单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
1541	2025-05-23	The molecular mechanism by which CTSB degrades FPN to disrupt macrophage iron homeostasis and promote the progression of atherosclerosis 2025-Jun, Molecular and cellular biochemistry IF:3.5Q3 DOI:10.1007/s11010-025-05228-9 PMID:39960586	研究论文	本文研究了CTSB通过降解FPN破坏巨噬细胞铁稳态并促进动脉粥样硬化进展的分子机制	首次揭示了CTSB通过降解FPN调控巨噬细胞铁死亡进而影响动脉粥样硬化进展的分子机制	研究主要基于动物模型和体外实验，人类样本验证相对有限	阐明CTSB在动脉粥样硬化进展中的作用机制	巨噬细胞铁稳态和动脉粥样硬化斑块	分子病理学	心血管疾病	单细胞转录组分析、基因敲除、药理学抑制	ApoE敲除小鼠和高脂饮食SD大鼠模型	基因表达数据、蛋白质水平数据	两种动物模型（数量未明确）和人类AS组织单细胞数据
1542	2025-05-23	Integrated single-cell and spatial transcriptomic profiling reveals that CD177+ Tregs enhance immunosuppression through apoptosis and resistance to immunotherapy in hepatocellular carcinoma 2025-Jun, Oncogene IF:6.9Q1 DOI:10.1038/s41388-025-03330-2 PMID:40055567	research paper	该研究通过单细胞和空间转录组分析，发现CD177+ Tregs通过凋亡和免疫治疗抵抗增强肝细胞癌的免疫抑制	首次鉴定CD177作为肿瘤浸润Treg细胞的生物标志物，并揭示其在肝细胞癌免疫抑制中的关键作用	研究主要基于体外实验和小鼠模型，临床转化效果需进一步验证	探索肝细胞癌中Treg细胞的免疫抑制机制并寻找新的治疗靶点	CD177+ Treg细胞	癌症免疫学	肝细胞癌	单细胞转录组测序	CD177 Treg条件性敲除小鼠模型	转录组数据	NA
1543	2025-05-23	Ifosfamide alleviates autoimmune toxicity and enhances antitumor efficacy in melanoma immunotherapy 2025-06, Biochemical pharmacology IF:5.3Q1 DOI:10.1016/j.bcp.2025.116851 PMID:40081767	研究论文	研究探讨了异环磷酰胺（IFO）在减轻自身免疫毒性及增强黑色素瘤免疫治疗效果中的作用	首次揭示了IFO在自身免疫条件下的广泛抑制作用，并展示了其增强CD8 T细胞活化的特异性免疫调节效应	研究主要基于小鼠模型，尚未在人类临床试验中验证IFO的效果	开发管理免疫相关不良事件（irAEs）的新策略，并增强免疫检查点抑制剂（ICI）的抗肿瘤效果	实验性自身免疫性葡萄膜炎（EAU）小鼠模型和荷瘤小鼠	免疫治疗	黑色素瘤	单细胞RNA测序	EAU小鼠模型	RNA测序数据	未明确提及具体样本数量
1544	2025-05-23	Swimming induces bone loss via regulating mechanical sensing pathways in bone marrow 2025-Jun, Mechanobiology in medicine DOI:10.1016/j.mbm.2025.100125 PMID:40395774	研究论文	该研究通过建立长期游泳训练模型，探讨了低负荷运动对骨稳态的影响机制	揭示了游泳通过调节骨髓中的机械感应通路（如Integrins和ERK1/2信号通路）诱导骨丢失的新机制	研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人类中验证	探究低负荷运动（如游泳）对骨稳态的影响机制	小鼠的骨组织和骨髓细胞	骨生物学	骨丢失	单细胞测序、microCT扫描、组织学染色	小鼠长期游泳训练模型	基因表达谱数据、影像数据	未明确说明小鼠数量
1545	2025-05-23	Dual cytokine-engineered macrophages rejuvenate the tumor microenvironment and enhance anti-PD-1 therapy in renal cell carcinoma 2025-05-27, International immunopharmacology IF:4.8Q1 DOI:10.1016/j.intimp.2025.114725 PMID:40294469	研究论文	研究开发了一种双细胞因子工程化的巨噬细胞，用于重编程肾细胞癌的肿瘤微环境并增强抗PD-1疗法的效果	开发了同时递送IL-12和CXCL-9的双细胞因子工程化巨噬细胞，能够重塑肿瘤微环境并显著增强抗PD-1疗法的效果	NA	克服肾细胞癌对抗PD-1疗法的耐药性	肾细胞癌的肿瘤微环境	肿瘤免疫治疗	肾细胞癌	单细胞RNA测序	NA	RNA测序数据	NA
1546	2025-05-23	Bisecting GlcNAc expression by bone marrow stromal cells modulates TGF-β1-driven macrophage polarization in myeloid leukemias 2025-May-22, Haematologica IF:8.2Q1 DOI:10.3324/haematol.2024.287091 PMID:40400458	研究论文	研究骨髓基质细胞中双分N-乙酰葡萄糖胺（GlcNAc）表达如何通过TGF-β1调控髓系白血病中的巨噬细胞极化	揭示了骨髓基质细胞中特定糖链（减少的双分GlcNAc）通过TGFβ1分泌促进M2极化巨噬细胞亚型的机制，并发现这一过程提高了PD-L1表达，从而损害CD8+ T细胞功能	NA	探讨骨髓基质细胞中糖链修饰对髓系白血病肿瘤微环境中巨噬细胞极化的影响	骨髓基质细胞、肿瘤相关巨噬细胞（TAMs）、CD8+ T细胞	肿瘤免疫学	髓系白血病（AML和MDS）	单细胞RNA测序、流式细胞术、免疫组织化学	NA	RNA测序数据、流式细胞数据、免疫组织化学数据	NA
1547	2025-05-23	A conserved epilepsy-associated gene co-expression module identifies increased metabolic rate as a shared pathomechanism 2025-May-22, Disease models & mechanisms IF:4.0Q1 DOI:10.1242/dmm.052307 PMID:40401642	研究论文	通过果蝇全脑单细胞RNA测序，研究癫痫相关基因共表达网络，揭示代谢率增加作为癫痫的共同病理机制	利用果蝇单细胞表达数据和行为验证人类基因共表达网络，首次将代谢率增加与癫痫易感性联系起来	研究结果主要基于果蝇模型，需要在人类样本中进一步验证	揭示癫痫的分子机制，特别是代谢与癫痫易感性的关系	果蝇和人类癫痫相关基因	神经科学	癫痫	单细胞RNA测序	果蝇基因敲低模型	RNA测序数据	26个基因的果蝇全脑单细胞RNA测序数据
1548	2025-05-23	Single-cell sequencing on PBMCs from HA & HB patients with inhibitors reveals different immune responses to FVIII & FIX 2025-May-22, Blood advances IF:7.4Q1 DOI:10.1182/bloodadvances.2025015799 PMID:40402102	研究论文	通过单细胞测序技术研究血友病A和血友病B患者对FVIII和FIX的不同免疫反应	首次在单细胞水平上比较了HA和HB患者对FVIII和FIX的免疫反应差异，揭示了淋巴细胞亚群组成和功能状态的差异	样本量较小（5例HA和5例HB患者），可能影响结果的普遍性	探索HA和HB患者对FVIII和FIX的不同免疫反应机制	血友病A和血友病B患者的外周血单个核细胞（PBMCs）	单细胞测序	血友病	单细胞测序	NA	单细胞转录组数据	5例HA患者和5例HB患者的PBMCs，共75,051个细胞
1549	2025-05-23	Myeloid Cells in Abdominal Aortic Aneurysm 2025-May-22, Current atherosclerosis reports IF:5.7Q1 DOI:10.1007/s11883-025-01302-1 PMID:40402405	review	综述了髓系细胞在腹主动脉瘤(AAA)发病机制中的关键作用及其治疗潜力	单细胞RNA测序揭示了AAA中髓系细胞的多样性，并阐明了不同髓系细胞亚群在疾病中的作用机制	临床转化面临微环境串扰和潜在脱靶效应的挑战	探讨髓系细胞在腹主动脉瘤发病机制中的作用及治疗靶向潜力	腹主动脉瘤中的髓系细胞	血管生物学	腹主动脉瘤	单细胞RNA测序	NA	转录组数据	NA
1550	2025-05-23	Mechanism of Initial Favorable Response to Decitabine in TP53-Mutated MDS/AML and Potential Mechanisms of Subsequent Relapse 2025-May-21, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research IF:10.0Q1 DOI:10.1158/1078-0432.CCR-24-3192 PMID:40397797	研究论文	该研究探讨了TP53突变型MDS/AML患者对地西他滨初始治疗反应及后续复发的潜在机制	整合了靶向骨髓组测序、纳米孔DNA甲基化测序和单细胞转录组学分析，揭示了白血病与免疫细胞群之间的动态变化	样本量有限，且为单中心研究	阐明TP53突变型MDS/AML患者对地西他滨治疗反应及复发的分子机制	骨髓增生异常综合征(MDS)和急性髓系白血病(AML)患者	血液肿瘤学	骨髓增生异常综合征/急性髓系白血病	靶向骨髓组测序、纳米孔DNA甲基化测序、单细胞转录组学	NA	基因组数据、转录组数据	II期临床试验中的系列患者样本
1551	2025-05-23	Exploring the untapped potential of single-cell and spatial omics in plant biology 2025-May-21, The New phytologist DOI:10.1111/nph.70220 PMID:40398874	综述	本文探讨了单细胞和空间组学技术在植物生物学中的未开发潜力及其当前应用	强调了单细胞和空间组学技术在植物生物学中的创新应用，包括多组学、谱系追踪、分子记录和高通量遗传与化学扰动表型分析等新兴技术	植物特有的技术挑战和资源限制，如细胞壁复杂性和抗体资源有限，以及需要更完整的参考图谱和计算工具	探索单细胞和空间组学技术在植物生物学中的应用潜力，推动植物科学的发展	植物细胞和组织	植物生物学	NA	单细胞转录组分析、染色质可及性分析、空间转录组学、多组学、谱系追踪、分子记录、高通量遗传与化学扰动表型分析	NA	分子和细胞数据	多个模型植物物种的综合细胞图谱
1552	2025-05-23	Gain-of-function PPM1D mutations attenuate ischemic stroke 2025-May-21, Cell death and differentiation IF:13.7Q1 DOI:10.1038/s41418-025-01523-6 PMID:40399534	研究论文	研究发现PPM1D基因的功能获得性突变可以减轻缺血性脑损伤，并验证了其药物稳定剂T2755作为缺血性中风的有前景疗法	首次发现PPM1D基因的功能获得性突变与缺血性中风患者的临床表型改善相关，并揭示了PPM1D通过PPARα途径保护内皮细胞功能的机制	研究中仅发现8例携带PPM1D突变的患者，样本量较小	探索缺血性中风的遗传基础及潜在治疗靶点	10,241名缺血性中风患者和Ppm1d缺陷小鼠	遗传学	缺血性中风	全基因组测序、空间转录组学、蛋白质组学分析	Ppm1d缺陷小鼠模型	基因组数据、转录组数据、蛋白质组数据	10,241名缺血性中风患者（其中8例携带PPM1D突变）和Ppm1d缺陷小鼠
1553	2025-05-23	Multigenerational cell tracking of DNA replication and heritable DNA damage 2025-May-21, Nature IF:50.5Q1 DOI:10.1038/s41586-025-08986-0 PMID:40399682	research paper	该研究通过多代单细胞追踪技术，结合内源性标记蛋白和定制计算工具，探讨了致癌扰动如何诱导姐妹细胞不对称和表型异质性	使用双CRISPR基因组编辑同时追踪DNA复制模式和可遗传的内源性DNA损伤，结合单细胞转录组学揭示了致癌事件如何触发多倍体化的多种途径	研究仅追踪了最多四代的细胞谱系树，可能无法完全反映长期细胞异质性的发展过程	解析细胞异质性的来源及其在多代细胞中的传递机制	异步生长的细胞及其多代谱系	基因组学	癌症	双CRISPR基因组编辑、单细胞转录组学、迭代染色	NA	基因组数据、转录组数据	异步生长的细胞谱系树（最多四代）
1554	2025-05-23	A multi-kingdom genetic barcoding system for precise clone isolation 2025-May-21, Nature biotechnology IF:33.1Q1 DOI:10.1038/s41587-025-02649-1 PMID:40399693	research paper	介绍了一种名为CloneSelect的多界遗传条形码系统，用于从复杂细胞群中精确分离目标克隆	开发了一种通过CRISPR碱基编辑触发目标克隆表达报告基因的新方法，实现了对特定表型或基因型克隆的精确分离	未提及具体的技术限制或应用范围限制	开发一种能够从复杂细胞群中精确分离目标克隆的技术	人类胚胎肾293T细胞、小鼠胚胎干细胞、人类多能干细胞、酵母细胞和细菌细胞	基因编辑技术	NA	CRISPR base editing, single-cell RNA sequencing	NA	基因序列数据	多种细胞类型（人类胚胎肾293T细胞、小鼠胚胎干细胞、人类多能干细胞、酵母细胞和细菌细胞）
1555	2025-05-23	Synergistic effects of PA (S184N) and PB2 (E627K) mutations on the increased pathogenicity of H3N2 canine influenza virus infections in mice and dogs 2025-May-20, Journal of virology IF:4.0Q2 DOI:10.1128/jvi.01984-24 PMID:40183583	研究论文	本研究通过在小鼠体内连续传代H3N2犬流感病毒，建立了致死性感染模型，并揭示了PA(S184N)和PB2(E627K)突变协同增强病毒对狗和小鼠的致病性	首次揭示了PA(S184N)和PB2(E627K)突变在H3N2犬流感病毒中对哺乳动物适应性的协同作用，并通过单细胞RNA测序阐明了其逃避宿主抗病毒反应的机制	研究主要集中在小鼠和狗模型，对人类潜在风险的研究仍需进一步验证	阐明H3N2犬流感病毒适应哺乳动物的分子机制	H3N2犬流感病毒及其在小鼠和狗中的感染模型	病毒学	流感	单细胞RNA测序、病毒连续传代	动物感染模型	基因序列数据、病毒滴度数据	小鼠和狗的肺组织样本
1556	2025-05-23	Avian photoreceptor homologies and the origin of double cones 2025-May-19, Current biology : CB IF:8.1Q1 DOI:10.1016/j.cub.2025.02.040 PMID:40250431	research paper	该研究通过单细胞RNA测序技术探索了鸟类光感受器与其他脊椎动物光感受器的进化关系	揭示了鸟类双锥细胞（DC-P和DC-A）分别起源于祖先的红锥细胞和蓝锥细胞，并通过CRISPR介导的基因敲除验证了这一假设	研究仅在新孵化的鸡视网膜中进行，可能无法完全代表所有鸟类或其他脊椎动物的情况	探索鸟类光感受器与其他脊椎动物光感受器的进化关系	鸟类视网膜中的光感受器细胞	进化生物学	NA	单细胞RNA测序（scRNA-seq），CRISPR介导的基因敲除	NA	RNA测序数据	新孵化的鸡视网膜细胞
1557	2025-05-23	Mucinous breast cancer organoids: an in vitro research model 2025-May-19, Discover oncology IF:2.8Q2 DOI:10.1007/s12672-025-02586-0 PMID:40388071	research paper	该研究建立了源自患者的黏液性乳腺癌类器官模型，用于临床药物筛选和科学研究	首次报道了黏液性乳腺癌类器官模型，并验证了其在早期传代中与原组织相似的特性	研究仅基于一名患者的样本，样本量有限	开发一种可靠的体外模型以解决纯黏液性乳腺癌的异质性问题	纯黏液性乳腺癌患者的手术肿瘤样本	digital pathology	breast cancer	single-cell RNA-Seq, histological staining, drug testing	organoid model	RNA sequencing data, histological images	1名64岁中国女性患者的肿瘤样本
1558	2025-05-23	Brain tumors induce immunoregulatory dendritic cells in draining lymph nodes that can be targeted by OX40 agonist treatment 2025-May-19, Journal for immunotherapy of cancer IF:10.3Q1 DOI:10.1136/jitc-2025-011548 PMID:40389372	research paper	该研究探讨了脑肿瘤引流淋巴结中免疫调节性树突状细胞的作用及其通过OX40激动剂治疗的潜在靶向性	揭示了脑肿瘤引流淋巴结中树突状细胞（DC-c）独特的免疫调节功能，并发现OX40信号通路在调节这些细胞功能中的关键作用	研究主要基于小鼠模型，结果在人类中的适用性尚需进一步验证	研究脑肿瘤免疫微环境中树突状细胞的免疫调节功能及其治疗潜力	小鼠模型中的胶质瘤和淋巴瘤	免疫学	脑肿瘤	高分辨率流式细胞术、单细胞RNA测序	小鼠模型	细胞和分子数据	NA
1559	2025-05-23	Single-cell RNA-sequencing reveals early mitochondrial dysfunction unique to motor neurons shared across FUS- and TARDBP-ALS 2025-May-19, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-025-59679-1 PMID:40389397	研究论文	通过单细胞RNA测序技术，研究了FUS和TARDBP基因突变导致的肌萎缩侧索硬化症（ALS）中运动神经元特异性线粒体功能障碍的共享机制	揭示了FUS和TARDBP突变导致的ALS中运动神经元特异性线粒体功能障碍的共享机制，并发现这些机制与蛋白质错误定位无关	研究基于诱导多能干细胞衍生的神经元模型，可能与体内真实情况存在差异	探究FUS和TARDBP基因突变导致ALS的选择性运动神经元退化的共同病理机制	携带FUS P525L、FUS R495X、TARDBP M337V突变或FUS敲除的诱导多能干细胞衍生的神经元	分子生物学	肌萎缩侧索硬化症	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	多种基因编辑的诱导多能干细胞系
1560	2025-05-23	A CRISPR/Cas9-based enhancement of high-throughput single-cell transcriptomics 2025-May-19, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-025-59880-2 PMID:40389438	研究论文	介绍了一种名为scCLEAN的分子方法，利用CRISPR/Cas9技术优化单细胞RNA测序（scRNAseq），以提高对低丰度转录本的检测能力	首次将CRISPR/Cas9技术应用于单细胞RNA测序文库的全局重组，显著提高了对低丰度转录本的检测能力	在某些生物背景下应用可能不理想，具体适用范围需要进一步验证	解决单细胞RNA测序中高丰度转录本掩盖低丰度转录本检测的问题	异质性免疫细胞和同质性血管平滑肌细胞	基因组学	NA	CRISPR/Cas9, scRNAseq, 单细胞MAS-Seq	NA	RNA测序数据	多种人类组织和细胞类型