单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 1561 - 1580 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1561 | 2025-10-05 |
Large-scale proteomics analysis identifies plasma protein biomarkers and potential therapeutic targets for rheumatoid arthritis: A prospective study in UK Biobank
2025-Nov, Bone
IF:3.5Q2
DOI:10.1016/j.bone.2025.117593
PMID:40669587
|
研究论文 | 通过大规模蛋白质组学分析鉴定类风湿关节炎的血浆蛋白生物标志物和潜在治疗靶点 | 整合蛋白质组学、全基因组关联研究和单细胞RNA测序数据，系统评估RA风险相关蛋白并识别新型治疗靶点 | 预测模型性能中等(AUC=0.74)，样本量相对有限 | 识别类风湿关节炎的生物标志物和潜在治疗靶点 | 类风湿关节炎患者和健康对照者 | 生物信息学 | 类风湿关节炎 | 蛋白质组学, GWAS, 单细胞RNA测序 | XGBoost | 蛋白质组数据, 基因组数据, 转录组数据 | 706例RA患者和1410例对照 | NA | 蛋白质组学, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1562 | 2025-10-05 |
Single-cell sequencing revealed the recurrence causes of ETV6:RUNX1 fusion-positive B-ALL in children
2025-Oct, Molecular and cellular probes
IF:2.3Q4
DOI:10.1016/j.mcp.2025.102041
PMID:40659095
|
研究论文 | 通过单细胞测序技术探究ETV6:RUNX1融合阳性儿童B-ALL复发的潜在机制 | 首次在单细胞水平揭示ETV6:RUNX1阳性B-ALL复发样本中免疫细胞组成变化、代谢通路转换和细胞间相互作用机制 | 样本量较小（仅4例患者），需要更大规模研究验证发现 | 揭示ETV6:RUNX1融合阳性B-ALL患儿复发的驱动通路 | ETV6:RUNX1融合阳性B-ALL患儿（包括新诊断和复发病例） | 单细胞组学 | B细胞急性淋巴细胞白血病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 4例B-ALL患者（3例新诊断，1例复发，选自25例患者队列） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1563 | 2025-10-05 |
Establishment of CRISPR/Cas9 lineage tracking technology for pig embryos
2025-Oct, Molecular and cellular probes
IF:2.3Q4
DOI:10.1016/j.mcp.2025.102046
PMID:40816522
|
研究论文 | 开发了一种结合分子条形码和单细胞转录组学的猪胚胎谱系追踪技术 | 首次在猪胚胎中建立了结合CRISPR/Cas9分子条形码和单细胞RNA测序的高分辨率谱系追踪系统 | NA | 研究猪组织发育过程并重建细胞谱系树 | 猪胚胎细胞 | 发育生物学 | NA | CRISPR/Cas9基因编辑、piggyBac转座、单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据、单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1564 | 2025-10-05 |
Single-Cell Analysis Reveals a Critical Role for Macrophage Epsins in Regulating the Origin of Foam Cells in Atherosclerosis
2025-Sep-11, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
DOI:10.1161/ATVBAHA.125.323288
PMID:40931837
|
研究论文 | 本研究通过单细胞分析揭示了巨噬细胞epsins在调控动脉粥样硬化泡沫细胞形成中的关键作用 | 首次发现巨噬细胞特异性表达epsins通过促进血管平滑肌细胞向巨噬细胞转化加速动脉粥样硬化 | 研究基于小鼠模型，人类临床相关性需进一步验证 | 探究巨噬细胞epsins在动脉粥样硬化泡沫细胞形成中的分子机制 | Apoe缺陷小鼠和髓系特异性epsin 1/2缺失小鼠 | 单细胞分析 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序，代谢分析，qRT-PCR，免疫染色，共培养实验 | NA | 单细胞转录组数据 | WT/Apoe-/-和LysM-DKO/Apoe-/-小鼠，西式饮食喂养16周 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1565 | 2025-10-05 |
