单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27474 篇文献，本页显示第 15761 - 15780 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 15761 | 2024-08-07 |
Urinary PART1 and PLA2R1 Could Potentially Serve as Diagnostic Markers for Diabetic Kidney Disease Patients
2023, Diabetes, metabolic syndrome and obesity : targets and therapy
DOI:10.2147/DMSO.S445341
PMID:38162802
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研究论文 | 本研究通过bulk-seq、scRNA-seq和snRNA-seq数据分析，识别出与糖尿病肾病相关的尿液-肾脏特异性基因，特别是PART1和PLA2R1，这些基因可能作为早期诊断糖尿病肾病的标志物 | 首次识别出尿液中的PART1和PLA2R1作为糖尿病肾病的潜在诊断标志物，并探讨了它们与肾脏损伤和蛋白尿的关系 | 研究样本量较小，且仅包括糖尿病肾病患者和健康对照组，未来研究需扩大样本量并考虑更多疾病阶段的患者 | 探索糖尿病肾病的非侵入性诊断方法，特别是早期诊断 | 糖尿病肾病患者和健康对照组的尿液样本 | NA | 糖尿病肾病 | bulk-seq, scRNA-seq, snRNA-seq | NA | 尿液样本 | 56个尿液样本，包括11个来自糖尿病肾病患者和11个来自健康对照组 |
| 15762 | 2024-08-07 |
Single-cell analyses EMP1 as a marker of the ratio of M1/M2 macrophages is associated with EMT, immune infiltration, and prognosis in bladder cancer
2023, Bladder (San Francisco, Calif.)
DOI:10.14440/bladder.2023.852
PMID:38163006
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研究论文 | 本研究探讨了单细胞分析中EMP1作为M1/M2巨噬细胞比例的标志物与膀胱癌的EMT、免疫浸润及预后的关联 | 首次研究了M1和M2巨噬细胞联合作用在膀胱癌发展、生长、进展和转移中的意义，并识别了EMP1作为关键基因 | 研究样本量较小，仅涉及32名患者 | 探究EMP1在膀胱癌中的作用及其作为预后标志物的潜力 | 膀胱癌中的M1/M2巨噬细胞比例及EMP1基因 | 数字病理学 | 膀胱癌 | Cibersortx算法、流式细胞术、Gene Set Enrichment Analysis (GSEA)、Gene Set Variation Analysis (GSVA)、Gene Ontology (GO)、单细胞转录组分析(scRNA-seq)、Cellchat | NA | 基因表达数据 | 32名膀胱癌患者 |
| 15763 | 2024-08-07 |
Deciphering the Divergent Gene Expression Landscapes of m6A/m5C/m1A Methylation Regulators in Hepatocellular Carcinoma Through Single-Cell and Bulk RNA Transcriptomic Analysis
2023, Journal of hepatocellular carcinoma
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JHC.S448047
PMID:38164510
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研究论文 | 本研究通过单细胞和批量RNA转录组分析，探索了m6A/m5C/m1A甲基化调控基因在肝细胞癌中的表达差异 | 本研究首次在单细胞水平上探索了m6A/m5C/m1A甲基化调控基因的表达，并验证了其在癌组织和邻近非癌肝组织中的表达 | 本研究仅分析了m6A/m5C/m1A甲基化调控基因的表达差异，未深入探讨其具体功能和机制 | 探索m6A/m5C/m1A甲基化调控基因在肝细胞癌中的表达差异 | m6A/m5C/m1A甲基化调控基因在肝细胞癌中的表达 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 收集了成人肝细胞癌患者的癌组织和邻近非癌肝组织样本 |
| 15764 | 2024-08-07 |
Titration of 124 antibodies using CITE-Seq on human PBMCs
2022-12-02, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-022-24371-7
PMID:36460735
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研究论文 | 研究使用CITE-Seq技术在人外周血单个核细胞（PBMCs）上滴定124种抗体的最佳浓度 | 首次系统地评估了188种CITE-Seq抗体在PBMCs上的检测能力，并找到了最佳的染色浓度 | 研究仅限于人外周血单个核细胞，未涉及其他细胞类型 | 确定哪些CITE-Seq抗体能在PBMCs上检测到其抗原，并找到最佳的染色浓度 | 188种CITE-Seq抗体及其在PBMCs上的检测能力 | 单细胞测序 | NA | CITE-Seq | NA | 单细胞RNA测序数据 | 人外周血单个核细胞（PBMCs） |
| 15765 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptomes and T cell receptors of vaccine-expanded apolipoprotein B-specific T cells
2022, Frontiers in cardiovascular medicine
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fcvm.2022.1076808
PMID:36684560
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了接种ApoB肽P6疫苗的小鼠中ApoB特异性T细胞的转录组和T细胞受体 | 首次深入表征了疫苗扩增的ApoB特异性T细胞，并揭示了T细胞受体与ApoB肽P6:MHC-II相互作用的特异性 | 研究仅限于C57BL/6J小鼠模型，尚未在人类中进行验证 | 探究疫苗接种对ApoB表位的诱导反应 | ApoB特异性T细胞的单细胞转录组和T细胞受体 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | C57BL/6J小鼠接种ApoB肽P6疫苗后的T细胞 |
| 15766 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptomics reveals the pulmonary inflammation induced by inhalation of subway fine particles
2024-02-05, Journal of hazardous materials
IF:12.2Q1
DOI:10.1016/j.jhazmat.2023.132896
PMID:37951166
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研究论文 | 本研究揭示了地铁细颗粒物如何引起肺部炎症。 | 首次实验研究地铁PM引起的肺部炎症损伤 | 研究主要在小鼠模型中进行，可能不完全适用于人类 | 探索地铁细颗粒物对肺部炎症的影响及其机制 | 小鼠及其免疫细胞亚群 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 组织样本和生物液体 | 小鼠样本，具体数量未提及 |
| 15767 | 2024-08-07 |
Isolation and functional identification of immune cells in hemolymph of blood clams Tegillarca granosa
2024-Jan, Fish & shellfish immunology
IF:4.1Q1
DOI:10.1016/j.fsi.2023.109320
PMID:38122950
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序技术，对血蛤Tegillarca granosa的血液细胞进行了分子层面的分类和功能鉴定 | 首次报道了血蛤Tegillarca granosa免疫细胞的分离和鉴定，为理解其免疫防御机制提供了新视角 | NA | 旨在深入研究红血软体动物的先天免疫系统 | 血蛤Tegillarca granosa的免疫细胞 | NA | NA | 单细胞转录组测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 15768 | 2024-08-07 |
Convergent differentiation of multiciliated cells
2023-12-27, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-023-50077-5
PMID:38155158
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研究论文 | 研究通过跨物种数据整合分析了人类和小鼠的鼻上皮细胞、支气管、输卵管和室下区室管膜细胞的单细胞转录组数据，探讨了多纤毛细胞（MCCs）在不同组织中的相似性和差异性 | 研究确认了MCCs在最终分化步骤中具有收敛的基因集表达，为理解发育过程中的纤毛生成提供了新的见解 | NA | 理解多纤毛细胞在多个组织中的相似性和差异性 | 多纤毛细胞在不同组织中的分化过程 | NA | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 人类和小鼠的鼻上皮细胞、支气管、输卵管和室下区室管膜细胞 |
| 15769 | 2024-08-07 |
Host CD34+ cells are replacing donor endothelium of transplanted heart
2023-12, The Journal of heart and lung transplantation : the official publication of the International Society for Heart Transplantation
DOI:10.1016/j.healun.2023.08.015
PMID:37634574
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和诱导性谱系追踪小鼠模型，探讨了心脏移植后供体内皮细胞被宿主CD34+细胞替代的机制 | 首次通过单细胞RNA测序和谱系追踪技术，揭示了宿主CD34+细胞在心脏移植后替代供体内皮细胞的详细过程和机制 | 研究主要基于小鼠模型，其结果在人类心脏移植中的适用性需要进一步验证 | 探讨心脏移植后内皮细胞再生的来源及其机制 | 心脏移植后的内皮细胞再生和宿主CD34+细胞的作用 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 小鼠模型 |
| 15770 | 2024-08-07 |
Colonic L-cell impairment in aged subjects with type 2 diabetes leads to diminished GLP-1 production
2023-Dec, Diabetes & metabolic syndrome
DOI:10.1016/j.dsx.2023.102907
PMID:37980723
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研究论文 | 研究探讨了2型糖尿病老年患者结肠L细胞功能障碍及其导致GLP-1分泌减少的机制 | 通过单细胞RNA测序分析揭示了L细胞功能障碍的分子机制，为改善GLP-1分泌提供了新的靶点 | NA | 解析2型糖尿病条件下L细胞生物学变化的机制，为基于肠道的2型糖尿病治疗策略提供研究支持 | 2型糖尿病老年患者的结肠L细胞及其GLP-1分泌功能 | NA | 2型糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 包括年轻和老年2型糖尿病患者以及非糖尿病患者，以及长期高脂肪高果糖饮食诱导的老年2型糖尿病Wistar大鼠模型 |
| 15771 | 2024-08-05 |
High-dimensional analysis reveals an immune atlas and novel neutrophil clusters in the lungs of model animals with Actinobacillus pleuropneumoniae-induced pneumonia
2023-Sep-13, Veterinary research
IF:3.7Q1
DOI:10.1186/s13567-023-01207-4
PMID:37705063
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研究论文 | 本研究揭示了模型动物肺部因Actinobacillus pleuropneumoniae引起的肺炎中的免疫图谱和新型中性粒细胞亚群 | 首次识别了具有抗原呈递细胞特征的MHC-II中性粒细胞，并发现了它们在APP感染后数量的增加 | 该研究主要集中在小鼠模型中，尚需在其他动物模型或人类中进行验证 | 研究肺部特异的免疫反应和参与细菌感染的关键免疫细胞亚群 | Actinobacillus pleuropneumoniae感染的小鼠及幼猪 | 数字病理学 | 猪肺炎 | 高维质谱细胞术和单细胞RNA-seq | NA | 细胞谱系和转录组数据 | 小鼠与感染APP和克雷伯氏肺炎杆菌的幼猪样本 |
| 15772 | 2024-08-07 |
Liquid biopsy-based protein biomarkers for risk prediction, early diagnosis, and prognostication of cholangiocarcinoma
2023-07, Journal of hepatology
IF:26.8Q1
DOI:10.1016/j.jhep.2023.02.027
PMID:36868481
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研究论文 | 本研究通过液态活检技术，在血清细胞外囊泡中寻找胆管癌的风险预测、早期诊断和预后蛋白标志物。 | 提出了基于蛋白标志物的预测、诊断和预后模型，为个性化医疗提供了新的液态活检工具。 | NA | 探索胆管癌的风险预测、早期诊断和预后蛋白标志物。 | 胆管癌患者及健康个体的血清细胞外囊泡。 | 数字病理学 | 胆管癌 | 质谱分析、ELISA、机器学习算法 | 机器学习 | 蛋白质 | 共256个样本，包括不同类型的胆管癌患者和健康个体。 |
| 15773 | 2024-08-07 |
TREM2+ macrophages suppress CD8+ T-cell infiltration after transarterial chemoembolisation in hepatocellular carcinoma
2023-07, Journal of hepatology
IF:26.8Q1
DOI:10.1016/j.jhep.2023.02.032
PMID:36889359
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研究论文 | 本研究探讨了肝细胞癌（HCC）患者在接受经动脉化疗栓塞（TACE）治疗后的免疫环境变化及其机制 | 发现TREM2+肿瘤相关巨噬细胞（TAMs）在TACE治疗后抑制CD8+ T细胞的浸润，并通过分泌Galectin-1促进PD-L1在血管内皮细胞中的过度表达，从而阻碍CD8+ T细胞的招募 | 研究样本量相对较小，且仅限于特定类型的HCC患者 | 阐明HCC患者在接受TACE治疗后的免疫环境变化及其对疾病进展的影响 | HCC患者的肿瘤样本及TACE治疗后的免疫细胞变化 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 5名未治疗HCC患者和5名接受TACE治疗的HCC患者的肿瘤样本，以及22对配对样本 |
| 15774 | 2024-08-05 |
TFAP2 paralogs regulate midfacial development in part through a conserved ALX genetic pathway
2023-Jun-16, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.06.16.545376
PMID:37398373
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研究论文 | 本文探讨了TFAP2家族在哺乳动物中脸部发育中的作用及其与ALX基因途径的关系 | 研究表明TFAP2对面部发育的调控作用通过ALX转录因子实现，并展示了这一调控轴在脊椎动物中的保守性 | 缺乏在人类或其他物种中的直接验证，主要基于小鼠和斑马鱼的模型研究 | 研究TFAP2家族在中面部发育中的调控机制 | 小鼠和斑马鱼的神经嵴细胞 | NA | NA | RNA-seq, ChIP-seq | NA | 基因表达数据 | 涉及小鼠和斑马鱼的神经嵴细胞 |
| 15775 | 2024-08-07 |
Decoding hereditary spastic paraplegia pathogenicity through transcriptomic profiling
2023-May-18, Zoological research
IF:4.0Q1
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综述 | 本文综述了通过转录组分析解码遗传性痉挛性截瘫（HSP）致病性的研究进展 | 探讨了转录组数据与临床表现之间的关联，并强调了跨物种模型的重要性，以及新兴的单细胞RNA测序技术在解决HSP致病性相关未解问题中的潜力 | 尽管识别了70多个新的HSP致病基因，但对HSP的病理生理学和有效管理及治疗策略的开发仍了解不足 | 研究HSP的致病机制，并探索转录组数据与临床表现之间的关系 | 遗传性痉挛性截瘫（HSP）及其致病基因 | NA | 遗传性痉挛性截瘫 | 下一代测序技术 | NA | 转录组数据 | NA |
| 15776 | 2024-08-05 |
Hepatocyte Adenosine Kinase Promotes Excessive Fat Deposition and Liver Inflammation
2023-01, Gastroenterology
IF:25.7Q1
DOI:10.1053/j.gastro.2022.09.027
PMID:36181835
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研究论文 | 本文研究了肝细胞腺苷激酶如何促进过量脂肪沉积和肝脏炎症 | 揭示了肝细胞腺苷激酶在肥胖基因/酶中的作用以及其在肝脏脂肪沉积和炎症中的机制 | 尚未提供各种治疗方法的临床验证 | 研究肝细胞腺苷激酶的功能及其在肥胖和非酒精性脂肪肝疾病中的作用 | 人类肝脏切片和特定转基因小鼠 | 数字病理学 | 非酒精性脂肪肝疾病 | RNA测序，单细胞RNA测序，脂质组学 | 小鼠模型 | 人类组织样本和小鼠生物样本 | 人类样本和多种小鼠样本，具体数量未提供 |
| 15777 | 2024-08-05 |
Highly Multiplexed Spatially Resolved Proteomic and Transcriptional Profiling of the Glioblastoma Microenvironment Using Archived Formalin-Fixed Paraffin-Embedded Specimens
2023-01, Modern pathology : an official journal of the United States and Canadian Academy of Pathology, Inc
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.modpat.2022.100034
PMID:36788070
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研究论文 | 本研究使用归档的福尔马林固定石蜡包埋标本对胶质母细胞瘤微环境进行了高度多重的空间解析蛋白质组和转录组分析 | 创新性地应用了整合的多模态方法来表征胶质母细胞瘤微环境的分子异质性 | 仅使用归档的固定标本，可能对新鲜样本的分析结果有局限性 | 研究胶质母细胞瘤微环境的空间分布及其潜在的治疗靶点 | 归档的福尔马林固定石蜡包埋的胶质母细胞瘤标本 | 数字病理学 | 脑胶质瘤 | NanoString GeoMx数字空间分析，单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 空间蛋白质组和转录组数据 | 使用了归档的多个胶质母细胞瘤标本 |
| 15778 | 2024-08-05 |
Integration of single-cell RNA sequencing and bulk RNA transcriptome sequencing reveals a heterogeneous immune landscape and pivotal cell subpopulations associated with colorectal cancer prognosis
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1184167
PMID:37675100
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研究论文 | 本研究揭示了结直肠癌预后相关的异质性免疫景观和关键细胞亚群。 | 通过整合单细胞RNA测序和大规模RNA转录组测序，提供了关于结直肠癌免疫细胞异质性的新见解。 | 该研究主要集中于免疫细胞的分析，其他肿瘤微环境因素的作用未得到足够探讨。 | 研究结直肠癌中免疫细胞的异质性及其对预后的影响。 | 结直肠癌患者的免疫细胞及其在肿瘤微环境中的分布。 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序、大规模RNA测序 | NA | 免疫细胞数据 | 62,398个免疫细胞 |
| 15779 | 2024-08-05 |
Substrate stiffness enhances human regulatory T cell induction and metabolism
2023-01, Biomaterials
IF:12.8Q1
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研究论文 | 该文章探讨了基质刚度对人类调节性T细胞（Tregs）诱导和代谢的影响 | 揭示了Tregs诱导对基质机械刚度的敏感性，并发现刚性的基质促进了氧化磷酸化的使用 | 研究未探讨不同类型的基质对Tregs诱导的影响 | 旨在提高调节性T细胞的诱导效率，以改善细胞免疫治疗 | 人类调节性T细胞（Tregs） | 数字病理学 | 自身免疫疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 生物材料 | 使用了不同刚度的聚丙烯酰胺胶（PA-gels）作为实验样本 |
| 15780 | 2024-08-07 |
Remarkable sex-specific differences at single-cell resolution in neonatal hyperoxic lung injury
2023-01-01, American journal of physiology. Lung cellular and molecular physiology
DOI:10.1152/ajplung.00269.2022
PMID:36283964
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研究论文 | 研究了新生儿暴露于高氧环境下肺损伤的性别特异性及细胞类型特异性转录变化，并描绘了发育中肺部细胞间通信网络的变化。 | 首次在单细胞分辨率下研究新生儿高氧肺损伤的性别特异性转录变化，并识别了肺部血管内皮细胞对高氧暴露的敏感性及新的中间型内皮细胞群体。 | 研究仅限于C57BL/6小鼠模型，可能限制了结果在人类中的直接应用。 | 探讨新生儿高氧暴露下肺损伤的性别特异性及细胞类型特异性转录变化，以及细胞间通信网络的变化。 | 新生儿肺部在高氧暴露下的细胞类型特异性转录变化及细胞间通信网络。 | 数字病理学 | 新生儿疾病 | 单细胞RNA测序（scRNAseq） | NA | 转录组数据 | 从暴露于高氧或正常氧环境的新生雄性和雌性C57BL/6小鼠肺部分离的超过35,000个细胞 |