单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27747 篇文献，本页显示第 15521 - 15540 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 15521 | 2024-08-07 |
Developmental trajectory of prehematopoietic stem cell formation from endothelium
2020-08-13, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2020004801
PMID:32392346
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研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序和单细胞转座酶可及染色质测序技术，探索了从小鼠胚胎尾部动脉的血管内皮细胞到造血干细胞前体的发育轨迹 | 首次识别出从内皮细胞到造血干细胞前体的连续发育轨迹，并定义了一个新的中间阶段——pre-HE细胞，该阶段具有特定的染色质可及性和转录因子富集 | NA | 探究造血干细胞前体形成的细胞和分子转变过程 | 小鼠胚胎的尾部动脉（背主动脉、脐动脉、卵黄动脉）中的细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序，单细胞转座酶可及染色质测序 | NA | 细胞 | 约40,000个细胞从小鼠胚胎的9.5天到11.5天 |
| 15522 | 2024-08-07 |
Transcriptional dynamics of pluripotent stem cell-derived endothelial cell differentiation revealed by single-cell RNA sequencing
2020-03-01, European heart journal
IF:37.6Q1
DOI:10.1093/eurheartj/ehz351
PMID:31242503
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术揭示了人胚胎干细胞衍生的内皮细胞在定向分化过程中的转录动态 | 发现了内皮细胞和间充质细胞谱系的分化过程中的转录分支以及新的转录特征 | NA | 探索从多能干细胞到内皮细胞分化的转录景观和细胞动态 | 人胚胎干细胞衍生的内皮细胞及其与成熟内皮细胞的比较 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 总共105,727个细胞进行了单细胞RNA测序分析 |
| 15523 | 2024-08-07 |
Therapy-induced mutations drive the genomic landscape of relapsed acute lymphoblastic leukemia
2020-01-02, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2019002220
PMID:31697823
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研究论文 | 研究急性淋巴细胞白血病（ALL）复发机制，通过全基因组测序和超深度测序分析复发特异性体细胞变异 | 发现了两种新的复发特异性突变特征，其中一种与硫嘌呤治疗有关，这些特征在非ALL的复发样本和泛癌诊断样本中未见 | 研究主要集中在特定基因和突变特征上，可能未涵盖所有影响ALL复发的因素 | 探究急性淋巴细胞白血病复发机制及其与治疗诱导突变的关系 | 急性淋巴细胞白血病患者的诊断-复发-胚系三联体和连续样本 | 数字病理学 | 急性淋巴细胞白血病 | 全基因组测序，超深度测序 | 数学模型 | 基因组数据 | 103个诊断-复发-胚系三联体和16名患者的208个连续样本 |
| 15524 | 2024-08-07 |
Beyond Fibroblast Heterogeneity: What Single-Cell RNA Sequencing Tells Us
2019-Jul, American journal of respiratory cell and molecular biology
IF:5.9Q1
DOI:10.1165/rcmb.2019-0120ED
PMID:30978296
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 15525 | 2024-08-07 |
A cloning and expression system to probe T-cell receptor specificity and assess functional avidity to neoantigens
2018-11-01, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood-2018-04-843763
PMID:30150207
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研究论文 | 本文开发了一种简化的方法，通过按需克隆和表达T细胞受体（TCR）并针对候选抗原进行筛选，来匹配TCR序列与相应抗原，以评估发现的TCR的特异性 | 本文提出的系统能够快速评估重建TCR的抗原特异性和功能亲和力，可用于监测抗原特异性T细胞反应，并可能指导基于T细胞的免疫疗法的设计 | NA | 提高对抗原-T细胞受体（TCR）相互作用的理解，以生成强效的抗肿瘤免疫反应 | T细胞受体的特异性和功能亲和力 | 免疫学 | 黑色素瘤，慢性淋巴细胞白血病 | 单细胞测序技术 | NA | TCR序列 | 来自接受个性化新抗原疫苗治疗的黑色素瘤患者的样本 |
| 15526 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptomics is revolutionizing the improvement of plant biotechnology research: recent advances and future opportunities
2024-Mar, Critical reviews in biotechnology
IF:8.1Q1
DOI:10.1080/07388551.2023.2165900
PMID:36775666
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评论 | 单细胞转录组学的现代进展促进了植物生物技术研究 | 提供了单细胞转录组学在植物中的最新进展，并探讨了其未来研究的潜力 | 分析了单细胞技术面临的各种技术障碍和固有限制 | 探讨单细胞转录组学在植物生物技术中的应用和发展 | 植物的单细胞转录组数据 | 植物生物学 | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | 转录组数据 | NA |
| 15527 | 2024-08-05 |
Skin single-cell transcriptomics reveals a core of sebaceous gland-relevant genes shared by mice and humans
2024-Feb-03, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-024-10008-8
PMID:38310227
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研究论文 | 本研究揭示了小鼠和人类皮肤中与皮脂腺相关的基因的核心。 | 首次通过单细胞转录组学方法比较了小鼠和人类皮脂腺相关基因的表达差异，发现种间间存在显著差异。 | 研究中观察到在小鼠和人类样本中，皮脂腺特有转录本的重叠极少，可能限制了其跨物种的比较分析。 | 探索并比较小鼠和人类皮脂腺中特有的基因表达模式。 | 小鼠和人类的皮肤样本，通过单细胞RNA测序进行分析。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠与人类皮肤样本 |
| 15528 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptome analyses reveal critical regulators of spermatogonial stem cell fate transitions
2024-Feb-03, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-024-10072-0
PMID:38310206
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了精原干细胞命运转变的关键调控因子 | 本研究首次描述了静止状态的精原干细胞亚群，即Eomes+精原细胞，并提供了精原干细胞命运决定的动态转录图谱 | NA | 探索未分化精原细胞亚群的分子特征和关键调控因子 | 精原干细胞及其前体细胞的命运转变 | NA | NA | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 从小鼠中分离的未分化精原细胞 |
| 15529 | 2024-08-05 |
Comparison of preparation methods of rat kidney single-cell suspensions
2024-02-02, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-53270-2
PMID:38307992
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研究论文 | 本文探讨了一种名为逐步酶消化（StE）的方法以制备大鼠整个肾脏组织的单细胞悬液。 | StE方法在收获率、单细胞率和细胞活性方面优于传统的机械研磨法和简单酶消化法。 | 文章没有提到本文方法的临床应用或长期效果的评估。 | 研究旨在提高大鼠肾脏单细胞悬液的制备效率与质量。 | 研究对象为大鼠的整个肾脏组织。 | 数字病理学 | NA | 酶消化 | NA | NA | NA |
| 15530 | 2024-08-05 |
Analysis of brain and blood single-cell transcriptomics in acute and subacute phases after experimental stroke
2024-Feb, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-023-01711-x
PMID:38177281
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研究论文 | 本研究探讨了缺血性中风后脑部和血液单细胞转录组学的变化 | 首次揭示了缺血性中风后微胶质细胞、单核细胞来源的巨噬细胞和中性粒细胞的时间动态和多样性 | 对外周白细胞和脑内常驻细胞的具体动态变化尚不够了解 | 研究缺血性中风后脑细胞和血细胞的转录组动态 | 小鼠在缺血性中风后2天和14天的脑和血液细胞 | 数字病理学 | 脑卒中 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 小鼠样本，具体数量未提供 |
| 15531 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptomics analysis of cellular heterogeneity and immune mechanisms in neurodegenerative diseases
2024-Feb, The European journal of neuroscience
DOI:10.1111/ejn.16242
PMID:38221677
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综述 | 本文章主要分析了单细胞转录组学在神经退行性疾病中的细胞异质性和免疫机制方面的应用 | 强调了单细胞转录组技术在揭示神经退行性疾病中细胞异质性和免疫机制方面的重要性 | 未明确提及具体的实验研究或数据支持 | 探讨神经退行性疾病的发病机制及开发新的治疗方法 | 神经退行性疾病中的单细胞转录组和免疫细胞 | 数字病理 | 神经退行性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 15532 | 2024-08-07 |
Association of HBsAg levels with differential gene expression in NK, CD8 T, and memory B cells in treated patients with chronic HBV
2024-Feb, JHEP reports : innovation in hepatology
IF:9.5Q1
DOI:10.1016/j.jhepr.2023.100980
PMID:38314025
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研究论文 | 本研究探讨了在慢性HBV感染治疗过程中，循环HBsAg水平对NK、CD8 T和记忆B细胞基因表达的影响。 | 首次发现HBsAg对NK、CD8 T和记忆B细胞亚群在血液和肝脏中有特定影响。 | 研究样本量较小，且仅限于接受NUC治疗的慢性HBV感染患者。 | 旨在研究高和低循环HBsAg水平对免疫调节的影响，以增进对HBV免疫反应的理解。 | 慢性HBV感染治疗中的NK、CD8 T和记忆B细胞。 | 免疫学 | 肝炎 | 10x Genomics单细胞RNA测序 | NA | RNA | 18名接受tenofovir/entecavir治疗的慢性HBV感染患者 |
| 15533 | 2024-08-05 |
The molecular mechanism of "Dahuang-Shengjiang-Banxia decoction" in the treatment of diabetic kidney disease was verified based on network pharmacology and molecular docking
2024-Jan-30, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e24776
PMID:38312712
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研究论文 | 探索大黄生姜半夏汤在糖尿病肾病中的分子机制 | 利用网络药理学和分子对接技术，揭示了大黄生姜半夏汤对糖尿病肾病的多成分、多途径和多靶点效应 | 未提及具体的临床试验数据支持所述结果 | 研究大黄生姜半夏汤治疗糖尿病肾病的分子机制 | 大黄生姜半夏汤及其在糖尿病肾病中的有效成分和靶点 | 数字药理学 | 糖尿病肾病 | 网络药理学、分子对接 | NA | 靶点数据、成分数据 | 共筛选出177种大黄生姜半夏汤成分和2906种糖尿病肾病靶点 |
| 15534 | 2024-08-07 |
Taste receptor type 1 member 3 is required for the fertility of male mice
2024-Jan-30, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e24577
PMID:38312691
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research paper | 本文研究了味觉受体类型1成员3（TAS1R3）在雄性小鼠生育中的作用 | 首次揭示了TAS1R3通过PKA/CREB/StAR信号通路在雄性生育中的关键作用 | NA | 探究TAS1R3对雄性小鼠生殖功能的影响 | 野生型和敲除（KO）小鼠 | NA | 男性不育 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 野生型和敲除小鼠 |
| 15535 | 2024-08-05 |
Cebp1 and Cebpβ transcriptional axis controls eosinophilopoiesis in zebrafish
2024-Jan-27, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-45029-0
PMID:38280871
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研究论文 | 本研究分析了斑马鱼中嗜酸性粒细胞的分化、分布和调节 | 建立了一个特异性标记嗜酸性粒细胞谱系的斑马鱼报告线，并揭示了Cebp1和Cebpβ转录轴在嗜酸性粒细胞分化中的作用 | 未明确提到本研究的限制 | 研究嗜酸性粒细胞的发育模式和调节机制 | 斑马鱼嗜酸性粒细胞谱系及其发育 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 使用了特异性标记的嗜酸性粒细胞谱系细胞 |
| 15536 | 2024-08-05 |
Tumor necrosis factor-related apoptosis-inducing ligand (TRAIL) deletion in myeloid cells augments cholestatic liver injury
2024-01-25, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-52710-3
PMID:38273071
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研究论文 | 本文探讨了肿瘤坏死因子相关的凋亡诱导配体(TRAIL)在骨髓细胞中的缺失如何加重胆汁淤积性肝损伤。 | 研究发现TRAIL源自招募的巨噬细胞，并抑制DR细胞扩展，从而限制胆汁淤积性肝损伤。 | 本文并未涉及湿剂量的不同或不同动物模型的比较，可能限制了其结果的广泛适用性。 | 研究TRAIL在骨髓细胞中的作用及其在胆汁淤积性肝损伤中的影响。 | 涉及Wild type (WT)、Trail和骨髓特异性Trail缺失的小鼠模型。 | 数字病理学 | 肝病 | 高维量子显微技术，空间转录组分析 | 小鼠模型 | 生物样本 | 包括Wild type、Trail和Trail缺失小鼠的多组小鼠 |
| 15537 | 2024-08-05 |
scCAN: Clustering With Adaptive Neighbor-Based Imputation Method for Single-Cell RNA-Seq Data
2024 Jan-Feb, IEEE/ACM transactions on computational biology and bioinformatics
DOI:10.1109/TCBB.2023.3337231
PMID:38285569
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研究论文 | 提出了一种新的适应性邻域聚类基础的缺失值插补方法scCAN，用于单细胞RNA测序数据 | 本研究创新性地设计了一个方法，通过不断更新细胞相似性信息来改善缺失值的插补 | 未提及具体的局限性 | 研究单细胞RNA测序数据中的细胞异质性 | 使用模拟和真实单细胞RNA测序数据进行研究 | 计算机视觉 | NA | RNA-seq | NA | RNA测序数据 | 四个模拟和八个真实的单细胞RNA-seq数据 |
| 15538 | 2024-08-05 |
Presence of onco-fetal neighborhoods in hepatocellular carcinoma is associated with relapse and response to immunotherapy
2024-Jan, Nature cancer
IF:23.5Q1
DOI:10.1038/s43018-023-00672-2
PMID:38168935
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研究论文 | 本文研究了肝细胞癌中的肿瘤生态系统的癌胎编程及其与免疫治疗反应和复发的关系 | 首次提出POSTN外源性基质癌相关成纤维细胞作为关键的癌胎相互作用中心，并探讨其在肝细胞癌复发和免疫治疗反应中的影响 | 未明确阐述样本量与研究设计的具体限制 | 研究肝细胞癌中的癌胎邻域与复发及免疫治疗反应的关系 | 研究特定细胞亚群，包括POSTN CAFs、FOLR2巨噬细胞和PLVAP内皮细胞在肝细胞癌复发和免疫治疗反应中的作用 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序、空间转录组学、整体RNA测序 | NA | NA | NA |
| 15539 | 2024-08-05 |
An emerging biomarker for the diagnosis and treatment of esophageal squamous cell carcinoma - Aurora A
2024-01, Computers in biology and medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.compbiomed.2023.107759
PMID:38043467
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研究论文 | 研究表明Aurora A在食管鳞状细胞癌中是一种潜在的预后和治疗生物标志物 | 本研究首次揭示了Aurora A在食管鳞状细胞癌中的作用及其对细胞增殖和药物敏感性的影响 | 本研究仅基于公共数据库的数据，可能存在数据集的局限性 | 探讨Aurora A在食管鳞状细胞癌中的分子机制及其作为生物标志物的潜力 | 研究对象为食管鳞状细胞癌患者的RNA-seq数据 | 数字病理学 | 食管癌 | RNA-seq | NA | 文本 | 来自公共数据库的RNA-seq数据集，具体样本量未明确提供 |
| 15540 | 2024-08-07 |
Genetic variants in BCL-2 family genes influence the risk of non-syndromic cleft lip with or without cleft palate
2024-Jan, Birth defects research
IF:1.6Q4
DOI:10.1002/bdr2.2288
PMID:38108593
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研究论文 | 本研究探讨了BCL-2家族基因中的遗传变异与非综合征性唇裂伴或不伴腭裂风险之间的关联 | 发现了位于增强子区域的rs3943258与非综合征性唇裂伴或不伴腭裂的风险相关，并表现出BCL2的eQTL效应 | NA | 研究BCL-2家族基因中的遗传变异与非综合征性唇裂伴或不伴腭裂风险之间的关联 | BCL-2家族基因中的遗传变异与非综合征性唇裂伴或不伴腭裂风险 | 遗传学 | 口腔疾病 | 多标记基因组注释的多标记分析（Multi-marker Analysis of GenoMic Annotation）、批量RNA测序、单细胞RNA测序 | 逻辑回归模型 | 基因组数据、RNA测序数据 | 第一阶段队列包括565例病例和1269例对照，候选SNPs通过额外的dbGaP病例-父母三联体进行复制 |