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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1541 | 2025-12-11 |
Turkey oviduct epithelial organoids express region-associated markers and avian influenza virus receptor†
2025-Dec-10, Biology of reproduction
IF:3.1Q2
DOI:10.1093/biolre/ioaf274
PMID:41369270
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和免疫荧光染色验证了火鸡输卵管上皮类器官的区域特异性标记物和禽流感病毒受体表达 | 首次构建了火鸡生殖道的单细胞图谱框架,并验证了类器官模型在保留区域分子特征和病毒受体表达方面的适用性 | 样本量较小(仅涉及两只性成熟母鸡),且为探索性研究,需要进一步验证和扩展 | 验证火鸡输卵管上皮类器官模型的区域特异性标记物和禽流感病毒受体表达,以支持其作为体外模型的应用 | 火鸡(Meleagris gallopavo)的输卵管六个区域(漏斗部、膨大部、峡部、子宫、子宫阴道连接部和阴道)的组织及衍生类器官 | 单细胞组学 | 禽流感 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、批量RNA测序、免疫荧光染色 | 类器官模型 | RNA序列数据、图像数据 | 两只性成熟母鸡的输卵管组织,衍生类器官样本(n=2用于批量RNA测序,n=4用于免疫荧光染色) | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 1542 | 2025-12-11 |
Microglia Display Heterogeneous Initial Responses to Disseminated Tumor Cells
2025-Dec-10, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-25-3425
PMID:41369553
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研究论文 | 本研究通过体内命运图谱成像、单细胞RNA测序和全息光转换技术,揭示了小胶质细胞在脑转移早期对播散肿瘤细胞的异质性反应 | 首次结合多种技术追踪同一动物体内肿瘤命运和小胶质细胞早期动态反应,发现小胶质细胞表型可通过抑制TGF-β信号或删除肿瘤抗原CD24a/CD47进行调控 | 研究主要聚焦早期转移阶段,未全面探讨晚期转移中系统免疫抑制的影响 | 探究脑转移早期小胶质细胞的异质性反应及其调控机制 | 小鼠模型中的播散肿瘤细胞和脑内小胶质细胞 | 数字病理学 | 脑转移癌 | 单细胞RNA测序, 全息光转换技术 | NA | 图像, 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1543 | 2025-12-11 |
Clusterin Drives Fiber Endocytosis by Mesothelial Cells to Resolve Liver Fibrosis
2025-Dec-10, Gastroenterology
IF:25.7Q1
DOI:10.1053/j.gastro.2025.08.022
PMID:41369634
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研究论文 | 本研究揭示了簇集蛋白(CLU)通过其受体LRP2驱动间皮细胞纤维内吞以缓解肝纤维化的新机制,并设计了一种模拟CLU的肽段CLUtide,展示了其治疗潜力 | 首次发现CLU由中央静脉周围衰老肝细胞分泌,并通过LRP2受体特异性作用于肝间皮细胞,诱导其增殖、迁移并内吞纤维,从而缓解肝纤维化;并成功设计出具有治疗潜力的模拟肽CLUtide | 研究主要在动物模型中进行,CLUtide的临床疗效和安全性尚未在人体中得到验证 | 探究簇集蛋白(CLU)在肝纤维化中的作用机制及治疗潜力 | 肝纤维化患者和小鼠模型、CLU基因敲除小鼠、间皮细胞特异性LRP2敲除小鼠 | 数字病理学 | 肝纤维化 | 单细胞RNA测序、免疫荧光 | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据、图像数据 | 患者和小鼠的肝组织样本(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1544 | 2025-12-11 |
Exploring the role of PANoptosis in idiopathic pulmonary fibrosis based on scRNA-seq and bulk-seq
2025-Dec-10, Clinical and experimental medicine
IF:3.2Q2
DOI:10.1007/s10238-025-01990-8
