿瘤细胞和非肿瘤细胞（包括髓系细胞、成纤维细胞等） | 数字病理学 | 脑膜瘤 | 单核RNA测序、空间转录组学、DNA甲基化测序、RNA测序、蛋白质组学 | NA | 图像、文本 | 712个样本（bulk DNA甲基化和RNA测序）、88个样本（bulk蛋白质组学）、59个样本（血浆甲基化） | 10x Genomics | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | 10x Chromium | 单核RNA测序和高分辨率空间转录组学平台 |
| 148 | 2026-06-14 |
RNA Metabolism Genes as Prognostic Biomarkers and Therapeutic Targets in Colorectal Cancer Based on the Analysis of Single-Cell and Bulk-RNA Sequencing Data
2026-Jun, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.71236
PMID:42271539
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序和批量转录组数据整合分析，鉴定结直肠癌中RNA代谢相关基因PCBP3和NGRN作为预后标志物和治疗靶点 | 首次从单细胞和批量RNA测序数据整合角度，系统鉴定PCBP3和NGRN作为结直肠癌预后生物标志物，并验证其通过PI3K/AKT信号通路调控肿瘤增殖和侵袭 | 尚未在更大规模临床队列或体内模型中验证该双基因预后模型的稳健性，且PCBP3和NGRN的功能机制研究仅限于HCT116细胞系 | 鉴定结直肠癌中RNA代谢相关基因的预后价值及潜在治疗靶点 | 结直肠癌患者的单细胞RNA测序数据及批量转录组数据 | 机器学习 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序，批量RNA测序 | 双基因预后模型（基于PCBP3和NGRN） | 基因表达数据 | 独立验证队列中的结直肠癌样本 | Illumina | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | Illumina NovaSeq | 单细胞RNA测序和批量转录组测序 |
| 149 | 2026-06-14 |
Immune Landscape and Tumour Heterogeneity in Ovarian Cancer: Insights From Single-Cell RNA Sequencing
2026-Jun, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.71235
PMID:42277572
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术揭示卵巢癌中肿瘤微环境的免疫景观与肿瘤异质性 | 利用单细胞RNA测序技术提供前所未有的分辨率，详细描绘免疫细胞亚群及其功能状态，为个性化免疫治疗提供新平台 | NA | 研究肿瘤免疫微环境的复杂性和动态变化，探索免疫细胞异质性对卵巢癌治疗反应和预后的影响 | 卵巢癌肿瘤微环境中的免疫细胞，包括树突状细胞、中性粒细胞、巨噬细胞、自然杀伤细胞、T淋巴细胞等 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 150 | 2026-06-14 |
Integrated Single-Cell Virtual Knockout and Machine Learning Analyses Reveal a Protective Role of CKAP2 in Gastric Cancer
2026-Jun-01, Molecules (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/molecules31111901
PMID:42280204
|
研究论文 | 通过整合单细胞虚拟敲除和机器学习分析，揭示了CKAP2在胃癌中的保护作用 | 首次结合单细胞虚拟敲除、机器学习算法及孟德尔随机化分析，系统研究CKAP2在胃癌中的保护机制及其与5-HT通路的关联 | 研究主要基于生物信息学分析和体外验证，缺乏体内动物模型实验及大规模临床队列的进一步验证 | 阐明CKAP2在胃癌进展中的作用，评估其预后价值和潜在保护意义 | 胃癌患者组织样本和胃癌细胞系 | 机器学习 | 胃癌 | 全转录组测序 | 加权基因共表达网络分析, 机器学习算法 | 表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 151 | 2026-06-14 |
The RELA-FTH1 axis in senescent cancer-associated fibroblasts creates a stromal iron sink that drives ferroptosis resistance and therapy failure across solid malignant tumors
2026-Jun-01, Drug resistance updates : reviews and commentaries in antimicrobial and anticancer chemotherapy
IF:15.8Q1
DOI:10.1016/j.drup.2026.101415
PMID:42284685
|
研究论文 | 揭示衰老癌症相关成纤维细胞通过RELA-FTH1轴形成基质铁池，促进铁死亡抵抗和实体恶性肿瘤治疗失败 | 首次阐明senCAFs通过RELA-FTH1轴建立基质铁池，通过螯合微环境铁离子保护肿瘤细胞免于铁死亡，且该机制在多种实体瘤中具有泛癌普适性 | 研究主要依赖细胞系和异种移植模型，缺乏患者来源样本的验证，且未深入探究senCAFs与免疫细胞间的相互作用 | 研究衰老癌症相关成纤维细胞如何通过铁代谢重编程驱动实体瘤治疗抵抗 | 31种实体恶性肿瘤中的senCAFs及邻近肿瘤细胞 | 数字病理学 | 肺癌、前列腺癌、心血管疾病、老年病等（泛实体瘤） | 单细胞RNA测序、空间转录组学、条件培养基实验、Transwell共培养、铁橙探针检测、基因干扰（shRNA/siRNA）、药物抑制、皮下异种移植模型 | LASSO/Cox回归模型 | 单细胞RNA测序数据、空间转录组数据、临床预后数据 | 6个单细胞RNA测序数据集（共431,513个细胞）及TCGA独立队列 | 10x Genomics, Illumina | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 10x Chromium, Illumina NovaSeq | 10x Chromium Single Cell 3'测序, 空间转录组学FFPE样本分析 |
| 152 | 2026-06-14 |
SGO1 and SGO2 are Associated With Disease Progression and an Immunosuppressive Microenvironment in Papillary Renal Cell Carcinoma
2026-Jun, Cancer medicine
IF:2.9Q2
DOI:10.1002/cam4.72034
PMID:42287003
|
research paper | 本研究整合多组学数据探究SGO1和SGO2在乳头状肾细胞癌中的表达模式、预后意义及对肿瘤免疫微环境的影响 | 首次揭示SGO1和SGO2在乳头状肾细胞癌中协同促进肿瘤进展并与免疫抑制性微环境重塑相关 | SGO1和SGO2与肿瘤免疫微环境的关联仍为相关性结论，尚需进一步机制研究建立直接的因果关系 | 确定SGO1和SGO2在乳头状肾细胞癌中的表达模式及预后意义，阐明其驱动肿瘤进展的功能机制，并评估其对肿瘤免疫微环境的影响 | 乳头状肾细胞癌（KIRP）中的SGO1和SGO2蛋白 | machine learning | 肾癌 | 多组学整合分析，单细胞转录组学，免疫组化，功能实验 | NA | 转录组数据，免疫组化图像 | TCGA、GTEx和GEO数据库中的多组学数据集，以及患者样本的免疫组化分析 | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 153 | 2026-06-14 |
Single-Cell and Bulk Transcriptomics Uncover the Cellular Ecosystem of Vascular Invasion in Intrahepatic Cholangiocarcinoma
2026-May-31, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells15111016
PMID:42274609
|
研究论文 | 通过单细胞和 bulk 转录组学揭示了肝内胆管癌中血管浸润的细胞生态系统 | 首次发现一种新型肿瘤样癌症相关成纤维细胞（tCAFs）在血管浸润阳性的肝内胆管癌中富集，并揭示缺氧-tCAFs-内皮细胞轴作为血管浸润的关键机制 | 未明确具体限制信息 | 探究肝内胆管癌中血管浸润的肿瘤微环境驱动因素及其分子机制 | 肝内胆管癌患者的肿瘤样本及临床特征 | 机器学学习，数字病理学 | 肝内胆管癌 | 单细胞 RNA 测序，bulk RNA 测序，空间转录组学，多重免疫荧光，RT-qPCR | NA | 转录组数据，空间转录组数据，图像数据 | 25 个肝内胆管癌样本 | NA | 单细胞 RNA 测序，空间转录组学 | NA | NA |
| 154 | 2026-06-14 |
Transcriptomic Signature of PDGF-BB Control of Annulus Fibrosus Reveals Modulation of Inflammatory and Neurogenic Pathways
2026-May-30, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells15111007
PMID:42274599
|
研究论文 | 本研究通过转录组分析揭示了PDGF-BB对人类纤维环细胞中炎症和神经源性信号通路及细胞外基质重塑的调控作用 | 首次通过转录组分析揭示PDGF-BB在健康和退变纤维环细胞中具有上下文依赖性的转录调控作用，并发现其通过调节GPCR网络和抑制炎症-神经源性信号通路发挥抗炎效果 | 未明确提出局限性 | 研究PDGF-BB对纤维环细胞生物学的影响及其在椎间盘退变中的作用机制 | 人类纤维环细胞（健康和退变） | 转录组学 | 椎间盘退变 | RNA-seq | NA | 转录组数据 | 健康和退变AF细胞经PDGF-BB处理3或5天 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | 使用了公开的单细胞RNA-seq数据集 |
| 155 | 2026-06-14 |
CCR5+ CD8+ T Cells Are Associated with Poor Response to PD-1 Blockade Therapy
2026-May-30, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms27114963
PMID:42278489
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研究论文 | 本文分析了非小细胞肺癌和黑色素瘤患者的单细胞RNA测序数据，发现CCR5+ CD8+ T细胞与PD-1阻断疗法的不良反应相关 | 首次系统性地将CCR5+ CD8+ T细胞的转录特征与免疫检查点抑制剂的不良反应联系起来，揭示了CCL3/4-CCR5轴作为潜在治疗靶点 | 主要基于公开数据集的分析，缺乏空间和功能实验验证 | 探究与PD-1/PD-L1阻断疗法不良反应相关的趋化因子受体转录特征 | 非小细胞肺癌、黑色素瘤、肝细胞癌和结直肠癌患者样本中的CD8+ T细胞 | 机器学习 | 非小细胞肺癌, 黑色素瘤, 肝细胞癌, 结直肠癌 | 单细胞RNA-seq | NA | 基因表达数据 | 来自公开数据集的非小细胞肺癌和黑色素瘤队列，以及肝细胞癌和结直肠癌数据集的额外分析 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 156 | 2026-06-14 |
Network-Based Bioinformatics Reveal Microenvironment-Driven Cell-to-Cell Communication in the Progression of Multiple Myeloma
2026-May-30, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms27114986
PMID:42278510
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研究论文 | 基于网络生物信息学分析揭示多发性骨髓瘤进展中微环境驱动的细胞间通讯 | 开发了一个结合CellChat、NicheNet等工具的计算流程，通过微环境特异性方法重建多发性骨髓瘤进展过程中的细胞间通讯网络，并识别关键细胞节点和信号通路 | 未明确提及 | 研究多发性骨髓瘤进展中肿瘤微环境驱动的细胞间通讯模式 | 多发性骨髓瘤进展过程中肿瘤微环境中的细胞群体 | 生物信息学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 三个公开的单细胞RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 157 | 2026-06-14 |
Sinomenine Regulates PSMB9 to Mediate Therapeutic Effects in Rheumatoid Arthritis
2026-May-29, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells15111005
PMID:42274598
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研究论文 | 本研究通过整合差异表达基因分析和加权基因共表达网络分析，鉴定出PSMB9为类风湿关节炎的枢纽基因，并探讨了青藤碱通过调控PSMB9发挥治疗作用的机制 | 首次将PSMB9鉴定为类风湿关节炎的潜在诊断生物标志物和治疗靶点，并揭示了青藤碱通过直接结合并降低PSMB9蛋白表达发挥抗炎作用的新机制 | 未提及 | 识别类风湿关节炎的潜在诊断生物标志物，并研究其与免疫浸润的关系及青藤碱的治疗机制 | 类风湿关节炎患者样本中的差异表达基因和免疫细胞浸润 | 机器学习 | 类风湿关节炎 | 基因表达分析、加权基因共表达网络分析、单细胞RNA测序、细胞热转变分析、Western blot | 加权基因共表达网络分析 | 基因表达数据、单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 158 | 2026-06-14 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals Cellular Heterogeneity and Developmental Dynamics of Goose Satellite Cells During Embryogenesis
2026-May-27, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells15110983
PMID:42274576
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示鹅胚胎发育过程中卫星细胞的异质性和发育动态 | 首次在鹅胚胎发育过程中对卫星细胞进行单细胞转录组分析，鉴定出三种功能状态（静息、激活、增殖/分化）及其连续线性伪时间轨迹，并揭示了细胞间通讯网络的动态变化 | 尚未提及具体局限 | 探究禽类胚胎发育过程中肌肉卫星细胞的细胞异质性和转录动态 | 鹅胚胎腿肌组织 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组 | 四个胚胎阶段（E13、E15、E18、E23），每阶段4个雌性胚胎的混合组织，共42,886个细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 159 | 2026-06-14 |
A Dual-Gene Signature of PMAIP1 and GADD45A for Early Detection of Intrahepatic Cholangiocarcinoma in the Context of Primary Sclerosing Cholangitis
2026-May-27, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms27114826
PMID:42278359
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析识别原发性硬化性胆管炎相关肝内胆管癌的早期检测双基因标志物 | 首次提出基于背景偏差框架分析PSC相关胆管癌发生，并识别出PMAIP1和GADD45A双基因标志物用于早期检测 | 仅在内部交叉验证和外部肿瘤-邻近验证队列中验证，尚需更多独立队列验证 | 探索PSC相关胆管癌发生过程中的恶性相关决定因素，建立早期检测标志物 | 原发性硬化性胆管炎患者、肝内胆管癌肿瘤组织和癌旁组织 | 数字病理学 | 肝内胆管癌 | 单细胞RNA测序 | LASSO回归、穷举最优子集选择 | 单细胞转录组数据 | 包含PSC、ICC肿瘤组织和癌旁组织的样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 160 | 2026-06-14 |
Transcriptomic Meta-Analysis as a Framework for Robust Cross-Study Biological Inference
2026-May-22, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms27114674
PMID:42278205
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综述 | 本文综述了转录组荟萃分析作为跨研究稳健生物学推断框架的方法论步骤和关键考虑因素 | 强调将技术与生物异质性视为可重复性和解释性的边界，而非单纯的噪声来源 | 未详细讨论具体分析方法的技术细节或实证验证 | 提供转录组荟萃分析的方法论框架以支持稳健的生物学推断 | 转录组荟萃分析的方法学步骤和挑战 | 生物信息学 | NA | 转录组荟萃分析 | NA | 转录组数据（包括微阵列、批量RNA测序、单细胞和空间转录组学） | NA | NA | NA | NA | NA |