单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
15761	2024-08-07	Human B-cell subset identification and changes in inflammatory diseases 2022-12-31, Clinical and experimental immunology IF:3.4Q3 DOI:10.1093/cei/uxac104 PMID:36617261	综述	本文综述了人类血液中B细胞亚群的识别及其在炎症疾病中的变化	利用高维表型工具如质谱流式细胞术和单细胞RNA测序揭示了先前被认为是均质的B细胞群体的异质性	关于B细胞亚群的识别和命名仍存在不确定性和研究间的差异	探讨人类血液中常见的B细胞亚群及其在炎症和自身免疫疾病中的频率和功能变化	人类血液中的B细胞亚群及其在炎症疾病中的变化	NA	炎症疾病	质谱流式细胞术, 单细胞RNA测序	NA	细胞	NA
15762	2024-08-07	Singling out motor neurons in the age of single-cell transcriptomics 2022-09, Trends in genetics : TIG IF:13.6Q1 DOI:10.1016/j.tig.2022.03.016 PMID:35487823	research paper	本文讨论了利用单细胞转录组学技术揭示成年动物运动神经元内在异质性的新兴技术及其对疾病和脊髓损伤的潜在影响	利用高吞吐量的单细胞转录组学技术，快速分离和分析运动神经元核，揭示了骨骼和自主神经系统的显著转录多样性	NA	定义成年运动系统中运动神经元的异质性，并探讨其对疾病和脊髓损伤的影响	运动神经元的异质性及其在健康和退化状态下的特性	digital pathology	neuromuscular disease	single-cell transcriptomics	NA	transcriptomic data	NA
15763	2024-08-07	Expression Profile of Inflammation Response Genes and Potential Regulatory Mechanisms in Dilated Cardiomyopathy 2022, Oxidative medicine and cellular longevity DOI:10.1155/2022/1051652 PMID:36035223	研究论文	本研究分析了扩张型心肌病（DCM）中的炎症反应基因表达谱及其潜在调控机制	首次详细描述了DCM中炎症反应基因的表达情况及其调控机制，包括转录因子和非编码RNA的调控网络	研究样本量相对较小，可能影响结果的普遍性	探讨DCM中炎症反应基因的表达及其调控机制	DCM患者和健康对照组的单细胞RNA测序数据	数字病理学	心血管疾病	单细胞RNA测序	NA	RNA测序数据	27,665个细胞样本，包括4个DCM样本和2个健康对照样本；166个DCM患者和166个健康对照的批量测序数据
15764	2024-08-07	Single-Cell Transcriptomics Analysis of the Pathogenesis of Tendon Injury 2022, Oxidative medicine and cellular longevity DOI:10.1155/2022/7887782 PMID:36148412	研究论文	本研究利用单细胞测序数据挖掘，分析了肌腱组织中的细胞组成及其在肌腱修复中的作用	首次揭示了肌腱组织中M1巨噬细胞和T细胞的异质性，及其在肌腱损伤和修复中的不同生理过程	NA	探索肌腱组织的细胞组成及与肌腱修复相关的细胞群体和信号通路	肌腱组织的细胞组成及肌腱修复机制	数字病理学	NA	单细胞测序	NA	基因表达数据	包含七种细胞亚群的肌腱组织样本
15765	2024-08-07	Single-Cell Transcriptional Profiling Reveals Low-Level Tragus Stimulation Improves Sepsis-Induced Myocardial Dysfunction by Promoting M2 Macrophage Polarization 2022, Oxidative medicine and cellular longevity DOI:10.1155/2022/3327583 PMID:36285297	研究论文	本研究通过单细胞转录组分析揭示了低水平耳屏刺激通过促进M2巨噬细胞极化改善脓毒症引起的心肌功能障碍	首次探讨了低水平耳屏刺激对脓毒症心肌功能障碍的影响及其机制，通过单细胞mRNA测序揭示了心脏细胞景观图	NA	探讨低水平耳屏刺激对脓毒症引起的心肌功能障碍的影响及其机制	脓毒症引起的心肌功能障碍及低水平耳屏刺激的作用	数字病理学	心血管疾病	单细胞mRNA测序	NA	mRNA	NA
15766	2024-08-05	Single-cell RNA-seq analysis decodes the kidney microenvironment induced by polystyrene microplastics in mice receiving a high-fat diet 2024-Jan-03, Journal of nanobiotechnology IF:10.6Q1 DOI:10.1186/s12951-023-02266-7 PMID:38167034	研究论文	本研究揭示了聚苯乙烯微塑料和高脂饮食诱导的小鼠肾脏微环境单细胞转录组特征	首次系统性揭示了聚苯乙烯微塑料和高脂饮食对小鼠肾脏细胞和免疫细胞的分子变化	研究主要基于小鼠模型，可能无法完全反映人类的情况	研究聚苯乙烯微塑料和高脂饮食对小鼠肾脏发展的影响	聚苯乙烯微塑料和高脂饮食对小鼠肾脏微环境的影响	数字病理学	肾脏疾病	单细胞RNA测序	NA	转录组数据	35天的高脂饮食和继续暴露于聚苯乙烯微塑料的小鼠模型
15767	2024-08-07	HSV1 microRNAs in glioblastoma development: an in silico study 2024-01-02, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-023-45249-2 PMID:38167429	研究论文	本研究通过计算方法探讨HSV1编码的microRNAs在胶质母细胞瘤发展中的作用	首次研究HSV1编码的microRNAs在胶质母细胞瘤发展中的作用，并揭示其在肿瘤抑制基因和致癌基因表达调控中的潜在影响	仅通过计算方法进行研究，未进行实验验证	探讨HSV1编码的microRNAs在胶质母细胞瘤发展中的作用及其对肿瘤抑制基因和致癌基因表达的影响	HSV1编码的microRNAs及其在胶质母细胞瘤发展中的作用	数字病理学	脑肿瘤	生物信息学分析	NA	基因表达数据	使用了GSE158284、GSE153679和GSE182109数据集，具体样本数量未详细说明
15768	2024-08-05	The role of ARL4C in predicting prognosis and immunotherapy drug susceptibility in pan-cancer analysis 2023, Frontiers in pharmacology IF:4.4Q1 DOI:10.3389/fphar.2023.1288492 PMID:38178862	研究论文	本研究探讨了ARL4C在全癌症分析中的预后预测和免疫治疗药物敏感性中的作用	首次揭示了ARL4C在不同类型癌症中的高表达与预后不良及免疫逃逸之间的关系，并对其在免疫微环境中的作用进行了分析	该研究可能存在样本量限制及ARL4C在特定癌症类型中的具体机制尚不清楚	研究ARL4C在肿瘤预后和免疫治疗药物敏感性中的作用	研究了33种不同类型癌症中ARL4C的表达及其与预后的相关性	数字病理学	NA	免疫组化和免疫荧光染色	NA	RNA-seq	23种不同类型癌症的样本
15769	2024-08-07	Transcriptome analysis reveals therapeutic potential of NAMPT in protecting against abdominal aortic aneurysm in human and mouse 2024-Apr, Bioactive materials IF:18.0Q1 DOI:10.1016/j.bioactmat.2023.11.020 PMID:38173843	研究论文	本研究利用单细胞RNA测序技术分析了正常和腹主动脉瘤（AAA）腹主动脉的分子特征，发现AAA中细胞异质性增加，并揭示了NAMPT在保护AAA中的潜在治疗作用。	首次揭示了NAMPT在腹主动脉瘤中的下调及其通过外泌体补充NAMPT的潜在治疗作用。	NA	探索腹主动脉瘤的分子机制及其潜在治疗策略。	人类和小鼠的腹主动脉瘤。	数字病理学	心血管疾病	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	NA
15770	2024-08-07	Single-cell RNA sequencing reveals that the immunosuppression landscape induced by chronic stress promotes colorectal cancer metastasis 2024-Jan-15, Heliyon IF:3.4Q1 DOI:10.1016/j.heliyon.2023.e23552 PMID:38169984	研究论文	本研究通过建立慢性不可预测轻度应激（CUMS）和原位结直肠癌的复合小鼠模型，利用10✕Genomics单细胞转录组测序技术，揭示了慢性应激状态下肿瘤免疫细胞趋向于更抑制和耗竭的状态，并描述了整体炎症环境与免疫抑制景观之间的相互作用。	首次揭示了慢性应激诱导的免疫抑制环境促进结直肠癌转移的机制，并提供了针对伴有抑郁症的结直肠癌患者的免疫治疗新策略。	NA	研究慢性应激对结直肠癌免疫微环境的影响及其对肿瘤进展的作用。	慢性应激状态下的小鼠结直肠肿瘤样本。	数字病理学	结直肠癌	单细胞转录组测序	NA	转录组数据	8只小鼠的肿瘤样本，近30,000个细胞
15771	2024-08-05	Exploring the relationship between immune heterogeneity characteristic genes of rheumatoid arthritis and acute myeloid leukemia 2024-Jan-02, Discover. Oncology DOI:10.1007/s12672-023-00852-7 PMID:38165493	研究论文	本研究探讨了类风湿关节炎的免疫异质性特征基因与急性髓系白血病之间的关系	该文章揭示了类风湿关节炎特征基因与急性髓系白血病的关联，提供了肉芽肿标记物的新见解	研究可能受限于获取的数据样本和数据库的限制	旨在通过RA研究发现AML的骨髓生物标志物	研究对象包括类风湿关节炎患者的滑膜转录组数据和急性髓系白血病患者的骨髓测序数据	数字病理学	类风湿关节炎, 急性髓系白血病	单细胞测序, 转录组测序	随机森林分类器	基因组数据	NA
15772	2024-08-05	Single-cell Transcriptomic Analysis Reveals an Immunosuppressive Network Between POSTN CAFs and ACKR1 ECs in TKI-resistant Lung Cancer 2024 Jan-Feb, Cancer genomics & proteomics IF:2.6Q3 DOI:10.21873/cgp.20430 PMID:38151287	研究论文	本研究通过单细胞转录组分析揭示了TKI耐药性肺癌中POSTN CAFs与ACKR1 ECs之间的免疫抑制网络	首次探讨了TKI治疗中血管内皮细胞与癌相关成纤维细胞亚群的关系	未能详细探讨不同CAF和EC亚群在其他癌症中的作用	探讨非小细胞肺癌中TKI治疗耐药的机制	47个不同阶段的非小细胞肺癌组织样本	数字病理学	肺癌	scRNA-seq	NA	RNA数据	49个晚期非小细胞肺癌样本
15773	2024-08-07	Single-cell RNA sequencing reveals immune microenvironment of small cell lung cancer-associated malignant pleural effusion 2024-Jan, Thoracic cancer IF:2.3Q2 DOI:10.1111/1759-7714.15145 PMID:38010064	研究论文	本文利用10×基因组单细胞转录组测序技术揭示了小细胞肺癌（SCLC）恶性胸腔积液（MPE）患者的肿瘤免疫微环境特征	首次通过单细胞RNA测序技术详细分析了SCLC相关恶性胸腔积液中的免疫细胞组成和基因表达特征	NA	揭示小细胞肺癌恶性胸腔积液的免疫微环境特征	小细胞肺癌患者的恶性胸腔积液中的免疫细胞和肿瘤细胞	数字病理学	肺癌	单细胞转录组测序	NA	转录组数据	共获得8008个高质量细胞进行后续生物信息学分析
15774	2024-08-07	Identification of basement membrane-related signatures for estimating prognosis, immune infiltration landscape and drug candidates in pancreatic adenocarcinoma 2024, Journal of Cancer IF:3.3Q2 DOI:10.7150/jca.89665 PMID:38169540	研究论文	本研究通过分析TCGA数据库中的数据，构建了与基底膜（BM）相关的基因风险评分系统，用于评估胰腺腺癌（PAAD）患者的预后、免疫浸润景观和潜在药物候选物	本研究首次开发了一种与基底膜相关的基因签名，为PAAD的诊断、预后评估、候选药物和治疗管理提供了新的见解和靶点	NA	探索基底膜相关基因在评估胰腺腺癌患者预后、微环境和治疗反应中的作用	胰腺腺癌（PAAD）患者	数字病理学	胰腺癌	单变量和LASSO Cox回归分析	NA	基因表达数据	使用TCGA数据库中的数据
15775	2024-08-07	Identification of a PANoptosis-related Gene Signature for Predicting the Prognosis, Tumor Microenvironment and Therapy Response in Breast Cancer 2024, Journal of Cancer IF:3.3Q2 DOI:10.7150/jca.90113 PMID:38169571	研究论文	本研究通过Cox回归分析、随机森林算法和LASSO算法识别了与PANoptosis相关的基因特征，用于预测乳腺癌的预后、肿瘤微环境和治疗反应	首次构建了基于PANoptosis相关评分的精确预测模型，并揭示了PANoptosis相关基因特征在调节乳腺癌肿瘤微环境和药物敏感性的重要性	NA	探索PANoptosis在乳腺癌中的作用，并开发预测乳腺癌预后和治疗反应的生物标志物	乳腺癌患者的PANoptosis相关基因特征及其对预后、肿瘤微环境和治疗反应的影响	数字病理学	乳腺癌	随机森林算法、LASSO算法、RNA测序	LASSO	RNA测序数据	涉及大量RNA和单细胞RNA测序数据
15776	2024-08-05	Tumor cell-intrinsic SETD2 inactivation sensitizes cancer cells to immune checkpoint blockade through the NR2F1-STAT1 pathway 2023-12-06, Journal for immunotherapy of cancer IF:10.3Q1 DOI:10.1136/jitc-2023-007678 PMID:38056895	研究论文	这篇文章探讨了SETD2失活对癌细胞免疫检查点抑制剂敏感性的影响	揭示了SETD2失活通过NR2F1-STAT1通路调节肿瘤免疫，提出了新的潜在治疗生物标志物	研究主要集中在小鼠模型上，尚需进一步验证在人类中的应用	探讨SETD2在免疫治疗中的功能及其对免疫反应的调节	小鼠肿瘤模型，特别是SETD2失活的肿瘤细胞	数字病理学	NA	RNA-seq, ATAC-seq, ChIP-seq, 流式细胞术	NA	RNA数据，流式细胞术数据	NA
15777	2024-08-07	Targeting integrin α5 in fibroblasts potentiates colorectal cancer response to PD-L1 blockade by affecting extracellular-matrix deposition 2023-12-01, Journal for immunotherapy of cancer IF:10.3Q1 DOI:10.1136/jitc-2023-007447 PMID:38040421	研究论文	本研究探讨了整合素α5在成纤维细胞中的作用，以及其如何通过影响细胞外基质沉积来增强结直肠癌对PD-L1阻断治疗的反应	首次揭示了整合素α5在成纤维细胞中通过影响细胞外基质沉积来调节抗肿瘤免疫的作用，并展示了α5β1抑制与PD-L1阻断联合治疗的疗效	研究样本量较小，仅为29名患者，可能影响结果的普遍性	研究整合素α5在成纤维细胞中的作用及其在结直肠癌免疫治疗中的效果	结直肠癌中的癌症相关成纤维细胞和免疫细胞	数字病理学	结直肠癌	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	29名结直肠癌患者
15778	2024-08-07	Molecular traces of Drosophila hemocytes reveal transcriptomic conservation with vertebrate myeloid cells 2023-Dec, PLoS genetics IF:4.0Q1 DOI:10.1371/journal.pgen.1011077 PMID:38113249	研究论文	本研究通过跨物种比较分析，利用单细胞RNA测序数据，探讨了果蝇血细胞与脊椎动物髓系细胞的转录组保守性	首次系统地分析了果蝇血细胞与脊椎动物髓系细胞的转录组保守性，并验证了CG8501（CD59）在果蝇血细胞吞噬作用中的功能	NA	探讨果蝇血细胞与脊椎动物髓系细胞的转录组保守性，以及免疫系统的进化	果蝇血细胞与脊椎动物免疫细胞	生物学	NA	单细胞RNA测序	NA	转录组数据	具体样本数量未在摘要中提及
15779	2024-08-05	MiR-26a-5p exerts its influence by targeting EP300, a molecule known for its role in activating the PI3K/AKT/mTOR signaling pathway in CD8+tumor-infiltrating lymphocytes of colorectal cancer 2023-Nov-30, Cellular and molecular biology (Noisy-le-Grand, France) DOI:10.14715/cmb/2023.69.12.37 PMID:38063089	研究论文	本文探讨了miR-26a-5p通过靶向EP300在结直肠癌CD8+肿瘤浸润淋巴细胞中的影响	本研究首次阐明了miR-26a-5p在调节肿瘤浸润T淋巴细胞功能中的作用，并识别EP300为其靶基因	关于miR-26a-5p在肿瘤浸润T淋巴细胞中的作用研究有限，且本研究未提供临床数据支持	旨在了解miR-26a-5p对结直肠癌肿瘤浸润淋巴细胞的影响及其机制	研究对象为结直肠癌患者的肿瘤浸润T淋巴细胞及正常T淋巴细胞	数字病理学	结直肠癌	单细胞测序	NA	生物信息学数据	NA
15780	2024-08-07	High-dimensional single-cell proteomics analysis of esophageal squamous cell carcinoma reveals dynamic alterations of the tumor immune microenvironment after neoadjuvant therapy 2023-11-28, Journal for immunotherapy of cancer IF:10.3Q1 DOI:10.1136/jitc-2023-007847 PMID:38016720	研究论文	本研究通过高维单细胞蛋白质组学分析食管鳞状细胞癌（ESCC）在接受新辅助治疗后的肿瘤免疫微环境动态变化	发现了与新辅助化疗反应相关的CCR4+CCR6+巨噬细胞亚群，并建立了一个基于CCR4/CCR6趋化因子的模型，用于预测ESCC患者对新辅助放化疗联合免疫治疗的反应	NA	揭示新辅助治疗对ESCC肿瘤免疫微环境细胞组成的调节作用，并提出预测治疗反应的模型	食管鳞状细胞癌（ESCC）患者的正常食管黏膜和肿瘤样本	数字病理学	食管癌	质谱流式细胞术，单细胞RNA测序，流式细胞术，免疫组化，免疫荧光分析	NA	单细胞数据，RNA序列数据	6个正常食管黏膜样本和26个肿瘤样本（12个未经治疗，14个接受新辅助治疗）