单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27504 篇文献，本页显示第 15741 - 15760 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 15741 | 2024-08-07 |
Identification of basement membrane-related signatures for estimating prognosis, immune infiltration landscape and drug candidates in pancreatic adenocarcinoma
2024, Journal of Cancer
IF:3.3Q2
DOI:10.7150/jca.89665
PMID:38169540
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研究论文 | 本研究通过分析TCGA数据库中的数据，构建了与基底膜（BM）相关的基因风险评分系统，用于评估胰腺腺癌（PAAD）患者的预后、免疫浸润景观和潜在药物候选物 | 本研究首次开发了一种与基底膜相关的基因签名，为PAAD的诊断、预后评估、候选药物和治疗管理提供了新的见解和靶点 | NA | 探索基底膜相关基因在评估胰腺腺癌患者预后、微环境和治疗反应中的作用 | 胰腺腺癌（PAAD）患者 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单变量和LASSO Cox回归分析 | NA | 基因表达数据 | 使用TCGA数据库中的数据 |
| 15742 | 2024-08-07 |
Identification of a PANoptosis-related Gene Signature for Predicting the Prognosis, Tumor Microenvironment and Therapy Response in Breast Cancer
2024, Journal of Cancer
IF:3.3Q2
DOI:10.7150/jca.90113
PMID:38169571
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研究论文 | 本研究通过Cox回归分析、随机森林算法和LASSO算法识别了与PANoptosis相关的基因特征，用于预测乳腺癌的预后、肿瘤微环境和治疗反应 | 首次构建了基于PANoptosis相关评分的精确预测模型，并揭示了PANoptosis相关基因特征在调节乳腺癌肿瘤微环境和药物敏感性的重要性 | NA | 探索PANoptosis在乳腺癌中的作用，并开发预测乳腺癌预后和治疗反应的生物标志物 | 乳腺癌患者的PANoptosis相关基因特征及其对预后、肿瘤微环境和治疗反应的影响 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 随机森林算法、LASSO算法、RNA测序 | LASSO | RNA测序数据 | 涉及大量RNA和单细胞RNA测序数据 |
| 15743 | 2024-08-05 |
Tumor cell-intrinsic SETD2 inactivation sensitizes cancer cells to immune checkpoint blockade through the NR2F1-STAT1 pathway
2023-12-06, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2023-007678
PMID:38056895
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研究论文 | 这篇文章探讨了SETD2失活对癌细胞免疫检查点抑制剂敏感性的影响 | 揭示了SETD2失活通过NR2F1-STAT1通路调节肿瘤免疫，提出了新的潜在治疗生物标志物 | 研究主要集中在小鼠模型上，尚需进一步验证在人类中的应用 | 探讨SETD2在免疫治疗中的功能及其对免疫反应的调节 | 小鼠肿瘤模型，特别是SETD2失活的肿瘤细胞 | 数字病理学 | NA | RNA-seq, ATAC-seq, ChIP-seq, 流式细胞术 | NA | RNA数据，流式细胞术数据 | NA |
| 15744 | 2024-08-07 |
Targeting integrin α5 in fibroblasts potentiates colorectal cancer response to PD-L1 blockade by affecting extracellular-matrix deposition
2023-12-01, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2023-007447
PMID:38040421
|
研究论文 | 本研究探讨了整合素α5在成纤维细胞中的作用，以及其如何通过影响细胞外基质沉积来增强结直肠癌对PD-L1阻断治疗的反应 | 首次揭示了整合素α5在成纤维细胞中通过影响细胞外基质沉积来调节抗肿瘤免疫的作用，并展示了α5β1抑制与PD-L1阻断联合治疗的疗效 | 研究样本量较小，仅为29名患者，可能影响结果的普遍性 | 研究整合素α5在成纤维细胞中的作用及其在结直肠癌免疫治疗中的效果 | 结直肠癌中的癌症相关成纤维细胞和免疫细胞 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 29名结直肠癌患者 |
| 15745 | 2024-08-07 |
Molecular traces of Drosophila hemocytes reveal transcriptomic conservation with vertebrate myeloid cells
2023-Dec, PLoS genetics
IF:4.0Q1
DOI:10.1371/journal.pgen.1011077
PMID:38113249
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研究论文 | 本研究通过跨物种比较分析，利用单细胞RNA测序数据，探讨了果蝇血细胞与脊椎动物髓系细胞的转录组保守性 | 首次系统地分析了果蝇血细胞与脊椎动物髓系细胞的转录组保守性，并验证了CG8501（CD59）在果蝇血细胞吞噬作用中的功能 | NA | 探讨果蝇血细胞与脊椎动物髓系细胞的转录组保守性，以及免疫系统的进化 | 果蝇血细胞与脊椎动物免疫细胞 | 生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 15746 | 2024-08-05 |
MiR-26a-5p exerts its influence by targeting EP300, a molecule known for its role in activating the PI3K/AKT/mTOR signaling pathway in CD8+tumor-infiltrating lymphocytes of colorectal cancer
2023-Nov-30, Cellular and molecular biology (Noisy-le-Grand, France)
DOI:10.14715/cmb/2023.69.12.37
PMID:38063089
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研究论文 | 本文探讨了miR-26a-5p通过靶向EP300在结直肠癌CD8+肿瘤浸润淋巴细胞中的影响 | 本研究首次阐明了miR-26a-5p在调节肿瘤浸润T淋巴细胞功能中的作用，并识别EP300为其靶基因 | 关于miR-26a-5p在肿瘤浸润T淋巴细胞中的作用研究有限，且本研究未提供临床数据支持 | 旨在了解miR-26a-5p对结直肠癌肿瘤浸润淋巴细胞的影响及其机制 | 研究对象为结直肠癌患者的肿瘤浸润T淋巴细胞及正常T淋巴细胞 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞测序 | NA | 生物信息学数据 | NA |
| 15747 | 2024-08-07 |
High-dimensional single-cell proteomics analysis of esophageal squamous cell carcinoma reveals dynamic alterations of the tumor immune microenvironment after neoadjuvant therapy
2023-11-28, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2023-007847
PMID:38016720
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研究论文 | 本研究通过高维单细胞蛋白质组学分析食管鳞状细胞癌（ESCC）在接受新辅助治疗后的肿瘤免疫微环境动态变化 | 发现了与新辅助化疗反应相关的CCR4+CCR6+巨噬细胞亚群，并建立了一个基于CCR4/CCR6趋化因子的模型，用于预测ESCC患者对新辅助放化疗联合免疫治疗的反应 | NA | 揭示新辅助治疗对ESCC肿瘤免疫微环境细胞组成的调节作用，并提出预测治疗反应的模型 | 食管鳞状细胞癌（ESCC）患者的正常食管黏膜和肿瘤样本 | 数字病理学 | 食管癌 | 质谱流式细胞术，单细胞RNA测序，流式细胞术，免疫组化，免疫荧光分析 | NA | 单细胞数据，RNA序列数据 | 6个正常食管黏膜样本和26个肿瘤样本（12个未经治疗，14个接受新辅助治疗） |
| 15748 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA-sequencing atlas reveals an FABP1-dependent immunosuppressive environment in hepatocellular carcinoma
2023-11-24, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2023-007030
PMID:38007237
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了不同阶段的肝细胞癌组织，揭示了FABP1依赖的免疫抑制环境，并探索了新的治疗策略。 | 首次对不同阶段的肝细胞癌进行单细胞RNA测序分析，发现FABP1在肿瘤相关巨噬细胞中的过表达及其对肝细胞癌进展的影响，并提出了新的治疗策略。 | 研究样本量较小，且仅限于特定阶段的肝细胞癌病例，需要进一步扩大样本量和涵盖更多阶段以验证结果的普遍性。 | 深入理解肝细胞癌的肿瘤微环境，并探索新的治疗靶点和策略。 | 肝细胞癌的不同阶段组织及其周围的正常组织和免疫细胞。 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 15个样本，包括3个II期和4个III期肝细胞癌病例的免疫细胞。 |
| 15749 | 2024-08-07 |
Identification of biomarkers and immune infiltration in acute myocardial infarction and heart failure by integrated analysis
2023-07-26, Bioscience reports
IF:3.8Q2
DOI:10.1042/BSR20222552
PMID:37334672
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研究论文 | 本研究通过综合分析方法，鉴定了急性心肌梗死和心力衰竭中的生物标志物和免疫浸润情况 | 本研究首次通过xCell算法和单细胞RNA测序数据，分析了急性心肌梗死和心力衰竭患者的免疫细胞浸润模式，并验证了相关枢纽基因 | NA | 旨在分析急性心肌梗死和心力衰竭患者的枢纽基因和免疫浸润情况 | 急性心肌梗死和心力衰竭患者 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用了来自急性心肌梗死患者的五个公开基因表达数据集 |
| 15750 | 2024-08-07 |
Intratumoral PPT1-positive macrophages determine immunosuppressive contexture and immunotherapy response in hepatocellular carcinoma
2023-06, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2022-006655
PMID:37385725
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研究论文 | 本研究探讨了肝细胞癌（HCC）中PPT1阳性巨噬细胞对免疫抑制微环境和免疫治疗反应的影响 | 首次揭示了PPT1阳性巨噬细胞在HCC中的作用，及其对免疫微环境和治疗反应的影响 | 研究样本仅来自中山医院的169名患者，可能限制了结果的普遍性 | 识别在HCC发展中起关键作用的巨噬细胞亚群 | 肝细胞癌（HCC）中的巨噬细胞 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 169名HCC患者 |
| 15751 | 2024-08-05 |
Spatial transcriptomics of murine bone marrow megakaryocytes at single-cell resolution
2023-May, Research and practice in thrombosis and haemostasis
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.rpth.2023.100158
PMID:37255850
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研究论文 | 本研究结合空间转录组学和单细胞序列技术，分析小鼠骨髓巨核细胞的异质性 | 首次在小鼠骨髓中以单细胞分辨率探讨巨核细胞的空间异质性 | 仅分析了小鼠的巨核细胞，可能不适用于其他物种或人类细胞 | 探讨小鼠骨髓巨核细胞的空间分布及其在转录组上的异质性 | C57BL/6J小鼠的骨髓巨核细胞 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 44个单个巨核细胞 |
| 15752 | 2024-08-05 |
Glucocorticoid activation by HSD11B1 limits T cell-driven interferon signaling and response to PD-1 blockade in melanoma
2023-04-07, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2021-004150
PMID:37028818
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研究论文 | 这篇文章探讨了HSD11B1如何通过限制T细胞驱动的干扰素信号通路反过来影响黑色素瘤对PD-1阻断的反应 | 识别了HSD11B1作为负反馈机制，并提出HSD11B1抑制剂与免疫检查点抑制剂（ICIs）结合使用的药物重定位策略 | 需要更加仔细的人群分层来评估疗效 | 旨在识别影响黑色素瘤免疫治疗反应的新机制 | 使用不同的同基因黑色素瘤小鼠模型研究PD-1的阻断影响 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | RNA-seq, 免疫荧光, 流式细胞术, 免疫组化 | NA | 组织样本 | 使用了多种小鼠模型和两组患者样本 |
| 15753 | 2024-08-07 |
Scleraxis-lineage cells are required for tendon homeostasis and their depletion induces an accelerated extracellular matrix aging phenotype
2023-01-19, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.84194
PMID:36656751
|
研究论文 | 本研究通过在小鼠中耗尽Scleraxis-lineage细胞，开发了一种加速肌腱细胞外基质（ECM）衰老的新模型，并探讨了其对肌腱稳态的影响 | 首次开发了一种通过耗尽Scleraxis-lineage细胞来加速肌腱ECM衰老的模型，并揭示了该模型中肌腱细胞功能的变化 | NA | 探究肌腱稳态破坏的机制，为开发维持肌腱健康的治疗方法提供依据 | Scleraxis-lineage细胞在肌腱稳态和ECM衰老中的作用 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 年轻小鼠 |
| 15754 | 2024-08-07 |
Characterizing Neonatal Heart Maturation, Regeneration, and Scar Resolution Using Spatial Transcriptomics
2021-Dec-21, Journal of cardiovascular development and disease
IF:2.4Q2
DOI:10.3390/jcdd9010001
PMID:35050211
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研究论文 | 本研究利用空间转录组学技术，探讨了新生小鼠心脏在心尖切除后修复过程中的成熟、再生和瘢痕愈合机制 | 本研究首次利用空间转录组学技术，揭示了新生小鼠心脏在再生和非再生时间点的动态表型变化，以及瘢痕愈合过程中的基因表达程序 | NA | 研究新生哺乳动物心脏的再生潜力及其修复机制 | 新生小鼠心脏的再生和瘢痕愈合过程 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 新生小鼠心脏样本 |
| 15755 | 2024-08-05 |
Integrating Single-cell and Bulk RNA-seq to Construct a Metastasis-related Model for Evaluating Immunotherapy and Chemotherapy in Uveal Melanoma
2024-Jan-03, Current medicinal chemistry
IF:3.5Q2
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研究论文 | 本文探讨了原发性和转移性葡萄膜黑色素瘤的异质性，并构建了一个与转移相关的模型。 | 通过整合单细胞和大规模RNA测序数据，发现了调控UM转移的潜在分子并建立了预后模型。 | 未提及该研究的具体限制。 | 改进转移性葡萄膜黑色素瘤患者的精准治疗。 | 焦点是原发性和转移性葡萄膜黑色素瘤及其细胞类型。 | 数字病理学 | 葡萄膜黑色素瘤 | RNA-seq | LASSO和Cox回归分析 | 基因表达数据 | 包含157个转录差异基因 |
| 15756 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA Sequencing Analysis Reveals the Role of Cancer-associated Fibroblasts in Skin Melanoma
2024-Jan-03, Current medicinal chemistry
IF:3.5Q2
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序数据揭示了皮肤黑色素瘤中癌症相关成纤维细胞的作用 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细解析了癌症相关成纤维细胞在皮肤黑色素瘤中的分子机制 | 研究仅基于三个病例的单细胞RNA测序数据，可能存在样本量不足的问题 | 揭示癌症相关成纤维细胞在皮肤黑色素瘤中的作用及其分子机制 | 皮肤黑色素瘤中的癌症相关成纤维细胞 | 数字病理学 | 皮肤黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 三个皮肤黑色素瘤病例 |
| 15757 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptomics and chromatin accessibility profiling elucidate the kidney-protective mechanism of mineralocorticoid receptor antagonists
2024-Jan-02, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI157165
PMID:37906287
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研究论文 | 本文使用单细胞转录组学和染色质可及性分析来阐明矿物皮质激素受体拮抗剂的肾脏保护机制 | 研究揭示了矿物皮质激素的靶基因和细胞类型，以及不同拮抗剂在高血压和心肾损伤模型中的保护作用 | 主要在大鼠模型中进行研究，可能在临床应用上存在局限性 | 探讨矿物皮质激素受体拮抗剂对高血压相关肾病的保护机制 | 矿物皮质激素拮抗剂及其在大鼠模型中的应用 | 数字病理学 | 高血压相关肾病 | 单细胞表达分析和染色质可及性分析 | 大鼠模型 | 基因表达数据，细胞类型数据 | 大鼠模型，样本数量未具体说明 |
| 15758 | 2024-08-07 |
Establishment and characterization of a recurrent malignant peripheral nerve sheath tumor cell line: RsNF
2024-Jan, Human cell
IF:3.4Q3
DOI:10.1007/s13577-023-01000-7
PMID:37938540
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研究论文 | 本文建立并描述了一种复发性恶性周围神经鞘瘤细胞系RsNF，该细胞系源自NF1患者，并通过全外显子测序检测到NF1和SUZ12体细胞突变。 | 通过肿瘤分子标记物靶向测序和单细胞转录组测序，发现该细胞系中染色体7的拷贝数变异增加，并过度表达ZNF804B和EGFR等基因。 | NA | 研究恶性周围神经鞘瘤的肿瘤异质性并开发多样化的治疗选择。 | 复发性恶性周围神经鞘瘤细胞系RsNF。 | 数字病理学 | 软组织肉瘤 | 全外显子测序 | NA | 基因组数据 | 单个细胞系 |
| 15759 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA-sequencing profiles reveal the developmental landscape of the Manihot esculenta Crantz leaves
2023-Dec-30, Plant physiology
IF:6.5Q1
DOI:10.1093/plphys/kiad500
PMID:37706525
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术揭示了木薯叶片的发育景观 | 首次构建了木薯叶片的单细胞转录组图谱，并识别了叶片的三大主要组织及其特性和代谢活性 | NA | 探究木薯叶片的结构和光合特性在细胞水平上的表现 | 木薯叶片的细胞结构和光合特性 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 11,177个高质量叶片细胞 |
| 15760 | 2024-08-07 |
Tr1 Cells Emerge and Suppress Effector Th17 Cells in Glomerulonephritis
2023-12-01, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.4049/jimmunol.2300305
PMID:37850963
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研究论文 | 本研究探讨了Tr1细胞在肾小球肾炎（GN）中的出现及其抑制效应Th17细胞的功能 | 首次详细研究了Tr1细胞在肾小球肾炎中的出现及其在疾病中的调控功能 | NA | 验证Tr1细胞在实验性肾小球肾炎中的治疗潜力 | Tr1细胞在肾小球肾炎中的作用及其调控机制 | 免疫学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 使用了实验性新月形肾小球肾炎的小鼠模型和双Foxp3mRFP IL-10eGFP报告小鼠，以及抗中性粒细胞胞浆自身抗体相关肾小球肾炎患者的肾脏样本 |