单细胞与空转测序相关文章

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当前共找到 27536 篇文献,本页显示第 15641 - 15660 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量
15641 2024-08-07
A neuroepithelial wave of BMP signalling drives anteroposterior specification of the tuberal hypothalamus
2023-02-10, eLife IF:6.4Q1
研究论文 本研究结合实验和生物信息学方法,探讨了胚胎期鸡的管状下丘脑前-后方向的生成机制 首次揭示了神经上皮来源的BMP信号波在胚胎发育中驱动管状下丘脑前-后方向特化的过程 NA 阐明管状下丘脑在胚胎发育中的细胞和信号通路特化机制 管状下丘脑的生成过程及其调控机制 NA NA scRNA-Seq NA 基因表达数据 胚胎期鸡
15642 2024-08-07
Development and Optimization of a Prognostic Model Associated with Stemness Genes in Hepatocellular Carcinoma
2022, BioMed research international IF:2.6Q3
研究论文 本研究旨在开发一种基于干细胞相关基因的预测模型,用于评估肝细胞癌(HCC)患者的预后,以优化治疗方案 本研究通过单细胞测序数据筛选与干细胞相关的差异表达基因,并利用LASSO回归分析构建了一个包含18个干细胞相关基因的预测模型,该模型能有效预测HCC患者的总体生存率 NA 开发和优化与干细胞基因相关的肝细胞癌预后模型 肝细胞癌(HCC)患者的预后评估 数字病理学 肝癌 单细胞测序 LASSO回归 基因表达数据 使用了TCGA和GSE14520两个队列的数据
15643 2024-08-05
Single-cell multi-omics in the study of digestive system cancers
2024-Dec, Computational and structural biotechnology journal IF:4.4Q2
review 本文全面回顾了单细胞组学技术在消化系统癌症研究中的进展 文章创新性地总结了单细胞多组学技术在消化系统肿瘤研究中的应用及其未来发展趋势 文章未提及具体的实验数据或样本量 研究消化系统癌症的单细胞组学技术的应用 消化系统癌症 数字病理学 消化系统癌症 单细胞测序 NA NA NA
15644 2024-08-07
T proliferating cells derived autophagy signature associated with prognosis and immunotherapy resistance in a pan-cancer analysis
2024-Jan-19, iScience IF:4.6Q1
研究论文 本研究通过手动整理自噬基因集,并在TCGA队列中比较恶性组织和正常组织,定义了一个泛癌自噬特征,该特征源自T增殖细胞,并通过多个单细胞RNA测序数据集进行验证 首次揭示了泛癌自噬特征与免疫治疗抵抗和预后之间的关系,并探讨了其在肿瘤微环境中的细胞间相互作用 NA 探讨自噬特征在泛癌中的免疫治疗预测作用及其机制调控 泛癌自噬特征及其与免疫治疗抵抗和预后的关联 数字病理学 NA 单细胞RNA测序 NA 转录组和蛋白质组数据 涉及转移性肾细胞癌、非小细胞肺癌、膀胱癌和黑色素瘤等多个队列
15645 2024-08-07
Expression of PD-1 mitigates phagocytic activities TAM in osteosarcoma
2024-Jan-15, Heliyon IF:3.4Q1
研究论文 本研究探讨了程序性死亡1(PD-1)在肿瘤相关巨噬细胞(TAMs)中的表达及其对骨肉瘤(OS)转移的影响 首次揭示了PD-1在TAMs中的表达抑制其吞噬能力,从而促进骨肉瘤转移的机制 NA 研究PD-1在TAMs中的表达对骨肉瘤转移的影响及其机制 骨肉瘤肺转移中的肿瘤相关巨噬细胞(TAMs)和肿瘤浸润淋巴细胞(TILs) 数字病理学 骨肉瘤 单细胞RNA测序(scRNA-Seq) NA 单细胞RNA测序数据 15500个来自人骨肉瘤肺转移病变的单个细胞
15646 2024-08-05
What role does GPR65 play in the progression of osteosarcoma? Its mechanism and clinical significance
2024-Jan-13, Cancer cell international IF:5.3Q1
研究论文 本研究旨在探讨GPR65在骨肉瘤的微环境、增殖及迁移中的作用 首次阐明GPR65在骨肉瘤发展中的作用及其机制,强调其作为预后生物标志物的潜力 研究样本均为术后标本,可能影响结果的普适性 探索GPR65在骨肉瘤进展中的机制及其临床意义 97名骨肉瘤患者的转录组数据及六个术后标本的单细胞测序数据 数字病理学 骨肉瘤 RNA-seq, 单细胞测序 NA 生物样本数据 97名骨肉瘤患者和六个手术标本
15647 2024-08-05
BIDCell: Biologically-informed self-supervised learning for segmentation of subcellular spatial transcriptomics data
2024-Jan-13, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本研究提出了一种名为BIDCell的自监督深度学习框架,用于亚细胞空间转录组数据的分割 BIDCell引入了生物学启发的损失函数,通过学习空间分布的基因表达与细胞形态之间的关系,克服了传统方法在细胞分割中的挑战 未提及具体的局限性 提高单细胞空间表达分析的精确度 使用来自公共库的单细胞转录组数据和细胞形态信息进行细胞分割 数字病理学 NA 自监督深度学习 NA 空间转录组数据 NA
