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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 141 | 2026-06-10 |
Targeting ATF4 overcomes dual resistance to chemo-immunotherapy in gastric cancer by disrupting the DNA damage response
2026-Jun-08, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2026-015109
PMID:42259601
|
研究论文 | 通过整合分析揭示ATF4通过上调HSPA9激活DNA损伤反应,导致胃癌对化疗免疫治疗的双重耐药性 | 首次发现转录因子ATF4作为调控胃癌化疗免疫双重耐药的关键因子,并阐明其通过HSPA9-DNA损伤反应轴连接内在化疗耐药与外源性免疫抑制的分子机制 | 未提及具体的局限性 | 阐明胃癌化疗免疫治疗双重耐药的分子机制,并鉴定关键调控因子和潜在治疗靶点 | 胃癌细胞系、患者来源类器官、患者来源异种移植模型及胃癌患者临床队列 | 机器学习 | 胃癌 | 单细胞RNA测序、批量转录组测序、染色质免疫共沉淀测序、RNA测序、多重免疫荧光 | NA | 基因表达数据、图像数据 | 多个胃癌队列的单细胞RNA测序和批量转录组数据集;胃癌细胞系、类器官和异种移植模型;临床胃癌患者样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 142 | 2026-06-10 |
USP1-mediated lipophagy-lipogenesis axis drives cholangiocarcinoma progression and immune evasion
2026-Jun-08, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2026-015116
PMID:42259603
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研究论文 | 本研究通过多组学分析揭示了USP1介导的脂噬-脂生成轴驱动胆管癌进展和免疫逃逸的机制 | 首次阐明USP1通过协调脂噬和脂生成促进长链不饱和脂肪酸积累,并建立代谢-免疫正反馈环,提出靶向USP1可增强免疫治疗效果 | NA | 阐明胆管癌代谢重编程与免疫逃逸的分子联系,为开发肿瘤微环境靶向疗法提供依据 | 胆管癌细胞、肿瘤相关巨噬细胞、细胞毒性T细胞 | 数字病理学 | 胆管癌 | 非靶向代谢组学、二代测序、蛋白质组学、单细胞RNA测序、Olink蛋白质组学、流式细胞术、多重免疫组化 | NA | 多组学数据(代谢组、转录组、蛋白质组) | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 143 | 2026-06-10 |
Mycobacterium tuberculosis IDH-PPARγ interaction suppresses GPX4 to drive macrophage ferroptosis and sustain persistent infection
2026-Jun-08, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-74032-w
PMID:42259813
|
研究论文 | 该研究揭示了结核分枝杆菌通过IDH-PPARγ相互作用抑制GPX4表达诱导巨噬细胞铁死亡,从而维持持续性感染的机制 | 首次发现结核分枝杆菌IDH蛋白与PPARγ直接相互作用并抑制其蛋白酶体降解,进而通过NCOR/SMRT复合物抑制GPX4表达诱导铁死亡,为结核病治疗提供了新靶点 | NA | 研究结核分枝杆菌如何操纵巨噬细胞脂质代谢诱导脂质过氧化和铁死亡以维持细菌持久性 | 小鼠巨噬细胞 | 数字病理学 | 结核病 | 单细胞RNA测序,蛋白质组学 | NA | 单细胞转录组数据,蛋白质组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 144 | 2026-06-10 |
Integrative machine learning and multi-omics analysis reveals ATIC as a promoter of hepatocellular carcinoma progression
2026-Jun-08, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-026-54816-2
PMID:42259854
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研究论文 | 通过整合机器学习和多组学分析,揭示ATIC作为肝细胞癌进展的促进因子 | 首次基于221个自噬相关基因表达模式,通过共识聚类识别肝细胞癌亚型,并构建包含ATIC、RHEB、TMEM74和PRKCD的四基因预后模型,结合单细胞RNA测序发现ATIC在肿瘤细胞和增殖T细胞中高表达且与自噬活性正相关 | 尚需进一步临床验证和机制研究以确认ATIC在肝细胞癌中的具体作用 | 探索自噬相关基因在肝细胞癌进展和免疫调控中的作用,并构建预后模型 | 肝细胞癌患者及其肿瘤样本 | 机器学习 | 肝细胞癌 | RNA-seq, 单细胞RNA测序 | LASSO, 多变量Cox回归 | 基因表达数据, 单细胞转录组数据 | TCGA数据库中的肝细胞癌患者样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 145 | 2026-06-10 |
CMS4 epithelial-intrinsic glycosyltransferase GALNT5 promotes tumor aggressiveness and correlates with poor survival in colorectal cancer
2026-Jun-08, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-026-57104-1
PMID:42259894
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析,定义了结直肠癌CMS4亚型肿瘤上皮细胞特有的糖基转移酶特征,并发现GALNT5促进肿瘤侵袭性并与不良生存相关 | 首次利用单细胞转录组学区分CMS4肿瘤上皮细胞与基质信号,揭示了CMS4亚型中肿瘤细胞内在的糖基转移酶程序,避免了传统批量转录组中基质信号的干扰 | NA | 解析结直肠癌CMS4亚型肿瘤上皮细胞内在的糖基转移酶图谱及其对肿瘤侵袭性的影响 | 结直肠癌CMS4亚型肿瘤上皮细胞 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 431例结直肠癌切除标本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 146 | 2026-06-10 |
Large language model consensus substantially improves the cell type annotation accuracy for scRNA-seq data
2026-Jun-08, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-026-10420-8
PMID:42260142
|
研究论文 | 提出mLLMCelltype框架,通过多个大型语言模型的迭代协商实现单细胞RNA测序数据的细胞类型注释,显著提升准确性和可靠性 | 利用多个LLM的集体智能进行结构化协商,克服单一模型偏见和参考数据依赖,提供透明推理链和共识置信度指标 | 未提及 | 提高单细胞RNA测序数据中细胞类型注释的准确性,减少人工标注工作 | 单细胞RNA测序数据中的细胞类型 | 自然语言处理 | NA | 单细胞RNA测序 | 大型语言模型 | 单细胞基因表达数据 | 49个不同数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 147 | 2026-06-10 |
Transcriptional analyses identify pericyte-centered signaling programs altered by sex and brain region in Alzheimer's Disease
2026-Jun-08, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-026-10446-y
PMID:42260160
|
研究论文 | 通过单核RNA测序分析,研究了阿尔茨海默病中周细胞转录和信号变化在性别和脑区上的差异 | 首次系统揭示周细胞在AD中性别和脑区特异性的信号传导程序变化,特别是发现雌性AD患者特定脑区中上调的周细胞-内皮TGFβ信号程序及下调的雌激素通路 | 未提及具体局限性,但可能受限于样本量、仅分析两个脑区,以及仍需功能验证推断的细胞间通讯 | 探究阿尔茨海默病中周细胞转录和信号变化在性别和脑区特异性方面的作用机制 | 人类脑组织中的周细胞及相关细胞类型(内皮细胞、星形胶质细胞、小胶质细胞) | 机器学习 | 阿尔茨海默病 | 单核RNA测序 | NA | 转录组数据 | AD和非AD捐赠者,按性别分层,涵盖中颞叶回和背外侧前额叶皮层两个脑区 | NA | 单核RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 148 | 2026-06-10 |
The embryonic origins of site-specific arthritis
2026-Jun-08, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-026-02542-2
PMID:42260300
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序、成像和X射线断层扫描,研究人类胎儿手指关节的细胞组成和空间结构,揭示近端指间关节易发炎性关节炎的胚胎起源 | 首次揭示PI16'通用'成纤维细胞在近端指间关节中的富集及其在血管周围和肌腱-韧带界面的定位,为炎症易感性的组织特异性提供胚胎学基础 | 未提及 | 探究炎性关节炎在不同关节位点选择性发病的细胞基础 | 人类胎儿手指关节,特别是近端指间关节和远端指间关节 | 数字病理学 | 关节炎 | 单细胞RNA测序、成像、X射线断层扫描 | NA | 单细胞转录组数据、图像数据 | 人类胎儿手指关节组织样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序平台 |
| 149 | 2026-06-10 |
GPNMB-ECD drives acquired resistance to osimertinib in NSCLC via inducing tumor cell cytoskeletal reorganization
2026-Jun-08, Cellular & molecular biology letters
IF:9.2Q1
DOI:10.1186/s11658-026-00965-1
PMID:42260371
|
研究论文 | 揭示GPNMB-ECD通过诱导肿瘤细胞骨架重排驱动非小细胞肺癌对奥希替尼获得性耐药的机制 | 首次发现GPNMB-ECD作为肿瘤微环境中的关键因子,通过SDC4-F-actin-YAP信号轴促进奥希替尼耐药,并验证了抗GPNMB-ECD抗体作为克服耐药的精准治疗策略的可行性 | 具体局限性未在摘要中提及 | 探究GPNMB-ECD在非小细胞肺癌对奥希替尼获得性耐药中的作用及其机制 | 非小细胞肺癌组织和细胞系,以及人源化患者来源异种移植模型(huPDX) | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序、批量RNA测序、免疫组化、ELISA、免疫共沉淀、免疫荧光、透射电镜 | NA | 基因表达数据、图像 | NSCLC患者组织样本和血浆样本,以及细胞系和裸鼠模型(具体数量未提及) | NA | 单细胞RNA测序、批量RNA测序 | NA | NA |
| 150 | 2026-06-10 |
C3+ cancer-associated fibroblast-derived GAS6 promotes cervical cancer metastasis via activation of AXL signaling pathway in a syngeneic orthotopic mouse model
2026-Jun-08, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-026-08392-8
PMID:42260511
|
研究论文 | 建立了一种同源原位小鼠模型,用于研究宫颈癌转移机制,并发现C3+癌症相关成纤维细胞通过GAS6/AXL信号通路促进转移 | 首次建立了能忠实再现宫颈癌转移级联反应且保留免疫活性肿瘤微环境的同源原位小鼠模型,并通过单细胞RNA测序揭示了C3+成纤维细胞亚型通过GAS6/AXL通路促进肿瘤侵袭的新机制 | 未在标题和摘要中明确说明研究的局限性 | 建立能再现转移级联反应的同源原位宫颈癌小鼠模型,并定义肿瘤微环境中与转移相关的细胞相互作用 | 小鼠宫颈癌U14细胞系、C57BL/6小鼠、宫颈癌患者 | 数字病理学 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠模型中的原发肿瘤和配对淋巴结转移肿瘤样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 151 | 2026-06-10 |
An epithelial cell fate-driven predictive model for liver metastasis risk in primary colorectal cancer through single-cell and multi-omics integration
2026-Jun-08, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-026-08375-9
PMID:42260568
|
研究论文 | 通过单细胞和多组学整合,构建基于上皮细胞命运驱动的结直肠癌肝转移风险预测模型 | 首次基于上皮细胞分化状态定义CRLM恶性发展特征(MDSCRLM),并结合多组学分析揭示三种转移风险轨迹,且通过实验验证HSPA1A的功能 | 未提及具体限制,但可能包括样本量有限、单细胞数据来源单一、外部验证队列较小等 | 建立一种新的、临床相关的CRLM风险分层模型,以弥合生物发现与精准医学之间的差距 | 结直肠癌患者的原发肿瘤和配对肝转移组织 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序、ATAC-seq染色质可及性、免疫组化、体外实验、体内转移模型 | 共识聚类、恶性发展签名 | 基因表达数据、蛋白质组数据、临床数据 | TCGA-COAD/READ队列(N=433)、ATAC-seq样本(N=81)、独立临床队列(45名患者) | NA | 单细胞RNA测序、ATAC-seq | NA | NA |
| 152 | 2026-06-10 |
Molecular classification of primary Sjögren's syndrome based on salivary gland omics
2026-Jun-08, Arthritis research & therapy
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s13075-026-03843-5
PMID:42260594
|
研究论文 | 整合单细胞RNA测序和批量RNA-seq数据,利用非负矩阵分解对原发性干燥综合征进行分子分型,识别出四种分子亚型并分析其临床特征和免疫微环境 | 首次利用整合单细胞和批量转录组数据,通过非负矩阵分解方法对原发性干燥综合征进行分子分型,发现四种亚型并鉴定亚型特异性基因特征集 | 研究样本量可能有限,且分型的临床验证和外推性需进一步评估 | 通过唾液腺组学数据解析原发性干燥综合征的疾病异质性,建立分子分型体系 | 原发性干燥综合征患者的小唾液腺组织样本 | 机器学习 | 干燥综合征 | 单细胞RNA测序、批量RNA测序、非负矩阵分解 | 非负矩阵分解 | 基因表达数据 | 未明确说明,涉及患者小唾液腺样本 | 未明确说明 | 单细胞RNA测序、批量RNA测序 | 未明确说明 | NA |
| 153 | 2026-06-10 |
Neutrophil-Mimetic MRI Enables Ultra-Early Detection of Vascular Inflammation After Stroke
2026-Jun-08, Advanced healthcare materials
IF:10.0Q1
DOI:10.1002/adhm.71325
PMID:42260622
|
研究论文 | 该文章开发了一种模拟中性粒细胞的MRI探针,用于超早期检测中风后血管炎症 | 通过单细胞RNA测序数据识别E-选择素作为早期激活内皮细胞的标志物,并设计靶向E-选择素的氧化铁微粒,实现超早期炎症的MRI检测 | 未提及具体局限性 | 开发一种能够实时、定量检测中风后早期血管炎症的成像方法,以指导免疫调节治疗 | 脑缺血性中风患者或模型的早期炎症反应 | 机器学习 | 脑血管疾病 | 单细胞RNA测序、MRI | 未提及 | 基因表达数据、MRI图像 | 未提及具体样本数量 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 154 | 2026-06-10 |
Single-cell analysis reveals an endothelial TP53-CXCL14 axis in breast cancer progression
2026-Jun-08, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-026-08355-z
PMID:42260654
|
研究论文 | 通过单细胞分析揭示了乳腺癌进展中内皮细胞TP53-CXCL14轴的调控机制 | 首次通过单细胞RNA测序鉴定出内皮细胞是肿瘤微环境中CXCL14的主要来源,并阐明了突变型TP53通过转录抑制CXCL14促进乳腺癌进展的机制 | 未提及明显的局限性 | 探究CXCL14在乳腺癌中的表达、预后意义及其与肿瘤微环境的关系,并揭示其上游调控机制 | 乳腺癌患者样本、HUVEC细胞系、MDA-231乳腺癌细胞系 | 机器学习 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序,ChIP-qPCR,双荧光素酶报告基因实验 | NA | 基因表达数据,单细胞转录组数据 | 基于TCGA、GEO和cBioPortal公共数据库的乳腺癌患者队列,具体数量未说明 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | NA |
| 155 | 2026-06-10 |
Sleeve Gastrectomy Is Associated with Improved Systemic Redox Homeostasis in T2DM Through Ghrelin-GHSR Attenuation, POMC Neuronal Modulation, and CD4+ T Cell Metabolic Reprogramming
2026-Jun-08, Antioxidants & redox signaling
IF:5.9Q1
DOI:10.1177/15230864261455465
PMID:42260953
|
研究论文 | 本研究探讨袖状胃切除术通过抑制Ghrelin-GHSR轴、重塑下丘脑POMC神经元活性及重编程CD4+T细胞免疫代谢以改善2型糖尿病全身代谢稳态的机制 | 首次整合单细胞RNA测序与代谢组学揭示袖状胃切除术通过协调中枢食欲调控与外周免疫代谢重编程改善2型糖尿病的神经-免疫-代谢机制 | 未提及 | 研究袖状胃切除术改善2型糖尿病的分子机制,重点关注Ghrelin-GHSR信号轴的作用 | 饮食诱导的2型糖尿病小鼠模型 | 机器学习 | 2型糖尿病 | RNA-seq, 单细胞RNA测序, 代谢组学 | NA | 基因表达数据, 代谢物数据 | 未提及 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 156 | 2026-06-10 |
Screening of Demethylation-related Biomarkers and Exploration of Regulatory Mechanisms in Esophageal Cancer Patients Based on Machine Learning and Mendelian Randomization
2026-Jun-08, Current cancer drug targets
IF:2.3Q3
|
研究论文 | 基于机器学习和孟德尔随机化筛选食管癌患者去甲基化相关生物标志物并探索调控机制 | 整合加权基因共表达网络分析、机器学习算法与孟德尔随机化方法,系统筛选食管鳞状细胞癌中与去甲基化相关的预后基因并构建风险预测模型 | 未提及具体局限性,但可能需进一步实验验证基因功能及更大样本队列确认模型普适性 | 筛选食管鳞状细胞癌中去甲基化相关的预后生物标志物,并探索其调控机制及治疗意义 | 食管鳞状细胞癌患者肿瘤组织和癌旁正常组织 | 机器学习 | 食管癌 | 单细胞RNA测序、qPCR | 随机生存森林、LASSO-Cox回归模型 | 基因表达数据、单细胞转录组数据 | 未明确提及样本数量,但包含组织样本用于qPCR验证 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 157 | 2026-06-10 |
Sini decoction inhibits colorectal cancer liver metastasis by suppressing HIF-1α-dependent exosomal integrin signaling
2026-Jun-07, Journal of ethnopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.jep.2026.121951
PMID:42259422
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研究论文 | 探讨四逆汤通过抑制HIF-1α依赖的外泌体整合素信号来抑制结直肠癌肝转移的机制 | 首次发现四逆汤通过靶向HIF-1α抑制ITGαvβ5富集的外泌体分泌,进而阻断M2巨噬细胞极化,揭示其抗转移新机制 | 未提及具体局限性 | 阐明四逆汤抑制结直肠癌肝转移的活性成分和机制,重点关注肿瘤来源外泌体和巨噬细胞极化 | 小鼠结直肠癌肝转移模型、luciferase标记的CT26细胞、巨噬细胞 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序、免疫组化、免疫荧光、ELISA、Western blotting、光谱流式细胞术、网络药理学、分子对接、CETSA | NA | 基因表达数据、图像、组织病理数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 158 | 2026-06-10 |
ArchVelo: archetypal velocity modeling for single-cell multi-omic trajectories
2026-Jun-06, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-74000-4
PMID:42248920
|
研究论文 | ArchVelo是一个从配对单细胞染色质可及性和转录组数据推断细胞轨迹的计算框架 | 将染色质可及性表示为共享调控程序的“原型”(archetypes),模型调控对转录的动态影响 | 未提及 | 从静态单细胞数据推断细胞动态和基因调控轨迹 | 小鼠脑、人类造血、病毒感染的CD8 T细胞 | 机器学习 | 病毒感染 | 单细胞多组学 | 原型速度模型 | 单细胞染色质可及性(scATAC-seq)和转录组(scRNA-seq)数据 | 小鼠脑、人类造血数据集及病毒感染的CD8 T细胞样本 | NA | 单细胞ATAC-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 159 | 2026-06-10 |
Establishment and multi-omics characterization of a PD-1-resistant murine esophageal squamous cell carcinoma cell line
2026-Jun-06, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2026.154109
PMID:42259198
|
研究论文 | 建立并多组学表征一种PD-1耐药的鼠食管鳞癌细胞系 | 首次建立一种新型鼠食管鳞癌细胞系mESCC-030,该细胞系来源于4-NQO诱导的原发性食管鳞癌肿瘤,经过连续体内选择获得,表现出对PD-1抗体治疗的明显耐药性,并提供了一个典型的免疫冷肿瘤模型 | 未提及具体的局限性 | 探索食管鳞癌免疫治疗耐药机制及开发联合治疗策略 | 4-NQO诱导的C57BL/6小鼠原发性食管鳞癌细胞系mESCC-030 | 机器学习 | 食管癌 | 单细胞RNA测序, 批量转录组分析 | NA | 转录组数据, 单细胞RNA测序数据 | 来源于C57BL/6小鼠的细胞系,具体样本数量未提及 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 160 | 2026-06-10 |
From Multiomics Discovery to Clinical Validation: Identification of Novel Noninvasive Biomarkers for Liver Fibrosis
2026-Jun-05, Journal of proteome research
IF:3.8Q1
DOI:10.1021/acs.jproteome.5c01198
PMID:42192591
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研究论文 | 通过多组学和单细胞测序整合分析,鉴定并验证了THBS2、GDF15和NFASC作为肝纤维化的新型非侵入性生物标志物 | 首次通过多组学发现与临床验证相结合的方法,系统鉴定了三个新型肝纤维化生物标志物,并开发了整合生物标志物与临床变量的多变量模型,显著提高了风险分层准确性 | 未提及具体局限性 | 鉴定用于肝纤维化早期诊断的非侵入性生物标志物 | 肝纤维化患者 | 机器学习的临床应用 | 肝纤维化 | 多组学、单细胞测序 | 多变量模型 | 多组学数据、临床数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序、多组学 | NA | NA |