单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27474 篇文献，本页显示第 15721 - 15740 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 15721 | 2024-08-05 |
Spatial transcriptomics of murine bone marrow megakaryocytes at single-cell resolution
2023-May, Research and practice in thrombosis and haemostasis
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.rpth.2023.100158
PMID:37255850
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研究论文 | 本研究结合空间转录组学和单细胞序列技术，分析小鼠骨髓巨核细胞的异质性 | 首次在小鼠骨髓中以单细胞分辨率探讨巨核细胞的空间异质性 | 仅分析了小鼠的巨核细胞，可能不适用于其他物种或人类细胞 | 探讨小鼠骨髓巨核细胞的空间分布及其在转录组上的异质性 | C57BL/6J小鼠的骨髓巨核细胞 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 44个单个巨核细胞 |
| 15722 | 2024-08-05 |
Glucocorticoid activation by HSD11B1 limits T cell-driven interferon signaling and response to PD-1 blockade in melanoma
2023-04-07, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2021-004150
PMID:37028818
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研究论文 | 这篇文章探讨了HSD11B1如何通过限制T细胞驱动的干扰素信号通路反过来影响黑色素瘤对PD-1阻断的反应 | 识别了HSD11B1作为负反馈机制，并提出HSD11B1抑制剂与免疫检查点抑制剂（ICIs）结合使用的药物重定位策略 | 需要更加仔细的人群分层来评估疗效 | 旨在识别影响黑色素瘤免疫治疗反应的新机制 | 使用不同的同基因黑色素瘤小鼠模型研究PD-1的阻断影响 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | RNA-seq, 免疫荧光, 流式细胞术, 免疫组化 | NA | 组织样本 | 使用了多种小鼠模型和两组患者样本 |
| 15723 | 2024-08-07 |
Scleraxis-lineage cells are required for tendon homeostasis and their depletion induces an accelerated extracellular matrix aging phenotype
2023-01-19, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.84194
PMID:36656751
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研究论文 | 本研究通过在小鼠中耗尽Scleraxis-lineage细胞，开发了一种加速肌腱细胞外基质（ECM）衰老的新模型，并探讨了其对肌腱稳态的影响 | 首次开发了一种通过耗尽Scleraxis-lineage细胞来加速肌腱ECM衰老的模型，并揭示了该模型中肌腱细胞功能的变化 | NA | 探究肌腱稳态破坏的机制，为开发维持肌腱健康的治疗方法提供依据 | Scleraxis-lineage细胞在肌腱稳态和ECM衰老中的作用 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 年轻小鼠 |
| 15724 | 2024-08-07 |
Characterizing Neonatal Heart Maturation, Regeneration, and Scar Resolution Using Spatial Transcriptomics
2021-Dec-21, Journal of cardiovascular development and disease
IF:2.4Q2
DOI:10.3390/jcdd9010001
PMID:35050211
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研究论文 | 本研究利用空间转录组学技术，探讨了新生小鼠心脏在心尖切除后修复过程中的成熟、再生和瘢痕愈合机制 | 本研究首次利用空间转录组学技术，揭示了新生小鼠心脏在再生和非再生时间点的动态表型变化，以及瘢痕愈合过程中的基因表达程序 | NA | 研究新生哺乳动物心脏的再生潜力及其修复机制 | 新生小鼠心脏的再生和瘢痕愈合过程 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 新生小鼠心脏样本 |
| 15725 | 2024-08-05 |
Integrating Single-cell and Bulk RNA-seq to Construct a Metastasis-related Model for Evaluating Immunotherapy and Chemotherapy in Uveal Melanoma
2024-Jan-03, Current medicinal chemistry
IF:3.5Q2
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研究论文 | 本文探讨了原发性和转移性葡萄膜黑色素瘤的异质性，并构建了一个与转移相关的模型。 | 通过整合单细胞和大规模RNA测序数据，发现了调控UM转移的潜在分子并建立了预后模型。 | 未提及该研究的具体限制。 | 改进转移性葡萄膜黑色素瘤患者的精准治疗。 | 焦点是原发性和转移性葡萄膜黑色素瘤及其细胞类型。 | 数字病理学 | 葡萄膜黑色素瘤 | RNA-seq | LASSO和Cox回归分析 | 基因表达数据 | 包含157个转录差异基因 |
| 15726 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA Sequencing Analysis Reveals the Role of Cancer-associated Fibroblasts in Skin Melanoma
2024-Jan-03, Current medicinal chemistry
IF:3.5Q2
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序数据揭示了皮肤黑色素瘤中癌症相关成纤维细胞的作用 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细解析了癌症相关成纤维细胞在皮肤黑色素瘤中的分子机制 | 研究仅基于三个病例的单细胞RNA测序数据，可能存在样本量不足的问题 | 揭示癌症相关成纤维细胞在皮肤黑色素瘤中的作用及其分子机制 | 皮肤黑色素瘤中的癌症相关成纤维细胞 | 数字病理学 | 皮肤黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 三个皮肤黑色素瘤病例 |
| 15727 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptomics and chromatin accessibility profiling elucidate the kidney-protective mechanism of mineralocorticoid receptor antagonists
2024-Jan-02, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI157165
PMID:37906287
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研究论文 | 本文使用单细胞转录组学和染色质可及性分析来阐明矿物皮质激素受体拮抗剂的肾脏保护机制 | 研究揭示了矿物皮质激素的靶基因和细胞类型，以及不同拮抗剂在高血压和心肾损伤模型中的保护作用 | 主要在大鼠模型中进行研究，可能在临床应用上存在局限性 | 探讨矿物皮质激素受体拮抗剂对高血压相关肾病的保护机制 | 矿物皮质激素拮抗剂及其在大鼠模型中的应用 | 数字病理学 | 高血压相关肾病 | 单细胞表达分析和染色质可及性分析 | 大鼠模型 | 基因表达数据，细胞类型数据 | 大鼠模型，样本数量未具体说明 |
| 15728 | 2024-08-07 |
Establishment and characterization of a recurrent malignant peripheral nerve sheath tumor cell line: RsNF
2024-Jan, Human cell
IF:3.4Q3
DOI:10.1007/s13577-023-01000-7
PMID:37938540
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研究论文 | 本文建立并描述了一种复发性恶性周围神经鞘瘤细胞系RsNF，该细胞系源自NF1患者，并通过全外显子测序检测到NF1和SUZ12体细胞突变。 | 通过肿瘤分子标记物靶向测序和单细胞转录组测序，发现该细胞系中染色体7的拷贝数变异增加，并过度表达ZNF804B和EGFR等基因。 | NA | 研究恶性周围神经鞘瘤的肿瘤异质性并开发多样化的治疗选择。 | 复发性恶性周围神经鞘瘤细胞系RsNF。 | 数字病理学 | 软组织肉瘤 | 全外显子测序 | NA | 基因组数据 | 单个细胞系 |
| 15729 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA-sequencing profiles reveal the developmental landscape of the Manihot esculenta Crantz leaves
2023-Dec-30, Plant physiology
IF:6.5Q1
DOI:10.1093/plphys/kiad500
PMID:37706525
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术揭示了木薯叶片的发育景观 | 首次构建了木薯叶片的单细胞转录组图谱，并识别了叶片的三大主要组织及其特性和代谢活性 | NA | 探究木薯叶片的结构和光合特性在细胞水平上的表现 | 木薯叶片的细胞结构和光合特性 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 11,177个高质量叶片细胞 |
| 15730 | 2024-08-07 |
Tr1 Cells Emerge and Suppress Effector Th17 Cells in Glomerulonephritis
2023-12-01, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.4049/jimmunol.2300305
PMID:37850963
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研究论文 | 本研究探讨了Tr1细胞在肾小球肾炎（GN）中的出现及其抑制效应Th17细胞的功能 | 首次详细研究了Tr1细胞在肾小球肾炎中的出现及其在疾病中的调控功能 | NA | 验证Tr1细胞在实验性肾小球肾炎中的治疗潜力 | Tr1细胞在肾小球肾炎中的作用及其调控机制 | 免疫学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 使用了实验性新月形肾小球肾炎的小鼠模型和双Foxp3mRFP IL-10eGFP报告小鼠，以及抗中性粒细胞胞浆自身抗体相关肾小球肾炎患者的肾脏样本 |
| 15731 | 2024-08-05 |
A Spatial Transcriptome Reveals Changes in Tumor and Tumor Microenvironment in Oral Cancer with Acquired Resistance to Immunotherapy
2023-11-22, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom13121685
PMID:38136558
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研究论文 | 这项研究揭示了在口腔癌患者获得免疫治疗耐药后，肿瘤及其微环境的动态变化 | 本研究采用空间转录组技术揭示了获得免疫治疗耐药后的表观遗传修饰相关通路的激活 | 本研究仅基于一个患者的案例，样本量较小，缺乏广泛适用性 | 研究免疫治疗对口腔癌及其微环境的影响 | 77岁男性口腔鳞状细胞癌患者 | 数字病理学 | 口腔癌 | 空间转录组技术 | NA | 转录组数据 | 1个样本 |
| 15732 | 2024-08-05 |
Good Cop, Bad Cop: Profiling the Immune Landscape in Multiple Myeloma
2023-11-07, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom13111629
PMID:38002311
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综述 | 本文描述了多发性骨髓瘤中骨髓微环境各成分的作用以及免疫治疗的临床试验。 | 结合经典免疫表型分析与单细胞测序技术的先进免疫特征分析，揭示了特定免疫细胞在多发性骨髓瘤中的作用。 | 未提供具体的临床试验数据和结果，可能限制对免疫治疗效果的全面理解 | 探讨多发性骨髓瘤中骨髓微环境对疾病发展的影响。 | 主要研究多发性骨髓瘤及其相关的免疫细胞和骨髓微环境。 | 数字病理学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞测序技术 | NA | NA | 采用外周血和骨髓中的特定免疫细胞进行分析，但样本数量未提供 |
| 15733 | 2024-08-05 |
Spatial and single-cell profiling of the metabolome, transcriptome and epigenome of the aging mouse liver
2023-Nov, Nature aging
IF:17.0Q1
DOI:10.1038/s43587-023-00513-y
PMID:37946043
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研究论文 | 这篇文章探讨了小鼠肝脏中细胞如何受到与年龄相关的微环境变化的影响 | 本研究首次通过空间转录组学结合单细胞ATAC-seq和RNA-seq等技术，揭示了脂质组学和功能测定在不同空间区域细胞衰老过程中的作用 | 该研究仅在男性小鼠的肝脏中进行，可能不适用于所有物种或性别 | 探究组织内细胞类型在不同空间位置受衰老影响的情况 | 研究对象为小鼠肝脏的不同细胞类型 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学, 单细胞ATAC-seq, RNA-seq, 脂质组学 | NA | NA | 男性小鼠肝脏的多个细胞类型 |
| 15734 | 2024-08-07 |
Hnf4 activates mimetic-cell enhancers to recapitulate gut and liver development within the thymus
2023-10-02, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20230461
PMID:37399024
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研究论文 | 研究通过Hnf4α和Hnf4γ转录因子激活模拟细胞增强子，重现胸腺中的肠道和肝脏发育 | 揭示了Hnf4在胸腺中的基因调控机制，并发现了Hnf4γ在肠道微褶细胞和IgA反应中的作用 | NA | 探讨Hnf4在胸腺中模拟细胞的基因调控机制 | 胸腺中的模拟细胞（mTECs）及其在肠道和肝脏发育中的作用 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 15735 | 2024-08-07 |
Paired single-cell host profiling with multiplex-tagged bacterial mutants reveals intracellular virulence-immune networks
2023-07-11, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2218812120
PMID:37399397
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research paper | 本文开发了一种名为scPAIR-seq的单细胞方法，用于分析感染过程中宿主细胞和细菌突变体的相互作用 | scPAIR-seq方法能够同时捕获感染宿主细胞和内部细菌突变体的条形码，从而分析突变体对宿主转录组的影响 | NA | 研究宿主细胞与内部细菌病原体相遇后复杂的表型及其对感染结果的影响 | 宿主细胞和内部细菌病原体的相互作用 | digital pathology | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 使用了感染了Typhimurium分泌系统效应子突变体库的巨噬细胞样本 |
| 15736 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptomics reveals cellular heterogeneity and macrophage-to-mesenchymal transition in bicuspid calcific aortic valve disease
2023-06-30, Biology direct
IF:5.7Q1
DOI:10.1186/s13062-023-00390-w
PMID:37391760
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研究论文 | 该文章研究了二尖瓣钙化主动脉瓣病中的细胞异质性和巨噬细胞转化为间充质细胞的过程。 | 首次在单细胞水平上揭示了二尖瓣病中细胞的异质性以及巨噬细胞向间充质细胞转化的机制 | 样本量较小，仅涉及四个BAV标本，需要更多样本进行进一步验证 | 探讨二尖瓣疾病中的细胞组成及其在钙化过程中的作用 | 四个存在主动脉瓣狭窄的二尖瓣患者的BAV标本 | 数字病理学 | 主动脉瓣钙化疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 细胞数据 | 4个BAV标本 |
| 15737 | 2024-08-05 |
Comprehensive analysis of KLF2 as a prognostic biomarker associated with fibrosis and immune infiltration in advanced hepatocellular carcinoma
2023-Jun-29, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-023-05391-0
PMID:37386390
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研究论文 | 本文分析了KLF2在晚期肝细胞癌中的预后生物标志物的作用，特别关注其与纤维化和免疫浸润的关系 | 首次系统性研究了KLF2在肝细胞癌（HCC）中的调节机制及其作为预后生物标志物的潜力 | 研究主要依赖于现有数据库，未进行独立的临床验证 | 探索KLF2作为晚期HCC的潜在诊断和预后生物标志物 | 晚期肝细胞癌（HCC）患者的样本数据和单细胞测序结果 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 基于公共数据库，具体样本量不详 |
| 15738 | 2024-08-07 |
Functionalized Lineage Tracing for the Study and Manipulation of Heterogeneous Cell Populations
2022, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-1811-0_8
PMID:35094325
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研究论文 | 本文介绍了COLBERT方法，通过使用独特的单引导RNA（sgRNA）条形码作为功能标签来识别和召回特定的细胞谱系 | COLBERT方法利用sgRNA条形码稳定整合并主动转录，使得所有细胞后代都包含亲本条形码并产生功能性sgRNA，从而实现对异质细胞群中特定谱系的追踪和分离 | NA | 研究并操控异质细胞群 | 异质细胞群中的独特细胞谱系 | NA | NA | CRISPR | NA | NA | NA |
| 15739 | 2024-08-07 |
Evaluating Capture Sequence Performance for Single-Cell CRISPR Activation Experiments
2021-Mar-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.0c00499
PMID:33625849
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研究论文 | 本文评估了单细胞CRISPR激活实验中捕获序列性能的影响 | 引入了特征条形码技术，允许同时捕获mRNA和gRNA | 该技术尚处于起步阶段，缺乏优化实验参数的信息 | 识别CRISPR激活基因扰动研究的最佳gRNA支架 | 捕获序列、捕获序列位置和gRNA骨架 | NA | NA | 单细胞RNA测序、CRISPR激活 | NA | mRNA、gRNA | NA |
| 15740 | 2024-08-07 |
Detection of gene cis-regulatory element perturbations in single-cell transcriptomes
2021-Mar, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1008789
PMID:33711017
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研究论文 | 介绍了一种基于poly-adenine CRISPR gRNA的单细胞RNA测序方法（pAC-Seq），用于直接观察scRNA-seq中的gRNAs，并评估CRISPR/Cas9对基因顺式调控区域改变的表型后果 | pAC-Seq能够检测到顺式调控引起的靶基因表达改变，即使在只有约5%的细胞中发生双等位基因丢失 | 低比例的双等位基因丢失显著增加了检测调控基因组变化后果所需的细胞数量 | 评估CRISPR/Cas9对基因顺式调控区域改变的表型后果 | 基因顺式调控区域的改变及其对靶基因表达的影响 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 约5%的细胞发生双等位基因丢失 |