单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 31051 篇文献，本页显示第 1561 - 1580 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1561 | 2025-08-03 |
The intricate cellular ecosystem of human peripheral veins as revealed by single-cell transcriptomic analysis
2024, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0296264
PMID:38206912
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示人类外周静脉复杂的细胞生态系统 | 首次在单细胞水平上解析了非病变人类上臂静脉的微解剖结构，揭示了静脉内皮细胞、平滑肌细胞、成纤维细胞和免疫细胞群的复杂生态系统 | 研究仅基于4个非病变静脉样本，样本量较小 | 探索静脉壁结构、重塑过程和炎症反应的细胞基础 | 人类上臂静脉（3条贵要静脉，1条头静脉） | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 无监督聚类 | 转录组数据 | 4个非病变人类静脉样本，共20,006个细胞 |
| 1562 | 2025-08-03 |
Enrichment of a neutrophil-like monocyte transcriptional state in glioblastoma myeloid suppressor cells
2023-Dec-28, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-3793353/v1
PMID:38234734
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研究论文 | 该研究通过单细胞转录组学揭示了胶质母细胞瘤（GBM）患者血液中单核髓源性抑制细胞（M-MDSC）的异质性，并发现了一种类似于中性粒细胞样单核细胞（NeuMo）的转录状态富集现象 | 发现了GBM患者M-MDSC中NeuMo转录状态的富集现象，并创建了量化这一状态的算法，同时揭示了地塞米松等药物对这一状态的影响 | 研究主要基于转录组数据，缺乏对M-MDSC功能特性的直接验证 | 探究胶质母细胞瘤中M-MDSC的异质性及其与免疫抑制的关系 | 胶质母细胞瘤、肺癌和头颈癌患者的M-MDSC | 肿瘤免疫学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 来自GBM、肺癌和头颈癌患者的M-MDSC样本 |
| 1563 | 2025-08-02 |
Endothelial Tgfbr2 Deficiency Ameliorate Liver Fibrosis Through Regulating Angiocrine Signalling and Macrophage Accumulation
2025-Sep, Liver international : official journal of the International Association for the Study of the Liver
IF:6.0Q1
DOI:10.1111/liv.70227
PMID:40747899
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研究论文 | 本研究探讨了内皮细胞中TGF-β信号在肝纤维化中的作用及其机制 | 首次揭示了内皮细胞特异性Tgfbr2缺失通过调节血管分泌信号和巨噬细胞积累改善肝纤维化的机制 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床应用的转化仍需进一步验证 | 探究TGF-β信号在肝窦内皮细胞(LSECs)中对肝纤维化的影响 | 肝窦内皮细胞(LSECs)和肝纤维化过程 | 肝脏病理学 | 肝纤维化 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq), RNA测序, qPCR, western blotting, 免疫染色, 流式细胞术 | 内皮细胞特异性Tgfbr2敲除小鼠模型 | 基因表达数据, 组织学数据 | 健康人群和肝硬化患者的scRNA-seq数据集, 基因敲除小鼠模型 |
| 1564 | 2025-08-02 |
Tumor Necrosis Factor Receptor Superfamily Member 12A Enhances Retinal Ganglion Cell Survival and Promotes Axon Regeneration
2025-Aug-15, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202500988RR
PMID:40747811
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析发现Tnfrsf12a（Fn14）在促进视网膜神经节细胞（RGCs）存活和轴突再生中的关键作用 | 首次揭示Fn14在αRGCs/ipRGCs中通过调控轴突再生相关生物过程发挥神经保护和再生作用，并验证其通过下调Socs3实现功能 | 研究仅在小鼠模型中进行，尚未验证其在人类或其他哺乳动物中的适用性 | 探索增强成年哺乳动物视网膜神经节细胞损伤后再生能力的转录调控途径 | 小鼠视网膜神经节细胞（RGCs） | 神经再生 | 视神经损伤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、AAV2病毒载体转染、CTB标记、免疫染色、视网膜电图（ERG） | NA | 转录组数据、图像数据、电生理数据 | 小鼠视神经压伤（ONC）和NMDA诱导视网膜毒性两种损伤模型 |
| 1565 | 2025-08-02 |
Surgical and blood-based minimal residual disease in patients with ovarian cancer after frontline therapy: Clinical outcomes and translational opportunities
2025-Aug-01, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-25-0512
PMID:40748258
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研究论文 | 探讨卵巢癌患者一线治疗后通过二次腹腔镜检查和循环肿瘤DNA检测微小残留病灶的预后和转化价值 | 首次结合手术和血液检测方法评估微小残留病灶，并应用空间多组学技术探索其生物学特征 | 样本量相对有限（95例患者），且空间多组学分析仅在部分患者中进行 | 评估微小残留病灶检测在卵巢癌预后判断和治疗靶点发现中的价值 | 高级别上皮性卵巢癌患者 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 二次腹腔镜检查(SLL), 循环肿瘤DNA(ctDNA)检测, 空间转录组学(GeoMx和Visium), 蛋白质组学(CODEX) | NA | 临床数据, 分子生物学数据 | 95例高级别上皮性卵巢癌患者，其中44例同时接受了SLL和ctDNA检测 |
| 1566 | 2025-08-02 |
Glucokinase activators contribute to gastrointestinal disease risks through metabolic-immune interplay in the gut-liver axis: insights from a multi-omics study
2025-Aug-01, Acta diabetologica
IF:3.1Q2
DOI:10.1007/s00592-025-02571-7
PMID:40748365
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研究论文 | 本研究探讨了葡萄糖激酶激活剂（GKAs）通过代谢-免疫相互作用对胃肠道疾病风险的影响 | 揭示了GK-GKRP解离通过代谢-免疫互作增加IBD和MASLD风险的机制，并识别了关键介质和细胞间通讯信号 | 研究基于遗传变异作为代理，可能无法完全反映药物直接作用 | 探究两种GK激活方式对胃肠道疾病的差异化影响机制 | 葡萄糖激酶激活剂（GKAs）及其对胃肠道疾病的影响 | 代谢组学与免疫学 | 炎症性肠病（IBD）和代谢功能障碍相关脂肪性肝病（MASLD） | 孟德尔随机化、多组学分析（包括scRNA-seq和Cellchat） | NA | 遗传变异数据、蛋白质组数据、单细胞转录组数据 | NA（基于公开数据库的遗传和组学数据） |
| 1567 | 2025-08-01 |
Pan-cancer Analyses Refine the Single-Cell Portrait of Tumor-Infiltrating Dendritic Cells
2025-Jul-31, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-24-3595
PMID:40742316
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研究论文 | 通过整合33种癌症类型中超过2500个样本的单细胞RNA测序数据，建立了人类树突状细胞（DCs）的全面蓝图，揭示了肿瘤浸润DCs的异质性及其功能潜力 | 发现了肿瘤中罕见的DCs亚群（如AXL+SIGLEC6+ DCs和Langerhans细胞样DCs），并展示了它们的功能潜力及其转录组特征，同时开发了机器学习模型以指导DCs注释 | 研究主要基于计算分析，需要进一步的实验验证来确认DCs亚群的功能及其在免疫治疗中的应用潜力 | 探索肿瘤微环境中DCs的异质性及其在抗肿瘤免疫中的作用，为开发基于DCs的免疫疗法提供见解 | 肿瘤浸润的树突状细胞（DCs） | 数字病理学 | 泛癌 | 单细胞RNA测序 | 机器学习模型 | RNA测序数据 | 超过2500个样本，涵盖33种癌症类型 |
| 1568 | 2025-08-01 |
Identification and validation of tricarboxylic acid cycle-related diagnostic biomarkers for diabetic nephropathy via weighted gene co-expression network analysis and single-cell transcriptome analysis
2025-Jul-31, Acta diabetologica
IF:3.1Q2
DOI:10.1007/s00592-025-02557-5
PMID:40742465
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研究论文 | 通过加权基因共表达网络分析和单细胞转录组分析，识别并验证了三羧酸循环相关的糖尿病肾病诊断生物标志物 | 首次将三羧酸循环相关基因作为糖尿病肾病的诊断生物标志物进行研究，并构建了诊断模型 | 研究依赖于公开数据集，未进行独立队列验证 | 探索三羧酸循环相关基因在糖尿病肾病诊断中的潜力 | 糖尿病肾病患者的基因表达数据 | 生物信息学 | 糖尿病肾病 | 加权基因共表达网络分析(WGCNA), 单样本基因集富集分析(ssGSEA), 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | 机器学习模型 | 基因表达数据 | GSE131882和GSE30122数据集中的样本 |
| 1569 | 2025-07-31 |
Characterization of stem cell landscape and identification of stemness-related gene ENY2 in colorectal cancer by intergrated transcriptomic analysis
2025-Dec, Global medical genetics
IF:1.2Q4
DOI:10.1016/j.gmg.2025.100067
PMID:40735504
|
研究论文 | 通过整合转录组分析，研究结直肠癌中的干细胞景观并鉴定与干性相关的基因ENY2 | 首次通过单细胞转录组数据整合分析，鉴定出ENY2作为结直肠癌干细胞的关键标志物，并探索其在肿瘤发生和转移中的潜在作用 | 研究样本量较小（9个原发性结直肠癌样本），且ENY2在结直肠癌中的具体作用机制仍需进一步实验验证 | 阐明结直肠癌干细胞的异质性及其潜在机制，为开发有效的治疗方法提供依据 | 结直肠癌干细胞 | 数字病理 | 结直肠癌 | scRNA-seq, 生物信息学分析 | NA | 单细胞转录组数据 | 9个原发性结直肠癌样本 |
| 1570 | 2025-07-31 |
Single-cell transcriptome analysis of in vivo and in vitro human pancreas development
2025-Nov, Genes & diseases
IF:6.9Q1
DOI:10.1016/j.gendis.2025.101573
PMID:40735693
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1571 | 2025-07-31 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals the Critical Role of SEC16B in Lung Metastasis of Osteosarcoma
2025-Aug, FASEB bioAdvances
IF:2.5Q3
DOI:10.1096/fba.2024-00161
PMID:40735296
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术揭示了SEC16B在骨肉瘤肺转移中的关键作用 | 发现了一个可能通过下调SEC16B促进肺转移的新细胞亚群，并揭示了肿瘤微环境中成纤维细胞和内皮细胞在骨肉瘤肺转移中的关键作用 | 样本量相对较小，仅包含6个原发骨肉瘤样本、2个肺转移样本和4个正常骨组织样本 | 探究骨肉瘤肺转移的分子机制并寻找潜在治疗靶点 | 骨肉瘤细胞、肺转移组织、正常骨组织 | 数字病理学 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、qRT-PCR、Transwell实验 | hdWGCNA分析 | RNA测序数据 | 6个原发骨肉瘤样本、2个肺转移样本、4个正常骨组织样本 |
| 1572 | 2025-07-31 |
Investigation of the mechanism of Xiaoyin Jiedu Yin in the treatment of psoriasis based on bioinformatics, machine learning
2025, Frontiers in chemistry
IF:3.8Q2
DOI:10.3389/fchem.2025.1623449
PMID:40735022
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研究论文 | 本研究基于生物信息学和机器学习探讨了消银解毒饮治疗银屑病的作用机制 | 首次结合网络药理学、机器学习靶点筛选和单细胞RNA测序技术，揭示了消银解毒饮通过多靶点协同作用治疗银屑病的机制，并鉴定AKR1B10为核心治疗靶点 | 研究主要基于体外细胞模型，缺乏动物模型或临床试验验证 | 探究消银解毒饮治疗银屑病的药理机制 | 银屑病患者皮肤组织样本和IL-17A诱导的HaCaT细胞模型 | 生物信息学 | 银屑病 | 网络药理学、机器学习靶点筛选、scRNA-seq、空间转录组学 | 机器学习 | 基因表达数据 | 未明确说明样本数量，涉及银屑病患者皮肤组织和HaCaT细胞系 |
| 1573 | 2025-07-31 |
High cGAS-STING expression associates with improved efficacy of neoadjuvant chemo-immunotherapy in head and neck squamous cell carcinoma
2025, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2025.1584061
PMID:40735041
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研究论文 | 本研究探讨了头颈部鳞状细胞癌（HNSCC）中cGAS和STING表达与新辅助化疗免疫疗法（NACI）疗效的相关性 | 首次揭示了cGAS和STING表达与NACI疗效的正相关性，并提出了它们作为预测生物标志物的潜力 | 样本量较小（仅38例患者），且为回顾性研究 | 探究cGAS和STING表达与HNSCC患者NACI疗效的关系 | 头颈部鳞状细胞癌患者 | 肿瘤免疫学 | 头颈部鳞状细胞癌 | 免疫组织化学、bulk RNA-seq、scRNA-seq | NA | 基因表达数据、临床数据 | 38例HNSCC患者 |
| 1574 | 2025-07-31 |
PM2.5 Induces Cell-Specific Transcriptomic Alterations in the Lungs of Juvenile Mice
2025, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S514437
PMID:40735270
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，探讨了PM2.5对幼鼠肺部不同细胞类型的转录组影响 | 首次在幼鼠模型中利用scRNA-seq技术揭示了PM2.5对不同肺部细胞类型的特异性转录组改变 | 研究仅基于小鼠模型，结果可能需要进一步在人类样本中验证 | 探究PM2.5对儿童肺部健康的细胞特异性影响及其分子机制 | 幼鼠肺部细胞 | 生物医学 | 呼吸系统疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq), GO和KEGG富集分析, 苏木精-伊红染色 | 幼鼠PM2.5气道暴露模型 | 基因表达数据, 组织病理学图像 | 未明确说明数量的幼鼠肺部样本 |
| 1575 | 2025-07-31 |
Disulfidptosis-Related Genes as Novel Biomarkers and Therapeutic Targets in Dilated Cardiomyopathy
2025, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S525114
PMID:40735269
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research paper | 该研究通过分析扩张型心肌病（DCM）患者与健康对照中24个二硫键死亡相关基因（DiGs）的表达，构建了预测模型并验证了核心基因的作用 | 首次将二硫键死亡机制与DCM发病联系起来，并鉴定出ACTN4、MYH10、TLN1、DSTN和NCKAP1作为核心预测基因 | 研究主要基于生物信息学分析，实验验证部分仅限于小鼠模型，需要进一步临床验证 | 探索二硫键死亡相关基因在扩张型心肌病中的作用机制及治疗靶点 | 扩张型心肌病患者和小鼠模型 | 生物信息学 | 心血管疾病 | RNA-seq, 单细胞RNA测序 | SVM | 基因表达数据 | 多个GEO数据集中的DCM患者和健康对照样本 |
| 1576 | 2025-07-31 |
Editorial: Single-cell sequencing of the immune microenvironment in cancer
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1660831
PMID:40735316
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1577 | 2025-07-31 |
Targeting the KLF5/PI3K/AKT axis as a therapeutic strategy to overcome neoadjuvant chemoresistance in colorectal cancer
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1593639
PMID:40735324
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研究论文 | 本研究探讨了KLF5/PI3K/AKT轴作为克服结直肠癌新辅助化疗耐药性的治疗靶点的潜力 | 通过单细胞RNA测序分析揭示了KLF5在化疗耐药性中的作用，并提出了KLF5/PI3K/AKT轴作为新的治疗靶点 | 研究主要基于临床前模型，尚未在人体临床试验中验证 | 探索克服结直肠癌新辅助化疗耐药性的机制和潜在治疗策略 | 结直肠癌患者样本和动物模型 | 肿瘤学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、InferCNV、差异表达基因分析、通路富集分析、细胞通讯分析、SCENIC、高通量药物筛选 | 动物模型 | RNA测序数据 | 结直肠癌患者样本(具体数量未提及)和动物模型 |
| 1578 | 2025-07-31 |
An integrated approach for analyzing spatially resolved multi-omics datasets from the same tissue section
2025, Frontiers in molecular biosciences
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fmolb.2025.1614288
PMID:40735471
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研究论文 | 本文开发了一种湿实验室和计算框架，用于在同一组织切片上进行空间转录组学（ST）和空间蛋白质组学（SP）的整合分析 | 首次在同一组织切片上整合ST和SP分析，实现了RNA和蛋白质表达的单细胞水平比较 | 未提及样本量是否足够大以覆盖广泛的肿瘤异质性 | 开发一种整合空间多组学数据的方法，以更深入地理解肿瘤-免疫微环境 | 人类肺癌样本 | 数字病理学 | 肺癌 | 空间转录组学（ST）、空间蛋白质组学（SP）、H&E染色 | Weave软件 | 空间多组学数据 | NA |
| 1579 | 2025-07-31 |
Collection of Growing Bovine Oocytes and Library Preparation for Single-Cell RNA Sequencing
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4658-8_4
PMID:40736790
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研究论文 | 本文详细介绍了用于单细胞RNA测序分析的牛生长卵母细胞的收集和文库制备方案 | 提供了针对牛生长卵母细胞的详细scRNA-seq分析方案，有助于识别物种特异性转录特征和发育轨迹 | NA | 研究牛卵母细胞的基因表达和发育过程 | 牛生长卵母细胞 | 单细胞测序 | NA | scRNA-seq | NA | RNA测序数据 | NA |
| 1580 | 2025-07-30 |
Characteristics and significance of γδ T cells in colorectal cancer
2025-Dec, Oncoimmunology
IF:6.5Q1
DOI:10.1080/2162402X.2025.2532231
PMID:40726078
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研究论文 | 探讨γδ T细胞在结直肠癌中的特征及其预后意义 | 首次在两项独立队列中通过多重免疫组化和单细胞RNA测序分析γδ T细胞在结直肠癌中的分布特征及其与患者生存期的关联 | 研究结果在第二队列中的HR置信区间较宽(0.50-1.33)，可能影响统计效力 | 阐明γδ T细胞在结直肠癌免疫微环境中的作用机制 | 结直肠癌患者组织样本中的γδ T细胞和αβ T细胞 | 肿瘤免疫学 | 结直肠癌 | 多重免疫组化、单细胞RNA测序 | NA | 组织样本、基因表达数据 | 1687例结直肠癌患者(两个队列) + 62例单细胞RNA测序样本 |