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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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15701 | 2024-08-07 |
Transcriptome characteristics of epithelial cells from advanced non-small cell lung cancer were revealed by single-cell RNA sequencing
2024-Feb, Environmental toxicology
IF:4.4Q1
DOI:10.1002/tox.23960
PMID:37676967
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了晚期非小细胞肺癌上皮细胞的转录组特征 | 首次发现TPI1作为LUAD的新型生物标志物,并揭示了MXD3和GATA4作为潜在的调控转录因子 | NA | 探索与LUAD患者免疫浸润和生存时间相关的差异表达基因,并预测转录因子以揭示LUAD的分子机制和个体化治疗 | 晚期非小细胞肺癌的上皮细胞 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 16种上皮细胞类型 |
15702 | 2024-08-07 |
The single-cell evolution trajectory presented different hypoxia heterogeneity to reveal the carcinogenesis of genes in clear cell renal cell carcinoma: Based on multiple omics and real experimental verification
2024-Feb, Environmental toxicology
IF:4.4Q1
DOI:10.1002/tox.24009
PMID:37886854
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序数据分析,揭示了透明细胞肾细胞癌(ccRCC)中基因的癌变机制及其与缺氧异质性的关系 | 本研究首次识别了ccRCC中多个与缺氧相关的肿瘤微环境(TME)亚群,并揭示了ANGPTL4在调控ccRCC增殖中的作用 | NA | 探讨透明细胞肾细胞癌中基因的癌变机制及其与缺氧异质性的关系 | 透明细胞肾细胞癌(ccRCC)及其相关基因和细胞亚群 | 数字病理学 | 肾癌 | scRNA-seq | UMAP, NMF | 单细胞RNA测序数据 | 使用了来自GSE159115数据集的scRNA-seq数据,以及ccRCC细胞系的786-O和Caki细胞 |
15703 | 2024-08-07 |
Adverse effects of gestational diabetes mellitus on fetal monocytes revealed by single-cell RNA sequencing
2024-Jan-19, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2023.108637
PMID:38188508
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了健康母亲和妊娠糖尿病(GDM)母亲胎儿脐带血单核细胞的转录组数据,揭示了GDM对胎儿单核细胞的不良影响。 | 首次揭示了GDM母亲胎儿脐带血中单核细胞的特征性变化,包括炎症相关通路下调和增殖相关通路上调,以及CXCL8+IL1B+亚群的扩增和功能增强。 | 研究仅限于脐带血单核细胞的分析,未涉及其他组织或细胞类型,可能需要进一步研究以全面理解GDM对胎儿的影响。 | 探讨妊娠糖尿病对胎儿单核细胞的影响及其潜在机制。 | 健康母亲和GDM母亲胎儿的脐带血单核细胞。 | 数字病理学 | 妊娠糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 包括健康和GDM母亲胎儿的脐带血单核细胞,以及儿童和青少年外周血单核细胞和动脉粥样硬化斑块中的髓样细胞。 |
15704 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptomic analysis of pea shoot development and cell-type-specific responses to boron deficiency
2024-Jan, The Plant journal : for cell and molecular biology
DOI:10.1111/tpj.16487
PMID:37794835
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了豌豆芽发育及细胞类型特异性响应硼缺乏的情况 | 相较于传统的整体组织RNA测序分析,本研究能够捕捉到细胞类型特异性的响应,揭示了硼缺乏对植物生理响应的重要性 | NA | 旨在理解营养胁迫如何影响植物生长,并探索提高作物在营养限制条件下产量的方法 | 豌豆芽的发育及对硼缺乏的细胞类型特异性响应 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 豌豆芽的顶端细胞 |
15705 | 2024-08-07 |
Author Correction: Longitudinal scRNA-seq analysis in mouse and human informs optimization of rapid mouse astrocyte differentiation protocols
2024-Jan, Nature neuroscience
IF:21.2Q1
DOI:10.1038/s41593-023-01531-0
PMID:37996532
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
15706 | 2024-08-07 |
Single-cell analysis identifies phospholysine phosphohistidine inorganic pyrophosphate phosphatase as a target in ulcerative colitis
2023-Dec-28, World journal of gastroenterology
IF:4.3Q1
DOI:10.3748/wjg.v29.i48.6222
PMID:38186864
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析溃疡性结肠炎患者的细胞互作和分子特征,发现磷赖氨酸磷组氨酸无机焦磷酸磷酸酶(LHPP)在炎症调控中的潜在作用。 | 本研究首次揭示了LHPP在溃疡性结肠炎中的下调与炎症反应的负相关性,并提出LHPP作为治疗溃疡性结肠炎的潜在靶点。 | NA | 利用单细胞RNA测序技术解析溃疡性结肠炎病理中的细胞互作和分子特征。 | 溃疡性结肠炎患者的细胞和分子机制。 | 数字病理学 | 溃疡性结肠炎 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | RNA | 溃疡性结肠炎患者的组织和血浆样本 |
15707 | 2024-08-05 |
Single-cell Analysis Reveals Inter- and Intratumour Heterogeneity in Metastatic Breast Cancer
2023-12-08, Journal of mammary gland biology and neoplasia
IF:3.0Q2
DOI:10.1007/s10911-023-09551-z
PMID:38066300
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研究论文 | 本研究揭示了转移性乳腺癌中的肿瘤间和肿瘤内异质性 | 首次通过单细胞RNA测序识别了与转移相关的分子机制,尤其是在肿瘤和转移细胞状态之间的平衡 | 未深入探讨所有潜在的分子机制,且样本来源于特定的患者衍生模型 | 识别转移过程中,特别是在肿瘤细胞群体形成过程中分子机制 | 乳腺癌患者衍生异种移植物的肿瘤及匹配的肺宏转移 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 (scRNA-Seq) | NA | RNA数据 | 来源于五种转移性乳腺癌模型的样本 |
15708 | 2024-08-07 |
Tobacco smoke exposure recruits inflammatory airspace monocytes that establish permissive lung niches for Mycobacterium tuberculosis
2023-12-06, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.adg3451
PMID:38055798
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研究论文 | 研究烟草烟雾暴露如何通过招募炎症性肺泡单核细胞,为结核分枝杆菌创造允许的肺部环境 | 通过单细胞RNA测序和流式细胞术,识别出与吸烟相关的肺部单核细胞亚群标记物CD93,并揭示了CCR2结合趋化因子在单核细胞招募中的作用 | 研究主要集中在细胞水平,未来研究可以进一步探讨这些细胞在体内对结核分枝杆菌感染的具体影响 | 探讨吸烟如何促进肺部微环境,使其有利于结核分枝杆菌的生长 | 吸烟者和非吸烟者的支气管肺泡灌洗细胞 | 数字病理学 | 结核病 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq), 流式细胞术 | NA | 细胞 | 来自吸烟者和非吸烟者的支气管肺泡灌洗细胞 |
15709 | 2024-08-07 |
Regulating the cell shift of endothelial cell-like myofibroblasts in pulmonary fibrosis
2023-06, The European respiratory journal
DOI:10.1183/13993003.01799-2022
PMID:36758986
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研究论文 | 本研究通过创建新的肺纤维化小鼠模型,发现并证实了正常肺组织中存在一种未知的内皮细胞样肌成纤维细胞,并探讨了其在肺纤维化中的作用及机制 | 首次发现并证实了正常肺组织中的内皮细胞样肌成纤维细胞,并揭示了其在肺纤维化中的作用机制 | NA | 揭示内皮细胞样肌成纤维细胞在肺纤维化中的分化机制,并探索新的治疗策略 | 内皮细胞样肌成纤维细胞及其在肺纤维化中的作用 | NA | 肺纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 小鼠模型及人类肺纤维化样本 |
15710 | 2024-08-05 |
Retracted: Single-Cell Transcriptomics Analysis of the Pathogenesis of Tendon Injury
2023, Oxidative medicine and cellular longevity
DOI:10.1155/2023/9856458
PMID:38189006
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撤回 | 该文章涉及对肌腱损伤发病机制的单细胞转录组学分析 | NA | NA | 研究肌腱损伤的发病机制 | 肌腱损伤的单细胞转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
15711 | 2024-08-05 |
New perspectives on biology, disease progression, and therapy response of head and neck cancer gained from single cell RNA sequencing and spatial transcriptomics
2023, Oncology research
IF:2.0Q3
DOI:10.32604/or.2023.044774
PMID:38188682
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综述 | 本综述探讨了单细胞RNA测序和空间转录组学在头颈癌中的应用 | 通过单细胞RNA测序和空间转录组学的方法,揭示了肿瘤微环境中不同细胞群体之间的异质性和细胞间通信 | 未提及特定的实验或临床数据,可能限制了理论与实际的结合 | 探讨单细胞RNA测序和空间转录组学对头颈癌的认识 | 头颈鳞状细胞癌及其微环境中的细胞类型和相互作用 | 数字病理学 | 头颈癌 | 单细胞RNA测序和空间转录组学 | NA | NA | NA |
15712 | 2024-08-07 |
GAPDH: unveiling its impact as a key hypoxia-related player in head and neck squamous cell carcinoma tumor progression, prognosis, and therapeutic potential
2023, American journal of cancer research
IF:3.6Q2
PMID:38187058
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研究论文 | 本文探讨了糖酵解酶GAPDH在头颈部鳞状细胞癌(HNSCC)中的作用,特别是在不同缺氧条件下的功能和治疗潜力 | 首次详细分析了GAPDH在HNSCC中的表达与患者生存率、免疫细胞浸润及药物疗效的关系 | 研究主要基于现有数据库和细胞系实验,未涉及临床试验验证 | 揭示GAPDH在HNSCC中的生物学功能及其对肿瘤进展、预后和治疗潜力的影响 | GAPDH在HNSCC中的表达及其与缺氧条件的关系 | 数字病理学 | 头颈部鳞状细胞癌 | RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用了来自TCGA、GSE29330、GSE41613和GSE139324等多个数据库的数据 |
15713 | 2024-08-07 |
Comprehensive analysis of senescence-related genes and immune infiltration in intervertebral disc degeneration: a meta-data approach utilizing bulk and single-cell RNA sequencing data
2023, Frontiers in molecular biosciences
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fmolb.2023.1296782
PMID:38187091
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研究论文 | 本研究旨在通过分析大量和单细胞RNA测序数据,识别与椎间盘退变相关的衰老基因及其潜在调控机制 | 本研究通过结合大量和单细胞RNA测序数据,构建了一个基于关键衰老相关差异表达基因和免疫细胞浸润的诊断模型,为椎间盘退变的发病机制和免疫治疗策略提供了新的见解 | NA | 识别与椎间盘退变相关的关键衰老基因及其潜在调控机制 | 椎间盘退变(IDD)的衰老基因和免疫浸润 | 数字病理学 | 脊柱疾病 | RNA测序 | lasso回归 | RNA测序数据 | 涉及GSE34095和GSE70362数据集以及单细胞数据集GSE165722 |
15714 | 2024-08-07 |
The origins and dynamic changes of C3- and S100A10-positive reactive astrocytes after spinal cord injury
2023, Frontiers in cellular neuroscience
IF:4.2Q2
DOI:10.3389/fncel.2023.1276506
PMID:38188669
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研究论文 | 本研究通过转基因小鼠和谱系追踪技术,探讨了脊髓损伤后C3和S100A10阳性反应性星形胶质细胞的起源和动态变化 | 首次详细描述了C3和S100A10阳性反应性星形胶质细胞在脊髓损伤后的起源和动态变化过程 | NA | 确定脊髓损伤后C3和S100A10阳性反应性星形胶质细胞的起源和动态变化 | C3和S100A10阳性反应性星形胶质细胞 | NA | 脊髓损伤 | RNA测序(RNA-seq)、单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | RNA | 幼年和成年脊髓损伤小鼠模型及培养的星形胶质细胞 |
15715 | 2024-08-07 |
Mechanisms of Lymphoma Clearance Induced by High-Dose Alkylating Agents
2019-07, Cancer discovery
IF:29.7Q1
DOI:10.1158/2159-8290.CD-18-1393
PMID:31040105
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研究论文 | 本文探讨了高剂量烷化剂在人类双打击淋巴瘤中清除淋巴瘤的机制 | 发现高剂量烷化剂通过诱导内质网应激,促进巨噬细胞依赖的淋巴瘤清除,这是一种新的机制 | NA | 研究高剂量环磷酰胺在人类双打击淋巴瘤中的作用机制 | 人类双打击淋巴瘤 | NA | 淋巴瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
15716 | 2024-08-07 |
MetaSort untangles metagenome assembly by reducing microbial community complexity
2017-Jan-23, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/ncomms14306
PMID:28112173
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研究论文 | 本文介绍了一种新的实验和生物信息学框架metaSort,用于从微生物组样本中有效构建细菌基因组 | metaSort采用流式细胞术和单细胞测序方法,结合新的计算算法,从排序的迷你微生物组中高效恢复高质量基因组 | NA | 提高从复杂或新颖微生物群落中获取微生物基因组的能力 | 微生物组样本中的细菌基因组 | 生物信息学 | NA | 流式细胞术,单细胞测序 | NA | 基因组数据 | 75个高质量基因组 |
15717 | 2024-08-05 |
PLZF protein forms a complex with protein TET1 to target TCF7L2 in undifferentiated spermatogonia
2024-Feb, Theriogenology
IF:2.4Q1
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研究论文 | 本文探讨了PLZF蛋白作为表观遗传调节因子在不分化精原细胞中的作用 | 本研究建立了新的PLZF&TET1-H3K4me3-TCF7L2轴以及PLZF和EZH2之间的新关联 | NA | 研究PLZF在精原细胞自我更新及维持中的功能 | 不分化精原细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | 基因组数据 | NA |
15718 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptomics analysis of zebrafish brain reveals adverse effects of manganese on neurogenesis
2024-Jan-15, Environmental pollution (Barking, Essex : 1987)
DOI:10.1016/j.envpol.2023.122908
PMID:37952916
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研究论文 | 本文探讨了锰对斑马鱼大脑神经发生的影响及其机制 | 本研究首次揭示了不同浓度锰暴露对斑马鱼大脑神经发生的促进与抑制作用 | 本研究仅在斑马鱼模型中进行,是否适用于其他物种尚未确定 | 研究锰暴露对神经发生影响的具体机制 | 斑马鱼大脑的神经细胞 | 数字病理学 | 帕金森病 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 正常组和锰暴露组的斑马鱼大脑样本 |
15719 | 2024-08-05 |
STOmicsDB: a comprehensive database for spatial transcriptomics data sharing, analysis and visualization
2024-Jan-05, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkad933
PMID:37953328
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研究论文 | 这篇文章介绍了STOmicsDB,一个提供空间转录组数据共享、分析和可视化的综合数据库 | STOmicsDB集成了218个手动筛选的数据集,并提供了可定制的子数据库功能,以增强数据的可重用性和互操作性 | 尚未提及具体的限制 | 旨在促进空间转录组数据的共享和分析 | 规则和分析空间转录组数据集,以揭示细胞类型和空间区域 | 数字病理学 | NA | 空间转录组技术 | NA | 数据集 | 包含218个数据集,代表17种物种 |
15720 | 2024-08-07 |
Author Correction: Spatial transcriptomics uncover sucrose post-phloem transport during maize kernel development
2024-Jan-04, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-44536-w
PMID:38177159
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |