单细胞与空转测序相关文章

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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量
15681 2024-08-05
Metformin potentiates nephrotoxicity by promoting NETosis in response to renal ferroptosis
2023-Oct-17, Cell discovery IF:13.0Q1
研究论文 这篇文章研究了二甲双胍如何通过促进肾脏铁死亡中的中性粒细胞死亡而加剧肾小管损伤。 揭示了二甲双胍加重肾脏损伤的全新机制,强调了铁、铁死亡和中性粒细胞死亡在急性肾损伤中的关系 尚未探讨二甲双胍对不同年龄段患者的影响 探索和阐明二甲双胍对肾功能的影响及其机制 小鼠模型,研究实验性急性肾损伤中的二甲双胍作用 数字病理学 NA 单细胞转录组分析 NA 生物样本数据 涉及多只小鼠
15682 2024-08-07
sciCNV: high-throughput paired profiling of transcriptomes and DNA copy number variations at single-cell resolution
2022-01-17, Briefings in bioinformatics IF:6.8Q1
研究论文 本文介绍了一种高吞吐量的单细胞RNA测序分析流程,能够为单个细胞提供配对的CNV和转录组图谱,从而探索CNV对细胞程序的影响 提出了sciCNV工具,用于从单细胞RNA测序数据中推断单细胞CNV,提高了CNV检测的灵敏度和特异性 NA 研究CNV对细胞功能的影响,并开发新的工具用于单细胞RNA测序数据的分析 单细胞RNA测序数据和CNV 数字病理学 多发性骨髓瘤 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 NA
15683 2024-08-07
Single-Cell Transcriptional Profiling of the Intestinal Epithelium
2020, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
review 本文综述了单细胞转录组学技术在研究小鼠小肠上皮细胞中的应用 单细胞RNA测序(scRNA-seq)技术使得能够在细胞水平上研究异质性生物系统 NA 探讨单细胞转录组学在小鼠小肠上皮细胞研究中的基本原理和实验设计 小鼠小肠上皮细胞 digital pathology NA scRNA-seq NA text NA
15684 2024-08-07
Immunocompetent mouse models revealed that S100A4+ monocytes/macrophages facilitate long-term Zika virus infection in the testes
2024-Dec, Emerging microbes & infections IF:8.4Q1
研究论文 本研究通过使用抗IFNAR抗体阻断的C57BL/6雄性小鼠和hSTAT2敲入雄性小鼠,建立了免疫活性小鼠模型,揭示了S100A4+单核细胞/巨噬细胞在睾丸中促进寨卡病毒长期感染的作用。 本研究首次使用免疫活性小鼠模型,揭示了S100A4+单核细胞/巨噬细胞在寨卡病毒睾丸感染中的关键作用,并提出了寨卡病毒在男性生殖系统中长期感染的新机制。 NA 研究寨卡病毒如何在男性生殖系统中侵入和持续存在。 寨卡病毒在男性生殖系统中的感染机制。 NA NA 单细胞RNA测序 NA RNA 使用抗IFNAR抗体阻断的C57BL/6雄性小鼠和hSTAT2敲入雄性小鼠
15685 2024-08-07
Single-cell RNA Sequencing (scRNA-seq): Advances and Challenges for Cardiovascular Diseases (CVDs)
2024-Feb, Current problems in cardiology IF:3.0Q2
研究论文 本文探讨了单细胞RNA测序(scRNA-seq)在心血管疾病(CVDs)研究中的应用及其带来的挑战 scRNA-seq技术揭示了心脏和血管系统中先前未知的细胞类型及其在不同疾病病理中的相关性 NA 深入理解心血管疾病的基本机制,改进治疗策略和患者风险评估 心血管疾病及其相关细胞类型 数字病理学 心血管疾病 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA RNA序列 NA
15686 2024-08-05
Integrated analysis of necroptosis related gene signature to predict clinical outcomes, immune status and drug sensitivity in lower grade Glioma
2024-Jan-15, Heliyon IF:3.4Q1
研究论文 本研究开发了一种可靠的坏死性凋亡相关基因特征,以预测低级别胶质瘤患者的预后 首次建立了基于坏死性凋亡相关基因的风险评分模型,揭示了其在低级别胶质瘤中的作用 未详细探讨坏死性凋亡在所有低级别胶质瘤中的作用机制 研究坏死性凋亡相关基因在低级别胶质瘤中的预后和免疫状态的影响 低级别胶质瘤患者 数字病理学 低级别胶质瘤 基因表达分析、功能富集分析、共识聚类分析、单细胞测序 风险评分模型 基因表达数据 七个预后机械基因的样本
15687 2024-08-07
StemDriver: a knowledgebase of gene functions for hematopoietic stem cell fate determination
2024-Jan-05, Nucleic acids research IF:16.6Q1
研究论文 StemDriver是一个专注于血液干细胞命运决定中基因功能注释的综合知识库 利用单细胞RNA测序数据成功构建了从血液干细胞初始形成到成熟细胞的全面谱系图,并进行了广泛的基因表达特征探索和表征 NA 构建一个全面的知识库,用于血液干细胞命运决定中基因功能的注释 血液干细胞命运决定中的基因功能 生物信息学 NA 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 涵盖42项研究,包括从胚胎期到成年的14种组织类型,评估了23,839个人类样本基因和29,533个鼠样本基因
15688 2024-08-05
Single-cell transcriptomics reveals ferrimagnetic vortex iron oxide nanoring-mediated mild magnetic hyperthermia exerts antitumor effects by alleviating macrophage suppression in breast cancer
2024-Jan, Biomedicine & pharmacotherapy = Biomedecine & pharmacotherapie
研究论文 该文章探讨了铁氧体旋涡铁氧化物纳米环介导的温和磁热疗法(FVIO-MHT)对乳腺癌肿瘤微环境的影响 本研究利用单细胞转录组测序揭示FVIO-MHT通过改善巨噬细胞的抑制作用来增强抗肿瘤效果 研究未明确揭示FVIO-MHT在其他类型肿瘤微环境中的影响 研究FVIO-MHT在乳腺癌治疗中的潜力及其对肿瘤微环境的影响 主要集中在乳腺癌的肿瘤微环境及巨噬细胞的变化 数字病理学 乳腺癌 单细胞转录组测序 NA NA NA
15689 2024-08-07
Patch-seq: Multimodal Profiling of Single-Cell Morphology, Electrophysiology, and Gene Expression
2024, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
研究论文 本文介绍了Patch-seq技术,该技术结合了全细胞膜片钳记录、免疫组织化学和单细胞RNA测序,用于全面分析单细胞的形态学、电生理学和转录组学特征 Patch-seq技术首次实现了对单细胞多模态特征的综合分析,包括形态学、电生理学和基因表达模式 NA 探索细胞间丰富的多维表型变异,并在单细胞水平上直接关联基因表达与表型 单细胞的形态学、电生理学和基因表达模式 NA NA 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 形态学、电生理学和转录组数据 单个细胞
15690 2024-08-07
Fibroblast subpopulations in Systemic Sclerosis - Functional implications of individual subpopulations and correlations with clinical features
2023-Dec-24, The Journal of investigative dermatology IF:5.7Q1
研究论文 本研究通过整合单细胞RNA测序(scRNA-seq)和批量RNA测序(bulk RNA-seq)数据以及临床信息,探讨了系统性硬化症(SSc)中个体成纤维细胞亚群的作用及其与临床特征的相关性 本研究首次将成纤维细胞亚群的比例纳入机器学习模型,提高了SSc患者皮肤纤维化进展与稳定性的分类准确性 NA 研究系统性硬化症中成纤维细胞亚群的功能及其与临床特征的相关性 系统性硬化症中的成纤维细胞亚群及其与皮肤纤维化的关系 数字病理学 系统性硬化症 单细胞RNA测序(scRNA-seq),批量RNA测序(bulk RNA-seq) 机器学习模型 RNA测序数据 PRESS和GENISOS两个队列的样本
15691 2024-08-07
De novo hematopoiesis from the fetal lung
2023-11-28, Blood advances IF:7.4Q1
研究论文 本文首次证明胎儿肺是HECs的潜在来源,这些HECs具有进行EHT以产生新生HSPCs及其后代的功能能力 首次描述胎儿肺中的HECs,并证明其能进行EHT产生新生HSPCs,为非骨髓造血提供新视角 NA 探索胎儿肺中HECs的存在及其进行EHT的能力 胎儿肺中的HECs及其进行EHT的能力 生物医学 NA scRNA-seq, 流式细胞术, 小分子调制 NA 细胞 小鼠和人类胎儿肺的组织培养
15692 2024-08-07
Elimination of senescent cells by treatment with Navitoclax/ABT263 reverses whole brain irradiation-induced blood-brain barrier disruption in the mouse brain
2023-10, GeroScience IF:5.3Q1
研究论文 本研究测试了全脑照射(WBI)诱导的内皮细胞衰老对血脑屏障(BBB)破坏和微血管稀疏的影响,并通过使用Navitoclax/ABT263消除衰老细胞来逆转这些效应。 本研究首次使用Navitoclax/ABT263消除衰老细胞,以逆转全脑照射诱导的血脑屏障破坏和微血管稀疏。 研究仅在转基因p16-3MR小鼠模型中进行,结果的普遍性和临床应用尚需进一步验证。 测试全脑照射诱导的内皮细胞衰老对血脑屏障破坏和微血管稀疏的影响,并探索消除衰老细胞的治疗方法。 转基因p16-3MR小鼠,接受全脑照射治疗。 NA NA 两光子显微镜、成像流式细胞术、免疫标记和单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 图像 转基因p16-3MR小鼠
15693 2024-08-05
Accelerated cerebromicrovascular senescence contributes to cognitive decline in a mouse model of paclitaxel (Taxol)-induced chemobrain
2023-07, Aging cell IF:8.0Q1
研究论文 本文探讨了紫杉醇诱导的内皮细胞衰老如何导致小鼠认知功能下降的机制 研究首次验证了紫杉醇诱导的内皮衰老与微血管功能障碍之间的因果关系 研究主要在小鼠模型中进行,尚未在临床试验中验证 研究目标是探讨紫杉醇如何通过内皮细胞衰老影响微血管功能并导致认知下降 研究对象为转基因p16-3MR小鼠,允许检测和选择性消除衰老细胞 数字病理学 癌症相关认知损害 流式细胞术和单细胞转录组学 NA 行为测试数据和生理测量数据 PTX处理的转基因小鼠和对照小鼠
15694 2024-08-05
Dicoumarol is an effective post-exposure prophylactic for SARS-CoV-2 Omicron infection in human airway epithelium
2023-06-10, Signal transduction and targeted therapy IF:40.8Q1
研究论文 本研究表明,双香豆素(DCM)对多种Omicron变种的SARS-CoV-2感染具有显著的抗病毒活性 研究揭示了DCM作为一种自然抗凝血剂在抑制SARS-CoV-2的潜在机制,以及其在COVID-19后暴露预防中的有效性 研究未明确DCM对病毒吸收、外排和传播的影响,也未直接消除病毒 探索现有药物在抑制SARS-CoV-2感染中的应用 主要人类气道上皮细胞(AECs) 数字病理学 COVID-19 单细胞测序分析和免疫荧光染色 NA 细胞 77,969个来自10名健康志愿者的细胞
15695 2024-08-05
Spatial transcriptomics in glioblastoma: is knowing the right zip code the key to the next therapeutic breakthrough?
2023, Frontiers in oncology IF:3.5Q2
review 本文探讨了空间转录组学在胶质母细胞瘤研究中的应用 提出空间转录组学为研究胶质母细胞瘤及其周围脑组织的空间组织提供了新视角 仅讨论了当前的研究现状和未来方向,缺乏实证数据支持 研究空间转录组学在胶质母细胞瘤中的应用以理解其空间组织 胶质母细胞瘤及其与周围脑组织的相互作用 数字病理学 胶质瘤 空间转录组学 NA NA NA
15696 2024-08-07
Resistance to PRMT5-targeted therapy in mantle cell lymphoma
2024-Jan-09, Blood advances IF:7.4Q1
研究论文 研究了蛋白精氨酸甲基转移酶5(PRMT5)靶向治疗在套细胞淋巴瘤(MCL)中的抗药性问题 发现mTOR信号通路的激活是PRMT5抑制剂抗药性的关键因素,并验证了mTORC1抑制剂temsirolimus在克服PRMT5抑制剂抗药性中的疗效 研究主要基于细胞系和患者来源的异种移植(PDX)模型,需要进一步的临床试验验证 探讨PRMT5靶向治疗在MCL中的抗药性机制及潜在的克服策略 套细胞淋巴瘤细胞系和患者来源的异种移植模型 NA 淋巴瘤 RNA测序 NA RNA 敏感细胞系4个,初级抗性细胞系4个,抗性PDX模型若干
15697 2024-08-07
Enhanced bone regeneration via endochondral ossification using Exendin-4-modified mesenchymal stem cells
2024-Apr, Bioactive materials IF:18.0Q1
研究论文 本文介绍了一种通过Exendin-4修饰的间充质干细胞促进骨再生的策略 提出了过表达Exendin-4的间充质干细胞在骨重塑中的自分泌和旁分泌功能的作用 未提及具体的临床数据支持 研究通过内软骨骨化促进骨再生的潜力 过表达Exendin-4的间充质干细胞 数字病理学 NA NA NA 单细胞测序数据 在大鼠颅骨缺损模型中使用
15698 2024-08-05
Integrated analysis of single-cell sequencing and weighted co-expression network identifies a novel signature based on cellular senescence-related genes to predict prognosis in glioblastoma
2024-Feb, Environmental toxicology IF:4.4Q1
研究论文 该文章探讨了细胞衰老相关基因在预后预测中的应用,特别是在胶质母细胞瘤中 本研究通过整合单细胞测序和加权共同表达网络分析,识别出一种新的与细胞衰老相关的基因签名,用于预测胶质母细胞瘤的预后 研究限制在于样本可能存在的偏倚及未完全考虑的潜在影响因素 本研究旨在揭示细胞衰老对胶质母细胞瘤患者预后的影响 研究对象为胶质母细胞瘤患者的基因表达和临床数据 数字病理学 胶质母细胞瘤 RNA测序 LASSO回归 基因表达数据 总计选取了150个差异表达基因
15699 2024-08-05
Multidimensional progressive single-cell sequencing reveals cell microenvironment composition and cancer heterogeneity in lung cancer
2024-Feb, Environmental toxicology IF:4.4Q1
研究论文 该文章通过多维逐渐单细胞测序揭示了肺癌的细胞微环境成分和肿瘤异质性。 通过单细胞RNA测序区分了八种不同的细胞类型,揭示了肿瘤微环境的显著肿瘤内异质性,并发现了潜在的预测生物标志物。 文章中未提及具体的研究限制。 研究肺癌细胞微环境的组成和肿瘤异质性。 研究对象为19个不同的肺癌肿瘤样本,分析其细胞类型和基因表达模式。 数字病理学 肺癌 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 19个肺癌肿瘤样本
15700 2024-08-07
Single-cell combined with bulk-RNA data reveal a pattern related to angiogenesis in breast cancer patients: Individualized medicine
2024-Feb, Environmental toxicology IF:4.4Q1
研究论文 本研究利用单细胞和批量RNA测序数据,揭示了与乳腺癌患者血管生成相关的模式,并构建了个性化治疗模型。 本研究首次综合单细胞和批量RNA测序数据,通过随机森林生存分析构建了预测模型,并在外部验证集中进行了验证。 研究主要集中在三阴性乳腺癌患者,可能不适用于所有乳腺癌亚型。 揭示乳腺癌患者血管生成的相关模式,并构建个性化治疗模型。 乳腺癌患者的RNA测序数据和生存数据。 数字病理学 乳腺癌 RNA测序 随机森林 RNA测序数据 1082名乳腺癌患者
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