单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
141	2025-05-23	Synergistic effects of PA (S184N) and PB2 (E627K) mutations on the increased pathogenicity of H3N2 canine influenza virus infections in mice and dogs 2025-May-20, Journal of virology IF:4.0Q2 DOI:10.1128/jvi.01984-24 PMID:40183583	研究论文	本研究通过在小鼠体内连续传代H3N2犬流感病毒，建立了致死性感染模型，并揭示了PA(S184N)和PB2(E627K)突变协同增强病毒对狗和小鼠的致病性	首次揭示了PA(S184N)和PB2(E627K)突变在H3N2犬流感病毒中对哺乳动物适应性的协同作用，并通过单细胞RNA测序阐明了其逃避宿主抗病毒反应的机制	研究主要集中在小鼠和狗模型，对人类潜在风险的研究仍需进一步验证	阐明H3N2犬流感病毒适应哺乳动物的分子机制	H3N2犬流感病毒及其在小鼠和狗中的感染模型	病毒学	流感	单细胞RNA测序、病毒连续传代	动物感染模型	基因序列数据、病毒滴度数据	小鼠和狗的肺组织样本
142	2025-05-23	scRNA-seq reveals an immune microenvironment and JUN-mediated NK cell exhaustion in relapsed T-ALL 2025-May-20, Cell reports. Medicine DOI:10.1016/j.xcrm.2025.102098 PMID:40306275	研究论文	通过单细胞转录组分析揭示了复发T-ALL患者的骨髓免疫微环境及JUN介导的NK细胞耗竭	首次在复发T-ALL患者中鉴定出JUN是NK细胞耗竭的关键因子，并验证了JUN抑制剂对白血病细胞的杀伤作用及对NK细胞功能的改善	研究样本量未明确说明，且机制研究主要基于细胞系和动物模型，需进一步临床验证	探究T-ALL复发的免疫微环境特征及潜在治疗靶点	复发T-ALL患者的骨髓免疫细胞（包括HSCs、GMPs、CD4 T、CD8 T、NK细胞等）	单细胞转录组学	T细胞急性淋巴细胞白血病（T-ALL）	scRNA-seq（单细胞RNA测序）	CDX（细胞源性肿瘤异种移植）、PDX（患者源性肿瘤异种移植）、NOTCH1突变小鼠模型	单细胞转录组数据	NA
143	2025-05-23	Dissecting the immune landscape in pediatric high-grade glioma reveals cell state changes under therapeutic pressure 2025-May-20, Cell reports. Medicine DOI:10.1016/j.xcrm.2025.102095 PMID:40315846	research paper	该研究通过单细胞RNA测序和空间转录组学，全面分析了儿童高级别胶质瘤(pHGG)的免疫景观，揭示了治疗压力下的细胞状态变化	首次在儿童高级别胶质瘤中系统比较了不同年龄组和治疗方案下的免疫微环境差异，并发现了与成人不同的髓系亚群比例	样本量相对有限，且未涉及长期治疗反应的动态监测	探究儿童高级别胶质瘤免疫微环境特征及其对治疗的反应	儿童弥漫性高级别胶质瘤(HGG)和高级别室管膜瘤患者的恶性细胞、髓系细胞和T细胞	肿瘤免疫学	儿童高级别胶质瘤	单细胞RNA测序(scRNA-seq), 空间转录组学	NA	转录组数据	未明确说明具体样本数量，但包含匹配的多种细胞类型
144	2025-05-23	Low T cell diversity associates with poor outcome in bladder cancer: A comprehensive longitudinal analysis of the T cell receptor repertoire 2025-May-20, Cell reports. Medicine DOI:10.1016/j.xcrm.2025.102101 PMID:40315845	research paper	该研究探讨了膀胱癌患者T细胞受体（TCR）多样性与临床结果的关系	首次全面分析了膀胱癌患者TCR多样性的纵向变化及其与治疗结果的关联	研究样本量有限，且未探讨TCR多样性影响生存的具体机制	评估TCR多样性作为膀胱癌预后生物标志物的潜力	膀胱癌患者的T细胞受体库	肿瘤免疫学	膀胱癌	单细胞测序	NA	测序数据	未明确说明数量的膀胱癌患者样本
145	2025-05-23	Targeting mitochondrial complex I of CD177+ neutrophils alleviates lung ischemia-reperfusion injury 2025-May-20, Cell reports. Medicine DOI:10.1016/j.xcrm.2025.102140 PMID:40398393	research paper	研究通过单细胞RNA测序和空间转录组学分析CD177+中性粒细胞在肺缺血再灌注损伤中的作用，并探索其作为早期生物标志物和治疗靶点的潜力	首次发现CD177+中性粒细胞在肺缺血再灌注损伤中的关键作用，并验证线粒体复合物I抑制剂IACS-010759的治疗效果	研究主要基于动物模型，临床转化效果需进一步验证	探索肺缺血再灌注损伤中中性粒细胞亚型的作用机制及治疗策略	CD177+中性粒细胞	生物医学	肺缺血再灌注损伤	单细胞RNA测序, 空间转录组学	小鼠IRI模型, 大鼠左肺移植模型	RNA测序数据	未明确提及具体样本数量
146	2025-05-23	Avian photoreceptor homologies and the origin of double cones 2025-May-19, Current biology : CB IF:8.1Q1 DOI:10.1016/j.cub.2025.02.040 PMID:40250431	research paper	该研究通过单细胞RNA测序技术探索了鸟类光感受器与其他脊椎动物光感受器的进化关系	揭示了鸟类双锥细胞（DC-P和DC-A）分别起源于祖先的红锥细胞和蓝锥细胞，并通过CRISPR介导的基因敲除验证了这一假设	研究仅在新孵化的鸡视网膜中进行，可能无法完全代表所有鸟类或其他脊椎动物的情况	探索鸟类光感受器与其他脊椎动物光感受器的进化关系	鸟类视网膜中的光感受器细胞	进化生物学	NA	单细胞RNA测序（scRNA-seq），CRISPR介导的基因敲除	NA	RNA测序数据	新孵化的鸡视网膜细胞
147	2025-05-23	Mucinous breast cancer organoids: an in vitro research model 2025-May-19, Discover oncology IF:2.8Q2 DOI:10.1007/s12672-025-02586-0 PMID:40388071	research paper	该研究建立了源自患者的黏液性乳腺癌类器官模型，用于临床药物筛选和科学研究	首次报道了黏液性乳腺癌类器官模型，并验证了其在早期传代中与原组织相似的特性	研究仅基于一名患者的样本，样本量有限	开发一种可靠的体外模型以解决纯黏液性乳腺癌的异质性问题	纯黏液性乳腺癌患者的手术肿瘤样本	digital pathology	breast cancer	single-cell RNA-Seq, histological staining, drug testing	organoid model	RNA sequencing data, histological images	1名64岁中国女性患者的肿瘤样本
148	2025-05-23	Brain tumors induce immunoregulatory dendritic cells in draining lymph nodes that can be targeted by OX40 agonist treatment 2025-May-19, Journal for immunotherapy of cancer IF:10.3Q1 DOI:10.1136/jitc-2025-011548 PMID:40389372	research paper	该研究探讨了脑肿瘤引流淋巴结中免疫调节性树突状细胞的作用及其通过OX40激动剂治疗的潜在靶向性	揭示了脑肿瘤引流淋巴结中树突状细胞（DC-c）独特的免疫调节功能，并发现OX40信号通路在调节这些细胞功能中的关键作用	研究主要基于小鼠模型，结果在人类中的适用性尚需进一步验证	研究脑肿瘤免疫微环境中树突状细胞的免疫调节功能及其治疗潜力	小鼠模型中的胶质瘤和淋巴瘤	免疫学	脑肿瘤	高分辨率流式细胞术、单细胞RNA测序	小鼠模型	细胞和分子数据	NA
149	2025-05-23	Single-cell RNA-sequencing reveals early mitochondrial dysfunction unique to motor neurons shared across FUS- and TARDBP-ALS 2025-May-19, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-025-59679-1 PMID:40389397	研究论文	通过单细胞RNA测序技术，研究了FUS和TARDBP基因突变导致的肌萎缩侧索硬化症（ALS）中运动神经元特异性线粒体功能障碍的共享机制	揭示了FUS和TARDBP突变导致的ALS中运动神经元特异性线粒体功能障碍的共享机制，并发现这些机制与蛋白质错误定位无关	研究基于诱导多能干细胞衍生的神经元模型，可能与体内真实情况存在差异	探究FUS和TARDBP基因突变导致ALS的选择性运动神经元退化的共同病理机制	携带FUS P525L、FUS R495X、TARDBP M337V突变或FUS敲除的诱导多能干细胞衍生的神经元	分子生物学	肌萎缩侧索硬化症	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	多种基因编辑的诱导多能干细胞系
150	2025-05-23	A CRISPR/Cas9-based enhancement of high-throughput single-cell transcriptomics 2025-May-19, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-025-59880-2 PMID:40389438	研究论文	介绍了一种名为scCLEAN的分子方法，利用CRISPR/Cas9技术优化单细胞RNA测序（scRNAseq），以提高对低丰度转录本的检测能力	首次将CRISPR/Cas9技术应用于单细胞RNA测序文库的全局重组，显著提高了对低丰度转录本的检测能力	在某些生物背景下应用可能不理想，具体适用范围需要进一步验证	解决单细胞RNA测序中高丰度转录本掩盖低丰度转录本检测的问题	异质性免疫细胞和同质性血管平滑肌细胞	基因组学	NA	CRISPR/Cas9, scRNAseq, 单细胞MAS-Seq	NA	RNA测序数据	多种人类组织和细胞类型
151	2025-05-23	Focusing on DC cells to optimize the prediction of prognosis and innovative treatment strategies for colon cancer 2025-May-19, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-025-01792-8 PMID:40389562	研究论文	本研究通过识别树突状细胞相关基因（DCRGs），构建风险评分系统（DCRI），并评估其在结肠癌预后和治疗中的意义	开发了一种新的DCRI评分系统，能够准确预测结肠癌的预后和免疫治疗反应，并发现PPP2CB作为潜在的治疗靶点	DCRGs在结肠癌中的预后意义尚未充分探索，研究可能受限于样本量和数据来源	优化结肠癌的预后预测和创新治疗策略	结肠腺癌（COAD）患者	数字病理学	结肠癌	单细胞RNA测序（scRNA-seq）、WGCNA、差异表达分析、单变量Cox回归、LASSO-Cox分析	风险评分系统（DCRI）	转录组数据、临床数据	来自TCGA和GEO数据库的结肠癌组织样本
152	2025-05-23	Single-cell transcriptomic landscape reveals complex cellular heterogeneity and dysregulated signaling pathways in nasopharyngeal carcinoma 2025-May-19, Discover oncology IF:2.8Q2 DOI:10.1007/s12672-025-02506-2 PMID:40389670	研究论文	通过单细胞转录组学分析鼻咽癌肿瘤微环境的复杂细胞异质性和失调信号通路	首次系统性地分析了鼻咽癌中不同细胞类型的转录特征及其在肿瘤发展中的作用	未提及样本量的具体限制或技术上的局限性	揭示鼻咽癌肿瘤微环境的细胞组成和信号通路失调	鼻咽癌组织和正常组织样本	数字病理学	鼻咽癌	单细胞RNA测序	NA	转录组数据	未提及具体样本数量
153	2025-05-23	Novel marker genes and small molecule drugs for radiotherapy resistance in cervical cancer identified based on single-cell multi-omics analysis 2025-May-19, Discover oncology IF:2.8Q2 DOI:10.1007/s12672-025-02532-0 PMID:40389794	研究论文	通过单细胞多组学分析和机器学习方法，识别宫颈癌放疗抗性的新标记基因和小分子药物	结合多组学数据和机器学习构建稳健的预后模型，识别与放疗抗性相关的分子标记和潜在治疗药物	研究依赖于公共数据库数据，未进行实验验证	探究宫颈癌放疗抗性的分子和细胞机制	宫颈癌患者	数字病理学	宫颈癌	单细胞测序、转录组测序、甲基化分析	Cox回归	测序数据	43,475个细胞和13种细胞类型
154	2025-05-23	Integrating single-cell and bulk RNA profiles to uncover glutamine metabolism's role in prognosis and immune dynamics in multiple myeloma 2025-May-19, BMC cancer IF:3.4Q2 DOI:10.1186/s12885-025-14239-0 PMID:40389878	研究论文	本研究通过整合单细胞和批量RNA测序数据，揭示了谷氨酰胺代谢相关基因在多发性骨髓瘤预后和免疫动态中的作用	首次系统性地鉴定了谷氨酰胺代谢相关基因在多发性骨髓瘤中的预后和免疫调控作用，并验证了其作为预后生物标志物和治疗靶点的潜力	研究主要基于公共数据库数据，需要进一步实验验证	探索谷氨酰胺代谢相关基因在多发性骨髓瘤中的预后价值和治疗意义	多发性骨髓瘤患者样本和谷氨酰胺代谢相关基因	生物信息学	多发性骨髓瘤	单细胞测序，批量转录组测序，加权共表达网络分析，Cox比例风险模型	NA	RNA测序数据	多个公共多组学队列数据集
155	2025-05-23	The gene regulatory mechanisms shaping the heterogeneity of venom production in the Cape coral snake 2025-May-19, Genome biology IF:10.1Q1 DOI:10.1186/s13059-025-03602-w PMID:40390047	research paper	该研究通过生成高质量的开普珊瑚蛇基因组草图，并结合毒腺单细胞RNA-seq数据和空间毒腺毒素分布分析，揭示了毒素调控的变异性和毒腺中异质性毒素产生的分子机制	揭示了不同毒素家族由不同的细胞群体产生，且毒素表达通过调控模块进一步精细调节，以及调控元件的进化与其相关毒素基因的进化密切相关	研究未明确探讨这些非适应性特征状态如何具体促进进化创新和新颖性	研究蛇毒腺中异质性毒素产生的分子机制及其进化意义	开普珊瑚蛇（Aspidelaps lubricus）及其毒腺	分子生物学	NA	单细胞RNA-seq, 空间毒腺毒素分布分析	NA	基因组数据, RNA-seq数据, 空间分布数据	NA
