单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新，已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价10元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 27924 篇文献，本页显示第 15901 - 15920 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 15901 | 2024-08-05 |
Establishment and Validation of Novel Prognostic Subtypes in Hepatocellular Carcinoma Based on Bile Acid Metabolism Gene Signatures Using Bulk and Single-Cell RNA-Seq Data
2024-Jan-11, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms25020919
PMID:38255993
|
研究论文 | 本研究基于胆汁酸代谢基因特征建立并验证了肝细胞癌的预后亚型 | 首次将胆汁酸代谢相关基因与肝细胞癌分类为四种亚型，并提出亚型C2a与更高生存几率相关 | 本研究为初步分析，尚需更多验证研究以阐明胆汁酸代谢与肝癌的具体机制 | 探索胆汁酸代谢在肝细胞癌发生发展中的作用及其对肿瘤微环境的影响 | 肝细胞癌样本及其与胆汁酸代谢相关的基因 | 数字病理学 | 肝癌 | RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 包含多种数据集的肝细胞癌样本 |
| 15902 | 2024-08-05 |
Single-Cell Transcriptome Analysis Reveals Development-Specific Networks at Distinct Synchronized Antral Follicle Sizes in Sheep Oocytes
2024-Jan-11, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms25020910
PMID:38255985
|
研究论文 | 该文章通过单细胞转录组分析揭示了羊卵母细胞不同同步的窦卵泡大小下的发育特异网络 | 为羊卵母细胞在窦卵泡发育过程中的转录组特征提供了全面的描绘，填补了羊卵子发生分子图谱的空白 | 未提及研究的具体限制 | 理解羊卵母细胞的成熟和卵泡发育 | 不同大小的羊卵母细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学 (SmartSeq2) | NA | 转录组数据 | 通过不同大小的羊卵母细胞进行分析 |
| 15903 | 2024-08-07 |
Metabolomics, Transcriptome and Single-Cell RNA Sequencing Analysis of the Metabolic Heterogeneity between Oral Cancer Stem Cells and Differentiated Cancer Cells
2024-Jan-05, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers16020237
PMID:38254728
|
研究论文 | 本研究通过代谢组学、转录组学和单细胞RNA测序分析，探讨口腔癌干细胞与分化癌细胞之间的代谢异质性 | 首次综合运用代谢组学、转录组学和单细胞RNA测序技术，深入分析口腔癌干细胞与分化癌细胞的代谢差异 | 研究仅限于细胞系和多细胞肿瘤球体模型，未涉及更多临床样本 | 理解癌干细胞的独特代谢特征，以应对与之相关的临床挑战 | 口腔癌干细胞与分化癌细胞的代谢特征 | 数字病理学 | 口腔癌 | 代谢组学、RNA测序、单细胞RNA测序 | NA | 代谢物、基因表达数据 | 使用CAL27和HSC3细胞系及六个口腔癌患者的单细胞RNA测序数据 |
| 15904 | 2024-08-07 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals Alterations in Patient Immune Cells with Pulmonary Long COVID-19 Complications
2024-Jan-02, Current issues in molecular biology
IF:2.8Q3
DOI:10.3390/cimb46010029
PMID:38248331
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，探讨了患有长期COVID-19并发症患者的免疫细胞变化 | 首次详细分析了长期COVID-19患者免疫细胞的动态变化，特别是幼稚中性粒细胞和CD8+ NKT样细胞的增加 | 研究样本量较小，仅包括一名患者，可能影响结果的普遍性 | 深入研究长期COVID-19患者的免疫景观 | 长期COVID-19患者的免疫细胞 | 数字病理学 | 肺部疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 一名71岁COVID-19患者及对照组 |
| 15905 | 2024-08-07 |
Single-Cell Transcriptome Analysis of Acute Myeloid Leukemia Cells Using Methanol Fixation and Cryopreservation
2023-Dec-20, Diseases (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/diseases12010001
PMID:38275564
|
研究论文 | 本研究通过甲醇固定和低温保存的方法，对急性髓系白血病细胞进行单细胞转录组分析 | 提出甲醇固定法作为常规临床使用的替代方法，用于获取难以活检的细胞进行单细胞RNA测序 | 观察到甲醇固定超过一年后会出现遗传性退化 | 探讨甲醇固定法在急性髓系白血病细胞单细胞转录组分析中的应用及其效果 | 急性髓系白血病细胞 | 数字病理学 | 白血病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 两个急性髓系白血病样本 |
| 15906 | 2024-08-05 |
Bibliometric and visual analysis of single-cell sequencing from 2010 to 2022
2023, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2023.1285599
PMID:38274109
|
研究论文 | 本文对2010年至2022年间单细胞测序相关研究进行了文献计量和视觉分析 | 首次通过文献计量软件绘制出单细胞测序研究的发展趋势图 | 缺乏对单细胞测序相关研究的全面和公正分析 | 旨在通过文献计量方法分析单细胞测序的研究状态和趋势 | 对2010年至2022年间的相关文献进行分析 | 数字病理学 | NA | 文献计量 | NA | 文献 | 9,929篇 |
| 15907 | 2024-08-05 |
Identification of a novel, MSC-induced macrophage subtype via single-cell sequencing: implications for intervertebral disc degeneration therapy
2023, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2023.1286011
PMID:38274272
|
研究论文 | 本研究通过单细胞测序识别了在缺氧条件下由间充质干细胞（MSC）诱导的独特巨噬细胞亚型，可能对椎间盘退变治疗具有重要意义 | 本文章创新性在于发现缺氧条件下MSC诱导的独特巨噬细胞亚群，揭示了MSC如何通过调节巨噬细胞表型影响椎间盘退变 | 研究局限性在于未能全面分离因缺氧影响而产生的所有调节因子 | 研究的目的在于探讨间充质干细胞对巨噬细胞的影响及其在椎间盘退变中的潜在治疗作用 | 研究对象为人类骨髓来源的巨噬细胞及间充质干细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞培养和基因表达数据 | 实验使用了人类骨髓来源的STRO3 MSCs和巨噬细胞 |
| 15908 | 2024-08-07 |
Single-cell multi-omics analysis of human pancreatic islets reveals novel cellular states in type 1 diabetes
2022-02, Nature metabolism
IF:18.9Q1
DOI:10.1038/s42255-022-00531-x
PMID:35228745
|
研究论文 | 本文通过单细胞多组学分析，研究了人类胰腺胰岛在1型糖尿病中的细胞状态 | 开发了一种先进的综合分析策略，用于评估胰腺胰岛并识别典型细胞类型 | NA | 揭示1型糖尿病中胰腺胰岛的新细胞状态 | 人类胰腺胰岛中的多种细胞类型 | 数字病理学 | 1型糖尿病 | 单细胞转录组学、飞行时间流式细胞术、原位成像质谱流式细胞术 | NA | 细胞 | 24名1型糖尿病、自身抗体阳性和非糖尿病器官捐赠者的胰腺胰岛 |
| 15909 | 2024-08-07 |
Correction to 'Probabilistic cell/domain-type assignment of spatial transcriptomics data with SpatialAnno'
2024-Jan-25, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkad1229
PMID:38109292
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 15910 | 2024-08-07 |
InClust+: the deep generative framework with mask modules for multimodal data integration, imputation, and cross-modal generation
2024-Jan-24, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-024-05656-2
PMID:38267858
|
研究论文 | 本文介绍了inClust+，一个用于多组学数据整合、插补和跨模态生成的深度生成框架，该框架通过增加两个掩码模块来增强其处理多模态数据的能力 | inClust+框架引入了输入掩码模块和输出掩码模块，专门设计用于处理多模态数据，提高了数据整合和跨模态生成的效率 | NA | 开发一种能够有效整合和处理多模态数据的计算方法 | 单细胞技术产生的多组学数据，包括基因表达、染色质可及性和蛋白质丰度等 | 机器学习 | NA | 深度学习 | 生成对抗网络（GAN） | 多模态数据 | 涉及多种类型的单细胞数据集，包括scRNA-seq、MERFISH和CITE-seq数据 |
