单细胞与空转测序相关文章

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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量
15701 2024-08-07
Single-Cell Transcriptomics Analysis of the Pathogenesis of Tendon Injury
2022, Oxidative medicine and cellular longevity
研究论文 本研究利用单细胞测序数据挖掘,分析了肌腱组织中的细胞组成及其在肌腱修复中的作用 首次揭示了肌腱组织中M1巨噬细胞和T细胞的异质性,及其在肌腱损伤和修复中的不同生理过程 NA 探索肌腱组织的细胞组成及与肌腱修复相关的细胞群体和信号通路 肌腱组织的细胞组成及肌腱修复机制 数字病理学 NA 单细胞测序 NA 基因表达数据 包含七种细胞亚群的肌腱组织样本
15702 2024-08-07
Single-Cell Transcriptional Profiling Reveals Low-Level Tragus Stimulation Improves Sepsis-Induced Myocardial Dysfunction by Promoting M2 Macrophage Polarization
2022, Oxidative medicine and cellular longevity
研究论文 本研究通过单细胞转录组分析揭示了低水平耳屏刺激通过促进M2巨噬细胞极化改善脓毒症引起的心肌功能障碍 首次探讨了低水平耳屏刺激对脓毒症心肌功能障碍的影响及其机制,通过单细胞mRNA测序揭示了心脏细胞景观图 NA 探讨低水平耳屏刺激对脓毒症引起的心肌功能障碍的影响及其机制 脓毒症引起的心肌功能障碍及低水平耳屏刺激的作用 数字病理学 心血管疾病 单细胞mRNA测序 NA mRNA NA
15703 2024-08-05
Single-cell RNA-seq analysis decodes the kidney microenvironment induced by polystyrene microplastics in mice receiving a high-fat diet
2024-Jan-03, Journal of nanobiotechnology IF:10.6Q1
研究论文 本研究揭示了聚苯乙烯微塑料和高脂饮食诱导的小鼠肾脏微环境单细胞转录组特征 首次系统性揭示了聚苯乙烯微塑料和高脂饮食对小鼠肾脏细胞和免疫细胞的分子变化 研究主要基于小鼠模型,可能无法完全反映人类的情况 研究聚苯乙烯微塑料和高脂饮食对小鼠肾脏发展的影响 聚苯乙烯微塑料和高脂饮食对小鼠肾脏微环境的影响 数字病理学 肾脏疾病 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 35天的高脂饮食和继续暴露于聚苯乙烯微塑料的小鼠模型
15704 2024-08-07
HSV1 microRNAs in glioblastoma development: an in silico study
2024-01-02, Scientific reports IF:3.8Q1
研究论文 本研究通过计算方法探讨HSV1编码的microRNAs在胶质母细胞瘤发展中的作用 首次研究HSV1编码的microRNAs在胶质母细胞瘤发展中的作用,并揭示其在肿瘤抑制基因和致癌基因表达调控中的潜在影响 仅通过计算方法进行研究,未进行实验验证 探讨HSV1编码的microRNAs在胶质母细胞瘤发展中的作用及其对肿瘤抑制基因和致癌基因表达的影响 HSV1编码的microRNAs及其在胶质母细胞瘤发展中的作用 数字病理学 脑肿瘤 生物信息学分析 NA 基因表达数据 使用了GSE158284、GSE153679和GSE182109数据集,具体样本数量未详细说明
15705 2024-08-05
The role of ARL4C in predicting prognosis and immunotherapy drug susceptibility in pan-cancer analysis
2023, Frontiers in pharmacology IF:4.4Q1
研究论文 本研究探讨了ARL4C在全癌症分析中的预后预测和免疫治疗药物敏感性中的作用 首次揭示了ARL4C在不同类型癌症中的高表达与预后不良及免疫逃逸之间的关系,并对其在免疫微环境中的作用进行了分析 该研究可能存在样本量限制及ARL4C在特定癌症类型中的具体机制尚不清楚 研究ARL4C在肿瘤预后和免疫治疗药物敏感性中的作用 研究了33种不同类型癌症中ARL4C的表达及其与预后的相关性 数字病理学 NA 免疫组化和免疫荧光染色 NA RNA-seq 23种不同类型癌症的样本
15706 2024-08-07
Transcriptome analysis reveals therapeutic potential of NAMPT in protecting against abdominal aortic aneurysm in human and mouse
2024-Apr, Bioactive materials IF:18.0Q1
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了正常和腹主动脉瘤(AAA)腹主动脉的分子特征,发现AAA中细胞异质性增加,并揭示了NAMPT在保护AAA中的潜在治疗作用。 首次揭示了NAMPT在腹主动脉瘤中的下调及其通过外泌体补充NAMPT的潜在治疗作用。 NA 探索腹主动脉瘤的分子机制及其潜在治疗策略。 人类和小鼠的腹主动脉瘤。 数字病理学 心血管疾病 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 NA
15707 2024-08-07
Single-cell RNA sequencing reveals that the immunosuppression landscape induced by chronic stress promotes colorectal cancer metastasis
2024-Jan-15, Heliyon IF:3.4Q1
研究论文 本研究通过建立慢性不可预测轻度应激(CUMS)和原位结直肠癌的复合小鼠模型,利用10✕Genomics单细胞转录组测序技术,揭示了慢性应激状态下肿瘤免疫细胞趋向于更抑制和耗竭的状态,并描述了整体炎症环境与免疫抑制景观之间的相互作用。 首次揭示了慢性应激诱导的免疫抑制环境促进结直肠癌转移的机制,并提供了针对伴有抑郁症的结直肠癌患者的免疫治疗新策略。 NA 研究慢性应激对结直肠癌免疫微环境的影响及其对肿瘤进展的作用。 慢性应激状态下的小鼠结直肠肿瘤样本。 数字病理学 结直肠癌 单细胞转录组测序 NA 转录组数据 8只小鼠的肿瘤样本,近30,000个细胞
15708 2024-08-05
Exploring the relationship between immune heterogeneity characteristic genes of rheumatoid arthritis and acute myeloid leukemia
2024-Jan-02, Discover. Oncology
研究论文 本研究探讨了类风湿关节炎的免疫异质性特征基因与急性髓系白血病之间的关系 该文章揭示了类风湿关节炎特征基因与急性髓系白血病的关联,提供了肉芽肿标记物的新见解 研究可能受限于获取的数据样本和数据库的限制 旨在通过RA研究发现AML的骨髓生物标志物 研究对象包括类风湿关节炎患者的滑膜转录组数据和急性髓系白血病患者的骨髓测序数据 数字病理学 类风湿关节炎, 急性髓系白血病 单细胞测序, 转录组测序 随机森林分类器 基因组数据 NA
15709 2024-08-05
Single-cell Transcriptomic Analysis Reveals an Immunosuppressive Network Between POSTN CAFs and ACKR1 ECs in TKI-resistant Lung Cancer
2024 Jan-Feb, Cancer genomics & proteomics IF:2.6Q3
研究论文 本研究通过单细胞转录组分析揭示了TKI耐药性肺癌中POSTN CAFs与ACKR1 ECs之间的免疫抑制网络 首次探讨了TKI治疗中血管内皮细胞与癌相关成纤维细胞亚群的关系 未能详细探讨不同CAF和EC亚群在其他癌症中的作用 探讨非小细胞肺癌中TKI治疗耐药的机制 47个不同阶段的非小细胞肺癌组织样本 数字病理学 肺癌 scRNA-seq NA RNA数据 49个晚期非小细胞肺癌样本
15710 2024-08-07
Single-cell RNA sequencing reveals immune microenvironment of small cell lung cancer-associated malignant pleural effusion
2024-Jan, Thoracic cancer IF:2.3Q2
研究论文 本文利用10×基因组单细胞转录组测序技术揭示了小细胞肺癌(SCLC)恶性胸腔积液(MPE)患者的肿瘤免疫微环境特征 首次通过单细胞RNA测序技术详细分析了SCLC相关恶性胸腔积液中的免疫细胞组成和基因表达特征 NA 揭示小细胞肺癌恶性胸腔积液的免疫微环境特征 小细胞肺癌患者的恶性胸腔积液中的免疫细胞和肿瘤细胞 数字病理学 肺癌 单细胞转录组测序 NA 转录组数据 共获得8008个高质量细胞进行后续生物信息学分析
15711 2024-08-07
Identification of basement membrane-related signatures for estimating prognosis, immune infiltration landscape and drug candidates in pancreatic adenocarcinoma
2024, Journal of Cancer IF:3.3Q2
研究论文 本研究通过分析TCGA数据库中的数据,构建了与基底膜(BM)相关的基因风险评分系统,用于评估胰腺腺癌(PAAD)患者的预后、免疫浸润景观和潜在药物候选物 本研究首次开发了一种与基底膜相关的基因签名,为PAAD的诊断、预后评估、候选药物和治疗管理提供了新的见解和靶点 NA 探索基底膜相关基因在评估胰腺腺癌患者预后、微环境和治疗反应中的作用 胰腺腺癌(PAAD)患者 数字病理学 胰腺癌 单变量和LASSO Cox回归分析 NA 基因表达数据 使用TCGA数据库中的数据
15712 2024-08-07
Identification of a PANoptosis-related Gene Signature for Predicting the Prognosis, Tumor Microenvironment and Therapy Response in Breast Cancer
2024, Journal of Cancer IF:3.3Q2
研究论文 本研究通过Cox回归分析、随机森林算法和LASSO算法识别了与PANoptosis相关的基因特征,用于预测乳腺癌的预后、肿瘤微环境和治疗反应 首次构建了基于PANoptosis相关评分的精确预测模型,并揭示了PANoptosis相关基因特征在调节乳腺癌肿瘤微环境和药物敏感性的重要性 NA 探索PANoptosis在乳腺癌中的作用,并开发预测乳腺癌预后和治疗反应的生物标志物 乳腺癌患者的PANoptosis相关基因特征及其对预后、肿瘤微环境和治疗反应的影响 数字病理学 乳腺癌 随机森林算法、LASSO算法、RNA测序 LASSO RNA测序数据 涉及大量RNA和单细胞RNA测序数据
15713 2024-08-05
Tumor cell-intrinsic SETD2 inactivation sensitizes cancer cells to immune checkpoint blockade through the NR2F1-STAT1 pathway
2023-12-06, Journal for immunotherapy of cancer IF:10.3Q1
研究论文 这篇文章探讨了SETD2失活对癌细胞免疫检查点抑制剂敏感性的影响 揭示了SETD2失活通过NR2F1-STAT1通路调节肿瘤免疫,提出了新的潜在治疗生物标志物 研究主要集中在小鼠模型上,尚需进一步验证在人类中的应用 探讨SETD2在免疫治疗中的功能及其对免疫反应的调节 小鼠肿瘤模型,特别是SETD2失活的肿瘤细胞 数字病理学 NA RNA-seq, ATAC-seq, ChIP-seq, 流式细胞术 NA RNA数据,流式细胞术数据 NA
15714 2024-08-07
Targeting integrin α5 in fibroblasts potentiates colorectal cancer response to PD-L1 blockade by affecting extracellular-matrix deposition
2023-12-01, Journal for immunotherapy of cancer IF:10.3Q1
研究论文 本研究探讨了整合素α5在成纤维细胞中的作用,以及其如何通过影响细胞外基质沉积来增强结直肠癌对PD-L1阻断治疗的反应 首次揭示了整合素α5在成纤维细胞中通过影响细胞外基质沉积来调节抗肿瘤免疫的作用,并展示了α5β1抑制与PD-L1阻断联合治疗的疗效 研究样本量较小,仅为29名患者,可能影响结果的普遍性 研究整合素α5在成纤维细胞中的作用及其在结直肠癌免疫治疗中的效果 结直肠癌中的癌症相关成纤维细胞和免疫细胞 数字病理学 结直肠癌 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 29名结直肠癌患者
15715 2024-08-07
Molecular traces of Drosophila hemocytes reveal transcriptomic conservation with vertebrate myeloid cells
2023-Dec, PLoS genetics IF:4.0Q1
研究论文 本研究通过跨物种比较分析,利用单细胞RNA测序数据,探讨了果蝇血细胞与脊椎动物髓系细胞的转录组保守性 首次系统地分析了果蝇血细胞与脊椎动物髓系细胞的转录组保守性,并验证了CG8501(CD59)在果蝇血细胞吞噬作用中的功能 NA 探讨果蝇血细胞与脊椎动物髓系细胞的转录组保守性,以及免疫系统的进化 果蝇血细胞与脊椎动物免疫细胞 生物学 NA 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 具体样本数量未在摘要中提及
15716 2024-08-05
MiR-26a-5p exerts its influence by targeting EP300, a molecule known for its role in activating the PI3K/AKT/mTOR signaling pathway in CD8+tumor-infiltrating lymphocytes of colorectal cancer
2023-Nov-30, Cellular and molecular biology (Noisy-le-Grand, France)
研究论文 本文探讨了miR-26a-5p通过靶向EP300在结直肠癌CD8+肿瘤浸润淋巴细胞中的影响 本研究首次阐明了miR-26a-5p在调节肿瘤浸润T淋巴细胞功能中的作用,并识别EP300为其靶基因 关于miR-26a-5p在肿瘤浸润T淋巴细胞中的作用研究有限,且本研究未提供临床数据支持 旨在了解miR-26a-5p对结直肠癌肿瘤浸润淋巴细胞的影响及其机制 研究对象为结直肠癌患者的肿瘤浸润T淋巴细胞及正常T淋巴细胞 数字病理学 结直肠癌 单细胞测序 NA 生物信息学数据 NA
15717 2024-08-07
High-dimensional single-cell proteomics analysis of esophageal squamous cell carcinoma reveals dynamic alterations of the tumor immune microenvironment after neoadjuvant therapy
2023-11-28, Journal for immunotherapy of cancer IF:10.3Q1
研究论文 本研究通过高维单细胞蛋白质组学分析食管鳞状细胞癌(ESCC)在接受新辅助治疗后的肿瘤免疫微环境动态变化 发现了与新辅助化疗反应相关的CCR4+CCR6+巨噬细胞亚群,并建立了一个基于CCR4/CCR6趋化因子的模型,用于预测ESCC患者对新辅助放化疗联合免疫治疗的反应 NA 揭示新辅助治疗对ESCC肿瘤免疫微环境细胞组成的调节作用,并提出预测治疗反应的模型 食管鳞状细胞癌(ESCC)患者的正常食管黏膜和肿瘤样本 数字病理学 食管癌 质谱流式细胞术,单细胞RNA测序,流式细胞术,免疫组化,免疫荧光分析 NA 单细胞数据,RNA序列数据 6个正常食管黏膜样本和26个肿瘤样本(12个未经治疗,14个接受新辅助治疗)
15718 2024-08-07
Single-cell RNA-sequencing atlas reveals an FABP1-dependent immunosuppressive environment in hepatocellular carcinoma
2023-11-24, Journal for immunotherapy of cancer IF:10.3Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了不同阶段的肝细胞癌组织,揭示了FABP1依赖的免疫抑制环境,并探索了新的治疗策略。 首次对不同阶段的肝细胞癌进行单细胞RNA测序分析,发现FABP1在肿瘤相关巨噬细胞中的过表达及其对肝细胞癌进展的影响,并提出了新的治疗策略。 研究样本量较小,且仅限于特定阶段的肝细胞癌病例,需要进一步扩大样本量和涵盖更多阶段以验证结果的普遍性。 深入理解肝细胞癌的肿瘤微环境,并探索新的治疗靶点和策略。 肝细胞癌的不同阶段组织及其周围的正常组织和免疫细胞。 数字病理学 肝细胞癌 单细胞RNA测序 NA RNA 15个样本,包括3个II期和4个III期肝细胞癌病例的免疫细胞。
15719 2024-08-07
Identification of biomarkers and immune infiltration in acute myocardial infarction and heart failure by integrated analysis
2023-07-26, Bioscience reports IF:3.8Q2
研究论文 本研究通过综合分析方法,鉴定了急性心肌梗死和心力衰竭中的生物标志物和免疫浸润情况 本研究首次通过xCell算法和单细胞RNA测序数据,分析了急性心肌梗死和心力衰竭患者的免疫细胞浸润模式,并验证了相关枢纽基因 NA 旨在分析急性心肌梗死和心力衰竭患者的枢纽基因和免疫浸润情况 急性心肌梗死和心力衰竭患者 数字病理学 心血管疾病 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 使用了来自急性心肌梗死患者的五个公开基因表达数据集
15720 2024-08-07
Intratumoral PPT1-positive macrophages determine immunosuppressive contexture and immunotherapy response in hepatocellular carcinoma
2023-06, Journal for immunotherapy of cancer IF:10.3Q1
研究论文 本研究探讨了肝细胞癌(HCC)中PPT1阳性巨噬细胞对免疫抑制微环境和免疫治疗反应的影响 首次揭示了PPT1阳性巨噬细胞在HCC中的作用,及其对免疫微环境和治疗反应的影响 研究样本仅来自中山医院的169名患者,可能限制了结果的普遍性 识别在HCC发展中起关键作用的巨噬细胞亚群 肝细胞癌(HCC)中的巨噬细胞 数字病理学 肝癌 单细胞RNA测序 NA RNA 169名HCC患者
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