单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 28333 篇文献，本页显示第 15821 - 15840 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 15821 | 2024-08-04 |
Genetic vulnerability to Crohn's disease reveals a spatially resolved epithelial restitution program
2023-10-25, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.adg5252
PMID:37878672
|
研究论文 | 本文解剖了肠黏膜愈合反应，通过单细胞分辨率绘制细胞间通信图谱并与空间转录组学结合 | 揭示了与克罗恩病相关的遗传变异如何破坏损伤感知通路，在愈合机制上提供了空间分辨的生物学模型 | 主要使用小鼠模型进行研究，可能与人类的生物学过程存在差异 | 研究肠道组织修复过程中的细胞间通信与信号传导机制 | 研究对象为克罗恩病相关的HGFAC基因变异及其在小鼠模型中的表现 | 数字病理学 | 克罗恩病 | 空间转录组学，单细胞转录组学 | 器官oid共培养模型 | 细胞数据 | 使用R509H小鼠模型进行实验 |
| 15822 | 2024-08-07 |
ETV6 represses inflammatory response genes and regulates HSPC function during stress hematopoiesis in mice
2023-09-26, Blood advances
IF:7.4Q1
DOI:10.1182/bloodadvances.2022009313
PMID:37522715
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研究论文 | 本研究通过生成携带Etv6R355X失活突变的小鼠模型，探讨ETV6基因在HSPC功能和炎症反应基因调控中的作用 | 首次揭示了ETV6在HSPC中抑制炎症基因表达的机制，特别是在应激造血过程中的作用 | NA | 阐明ETV6基因变异如何影响HSPC功能并导致疾病 | ETV6基因在HSPC中的功能及其对炎症反应基因的调控作用 | NA | 血液系统恶性肿瘤 | 转座酶可及染色质测序、高吞吐量染色体构象捕获、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠模型，包括Etv6R355X/+和Etv6+/+小鼠的骨髓细胞 |
| 15823 | 2024-08-07 |
A Frizzled4-LRP5 agonist promotes blood-retina barrier function by inducing a Norrin-like transcriptional response
2023-Aug-18, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2023.107415
PMID:37559903
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研究论文 | 本研究通过使用四价抗体模式F4L5.13，在因NDP信号受损而表现出复杂视网膜病理的幼鼠中，发现FZD4-LRP5激动剂的活动，并探讨其在发育期和成熟期对血视网膜屏障（BRB）功能的恢复作用。 | 本研究首次使用F4L5.13抗体模式，识别并验证了FZD4-LRP5激动剂在恢复血视网膜屏障功能中的作用，揭示了其在视网膜和神经疾病治疗中的潜在价值。 | 研究主要集中在幼鼠和成熟鼠模型上，未涉及其他年龄段的动物模型，可能影响结果的普遍性。 | 探讨FZD4-LRP5激动剂在维持和恢复血视网膜屏障功能中的作用及其潜在治疗价值。 | 幼鼠和成熟鼠的视网膜病理模型。 | 生物医学 | 视网膜疾病 | scRNA-seq | NA | RNA | 幼鼠和成熟鼠 |
| 15824 | 2024-08-07 |
EZH2 inhibition promotes tumor immunogenicity in lung squamous cell carcinomas
2023-Jun-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.06.06.543919
PMID:37333199
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研究论文 | 本研究探讨了EZH2甲基转移酶抑制剂在肺鳞状细胞癌（LSCC）中增强免疫检查点抑制剂（ICI）反应的可能性 | 首次证明EZH2抑制剂能增加主要组织相容性复合体I和II（MHCI/II）的表达，并改变肿瘤微环境，使其更具免疫原性 | NA | 研究EZH2抑制剂在肺鳞状细胞癌中增强免疫检查点抑制剂反应的效果 | 肺鳞状细胞癌（LSCC）及其免疫微环境 | 数字病理学 | 肺鳞状细胞癌 | ChIP-seq, 单细胞RNA测序 | NA | mRNA, 蛋白质 | 使用2D人类癌细胞系以及3D鼠源和患者来源的类器官进行实验 |
| 15825 | 2024-08-07 |
A TREM2-activating antibody with a blood-brain barrier transport vehicle enhances microglial metabolism in Alzheimer's disease models
2023-03, Nature neuroscience
IF:21.2Q1
DOI:10.1038/s41593-022-01240-0
PMID:36635496