156	2025-05-23	FK506 prolongs corneal allograft survival and prevents dendritic cell infiltration in an MDSC-dependent manner 2025-May-19, American journal of transplantation : official journal of the American Society of Transplantation and the American Society of Transplant Surgeons IF:8.9Q1 DOI:10.1016/j.ajt.2025.05.018 PMID:40398562	研究论文	本文研究了FK506通过诱导MDSC介导的早期DC激活抑制来延长角膜同种异体移植物存活的细胞机制	揭示了FK506通过MDSC依赖性和时间性方式减少免疫细胞浸润的新机制	研究仅在小鼠模型中进行，未涉及人类临床试验	探究FK506抑制免疫激活和延长同种异体移植物存活的细胞机制	小鼠角膜穿透性角膜移植模型	免疫学	角膜移植排斥	单细胞RNA测序分析、免疫荧光染色	小鼠模型	基因表达数据、图像数据	未明确说明具体样本数量，使用小鼠模型
157	2025-05-23	Crosstalk between kidney and bones: New perspective for modulating osteoporosis 2025-May-17, Ageing research reviews IF:12.5Q1 DOI:10.1016/j.arr.2025.102776 PMID:40389172	review	本文综述了肾脏与骨骼之间的相互作用及其在骨质疏松症中的调控作用	提出了肾脏与骨骼之间相互作用的新视角，并强调了创新方法在研究器官间相互作用中的重要性	NA	探讨肾脏与骨骼之间的相互作用及其在骨质疏松症中的调控机制	肾脏与骨骼的相互作用及其相关疾病（如慢性肾病伴骨密度异常、肾性骨营养不良和骨质疏松症）	NA	骨质疏松症	细胞共培养、器官芯片、单细胞测序、空间转录组学	NA	NA	NA
158	2025-05-23	Astrocytic AEG-1 drives neuroinflammation and enhances seizure susceptibility 2025-May-16, Neurobiology of disease IF:5.1Q1 DOI:10.1016/j.nbd.2025.106957 PMID:40383165	研究论文	本研究探讨了星形胶质细胞中AEG-1基因在神经炎症和癫痫易感性中的作用	首次揭示了AEG-1通过NF-κB信号通路介导神经炎症和癫痫易感性的机制	研究主要基于小鼠模型和体外培养的星形胶质细胞，人类临床相关性尚需进一步验证	探究AEG-1在神经炎症和癫痫易感性中的分子机制	小鼠模型和体外培养的星形胶质细胞	神经科学	癫痫	单细胞RNA测序	小鼠炎症模型	基因表达数据	NA
159	2025-05-23	The battle within: Discovering new insights into phytopathogen interactions and effector dynamics 2025-May-15, Microbiological research IF:6.1Q1 DOI:10.1016/j.micres.2025.128220 PMID:40398012	综述	本文全面回顾了植物病原体相互作用中的效应子动态及其在宿主免疫防御和病原体毒力策略中的作用	强调了元种群动态和快速适应在效应子与植物抗性蛋白互作中的作用，以及环境变化对宿主-病原体互作的影响	NA	探讨植物病原体相互作用机制及效应子动态，为疾病管理策略提供理论基础	植物病原体效应子与宿主免疫系统的相互作用	植物病理学	植物病害	生物信息学、单细胞转录组学	NA	NA	NA
160	2025-05-23	NanoCRISPR-assisted biomimetic tissue-equivalent patch regenerates the intervertebral disc by inhibiting endothelial-to-mesenchymal transition 2025-May-14, Biomaterials IF:12.8Q1 DOI:10.1016/j.biomaterials.2025.123404 PMID:40398216	研究论文	该研究提出了一种纳米CRISPR辅助的生物仿生组织等效补片，通过抑制内皮-间质转化来再生椎间盘	使用纳米CRISPR系统靶向消除VEGF介导的血管生成因子，并结合仿生纳米纤维支架促进椎间盘修复	NA	解决椎间盘纤维环损伤后的生物修复和血管生成问题	椎间盘纤维环(AF)和血管内皮生长因子(VEGF)	生物医学工程	椎间盘退行性疾病	单细胞RNA测序、纳米CRISPR系统	NA	NA	NA