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当前共找到 34772 篇文献，本页显示第 1561 - 1580 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1561 | 2025-12-11 |
FastSCODE: an accelerated SCODE algorithm for inferring gene regulatory networks on manycore processors
2025-Dec-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaf624
PMID:41237047
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研究论文 | 本文介绍了FastSCODE，一种针对多核处理器优化的加速版SCODE算法，用于从单细胞RNA测序数据推断基因调控网络 | 开发了FastSCODE，通过批处理计算和GPU加速，显著提升了SCODE算法的计算性能，处理大型数据集时速度提升高达6000倍 | 未在摘要中明确提及具体限制，但可能依赖于GPU硬件和大型数据集的有效性 | 优化基因调控网络推断算法的计算性能，以处理大规模单细胞RNA测序数据 | 单细胞RNA测序数据，包括小鼠、人类和植物细胞 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 线性ODE模型 | 基因表达谱数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1562 | 2025-12-11 |
Microplastic exposure elicits sex-specific atherosclerosis development in lean low-density lipoprotein receptor-deficient mice
2025-Dec, Environment international
IF:10.3Q1
DOI:10.1016/j.envint.2025.109938
PMID:41275764
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研究论文 | 本研究探讨了环境相关剂量微塑料暴露对低密度脂蛋白受体缺陷小鼠动脉粥样硬化发展的性别特异性影响 | 揭示了微塑料暴露在非肥胖小鼠模型中导致动脉粥样硬化发展的性别差异，并通过单细胞RNA测序提供了细胞机制见解 | 研究仅使用小鼠模型，结果向人类外推需谨慎；暴露剂量和持续时间可能无法完全模拟人类长期低剂量暴露 | 评估微塑料暴露对心血管系统的影响，特别是动脉粥样硬化的发展 | 低密度脂蛋白受体缺陷小鼠（LDLR小鼠）的动脉组织及原代内皮细胞 | 心血管疾病研究 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序，体外细胞培养 | 动物模型（小鼠），细胞模型 | 基因表达数据，组织病理学数据 | 未明确具体数量，但涉及雄性和雌性LDLR小鼠分组 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1563 | 2025-12-11 |
Phenotypic Changes in a Monocyte Cluster with High Interleukin-1 Beta Expression during Long-Term Anti-CD20 Therapy
2025-Dec, Annals of neurology
IF:8.1Q1
DOI:10.1002/ana.78004
PMID:40879186
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研究论文 | 本研究通过单细胞多组学分析，揭示了多发性硬化症患者在接受长期抗CD20治疗期间，一个高表达白细胞介素-1β的单核细胞亚群的表型变化 | 首次在单细胞分辨率下鉴定出一个具有独特促炎特征和中枢神经系统浸润潜能的IL1Bhigh单核细胞亚群，并阐明了其在抗CD20治疗前后的动态变化 | 样本量相对有限，且主要关注外周血单核细胞，未直接分析中枢神经系统内的细胞变化 | 探究多发性硬化症患者在接受抗CD20治疗期间，外周血单核细胞的疾病相关和治疗相关变化 | 多发性硬化症患者和健康对照者的外周血单核细胞 | 单细胞多组学 | 多发性硬化症 | 靶向单细胞转录组和表位测序、多色光谱流式细胞术 | 细胞聚类分析、基因本体富集分析、细胞间通讯网络分析 | 单细胞转录组数据、表位数据、流式细胞术数据 | 64份血液样本（来自多发性硬化症患者基线及治疗后3个时间点，以及健康对照） | NA | 单细胞RNA测序、单细胞表位分析 | NA | NA |
| 1564 | 2025-12-11 |
Pangenomics and single-cell transcriptomics uncover the genetic basis of continuous bearing trait in grapevine
2025-Dec, Horticulture research
IF:7.6Q1
DOI:10.1093/hr/uhaf228
PMID:41355945
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研究论文 | 本研究通过整合泛基因组学、比较基因组学、单细胞转录组学和批量转录组学，揭示了葡萄连续开花和结实性状（CFB）的遗传基础 | 首次结合泛基因组学和单细胞转录组学分析葡萄连续开花性状，并基于新生成的单倍型分辨近端粒到端粒（T2T）基因组进行深入研究 | NA | 阐明葡萄连续开花和结实性状的遗传机制 | 葡萄品种'Julian'（连续开花和结实）和'Muscat Hamburg'（季节性开花和结实） | 植物基因组学 | NA | 泛基因组学, 比较基因组学, 单细胞转录组学, 批量转录组学 | NA | 基因组数据, 转录组数据 | 16个葡萄基因组（包括新生成的'Julian' T2T基因组和15个已发表基因组），以及两个品种的花芽单细胞转录组数据 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 1565 | 2025-12-11 |
Integrating Single-Cell and Spatial Transcriptomics Reveals NK Cell Subpopulations Associated With Immunotherapy for Melanoma
2025-Dec, Smart medicine
DOI:10.1002/smmd.70023
PMID:41357561
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞和空间转录组学，揭示了与黑色素瘤免疫治疗相关的NK细胞亚群及其功能 | 首次在黑色素瘤中系统鉴定出四个NK细胞亚群，并利用空间转录组学揭示了关键亚群NK cluster 01与肿瘤细胞的空间邻近关系及潜在的IFN-II信号通路调控网络 | 研究机制尚未通过体内外实验完全验证，分子对接的靶向治疗策略仍需后续实验确认 | 探究黑色素瘤患者对免疫检查点抑制剂产生耐药性的机制，并寻找新的治疗靶点 | 黑色素瘤患者样本中的NK细胞 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | NA | 转录组数据，空间位置数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq，空间转录组学 | NA | NA |
| 1566 | 2025-12-11 |
Protocol to analyze changes in hippocampal neural stem cell quiescence from single-cell RNA sequencing data
2025-Nov-24, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2025.104226
PMID:41289073
|
研究论文 | 本文提出了一种从单细胞RNA测序数据中分析小鼠海马神经干细胞静息状态变化的计算协议 | 通过计算协议克服了区分静息神经干细胞与星形胶质细胞以及增殖神经干细胞与祖细胞的挑战 | NA | 分析扰动如何影响神经干细胞静息深度 | 小鼠海马神经干细胞 | 自然语言处理 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1567 | 2025-12-11 |
Sex-biased immune rewiring may underlie reduced risk for cardiac allograft vasculopathy in females following heart transplantation
2025-Nov-24, The Journal of heart and lung transplantation : the official publication of the International Society for Heart Transplantation
DOI:10.1016/j.healun.2025.11.022
PMID:41297731
|
研究论文 | 本研究探讨了心脏移植后性别差异对免疫结果的影响，特别是女性在心脏同种异体移植物血管病变风险降低的潜在机制 | 首次结合大规模临床数据和单细胞RNA测序技术，揭示了心脏移植后性别特异性免疫重编程的分子机制，并发现男性在移植后表现出独特的炎症通路激活 | 研究样本量有限，单细胞RNA测序数据仅来自公开数据集和40例移植受者，需要更多研究验证这些发现 | 揭示心脏移植后性别差异对免疫结果的影响机制，为风险分层和精准免疫抑制策略提供依据 | 833名成人和儿童心脏移植受者，以及健康个体的单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 833名心脏移植受者（694名成人，139名儿童）和981名健康个体的单细胞RNA测序数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1568 | 2025-12-11 |
Periductal Fibroblast Density Defines Lymphocyte Exclusion via a CD44-Dependent Stromal Checkpoint in Pancreatic Cancer
2025-Nov-06, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.05.23.593868
PMID:38853982
|
研究论文 | 本研究揭示了胰腺导管腺癌中，导管周围成纤维细胞密度通过CD44依赖性基质检查点调控淋巴细胞排斥的机制 | 首次将癌症相关成纤维细胞分层的导管空间结构确立为PDAC中免疫排斥的基本决定因素，并识别出可靶向的“基质检查点” | 研究主要基于治疗初治患者样本，未涉及治疗后或晚期疾病阶段的动态变化 | 探究胰腺导管腺癌中纤维化对基质-导管结构和免疫细胞定位的影响 | 胰腺导管腺癌患者样本，包括恶性PDAC上皮导管区域 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 成像质谱流式技术、多重免疫组化、单细胞RNA测序 | NA | 图像、测序数据 | 来自三个独立队列的治疗初治患者样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1569 | 2025-12-11 |
Circulating Cathepsin D Exacerbates Injury-Induced Brain Damage by Promoting Neutrophil Infiltration Into the Brain
2025-Nov-04, Journal of the American Heart Association
IF:5.0Q1
DOI:10.1161/JAHA.125.043416
PMID:41147378
|
研究论文 | 本研究探讨了循环中的组织蛋白酶D（CTSD）如何通过上调脑内皮VCAM-1表达促进中性粒细胞浸润，从而加剧创伤性和缺血性脑损伤 | 首次揭示了循环中的非酶原型CTSD（pro-CTSD）通过激活脑内皮细胞上调VCAM-1表达，促进中性粒细胞向脑部迁移的新机制 | 研究主要基于转基因小鼠模型，尚未在人类临床样本中验证；单细胞RNA测序样本量有限，可能未完全捕捉所有细胞类型的变化 | 探究循环CTSD对脑损伤后炎症反应的影响及其分子机制 | 转基因hCTSDhi小鼠（高循环CTSD水平）、CTSDMono敲除小鼠（低血浆CTSD水平）、创伤性和缺血性脑损伤模型 | 神经科学 | 脑损伤（创伤性脑损伤、缺血性脑损伤） | 单细胞RNA测序、转基因动物模型、行为学测试 | 转基因小鼠模型 | 基因表达数据、行为学数据 | 两组转基因小鼠群体，具体数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1570 | 2025-12-11 |
Genome-Wide Association Analysis and Multi-Omic Mendelian Randomization Insight Into the Molecular Network of Immune-Related Dysfunction in the Pathogenesis of Rheumatoid Arthritis
2025-Nov, International journal of rheumatic diseases
IF:2.4Q2
DOI:10.1111/1756-185x.70479
PMID:41287581
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研究论文 | 通过全基因组关联分析和多组学孟德尔随机化方法，揭示免疫相关功能障碍在类风湿关节炎发病机制中的分子网络 | 整合GWAS、cis-eQTL、pQTL和单细胞RNA测序数据，识别出ERAP2、SWAP70和LTBR等新的候选因果基因，并验证其在RA发病中的潜在作用 | 研究主要基于遗传关联分析，因果推断仍需实验验证；样本来源和种族多样性可能影响结果普适性 | 探究免疫相关基因在类风湿关节炎发病中的因果作用机制 | 类风湿关节炎患者及其遗传与分子数据 | 生物信息学 | 类风湿关节炎 | 全基因组关联分析（GWAS）、孟德尔随机化（MR）、单细胞RNA测序（scRNA-seq）、bulk RNA-seq | 孟德尔随机化模型、汇总数据基础MR（SMR） | 遗传变异数据、基因表达数据、蛋白质定量数据 | 三个RA队列的大规模GWAS荟萃分析 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 1571 | 2025-12-11 |
Emergence of endothelial subtypes and role of cell cycle control in arterial-venous specification during embryonic vascular development
2025-Oct-28, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.116368
PMID:41066228
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和Fucci胚胎模型，揭示了细胞周期控制在胚胎血管发育早期动静脉分化中的关键作用 | 首次在胚胎发育早期（血流出现前后）系统揭示内皮细胞亚型出现与细胞周期状态的关联，并证明细胞周期抑制剂p27在动静脉分化中的关键调控作用 | 研究主要聚焦于小鼠胚胎早期发育阶段（E8.0-E9.5），后期发育阶段和其他物种的验证仍需进一步探索 | 探究细胞周期控制在胚胎血管发育过程中动静脉分化中的作用机制 | 小鼠胚胎内皮细胞 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序，bulk RNA测序，Fucci荧光报告系统，成像分析 | NA | RNA测序数据，成像数据 | E8.0、E8.5、E9.5三个时间点的胚胎内皮细胞 | NA | 单细胞RNA-seq，bulk RNA-seq | NA | NA |
| 1572 | 2025-12-11 |
A universal and cost-efficient sample labeling approach for multiplexed single-cell RNA-seq based on recombinant HUH-endonuclease-agglutinin tagging
2025-Oct-28, Journal of genetics and genomics = Yi chuan xue bao
DOI:10.1016/j.jgg.2025.10.004
PMID:41167558
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研究论文 | 本文介绍了一种名为HEATag的通用细胞膜标记方法，用于多路复用单细胞RNA测序，以降低成本并提高效率 | 结合鸭环病毒HUH内切酶和小麦胚芽凝集素，实现高效、序列特异性的单链DNA标记，适用于多种物种和细胞状态 | NA | 开发一种成本效益高且可扩展的样本标记方法，以促进高通量单细胞研究 | 新鲜或固定细胞的细胞膜 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 单链DNA标记数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1573 | 2025-12-11 |
Transcriptome Analysis Identified SPP1-Positive Monocytes as a Key in Extracellular Matrix Formation in Thrombi
2025-Oct-07, Journal of the American Heart Association
IF:5.0Q1
DOI:10.1161/JAHA.125.044299
PMID:41025474
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研究论文 | 本研究通过转录组分析发现SPP1阳性单核细胞在血栓细胞外基质形成中起关键作用 | 首次通过单细胞RNA测序识别出SPP1高表达的单核细胞/巨噬细胞亚群，并揭示其在血栓成熟过程中的核心作用 | 样本量较小（3个血栓用于RNA表达比较），且主要基于脑血栓和肺动脉血栓数据，可能不适用于所有血栓类型 | 探究血栓成熟的详细机制，特别是细胞外基质形成的关键因素 | 人类血栓样本（来自脑血管和肺动脉） | 数字病理学 | 心血管疾病 | RNA-seq, 单细胞RNA测序, 免疫组织化学 | NA | RNA表达数据, 单细胞RNA测序数据, 图像数据 | 3个血栓用于RNA表达比较，66个血栓用于免疫组织化学验证 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 1574 | 2025-12-11 |
Reduced Intestinal GLP-1+ Cell Numbers Are Associated With an Inflammation-related Epithelial Metabolic Signature
2025-Oct-03, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2025.101656
PMID:41047099
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研究论文 | 本研究探讨了肠道炎症中GLP-1+细胞数量减少与炎症相关上皮代谢特征之间的关联 | 首次在多种小鼠模型和克罗恩病患者中一致观察到GLP-1+细胞数量减少，并揭示了线粒体功能障碍在调控L细胞分化中的因果作用 | 研究主要基于动物模型和体外器官培养，人类样本验证有限，且机制研究尚未完全阐明GLP-1减少如何具体影响炎症过程 | 探究肠内分泌细胞（特别是GLP-1+ L细胞）在肠道炎症中的作用及其分子机制 | 小鼠模型（包括白细胞介素-10缺陷小鼠和ClpPΔIEC小鼠）、人类克罗恩病患者黏膜活检样本、以及小鼠和人类肠道类器官 | NA | 炎症性肠病 | 单细胞RNA测序、转录组分析、器官培养 | NA | RNA测序数据、转录组数据 | 4种不同的小鼠炎症模型、公共单细胞RNA测序数据集中的克罗恩病患者活检样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1575 | 2025-12-11 |
Mapping Plasmodium transitions and interactions in the Anopheles female
2025-Oct-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.11.12.623125
PMID:39605504
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，揭示了疟原虫在按蚊中肠内的关键发育阶段转变及蚊虫-寄生虫相互作用机制 | 首次结合单细胞RNA测序与共聚焦显微镜技术，系统解析了疟原虫在蚊媒中肠内的发育轨迹和细胞互作网络，并发现转录因子SIP2对子孢子感染人肝细胞的关键作用 | 研究主要基于实验室培养的蚊虫-寄生虫体系，虽验证了部分野外来源寄生虫，但自然条件下的复杂互作机制仍需进一步探索 | 阐明疟原虫在按蚊体内的发育生物学机制及蚊虫-寄生虫相互作用 | 恶性疟原虫与按蚊的相互作用体系 | 单细胞生物学 | 疟疾 | 单细胞RNA测序，共聚焦显微镜，功能分析 | NA | 单细胞转录组数据，显微成像数据 | 多个发育阶段和代谢条件下的寄生虫与蚊虫细胞样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1576 | 2025-12-11 |
The immune landscape of pediatric (extra)cranial solid tumors: A systematic review and integration of immunohistochemistry and single-cell RNA sequencing data
2025-Oct-01, European journal of cancer (Oxford, England : 1990)
DOI:10.1016/j.ejca.2025.115708
PMID:40857838
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系统综述 | 本文通过整合免疫组化和单细胞RNA测序数据，系统性地综述了儿童（颅）外实体瘤的免疫微环境特征 | 首次系统性地整合了免疫组化和单细胞/单核RNA测序数据，对儿童实体瘤的免疫景观进行了全面分析，并创建了公开可用的交互式热图图谱 | 纳入研究的方法学存在异质性，且部分肿瘤类型的数据仅来自单一技术 | 阐明儿童（颅）外实体瘤的独特免疫微环境，以指导针对儿童癌症的免疫治疗策略的开发与选择 | 儿童脑肿瘤和颅外实体瘤 | 数字病理学 | 儿童实体瘤 | 免疫组化，单细胞RNA测序，单核RNA测序 | NA | 图像，测序数据 | 共73项研究，包含2187个肿瘤样本（IHC）和272个肿瘤样本（sc/snSeq） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1577 | 2025-12-11 |
Identification of conserved gene expression changes across common glomerular diseases by spatial transcriptomics
2025-Sep, Journal of nephrology
IF:2.7Q2
DOI:10.1007/s40620-025-02233-5
PMID:40067649
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研究论文 | 本研究通过空间转录组学技术，分析了多种肾小球疾病中肾小球特异性基因表达谱，以识别共同的基因表达变化 | 首次利用空间转录组学技术系统比较多种肾小球疾病中的基因表达变化，识别出35个一致下调的差异表达基因，并揭示了与DNA结合转录因子活性相关的分子功能 | 研究样本量有限，仅包括五种肾小球疾病类型，且未涵盖所有可能的疾病亚型，可能影响结果的普遍性 | 探索肾小球疾病中共同的基因表达通路，以揭示潜在的分子机制 | 肾小球疾病患者和健康肾脏捐赠者的肾活检标本 | 数字病理学 | 肾小球疾病 | 空间转录组学，免疫荧光染色 | NA | 空间转录组数据，图像数据 | 包括肾小球疾病患者和健康捐赠者，具体样本数未明确说明，但涉及五种疾病类型 | NanoString | 空间转录组学 | GeoMx Digital Spatial Profiler | GeoMx Digital Spatial Profiler用于空间转录组分析，配置了疾病代表性肾小球区域兴趣点 |
| 1578 | 2025-12-11 |
Spatial Transcriptomics to Study Virus-Host Interactions
2025-Sep, Annual review of virology
IF:8.1Q1
|
综述 | 本文综述了空间转录组学在研究病毒-宿主相互作用中的变革潜力及其技术细节与实施方法 | 强调了空间转录组学在病毒致病机制研究中的创新应用潜力 | NA | 探讨空间转录组学在理解病毒致病机制和开发抗病毒策略中的应用 | 植物、动物和人类中的病毒性疾病 | 空间转录组学 | 病毒性疾病 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1579 | 2025-12-11 |
Recent developments in omics studies and artificial intelligence in depression and suicide
2025-Aug-11, Translational psychiatry
IF:5.8Q1
DOI:10.1038/s41398-025-03497-y
PMID:40790016
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综述 | 本文系统综述了与抑郁症和自杀相关的转录组学、非编码RNA和人工智能领域的最新进展 | 整合了高通量测序技术、多组学数据与人工智能方法，探讨了空间转录组学等新研究途径，并提出了未来研究方向 | NA | 寻找抑郁症和自杀的新分子通路、有效生物标志物和药物靶点，以提供有效的诊断、预后和治疗方案 | 重度抑郁症患者、自杀相关样本（血液样本、人尸检脑组织）以及各种动物模型 | 自然语言处理, 机器学习 | 抑郁症 | 高通量测序技术, 全基因组分析 | NA | 组学数据（转录组、表观基因组、蛋白质组） | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1580 | 2025-12-11 |
Diminished SUV3 expression and its functional implications in the IFN-enriched monocyte subset of childhood Sjögren's disease
2025-Jul-01, Rheumatology (Oxford, England)
DOI:10.1093/rheumatology/keaf193
PMID:40268748
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研究论文 | 本研究探讨了儿童干燥综合征中单核细胞IFN富集亚群SUV3表达降低的分子和功能意义，揭示了mt-dsRNA介导的PKR激活导致固有免疫功能缺陷的新机制 | 首次在儿童干燥综合征的IFN富集单核细胞亚群中发现SUV3表达降低，并阐明其通过mt-dsRNA在胞质中积累激活PKR，进而导致线粒体功能障碍和炎症特征的新致病机制 | 研究主要基于体外细胞模型和患者样本分析，缺乏体内动物模型验证；样本量相对有限；机制研究集中在PKR通路，可能存在其他未被探索的调控途径 | 探究儿童干燥综合征中单核细胞亚群SUV3表达降低的分子机制及其对固有免疫功能的影响 | 儿童干燥综合征患者的CD14+单核细胞（特别是IFN富集亚群）及单核细胞系 | 单细胞组学与免疫学 | 自身免疫性疾病（儿童干燥综合征） | 单细胞RNA测序，fCLIP-qPCR，透射电子显微镜，体外功能实验（氧化应激、ATP产生、迁移和吞噬作用测定） | 基因敲低细胞模型 | 单细胞转录组数据，免疫沉淀数据，显微镜图像，功能测定数据 | 儿童干燥综合征患者与对照的单核细胞样本（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |