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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1561 | 2026-03-14 |
High-throughput single cell -omics using semi-permeable capsules
2025-Mar-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.03.14.642805
PMID:40166174
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研究论文 | 本文介绍了一种基于半透性胶囊(SPCs)的高通量单细胞组学技术,用于多种核酸分析,包括数字PCR、基因组测序和单细胞RNA测序 | 开发了基于半透性胶囊的通用技术,克服了液滴微流体系统长期培养和克隆扩增的限制,提供了更高的转录本捕获效率 | 未明确说明技术在大规模应用中的成本、通量上限或与其他单细胞平台的直接比较数据 | 开发一种高效、可定制的单细胞组学技术,用于解析生物系统的复杂性和异质性 | 造血系统疾病患者的白细胞,特别是急性髓系白血病样本中的成熟粒细胞和单核细胞 | 单细胞组学 | 急性髓系白血病 | 单细胞RNA测序(scRNA-Seq)、数字PCR、基因组测序、FACS分选 | NA | 单细胞转录组数据 | 造血系统疾病患者的白细胞样本(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA测序 | CapSeq(胶囊测序) | 基于半透性胶囊(SPCs)的单细胞测序技术,支持长期细胞培养和克隆扩增 |
| 1562 | 2026-03-14 |
Linking Cellular Senescence to Vascular Pathology: The Diagnostic Potential of Superoxide Dismutase 2 in Aortic Dissection
2025, Vascular health and risk management
IF:2.6Q2
DOI:10.2147/VHRM.S553609
PMID:41334574
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研究论文 | 本研究通过整合生物信息学和单细胞转录组学分析,探讨了血管衰老的分子和细胞机制及其在主动脉夹层(AD)发病中的关键作用,并确定了超氧化物歧化酶2(SOD2)作为AD的潜在诊断生物标志物和治疗靶点 | 首次将SOD2与主动脉夹层的血管衰老和免疫调节联系起来,并通过单细胞RNA测序揭示了其在巨噬细胞和树突状细胞中的特异性表达,同时构建了基因-药物相互作用网络以探索靶向治疗的可能性 | 研究主要基于公开数据集和单细胞测序数据,需要进一步的实验验证和临床队列研究来确认SOD2的诊断和治疗价值 | 探讨血管衰老在主动脉夹层发病中的分子和细胞机制,并寻找潜在的诊断生物标志物和治疗靶点 | 主动脉夹层组织样本及相关公开数据集(GSE52093, GSE153434) | 生物信息学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, 生物信息学分析, ROC分析 | NA | 转录组数据, 单细胞RNA测序数据 | 基于两个公开数据集(GSE52093, GSE153434)的样本,具体数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1563 | 2026-03-14 |
Exhaustion of NK cells and interferon activation in anti-MDA5+ dermatomyositis are associated and determine the development of ILD
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1697803
PMID:41438768
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和流式细胞术,揭示了抗MDA5+皮肌炎患者中干扰素过度激活导致自然杀伤细胞耗竭,并与间质性肺病的发生发展相关 | 首次在抗MDA5+皮肌炎患者中,通过单细胞RNA测序揭示了干扰素信号通路广泛激活与自然杀伤细胞耗竭之间的关联,并证实了这种耗竭与间质性肺病严重程度的相关性 | 样本量较小(仅6名患者),且为横断面研究,无法确定因果关系 | 探究抗MDA5+皮肌炎患者外周血中自然杀伤细胞和干扰素信号的作用,特别是在间质性肺病发展中的作用 | 抗MDA5+皮肌炎患者(伴有或不伴有间质性肺病)的外周血单个核细胞和血清样本 | 数字病理学 | 皮肌炎与间质性肺病 | 单细胞RNA测序,流式细胞术,体外细胞培养实验 | NA | 单细胞转录组数据,流式细胞术数据,血清细胞因子数据 | 6名新诊断的活动性抗MDA5+皮肌炎患者(3名伴有ILD,3名不伴有ILD),以及一个独立队列用于验证 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1564 | 2026-03-14 |
Exploration of the Prognostic Role of Apoptosis-Related Genes in Glioblastoma
2025, Stem cells international
IF:3.8Q2
DOI:10.1155/sci/8727203
PMID:41497799
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研究论文 | 本研究构建了一个基于凋亡相关基因的预后模型(AS模型),用于预测胶质母细胞瘤(GBM)患者的预后,并探讨了其与肿瘤免疫微环境和细胞间通讯的关联 | 通过整合TCGA、CGGA和GEO数据库的转录组和单细胞测序数据,在101种机器学习算法组合优化下构建了凋亡相关基因预后模型,并发现HSPB1基因与风险评分高度相关,对GBM预后有良好预测效果 | 研究主要基于公共数据库的回顾性数据,缺乏前瞻性临床验证,且模型在外部数据集中的泛化能力需进一步评估 | 探索凋亡相关基因在胶质母细胞瘤预后中的作用,并构建一个高预测性能的预后模型 | 胶质母细胞瘤(GBM)患者及其肿瘤组织与相邻非肿瘤组织 | 生物信息学 | 胶质母细胞瘤 | 转录组测序, 单细胞测序 | 机器学习算法组合(具体未指定,如Cox分析等) | 基因表达数据 | 来自TCGA、CGGA和GEO数据库的多个数据集,具体样本数未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 1565 | 2026-03-14 |
Glioblastoma Prognosis and Therapeutic Response Predicted by a Cancer-Associated Fibroblasts Risk Score
2025, Mediators of inflammation
IF:4.4Q2
DOI:10.1155/mi/4342537
PMID:41498024
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研究论文 | 本研究基于癌症相关成纤维细胞相关特征构建了胶质母细胞瘤的预后风险评分模型,旨在为患者提供精确分层和优化治疗策略的新见解 | 首次系统性地将癌症相关成纤维细胞特征整合到胶质母细胞瘤的预后模型中,并开发了包含风险评分和临床病理特征的综合列线图,提高了预测准确性 | 研究依赖于公共数据库数据,可能受样本异质性和数据质量的限制,且模型需在更大规模的前瞻性队列中进一步验证 | 开发一个基于癌症相关成纤维细胞特征的胶质母细胞瘤预后模型,以改善患者分层和治疗策略 | 胶质母细胞瘤患者及其肿瘤微环境中的癌症相关成纤维细胞 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | 回归分析模型 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1566 | 2026-03-14 |
Comprehensive Single-Cell Characterization of LDL in the Ovarian Cancer Microenvironment and Its Prognostic Implications
2025, Mediators of inflammation
IF:4.4Q2
DOI:10.1155/mi/6540537
PMID:41498033
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析,全面揭示了低密度脂蛋白(LDL)在卵巢癌肿瘤微环境中的分布、功能通路及预后价值 | 首次在单细胞水平系统表征LDL在卵巢癌微环境中的空间分布,并构建了基于LDL相关基因的卵巢癌预后签名模型(LDLOCPS) | 研究主要基于转录组数据,缺乏蛋白质水平验证;样本来源和队列异质性可能影响模型泛化性 | 阐明LDL在卵巢癌肿瘤微环境中的具体作用和机制,并开发预后预测工具 | 卵巢癌患者的单细胞转录组数据和批量RNA-seq数据 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | 机器学习模型 | 转录组数据 | 多个队列的卵巢癌患者数据(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 1567 | 2026-03-14 |
Single-Cell Transcriptomic Analysis Reveals an Inflammatory Antigen-Presenting Macrophages Subtype Drive Vitiligo Pathogenesis Through STAT1-Mediated Dual Mechanisms
2025, Mediators of inflammation
IF:4.4Q2
DOI:10.1155/mi/8878698
PMID:41498037
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了白癜风发病机制中一个关键的炎症性抗原呈递巨噬细胞亚型及其通过STAT1介导的双重作用机制 | 首次在白癜风中鉴定出炎症性抗原呈递巨噬细胞亚型,并阐明其通过STAT1介导的直接抑制黑色素细胞和增强T细胞活化的双重致病机制 | 研究主要基于单细胞转录组数据,体内外实验验证仍需进一步扩展,样本量相对有限 | 阐明白癜风发病机制中巨噬细胞的异质性、功能及其调控网络 | 健康与白癜风患者的皮肤组织样本 | 数字病理学 | 白癜风 | 单细胞RNA测序 | hdWGCNA | 单细胞转录组数据 | 未明确具体样本数量,但包括健康与白癜风患者的皮肤组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1568 | 2026-03-14 |
Integrative Genomic and Single-Cell Insights Into Efferocytosis-Mediated Immune Regulation in Clear Cell Renal Cell Carcinoma
2025, Mediators of inflammation
IF:4.4Q2
DOI:10.1155/mi/8710699
PMID:41498044
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研究论文 | 本研究通过整合基因组学和单细胞技术,探讨了efferocytosis在透明细胞肾细胞癌中的免疫调节作用及其预后意义 | 首次在ccRCC中系统量化efferocytosis通路活性,构建基于岭回归的预后模型,并通过多组学整合及单细胞/空间转录组学鉴定RAC1为关键风险基因 | 研究主要基于公共数据集,缺乏前瞻性临床队列验证;IHC验证数据来源单一(Human Protein Atlas) | 阐明efferocytosis在ccRCC中的预后价值、分子机制及免疫调控作用 | 透明细胞肾细胞癌(ccRCC)患者样本及相关基因组/转录组数据 | 计算生物学 | 肾细胞癌 | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 免疫组化, 基因组变异分析 | 岭回归模型 | 基因组数据, 转录组数据, 单细胞数据, 空间转录组数据, 蛋白质组数据 | 未明确样本数量(基于公共数据集) | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1569 | 2026-03-14 |
A cross-disease resource of living human microglia identifies disease-enriched subsets and tool compounds recapitulating microglial states
2024-Dec, Nature neuroscience
IF:21.2Q1
DOI:10.1038/s41593-024-01764-7
PMID:39406950
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了来自74名不同神经系统疾病和中枢神经系统区域捐赠者的215,680个活体人类小胶质细胞,揭示了小胶质细胞的异质性,并识别了与疾病相关的亚群及能模拟其状态的化合物 | 构建了一个跨疾病的活体人类小胶质细胞资源库,识别了与疾病相关的亚群,并验证了能在体外模拟特定亚群状态的化合物,如喜树碱 | NA | 理解人类小胶质细胞的异质性,以促进针对其状态或功能的靶向治疗开发 | 活体人类小胶质细胞 | 数字病理学 | 神经系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 215,680个细胞来自74名捐赠者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1570 | 2026-03-14 |
Leveraging deep single-soma RNA sequencing to explore the neural basis of human somatosensation
2024-Dec, Nature neuroscience
IF:21.2Q1
DOI:10.1038/s41593-024-01794-1
PMID:39496796
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研究论文 | 本研究利用单细胞体深度RNA测序和空间转录组学技术,构建了人类背根神经节神经元图谱,揭示了人类体感生理学的新见解 | 首次通过单细胞体深度RNA测序技术,从个体人类背根神经节神经元中检测到平均超过9,000个独特基因,并识别出16种神经元类型,结合跨物种分析揭示了人类特异性神经元类型的存在 | 技术难度可能限制了样本获取和处理,且研究依赖于特定实验条件,可能影响结果的普适性 | 探索人类体感系统的神经基础,特别是背根神经节神经元的分子特征和功能 | 人类背根神经节神经元 | 数字病理学 | NA | RNA-seq, 空间转录组学, RNAscope原位杂交 | NA | RNA序列数据, 空间转录组数据 | 个体人类背根神经节神经元 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1571 | 2024-11-07 |
Mapping out multiple sclerosis with spatial transcriptomics
2024-Dec, Nature neuroscience
IF:21.2Q1
DOI:10.1038/s41593-024-01798-x
PMID:39501034
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1572 | 2026-03-14 |
Cell type mapping reveals tissue niches and interactions in subcortical multiple sclerosis lesions
2024-Dec, Nature neuroscience
IF:21.2Q1
DOI:10.1038/s41593-024-01796-z
PMID:39501036
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研究论文 | 本研究利用单核和空间转录组学技术,绘制了皮层下多发性硬化病变区域的细胞类型图谱,揭示了组织微环境中的细胞组成、相互作用及病变进展机制 | 首次结合单核与空间转录组学,系统性地绘制了皮层下多发性硬化病变中特定组织微环境(如血管周围空间、病变边缘)的细胞类型图谱,并揭示了慢性活动期病变边缘的细胞间通讯网络 | 研究主要聚焦于皮层下病变,可能未全面涵盖其他脑区或疾病阶段的微环境变化;样本量相对有限,需进一步扩大验证 | 解析多发性硬化病变中组织微环境的细胞组成、相互作用及病变进展的分子机制 | 皮层下多发性硬化病变组织及对照组织 | 数字病理学 | 多发性硬化 | 单核转录组学, 空间转录组学 | NA | 转录组数据, 空间数据 | NA | NA | 单核RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1573 | 2026-03-14 |
CD4+ T cells reactive to a hybrid peptide from insulin-chromogranin A adopt a distinct effector fate and are pathogenic in autoimmune diabetes
2024-10-08, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2024.07.024
PMID:39214091
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研究论文 | 本研究探讨了在非肥胖糖尿病小鼠中,针对胰岛素衍生表位的CD4 T细胞反应的动态性和致病性,特别关注了InsC-ChgA特异性CD4 T细胞的独特致病作用 | 通过单细胞RNA测序揭示了胰岛抗原特异性T细胞命运的多样性,并首次证明InsC-ChgA特异性CD4 T细胞偏向于独特的Th1效应表型且具有致病性 | 研究仅限于非肥胖糖尿病小鼠模型,未在人类中验证,且样本规模可能有限 | 探究自身免疫性糖尿病中T细胞介导的胰岛破坏机制,特别是针对胰岛素衍生表位的CD4 T细胞反应的异质性和致病性 | 非肥胖糖尿病小鼠的胰腺CD4 T细胞,特别是针对四种胰岛素衍生表位的反应 | 免疫学 | 自身免疫性糖尿病 | 单细胞RNA测序,四聚体分选 | NA | RNA序列数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1574 | 2026-03-14 |
Inferring cell differentiation maps from lineage tracing data
2024-Sep-13, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.09.09.611835
PMID:39314473
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研究论文 | 本文介绍了一种基于潜能概念的细胞分化图数学框架,并开发了算法,用于从单细胞谱系追踪数据中推断最优细胞分化图 | 引入基于潜能概念的细胞分化图数学框架,开发算法平衡分化图复杂性与谱系树上未观察到的细胞类型转换数量,相比现有方法更准确地推断分化图 | NA | 推断细胞分化图,以描述多能细胞在发育过程中通过逐渐受限的祖细胞类型层次分化为特化细胞类型的过程 | 哺乳动物躯干发育模型和小鼠造血系统 | 机器学习 | NA | 单细胞谱系追踪技术 | NA | 单细胞谱系追踪数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1575 | 2026-03-14 |
Single-Cell Transcriptome Landscape and Cell Fate Decoding in Human Brain Organoids after Transplantation
2024-07, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202402287
PMID:38711218
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序技术,探索了人脑类器官在移植到前额叶皮层和海马体后的细胞命运变化 | 首次在单细胞分辨率下系统揭示了人脑类器官移植后,其细胞命运如何受到宿主微环境(特别是前额叶皮层中多巴胺和乙酰胆碱的丰富表达)的调控,并随时间从神经发育转向胶质发育 | 研究主要基于体外实验和特定时间点的观察,移植后更长期的细胞命运稳定性、功能整合程度以及潜在的免疫排斥反应尚未充分阐明 | 阐明移植后人脑类器官的细胞命运决定机制,以增进对细胞移植和再生医学的理解 | 移植到小鼠前额叶皮层和海马体的人脑类器官 | 单细胞组学 | 神经系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 移植到不同脑区(前额叶皮层和海马体)并在不同时间点(移植后2个月和4个月)采集的人脑类器官样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1576 | 2026-03-14 |
GHCU, a Molecular Chaperone, Regulates Leaf Curling by Modulating the Distribution of KNGH1 in Cotton
2024-07, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202402816
PMID:38666376
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研究论文 | 本研究通过遗传定位和分子研究,鉴定了棉花叶片卷曲突变体cu中的关键基因GHCU,揭示了其通过调控KNGH1蛋白分布影响生长素响应水平,从而控制叶片扁平化的分子机制 | 首次在棉花中鉴定出GHCU作为分子伴侣调控叶片形态的关键基因,并阐明其通过促进KNGH1从近轴面向远轴面运输来影响生长素分布的新机制 | 研究主要基于自然突变体和模式植物烟草,在棉花中的功能验证和具体分子互作网络仍需进一步探索 | 探究棉花叶片形态建成的分子基础,特别是叶片卷曲性状的遗传调控机制 | 棉花自然突变体cu及其野生型,以及烟草作为模式植物 | 植物分子生物学 | NA | CRISPR基因编辑、单细胞RNA测序、时空转录组分析 | NA | 遗传数据、分子数据、转录组数据 | 未明确具体样本数量,涉及棉花突变体和烟草转基因材料 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1577 | 2026-03-14 |
Mgp High-Expressing MSCs Orchestrate the Osteoimmune Microenvironment of Collagen/Nanohydroxyapatite-Mediated Bone Regeneration
2024-06, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202308986
PMID:38588510
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和空间转录组学分析,揭示了胶原/纳米羟基磷灰石骨修复材料周围骨免疫微环境的细胞图谱,并鉴定了一组高表达基质Gla蛋白(Mgp)的功能性间充质干细胞亚群 | 首次在单细胞水平结合空间转录组学描绘了骨修复材料植入后的骨免疫微环境动态图谱,并鉴定出Mgp高表达间充质干细胞(MgpMSCs)这一关键先驱亚群及其通过Mdk/Lrp1配体-受体对调控巨噬细胞极化的新机制 | 研究主要聚焦于早期骨再生阶段,长期效应及临床转化潜力仍需进一步验证 | 阐明生物材料介导的骨再生早期阶段中功能性间充质干细胞亚群的作用及其调控骨免疫微环境的分子机制 | 植入胶原/纳米羟基磷灰石骨修复材料后的小鼠骨修复区域细胞 | 数字病理学 | 骨科疾病 | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据,空间基因表达数据 | 未明确说明样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |
| 1578 | 2026-03-14 |
Multiome in the Same Cell Reveals the Impact of Osmotic Stress on Arabidopsis Root Tip Development at Single-Cell Level
2024-06, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202308384
PMID:38634607
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研究论文 | 本文通过单细胞多组学技术,研究了渗透胁迫对拟南芥根尖发育的影响,并重建了转录调控网络 | 首次在单细胞水平同时捕获基因表达和染色质可及性,并构建了高分辨率的转录调控网络,揭示了渗透胁迫下细胞异质性 | 数据整合仍存在挑战,且样本仅限于拟南芥根尖,可能不适用于其他植物或组织 | 研究渗透胁迫下拟南芥根尖发育的细胞特异性转录调控网络 | 拟南芥根尖细胞 | 单细胞组学 | NA | 单细胞多组学(scRNA-seq和scATAC-seq) | 伪时间轨迹分析 | 单细胞基因表达和染色质可及性数据 | 16,670个拟南芥根尖细胞核 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 1579 | 2026-03-14 |
Ghrelin deletion and conditional ghrelin cell ablation increase pancreatic islet size in mice
2023-12-15, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI169349
PMID:38099492
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研究论文 | 本研究探讨了胃饥饿素缺失或胃饥饿素细胞条件性消融对小鼠胰腺胰岛大小和β细胞质量的影响 | 揭示了胃饥饿素减少通过降低β细胞凋亡来增加胰岛大小和β细胞数量,并利用单细胞转录组学鉴定了相关基因表达变化 | 研究主要基于小鼠模型,对人类糖尿病的直接治疗意义仍需进一步验证 | 确定胃饥饿素是否影响胰岛大小和β细胞质量 | 小鼠胰腺胰岛和β细胞 | NA | 糖尿病 | 单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据 | 不同年龄和基因型的小鼠(如4周龄、10-12周龄的GKO和WT小鼠) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1580 | 2026-03-14 |
Single cell RNA-seq in phytohormone signaling: a promising future
2023-Nov, Trends in plant science
IF:17.3Q1
DOI:10.1016/j.tplants.2023.07.010
PMID:37550122
|
综述 | 本文探讨了单细胞RNA测序在植物激素信号传导研究中的应用前景 | 强调了scRNA-seq在解析激素介导的时空基因调控网络方面的独特潜力,并引用Nolan等人的研究作为案例 | NA | 探索单细胞RNA测序技术如何促进对植物激素信号传导机制的理解 | 植物激素信号传导及其在植物生长和发育中的作用 | 自然语言处理 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |