本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!
如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!


除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1561 | 2026-05-21 |
Single-cell transcriptomic analysis reveals cellular heterogeneity and prognostic subtypes in colorectal cancer
2026-Jun, Clinical & translational oncology : official publication of the Federation of Spanish Oncology Societies and of the National Cancer Institute of Mexico
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12094-025-04153-z
PMID:41430524
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析结直肠癌的细胞异质性并识别预后亚型 | 整合单细胞RNA-seq与批量RNA-seq数据,在单细胞水平揭示结直肠癌肿瘤微环境的细胞组成,并基于标记基因对患者进行基因分型,识别出具有预后意义的分子亚型 | 需要进一步的功能验证以充分理解这些发现的临床意义 | 探索结直肠癌的细胞组成,整合单细胞与批量转录组数据以识别预后标志物并表征肿瘤异质性 | 结直肠癌肿瘤样本的细胞 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序、批量RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 17例结直肠癌样本用于单细胞RNA-seq,566例结直肠癌样本用于批量RNA-seq | NA | 单细胞RNA测序、批量RNA测序 | NA | NA |
| 1562 | 2026-05-21 |
CCR5 expression defines the functional heterogeneity of tumor-infiltrating CD8+ T cells and predicts enhanced antitumor immunity and favorable prognosis in non-small cell lung cancer
2026-Jun, Clinical & translational oncology : official publication of the Federation of Spanish Oncology Societies and of the National Cancer Institute of Mexico
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12094-025-04170-y
PMID:41432877
|
研究论文 | 本研究通过综合转录组、单细胞RNA测序及功能实验,揭示了CCR5+CD8+ T细胞在非小细胞肺癌中的抗肿瘤作用及其作为预后标志物的潜力 | 首次在非小细胞肺癌中系统验证CCR5+CD8+ T细胞的功能异质性及其独立预后价值,并采用多方法联合验证(转录组、单细胞、染色、功能实验) | 未提供明显局限性,可能包括样本量有限或机制深度不足(基于摘要推断) | 评估CCR5+CD8+ T细胞在非小细胞肺癌中的抗肿瘤功能和预后价值 | 非小细胞肺癌患者肿瘤浸润CD8+ T细胞 | 机器学习 | 肺癌 | RNA-seq, 单细胞RNA测序, 多重免疫荧光染色, 体外细胞共培养杀伤实验 | NA | 转录组数据, 单细胞转录组数据, 组织图像 | TCGA和GEO队列(多个队列),15例NSCLC患者样本(单细胞RNA测序) | NA | NA | NA | NA |
| 1563 | 2026-05-21 |
Macrophage-Fibroblast Crosstalk Shapes Wound Repair Signaling In Vitro
2026-May-31, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202601156R
PMID:42149092
|
研究论文 | 利用体外2D和3D伤口愈合模型结合活细胞钙成像和单细胞RNA测序,研究巨噬细胞与成纤维细胞之间的接触依赖性和旁分泌互作机制 | 揭示了接触依赖性钙信号和连接蛋白信号与转录重塑的整合如何协调巨噬细胞-成纤维细胞行为,特别是发现连接蛋白Cx43介导的细胞-细胞接触增强巨噬细胞IL10生成并抑制TNFα分泌 | 研究仅基于体外模型,尚未在体内伤口愈合环境中验证相关信号通路 | 阐明巨噬细胞与成纤维细胞之间接触依赖性信号如何与旁分泌通路整合以调控伤口愈合过程中的相互行为 | 骨髓来源巨噬细胞和成纤维细胞 | 数字病理学 | 伤口愈合 | 单细胞RNA测序、活细胞钙成像 | NA | 基因表达数据、钙成像数据 | 使用骨髓来源巨噬细胞和成纤维细胞进行体外实验,未提供具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1564 | 2026-05-21 |
Contrastive graph regularized non-negative matrix factorization for domain identification of spatial transcriptomics
2026-May-20, Journal of the Royal Society, Interface
DOI:10.1098/rsif.2025.0424
PMID:42159088
|
研究论文 | 提出对比图正则化非负矩阵分解模型用于空间转录组学的域识别,实现可解释的降维和空间结构保留 | 首次将对比学习与图正则化非负矩阵分解相结合,通过构建正负样本对同时利用基因表达相似性和空间邻近性,增强特征表示和空间结构保留,提升模型的可解释性 | 未提及局限性,但可能依赖于高质量空间转录组数据,且对比学习框架的计算复杂度较高 | 开发一种可解释的降维方法,用于空间转录组学中的空间域自动识别和生物学相关区域发现 | 空间转录组学数据中的空间域和生物功能区域 | 机器学习 | NA | 空间转录组学 | 非负矩阵分解 | 基因表达数据 | 三个公开空间转录组数据集 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1565 | 2026-05-21 |
PFAS is associated with perineural invasion in triple-negative breast cancer with a potential role for Cathepsin D dysregulation: a multi-omics and experimental study
2026-May-20, Clinical and experimental medicine
IF:3.2Q2
DOI:10.1007/s10238-026-02164-w
PMID:42159784
|
研究论文 | 整合多组学数据,探究全氟和多氟烷基物质(PFAS)与三阴性乳腺癌(TNBC)中神经侵袭(PNI)的关联,并验证组织蛋白酶D(CTSD)的作用 | 首次揭示PFAS暴露与TNBC中PNI的关联,并证明CTSD为该关联的中介因子;利用多组学数据构建基于CTSD的预后模型,发现天然抑制剂Aurantio-obtusin | 未提及具体局限性,但可能包括样本量有限、机制验证仅基于体外实验、PFAS暴露剂量与真实环境差异等 | 阐明PFAS暴露在TNBC中促进神经侵袭的分子机制,并开发预后标志物和潜在治疗策略 | 三阴性乳腺癌患者样本及细胞系 | 机器学习, 数字病理学 | 三阴性乳腺癌 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 分子对接, 分子动力学模拟 | CNN(卷积神经网络), 机器学习预后模型 | 基因表达数据, 单细胞转录组数据, 蛋白质结构数据 | TCGA-BRCA和METABRIC队列及多个单细胞RNA-seq数据集,具体样本数未提供 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | 使用Seurat、Monocle2、CellChat等工具进行单细胞分析 |
| 1566 | 2026-05-21 |
Decoding the breast cancer microenvironment by spatial multi-omics: from architecture to clinical translation
2026-May-20, Clinical & translational oncology : official publication of the Federation of Spanish Oncology Societies and of the National Cancer Institute of Mexico
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12094-026-04398-2
PMID:42159876
|
综述 | 通过空间多组学技术解码乳腺癌微环境,从结构到临床转化的全面综述 | 综合讨论空间转录组学、空间蛋白质组学和新兴代谢组学在乳腺癌微环境中的应用,强调从静态分子清单向高分辨率空间图谱的转变,并构建基于肿瘤-免疫界面距离的预后模型 | 多模态数据整合、批次效应、高成本以及临床实施中缺乏标准化方案 | 评估空间多组学技术在乳腺癌研究中的进展、挑战及临床转化潜力 | 乳腺癌肿瘤微环境,包括肿瘤细胞异质性、基质细胞亚型、免疫细胞拓扑结构和三级淋巴结构 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 空间转录组学, 空间蛋白质组学, 代谢组学 | NA | 图像, 文本 | NA | NA | 空间转录组学, 空间蛋白质组学 | NA | NA |
| 1567 | 2026-05-21 |
SSR4 sustains Tertiary Lymphoid Structures by Regulation Quality Control of N-linked Glycosylation During B-cell Differentiation Into Plasmacyte in Colorectal Cancer
2026-May-20, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.75790
PMID:42159884
|
research paper | 通过整合空间转录组学和单细胞RNA测序,研究SSR4在结直肠癌中如何通过调控N-连接糖基化的质量控制来维持三级淋巴结构(TLS)功能 | 首次揭示SSR4作为TRAP复合体组分在B细胞分化中渐进诱导,通过调控BAFFR的N-糖基化维持B细胞活化和TLS依赖性抗肿瘤免疫,并发现其在抗PD-1治疗应答中的上调作用 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验,人体内具体调控机制及临床转化效果仍需进一步验证 | 阐明维持肿瘤内三级淋巴结构(TLS)中B细胞分化和抗体产生的内在调控程序 | 结直肠癌患者肿瘤组织中的B细胞及三级淋巴结构 | machine learning | colorectal cancer | spatial transcriptomics, single-cell RNA sequencing | NA | spatial transcriptomic data, single-cell RNA sequencing data | 结直肠癌组织样本,具体数量未提供 | 10x Genomics | single-cell RNA-seq, spatial transcriptomics | 10x Chromium, 10x Visium | 10x Chromium Single Cell 3' 用于单细胞RNA测序,10x Visium 用于空间转录组学 |
| 1568 | 2026-05-21 |
SIRT6-Mediated Deacetylation of ATF3 Promotes Silica-Induced Lung Fibrosis by Enhancing its Nuclear Import via Binding to Importin α
2026-May-20, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.75782
PMID:42160006
|
研究论文 | 研究发现SIRT6介导的ATF3去乙酰化通过增强其与importin α的结合促进核输入,从而驱动矽肺相关肺纤维化 | 首次揭示SIRT6介导的ATF3去乙酰化通过importin α介导的核输入促进巨噬细胞衰老及矽肺纤维化的全新机制,并发现伊曲康唑可作为潜在治疗靶点 | 未明确提及具体局限性 | 探究巨噬细胞衰老在矽肺纤维化中的作用机制及潜在治疗靶点 | 健康与矽肺患者及小鼠肺组织中的巨噬细胞 | 数字病理学 | 矽肺(肺纤维化) | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 人类和小鼠肺组织样本(健康与矽肺) | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序平台 |
| 1569 | 2026-05-21 |
RGS proteins: Potential regulators of mouse melanopsin's signaling phototransduction cascade across ipRGC subtypes
2026-May-19, Biophysical journal
IF:3.2Q2
DOI:10.1016/j.bpj.2025.11.006
PMID:41204666
|
研究论文 | 本研究揭示了RGS蛋白在调控小鼠黑视素信号转导级联反应中,不同ipRGC亚型可能通过特异性RGS蛋白组合影响G蛋白信号通路,从而实现单一GPCR在不同细胞类型中启动不同光转导级联的机制 | 首次发现ipRGC亚型选择性富集特定RGS蛋白(M1亚型富集Rgs16,M4亚型富集Rgs5和Rgs11),并证明RGS蛋白的亚型特异性组合可差异调控Gα信号,从而可能解释单一GPCR如何在不同细胞中启动不同信号通路 | 研究主要在异源表达系统和离体视网膜中进行,缺乏体内功能验证;RGS蛋白对Gα信号的调控机制及其在完整视觉行为中的作用尚需进一步研究 | 探究单一G蛋白偶联受体黑视素如何在不同ipRGC亚型中启动不同光转导级联的潜在机制 | 小鼠视网膜中的固有光敏视网膜神经节细胞(ipRGC)亚型(M1和M4亚型)及异源表达小鼠黑视素的HEK293细胞 | 神经科学,分子生物学 | NA | 异源表达系统,单细胞转录组学元分析,RNAscope,DREADD-Gs激活,膜片钳电生理 | NA | 单细胞转录组数据,电生理数据,异源表达数据 | 使用小鼠视网膜样本(具体数量未在摘要中说明),以及HEK293细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 使用单细胞转录组学元分析和RNAscope技术(具体平台未提及) |
| 1570 | 2026-05-21 |
Pan-cancer analysis of spatial transcriptomics reveals heterogeneous tumor spatial microenvironment
2026-May-19, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2026.102751
PMID:41999752
|
研究论文 | 对12种癌症类型373个样本进行泛癌空间转录组分析,揭示肿瘤空间微环境的异质性 | 首次大规模泛癌空间转录组分析,识别出56个局部细胞程序和13个重现性微环境,并发现肿瘤细胞和巨噬细胞的基因表达高度依赖于其空间位置 | 样本量和癌症类型覆盖仍有局限,部分微环境的临床关联需进一步验证 | 系统解析肿瘤空间微环境的异质性及其对临床结局的影响 | 12种癌症类型的373个肿瘤样本 | 数字病理学 | 多种癌症(泛癌) | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | 373个肿瘤样本(12种癌症类型) | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 10x Visium空间转录组平台 |
| 1571 | 2026-05-21 |
Senescent-like neutrophils shape angiogenic immunosuppressive niches in colorectal cancer liver metastasis
2026-May-19, Cancer discovery
IF:29.7Q1
DOI:10.1158/2159-8290.CD-25-0820
PMID:42154581
|
研究论文 | 利用单细胞RNA测序和空间增强分辨率组学测序揭示结直肠癌肝转移中肿瘤相关中性粒细胞的转录组图谱,并发现衰老样中性粒细胞通过促进血管生成和招募免疫抑制巨噬细胞形成免疫抑制微环境 | 首次在单细胞和空间水平系统描绘结直肠癌肝转移中肿瘤相关中性粒细胞的转录图谱,并鉴定出以糖酵解特征和衰老表型为特征的终末分化促肿瘤中性粒细胞亚群(TAN1),揭示BHLHE40在葡萄糖剥夺驱动的TAN1生成中的关键作用 | 未提及明显局限性 | 阐明结直肠癌肝转移中肿瘤相关中性粒细胞的异质性和功能 | 结直肠癌肝转移肿瘤组织中的中性粒细胞 | 数字病理学 | 结直肠癌肝转移 | 单细胞RNA测序,空间增强分辨率组学测序 | NA | 单细胞转录组数据,空间转录组数据 | 结直肠癌肝转移患者样本(具体数量未提及) | 10x Genomics,华大基因 | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | 10x Chromium,华大基因Stereo-seq | 10x Chromium单细胞RNA测序,华大基因Stereo-seq空间转录组学 |
| 1572 | 2026-05-21 |
High-salt diet in macrophage-associated metabolic disorders: Mechanisms and therapeutic implications
2026-May-19, Chinese medical journal
IF:7.5Q1
DOI:10.1097/CM9.0000000000004098
PMID:42156155
|
review | 总结了高盐饮食通过调节巨噬细胞极化、代谢重编程和表观遗传印记,在肥胖相关2型糖尿病等代谢紊乱中促进慢性炎症和胰岛素抵抗的机制及潜在治疗策略 | 系统阐述了高盐饮食通过p38/MAPK、NF-κB和NLRP3炎症小体通路驱动巨噬细胞向M1促炎表型极化及糖酵解代谢转变,并协调组蛋白修饰、DNA甲基化和非编码RNA等表观遗传机制形成持续“代谢记忆”的创新观点 | 未提及具体研究的局限性,但未来需通过谱系追踪、单细胞测序和空间多组学技术进一步验证机制并推进精准医学发展 | 探讨高盐饮食在巨噬细胞相关代谢紊乱中的作用机制及治疗意义 | 巨噬细胞与代谢组织(脂肪、肝脏、胰腺、肠道)中的相互作用 | machine learning | cardiovascular disease | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1573 | 2026-05-21 |
Stem cell activity is linked to a transient acquisition of pluripotency during callus proliferation
2026-May-19, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-73124-x
PMID:42156391
|
研究论文 | 通过单细胞转录组分析,揭示愈伤组织形成过程中多能性获得是短暂的,并由WOX5-TAA1模块的干细胞活性调控 | 首次发现愈伤组织多能性获得是短暂的,并识别出WOX5-TAA1模块在干细胞活性中的关键作用,以及愈伤组织发育的连续程序 | 未说明 | 研究植物体细胞重编程过程中多能性获得的动态机制 | 拟南芥的愈伤组织细胞 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞转录组分析 | NA | 单细胞转录组数据 | 多能性和非多能性愈伤组织样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞测序平台 |
| 1574 | 2026-05-21 |
Single-cell transcriptomics reveals anti-inflammatory effects of prednisolone on the hepatic niche in biliary atresia
2026-May-19, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-026-48897-2
PMID:42156429
|
研究论文 | 单细胞转录组揭示泼尼松龙对胆道闭锁肝脏微环境的抗炎作用机制 | 首次通过单细胞RNA测序解析泼尼松龙在胆道闭锁模型中对肝星状细胞和巨噬细胞亚群的特异性调控,发现Nr3c1-Klf7基因调控网络介导的HSC静息-激活转换及Fosl1-Hnf1b调控的促炎性肌成纤维细胞亚群MFB-2 | 研究基于小鼠模型,需进一步在临床样本中验证;泼尼松龙耐药性MFB-2亚群的机制尚未完全阐明 | 阐明泼尼松龙治疗胆道闭锁的细胞和分子机制 | 恒河猴轮状病毒诱导的胆道闭锁小鼠模型及胆道闭锁患者肝脏样本 | 单细胞转录组学 | 胆道闭锁 | 单细胞RNA测序、免疫组织化学 | NA | 单细胞基因表达数据 | 小鼠肝脏样本(感染后第21天和第28天),每组注射PBS或泼尼松龙 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 1575 | 2026-05-21 |
E2F-mediated activation of mTORC1 through the ubiquitin-proteasome system promotes lung adenocarcinoma progression
2026-May-19, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-026-08863-2
PMID:42156726
|
研究论文 | 通过整合TCGA/GEO数据集和单细胞RNA-seq数据,发现E2F8通过泛素-蛋白酶体系统激活mTORC1通路,促进肺腺癌进展 | 首次揭示E2F8通过转录激活E3连接酶WWP1,介导TSC1的K48连接多聚泛素化降解,从而维持mTORC1信号通路的分子机制,并鉴定出E2F8-WWP1-TSC1-mTORC1轴作为肺腺癌的可靶向调控回路 | 尚未明确E2F8在肺腺癌中上调的上游调控机制,以及该轴在其他肺癌亚型或临床样本中的验证 | 探究肺腺癌中mTORC1异常激活的分子机制及其与E2F转录因子的关联 | TCGA/GEO数据集中的肺腺癌样本、PC-9和H1975细胞系及异种移植瘤模型 | 分子生物学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序、RNA-seq、免疫印迹、免疫组化 | NA | 转录组数据、单细胞转录组数据 | TCGA/GEO公共数据库肺腺癌样本及实验室单细胞RNA-seq样本(具体数量未明确提及) | Illumina | 单细胞RNA-seq | Illumina NovaSeq | 用于单细胞RNA测序的Illumina平台(具体配置未详述) |
| 1576 | 2026-05-21 |
Osteoblast-derived CAR3 synergizing with collagen and bone sialoprotein enhances bone formation
2026-May-19, International journal of oral science
IF:10.8Q1
DOI:10.1038/s41368-026-00443-6
PMID:42156740
|
研究论文 | 成骨细胞分泌的碳酸酐酶III(CAR3)通过与胶原和骨唾液蛋白协同作用,促进骨形成和修复 | 首次发现并阐明成骨细胞特异性表达的CAR3在骨骼发育和内稳态中的关键作用,揭示其通过形成三元复合物促进胶原纤维内矿化的新机制 | NA | 探究CAR3在成骨细胞谱系细胞中的功能及其在骨骼发育和修复中的作用机制 | 小鼠颅骨和长骨组织、Prx1谱系细胞、三种细胞成骨细胞 | 数字病理学 | 骨质疏松症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠颅骨和长骨样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1577 | 2026-05-21 |
Inferring stochastic dynamics by biophysical Neural ODE using single-cell transcriptomics
2026-May-19, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-73257-z
PMID:42156756
|
研究论文 | 提出一种名为DynNet的深度学习方法,整合神经ODE与生物物理模型,从单细胞转录组数据推断随机动力学 | 将神经ODE与生物物理模型和基因表达动力学先验知识相结合,实现可解释的细胞命运随机动力学推断 | 主要依赖合成数据和有限实验数据验证,未见大规模临床应用或跨物种泛化性评估 | 开发从静态单细胞转录组数据推断细胞命运随机动力学的计算方法 | 合成数据及肝细胞分化、上皮间质转化(EMT)实验数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 神经ODE | 基因表达数据 | 未明确提及具体样本量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1578 | 2026-05-21 |
Stroke-induced gut microbiome dysbiosis accelerates Alzheimer's disease progression
2026-May-19, Journal of cerebral blood flow and metabolism : official journal of the International Society of Cerebral Blood Flow and Metabolism
IF:4.9Q1
DOI:10.1177/0271678X261449017
PMID:42157525
|
研究论文 | 揭示中风后肠道微生物失调加速阿尔茨海默病进展的机制 | 首次证明中风诱导的肠道微生物组是阿尔茨海默病相关病理的关键驱动因素,通过粪便移植和单细胞空间转录组学揭示脑肠轴作用 | 主要基于小鼠模型,人体验证有限;使用年轻小鼠而非老年模型,可能影响临床转化 | 探究中风后肠道微生物失调如何加速阿尔茨海默病进展的生物学机制 | 中风患者粪便微生物、三转基因阿尔茨海默病小鼠(3xTg-AD) | 数字病理学 | 阿尔茨海默病、脑血管疾病 | 粪便微生物移植、单细胞空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | 未明确提供具体样本数量,涉及中风患者和健康供体粪便样本及小鼠模型 | NA | 单细胞空间转录组学 | NA | NA |
| 1579 | 2026-05-21 |
Depicting the dynamic transcriptional and epigenetic landscape of testis development in pubertal Simmental cattle
2026-May-18, Journal of animal science and biotechnology
IF:6.3Q1
DOI:10.1186/s40104-026-01406-x
PMID:42144636
|
研究论文 | 利用单细胞RNA测序和单核ATAC测序揭示了青春期西门塔尔牛睾丸发育中的动态转录和表观遗传图谱 | 首次整合scRNA-seq和sNucATAC-seq技术系统解析青春期前后西门塔尔牛睾丸发育中生殖细胞命运转变的调控网络,并鉴定出跨物种保守的转录因子E2F1、BCLAF1和YY1 | 未明确提及样本量局限性或技术验证不足等限制 | 阐明牛睾丸发育中生殖细胞命运转变的调控机制 | 西门塔尔牛睾丸组织(出生后、青春期前和青春期三个阶段) | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、单核ATAC测序(sNucATAC-seq) | NA | 基因表达数据、染色质开放性数据 | 西门塔尔牛睾丸组织样本覆盖三个发育阶段(出生后、青春期前、青春期) | NA | 单细胞RNA测序、单核ATAC测序 | NA | NA |
| 1580 | 2026-05-21 |
Single-cell profiling and machine learning identify cuproptosis-related fibroblast subpopulations and fibrogenesis modulator AEBP1 in endometriosis
2026-05-18, Apoptosis : an international journal on programmed cell death
IF:6.1Q1
DOI:10.1007/s10495-026-02342-x
PMID:42149287
|
研究论文 | 利用单细胞RNA测序和机器学习,鉴定子宫内膜异位症中与铜死亡相关的成纤维细胞亚群和纤维化调节因子AEBP1 | 首次将铜死亡与子宫内膜异位症的成纤维细胞介导的纤维化进程关联,并利用机器学习和网络分析优先筛选出关键枢纽基因AEBP1 | 铜死亡相关分子机制与纤维化进展的因果关联仍需进一步验证,且目前仅限于体外和动物模型 | 阐明铜死亡在子宫内膜异位症成纤维细胞介导的纤维化进程中的作用 | 正常、在位和异位子宫内膜组织、子宫内膜基质细胞、子宫内膜异位症小鼠模型 | 单细胞分析、机器学习 | 子宫内膜异位症 | 单细胞RNA测序 | 机器学习模型 | 单细胞转录组数据 | 正常、在位和异位子宫内膜组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |