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当前共找到 37260 篇文献,本页显示第 141 - 160 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
141 2026-03-10
Hypoxic Upregulation of IER2 Increases Paracrine GMFG Signaling of Endoplasmic Reticulum Stress-CAF to Promote Chordoma Progression via Targeting ITGB1
2024-10, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 本研究揭示了内质网应激相关癌症相关成纤维细胞亚群通过IER2/GMFG/ITGB1轴促进脊索瘤进展的分子机制 首次系统阐明了缺氧微环境如何通过上调IER2将CAFs重编程为ERS-CAF亚群,并发现该亚群通过旁分泌GMFG信号靶向肿瘤细胞ITGB1驱动脊索瘤进展 研究主要基于体外和动物模型,临床转化潜力需进一步验证;ERS抑制剂的具体作用机制尚未完全阐明 探究内质网应激相关癌症相关成纤维细胞亚群在脊索瘤中的致癌机制 脊索瘤肿瘤微环境中的癌症相关成纤维细胞亚群、肿瘤细胞和SPP1巨噬细胞 单细胞组学与空间转录组学 脊索瘤 单细胞RNA测序、空间转录组学、GeoMx数字空间分析、数据非依赖性采集蛋白质组学、bulk RNA-seq、多重定量免疫荧光 NA 单细胞转录组数据、空间转录组数据、蛋白质组数据、RNA-seq数据、免疫荧光图像数据 未明确说明具体样本数量 NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 蛋白质组学, bulk RNA-seq GeoMx Digital Spatial Profiler NA
142 2026-03-10
Improved characterization of single-cell RNA-seq libraries with paired-end avidity sequencing
2024-Jul-12, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究评估了Element Biosciences的亲和碱基化学DNA测序技术在单细胞RNA-seq文库中准确测序通过同聚物引物区域的能力,并探讨了额外cDNA序列对读段比对和多聚腺苷酸化位点精确定量的影响 首次利用Element Aviti仪器的亲和碱基化学测序技术,成功实现了对单细胞RNA-seq文库中同聚物引物区域的准确测序,从而直接独立地将读段分配给多聚腺苷酸化位点,避免了传统方法的复杂性 尽管亲和碱基测序在多聚腺苷酸化位点分析中表现优异,但相比单端比对,并未一致提高读段映射率,且存在低水平伪影,需调整适配器修剪和比对流程 评估亲和碱基化学测序技术在单细胞RNA-seq文库中测序同聚物引物区域的准确性,并优化比对流程以提高数据质量 单细胞RNA-seq文库中的cDNA片段,特别是包含同聚物引物区域的序列 自然语言处理 NA 单细胞RNA-seq, 亲和碱基化学DNA测序 NA 序列数据 NA Element Biosciences, Illumina 单细胞RNA-seq Element Aviti, Illumina测序平台 Element Aviti仪器使用亲和碱基化学测序技术,Illumina测序平台用于标准单细胞RNA-seq
143 2026-03-10
Comprehensive Integration of Multiple Single-Cell Transcriptomic Data Sets Defines Distinct Cell Populations and Their Phenotypic Changes in Murine Atherosclerosis
2024-02, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
研究论文 本研究通过整合多个单细胞转录组数据集,定义了小鼠动脉粥样硬化中不同的细胞群体及其表型变化 开发了基于报告基因表达的算法来量化平滑肌细胞向巨噬细胞表型的转分化,并整合多个数据集进行元分析以解决现有研究中的不一致发现 研究受限于现有数据集的实验条件,且转分化事件在检测范围内极为罕见 解决动脉粥样硬化单细胞RNA测序研究中的不一致结果,并深入理解驻留血管细胞在疾病中的作用 小鼠动脉粥样硬化模型中的血管细胞,包括平滑肌细胞、内皮细胞和主动脉瓣细胞 数字病理学 心血管疾病 单细胞RNA测序,原位杂交 分类算法 单细胞转录组数据,图像数据 多个已发表数据集的整合,具体样本数量未明确说明 NA 单细胞RNA-seq NA NA
144 2026-03-10
Dissecting the immune suppressive human prostate tumor microenvironment via integrated single-cell and spatial transcriptomic analyses
2023-02-07, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 通过整合单细胞和空间转录组分析,深入解析了人类前列腺肿瘤微环境的免疫抑制特性 首次结合单细胞RNA测序和高分辨率空间转录组技术,全面描述局部前列腺癌的肿瘤微环境,并推断未解离组织切片中的细胞间相互作用 未明确提及研究样本量限制或技术验证的不足 理解前列腺癌免疫逃逸和肿瘤进展的驱动因素,以改善临床治疗策略 局部前列腺癌患者样本、邻近正常组织和健康对照 数字病理学 前列腺癌 单细胞RNA测序, 空间转录组分析 NA RNA测序数据, 空间转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
145 2026-03-10
Single-cell RNA sequencing in human lung cancer: Applications, challenges, and pathway towards personalized therapy
2021-06-01, Journal of the Chinese Medical Association : JCMA IF:1.9Q2
综述 本文综述了单细胞RNA测序在人类肺癌研究中的应用、挑战及其在推动个性化治疗发展中的潜力 填补了现有综述的空白,全面总结了scRNA-seq在肺癌研究中的广泛应用,并探讨了其在个性化癌症治疗中的未来应用与挑战 NA 总结scRNA-seq在人类肺癌研究中的各种应用,并探讨其在促进未来个性化癌症治疗发展中的潜力与挑战 人类肺癌 数字病理学 肺癌 单细胞RNA测序 NA NA NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
146 2026-03-10
De novo prediction of cell-type complexity in single-cell RNA-seq and tumor microenvironments
2019-08, Life science alliance IF:3.3Q1
研究论文 本文提出了一种新的单细胞RNA-seq数据分析方法,用于预测样本中的细胞类型复杂性,并应用于肿瘤微环境研究 结合非负矩阵分解和贝叶斯模型比较,实现了无需经验参数或间接质量度量的细胞类型异质性深度预测 方法主要基于模拟和有限真实数据集验证,可能在其他复杂样本中需进一步评估 开发一种能准确预测单细胞RNA-seq数据中细胞类型复杂性的算法 单细胞RNA-seq数据,包括模拟数据、原代血单核细胞、胰腺细胞和肿瘤样本 单细胞转录组学 肿瘤 单细胞RNA-seq 非负矩阵分解,贝叶斯模型比较 单细胞RNA计数数据 模拟数据、原代血单核细胞、胰腺细胞及多个单细胞肿瘤样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
147 2026-03-10
Cell lineage and communication network inference via optimization for single-cell transcriptomics
2019-06-20, Nucleic acids research IF:16.6Q1
研究论文 本文提出了一种名为SoptSC的基于相似矩阵优化的单细胞转录组数据分析方法,用于同时推断细胞聚类、伪时间排序、谱系关系和细胞间通讯网络 首次在统一的数学框架内整合了细胞聚类、伪时间排序、谱系推断和标记基因识别,并在此基础上预测细胞间通讯网络,能够重建包含反馈或前馈相互作用的复杂细胞谱系 未明确说明方法在特定数据类型或实验条件下的适用性限制,也未与其他现有工具进行全面的性能比较 开发一个统一的计算框架,用于从单细胞转录组数据中同时推断细胞亚群、谱系关系和细胞间通讯网络 单细胞转录组数据 单细胞转录组学 NA 单细胞RNA测序 基于相似矩阵的优化模型 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
148 2026-03-10
The Tcf21 lineage constitutes the lung lipofibroblast population
2019-05-01, American journal of physiology. Lung cellular and molecular physiology
研究论文 本文通过谱系追踪和单细胞转录组分析,揭示了Tcf21在肺间质细胞发育中的作用,特别是其与脂成纤维细胞群体的关联 首次利用谱系追踪技术明确了Tcf21在肺脂成纤维细胞群体中的特异性表达,并发现其在脂代谢中的调控作用 研究主要基于小鼠模型,未在人类样本中验证,且对Tcf21调控脂成纤维细胞功能的具体分子机制探讨有限 探究Tcf21表达细胞在肺发育和成年期的谱系命运,以理解其在间质细胞分化中的作用 小鼠胚胎及成年肺组织中的Tcf21表达细胞 发育生物学 NA 单细胞转录组分析、谱系追踪、基因过表达实验 NA 转录组数据、细胞图像 小鼠胚胎(如E11.5、E15.5)及成年肺组织样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
149 2026-03-09
Single-cell RNA sequencing analysis of bone cancer pain model induced by Lewis lung cancer cells in male mice
2026-Dec, Annals of medicine IF:4.9Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了雄性小鼠中由Lewis肺癌细胞诱导的骨癌疼痛模型的脊髓细胞组成和分子特征 首次在骨癌疼痛模型中应用单细胞RNA测序技术,系统性地揭示了脊髓中多种细胞类型的比例变化和分子通路改变 研究仅针对雄性小鼠,未考虑性别差异;模型基于特定肺癌细胞系,可能无法完全代表其他癌症类型引起的骨痛 探究骨癌疼痛的分子机制,为开发新的治疗方法提供依据 雄性小鼠的L2-L4脊髓组织 数字病理学 肺癌 单细胞RNA测序 NA RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
150 2026-03-09
TimeVault turns vault particles into molecular memory of transcriptional states: how to decode the cellular black box
2026-Dec, Cell cycle (Georgetown, Tex.)
研究论文 本文介绍了一种名为TimeVault的新技术,该技术能够将细胞内的转录状态以分子记忆的形式存储于活细胞中 通过重新利用穹窿核糖核蛋白颗粒来捕获和稳定多聚腺苷酸化mRNA,实现了在活细胞内长期存储内源性转录组,从而能够回顾性重建分子历史 NA 开发一种能够在活细胞内长期存储转录状态分子记忆的技术,以揭示瞬时基因表达与长期表型结果之间的因果关系 活细胞(包括应激反应模型和癌症模型中的细胞) 分子生物学 癌症 TimeVault技术 NA 转录组数据 NA NA NA NA NA
151 2026-03-09
3D culture reveals dual role of ICAM-1 in mediating tissue-specific human MSC spheroid formation & enhanced immunomodulation
2026-Jul, Biomaterials IF:12.8Q1
研究论文 本研究探讨了三维培养系统如何影响人骨髓和胎盘来源间充质干细胞的免疫调节能力,并揭示了ICAM-1在介导球体形成和增强免疫调节中的双重作用 首次通过三维培养系统比较不同来源MSCs的免疫调节差异,并识别ICAM-1在球体形成和免疫调节中的关键双重功能 研究主要基于体外实验,体内验证有限,且仅聚焦于两种MSC来源,可能未涵盖其他组织来源的MSCs 探究三维培养对MSCs免疫调节能力的影响及其机制,以优化干细胞治疗策略 人骨髓来源间充质干细胞和胎盘来源间充质干细胞 细胞生物学 NA qPCR、流式细胞术、单细胞RNA测序、生物信息学分析 NA 转录组数据、单细胞RNA测序数据 两种来源的MSCs(骨髓和胎盘) NA 单细胞RNA测序 NA NA
152 2026-03-09
Automatic cell type identification methods for single-cell RNA sequencing based on coordinate convolutional neural network
2026-Jun, Computational biology and chemistry IF:2.6Q2
研究论文 本文提出了一种基于坐标卷积神经网络的单细胞RNA测序数据自动细胞类型识别方法BP-Coord,通过整合坐标信息提升模型的空间感知能力 提出BP-Coord方法,通过引入坐标信息作为额外通道和双三次插值上采样层,解决了CNN在单细胞RNA测序数据中因平移不变性导致的细胞类型误分类问题 NA 开发一种高效准确的单细胞RNA测序数据自动细胞类型识别方法 单细胞RNA测序数据 机器学习 NA 单细胞RNA测序 CNN 基因表达数据 五个公共单细胞RNA测序基准数据集 NA 单细胞RNA测序 NA NA
153 2026-03-09
MYB: A potential therapeutic target in triple-negative breast cancer based on the PI3K/AKT signaling pathway
2026-Jun, Computational biology and chemistry IF:2.6Q2
研究论文 本研究通过多组学分析揭示PI3K/AKT信号通路在三阴性乳腺癌与非三阴性乳腺癌预后差异中的关键作用,并识别MYB基因为潜在治疗靶点 首次通过整合多组学数据(包括单细胞RNA测序和空间转录组学)结合机器学习特征选择,系统阐明PI3K/AKT通路在TNBC预后差异中的核心机制,并发现传统中药桃红四物汤活性成分与MYB的强结合潜力 研究主要基于公共数据库的回顾性数据,缺乏实验验证;分子对接结果需体外/体内实验确认;样本来源和批次效应可能影响结果泛化性 探究PI3K/AKT信号通路是否导致三阴性乳腺癌与非三阴性乳腺癌的预后差异,并寻找潜在治疗靶点 三阴性乳腺癌与非三阴性乳腺癌患者的转录组数据及MYB基因 数字病理学 乳腺癌 转录组测序,单细胞RNA测序,空间转录组学,分子对接 机器学习特征选择算法 转录组数据,单细胞数据,空间转录组数据 从GEO数据库下载的原始转录组数据集(具体数量未明确说明) NA 单细胞RNA测序,空间转录组学 NA NA
154 2026-03-09
R-loop-driven molecular subtypes reveal prognostic and immunogenomic features in uterine corpus endometrial carcinoma
2026-Jun, Computational biology and chemistry IF:2.6Q2
研究论文 本研究通过多组学分析揭示了R-loop活性在子宫体子宫内膜癌中的预后意义,并识别出CSDE1作为关键预测基因,其通过SPP1通路与免疫细胞相互作用,影响肿瘤进展和免疫抑制 首次将R-loop活性与UCEC的分子亚型、预后及免疫基因组特征关联,并发现CSDE1在成纤维细胞中的特异性表达及其通过SPP1通路介导的免疫抑制机制 研究主要基于公共数据库数据,缺乏大规模独立队列验证;功能实验仅限于CSDE1,其他R-loop基因的作用未深入探讨 阐明R-loop在子宫体子宫内膜癌中的预后价值和生物学机制,探索CSDE1作为潜在治疗靶点 子宫体子宫内膜癌患者样本及相关转录组、临床、突变和空间数据 生物信息学 子宫内膜癌 转录组分析、单细胞转录组学、空间转录组学、拷贝数变异分析、体细胞突变比较 预后模型 转录组数据、临床数据、突变数据、空间数据 来自TCGA及公共数据库的UCEC样本,具体数量未明确说明 NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
155 2026-03-09
Electrocorticographic, astrocytic and transcriptomic signatures in the triple transgenic mouse model of Alzheimer's disease submitted to stearoyl-CoA desaturase inhibition
2026-May-15, Neuropharmacology IF:4.6Q1
研究论文 本研究探讨了在阿尔茨海默病三转基因小鼠模型中,抑制硬脂酰辅酶A去饱和酶对睡眠、脑电图活动、星形胶质细胞功能、脂质代谢和转录组的影响 首次结合脑电图记录、星形胶质细胞标记、脂滴分析和空间转录组学,全面评估SCD抑制对AD模型小鼠多维度病理特征的挽救作用 研究仅使用雌性小鼠,未涵盖性别差异;SCD抑制未能恢复AD小鼠的睡眠时间改变 探究SCD抑制是否能恢复AD模型小鼠的睡眠障碍,并评估其对脑脂质代谢、星形胶质细胞功能和转录组的影响 野生型和三转基因阿尔茨海默病雌性小鼠 神经科学 阿尔茨海默病 脑电图记录、免疫组织化学、空间转录组学 三转基因小鼠模型 生理信号、图像、转录组数据 野生型和3xTg-AD雌性小鼠,接受SCD抑制剂或对照处理 NA NA NA NA
156 2026-03-09
The modified Zuojin formula (SQQT) associates ILC2-linked JAK-2/STAT5/c-Myc cascade and gastric metaplasia regression
2026-May-10, Journal of ethnopharmacology IF:4.8Q1
研究论文 本研究探讨了改良左金方(SQQT)通过调节ILC2介导的JAK-2/STAT5/c-Myc通路治疗胃化生的机制 首次通过单细胞RNA测序揭示胃化生患者中ILC2增加,并验证SQQT通过靶向JAK-2/STAT5/c-Myc通路抑制细胞增殖 研究主要基于小鼠模型和体外细胞实验,临床样本量有限,且SQQT的具体活性成分作用机制需进一步验证 探究SQQT在胃化生免疫微环境中的作用机制 胃化生患者样本、小鼠模型(GM诱导)及GES-1细胞系 数字病理学 胃化生 单细胞RNA测序、网络药理学、分子对接、组织学分析、细胞因子检测 NA RNA测序数据、图像数据、蛋白质数据 胃化生患者样本(未明确数量)、小鼠模型(剂量分组:1.69, 3.38, 6.76 g/kg SQQT) NA 单细胞RNA测序 NA NA
157 2026-03-09
Construction of a multi-tissue immune atlas for Chinese tongue sole (Cynoglossus semilaevis) reveals granulocyte functional adaptation and underlying regulatory mechanisms
2026-May, Fish & shellfish immunology IF:4.1Q1
研究论文 本研究通过整合血液、肝脏、脾脏和头肾的单细胞RNA测序数据,构建了中国半滑舌鳎的多组织免疫图谱,揭示了粒细胞的功能适应性和调控机制 首次构建了中国半滑舌鳎的多组织免疫图谱,识别了五个转录不同的粒细胞亚群,揭示了其组织特异性分布和发育轨迹,以及cxcr2/cxcr4轴和cd44b介导的通讯策略 NA 研究硬骨鱼粒细胞在不同组织微环境中的功能适应性和调控机制 中国半滑舌鳎(Cynoglossus semilaevis) 单细胞组学 NA 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 单细胞RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
158 2026-03-09
Spatial and multi-omics transcriptomic dissects platinum resistance in lung adenocarcinoma: a five-gene predictive model with tumor microenvironment dynamics
2026-Apr-25, Chemico-biological interactions IF:4.7Q1
研究论文 本研究通过多组学技术识别肺腺癌铂类耐药相关分子亚型,并构建了一个五基因预测模型 首次结合空间转录组学和多组学分析,揭示了肿瘤微环境动态在铂类耐药中的作用,并开发出具有临床级诊断精度的五基因预测模型 研究主要基于公共数据集和细胞系实验,缺乏大规模前瞻性临床队列验证 识别肺腺癌铂类耐药的分子亚型并构建预测模型 肺腺癌患者数据、A549/DDP细胞系、裸鼠模型 数字病理学 肺癌 空间转录组学、多组学分析、生物信息学策略、一致性聚类、机器学习 监督主成分算法、诊断模型 转录组数据、空间转录组数据 公共数据集中的肺腺癌患者样本、A549/DDP细胞系、裸鼠模型 NA 空间转录组学、多组学技术 NA NA
159 2026-03-09
Aberrant STING signalling promotes endothelial dysfunction and neurovascular injury in diabetic retinopathy
2026-Apr, Diabetologia IF:8.4Q1
研究论文 本研究揭示了cGAS/STING/IFN信号通路在内皮细胞中的异常激活是糖尿病视网膜病变中视网膜炎症和神经血管功能障碍的关键驱动因素 首次在糖尿病视网膜病变中明确了STING信号通路在内皮细胞中的特异性激活作用,并证实靶向该通路可改善视网膜炎症和神经血管功能障碍 研究主要基于小鼠模型和体外实验,人类样本验证相对有限,且长期治疗效果和安全性尚未评估 探究STING信号通路在糖尿病视网膜病变发病机制中的作用及其作为早期干预靶点的潜力 人类增殖性糖尿病视网膜病变纤维膜样本、正常死后视网膜、糖尿病和非糖尿病小鼠的视网膜内皮细胞 单细胞组学 糖尿病视网膜病变 单细胞RNA测序 NA 单细胞RNA测序数据 人类增殖性糖尿病视网膜病变和特发性黄斑裂孔患者的纤维膜样本、正常死后视网膜、糖尿病和非糖尿病小鼠的视网膜内皮细胞 NA 单细胞RNA-seq NA NA
160 2026-03-09
Tumor-derived ITIH2 activates PI3K\AKT pathway via THBS1 ubiquitination and promotes tumor angiogenesis in hepatocellular carcinoma
2026-Apr, Biochimica et biophysica acta. Molecular basis of disease
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析,鉴定出ITIH2作为肝细胞癌的新型预后生物标志物,并揭示了其通过泛素化调控THBS1稳定性,进而激活PI3K/AKT通路促进肿瘤血管生成的分子机制 首次发现肿瘤来源的ITIH2通过泛素化依赖的THBS1调控激活PI3K/AKT通路,从而增强内皮细胞血管生成能力,促进肝细胞癌进展 研究样本量有限(仅使用两个患者的scRNA-seq数据),且主要依赖公共数据库(TCGA和ICGC)进行验证,缺乏大规模独立队列验证 探究肝细胞癌中血管生成与肿瘤进展相互作用的分子机制,并寻找新的预后生物标志物 肝细胞癌肿瘤微环境中的血管内皮细胞 数字病理学 肝细胞癌 单细胞RNA测序,免疫组化染色,功能实验(集落形成、CCK-8、流式细胞术) LASSO回归,多变量Cox回归,风险评分系统,列线图 单细胞RNA测序数据,临床样本数据,公共数据库(TCGA, ICGC) 两个肝细胞癌患者的scRNA-seq数据(GSE166635),TCGA和ICGC数据库中的肝细胞癌数据集 NA 单细胞RNA-seq NA NA
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