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研究论文 | 本文描述了一种高亲和力的人源TREM2激活抗体，该抗体通过单价的转铁蛋白受体（TfR）结合位点工程化，称为抗体运输载体（ATV），以促进血脑屏障的转运，从而增强阿尔茨海默病模型中的小胶质细胞代谢。 | 开发了一种新型的高亲和力TREM2激活抗体，结合了抗体运输载体（ATV）技术，以改善血脑屏障的穿透性和小胶质细胞的代谢活性。 | NA | 探索通过激活TREM2受体来改善阿尔茨海默病患者脑内小胶质细胞功能和代谢的治疗策略。 | TREM2激活抗体及其在阿尔茨海默病模型中的应用。 | 生物技术 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 使用人诱导多能干细胞（iPSC）衍生的小胶质细胞和阿尔茨海默病小鼠模型进行研究。 |
| 15826 | 2024-08-04 |
Single cell transcriptomics identifies adipose tissue CD271+ progenitors for enhanced angiogenesis in limb ischemia
2023-Feb-13, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.02.09.527726
PMID:36865239
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析，我们识别了来自皮下脂肪组织的CD271+前体细胞，具有增强的血管生成能力 | 该研究首次识别出皮下脂肪组织CD271+前体细胞，展示了它们在小鼠肢体缺血模型中显著的血管生成潜力 | 研究未涉及体内实验以进一步验证CD271+前体细胞在临床应用中的效果 | 探讨在肢体缺血中采用CD271+前体细胞作为治疗方法的潜力 | 主要研究对象为CD271+前体细胞及其在小鼠模型中的血管生成能力 | 数字病理学 | 肢体缺血 | 单细胞转录组分析 | 小鼠异种移植模型 | 基因表达数据 | 未提供具体样本数量 |
| 15827 | 2024-08-04 |
A Novel Molecular Classification Method for Glioblastoma Based on Tumor Cell Differentiation Trajectories
2023, Stem cells international
IF:3.8Q2
DOI:10.1155/2023/2826815
PMID:37964983
|
研究论文 | 本文提出了一种基于肿瘤细胞分化轨迹的新的胶质母细胞瘤分子分类方法 | 探索了基于单细胞转录组测序(scRNA-seq)数据的分化轨迹推断在胶质母细胞瘤分子分类中的应用 | 该研究仅使用了10个胶质母细胞瘤样本的单细胞数据，并在公共队列中验证其结果 | 研究新的胶质母细胞瘤分子分类，以便于治疗选择和提高癌症患者的反应率 | 10个胶质母细胞瘤样本的单细胞转录组测序数据 | 数字病理学 | 胶质瘤 | 单细胞转录组测序(串行单细胞RNA测序) | NA | 基因表达数据 | 10个胶质母细胞瘤样本 |
| 15828 | 2024-08-04 |
Tsp-1+ microglia attenuate retinal neovascularization by maintaining the expression of Smad3 in endothelial cells through exosomes with decreased miR-27a-5p
2023, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.84236
PMID:37441592
|
研究论文 | 本文探讨了微胶质细胞通过调节Smad3的表达而影响视网膜新血管生成的机制 | 揭示了Tsp-1/miR-27a-5p/Smad3轴在微胶质细胞相关和外泌体介导的抗血管生成调控中的新机制 | 文章中未提到实验样本的多样性和长期效果的观察 | 研究视网膜微胶质细胞在病理性新血管生成中的作用及其机制 | 小鼠视网膜中微胶质细胞和内皮细胞 | 数字病理 | NA | 单细胞RNA测序，外泌体分离，miRNA测序，荧光素酶报告试验 | NA | RNA数据 | 小鼠视网膜样本 |
| 15829 | 2024-08-04 |
Ferritin light chain promotes the reprogramming of glioma immune microenvironment and facilitates glioma progression
2023, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.82975
PMID:37441589
|
研究论文 | 这篇文章研究了铁蛋白轻链（FTL）如何促进胶质瘤的免疫微环境重编程和胶质瘤进展 | 本研究首次揭示了FTL在胶质瘤免疫微环境中的作用机制，并探索了抑制FTL对改进抗PD-1治疗效果的潜在策略 | 尚不清楚FTL在胶质瘤免疫微环境中的所有调控机制，未来研究需要进一步验证 | 研究FTL在胶质瘤免疫微环境中的作用以及其对胶质瘤进展的影响 | 研究对象为胶质瘤相关的巨噬细胞（TAMs）及其在肿瘤微环境中的作用 | 数字病理学 | 胶质瘤 | RNA测序 | NA | 生物信息学数据 | 在胶质瘤的TAMs中分析了bulk和单细胞RNA-seq水平的样本 |
| 15830 | 2024-08-07 |
Microtubule stabilization targeting regenerative chondrocyte cluster for cartilage regeneration
2023, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.85077
PMID:37351173
|
研究论文 | 本研究旨在探索骨关节炎（OA）病理条件下软骨细胞（CHs）再生的潜在机制及其治疗策略 | 发现微管稳定化在促进软骨再生中的作用，并揭示了其通过抑制YAP活性来实现的效果 | NA | 探索软骨细胞在骨关节炎病理条件下的再生机制及其治疗策略 | 从不同OA阶段的人体软骨中分离出的软骨细胞 | NA | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 人源性软骨细胞及大鼠软骨损伤模型 |
| 15831 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing identifies critical transcription factors of tumor cell invasion induced by hypoxia microenvironment in glioblastoma
2023, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.81407
PMID:37441593
|
研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术，研究了低氧微环境对胶质母细胞瘤细胞侵袭的影响，并识别了关键的转录因子 | 提出了一个数据驱动的建模框架CHPF，用于预测细胞低氧状态，并揭示了低氧亚群中具有高度侵袭潜力的关键调控因子 | NA | 阐明低氧对胶质母细胞瘤侵袭的影响 | 胶质母细胞瘤细胞及其在低氧微环境中的侵袭行为 | 数字病理学 | 脑癌 | 单细胞RNA测序 | 数据驱动的建模框架 | 转录组 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 15832 | 2024-08-07 |
Single-cell analysis of castration-resistant prostate cancers to identify potential biomarkers for diagnosis and prognosis of neuroendocrine prostate cancer
2023, American journal of cancer research
IF:3.6Q2
PMID:37970364
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研究论文 | 本文通过单细胞分析去势抵抗性前列腺癌，旨在识别神经内分泌前列腺癌的潜在诊断和预后生物标志物。 | 本文首次采用重新聚类特定细胞类型的方法，研究神经内分泌前列腺癌的异质性，并识别出三种神经内分泌状态，其中N-Myc和REST在介导谱系可塑性和分类神经内分泌表型中起中心作用。 | 文章指出，前列腺癌中神经内分泌细胞的高异质性和低比例限制了传统批量RNA测序和单细胞RNA测序在寻找更好生物标志物方面的应用。 | 识别神经内分泌前列腺癌的潜在诊断和预后生物标志物。 | 去势抵抗性前列腺癌样本中的神经内分泌细胞。 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 多个去势抵抗性前列腺癌样本 |
| 15833 | 2024-08-07 |
Exploring tissue architecture using spatial transcriptomics
2021-08, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-021-03634-9
PMID:34381231
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综述 | 本文综述了空间转录组技术及其在生物学研究中的应用 | 介绍了空间转录组技术在探索组织结构中的创新应用 | NA | 探讨基因活动如何调控多细胞生物中的复杂细胞排列 | 空间转录组技术在神经科学、发育生物学、植物生物学及疾病研究中的应用 | 生物信息学 | 癌症 | 下一代测序技术 | NA | 转录组数据 | NA |
| 15834 | 2024-08-07 |
De novo gene signature identification from single-cell RNA-seq with hierarchical Poisson factorization
2019-02-22, Molecular systems biology
IF:8.5Q1
DOI:10.15252/msb.20188557
PMID:30796088
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研究论文 | 本文介绍了一种名为单细胞层次泊松分解（scHPF）的贝叶斯分解方法，用于从单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据中发现连续和离散的表达模式 | scHPF方法不需要预先归一化，并且能更好地捕捉单细胞数据的统计特性 | NA | 开发一种新的方法来识别单细胞RNA测序数据中的基因特征 | 单细胞RNA测序数据中的基因表达模式 | 数字病理学 | 脑瘤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 层次泊松分解（HPF） | 基因表达数据 | 高级别胶质瘤的核心和边缘区域的单细胞RNA测序数据 |
| 15835 | 2024-08-07 |
Single-Cell RNA Sequencing of Visceral Adipose Tissue Leukocytes Reveals that Caloric Restriction Following Obesity Promotes the Accumulation of a Distinct Macrophage Population with Features of Phagocytic Cells
2019, Immunometabolism
DOI:10.20900/immunometab20190008
PMID:31396408
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析内脏脂肪组织中的白细胞，探讨肥胖后热量限制对特定巨噬细胞亚群积累的影响 | 首次揭示了肥胖后热量限制促进具有吞噬细胞特征的特定巨噬细胞亚群的积累 | 研究仅限于短期2周的热量限制效果，长期影响需进一步研究 | 探究肥胖及随后热量限制对内脏脂肪组织中白细胞亚群的影响 | 内脏脂肪组织中的白细胞，特别是巨噬细胞 | 数字病理学 | 肥胖 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及15种白细胞亚群的转录变化 |
| 15836 | 2024-08-07 |
Patch-Seq Protocol to Analyze the Electrophysiology, Morphology and Transcriptome of Whole Single Neurons Derived From Human Pluripotent Stem Cells
2018, Frontiers in molecular neuroscience
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fnmol.2018.00261
PMID:30147644
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研究论文 | 本文介绍了一种名为Patch-seq的新方法，结合单细胞RNA测序（scRNA-seq）、膜片钳电生理记录和形态学分析，用于全面分析从人多能干细胞衍生的单个神经元的电生理、形态和转录组特征。 | Patch-seq方法的创新之处在于它能够同时进行多模态的神经元分析，揭示功能特性、形态和基因表达之间的联系。 | NA | 研究目的是通过Patch-seq方法深入剖析神经元的类型和状态，揭示人类神经多样性的分子基础，并探索脑部疾病的细胞机制。 | 研究对象是从人胚胎和诱导多能干细胞（ESCs/iPSCs）衍生的单个神经元。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 研究中使用了从健康受试者衍生的胚胎和诱导多能干细胞（ESCs/iPSCs）衍生的神经元。 |
| 15837 | 2024-08-07 |
Differentiation dynamics of mammary epithelial cells revealed by single-cell RNA sequencing
2017-12-11, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-017-02001-5
PMID:29225342
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，分析了四个发育阶段的乳腺上皮细胞（MECs）的基因表达谱 | 研究提出了乳腺上皮细胞应被视为连续分化谱系的一部分，并支持存在一个共同的腔内祖细胞 | NA | 揭示乳腺上皮细胞的分化动态及其在成人发育中的调控机制 | 乳腺上皮细胞在不同发育阶段的分化动态 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 23,184个细胞 |
| 15838 | 2024-08-07 |
Functional characterization of human pluripotent stem cell-derived arterial endothelial cells
2017-07-25, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.1702295114
PMID:28696312
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研究论文 | 本文报道了从人多能干细胞中衍生出的动脉内皮细胞，这些细胞在体外和体内表现出动脉特异性功能 | 结合单细胞RNA测序和双报告人胚胎干细胞系，识别调控动脉内皮细胞分化的因子，并开发了一种无异种成分的培养协议 | NA | 研究人多能干细胞衍生的动脉内皮细胞的功能特性 | 人多能干细胞衍生的动脉内皮细胞 | 再生医学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 多个人的胚胎和诱导多能干细胞系 |
| 15839 | 2024-08-04 |
Alternative Polyadenylation Characterizes Epithelial and Fibroblast Phenotypic Heterogeneity in Pancreatic Ductal Adenocarcinoma
2024-Feb-02, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers16030640
PMID:38339391
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研究论文 | 这篇文章探讨了3'非翻译区选择性聚腺苷酸化(3' UTR-APA)如何特征化胰腺导管腺癌中的表型异质性 | 文章首次揭示了3' UTR-APA事件在肿瘤细胞状态表型异质性中的作用 | 目前未能完全理解转录和表型异质性的机制驱动因素 | 研究3' UTR-APA如何影响肿瘤细胞状态的表型异质性 | 胰腺导管腺癌中的不同细胞状态 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞测序 | NA | NA | 最大的单细胞人胰腺导管腺癌(PDAC)数据集 |
| 15840 | 2024-08-04 |
Identification of Hypoxia Prognostic Signature in Glioblastoma Multiforme Based on Bulk and Single-Cell RNA-Seq
2024-Feb-01, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers16030633
PMID:38339384
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研究论文 | 本研究旨在基于多组学分析识别脑胶质瘤中的缺氧预后标志 | 提出了一种由六个基因组成的缺氧相关预后标志，并揭示其与免疫细胞浸润的相关性 | 研究可能受限于公共数据库样本的选择和多组学分析的复杂性 | 识别缺氧相关的差异表达基因并构建脑胶质瘤患者的预后模型 | 脑胶质瘤患者的缺氧相关基因 | 数字病理 | 脑胶质瘤 | RNA-Seq | Cox回归 | 基因表达数据 | 从多个公共数据库收集的样本数量不详 |