Extracellular matrix-myCAF signatures correlate with resistance to neoadjuvant aPD-L1 immune checkpoint inhibition with durvalumab + metformin in HPV+ HNSCC
2025-Sep-11, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-25-1098
PMID:40932382
|
研究论文 | 本研究通过多组学分析揭示了HPV阳性头颈鳞癌患者对新辅助免疫检查点抑制剂联合二甲双胍治疗反应与抵抗的分子特征 | 首次在HPV阳性头颈鳞癌中发现细胞外基质-肌成纤维样癌相关成纤维细胞特征与免疫联合治疗抵抗相关，并识别出朗格汉斯样树突状细胞状态作为治疗反应的预测标志物 | 样本量有限，仅针对HPV阳性头颈鳞癌患者，且为单中心研究 | 探索HPV阳性头颈鳞癌患者对durvalumab联合二甲双胍新辅助治疗反应与抵抗的预测标志物和机制 | 未经治疗的非糖尿病HPV阳性头颈鳞癌患者 | 数字病理学 | 头颈鳞癌 | 多组学分析, 空间转录组学 | NA | 临床数据, 病理数据, 转录组数据, 空间转录组数据 | 随机新辅助临床试验(NCT03618654)的参与者 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1566 | 2025-10-05 |
Unveiling the genetic overlap and causal links between gastroesophageal reflux disease and asthma
2025-Sep-11, International journal of surgery (London, England)
DOI:10.1097/JS9.0000000000003283
PMID:40932390
|
研究论文 | 本研究通过多种遗传分析方法揭示了胃食管反流病和哮喘之间的遗传重叠和因果关系 | 新发现56个GERD与哮喘共享风险位点，其中51个为新发现位点，并识别出3个新的共享基因(RBM6、SUOX、MPHOSPH9) | 基于欧洲人群的GWAS数据，结果可能不适用于其他人群 | 探究胃食管反流病与哮喘之间的遗传重叠和因果关系 | GERD患者(71,522例)和对照(261,079例)，哮喘患者(56,167例)和对照(352,255例) | 遗传学 | 胃食管反流病,哮喘 | GWAS, LDSC, 孟德尔随机化, 跨性状meta分析, 共定位分析, SMR, TWAS, scRNA-seq | NA | 基因组关联数据, 基因表达数据 | GERD: 71,522病例/261,079对照; 哮喘: 56,167病例/352,255对照 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1567 | 2025-10-05 |
The PAR-score based on PANoptosis genes predicts the progression of ulcerative colitis and the response to anti-TNF-α treatment
2025-Sep-11, Genes & genomics
IF:1.6Q3
DOI:10.1007/s13258-025-01675-2
PMID:40932643
|
研究论文 | 基于PANoptosis基因开发PAR-score预测溃疡性结肠炎进展及抗TNF-α治疗反应 | 首次将PANoptosis（整合焦亡、凋亡和坏死性凋亡的协调细胞死亡机制）特征应用于溃疡性结肠炎进展和结肠炎相关结直肠癌风险的预测模型构建 | 研究主要基于公共数据库的转录组数据，需要进一步实验验证 | 阐明PANoptosis在溃疡性结肠炎进展中的作用并开发预测模型 | 溃疡性结肠炎患者、结肠炎相关结直肠癌病例和对照样本 | 生物信息学 | 溃疡性结肠炎 | 转录组分析、单细胞测序、孟德尔随机化、分子对接 | 风险评分模型 | 基因表达数据 | 来自GEO数据库的UC患者、CAC病例和对照样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 转录组测序 | NA | NA |
| 1568 | 2025-10-05 |
scGraphDap: Integrating Functional State Pseudo-labels and Graph Structure Learning for Robust Cell Type Annotation in Tumor Microenvironments
2025-Sep-10, IEEE journal of biomedical and health informatics
IF:6.7Q1
DOI:10.1109/JBHI.2025.3607687
PMID:40928910
|
研究论文 | 提出scGraphDap图神经网络框架，通过整合功能状态伪标签和图结构学习改进肿瘤微环境中的细胞类型注释和细胞间通讯推断 | 利用通路活性评分作为伪标签优化细胞-细胞图以捕获功能邻近性，并采用图域适应模块对齐不同患者间的细胞嵌入 | 基于非空间scRNA-seq数据，受限于不完整的配体-受体数据库和嘈杂的细胞类型注释 | 改进肿瘤微环境中细胞类型注释和细胞间通讯推断的准确性 | 肿瘤微环境中的细胞 | 单细胞分析 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | 图神经网络(GNN) | 单细胞RNA测序数据 | 来自15名患者的38,667个细胞，涵盖三种癌症类型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1569 | 2025-10-05 |
scSPAF: Cell Similarity Purified Adaptive Fusion Network for Single-Cell Multi-Omics Clustering
2025-Sep-10, IEEE transactions on computational biology and bioinformatics
DOI:10.1109/TCBBIO.2025.3608251
PMID:40928916
|
研究论文 | 提出了一种用于单细胞多组学聚类的细胞相似性纯化自适应融合网络scSPAF | 采用多级融合方法探索组学数据的一致性和互补性，设计了细胞相似性纯化模块和自适应融合机制 | NA | 提高单细胞多组学聚类分析的性能 | 单细胞多组学数据 | 机器学习 | NA | 单细胞多组学测序 | 自适应融合网络 | 单细胞多组学数据 | 六个真实世界数据集 | NA | 单细胞多组学 | NA | NA |
| 1570 | 2025-10-05 |
Interferon-induced senescent CD8+ T cells reduce anti-PD1 immunotherapy efficacy in early triple-negative breast cancer
2025-Sep-10, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.adj7808
PMID:40929245
|
研究论文 | 本研究通过单细胞测序发现干扰素诱导的衰老CD8+ T细胞是早期三阴性乳腺癌免疫治疗无效的关键因素 | 首次发现干扰素诱导的CD8+ T细胞衰老是早期三阴性乳腺癌免疫治疗无效的驱动因素，并提出了烟酰胺单核苷酸治疗策略 | 样本量相对有限（171例患者），需要在更大队列中验证 | 探索早期三阴性乳腺癌免疫治疗无效的机制并寻找解决方案 | 早期三阴性乳腺癌患者样本、患者来源类器官和小鼠模型 | 数字病理学 | 三阴性乳腺癌 | 单细胞RNA测序, 批量转录组学, 病理学检测 | NA | 基因表达数据, 病理图像 | 171例早期三阴性乳腺癌患者 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 1571 | 2025-10-05 |
Igf2 regulates early postnatal DPP4+ preadipocyte pool expansion
2025-Sep-10, Genes & development
IF:7.5Q1
DOI:10.1101/gad.352710.125
PMID:40930990
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了早期生命阶段脂肪组织快速扩张的机制，发现IGF2通过驱动DPP4+前体脂肪细胞增殖而非分化来促进脂肪组织发育 | 首次发现IGF2在早期发育阶段特异性表达于皮下脂肪组织网状间质中的DPP4+前体细胞群，并阐明其通过促进细胞增殖而非分化来扩大前体脂肪细胞库 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类组织中验证；机制研究可能不够深入 | 阐明早期生命阶段脂肪组织快速扩张的分子机制 | 小鼠皮下脂肪组织，特别是DPP4+前体脂肪细胞 | 单细胞生物学 | 代谢性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 幼年和成年小鼠皮下脂肪组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1572 | 2025-10-05 |
Endothelial cell-ILC3 crosstalk via the ET-1/EDNRA axis promotes NKp46+ILC3 glycolysis to alleviate intestinal inflammation
2025-Sep-10, Cellular & molecular immunology
IF:21.8Q1
DOI:10.1038/s41423-025-01345-z
PMID:40931105
|
研究论文 | 本研究揭示了肠道内皮细胞通过ET-1/EDNRA轴与ILC3细胞互作，促进NKp46+ILC3糖酵解代谢以缓解肠道炎症的新机制 | 首次发现肠道内皮细胞与ILC3细胞间的相互作用，并阐明ET-1/EDNRA轴通过调控HIF-1α和AKT信号通路促进ILC3糖酵解代谢的分子机制 | NA | 探究肠道内皮细胞与ILC3细胞间相互作用在肠道炎症调控中的作用机制 | 肠道内皮细胞、第3组固有淋巴细胞(ILC3)、NKp46+ILC3亚群 | 免疫学 | 肠道炎症 | 单细胞转录组分析、蛋白质表达检测 | NA | 转录组数据、蛋白质表达数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 1573 | 2025-10-05 |
