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当前共找到 39637 篇文献，本页显示第 1561 - 1580 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1561 | 2026-05-05 |
PALINCODE: Recording cell lineage with ternary palindromic CRISPR bits
2026-Apr-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.16.718941
PMID:42039399
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研究论文 | 介绍PALINCODE系统，利用三元CRISPR位点随机写入细胞谱系信息，实现高密度谱系记录 | 首次提出使用三元CRISPR位点（cBits）实现更高信息密度的细胞谱系记录，通过截断的Cas9引导序列提高三元编辑效率，理论编码能力达10^25比特 | 未明确提及局限性，但可能受限于CRISPR编辑的随机性及体内应用时的脱靶效应 | 开发高密度、高精度的细胞谱系记录平台，克服传统CRISPR谱系追踪方法的局限性 | 细胞谱系记录系统及体内黑色素瘤模型中的克隆进化 | 机器学习 | 黑色素瘤 | CRISPR | NA | 单细胞测序数据 | 293T细胞及黑色素瘤体内模型 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 1562 | 2026-05-05 |
Dynamic regulation of long non-coding RNAs across asexual and gametocyte development in Plasmodium falciparum
2026-Apr-18, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.15.718799
PMID:42039573
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研究论文 | 利用长读长Oxford Nanopore直接RNA测序、核糖体图谱分析和单细胞转录组学，对恶性疟原虫无性期和配子体发育过程中的长链非编码RNA进行动态调控研究 | 首次整合长读长纳米孔直接RNA测序、核糖体分析和单细胞转录组学，对恶性疟原虫lncRNA进行稳健的阶段特异性表征，揭示了其在配子体发生和传播中的潜在作用 | 研究中可能受到短读长Illumina测序、逆转录酶伪迹以及链特异性cDNA文库中第二链不完全降解的影响，这些因素阻碍了全基因组lncRNA的鉴定 | 全面鉴定恶性疟原虫无性期和配子体阶段的lncRNA，并探讨其基因表达调控中的作用 | 恶性疟原虫的无性期和配子体阶段样本 | 机器学习 | 疟疾 | 纳米孔直接RNA测序、核糖体图谱分析、单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据、单细胞转录组数据 | 多个无性期和配子体阶段样本，具体数量未说明 | Oxford Nanopore Technologies | 直接RNA测序、单细胞RNA测序 | Oxford Nanopore直接RNA测序平台 | NA |
| 1563 | 2026-05-05 |
Nanoparticle-delivered resiquimod induces brain tumor regression in medulloblastoma and diffuse midline glioma models by interrupting paracrine growth support and activating myeloid immune signaling and phagocytosis
2026-Apr-16, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.07.714454
PMID:41993485
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研究论文 | 使用纳米颗粒递送的瑞西莫德通过激活髓系免疫信号和吞噬作用诱导髓母细胞瘤和弥漫性中线胶质瘤模型中的脑肿瘤消退 | 本研究首次使用聚恶唑啉纳米颗粒包裹TLR7/8激动剂瑞西莫德（ResiPOx），证明其能有效穿透血脑屏障，并在两种儿童脑肿瘤模型中诱导抗肿瘤免疫反应，包括髓母细胞瘤和弥漫性中线胶质瘤 | 主要限制是研究仅限于小鼠和非人灵长类动物模型，尚未在人类患者中进行验证 | 研究使用聚恶唑啉纳米颗粒递送的TLR7/8激动剂瑞西莫德（ResiPOx）对髓母细胞瘤和弥漫性中线胶质瘤中肿瘤相关髓系细胞的先天免疫功能的影响 | 髓母细胞瘤和弥漫性中线胶质瘤肿瘤模型中的肿瘤相关髓系细胞 | 机器学习 | 髓母细胞瘤, 弥漫性中线胶质瘤 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 流式细胞术, 免疫组化, 质谱成像, 免疫印迹 | NA | 基因表达数据 | 免疫活性小鼠（MB和DMG模型）和恒河猴（非人灵长类模型） | Illumina | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | Illumina NovaSeq | 用于单细胞RNA-seq和批量RNA-seq的Illumina NovaSeq测序平台 |
| 1564 | 2026-05-05 |
Transcriptomics and single cell sequencing revealed the important role of PPAR signaling pathway in zebrafish liver fibrosis induced by thioacetamide
2026-Apr-15, Environmental pollution (Barking, Essex : 1987)
DOI:10.1016/j.envpol.2026.128145
PMID:41997351
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研究论文 | 利用转录组学和单细胞测序揭示PPAR信号通路在硫代乙酰胺诱导的斑马鱼肝纤维化中的重要作用 | 首次通过转录组和单细胞测序联合分析，发现PPAR信号通路在TAA诱导的斑马鱼肝纤维化中起关键作用，并通过干预实验验证 | 未明确提及具体局限性，可能缺乏人类样本验证或临床相关性分析 | 探究硫代乙酰胺诱导斑马鱼肝纤维化的分子机制，特别是PPAR信号通路的作用 | 斑马鱼肝纤维化模型 | 转录组学， 单细胞测序 | 肝纤维化 | 转录组测序， 单细胞测序 | NA | 转录组数据， 单细胞数据 | 斑马鱼肝纤维化模型样本 | NA | bulk RNA-seq， 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1565 | 2026-05-05 |
Whole-organism spatial transcriptomics at single-cell resolution in C. elegans
2026-Apr-11, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.09.717568
PMID:41993495
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研究论文 | 展示了一种在秀丽隐杆线虫完整个体中实现单细胞分辨率空间转录组学的工作流程 | 首次在完整生物体上实现单细胞分辨率的多重空间转录成像，通过最多40个基因的连续成像保留空间背景，并结合标记基因面板实现神经元可重复识别 | 目前仅适用于线虫紧凑透明的体型，可能难以直接扩展到更大或更复杂的生物体 | 开发一种可扩展的空间转录组学框架，用于分析完整生物体中的基因表达和细胞身份 | 秀丽隐杆线虫 | 数字病理学 | NA | 单分子荧光原位杂交（smFISH），多重成像 | NA | 图像 | 整个秀丽隐杆线虫个体 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1566 | 2026-05-05 |
Dysregulation of Hippo Signaling Pathway as a Convergent Mechanism Underlying Choroid Plexus Defects in Bipolar Disorder
2026-Apr-10, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.10.717745
PMID:41993308
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研究论文 | 发现Hippo信号通路失调是双相情感障碍中脉络丛缺陷的汇聚机制 | 首次通过人类大脑类器官和脉络丛类器官揭示Hippo通路激活驱动脉络丛过度生长，并整合遗传学证据表明该通路在双相情感障碍病理中的关键作用 | 未提及具体局限性 | 探究双相情感障碍中脉络丛异常的分子机制 | 双相情感障碍患者与健康对照者来源的人类皮层类器官和脉络丛类器官 | 数字病理学 | 双相情感障碍 | 单细胞转录组学，全基因组关联研究，结构磁共振成像 | NA | 基因表达数据，影像数据 | 双相情感障碍患者和健康对照者来源的类器官及结构磁共振成像扫描 | 10x Genomics, Illumina | 单细胞RNA测序，全基因组测序 | 10x Chromium, Illumina NovaSeq | 10x Chromium Single Cell 3' 试剂盒进行单细胞转录组测序，Illumina NovaSeq平台进行全基因组测序 |
| 1567 | 2026-05-05 |
SCOPE: Localizing fate-decision states and their regulatory drivers in single-cell differentiation
2026-Apr-09, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.07.717037
PMID:41993275
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研究论文 | 提出SCOPE框架，利用半监督共形预测将单细胞分化中的命运决策状态及表观遗传预启动局部化至离散转录组学窗口 | 首次通过共形推断形式化命运不确定性，在高维单细胞数据中严格界定细胞命运承诺的边界，并揭示染色质可及性先于基因表达的时序滞后 | 依赖于共形预测的假设（数据可交换性），在高度噪声或样本量较小的数据中性能可能受限 | 定位单细胞分化中命运决策的关键转录组学状态及调控因子 | 模拟数据、谱系追踪的小鼠造血系统、多个人类造血数据集和人类视网膜发生数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序、单细胞ATAC测序、多组学测序 | 半监督共形预测 | 基因表达数据、染色质可及性数据 | 涵盖模拟、小鼠造血、人类造血及人类视网膜发生的多个数据集 | NA | 单细胞RNA测序、单细胞ATAC测序、单细胞多组学 | NA | NA |
| 1568 | 2026-05-05 |
Chemotherapy-Induced Oral Mucosal Injury Is Defined by p53 Activation, Cell Cycle Arrest and Diverse Epithelial Progenitor Dynamics
2026-Apr-09, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.06.716752
PMID:41993375
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研究论文 | 通过小鼠模型研究化疗诱导的口腔黏膜损伤的机制，定义p53激活、细胞周期阻滞和不同上皮祖细胞动态变化 | 首次揭示化疗诱导的口腔黏膜损伤主要由细胞周期阻滞而非凋亡驱动，并发现口腔黏膜独特的代谢重编程和p53/AP-1基因特征的化学耐药细胞群 | 研究局限于小鼠模型，可能无法完全代表人类口腔黏膜对化疗的反应 | 阐明化疗诱导的口腔黏膜损伤和修复的分子机制 | 5-氟尿嘧啶诱导的口腔黏膜炎小鼠模型中的口腔黏膜组织 | 自然语言处理 | 口腔黏膜炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 未明确说明样本数量，涉及小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1569 | 2026-05-05 |
Genetic interaction between Adgrg6 and Sox9 reveals a feedforward mechanism for postnatal spinal stability
2026-Apr-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.06.716681
PMID:41993334
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研究论文 | 利用空间转录组学揭示Adgrg6与Sox9在脊柱稳定中的遗传互作机制 | 首次提出Adgrg6和Sox9之间的前馈调控环路，为青少年特发性脊柱侧凸的遗传机制提供新见解 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证有限 | 阐明Adgrg6和Sox9在脊柱稳定中的功能互作及对青少年特发性脊柱侧凸的致病机制 | Adgrg6条件敲除小鼠及Sox9低表达等位基因小鼠的脊柱组织 | 机器学习 | 青少年特发性脊柱侧凸 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | 小鼠脊柱组织样本，具体数量未提及 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1570 | 2026-05-05 |
Transcriptional profiling of extraocular motor neurons reveals sim1a as a candidate strabismus-related gene
2026-Apr-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.07.717009
PMID:41993546
|
研究论文 | 通过斑马鱼外眼运动神经元的转录组分析，发现 sim1a 是潜在的斜视相关基因 | 利用斑马鱼作为模型进行外眼运动神经元的单细胞和批量测序，揭示了 nIII/nIV 脑神经核中运动神经元亚群的转录组多样性，并建立了研究眼运动疾病病因的筛选管道 | 仅进行了 CRISPR/Cas9 介导的基因敲除功能验证，未在人类样本中直接验证；仅检测了前庭眼反射行为，未评估其他眼动功能 | 鉴定调控外眼运动神经元发育并与斜视相关的候选基因 | 斑马鱼幼虫的外眼运动神经元（颅神经核 nIII/nIV 中的神经元亚群） | 数字病理学 | 斜视 | NGS, 单细胞测序, 批量RNA测序, CRISPR/Cas9 | NA | 转录组数据（RNA-seq） | 斑马鱼幼虫（未具体说明数量） | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 1571 | 2026-05-05 |
A transcriptomic axis aligns with in vivo functional dynamics in hippocampal inhibitory circuits
2026-Apr-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.07.716935
PMID:41993541
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研究论文 | 通过细胞分辨双光子成像和空间转录组学，将小鼠海马体抑制性回路的分子身份与体内功能动态直接关联 | 建立端到端流程，结合双光子钙成像与空间转录组学，揭示转录组轴与神经元功能动态的对应关系，并证明仅凭生理特征即可恢复转录组分类 | 研究仅限于小鼠海马体CA1区，且虚拟现实导航行为的复杂性可能限制生理反应分类的普适性 | 在单细胞分辨率下桥接神经元分子身份与功能动态的关系 | 小鼠海马体CA1区的抑制性中间神经元 | 数字病理学， 机器学习 | NA | 空间转录组学， 双光子钙成像 | 分类器 | 基因表达数据， 成像数据 | 小鼠海马体CA1区的抑制性中间神经元（具体数量未提及） | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1572 | 2026-05-05 |
Longitudinal Single-Cell RNA-seq Profiling of Lung Cell Phenotypes, Signaling, and Cross-talk During Fibrosis Resolution
2026-Apr-07, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.06.716772
PMID:41993271
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研究论文 | 通过纵向单细胞RNA测序分析肺纤维化消退过程中的细胞表型、信号通路和细胞间通讯变化 | 首次在自发消退的肺纤维化小鼠模型中进行纵向单细胞RNA测序，系统描绘了纤维化消退过程中免疫、间质和上皮细胞的动态变化，并发现cAMP、HGF/MET和TWEAK等潜在抗纤维化通路 | 研究仅限于小鼠模型，可能无法完全反映人类肺纤维化消退机制；单细胞测序缺乏空间信息，无法提供细胞在组织中的位置分布 | 阐明肺纤维化自发消退过程中涉及的信号通路、细胞间通讯和表型变化，为治疗肺纤维化发现内源性通路 | 小鼠全肺细胞 | 单细胞基因组学 | 肺纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 自发消退纤维化小鼠模型的纵向样本，具体数量未说明 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 1573 | 2026-05-05 |
STDrug enables spatially informed personalized drug repurposing from spatial transcriptomics
2026-Apr-07, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.03.715101
PMID:41993522
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研究论文 | STDrug是一个空间感知的计算框架，整合空间转录组学、图建模和多模态学习，实现患者特异性的药物重定位 | 首次将空间转录组学与药物重定位结合，通过图卷积网络和相干点漂移技术对齐疾病与对照空间域，并融合多模态学习进行药物优先排序 | 需要利用空间转录组数据，可能对数据质量和可用性有较高要求；且仅通过肝细胞癌和前列腺癌数据集验证，泛化性有待进一步测试 | 利用空间转录组学实现患者特异性的药物重定位 | 肝细胞癌和前列腺癌患者的空间转录组数据 | 机器学习 | 肝细胞癌, 前列腺癌 | 空间转录组学 | 图卷积网络, 机器学习框架 | 空间转录组数据 | 肝细胞癌和前列腺癌数据集（具体样本数未提供） | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1574 | 2026-05-05 |
Gain-of-function mutation in SKAP2 leads to type 1 diabetes and broader autoimmunity through hyperactive integrin signaling in myeloid cells
2026-Apr-06, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.02.716136
PMID:41993266
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研究论文 | 本文发现SKAP2基因的功能获得性突变通过髓系细胞中过度活跃的整合素信号通路导致1型糖尿病和更广泛的自身免疫 | 首次鉴定出SKAP2基因功能获得性突变与1型糖尿病相关，并通过整合素信号过度激活解释机制 | 研究主要基于小鼠模型，突变对人类的直接作用需进一步验证 | 阐明SKAP2基因突变导致1型糖尿病和自身免疫的机制 | 携带SKAP2 p.G153R突变的小鼠（NOD和C57BL/6J遗传背景） | 机器学习 | 1型糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 携带突变的SKAP2小鼠（雌性和雄性）与对照小鼠 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 1575 | 2026-05-05 |
Halo: a pretrained model for whole-cell segmentation from nuclei images in spatial transcriptomics
2026-Apr-06, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.02.716237
PMID:41993456
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研究论文 | 介绍Halo，一种基于核形态与RNA转录本空间分布整合的全细胞分割预训练模型，用于空间转录组学中从细胞核图像重建全细胞边界 | 提出Halo模型，直接整合原子核形态与RNA转录本的空间分布，无需特定数据集训练即可应用于新数据集，且在多种组织中优于传统核扩张策略 | NA | 开发一种通用且可规模化的全细胞分割模型，提高图像空间转录组学中细胞边界推断的准确性和可重复性 | 空间转录组学中的细胞核图像和RNA转录本坐标 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | Cellpose-SAM | 图像 | 12种组织类型的Xenium多模态数据 | 10x Genomics | 空间转录组学 | Xenium | NA |
| 1576 | 2026-05-05 |
Comparative single cell analysis of wound and cancer identifies the metabolic dialogues between tumor initiating stem cells and macrophages
2026-Apr-06, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.02.716187
PMID:41993506
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研究论文 | 通过比较单细胞分析揭示伤口愈合与癌症中肿瘤起始干细胞与巨噬细胞之间的代谢对话 | 首次通过比较单细胞RNA测序揭示伤口相关巨噬细胞与肿瘤相关巨噬细胞的差异，发现失调的脂质代谢是TAMs的独特特征，并识别SOX2肿瘤起始干细胞为调控TAMs脂质代谢和细胞状态的关键协调者 | NA | 探究伤口相关巨噬细胞与肿瘤相关巨噬细胞的分子和功能差异，以及肿瘤起始干细胞如何调节TAMs的代谢对话 | 皮肤伤口愈合和皮肤鳞状细胞癌进展过程中的巨噬细胞和SOX2肿瘤起始干细胞 | 机器学习 | 皮肤鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 1577 | 2026-05-05 |
Mapping whole-organism genetic comorbidities across model Species using unified ontologies
2026-04-04, Genetics
IF:3.3Q2
DOI:10.1093/genetics/iyag038
PMID:41664592
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研究论文 | 利用统一本体论跨物种绘制全生物体遗传合并症图谱 | 首次开发了跨物种表型本体整合框架，结合新构建的生殖表型本体与标准化全身体表型类别，实现了小鼠、斑马鱼、果蝇、线虫和人类之间的直接跨物种比较 | 仅分析了与无梗阻性无精症相关的基因，且跨物种表型比较依赖于现有数据库的完备性和注释质量 | 识别与无梗阻性无精症相关基因在全生物体层面的合并症模式，揭示男性不育与系统性疾病之间的共享遗传基础 | 204个小鼠生精失败相关基因及其在人、小鼠、斑马鱼、果蝇、线虫中的直系同源基因和表型注释 | 机器学习 | 男性不育症 | 单细胞RNA测序、基因本体注释 | 聚类分析 | 基因型-表型关联数据、单细胞RNA测序数据、全身体基因表达数据 | 204个小鼠基因，涵盖多种跨物种模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1578 | 2026-05-05 |
Single-cell, clonal and spatial atlases of cranial placodes illuminate their specification and evolution
2026-Apr-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.01.715621
PMID:41959073
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研究论文 | 整合单细胞、克隆和空间图谱揭示颅窝的发育和进化机制 | 首次将单细胞RNA测序、空间转录组学和高分辨率克隆追踪整合，构建颅窝发育的综合性图谱，揭示前体细胞连续转录景观及竞争性谱系分离模型 | 未明确提及研究局限性，可能包括样本量有限或跨物种比较的潜在偏差 | 解析颅窝前体细胞的谱系分化动态和进化起源 | 脊椎动物颅窝及其前体细胞 | 生物信息学, 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 克隆追踪 | NA | 单细胞基因表达数据, 空间基因表达数据, 克隆谱系数据 | 涉及多个脊椎动物样本（具体数量未提及） | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1579 | 2026-05-05 |
Human hippocampal neurogenesis in adulthood, ageing and Alzheimer's disease
2026-Apr, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-026-10169-4
PMID:41741649
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研究论文 | 通过多组学单细胞测序技术，研究了人类海马神经发生在成年期、衰老和阿尔茨海默病中的变化及其分子机制 | 首次利用多组学单细胞测序（单细胞核RNA测序和单细胞核ATAC测序）分析大规模海马样本，揭示了神经发生失调与染色质可及性变化的关联，并识别了SuperAgers中的‘韧性特征’ | 研究仅基于死后人体样本，样本量有限，且未直接验证神经发生在认知功能中的因果关系 | 探索人类海马神经发生是否存在，以及其在衰老和阿尔茨海默病中的调控机制和认知影响 | 来自不同队列的人类死后海马样本，包括记忆完整的年轻成人、无认知障碍的老年人、有非凡记忆能力的老年人（SuperAgers）、临床前中间病理成人及阿尔茨海默病患者 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞核RNA测序、单细胞核ATAC测序 | NA | 单细胞测序数据 | 355,997个海马样本的单细胞核 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序、单细胞ATAC测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞核RNA测序和单细胞核ATAC测序 |
| 1580 | 2026-05-05 |
Prosta-omics: machine learning-driven TPSA prediction and molecular modeling of ASPM-inhibitors for prostate cancer treatment
2026-Apr, Molecular diversity
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s11030-026-11470-0
PMID:41781783
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研究论文 | 提出Prosta-Omics整合流程，将单细胞转录组学、化学信息学和机器学习结合，用于前列腺癌生物标志物发现和药物筛选 | 首次将单细胞RNA测序、机器学习预测拓扑极性表面积与分子对接相结合，构建从组学到治疗的全链条精准医学平台 | 未进行体外或体内实验验证预测化合物的实际疗效 | 开发整合组学与机器学习的前列腺癌精准治疗策略，筛选新型治疗靶点和候选药物 | 前列腺癌组织样本中的恶性及非恶性细胞群体 | 机器学习 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序，分子对接，分子动力学模拟，ADMET分析 | 随机森林 | 单细胞转录组数据，分子SMILES数据 | 前列腺癌组织样本（具体数量未在摘要中说明） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |