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当前共找到 38777 篇文献,本页显示第 1561 - 1580 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
1561 2026-04-07
Single-cell characterization of a model of poly I:C-stimulated peripheral blood mononuclear cells in severe asthma
2021-Apr-26, Respiratory research IF:4.7Q1
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序和质谱流式细胞术,表征了重症哮喘患者外周血单个核细胞在Poly I:C刺激下的免疫反应模型 首次结合两种互补的单细胞技术(DropSeq scRNA-Seq和CyTOF)来表征重症哮喘患者PBMCs对TLR3激动剂Poly I:C的反应,揭示了基线状态下的促炎特征和刺激后强烈的干扰素通路诱导 样本量相对较小(5名SA患者和3名健康对照),且为体外模型,可能无法完全反映体内复杂的免疫微环境 表征重症哮喘患者外周血单个核细胞对TLR3激动剂Poly I:C刺激的免疫反应,以评估哮喘相关的干扰素反应缺陷 重症哮喘患者和健康对照者的外周血单个核细胞 单细胞组学 哮喘 单细胞RNA测序, 质谱流式细胞术 NA 单细胞转录组数据, 蛋白质表达数据 8名个体(5名重症哮喘患者,3名健康对照)的PBMCs;scRNA-Seq分析9414个细胞,CyTOF分析160,000个细胞 NA 单细胞RNA-seq DropSeq NA
1562 2026-04-07
Flexible comparison of batch correction methods for single-cell RNA-seq using BatchBench
2021-04-19, Nucleic acids research IF:16.6Q1
研究论文 本文介绍了BatchBench,一个用于比较单细胞RNA-seq数据批次校正方法的模块化灵活流程 提出了一个系统化评估和比较批次校正方法的开源工具,通过整合多个数据集进行性能分析 仅评估了八种方法,可能未涵盖所有现有技术,且依赖于特定数据集 比较和评估单细胞RNA-seq数据批次校正方法的性能 单细胞RNA-seq数据集和批次校正算法 自然语言处理 NA 单细胞RNA-seq NA RNA-seq数据 多个已研究的数据集 NA 单细胞RNA-seq NA NA
1563 2026-04-07
A flexible microfluidic system for single-cell transcriptome profiling elucidates phased transcriptional regulators of cell cycle
2021-04-12, Scientific reports IF:3.8Q1
研究论文 本文介绍了一种名为Nadia Instrument的灵活、经济高效且用户友好的基于液滴的微流控系统,用于单细胞转录组分析,并展示了其在细胞周期研究中的应用 开发了一种新型微流控系统,具有高重现性液滴大小、低双联体率和高mRNA捕获效率,且可通过Nadia Innovate模块实现灵活配置,支持不同缓冲液和条形码珠设置 未明确提及系统在更大规模样本或更复杂组织类型中的验证,以及与其他现有平台的直接比较数据 开发并验证一种用于单细胞转录组分析的微流控系统,以促进细胞分辨率下的转录组学研究 异步人类和小鼠细胞 单细胞转录组学 NA 单细胞RNA测序 NA mRNA序列数据 约50,000个单细胞或细胞核 NA 单细胞RNA-seq Nadia Instrument 基于液滴的微流控系统,支持3' mRNA捕获,可与Nadia Innovate模块结合使用
1564 2026-04-07
CD11c+CD88+CD317+ myeloid cells are critical mediators of persistent CNS autoimmunity
2021-04-06, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America IF:9.4Q1
研究论文 本研究通过基因工程小鼠模型和单细胞RNA测序技术,揭示了CD11c+CD88+CD317+髓系细胞在持续性中枢神经系统自身免疫中的关键作用 首次鉴定出CD11c+CD88+CD317+髓系细胞亚群是中枢神经系统自身免疫的关键介质,并证明抗CD317治疗能显著改善实验性自身免疫性脑脊髓炎 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证有限;单细胞测序样本量相对较小 探究α4-整合素在CD11c+细胞中的特异性缺失对实验性自身免疫性脑脊髓炎的影响,并鉴定关键致病细胞亚群 CD11c.Cre C57BL/6基因工程小鼠、野生型对照小鼠、人类脑脊液样本 免疫学 多发性硬化症/实验性自身免疫性脑脊髓炎 单细胞RNA测序、多参数流式细胞术、基因工程小鼠模型 NA 单细胞转录组数据、流式细胞术数据 基因工程小鼠模型(具体数量未明确)、人类脑脊液样本(数量未明确) NA 单细胞RNA测序 NA NA
1565 2026-04-07
Targeted Single-Cell RNA-seq Identifies Minority Cell Types of Kidney Distal Nephron
2021-Apr, Journal of the American Society of Nephrology : JASN IF:10.3Q1
研究论文 本研究通过结合FACS富集与单细胞RNA-seq技术,分析了小鼠肾脏远端肾单位中9099个细胞的转录组,揭示了DCT和CTAL细胞亚型的多样性 首次在单细胞水平上系统识别了肾脏远端肾单位中的少数细胞类型,包括DCT1和DCT2的异质性以及三种不同的CTAL亚型,并发现了新的转录因子表达模式 研究仅基于小鼠模型,未涉及人类样本;单细胞RNA-seq可能无法完全捕获低丰度转录本;功能验证实验有限 探索肾脏远端肾单位中少数细胞类型的转录组多样性及其在水分和电解质平衡中的作用 小鼠肾脏厚壁升支(CTAL)和远端曲小管(DCT)区域的细胞 单细胞转录组学 肾脏疾病 单细胞RNA-seq,FACS(荧光激活细胞分选) 无监督聚类分析 转录组数据 9099个细胞 NA 单细胞RNA-seq NA NA
1566 2026-04-06
Integrating tumor and immune cell transcriptomics to predict immune checkpoint inhibitor primary resistance in metastatic melanoma
2026-Dec-31, Oncoimmunology IF:6.5Q1
研究论文 本研究通过整合肿瘤和免疫细胞的转录组学数据,旨在预测转移性黑色素瘤患者对免疫检查点抑制剂的原发性耐药 提出了一个由82个基因组成的转录组特征,该特征结合了肿瘤相关和免疫相关基因,并首次通过单细胞RNA测序指导的免疫反卷积,识别出四种免疫细胞亚群作为耐药预后指标 样本量相对有限(组织样本46例,验证队列54例),且液体活检的单细胞RNA测序仅涉及8例患者 识别和验证能够预测转移性黑色素瘤患者对免疫检查点抑制剂产生原发性耐药的生物标志物 转移性皮肤黑色素瘤患者 数字病理学 黑色素瘤 RNA-seq, 单细胞RNA测序, 流式细胞术 预测模型 转录组数据, 单细胞数据 组织样本:发现队列(FFPE RNA-seq子队列)和独立外部验证队列共100例(46+54);液体活检:scRNA-seq 8例,流式细胞术46例 NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
1567 2026-04-06
Retinoic acid regulates fetoplacental vascularization via notch signaling and a SEMA3E/F-PLEXIND1 axis
2026-Apr-17, iScience IF:4.6Q1
研究论文 本研究揭示了视黄酸通过Notch信号通路和SEMA3E/F-PLEXIND1轴调控胎儿胎盘血管化的机制 首次发现视黄酸通过Notch信号和SEMA3E/F-PLEXIND1轴调控胎盘血管化,并明确了其在胎儿内皮细胞与绒毛滋养层前体细胞间信号传导中的作用 研究主要基于小鼠模型(Raldh2胚胎),人类胎盘中的具体机制仍需进一步验证 探究视黄酸缺乏导致胎盘血管化异常的分子机制 小鼠胚胎胎盘组织(特别是内皮细胞和滋养层细胞) 发育生物学 妊娠并发症(胎儿生长受限、早产等) 单细胞RNA测序、功能实验 NA 单细胞转录组数据 E9.5阶段Raldh2缺陷型、野生型及ATRA处理组胎盘细胞 NA 单细胞RNA-seq NA NA
1568 2026-04-06
Integration of machine learning-based screening approaches and single-cell sequencing technique to identify cancer stemness genes associated with radiotherapy resistance in lung adenocarcinoma
2026-Apr-04, Discover oncology IF:2.8Q2
NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
1569 2026-04-06
Helicobacter pylori-linked gene CFAP73 rewires epithelial programs and shapes the gastric cancer microenvironment
2026-Apr-04, Discover oncology IF:2.8Q2
研究论文 本研究揭示了幽门螺杆菌感染通过下调CFAP73基因表达,重塑胃上皮细胞程序并改变肿瘤微环境,从而促进胃癌发生发展的新机制 首次鉴定出CFAP73是一个在幽门螺杆菌感染早期即被抑制的、具有肿瘤保护作用的上皮基因,并系统阐明了其通过调控上皮细胞状态、影响成纤维细胞和T细胞功能来重塑肿瘤微环境的机制 研究主要基于生物信息学分析和回顾性队列数据,CFAP73的具体功能机制和作为治疗靶点的潜力仍需进一步的体内外实验验证 探究幽门螺杆菌感染过程中逐渐被破坏的上皮细胞程序及其与胃癌恶性转化的关联 幽门螺杆菌感染相关的胃上皮细胞、胃癌微环境中的成纤维细胞和T细胞 数字病理学 胃癌 单细胞RNA测序、空间转录组学、配体-受体推断分析 随机森林模型 基因表达数据、单细胞数据、空间转录组数据 多个独立验证队列(包括TCGA-STAD、GSE60662、GSE60427、GSE249874等数据集) NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
1570 2026-04-06
scAgeClock: a single-cell transcriptome-based human aging clock model using gated multi-head attention neural networks
2026-Apr-04, npj aging IF:4.1Q2
研究论文 本研究提出了一种名为scAgeClock的新型单细胞转录组人类衰老时钟模型,该模型基于门控多头注意力神经网络,利用大规模单细胞转录组数据进行年龄预测 开发了首个基于门控多头注意力神经网络的单细胞分辨率人类衰老时钟模型,能够解析细胞和组织异质性,并提出了新的衰老偏差指数指标 不同细胞类型的预测准确性存在显著差异,部分细胞类型的年龄预测误差可能较大 构建高精度的单细胞分辨率人类衰老时钟模型,用于评估生物年龄和细胞衰老状态 人类单细胞转录组数据 机器学习 衰老相关疾病 单细胞RNA测序 门控多头注意力神经网络 单细胞转录组数据 超过1600万个单细胞转录组图谱,来自40多种人类组织和400多种细胞类型 NA 单细胞RNA-seq NA NA
1571 2026-04-06
Deciphering oxidative stress-related heterogeneity and developing a prognostic signature for colorectal cancer
2026-Apr-04, Scientific reports IF:3.8Q1
研究论文 本研究旨在揭示氧化应激在结直肠癌肿瘤微环境中的作用,并开发一个基于氧化应激相关基因的预后风险特征模型 首次结合单细胞和bulk RNA-seq数据解析氧化应激在结直肠癌中的异质性,并构建了一个12基因的预后风险特征模型 研究主要基于公共数据集分析,临床验证样本有限,需要进一步的前瞻性研究验证模型的临床应用价值 阐明氧化应激在结直肠癌肿瘤微环境中的作用并开发预后预测工具 结直肠癌患者样本 生物信息学 结直肠癌 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq, qRT-PCR, 免疫组化 LASSO Cox回归模型 基因表达数据, 组织芯片图像 多个公共数据集(GSE132465, TCGA-CRC, GSE39582, GSE17538)及组织芯片验证样本 NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
1572 2026-04-06
Deciphering functional intra-tumoral heterogeneity in BRAFV600E-driven mouse thyroid cancer reveals EMT trajectory and metabolic remodeling
2026-Apr-04, Oncogene IF:6.9Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析,揭示了BRAFV600E驱动的小鼠甲状腺乳头状癌中肿瘤细胞的功能性瘤内异质性,发现了上皮-间质转化轨迹和代谢重塑过程 首次在成年发病的自发性BRAF驱动小鼠PTC模型中,利用单细胞RNA测序解析了恶性甲状腺细胞的转录异性和层级轨迹,并验证了EMT轨迹与临床相关性 研究主要基于小鼠模型,虽然验证了临床相关性,但人类样本的直接验证仍需进一步研究 解析甲状腺乳头状癌中肿瘤细胞的功能性瘤内异质性,以改善诊断和开发有效疗法 BRAFV600E驱动的成年发病自发性小鼠甲状腺乳头状癌模型中的恶性甲状腺细胞 单细胞组学 甲状腺癌 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
1573 2026-04-06
Integrated analysis of single-cell RNA sequencing, transcriptomics, and thermal proteome profiling identifies PLCG1 as the therapeutic target of isopimpinellin in treating rheumatoid arthritis
2026-Apr-04, Cellular & molecular biology letters IF:9.2Q1
NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
1574 2026-04-06
Regulation of mitochondrial ROS by C15ORF48 in a basal cell subpopulation contributes to chemotherapy resistance in TNBC
2026-Apr-03, Science advances IF:11.7Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序揭示了TNBC中C15ORF48在基底细胞亚群中上调,通过调节线粒体ROS来诱导化疗耐药性 首次发现C15ORF48作为NDUFA4的旁系同源物,在TNBC基底细胞亚群中上调并调控线粒体ROS,从而介导化疗耐药 研究基于患者来源的异种移植模型,可能不完全反映人类肿瘤的复杂性;样本量未明确说明 探究TNBC化疗耐药的机制,并寻找潜在的治疗靶点 三阴性乳腺癌(TNBC)患者来源的异种移植肿瘤中的肿瘤上皮细胞,特别是基底细胞亚群 单细胞组学 乳腺癌 单细胞RNA测序 NA 单细胞RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
1575 2026-04-06
Nested co-expression network analysis identifies compact gene clusters in a black box
2026-Apr-03, Bioinformatics (Oxford, England)
研究论文 本文介绍了一种名为Nested-WGCNA的两阶段无监督网络分析算法,用于从转录组数据中识别粗粒度和细粒度的基因模块 提出了一种新的嵌套共表达网络分析方法,能够识别传统方法可能遗漏的、对应于特定细胞类型子过程的紧凑基因集 NA 开发一种能够识别反映复杂生物过程的广泛和嵌套基因模块的转录组分析方法 基因表达数据中的基因模块 生物信息学 NA RNA-seq 无监督网络分析算法 转录组数据 NA NA bulk RNA-seq, scRNA-seq NA NA
1576 2026-04-06
Spatially resolved osteoblast-traced transcriptomics uncovers TGF-β as a combination target with sclerostin in osteoporosis
2026-Apr-02, Bone research IF:14.3Q1
研究论文 本研究利用空间分辨的成骨细胞追踪转录组学技术,揭示了TGF-β信号在调控成骨细胞激活中的作用,并提出TGF-β与硬化蛋白的双重抑制可作为骨质疏松症的治疗新策略 首次整合成骨细胞特异性谱系追踪与空间分辨激光激活细胞分选技术,在静止骨表面解析成骨细胞状态,并发现TGF-β是调控成骨细胞激活的关键因子 研究主要基于小鼠模型,其在人类骨质疏松症中的直接应用仍需进一步验证 探究成熟成骨细胞在活跃与静止状态间动态转换的调控机制,并开发针对骨质疏松症的骨合成代谢治疗新靶点 小鼠成骨细胞 空间转录组学 骨质疏松症 空间分辨激光激活细胞分选, 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 NA NA 空间分辨转录组学, 单细胞RNA-seq NA NA
1577 2026-04-06
Integrated spatial transcriptomics and pan-cancer XGBoost modeling uncover spatial drivers of immune exclusion and predict immunotherapy response
2026-Apr-02, Cancer immunology, immunotherapy : CII
研究论文 本研究整合空间转录组学和泛癌XGBoost模型,揭示了免疫排斥的空间驱动因素并预测免疫治疗反应 结合空间转录组学解析肿瘤免疫微环境的空间复杂性,并开发了泛癌XGBoost模型用于免疫治疗反应预测,超越了传统的PD-L1等标志物 研究涉及27种癌症类型,但具体样本量未在摘要中明确说明;模型性能虽优于传统标志物,但AUC为0.771仍有提升空间 解码免疫相关非编码RNA调控网络,揭示免疫排斥的空间驱动机制,并开发预测免疫治疗反应的机器学习工具 27种癌症类型的多组学数据,重点关注肺腺癌中的SNHG6-BIRC5轴 空间转录组学,机器学习 肺癌(肺腺癌),泛癌 空间转录组学,多组学分析,CRISPR-Cas9筛选,药物基因组学分析 XGBoost 空间转录组数据,多组学数据,CRISPR筛选数据,药物反应数据 涉及27种癌症类型,具体样本量未明确 NA 空间转录组学 NA NA
1578 2026-04-06
Hepatic radiofrequency ablation induces widespread cellular activation throughout the liver
2026-Apr-02, European radiology experimental IF:3.7Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和蛋白质组学分析,探讨了肝射频消融后远处肝组织的细胞、转录和翻译水平激活情况 首次在单细胞水平上全面揭示了肝射频消融后远处肝组织的广泛细胞激活,包括细胞间互作、通路激活和蛋白质表达变化 研究仅使用小鼠模型,样本量较小(仅3只小鼠),且未涉及肿瘤模型,可能限制其临床直接应用 探究肝射频消融后远处肝组织的细胞、转录和翻译水平激活程度及其分子机制 健康C57/Bl6小鼠的肝组织 数字病理学 肝病 单细胞RNA测序, 蛋白质组学分析 NA 单细胞RNA测序数据, 蛋白质组学数据 3只8-10周龄雄性C57/Bl6小鼠(2只接受RFA,1只对照) NA 单细胞RNA-seq, 蛋白质组学 NA NA
1579 2026-04-06
Chromatin remodeling in pericentral hepatocytes modulates MASH through CYP450 activity
2026-Apr-02, Journal of hepatology IF:26.8Q1
研究论文 本研究揭示了Lgr5+肝细胞中染色质重塑因子DPF2通过调控CYP450酶活性来调节全肝代谢稳态,从而影响代谢相关脂肪性肝病(MASLD/MASH)进展的机制 首次阐明了特定肝细胞亚群(Lgr5+肝细胞)通过染色质重塑调控CYP2酶表达,进而通过代谢物全反式维甲酸(atRA)非细胞自主性地协调全肝AMPK活性和代谢的机制 研究主要基于小鼠模型,虽然有人类肝组织验证,但临床转化仍需在更大规模的人类肝队列和精心设计的患者研究中得到证实 探究Lgr5+肝细胞中DPF2如何通过调控atRA稳态来协调肝脏范围内的AMPK介导的代谢,以理解代谢性肝病的发病机制 转基因C57BL/6J小鼠、人类肝组织、Lgr5+肝细胞 数字病理学 代谢相关脂肪性肝病 scRNA-seq, 空间转录组学, ATAC-seq, CUT&Tag, CUT&RUN, 多组学分析 NA 单细胞转录组数据、空间转录组数据、表观基因组数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 单细胞ATAC-seq NA NA
1580 2026-04-06
Metabolic reprogramming in lacrimal gland GVHD: Stage-specific shifts in acinar cells as drivers of disease progression
2026-Apr, The ocular surface
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序揭示了眼移植物抗宿主病(oGVHD)中泪腺细胞生态系统的时相特异性变化,特别是腺泡细胞的代谢重编程在疾病进展中的作用 首次在oGVHD中整合单细胞转录组学、伪时间轨迹分析和细胞间通讯网络,揭示了急性与慢性阶段腺泡细胞代谢重编程的时相特异性机制 研究基于小鼠模型,结果在人类中的适用性需进一步验证;单细胞测序数据可能受技术偏差影响 阐明oGVHD发病机制中泪腺细胞生态系统的时相特异性变化 小鼠泪腺细胞,特别是腺泡细胞、成纤维细胞、T细胞、浆细胞样树突状细胞和肥大细胞 单细胞组学 移植物抗宿主病 单细胞RNA测序、伪时间轨迹分析、细胞间通讯网络推断、免疫荧光验证 NA 单细胞转录组数据、图像数据 小鼠泪腺在急性(7天)和慢性(28天)GVHD阶段的样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
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