Influence of Age on Fracture Healing in Young and Middle-Aged Mice in a Proximal Femur Fracture Model
2025-Sep-10, Journal of orthopaedic research : official publication of the Orthopaedic Research Society
IF:2.1Q2
DOI:10.1002/jor.70063
PMID:40931376
|
研究论文 | 本研究通过小鼠股骨近端骨折模型探讨年龄对骨折愈合的影响 | 首次在年轻和中年小鼠中系统比较股骨近端骨折愈合差异，并发现p21衰老细胞和SASP因子在年龄相关愈合延迟中的作用 | 研究仅使用雄性C57BL/6J小鼠，结果可能不适用于雌性或其他品系小鼠 | 确定年龄对小鼠股骨近端骨折愈合的影响，验证该模型用于研究年龄相关骨折愈合延迟分子机制的适用性 | 12周和52周龄雄性C57BL/6J小鼠 | 骨生物学 | 骨质疏松性骨折 | 多重细胞因子分析,μCT分析,组织形态计量学,免疫染色,空间转录组学 | NA | 图像,分子表达数据,组织学数据 | 年轻(12周)和中年(52周)雄性C57BL/6J小鼠 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1574 | 2025-10-05 |
Immunological microenvironment differences between left and right colon cancer: dynamic interactions of CASC15+KLK6+ epithelial subpopulation with T cells and mast cells
2025-Sep-10, International journal of surgery (London, England)
DOI:10.1097/JS9.0000000000003453
PMID:40932351
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示左右结肠癌免疫微环境差异，发现右结肠癌特有的CASC15⁺KLK6⁺上皮亚群与免疫细胞互作机制 | 首次在单细胞层面鉴定出右结肠癌特有的CASC15⁺KLK6⁺恶性上皮亚群，并揭示其通过MIF和CD99信号通路与T细胞、肥大细胞的动态互作 | 样本量较小（6例单细胞测序，70例验证），需更大队列验证发现 | 探究左右结肠癌免疫微环境差异及其分子机制 | 结肠癌患者肿瘤组织 | 单细胞组学 | 结肠癌 | 单细胞RNA测序，免疫荧光 | Seurat, inferCNV, Monocle2, GSVA, CellChat | 单细胞转录组数据，图像数据 | 6例单细胞测序（3左结肠癌+3右结肠癌），70例验证（30左结肠癌+40右结肠癌） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1575 | 2025-10-05 |
Single-cell transcriptome analysis reveals regulatory programs associated with tumor resistance during immunotherapy in colorectal cancer
2025-Sep-10, International journal of surgery (London, England)
DOI:10.1097/JS9.0000000000003459
PMID:40932376
|
研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示结直肠癌免疫治疗耐药相关的调控程序 | 首次在转移性dMMR结直肠癌中系统分析T细胞亚群在免疫治疗耐药中的作用机制，发现KLRB1作为新型生物标志物 | 样本量相对有限，机制研究主要基于相关性分析 | 探究结直肠癌免疫治疗耐药的分子机制 | 转移性DNA错配修复缺陷结直肠癌患者 | 单细胞转录组学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序, 基因集富集分析, 细胞通讯分析, 免疫组化 | NA | 单细胞转录组数据, 临床样本 | 190例结直肠癌患者及其配对癌旁组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1576 | 2025-10-05 |
CRISPR-based genetic tools for the study of host-microbe interactions
2025-Sep-09, Infection and immunity
IF:2.9Q2
DOI:10.1128/iai.00510-24
PMID:40757822
|
综述 | 本文综述了基于CRISPR的遗传工具在研究宿主-微生物相互作用中的应用与进展 | 系统总结了CRISPR工具在宿主-微生物互作研究中的创新应用，包括筛选、基因组编辑和记录系统，以及与单细胞RNA测序等新兴技术的结合 | 当前工具仍存在一定局限性，需要进一步发展更先进的遗传工具包 | 研究宿主-微生物相互作用的遗传基础及其在健康和疾病中的作用 | 宿主细胞、微生物细胞和动物模型 | 基因编辑技术 | 与宿主-微生物相互作用相关的疾病 | CRISPR基因编辑, 单细胞RNA测序 | NA | 遗传数据, 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1577 | 2025-10-05 |
