单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
15601	2024-08-07	Adversarial domain translation networks for integrating large-scale atlas-level single-cell datasets 2022-May, Nature computational science IF:12.0Q1 DOI:10.1038/s43588-022-00251-y PMID:38177826	研究论文	本文介绍了一种名为Portal的统一框架，利用对抗域翻译网络来学习大规模图谱级别单细胞RNA-seq数据集的协调表示	Portal框架在集成过程中能更好地保留生物变异，且在低内存消耗下快速集成数百万个细胞	NA	开发一种能够有效集成和协调大规模单细胞RNA-seq数据集的方法	大规模图谱级别的单细胞RNA-seq数据集	机器学习	NA	单细胞RNA测序	对抗域翻译网络	单细胞RNA-seq数据	数百万个细胞
15602	2024-08-07	Mechanotherapy Reprograms Aged Muscle Stromal Cells to Remodel the Extracellular Matrix during Recovery from Disuse 2022, Function (Oxford, England) DOI:10.1093/function/zqac015 PMID:35434632	研究论文	研究探讨了机械疗法在老年肌肉恢复期间对细胞外基质（ECM）重塑的影响	首次通过单细胞RNA测序分析了机械疗法对老年肌肉恢复期间ECM重塑的影响，并验证了其效果	研究仅限于实验动物模型，尚未在人体中验证	探究机械疗法是否能促进老年肌肉在废用性萎缩恢复期间的ECM重塑	老年和成年大鼠的腓肠肌在废用性萎缩恢复期间的细胞	NA	NA	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	基因表达数据	成年和老年大鼠的腓肠肌细胞
15603	2024-08-05	ImmunoPET imaging of Trop2 expression in solid tumors with nanobody tracers 2024-Jan, European journal of nuclear medicine and molecular imaging IF:8.6Q1 DOI:10.1007/s00259-023-06454-3 PMID:37792026	研究论文	本文研究了使用纳米抗体探针在固体肿瘤中进行Trop2表达的免疫正电子发射成像（immunoPET）	构建了特异性针对Trop2的免疫PET探针，并评估了其在前临床胰腺癌和胃癌模型中的诊断能力	文中未提及样本量的具体大小及其对结果的影响	评估Trop2在胰腺癌和胃癌中的表达及其作为靶向治疗的潜力	胰腺癌细胞系及其相关患者来源的胃癌模型	数字病理学	胰腺癌，胃癌	免疫正电子发射成像（immunoPET）	NA	组织微阵列，单细胞测序	未明确提及具体样本量
15604	2024-08-07	Altered bile acid metabolism in skin tissues in response to ionizing radiation: deoxycholic acid (DCA) as a novel treatment for radiogenic skin injury 2024, International journal of radiation biology IF:2.1Q2 DOI:10.1080/09553002.2023.2245461 PMID:37540505	研究论文	研究放射性皮肤损伤（RSI）中胆汁酸（BAs）及其衍生物的代谢变化，并探讨去氧胆酸（DCA）作为治疗RSI的新疗法	发现放射性皮肤损伤中胆汁酸代谢的显著变化，并证实去氧胆酸（DCA）具有促进伤口愈合和减轻表皮增生的作用	NA	探究放射性皮肤损伤中胆汁酸及其衍生物的代谢变化	放射性皮肤损伤中的胆汁酸代谢	NA	NA	液相色谱-质谱联用（LC-MS），单细胞RNA测序（scRNA-Seq）	NA	RNA	大鼠皮肤组织，放射性皮肤损伤的人类和动物模型
15605	2024-08-07	Decreased CNNM2 expression in prefrontal cortex affects sensorimotor gating function, cognition, dendritic spine morphogenesis and risk of schizophrenia 2024-Jan, Neuropsychopharmacology : official publication of the American College of Neuropsychopharmacology IF:6.6Q1 DOI:10.1038/s41386-023-01732-y PMID:37715107	研究论文	本研究通过全基因组关联研究（GWAS）和数量性状位点（QTL）分析，发现CNNM2基因在额叶皮层中的表达降低影响感觉运动门控功能、认知、树突棘形态发生以及精神分裂症的风险	首次揭示CNNM2基因在精神分裂症发病机制中的重要作用，并通过小鼠模型和蛋白质组学分析验证了其与精神分裂症内表型的关联	NA	旨在识别与精神分裂症风险相关的基因，并探讨其分子机制	CNNM2基因在额叶皮层中的表达及其对感觉运动门控功能、认知和树突棘形态发生的影响	神经科学	精神分裂症	全基因组关联研究（GWAS）、数量性状位点（QTL）分析、单细胞RNA测序（scRNA-seq）、蛋白质组学分析	NA	基因表达数据、蛋白质表达数据	使用PsychENCODE、ROSMAP和Banner数据库中的额叶皮层表达QTL（eQTL）和蛋白质QTL（pQTL）数据集
15606	2024-08-07	Single-Cell Mapping of Brain Myeloid Cell Subsets Reveals Key Transcriptomic Changes Favoring Neuroplasticity after Ischemic Stroke 2024-Jan, Neuroscience bulletin IF:5.9Q1 DOI:10.1007/s12264-023-01109-7 PMID:37755676	研究论文	本研究利用单细胞RNA测序技术，描绘了脑缺血后梗死周边区域的免疫细胞组成和转录特征，揭示了微胶质细胞和单核细胞衍生巨噬细胞在促进神经再生中的作用	首次详细描述了脑缺血后梗死周边区域免疫细胞的单细胞转录组特征，特别是微胶质细胞和单核细胞衍生巨噬细胞在神经再生中的作用	NA	探究脑缺血后免疫细胞在促进神经可塑性和神经再生中的作用	脑缺血后梗死周边区域的免疫细胞	数字病理学	脑血管疾病	单细胞RNA测序	NA	转录组数据	具体样本数量未提及
15607	2024-08-05	TrkA-mediated sensory innervation of injured mouse tendon supports tendon sheath progenitor cell expansion and tendon repair 2023-12-20, Science translational medicine IF:15.8Q1 DOI:10.1126/scitranslmed.ade4619 PMID:38117901	研究论文	本研究探讨外周神经在小鼠肌腱损伤与修复中的作用	首次揭示外周神经通过调控神经生长因子和TGFβ信号通路促进肌腱细胞的扩展与修复	需要进一步研究去神经化对肌腱机械负荷的潜在影响	研究外周神经在小鼠肌腱损伤后的修复过程中的作用	小鼠肌腱及其神经生长与修复机制	数字病理学	NA	单细胞和空间转录组学	NA	组织样本	小鼠以及人类肌腱活检样本
15608	2024-08-07	Autologous Airway Basal Cell Transplantation Alleviates Airway Epithelium Defect in Recurrent Benign Tracheal Stenosis 2023-Dec-18, Stem cells translational medicine IF:5.4Q1 DOI:10.1093/stcltm/szad062 PMID:37804518	研究论文	本文研究了自体气道基底细胞移植在恢复良性复发性气管狭窄中气道稳态的作用	首次探讨了自体气道基底细胞移植与生物胶结合使用在犬模型中的治疗效果	研究仅在犬模型中进行，尚未在人类中验证	探索自体气道基底细胞移植在治疗良性复发性气管狭窄中的应用	良性复发性气管狭窄患者及犬模型	NA	良性气管狭窄	单细胞RNA测序	NA	单细胞RNA测序数据	研究包括多个犬模型组别，具体数量未详细说明
15609	2024-08-07	Diversity of intratumoral regulatory T cells in B-cell non-Hodgkin lymphoma 2023-12-12, Blood advances IF:7.4Q1 DOI:10.1182/bloodadvances.2023010158 PMID:37695745	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序和T细胞受体测序结合高维流式细胞术，解析了弥漫大B细胞淋巴瘤和滤泡淋巴瘤中肿瘤内调节性T细胞的异质性	首次揭示了B细胞非霍奇金淋巴瘤中肿瘤内调节性T细胞的三个不同转录状态，并发现激活的调节性T细胞在肿瘤组织中富集，具有更强的免疫抑制活性	研究主要集中在弥漫大B细胞淋巴瘤和滤泡淋巴瘤，其他类型的B细胞非霍奇金淋巴瘤的调节性T细胞异质性尚未探讨	探讨B细胞非霍奇金淋巴瘤中肿瘤内调节性T细胞的异质性及其对预后的影响	弥漫大B细胞淋巴瘤和滤泡淋巴瘤中的肿瘤内调节性T细胞	数字病理学	淋巴瘤	单细胞RNA测序，T细胞受体测序，高维流式细胞术	NA	基因表达数据	两个独立的滤泡淋巴瘤队列
15610	2024-08-05	Metformin potentiates nephrotoxicity by promoting NETosis in response to renal ferroptosis 2023-Oct-17, Cell discovery IF:13.0Q1 DOI:10.1038/s41421-023-00595-3 PMID:37848438	研究论文	这篇文章研究了二甲双胍如何通过促进肾脏铁死亡中的中性粒细胞死亡而加剧肾小管损伤。	揭示了二甲双胍加重肾脏损伤的全新机制，强调了铁、铁死亡和中性粒细胞死亡在急性肾损伤中的关系	尚未探讨二甲双胍对不同年龄段患者的影响	探索和阐明二甲双胍对肾功能的影响及其机制	小鼠模型，研究实验性急性肾损伤中的二甲双胍作用	数字病理学	NA	单细胞转录组分析	NA	生物样本数据	涉及多只小鼠
15611	2024-08-07	sciCNV: high-throughput paired profiling of transcriptomes and DNA copy number variations at single-cell resolution 2022-01-17, Briefings in bioinformatics IF:6.8Q1 DOI:10.1093/bib/bbab413 PMID:34655292	研究论文	本文介绍了一种高吞吐量的单细胞RNA测序分析流程，能够为单个细胞提供配对的CNV和转录组图谱，从而探索CNV对细胞程序的影响	提出了sciCNV工具，用于从单细胞RNA测序数据中推断单细胞CNV，提高了CNV检测的灵敏度和特异性	NA	研究CNV对细胞功能的影响，并开发新的工具用于单细胞RNA测序数据的分析	单细胞RNA测序数据和CNV	数字病理学	多发性骨髓瘤	单细胞RNA测序	NA	转录组数据	NA
15612	2024-08-07	Single-Cell Transcriptional Profiling of the Intestinal Epithelium 2020, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.) DOI:10.1007/978-1-0716-0747-3_8 PMID:32705639	review	本文综述了单细胞转录组学技术在研究小鼠小肠上皮细胞中的应用	单细胞RNA测序（scRNA-seq）技术使得能够在细胞水平上研究异质性生物系统	NA	探讨单细胞转录组学在小鼠小肠上皮细胞研究中的基本原理和实验设计	小鼠小肠上皮细胞	digital pathology	NA	scRNA-seq	NA	text	NA
15613	2024-08-07	Immunocompetent mouse models revealed that S100A4+ monocytes/macrophages facilitate long-term Zika virus infection in the testes 2024-Dec, Emerging microbes & infections IF:8.4Q1 DOI:10.1080/22221751.2023.2300466 PMID:38164719	研究论文	本研究通过使用抗IFNAR抗体阻断的C57BL/6雄性小鼠和hSTAT2敲入雄性小鼠，建立了免疫活性小鼠模型，揭示了S100A4+单核细胞/巨噬细胞在睾丸中促进寨卡病毒长期感染的作用。	本研究首次使用免疫活性小鼠模型，揭示了S100A4+单核细胞/巨噬细胞在寨卡病毒睾丸感染中的关键作用，并提出了寨卡病毒在男性生殖系统中长期感染的新机制。	NA	研究寨卡病毒如何在男性生殖系统中侵入和持续存在。	寨卡病毒在男性生殖系统中的感染机制。	NA	NA	单细胞RNA测序	NA	RNA	使用抗IFNAR抗体阻断的C57BL/6雄性小鼠和hSTAT2敲入雄性小鼠
15614	2024-08-07	Single-cell RNA Sequencing (scRNA-seq): Advances and Challenges for Cardiovascular Diseases (CVDs) 2024-Feb, Current problems in cardiology IF:3.0Q2 DOI:10.1016/j.cpcardiol.2023.102202 PMID:37967800	研究论文	本文探讨了单细胞RNA测序（scRNA-seq）在心血管疾病（CVDs）研究中的应用及其带来的挑战	scRNA-seq技术揭示了心脏和血管系统中先前未知的细胞类型及其在不同疾病病理中的相关性	NA	深入理解心血管疾病的基本机制，改进治疗策略和患者风险评估	心血管疾病及其相关细胞类型	数字病理学	心血管疾病	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	RNA序列	NA
15615	2024-08-05	Integrated analysis of necroptosis related gene signature to predict clinical outcomes, immune status and drug sensitivity in lower grade Glioma 2024-Jan-15, Heliyon IF:3.4Q1 DOI:10.1016/j.heliyon.2023.e23947 PMID:38192784	研究论文	本研究开发了一种可靠的坏死性凋亡相关基因特征，以预测低级别胶质瘤患者的预后	首次建立了基于坏死性凋亡相关基因的风险评分模型，揭示了其在低级别胶质瘤中的作用	未详细探讨坏死性凋亡在所有低级别胶质瘤中的作用机制	研究坏死性凋亡相关基因在低级别胶质瘤中的预后和免疫状态的影响	低级别胶质瘤患者	数字病理学	低级别胶质瘤	基因表达分析、功能富集分析、共识聚类分析、单细胞测序	风险评分模型	基因表达数据	七个预后机械基因的样本
15616	2024-08-07	StemDriver: a knowledgebase of gene functions for hematopoietic stem cell fate determination 2024-Jan-05, Nucleic acids research IF:16.6Q1 DOI:10.1093/nar/gkad1063 PMID:37953308	研究论文	StemDriver是一个专注于血液干细胞命运决定中基因功能注释的综合知识库	利用单细胞RNA测序数据成功构建了从血液干细胞初始形成到成熟细胞的全面谱系图，并进行了广泛的基因表达特征探索和表征	NA	构建一个全面的知识库，用于血液干细胞命运决定中基因功能的注释	血液干细胞命运决定中的基因功能	生物信息学	NA	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	涵盖42项研究，包括从胚胎期到成年的14种组织类型，评估了23,839个人类样本基因和29,533个鼠样本基因
15617	2024-08-05	Single-cell transcriptomics reveals ferrimagnetic vortex iron oxide nanoring-mediated mild magnetic hyperthermia exerts antitumor effects by alleviating macrophage suppression in breast cancer 2024-Jan, Biomedicine & pharmacotherapy = Biomedecine & pharmacotherapie DOI:10.1016/j.biopha.2023.115954 PMID:38039753	研究论文	该文章探讨了铁氧体旋涡铁氧化物纳米环介导的温和磁热疗法（FVIO-MHT）对乳腺癌肿瘤微环境的影响	本研究利用单细胞转录组测序揭示FVIO-MHT通过改善巨噬细胞的抑制作用来增强抗肿瘤效果	研究未明确揭示FVIO-MHT在其他类型肿瘤微环境中的影响	研究FVIO-MHT在乳腺癌治疗中的潜力及其对肿瘤微环境的影响	主要集中在乳腺癌的肿瘤微环境及巨噬细胞的变化	数字病理学	乳腺癌	单细胞转录组测序	NA	NA	NA
15618	2024-08-07	Patch-seq: Multimodal Profiling of Single-Cell Morphology, Electrophysiology, and Gene Expression 2024, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.) DOI:10.1007/978-1-0716-3621-3_15 PMID:38194038	研究论文	本文介绍了Patch-seq技术，该技术结合了全细胞膜片钳记录、免疫组织化学和单细胞RNA测序，用于全面分析单细胞的形态学、电生理学和转录组学特征	Patch-seq技术首次实现了对单细胞多模态特征的综合分析，包括形态学、电生理学和基因表达模式	NA	探索细胞间丰富的多维表型变异，并在单细胞水平上直接关联基因表达与表型	单细胞的形态学、电生理学和基因表达模式	NA	NA	单细胞RNA测序(scRNA-seq)	NA	形态学、电生理学和转录组数据	单个细胞
15619	2024-08-07	Fibroblast subpopulations in Systemic Sclerosis - Functional implications of individual subpopulations and correlations with clinical features 2023-Dec-24, The Journal of investigative dermatology IF:5.7Q1 DOI:10.1016/j.jid.2023.09.288 PMID:38147960	研究论文	本研究通过整合单细胞RNA测序（scRNA-seq）和批量RNA测序（bulk RNA-seq）数据以及临床信息，探讨了系统性硬化症（SSc）中个体成纤维细胞亚群的作用及其与临床特征的相关性	本研究首次将成纤维细胞亚群的比例纳入机器学习模型，提高了SSc患者皮肤纤维化进展与稳定性的分类准确性	NA	研究系统性硬化症中成纤维细胞亚群的功能及其与临床特征的相关性	系统性硬化症中的成纤维细胞亚群及其与皮肤纤维化的关系	数字病理学	系统性硬化症	单细胞RNA测序（scRNA-seq），批量RNA测序（bulk RNA-seq）	机器学习模型	RNA测序数据	PRESS和GENISOS两个队列的样本
15620	2024-08-07	De novo hematopoiesis from the fetal lung 2023-11-28, Blood advances IF:7.4Q1 DOI:10.1182/bloodadvances.2022008347 PMID:37729429	研究论文	本文首次证明胎儿肺是HECs的潜在来源，这些HECs具有进行EHT以产生新生HSPCs及其后代的功能能力	首次描述胎儿肺中的HECs，并证明其能进行EHT产生新生HSPCs，为非骨髓造血提供新视角	NA	探索胎儿肺中HECs的存在及其进行EHT的能力	胎儿肺中的HECs及其进行EHT的能力	生物医学	NA	scRNA-seq, 流式细胞术, 小分子调制	NA	细胞	小鼠和人类胎儿肺的组织培养