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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1561 | 2026-06-18 |
Analysis of immune and autophagy-related genes and their regulatory mechanisms in osteoporosis patients post-menopause
2026, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2026.1783374
PMID:42305270
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研究论文 | 分析绝经后骨质疏松症中免疫和自噬相关基因及其调控机制,并构建诊断模型 | 首次整合免疫和自噬相关差异表达基因,基于CDK2、DDIT3和MAPK3个核心基因构建并验证了高预测准确度(AUC=0.91)的诊断模型,并通过单细胞RNA测序和假时间分析揭示了基因在骨髓间充质干细胞分化过程中的动态表达 | 研究基于公开数据库和动物模型,需要更多临床样本验证;核心基因的功能机制尚需进一步实验验证 | 识别绝经后骨质疏松症中连接免疫细胞和自噬的关键基因,并构建诊断模型 | 绝经后骨质疏松症患者 | 机器学习 | 骨质疏松症 | RNA-seq, 单细胞RNA测序, RT-qPCR | NA | 基因表达数据 | 公共数据库数据及卵巢切除小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1562 | 2026-06-18 |
Identification of potential drug target genes for atopic dermatitis leveraging Mendelian randomization, single-cell transcriptomics, and spatial transcriptomics
2026, Archives of medical science : AMS
IF:3.0Q1
DOI:10.5114/aoms/208855
PMID:42305302
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研究论文 | 通过整合孟德尔随机化、单细胞转录组学和空间转录组学,识别特应性皮炎的潜在药物靶点基因 | 首次结合孟德尔随机化、共定位分析、单细胞RNA测序和空间转录组数据,系统筛选特应性皮炎的潜在药物靶点基因 | 未提供明确的局限性信息 | 识别特应性皮炎的潜在药物靶点基因 | 特应性皮炎患者及对照组的遗传数据、单细胞转录组和空间转录组数据 | 机器学习和基因组学 | 特应性皮炎 | 孟德尔随机化、单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | 基因表达数据、遗传变异数据、单细胞转录组数据、空间转录组数据 | GWAS数据集:病例22,474例,对照774,187例;独立验证队列:病例10,788例,对照30,047例 | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | NA |
| 1563 | 2026-06-18 |
CD4/CD8 ratio is associated with structural reorganization of vaccine-induced immune responses in people living with HIV
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1821444
PMID:42305530
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研究论文 | 单细胞RNA测序分析揭示CD4/CD8比值与HIV感染者疫苗诱导免疫反应的结构重组相关 | 首次通过单细胞RNA测序与配对TCR分析,结合蛋白互作网络拓扑结构,揭示CD4/CD8比值定义的不同免疫状态下疫苗诱导免疫反应的网络级组织差异 | 未提及具体限制 | 探究HIV感染者中CD4/CD8比值如何影响疫苗诱导的免疫反应及其分子机制 | HIV感染者与健康对照者的外周血单个核细胞 | 单细胞生物学 | HIV感染 | 单细胞RNA测序、配对TCR分析、蛋白互作网络分析、Bulk BCR分析 | NA | 单细胞转录组数据、TCR/BCR序列数据 | HIV感染者和健康对照者外周血单个核细胞样本,共采集两次(首次和第二次mRNA疫苗后) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1564 | 2026-06-18 |
A machine learning integrated multi-omics framework for risk prediction and target discovery in insomnia aggravated sepsis induced acute lung injury
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1721749
PMID:42305536
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研究论文 | 该研究通过整合多组学数据和机器学习方法,揭示了失眠加剧败血症诱导急性肺损伤的关键生物标志物PTPN6及其潜在机制 | 首次将失眠与败血症诱导的急性肺损伤关联起来,利用孟德尔随机化确立因果关系,并通过机器学习(随机森林、SVM、KNN)结合SHAP可解释性建模识别核心基因PTPN6,发现其通过调节巨噬细胞极化和JAK/STAT3信号通路发挥抑制作用 | 需要进一步的机制研究和全面临床验证以完全阐明涉及的复杂调控网络 | 识别失眠加剧败血症诱导急性肺损伤的关键生物标志物并阐明其分子机制 | 失眠与败血症诱导急性肺损伤的因果关系及分子通路 | 机器学习 | 急性肺损伤 | 孟德尔随机化、加权基因共表达网络分析、单细胞RNA测序 | 随机森林、SVM、KNN | 转录组数据、单细胞RNA测序数据 | 小鼠模型(LPS诱导的SALI模型) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1565 | 2026-06-18 |
Irofulven and RSL3 synergistically target ferroptosis-related gene PTGR1 to treat head and neck squamous cell carcinoma
2026-Jan, Open life sciences
IF:1.7Q3
DOI:10.1515/biol-2025-1332
PMID:42306048
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研究论文 | 研究铁死亡相关基因PTGR1在头颈部鳞状细胞癌中的作用,并发现Irofulven与RSL3的协同治疗策略 | 首次构建基于铁死亡相关基因的预后模型,并结合单细胞RNA测序分析肿瘤分类风险评分,发现Irofulven靶向PTGR1并与铁死亡诱导剂RSL3协同治疗HNSCC | 基于数据库分析和体外实验,未进行体内验证或大规模临床试验 | 评估铁死亡作为HNSCC生物标志物和治疗靶点的潜力,开发联合治疗策略 | 头颈部鳞状细胞癌(HNSCC)细胞系和数据库样本 | 机器学习 | 头颈部鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | LASSO回归模型 | 基因表达数据、DNA甲基化数据、突变数据、单细胞转录组数据 | 来自公共数据库的HNSCC样本(具体数量未说明) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1566 | 2026-06-18 |
Pathogenic mechanisms of RPGR mutations in X-linked retinitis pigmentosa: integrating clinical pedigree and single-cell transcriptomics
2026, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2026.1814462
PMID:42306097
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研究论文 | 通过整合临床家系分析和单细胞转录组学,阐明RPGR突变导致X连锁视网膜色素变性的致病机制 | 首次将临床家系与单细胞转录组分析相结合,揭示RPGR功能缺失突变通过破坏纤毛运输-光转导轴、激活应激反应并阻滞光感受器分化而致病的分子机制 | 单细胞转录组数据来源于视网膜类器官模型,可能无法完全模拟体内真实病理过程 | 鉴定X连锁视网膜色素变性中的RPGR致病突变并阐明光感受器变性的细胞与分子机制 | 中国X连锁视网膜色素变性家系三代成员及RPGR突变视网膜类器官 | 数字病理学 | 视网膜色素变性 | 全外显子测序, 桑格测序, 单细胞RNA测序 | 无特定模型 | 测序数据 | 一个中国XLRP家系共三代成员 | 无明确信息 | 单细胞RNA测序 | 无明确信息 | 无明确信息 |
| 1567 | 2026-06-18 |
Deciphering the role of per- and polyfluoroalkyl substances in prostate cancer: a multi-omics and computational toxicology approach
2026, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2026.1786248
PMID:42306304
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研究论文 | 采用多组学和计算毒理学方法揭示全氟和多氟烷基物质在前列腺癌发展中的作用机制 | 首次将PFOA和PFOS的毒理基因组数据与前列腺癌转录组数据整合,构建基于机器学习的10基因预后模型,并利用单细胞和空间转录组学识别CDC20为核心靶点,结合分子对接探索天然化合物干预可能性 | 研究主要依赖计算预测和单一DU145细胞系验证,缺乏多种模型和实验系统的进一步确认 | 阐明全氟和多氟烷基物质暴露与前列腺癌分子关联机制并开发预后模型 | PFOA、PFOS暴露与前列腺癌的分子靶点及核心基因CDC20 | 计算毒理学 | 前列腺癌 | 毒理基因组学、转录组学、单细胞RNA测序、空间转录组学、分子对接 | 机器学习 | 毒理基因组数据、转录组数据、单细胞转录组数据、空间转录组数据 | DU145前列腺癌细胞系 | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | NA |
| 1568 | 2026-06-18 |
Deciphering the cellular landscape and genetic underpinnings of fiber diameter determined by dermal papilla cells in fine-wool sheep
2026, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2026.1764812
PMID:42306303
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research paper | 通过单细胞RNA测序构建细毛羊皮肤组织转录图谱,揭示真皮乳头细胞在毛囊发育及纤维直径决定中的潜在分子机制 | 首次在细毛羊中利用单细胞RNA测序解析毛囊微环境的细胞景观,并鉴定真皮乳头细胞三种状态及其对纤维直径的调控机制 | 未明确说明局限性 | 阐明细毛羊纤维直径的细胞与分子调控机制,为超细毛羊精准育种提供参考 | 六只半同胞细毛羊的皮肤组织细胞 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞基因表达数据 | 6只细毛羊的59732个高质量细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1569 | 2026-06-18 |
Single-cell transcriptomics of granulocytes in asthma and atopic diseases
2026, Frontiers in molecular biosciences
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fmolb.2026.1739145
PMID:42306773
|
综述 | 一篇关于粒细胞在哮喘和特应性疾病中单细胞转录组学研究的综述,概述了历史和技术的挑战以及方法学突破,并强调了粒细胞异质性在这类疾病中的新兴作用 | 系统回顾了单细胞RNA测序研究在揭示粒细胞(包括嗜酸性粒细胞、中性粒细胞和肥大细胞)表型与功能异质性方面的进展,同时指出嗜碱性粒细胞在现有数据集中仍然很少,强调了扩展该分辨率至粒细胞的必要性 | 指出了当前数据集中嗜碱性粒细胞代表不足的问题,以及技术挑战(如粒细胞易碎、转录本丰度低)限制的广泛研究 | 概述粒细胞在哮喘和特应性疾病中的角色异质性,以及识别需要实验和计算方法进步来填补的知识空白 | 人类粒细胞(包括嗜酸性粒细胞、中性粒细胞、肥大细胞和嗜碱性粒细胞) | 数字病理学 | 哮喘, 特应性疾病 | scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1570 | 2026-06-18 |
Identifying Shared Key Genes and Cellular Characteristics Between Chronic Periodontitis and Aging Using Integrative Single-Cell and Mendelian Randomization Analyses
2026, BioMed research international
IF:2.6Q3
DOI:10.1155/bmri/5156800
PMID:42307068
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研究论文 | 利用整合单细胞测序和孟德尔随机化方法,鉴定慢性牙周炎与衰老之间的共享关键基因和细胞特征 | 通过单细胞RNA测序与孟德尔随机化分析的整合,首次系统揭示了CD8_CM细胞下调是慢性牙周炎和衰老的共同特征,并识别出GZMK、KLRG1和LYAR作为分子连接 | 共定位分析支持共享因果变异的证据有限,可能受限于样本量和GWAS数据分辨率 | 探究慢性牙周炎与衰老之间共享的关键基因和细胞特征 | 慢性牙周炎患者、衰老个体和健康对照组的外周血样本 | 数字化病理学 | 慢性牙周炎、衰老相关疾病 | 单细胞RNA测序、孟德尔随机化分析、伪时间轨迹分析、细胞间通讯建模、共定位分析、代谢通路富集分析 | NA | 单细胞转录组数据、GWAS数据、表达数量性状位点数据 | 未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1571 | 2026-06-18 |
Untangling the fusion of spatial omics and mechanobiology
2025-12-12, Progress in biomedical engineering (Bristol, England)
DOI:10.1088/2516-1091/ae16f2
PMID:41130259
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研究论文 | 本文探讨了空间力学转录组学这一整合平台的出现,它结合了空间转录组学和机械生物学数据,用于预测疾病状态 | 首次提出空间力学转录组学这一整合方法,将空间转录组学与细胞力学特性相结合,在诊断时间窗口内从相同细胞中获取两种数据 | 未提及具体实验验证或定量评估该方法的性能 | 探索空间组学与机械生物学融合的潜力,以推动精准诊断和新型治疗发展 | 细胞(关注其转录谱和机械特性) | 数字病理学 | 肌肉萎缩症、癌症、青光眼 | 空间转录组学、机械生物学 | NA | 空间转录组数据、细胞力学数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1572 | 2026-06-18 |
Stem cell-based approach to identify regulatory TFs during mammalian cell differentiation
2025-12-09, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2025.102716
PMID:41270744
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研究论文 | 结合多能干细胞分化、单细胞转录组学和CRISPR基因功能缺失筛选,识别哺乳动物细胞分化过程中关键转录因子的方法 | 首次将CRISPR全基因组筛选与单细胞转录组学结合,应用于脊髓运动神经元分化,发现了116个新转录因子及非差异表达基因的关键调控作用 | 小鼠与人源筛选存在交叉物种验证差异,部分靶点的功能保守性需进一步确认 | 系统识别哺乳动物细胞分化中的调控性转录因子 | 小鼠和人类脊髓运动神经元分化过程中的转录因子 | 机器学习 | NA | CRISPR基因功能缺失筛选、单细胞转录组学 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠运动神经元分化模型、人类干细胞分化模型(具体数量未提及) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1573 | 2026-06-18 |
Endothelial protective effects of ferulic acid in preeclampsia treatment
2025-12-01, American journal of physiology. Cell physiology
DOI:10.1152/ajpcell.00495.2025
PMID:41165539
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研究论文 | 本研究探讨阿魏酸通过STAT3/VEGF信号轴改善先兆子痫小鼠内皮功能及减轻炎症的治疗效果 | 首次揭示阿魏酸通过抑制STAT3磷酸化增强内皮屏障功能、稳定血管完整性及改善胎儿发育结局的分子机制 | 未提供明确的局限性描述 | 评估阿魏酸在先兆子痫治疗中对内皮功能障碍的改善作用及分子机制 | 先兆子痫小鼠模型(N-硝基-L-精氨酸甲酯诱导) | 数字病理学 | 先兆子痫 | 单细胞RNA测序、分子检测 | NA | 基因表达数据 | 先兆子痫小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1574 | 2026-06-18 |
Characterizing hypoxia-orchestrated post-stroke changes in oligodendrocyte precursor cells for optimized cell therapy
2025-11-11, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2025.102687
PMID:41173004
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研究论文 | 通过整合小鼠单细胞RNA测序数据、离体OPC培养和在体细胞移植实验,揭示了缺血性中风后少突胶质前体细胞的低氧调控动态变化,并优化细胞治疗策略 | 首次发现缺血性中风后OPC表现出“血管生成”和“寡源性”两种亚型,由不同低氧水平驱动,并利用严重低氧预处理诱导血管生成型OPC,通过静脉移植促进血管新生和功能恢复 | 研究主要基于小鼠模型,结果向人类转化需进一步验证;具体信号通路和细胞间互作机制尚未完全阐明 | 阐明缺血性中风后少突胶质前体细胞的功能调整机制及其对恢复的贡献,以优化干细胞治疗 | 小鼠少突胶质前体细胞 | 计算生物学 | 缺血性中风 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞基因表达数据 | 整合多个小鼠scRNA-seq数据集,涉及tMCAO模型样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1575 | 2026-06-18 |
Delineating transcriptomic signatures of in vitro human skeletal muscle models in comparison to in vivo references
2025-11-11, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2025.102684
PMID:41135530
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研究论文 | 通过大规模比较分析,揭示体外人类骨骼肌模型与体内参考组织之间的转录组特征差异 | 首次对涵盖2D和3D模型的超过400个样本进行系统比较,发现体外模型在肌原性因子表达、表观遗传记忆保留及成纤维细胞生长因子配体缺失等方面的关键不足 | 未明确说明,但可能包括数据集的异质性、模型特异性差异的深入机制分析不足 | 评估体外骨骼肌模型与体内组织在转录组水平上的保真度,为改进模型提供靶向方向 | 人类骨骼肌体外模型(2D和3D)及其体内对应样本 | 机器学习 | 肌肉疾病 | 批量RNA测序、单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据、单细胞转录组数据 | 400多个样本,覆盖39项研究 | NA | 批量RNA测序、单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1576 | 2026-06-18 |
"Oxygen tone" drives stage-specific OPC phenotypes for cell-based stroke therapy
2025-11-11, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2025.102709
PMID:41223837
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研究论文 | 探讨低氧环境如何影响缺血性脑卒中后少突胶质前体细胞(OPC)的表型变化,并揭示其促进血管生成和髓鞘再生的潜力 | 首次揭示“氧气张力”通过调控OPC阶段特异性表型来促进血管生成和髓鞘再生,为细胞治疗脑卒中提供新策略 | 依赖体内外模型,可能未能完全模拟人类脑卒中后的复杂微环境 | 研究低氧对缺血性脑卒中后OPC特征的调控作用及其治疗潜力 | 缺血性脑卒中后的少突胶质前体细胞(OPC) | 机器学习 | 脑血管疾病 | 单细胞转录组测序、体内外模型 | NA | 图像 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1577 | 2026-06-18 |
CFTR High Expresser BEST4+ cells are pH-sensing neuropod cells: new implications for intestinal physiology and cystic fibrosis disease
2025-11-01, American journal of physiology. Cell physiology
DOI:10.1152/ajpcell.00082.2025
PMID:41005986
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序研究,确认人类肠道中的BEST4+细胞是CFTR高表达细胞(CHE),并进一步揭示其为pH感应神经足细胞,在肠道生理和囊性纤维化疾病中具有新意义 | 首次确定大鼠小肠中的CFTR高表达细胞为能够感应和响应腔内pH的神经足细胞,并证实BEST4细胞是近端小肠中的CHE,同时首次在CF大鼠模型中表征CHE中的CFTR及相关mRNA和蛋白 | NA | 探究BEST4+细胞作为CFTR高表达细胞的性质及其在肠道pH感应和囊性纤维化疾病中的作用 | 人类和大鼠肠道上皮细胞,特别是BEST4+和CFTR高表达细胞亚群 | 数字病理学 | 囊性纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 人类和小鼠肠道组织样本,具体数量未提及 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | scRNA-Seq使用10x Chromium平台进行 |
| 1578 | 2026-06-18 |
IL-6+ fibroblasts contribute to shaping the pro-inflammatory microenvironment in severe periodontitis after non-surgical periodontal therapy
2025-Oct-15, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-07132-8
PMID:41094591
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研究论文 | 揭示非手术牙周治疗后重度牙周炎残余深袋中IL-6+成纤维细胞促进促炎微环境形成的作用 | 首次发现非手术牙周治疗后重度牙周炎残余深袋中IL-6+成纤维细胞富集,并揭示其与FCN1+巨噬细胞的相互作用通过缺氧微环境驱动持续性炎症和骨吸收,为靶向治疗提供新见解 | 未明确提及 | 探索非手术牙周治疗后重度牙周炎残余深袋的细胞组成和分子环境,为靶向治疗提供关键见解 | 重度牙周炎患者(非手术牙周治疗后)和健康捐赠者的牙周组织 | 机器学习 | 牙周炎 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 多重免疫组化免疫荧光 | NA | 基因表达数据, 组织图像 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 1579 | 2026-06-18 |
Human deep subcutaneous adipose tissue is enriched for inflammatory and tissue remodeling pathways
2025-10-01, American journal of physiology. Cell physiology
DOI:10.1152/ajpcell.00463.2025
PMID:40833844
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研究论文 | 本研究通过批量与单细胞RNA测序揭示了人类深层皮下脂肪组织与浅层脂肪组织在炎症和组织重塑通路上的差异 | 首次系统比较浅层和深层皮下脂肪组织在转录组水平上的差异,发现深层脂肪组织富含炎症和组织重塑相关基因,并鉴定出特异性细胞亚型,如氧化应激相关Mox巨噬细胞和应激反应性成纤维细胞 | 未提及 | 比较浅层和深层皮下脂肪组织的转录组差异,揭示其在炎症和组织重塑中的不同作用 | 人类浅层和深层皮下脂肪组织 | 机器学习和生物信息学 | 代谢性疾病 | 批量RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | 转录组数据 | 未提及样本数量 | NA | 批量RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1580 | 2026-06-18 |
In Vivo Reprogramming Dysfunctional Retinal Ganglion Cells and Visual-phototransduction via Wireless Charging Nanogold for Leber's Hereditary Optic Neuropathy
2025-10, Advanced materials (Deerfield Beach, Fla.)
DOI:10.1002/adma.202504509
PMID:40852879
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研究论文 | 利用无线充电纳米金颗粒在体内重编程功能障碍的视网膜神经节细胞并恢复视觉光转导,用于治疗莱伯遗传性视神经病变 | 提出了一种线粒体靶向的无线充电金纳米颗粒,兼具基因递送平台和电刺激恢复光转导的双重功能 | 该研究仅在小鼠模型和患者来源的类器官中验证,未在人体临床试验中评估疗效和安全性 | 开发一种新型基因治疗策略,通过无线充电纳米颗粒促进视网膜神经节细胞再生和视觉功能恢复,用于治疗莱伯遗传性视神经病变 | 莱伯遗传性视神经病变患者来源的诱导多能干细胞分化的视网膜类器官和LHON小鼠模型 | 数字病理学, 机器学习 | 眼科疾病 | 单细胞RNA测序, 时空转录组学 | NA | 转录组数据 | LHON小鼠模型和患者来源的视网膜类器官样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | 10x Chromium单细胞3'测序, 10x Visium空间转录组学 |