Analyzing the toxicological effects of PET-MPs on male infertility: Insights from network toxicology, mendelian randomization, and transcriptomics
2025-Sep-09, Reproductive biology
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.repbio.2025.101076
PMID:40929757
|
研究论文 | 本研究通过多组学方法探究PET微塑料导致男性不育的分子机制 | 首次整合网络毒理学、孟德尔随机化和转录组学方法揭示PET-MPs通过CLK4基因影响男性不育的新机制 | 研究主要基于生物信息学分析，需要进一步实验验证 | 探究PET微塑料对男性生殖功能的毒性作用机制 | 男性不育相关基因和细胞类型 | 生物信息学 | 男性不育症 | 网络毒理学, 孟德尔随机化, 转录组学, 分子对接, 分子动力学模拟 | SMR分析 | 基因组数据, 转录组数据 | NA | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 1578 | 2025-10-05 |
Targeting annexin A2 enhances anti-PD-1 immunotherapy in pancreatic ductal adenocarcinoma by remodeling the tumor immune microenvironment
2025-Sep-09, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2025.115504
PMID:40929955
|
研究论文 | 本研究探讨膜联蛋白A2在胰腺导管腺癌中的作用及其作为免疫治疗靶点的潜力 | 首次通过单细胞RNA测序发现ANXA2表达与PDAC患者预后不良相关，并证实ANXA2抑制可增强抗PD-1免疫疗法效果 | 研究主要基于小鼠模型，需要进一步临床验证 | 探索ANXA2在PDAC免疫治疗中的作用机制 | 胰腺导管腺癌组织和细胞 | 癌症免疫学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序, 共培养系统, 流式细胞术, 蛋白质印迹法 | 小鼠PDAC模型 | 基因表达数据, 蛋白质数据, 细胞表型数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1579 | 2025-10-05 |
Combinatorial BMP4 and activin direct the choice between alternate routes to endoderm in a stem cell model of human gastrulation
2025-Sep-09, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2025.08.009
PMID:40930099
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学、活细胞成像和数学模型探索了activin和BMP4信号如何指导人类原肠胚形成过程中的命运特化 | 揭示了细胞命运决定的谱系收敛现象：定型内胚层可通过从多能性直接分化和经由中胚层祖细胞状态的间接分化两条路径产生 | 研究基于干细胞模型，可能与体内真实发育过程存在差异 | 探索组合信号如何影响人类原肠胚形成过程中的细胞命运决定 | 人类干细胞模型 | 发育生物学 | NA | 单细胞转录组学, 活细胞成像, 数学模型 | NA | 转录组数据, 成像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1580 | 2025-10-05 |
Single-cell MultiOmics and spatial transcriptomics demonstrate neuroblastoma developmental plasticity
2025-Sep-08, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2025.04.013
PMID:40347947
|
研究论文 | 本研究通过单细胞多组学和空间转录组学技术揭示了神经母细胞瘤的发育可塑性机制 | 首次结合小鼠自发肿瘤模型的单细胞多组学和人类患者样本的空间转录组学，揭示了神经母细胞瘤发育中间状态及其恶性转化的表观遗传调控机制 | 研究样本数量有限，主要依赖小鼠模型和部分人类样本 | 解析神经母细胞瘤发育可塑性的调控机制 | 神经母细胞瘤小鼠模型和人类患者样本 | 数字病理学 | 神经母细胞瘤 | 单细胞多组学, 空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据, 表观遗传数据, 空间基因表达数据 | NA | NA | 单细胞多组学, 空间转录组学 | NA | NA |