| 15911 | 2024-08-07 |
PIM kinases regulate early human Th17 cell differentiation
2023-12-26, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2023.113469
PMID:38039135
|
研究论文 | 本研究探讨了PIM激酶家族在人类Th17细胞分化早期的转录基因调控中的作用 | 首次全面研究了PIM1、PIM2和PIM3在人类Th17细胞分化早期的分子功能 | NA | 探讨PIM激酶在人类Th17细胞分化中的作用及其与自身免疫表型的关联 | PIM激酶家族及其在Th17细胞分化中的调控作用 | 免疫学 | 自身免疫病 | scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | NA |
| 15912 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing uncovers the cell type-dependent transcriptomic changes in the retrosplenial cortex after peripheral nerve injury
2023-12-26, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2023.113551
PMID:38048224
|
研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术研究了外周神经损伤后后侧皮质（RSC）的细胞类型依赖性转录组变化 | 首次揭示了RSC在疼痛调节中的作用，并展示了通过化学遗传学方法减少特定神经元活动可以缓解神经损伤引起的疼痛 | NA | 探究外周神经损伤后RSC在疼痛调节中的作用及其分子机制 | 小鼠的RSC在神经损伤后的转录组变化 | 数字病理学 | 神经病理性疼痛 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | NA |
| 15913 | 2024-08-07 |
SPIDE: A single cell potency inference method based on the local cell-specific network entropy
2023-12, Methods (San Diego, Calif.)
DOI:10.1016/j.ymeth.2023.11.006
PMID:37952704
|
研究论文 | 本文提出了一种基于细胞特异性网络熵的单细胞潜能推断方法SPIDE，通过引入局部加权细胞特异性网络来保持细胞异质性，并结合基因表达与网络结构计算熵值 | SPIDE方法通过引入局部加权细胞特异性网络，有效解决了现有方法中由于scRNA-seq数据不准确交互和噪声导致的推断不准确问题 | NA | 旨在准确推断单细胞RNA-seq数据中的细胞分化潜能 | 单细胞RNA-seq数据中的细胞分化潜能 | 生物信息学 | 结直肠癌 | scRNA-Seq | NA | 基因表达数据 | 八个scRNA-Seq数据集 |
| 15914 | 2024-08-05 |
Hypoxia-sensitive cells trigger NK cell activation via the KLF4-ASH1L-ICAM-1 axis, contributing to impairment in the rat epididymis
2023-11-28, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2023.113442
PMID:37952156
|
研究论文 | 该研究探讨了缺氧对大鼠附睾细胞的影响及其在不孕症中的作用 | 首次识别了缺氧敏感的附睾细胞，并阐明了通过KLF4-ASH1L-ICAM-1轴激活自然杀伤细胞的机制 | 研究主要在大鼠模型中进行，未必能完全适用于人类 | 探讨缺氧环境对附睾功能和不孕症的影响 | 大鼠附睾细胞在不同氧气条件下的变化 | 数字病理学 | 不孕症 | 单细胞转录组学 | NA | 细胞数据 | NA |
| 15915 | 2024-08-05 |
Single-cell analysis of multiple invertible promoters reveals differential inversion rates as a strong determinant of bacterial population heterogeneity
2023-08-04, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adg5476
PMID:37540747
|
研究论文 | 本文研究了细菌种群异质性的一个重要机制，即可逆启动子的差异反转率。 | 揭示了通过组合性启动子反转生成的显著种群异质性，并表明反转率的差异在种群动态中起主要作用。 | 研究中可能未涵盖所有类型的微生物，局限于特定的细菌种群及其环境。 | 研究细菌种群异质性的机制及其对细菌适应性的影响。 | 以人类肠道共生细菌为研究对象，分析启动子反转对种群异质性的影响。 | 微生物学 | NA | 单细胞高通量测序 | 随机计算模型 | 基因组数据 | NA |
| 15916 | 2024-08-05 |
A novel protein encoded by circKANSL1L regulates skeletal myogenesis via the Akt-FoxO3 signaling axis
2024-Feb, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2023.128609
PMID:38056741
|
研究论文 | 该文章报道了一种新型蛋白质circKANSL1L在骨骼肌生成中的作用 | 发现了由circKANSL1L编码的新型蛋白质及其在肌生成中的潜在功能 | 研究主要集中在猪的肌肉，可能不适用于其他物种 | 探究circKANSL1L如何通过Akt-FoxO3信号通路调控骨骼肌生成 | Lantang和Landrace猪的长背肌肉样本 | 数字病理学 | NA | circRNAome-seq和Ribo-seq | NA | 代谢组学和单细胞转录组学数据 | 来自Lantang和Landrace小猪的长背肌肉样本 |
| 15917 | 2024-08-05 |
Cellular and molecular mechanisms of highly active mesenchymal stem cells in the treatment of senescence of rhesus monkey ovary
2024-01-08, Stem cell research & therapy
IF:7.1Q1
DOI:10.1186/s13287-023-03631-x
PMID:38191526
|
研究论文 | 这篇文章研究了高活性间充质干细胞在猴子卵巢抗衰老中的细胞和分子机制 | 这项研究首次揭示了高活性间充质干细胞对卵巢衰老的多种细胞和分子机制 | 该研究主要在猕猴卵巢进行，可能无法直接推广到人类 | 探讨高活性间充质干细胞在猴子卵巢衰老治疗中的作用机制 | 猕猴卵巢的老化细胞群和高活性间充质干细胞 | 数字病理学 | 衰老相关疾病 | 单核转录组测序 | NA | 基因表达数据 | 使用了不说明数量的猕猴卵巢样本和高活性间充质干细胞 |
| 15918 | 2024-08-07 |
Comparative single-cell analysis reveals heterogeneous immune landscapes in adenocarcinoma of the esophagogastric junction and gastric adenocarcinoma
2024-01-05, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-023-06388-6
PMID:38182569
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了食管胃结合部腺癌（AEG）和胃腺癌（GAC）的肿瘤微环境（TME），揭示了AEG中异质性恶性细胞和肿瘤相关成纤维细胞（CAFs）的特征 | 首次全面解析了AEG的TME，识别了具有多样生物功能和内在恶性特性的异质性AEG恶性细胞，并揭示了AEG中T细胞的转录特征和TCR谱系 | NA | 旨在深入理解食管胃结合部腺癌（AEG）的肿瘤微环境（TME） | 食管胃结合部腺癌（AEG）和胃腺癌（GAC）的肿瘤和邻近正常组织 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 四名AEG患者和公开的GAC单细胞数据集 |
| 15919 | 2024-08-05 |
Exploring distinct properties of endometrial stem cells through advanced single-cell analysis platforms
2023-12-20, Stem cell research & therapy
IF:7.1Q1
DOI:10.1186/s13287-023-03616-w
PMID:38124100
|
综述 | 本研究综述了先进的单细胞分析技术在子宫内膜干细胞研究中的应用 | 介绍了单细胞RNA测序、单细胞ATAC测序和空间转录组学等新技术在识别和表征子宫内膜干细胞群体方面的创新 | 现有技术仍存在许多需要改进的技术局限性 | 探索子宫内膜干细胞在相关疾病中的重要性 | 子宫内膜干细胞及其在月经周期和分化过程中的动态变化 | 数字病理 | 子宫内膜疾病 | 单细胞RNA测序，单细胞ATAC测序，空间转录组学 | NA | NA | NA |
| 15920 | 2024-08-07 |
PD-L1 expression levels in mesenchymal stromal cells predict their therapeutic values for autoimmune hepatitis
2023-12-18, Stem cell research & therapy
IF:7.1Q1
DOI:10.1186/s13287-023-03594-z
PMID:38111045
|
研究论文 | 本研究探讨了间充质基质细胞中PD-L1表达水平对其治疗自身免疫性肝炎疗效的预测作用 | 首次揭示了PD-L1表达水平与间充质基质细胞治疗自身免疫性肝炎疗效之间的正相关关系 | 研究仅限于从58个人类供体中分离的Wharton's jelly衍生的间充质基质细胞，且使用小鼠模型进行验证 | 探索间充质基质细胞中PD-L1表达水平作为选择治疗自身免疫性肝炎最佳细胞的指标 | 间充质基质细胞（MSCs）及其在自身免疫性肝炎治疗中的应用 | NA | 自身免疫性疾病 | 转录组和单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 58个不同供体来源的Wharton's jelly衍生的间充质基质细胞 |