15648 2024-08-05
Zhilong Huoxue Tongyu capsule alleviates myocardial fibrosis by improving endothelial cell dysfunction
2024-Jan, Journal of traditional and complementary medicine IF:3.3Q1
研究论文 该论文研究了智龙活血通瘀胶囊对心肌纤维化中内皮细胞功能障碍的影响 首次提供了智龙活血通瘀胶囊通过调节内皮-间质转化和MHC-II表达来改善心肌纤维化的证据 缺乏对长期疗效和作用机制的深入探讨 研究智龙活血通瘀胶囊对心肌纤维化中内皮细胞功能障碍的治疗效果 心肌纤维化过程中受到影响的内皮细胞 数字病理学 心血管疾病 免疫荧光染色、组织染色 小鼠模型 生物标志物、心脏超声波和组织学数据 使用异丙肾上腺素注射建立的小鼠模型
15649 2024-08-07
Single-cell transcriptomes of kidneys in a 6-month-old boy with Denys-Drash syndrome reveal stromal cell heterogeneity in the tumor microenvironment
2024-Jan, Clinical kidney journal IF:3.9Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序探索了Denys-Drash综合征患者肾脏组织中的细胞异质性 发现了一个新的WT1基因突变,并通过单细胞RNA测序揭示了Wilms肿瘤和肾脏组织中的细胞成分异质性 NA 探索Denys-Drash综合征患者肾脏组织中的细胞成分和相互作用 Denys-Drash综合征患者的肾脏组织 数字病理学 肾母细胞瘤 单细胞RNA测序 NA 转录组 31,135个细胞
15650 2024-08-07
Multi-context genetic modeling of transcriptional regulation resolves novel disease loci
2022-09-28, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本文介绍了一种名为CONTENT的新方法,该方法利用多上下文表达研究中的个体内部相关性,通过跨上下文的错误发现校正提高功率,并生成上下文特定和上下文共享的表达成分。 CONTENT方法通过利用跨上下文的相关结构,提高了遗传预测基因的数量,并在转录组关联研究中增加了位点-表型关联的发现数量。 NA 提高转录组关联研究(TWAS)的解释和发现与复杂性状相关基因的能力。 多组织和单细胞RNA-seq数据集。 基因组学 NA RNA-seq NA 基因表达数据 涉及多组织和单细胞数据集,具体样本数量未详细说明。
15651 2024-08-07
Spatial transcriptomic reconstruction of the mouse olfactory glomerular map suggests principles of odor processing
2022-04, Nature neuroscience IF:21.2Q1
research paper 本研究利用单细胞RNA测序、空间转录组学和机器学习技术,生成了小鼠嗅球中大多数glomeruli位置的地图 本研究首次生成了小鼠嗅球中大多数glomeruli位置的详细地图,并提出了可能的组织原则,有助于大脑进行气味解码 研究仅限于小鼠嗅球中的glomeruli位置,未涉及其他物种或更广泛的嗅觉系统功能 探究小鼠嗅球中glomeruli位置与气味辨别之间的关系 小鼠嗅球中的glomeruli位置及其在气味处理中的作用 生物信息学 NA 单细胞RNA测序, 空间转录组学 机器学习 转录组数据 未具体说明样本数量
15652 2024-08-05
Single-Cell RNA Sequencing Technology Landscape in 2023
2024-Jan-13, Stem cells (Dayton, Ohio)
综述 本文概述了2023年单细胞RNA测序技术的发展与应用 提出了多种单细胞RNA测序技术的比较及其在干细胞研究中的重要性 未具体讨论各技术在不同实验场景下的优缺点 提供单细胞RNA测序技术的全景视图及其在细胞生物学和疾病机制研究中的应用 单细胞RNA测序(scRNA-seq)和单核RNA测序(snRNA-seq)技术 数字病理学 NA RNA测序 NA NA NA
15653 2024-08-05
Update on Biomarkers in Renal Cell Carcinoma
2024-Jan, American Society of Clinical Oncology educational book. American Society of Clinical Oncology. Annual Meeting
研究论文 该文章更新了肾细胞癌生物标志物的相关进展 本文创新性地探索了宿主因素及其对免疫系统的深入特征化,并提出了新技术以克服现有技术面临的挑战 尽管对肿瘤内在特征进行了广泛研究,但尚未提供明确和可靠的预测生物标志物 本文旨在识别能够预测治疗反应和耐药性的生物标志物 研究对象主要是肾细胞癌及其相关的生物标志物 肿瘤病理学 肾癌 NA NA NA NA
15654 2024-08-07
A proteome-wide screen identifies the calcium binding proteins, S100A8/S100A9, as clinically relevant therapeutic targets in aortic dissection
2024-Jan, Pharmacological research IF:9.1Q1
研究论文 本研究通过蛋白质组学分析,发现钙结合蛋白S100A8/S100A9在主动脉夹层中作为新的治疗靶点 首次确定S100A8/S100A9作为主动脉夹层的治疗靶点,并通过药物ABR-25757验证其安全性和有效性 NA 发现主动脉夹层的新治疗靶点 主动脉夹层患者和对照组的升主动脉样本 心血管疾病 主动脉夹层 蛋白质组学分析 NA 蛋白质数据 NA
15655 2024-08-05
Pancancer analysis reveals the role of disulfidptosis in predicting prognosis, immune infiltration and immunotherapy response in tumors
2023-Dec-29, Medicine IF:1.3Q2
研究论文 本研究构建了多组学数据分析,揭示了二硫化死亡在肿瘤中的作用。 提出了二硫化死亡作为癌症治疗的新策略,并系统分析了其在多种肿瘤中的作用。 样本规模和数据库选择可能影响结果的普遍性。 探讨二硫化死亡在预测肿瘤预后、免疫浸润和免疫治疗反应中的作用。 33种肿瘤的数据以及与二硫化死亡相关的基因。 数字病理学 NA 多组学数据分析 NA 基因表达数据 33种肿瘤
15656 2024-08-05
Neural tube-associated boundary caps are a major source of mural cells in the skin
2023-Dec-14, eLife IF:6.4Q1
研究论文 本文研究了神经管相关的边界帽细胞在皮肤血管中作为重要的壁细胞来源的作用 揭示了边界帽细胞衍生物的多样性及其在小鼠皮肤中的壁细胞来源的潜力 研究主要基于小鼠模型,结果的普遍适用性仍需进一步验证 探讨边界帽细胞在皮肤血管发育中的作用 小鼠中的边界帽细胞衍生物 NA NA Cre基础报告细胞追踪和单细胞转录组学 NA NA 小鼠模型中涉及的数量未具体说明
15657 2024-08-07
Multimodal single-cell datasets characterize antigen-specific CD8+ T cells across SARS-CoV-2 vaccination and infection
2023-Oct, Nature immunology IF:27.7Q1
研究论文 本研究利用多模态测序技术对mRNA疫苗BNT162b2接种前后循环人白细胞进行纵向分析,以表征和量化T细胞反应 本研究定义了CD8 T细胞的转录组、可及染色质景观和免疫表型,并识别了每种模态中的独特生物标志物 NA 研究SARS-CoV-2感染或疫苗接种后抗原特异性CD8+ T细胞的特征 SARS-CoV-2疫苗接种和感染后的抗原特异性CD8+ T细胞 数字病理学 COVID-19 多模态测序技术 NA 单细胞RNA测序数据 接种mRNA疫苗BNT162b2前后收集的循环人白细胞样本
15658 2024-08-05
Potential to Enhance Large Scale Molecular Assessments of Skin Photoaging through Virtual Inference of Spatial Transcriptomics from Routine Staining
2023-Jul-31, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文探讨了如何通过常规染色法推断空间转录组学信息,以增强皮肤光老化的大规模分子评估 提出了一种利用常规H&E染色切片推断空间转录组学信息的新方法,以提高评估光老化的可靠性 使用最先进的空间转录组学技术成本高,且不同患者间存在变异性,限制了大规模分子流行病学研究的范围 研究空间转录组学在皮肤光老化评估中的应用潜力 分析261个皮肤标本中4位患者的基底细胞和鳞状细胞肿瘤切片 数字病理学 皮肤癌 空间转录组学 机器学习模型 基因表达数据 261个皮肤标本,分析4位患者的切片
15659 2024-08-05
Single-cell transcriptomics uncovers cellular architecture and developmental trajectories in hepatoblastoma
2023-06-01, Hepatology (Baltimore, Md.)
研究论文 本研究揭示了肝母细胞瘤的细胞结构和发育轨迹 利用单细胞转录组分析,建立了肝母细胞瘤的细胞层级和亚型分类方法 基于仅五名患者的样本,样本量较小 探讨肝母细胞瘤的肿瘤发生机制及其异质性 肝母细胞瘤患者的肿瘤及配对远端肝组织样本 数字病理学 肝母细胞瘤 单细胞转录组测序 NA 转录组数据 五名肝母细胞瘤患者的样本
15660 2024-08-05
Single-cell sequencing dissects the transcriptional identity of activated fibroblasts and identifies novel persistent distal tubular injury patterns in kidney fibrosis
2023-May-17, Research square
研究论文 该研究通过单细胞转录组分析揭示了肾纤维化中活化成纤维细胞的转录特征,并识别了新的持久远端小管损伤模式 首次确定了三种具有特定转录特征的成纤维细胞簇,并识别了肾小管损伤的新空间模式 研究未提及样本数量及其具体来源 深入理解肾纤维化的分子机制和促进靶向策略的开发 分析了两种与临床相关的肾纤维化模型中的单细胞转录组特征 数字病理学 慢性肾病 单细胞转录组测序 NA 转录组数据 NA
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