PMID:41369928
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研究论文 | 本研究结合单细胞RNA测序和转录组数据,探索PANoptosis在特发性肺纤维化发病机制中的作用 | 首次将PANoptosis(一种整合了细胞焦亡、凋亡和坏死性凋亡的新型程序性细胞死亡形式)的概念引入特发性肺纤维化研究,并基于此构建了诊断预测模型 | 研究主要基于公共数据集和动物模型,需要在更大规模的人类临床样本中进行验证 | 阐明PANoptosis在特发性肺纤维化发病机制中的作用,并开发基于相关基因的诊断预测模型 | 特发性肺纤维化患者及动物模型的肺组织 | 生物信息学 | 特发性肺纤维化 | 单细胞RNA测序,转录组测序,qRT-PCR | 加权基因共表达网络分析,机器学习方法 | 基因表达数据 | 基于公共数据集GSE227136(具体样本数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA-seq,bulk RNA-seq | NA | NA |
| 1545 | 2025-12-11 |
Vinculin influences essential processes in enteric nervous system development and Hirschsprung disease pathogenesis
2025-Dec-09, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI198531
PMID:41364504
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研究论文 | 本研究探讨了Vinculin在肠神经系统发育及先天性巨结肠症发病机制中的作用 | 首次将Vinculin突变与先天性巨结肠症关联,并通过单细胞和空间转录组学揭示了其在细胞间互作和信号通路中的枢纽作用 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证有限,且未深入探讨VCL在其他神经系统疾病中的潜在作用 | 阐明Vinculin在肠神经系统发育和先天性巨结肠症中的功能机制 | Vinculin基因突变、小鼠模型(Vcl条件敲除和Ptn敲除)、肠神经系统细胞 | 生物医学研究 | 先天性巨结肠症 | 全基因组测序、单细胞转录组学、空间RNA测序、体外实验 | NA | 基因组数据、转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1546 | 2025-12-11 |
CD8+ T cells in the tumor microenvironment modulate response to endocrine therapy in breast cancer
2025-Dec-09, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI188458
PMID:41364532
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研究论文 | 本研究探讨了肿瘤免疫微环境(TIME)中CD8+ T细胞通过分泌CXCL11调控激素受体阳性(HR+)乳腺癌对内分泌治疗(如来曲唑)的反应 | 首次揭示了CD8+ T细胞通过CXCL11-CXCR3/CXCR7轴促进HR+乳腺癌细胞在雌激素剥夺条件下的生长,从而介导内分泌治疗耐药 | 研究主要基于体外细胞系实验和有限的患者活检样本,缺乏大规模临床队列验证,且体内机制和临床转化潜力需进一步探索 | 阐明肿瘤免疫微环境如何影响激素受体阳性乳腺癌对内分泌治疗的反应 | 激素受体阳性乳腺癌患者活检组织、HR+乳腺癌细胞系(MCF7、T47D)及CD8+ T细胞 | 肿瘤免疫学 | 乳腺癌 | RNA测序、循环免疫荧光、空间转录组学、细胞共培养 | NA | 组织切片图像、基因表达数据、空间转录组数据 | 接受来曲唑治疗的HR+乳腺癌患者治疗前后活检样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1547 | 2025-12-11 |
Nectin-4 reduces T cell effector function and is a therapeutic target in pancreatic cancer
2025-Dec-09, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.194290
PMID:41364531
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研究论文 | 本研究通过多色流式细胞术、免疫组化和单细胞RNA测序分析,揭示了Nectin-4在胰腺癌中抑制T细胞效应功能,并作为治疗靶点,使用抗体药物偶联物enfortumab vedotin在患者来源的PDAC类器官中抑制肿瘤生长 | 首次发现Nectin-4(而非CD155)与胰腺癌不良预后相关,并证明其能抑制T细胞效应细胞因子产生,为PDAC提供了新的治疗靶点 | 研究主要基于体外实验和患者样本分析,缺乏体内动物模型验证,且临床疗效需进一步在患者中测试 | 探索胰腺导管腺癌(PDAC)中TIGIT轴配体和受体的作用,并评估Nectin-4作为治疗靶点的潜力 | 胰腺导管腺癌(PDAC)患者肿瘤和血液样本、患者来源的PDAC类器官 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 多色流式细胞术、免疫组化、单细胞RNA测序 | NA | 图像、文本(基因表达数据) | 来自不同阶段PDAC患者的肿瘤和血液样本,以及患者来源的PDAC类器官 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1548 | 2025-12-11 |
Longitudinal profiling of tumor and immune compartments uncovers patterns of dysregulation and associations with response in multiple myeloma
2025-Dec-09, Blood cancer discovery
IF:11.5Q1
DOI:10.1158/2643-3230.BCD-25-0205
PMID:41364805
|
研究论文 | 本研究通过多组学分析,揭示了多发性骨髓瘤中肿瘤与免疫微环境的动态相互作用,并识别了与治疗反应相关的生物标志物 | 首次在纵向研究中结合单细胞RNA测序和批量测序,全面剖析了多发性骨髓瘤的免疫微环境变化,并发现了幼稚B细胞重建作为持久反应的新生物标志物 | 样本量相对有限(102名患者),且主要基于骨髓样本,可能无法完全代表全身性免疫状态 | 探究多发性骨髓瘤治疗反应和疾病进展的免疫相关因素 | 多发性骨髓瘤患者及其骨髓样本中的肿瘤细胞和免疫细胞 | 数字病理学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 全基因组测序 | NA | 基因表达数据, 基因组数据 | 243个骨髓样本(来自102名患者,共631,226个细胞)和209个样本的批量测序数据 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq, 全基因组测序 | NA | NA |
| 1549 | 2025-12-11 |
RAB25 modulates pit cell commitment by coordinating transforming growth factor-alpha secretion from gastric epithelial cells
2025-Dec-09, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-025-08316-2
PMID:41365858
|
研究论文 | 本文探讨了RAB25通过协调胃上皮细胞分泌转化生长因子-α来调控胃小凹细胞分化的生理作用 | 首次揭示了RAB25在胃环境中通过调节TGFA分泌来维持正常细胞谱系分化的生理机制,并关联了人类Ménétrier's疾病 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验,人类疾病关联性证据尚需进一步验证 | 探究胃中EGFR信号调控细胞谱系分化的分子机制 | 胃上皮细胞、小鼠模型、人类Ménétrier's疾病样本 | 单细胞组学 | 胃疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1550 | 2025-12-11 |
Functional KCC2 expression marks an evolutionarily conserved population of early-maturing interneurons in the perinatal cortex
2025-Dec-09, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-67270-x
PMID:41365903
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研究论文 | 本研究通过识别和表征小鼠皮层中一类表达KCC2的早期成熟中间神经元,揭示了GABA能功能成熟在中间神经元亚群中的异质性,并证明了该群体在人类中的进化保守性 | 首次在小鼠皮层中识别出一类在胚胎期就表达KCC2、出生时即具有超极化GABA反应的早期成熟中间神经元亚群,并证明其在人类中存在进化保守性 | 研究主要基于小鼠模型,人类数据的验证仍需进一步扩展;对早期成熟中间神经元的具体功能回路贡献尚未完全阐明 | 探究皮层中间神经元GABA能反应功能成熟的时间模式异质性,并寻找早期成熟中间神经元的分子标记 | 小鼠及人类皮层中间神经元 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学,差异基因表达分析 | NA | 基因表达数据,空间转录组数据,电生理记录数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |
| 1551 | 2025-12-11 |
AUTOENCODIX: a generalized and versatile framework to train and evaluate autoencoders for biological representation learning and beyond
2025-Dec-09, Nature computational science
IF:12.0Q1
DOI:10.1038/s43588-025-00916-4
PMID:41366150
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研究论文 | 本文介绍了一个名为AUTOENCODIX的开源框架,用于标准化、灵活地预处理、训练和评估自编码器架构,以促进生物表示学习 | 提出了一个标准化且通用的框架,支持包括基于本体和跨模态自编码器在内的多种架构,增强了表示学习的可解释性和跨模态转换能力 | 未明确提及具体的技术限制或框架在特定数据集上的性能瓶颈 | 开发一个通用框架以标准化自编码器的训练和评估,推动生物医学数据表示学习的研究 | 自编码器架构及其在生物医学数据中的应用 | 机器学习 | 泛癌研究 | 自编码器、深度学习 | 自编码器(包括基于本体和跨模态变体) | 多模态数据(如单细胞测序数据、影像数据) | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1552 | 2025-12-11 |
Unveiling the role of angiogenesis-related biomarkers in diabetic nephropathy via transcriptomics
2025-Dec-09, Diabetology & metabolic syndrome
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s13098-025-02044-5
PMID:41366482
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研究论文 | 本研究通过整合转录组学数据、孟德尔随机化分析和单细胞RNA测序,识别了与糖尿病肾病相关的血管生成生物标志物,并探讨了它们在疾病中的作用 | 结合孟德尔随机化分析与单细胞RNA测序,首次将CD44、HSPG2、LPAR1和PTGES确定为糖尿病肾病的新型生物标志物和风险因素 | 研究主要依赖公共数据库数据,样本来源可能有限,且实验验证仅通过qRT-PCR和Western blot进行,需要进一步功能研究 | 探索糖尿病肾病中血管生成相关生物标志物,为临床诊断和治疗提供理论依据 | 糖尿病肾病患者的转录组学数据、免疫微环境及细胞类型 | 生物信息学 | 糖尿病肾病 | 转录组学分析、孟德尔随机化分析、单细胞RNA测序、qRT-PCR、Western blotting | NA | 转录组数据、单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1553 | 2025-12-11 |
REL overexpression and sustained NF-κB signaling associated with 2p gain induce resistance to BTK inhibitors in Chronic Lymphocytic Leukemia
2025-Dec-09, Leukemia
IF:12.8Q1
DOI:10.1038/s41375-025-02818-w
PMID:41366531
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研究论文 | 本研究揭示了慢性淋巴细胞白血病中2号染色体短臂增益通过导致REL过表达和持续NF-κB信号传导,从而介导对BTK抑制剂耐药的机制 | 首次在单细胞水平上发现2p增益导致REL过表达和NF-κB通路富集,并证实这是除BTK和PLCG2突变外的一种新型BTK抑制剂耐药机制 | 研究主要基于体外实验和细胞系模型,临床样本验证的队列规模可能有限,且未详细探讨其他可能共存的耐药机制 | 探究慢性淋巴细胞白血病中2号染色体短臂增益介导BTK抑制剂耐药的分子机制 | 慢性淋巴细胞白血病患者样本(包括2p增益和非2p增益)及B淋巴样细胞系 | 数字病理学 | 慢性淋巴细胞白血病 | 单细胞RNA测序,CRISPR/Cas9基因编辑,体外功能分析 | NA | 单细胞转录组数据,DNA结合活性数据,临床治疗反应数据 | 大量原发性CLL样本队列(具体数量未明确说明)及B淋巴样细胞系 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1554 | 2025-12-11 |
Aire-dependent interferon signalling shapes thymocyte maturation and central tolerance in mice
2025-Dec-09, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-025-09317-9
PMID:41366551
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了Aire缺陷如何通过干扰素信号通路影响胸腺细胞成熟和中枢免疫耐受 | 首次在单细胞水平系统揭示Aire通过调控I型干扰素信号影响胸腺微环境中多种免疫细胞的转录组特征 | 研究仅在小鼠模型中进行,未验证人类对应机制;未阐明干扰素信号下游的具体分子通路 | 探究Aire缺陷如何通过干扰素信号通路影响免疫细胞发育和中枢耐受建立 | Aire缺陷型和野生型小鼠的胸腺、骨髓和淋巴结免疫细胞 | 单细胞组学 | 自身免疫性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | Aire缺陷型和野生型小鼠的多组织免疫细胞(具体数量未说明) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1555 | 2025-12-11 |
LINC01116, a hypoxia-lncRNA marker of pathological lymphangiogenesis and poor prognosis in lung adenocarcinoma
2025-Dec-09, Molecular oncology
IF:5.0Q1
DOI:10.1002/1878-0261.70175
PMID:41367062
|
研究论文 | 本研究鉴定出长链非编码RNA LINC01116作为肺腺癌中缺氧诱导的病理淋巴管生成标志物,并与不良预后相关 | 首次发现LINC01116在淋巴内皮细胞中特异性高表达,并揭示其在缺氧微环境下调控淋巴管生成的作用机制 | 在肿瘤细胞系中的功能实验未发现LINC01116的明确调控作用,其具体分子机制仍需进一步研究 | 探索肺腺癌中缺氧诱导的淋巴管生成机制及其预后标志物 | 肺腺癌患者队列、肺腺癌细胞系、淋巴内皮细胞 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序、RNA荧光原位杂交、CRISPRi、RNA干扰 | NA | 转录组数据、单细胞测序数据、图像数据 | 多个肺腺癌患者队列(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1556 | 2025-12-11 |
Integrative epidemiological and spatial multi-omics analyses reveal SPP1⁺ macrophages with senescence-like features as key mediators linking NO₂ exposure to coronary heart disease
2025-Dec-05, Journal of hazardous materials
IF:12.2Q1
DOI:10.1016/j.jhazmat.2025.140429
PMID:41232188
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研究论文 | 本研究通过整合流行病学数据、因果推断方法和多组学分析,揭示了环境污染物二氧化氮(NO₂)通过加速生物衰老(特别是PhenoAge)增加冠心病风险的机制,并识别出SPP1⁺巨噬细胞作为关键介导细胞 | 首次将大规模流行病学数据、因果推断方法(倾向评分匹配和孟德尔随机化)与多组学分析(包括单细胞和空间转录组学)相结合,系统阐明了NO₂暴露通过生物衰老途径影响冠心病风险的完整证据链,并识别出具有衰老样特征的SPP1⁺巨噬细胞作为关键介导细胞 | 研究主要基于中国人群数据,结论在其他种族/人群中的普适性有待验证;多组学分析样本量相对较小;环境暴露评估可能存在测量误差 | 探究环境污染物NO₂暴露通过生物衰老途径影响冠心病风险的因果机制 | 冠心病患者及对照人群(来自天津队列和CHARLS队列)、人类动脉粥样硬化斑块组织 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞转录组测序, 空间转录组学, 批量转录组测序, 孟德尔随机化, 倾向评分匹配 | NA | 流行病学数据, 基因组数据, 转录组数据, 空间数据 | 流行病学队列:17,412人(13,886例患者,3,526例对照);多组学分析:人类动脉粥样硬化斑块样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 1557 | 2025-12-11 |
Identification of Neurotrophic Factor Related Biomarkers and Mechanistic Insights into Neuropathic Pain via Integrated Bioinformatics Analysis
2025-Dec-02, ACS omega
IF:3.7Q2
DOI:10.1021/acsomega.5c07765
PMID:41358093
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研究论文 | 本研究通过整合生物信息学方法,识别了与神经病理性疼痛相关的五个关键生物标志物,并探讨了其潜在机制 | 结合单细胞RNA测序、差异表达分析、孟德尔随机化及细胞通讯分析,首次系统性地识别了神经病理性疼痛中与神经营养因子相关的生物标志物及其在细胞相互作用和分化轨迹中的作用 | 研究主要基于公共数据库和小鼠背根神经节数据,人类样本验证不足,且机制探索仍处于初步阶段 | 识别神经病理性疼痛的关键生物标志物并探索其潜在机制 | 小鼠背根神经节细胞及公共数据库中的神经病理性疼痛数据集 | 生物信息学 | 神经病理性疼痛 | 单细胞RNA测序, 差异表达分析, 孟德尔随机化, 细胞通讯分析, 伪时间分析 | NA | RNA-seq数据, 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 1558 | 2025-12-11 |
Lipid-laden macrophages in atherosclerosis and cancer
2025-Dec, Seminars in cancer biology
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.semcancer.2025.09.007
PMID:41005549
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综述 | 本文综述了脂质负载巨噬细胞在炎症、动脉粥样硬化和癌症中的双重作用,比较了其在生理和病理条件下的异同 | 系统比较了脂质负载巨噬细胞在动脉粥样硬化和癌症这两种不同疾病背景下的共同和独特功能,并探讨了基于脂质代谢调节的治疗策略在癌症治疗中的潜力 | 作为综述文章,主要基于现有文献进行总结,未提出新的实验数据或验证 | 探讨脂质负载巨噬细胞在不同疾病(动脉粥样硬化和癌症)中的作用机制及治疗靶点 | 脂质负载巨噬细胞 | 自然语言处理 | 动脉粥样硬化,癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1559 | 2025-12-11 |
Lactylated histone H4K8 regulation of MFN2/Wnt signaling integrates glycolytic metabolism and Müller cell activation in the pathogenesis of glaucoma
2025-Dec, Neurobiology of disease
IF:5.1Q1
DOI:10.1016/j.nbd.2025.107178
PMID:41197676
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研究论文 | 本研究揭示了在青光眼发病过程中,组蛋白H4K8乳酰化通过调控MFN2/Wnt信号通路,将糖酵解代谢与Müller细胞激活联系起来,并最终导致视网膜神经节细胞凋亡的分子机制 | 首次发现组蛋白H4K8乳酰化在青光眼视网膜中显著增加,并作为乳酸响应的表观遗传检查点,通过调控MFN2基因表达,将线粒体动力学与Wnt/β-catenin信号通路激活相耦合 | 研究主要基于动物模型和体外实验,在人类青光眼患者中的直接验证尚不充分;MFN2作为治疗靶点的具体干预策略和潜在副作用有待进一步探索 | 阐明青光眼发病过程中代谢应激、表观遗传调控与神经胶质细胞-神经元相互作用之间的分子机制 | 青光眼模型中的视网膜组织、Müller胶质细胞、视网膜神经节细胞、光感受器细胞 | 分子生物学与表观遗传学 | 青光眼 | CUT&Tag(靶向切割与标签化)、单细胞RNA测序、基因组学分析、体内实验 | NA | 基因组学数据、表观遗传学数据、单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1560 | 2025-12-11 |
QuiCAT: a scalable and flexible framework for mapping synthetic sequences
2025-Dec-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaf607
PMID:41217759
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研究论文 | 本文介绍了一个名为QuiCAT的Python包,用于从测序数据中高效提取、聚类和分析合成标签,以支持细胞命运和谱系追踪研究 | QuiCAT是一个端到端的、可扩展的软件框架,在速度和准确性上优于现有方法,并提供参考无和参考两种工作流程,适用于大规模单细胞和空间转录组学应用 | 未在摘要中明确提及 | 开发一个可扩展且灵活的软件框架,用于分析合成细胞标记技术的数据,以支持细胞命运和谱系追踪研究 | 合成序列标签,包括来自群体水平数据、单细胞和空间分辨转录组学的数据集 | 生物信息学 | NA | 合成细胞标记技术,单细胞和空间转录组学测序 | NA | 测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |