单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27474 篇文献，本页显示第 15681 - 15700 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 15681 | 2024-08-05 |
New perspectives on biology, disease progression, and therapy response of head and neck cancer gained from single cell RNA sequencing and spatial transcriptomics
2023, Oncology research
IF:2.0Q3
DOI:10.32604/or.2023.044774
PMID:38188682
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综述 | 本综述探讨了单细胞RNA测序和空间转录组学在头颈癌中的应用 | 通过单细胞RNA测序和空间转录组学的方法，揭示了肿瘤微环境中不同细胞群体之间的异质性和细胞间通信 | 未提及特定的实验或临床数据，可能限制了理论与实际的结合 | 探讨单细胞RNA测序和空间转录组学对头颈癌的认识 | 头颈鳞状细胞癌及其微环境中的细胞类型和相互作用 | 数字病理学 | 头颈癌 | 单细胞RNA测序和空间转录组学 | NA | NA | NA |
| 15682 | 2024-08-07 |
GAPDH: unveiling its impact as a key hypoxia-related player in head and neck squamous cell carcinoma tumor progression, prognosis, and therapeutic potential
2023, American journal of cancer research
IF:3.6Q2
PMID:38187058
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研究论文 | 本文探讨了糖酵解酶GAPDH在头颈部鳞状细胞癌（HNSCC）中的作用，特别是在不同缺氧条件下的功能和治疗潜力 | 首次详细分析了GAPDH在HNSCC中的表达与患者生存率、免疫细胞浸润及药物疗效的关系 | 研究主要基于现有数据库和细胞系实验，未涉及临床试验验证 | 揭示GAPDH在HNSCC中的生物学功能及其对肿瘤进展、预后和治疗潜力的影响 | GAPDH在HNSCC中的表达及其与缺氧条件的关系 | 数字病理学 | 头颈部鳞状细胞癌 | RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用了来自TCGA、GSE29330、GSE41613和GSE139324等多个数据库的数据 |
| 15683 | 2024-08-07 |
Comprehensive analysis of senescence-related genes and immune infiltration in intervertebral disc degeneration: a meta-data approach utilizing bulk and single-cell RNA sequencing data
2023, Frontiers in molecular biosciences
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fmolb.2023.1296782
PMID:38187091
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研究论文 | 本研究旨在通过分析大量和单细胞RNA测序数据，识别与椎间盘退变相关的衰老基因及其潜在调控机制 | 本研究通过结合大量和单细胞RNA测序数据，构建了一个基于关键衰老相关差异表达基因和免疫细胞浸润的诊断模型，为椎间盘退变的发病机制和免疫治疗策略提供了新的见解 | NA | 识别与椎间盘退变相关的关键衰老基因及其潜在调控机制 | 椎间盘退变（IDD）的衰老基因和免疫浸润 | 数字病理学 | 脊柱疾病 | RNA测序 | lasso回归 | RNA测序数据 | 涉及GSE34095和GSE70362数据集以及单细胞数据集GSE165722 |
| 15684 | 2024-08-07 |
The origins and dynamic changes of C3- and S100A10-positive reactive astrocytes after spinal cord injury
2023, Frontiers in cellular neuroscience
IF:4.2Q2
DOI:10.3389/fncel.2023.1276506
PMID:38188669
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研究论文 | 本研究通过转基因小鼠和谱系追踪技术，探讨了脊髓损伤后C3和S100A10阳性反应性星形胶质细胞的起源和动态变化 | 首次详细描述了C3和S100A10阳性反应性星形胶质细胞在脊髓损伤后的起源和动态变化过程 | NA | 确定脊髓损伤后C3和S100A10阳性反应性星形胶质细胞的起源和动态变化 | C3和S100A10阳性反应性星形胶质细胞 | NA | 脊髓损伤 | RNA测序（RNA-seq）、单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 幼年和成年脊髓损伤小鼠模型及培养的星形胶质细胞 |
| 15685 | 2024-08-07 |
Mechanisms of Lymphoma Clearance Induced by High-Dose Alkylating Agents
2019-07, Cancer discovery
IF:29.7Q1
DOI:10.1158/2159-8290.CD-18-1393
PMID:31040105
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研究论文 | 本文探讨了高剂量烷化剂在人类双打击淋巴瘤中清除淋巴瘤的机制 | 发现高剂量烷化剂通过诱导内质网应激，促进巨噬细胞依赖的淋巴瘤清除，这是一种新的机制 | NA | 研究高剂量环磷酰胺在人类双打击淋巴瘤中的作用机制 | 人类双打击淋巴瘤 | NA | 淋巴瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 15686 | 2024-08-07 |
MetaSort untangles metagenome assembly by reducing microbial community complexity
2017-Jan-23, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/ncomms14306
PMID:28112173
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研究论文 | 本文介绍了一种新的实验和生物信息学框架metaSort，用于从微生物组样本中有效构建细菌基因组 | metaSort采用流式细胞术和单细胞测序方法，结合新的计算算法，从排序的迷你微生物组中高效恢复高质量基因组 | NA | 提高从复杂或新颖微生物群落中获取微生物基因组的能力 | 微生物组样本中的细菌基因组 | 生物信息学 | NA | 流式细胞术，单细胞测序 | NA | 基因组数据 | 75个高质量基因组 |
| 15687 | 2024-08-05 |
PLZF protein forms a complex with protein TET1 to target TCF7L2 in undifferentiated spermatogonia
2024-Feb, Theriogenology
IF:2.4Q1
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研究论文 | 本文探讨了PLZF蛋白作为表观遗传调节因子在不分化精原细胞中的作用 | 本研究建立了新的PLZF&TET1-H3K4me3-TCF7L2轴以及PLZF和EZH2之间的新关联 | NA | 研究PLZF在精原细胞自我更新及维持中的功能 | 不分化精原细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | 基因组数据 | NA |
| 15688 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptomics analysis of zebrafish brain reveals adverse effects of manganese on neurogenesis
2024-Jan-15, Environmental pollution (Barking, Essex : 1987)
DOI:10.1016/j.envpol.2023.122908
PMID:37952916
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研究论文 | 本文探讨了锰对斑马鱼大脑神经发生的影响及其机制 | 本研究首次揭示了不同浓度锰暴露对斑马鱼大脑神经发生的促进与抑制作用 | 本研究仅在斑马鱼模型中进行，是否适用于其他物种尚未确定 | 研究锰暴露对神经发生影响的具体机制 | 斑马鱼大脑的神经细胞 | 数字病理学 | 帕金森病 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 正常组和锰暴露组的斑马鱼大脑样本 |
| 15689 | 2024-08-05 |
STOmicsDB: a comprehensive database for spatial transcriptomics data sharing, analysis and visualization
2024-Jan-05, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkad933
PMID:37953328
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研究论文 | 这篇文章介绍了STOmicsDB，一个提供空间转录组数据共享、分析和可视化的综合数据库 | STOmicsDB集成了218个手动筛选的数据集，并提供了可定制的子数据库功能，以增强数据的可重用性和互操作性 | 尚未提及具体的限制 | 旨在促进空间转录组数据的共享和分析 | 规则和分析空间转录组数据集，以揭示细胞类型和空间区域 | 数字病理学 | NA | 空间转录组技术 | NA | 数据集 | 包含218个数据集，代表17种物种 |
| 15690 | 2024-08-07 |
Author Correction: Spatial transcriptomics uncover sucrose post-phloem transport during maize kernel development
2024-Jan-04, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-44536-w
PMID:38177159
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 15691 | 2024-08-05 |
ITGB4 upregulation is associated with progression of lower grade glioma
2024-01-03, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-023-49801-y
PMID:38172503
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研究论文 | 研究表明ITGB4在低级别神经胶质瘤中上调，并且能准确预测其预后 | ITGB4被发现是一个良好预测低级别神经胶质瘤预后的风险因素，并且与免疫相关基因密切相关 | 该研究未详细探讨ITGB4在神经胶质瘤中的具体机制 | 揭示ITGB4在低级别神经胶质瘤中的作用和其与预后的关系 | 研究对象为低级别神经胶质瘤患者及其肿瘤组织样本 | 数字病理学 | 神经胶质瘤 | 免疫组化分析、单细胞测序分析、非负矩阵分解聚类分析 | Cox回归模型 | 肿瘤组织样本 | 研究中涉及的样本数量未明确说明 |
| 15692 | 2024-08-07 |
Predicting cell types with supervised contrastive learning on cells and their types
2024-01-03, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-023-50185-2
PMID:38172501
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研究论文 | 本文提出了一种基于监督对比学习的细胞类型注释新模型SCLSC，用于单细胞RNA测序数据的细胞类型预测 | SCLSC模型采用实例-类型对的对比学习方法，不同于以往实例-实例对的对比学习，提高了细胞类型预测的准确性 | NA | 提高单细胞RNA测序数据中细胞类型注释的准确性和效率 | 单细胞RNA测序数据中的细胞类型 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 监督对比学习 | 基因表达数据 | 大量细胞 |
| 15693 | 2024-08-05 |
Upregulated PPP1R14B is connected to cancer progression and immune infiltration in kidney renal clear cell carcinoma
2024-Jan, Clinical & translational oncology : official publication of the Federation of Spanish Oncology Societies and of the National Cancer Institute of Mexico
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12094-023-03228-z
PMID:37261660
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研究论文 | 本研究探讨了PPP1R14B在肾透明细胞癌中的预后和发展作用 | 发现PPP1R14B在KIRC中上调并作为独立风险因素，与肿瘤浸润免疫细胞相关 | 研究仅基于TCGA和ICGC队列，未包括不同患者群体的样本 | 确定PPP1R14B是否可以作为KIRC的预后生物标志物 | 肾透明细胞癌(KIRC)患者的样本 | 数字病理学 | 肾癌 | RNA-seq | NA | 生物样本 | 使用了TCGA和ICGC队列中的患者样本及我们的临床样本 |
| 15694 | 2024-08-07 |
Computational identification of key transcription factors for embryonic and postnatal Sox2+ dental epithelial stem cell
2023-Dec-23, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.12.22.573158
PMID:38187542
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研究论文 | 本文通过计算方法识别了胚胎期和出生后Sox2+牙上皮干细胞的关键转录因子 | 利用Smart-Seq2协议和ATAC-seq协议生成P2牙上皮干细胞的转录组和染色质可及性图谱，并系统地识别了E11.5细胞和P2细胞的关键转录因子 | 由于DESC标记物的表达水平过低或DESC在整体牙齿中的比例过低，之前的单细胞RNA测序实验未能明确识别出DESC集群 | 研究牙上皮干细胞的基因表达和染色质可及性特征，以识别关键转录因子 | 胚胎期和出生后Sox2+牙上皮干细胞 | NA | NA | Smart-Seq2, ATAC-seq | NA | 转录组, 染色质可及性图谱 | E11.5 Sox2+牙上皮细胞和P2牙上皮干细胞 |
| 15695 | 2024-08-07 |
Transcriptomic Landscape of Prurigo Nodularis Lesional Skin CD3+ T Cells Using Single-Cell RNA Sequencing
2023-12, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2023.05.011
PMID:37263486
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 15696 | 2024-08-05 |
Spatial transcriptomics uncover sucrose post-phloem transport during maize kernel development
2023-11-08, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-43006-7
PMID:37938556
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研究论文 | 本研究通过空间转录组学揭示了玉米籽粒发育过程中蔗糖的后韧运输 | 首次利用空间转录组学分析玉米籽粒发育阶段，识别了11个细胞群体和332个分子标记基因 | 本研究主要集中于玉米籽粒的特定时段，可能无法概括其他发育阶段 | 揭示玉米籽粒中各细胞群体的基因表达及其功能 | 玉米籽粒的母体组织、后代胚胎和后代胚乳 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 15697 | 2024-08-05 |
Human neural stem cells restore spatial memory in a transgenic Alzheimer's disease mouse model by an immunomodulating mechanism
2023-Nov-04, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.11.01.565161
PMID:37961246
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研究论文 | 这篇文章研究了人类神经干细胞在转基因阿尔茨海默病小鼠模型中恢复空间记忆的作用机制 | 首次使用空间转录组学阐明人类神经干细胞在阿尔茨海默病中的治疗机制 | 未能观察到淀粉样斑块负担的变化，可能影响结果的解读 | 探讨人类神经干细胞在阿尔茨海默病治疗中的作用及其机制 | 人类神经干细胞和5XFAD小鼠模型 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 5XFAD小鼠模型 |
| 15698 | 2024-08-07 |
Human B-cell subset identification and changes in inflammatory diseases
2022-12-31, Clinical and experimental immunology
IF:3.4Q3
DOI:10.1093/cei/uxac104
PMID:36617261
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综述 | 本文综述了人类血液中B细胞亚群的识别及其在炎症疾病中的变化 | 利用高维表型工具如质谱流式细胞术和单细胞RNA测序揭示了先前被认为是均质的B细胞群体的异质性 | 关于B细胞亚群的识别和命名仍存在不确定性和研究间的差异 | 探讨人类血液中常见的B细胞亚群及其在炎症和自身免疫疾病中的频率和功能变化 | 人类血液中的B细胞亚群及其在炎症疾病中的变化 | NA | 炎症疾病 | 质谱流式细胞术, 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | NA |
| 15699 | 2024-08-07 |
Singling out motor neurons in the age of single-cell transcriptomics
2022-09, Trends in genetics : TIG
IF:13.6Q1
DOI:10.1016/j.tig.2022.03.016
PMID:35487823
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research paper | 本文讨论了利用单细胞转录组学技术揭示成年动物运动神经元内在异质性的新兴技术及其对疾病和脊髓损伤的潜在影响 | 利用高吞吐量的单细胞转录组学技术，快速分离和分析运动神经元核，揭示了骨骼和自主神经系统的显著转录多样性 | NA | 定义成年运动系统中运动神经元的异质性，并探讨其对疾病和脊髓损伤的影响 | 运动神经元的异质性及其在健康和退化状态下的特性 | digital pathology | neuromuscular disease | single-cell transcriptomics | NA | transcriptomic data | NA |
| 15700 | 2024-08-07 |
Expression Profile of Inflammation Response Genes and Potential Regulatory Mechanisms in Dilated Cardiomyopathy
2022, Oxidative medicine and cellular longevity
DOI:10.1155/2022/1051652
PMID:36035223
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研究论文 | 本研究分析了扩张型心肌病（DCM）中的炎症反应基因表达谱及其潜在调控机制 | 首次详细描述了DCM中炎症反应基因的表达情况及其调控机制，包括转录因子和非编码RNA的调控网络 | 研究样本量相对较小，可能影响结果的普遍性 | 探讨DCM中炎症反应基因的表达及其调控机制 | DCM患者和健康对照组的单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 27,665个细胞样本，包括4个DCM样本和2个健康对照样本；166个DCM患者和166个健康对照的批量测序数据 |