单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 28135 篇文献，本页显示第 15521 - 15540 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 15521 | 2024-08-05 |
Type I interferon signature and cycling lymphocytes in macrophage activation syndrome
2023-11-15, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI165616
PMID:37751296
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研究论文 | 本文研究了与Still病相关的巨噬细胞激活综合征（MAS）中的I型干扰素特征和循环淋巴细胞。 | 该研究揭示了MAS患者中I型干扰素过量产生与IL-15的协同作用，导致CD38+HLA-DR+循环淋巴细胞的生成，这为理解MAS的免疫机制提供了新见解。 | 该研究主要基于对外周血单核细胞的分析，尚需进一步验证其在不同患者群体中的普遍性。 | 旨在更深入地理解Still病和巨噬细胞激活综合征的免疫学特征。 | 研究对象为健康对照组与有或没有MAS的Still病患者。 | 数字病理学 | Still病 | bulk RNA-Seq, single-cell RNA-Seq, 质量细胞术, 流式细胞术 | NA | RNA数据 | 超过65,000个PBMC样本 |
| 15522 | 2024-08-05 |
SnapATAC2: a fast, scalable and versatile tool for analysis of single-cell omics data
2023-Sep-15, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.09.11.557221
PMID:37745443
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研究论文 | 本文介绍了一种新算法SnapATAC2，用于单细胞组学数据的分析。 | 提出了一种快速非线性降维算法，能够高效捕捉单细胞组学数据的异质性，同时运行时间和内存使用与细胞数量线性相关。 | 未提及具体的限制 | 旨在提高对复杂组织中动态基因调控的理解。 | 分析单细胞组学数据，包括单细胞ATAC-seq和单细胞RNA-seq等。 | 单细胞组学 | NA | NA | NA | 单细胞组学数据 | 使用了多种单细胞组学数据类型 |
| 15523 | 2024-08-07 |
Plakoglobin is a mechanoresponsive regulator of naive pluripotency
2023-07-07, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-39515-0
PMID:37419903
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研究论文 | 本文研究了机械力对小鼠胚胎干细胞原始多能性的调控作用，特别是通过微流控技术调控细胞微环境，发现Plakoglobin在维持原始多能性中的关键作用 | 首次揭示了Plakoglobin作为机械敏感调节因子在原始多能性中的作用，并提供了一种研究体积限制对细胞命运转变影响的新范式 | NA | 探讨机械刺激如何转化为转录程序，以深入了解哺乳动物植入前发育的机制 | 小鼠胚胎干细胞 | NA | NA | 微流控技术 | NA | 单细胞转录组 | NA |
| 15524 | 2024-08-05 |
New technologies to study helminth development and host-parasite interactions
2023-07, International journal for parasitology
IF:3.7Q1
DOI:10.1016/j.ijpara.2022.11.012
PMID:36931423
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综述 | 本文回顾了单细胞RNA测序在研究多细胞蠕虫和探讨宿主免疫细胞类型中的应用 | 引入了单细胞RNA测序技术，以更细致的方式分析寄生虫生物学和宿主免疫 | 在体内研究宿主与寄生虫的相互作用具挑战性 | 理解寄生虫的发展及其与宿主免疫反应的相互作用 | 多细胞蠕虫及其与宿主细胞之间的相互作用 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 15525 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptomics for the assessment of cardiac disease
2023-05, Nature reviews. Cardiology
DOI:10.1038/s41569-022-00805-7
PMID:36539452
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综述 | 本文综述了用于评估心脏疾病的单细胞转录组学的技术挑战和新发现 | 介绍了心脏不同细胞类型的新的转录组学发现，并讨论了单细胞数据与空间转录组学结合的高级应用 | 文章提到目前在细胞类型标注上存在共识与不一致，表明急需标准化 | 提高对心血管疾病机制的理解，以改善治疗策略和患者风险分层 | 心脏细胞类型的转录组学研究 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
| 15526 | 2024-08-05 |
Spatially Resolved Transcriptomics Deconvolutes Prognostic Histological Subgroups in Patients with Colorectal Cancer and Synchronous Liver Metastases
2023-04-14, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-22-2794
PMID:37057593
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研究论文 | 本研究确定了简单的组织学评估在预测结直肠癌和肝转移患者手术后结果中的实际应用 | 通过空间转录组学分析揭示了驱动不同预后表型的转录组程序 | 大规模转录组分析受到基质成分的干扰 | 研究结直肠癌和肝转移患者在同步切除后的预后预测 | 接受结直肠癌和肝转移同步切除手术的患者样本 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 空间转录组学 | NA | 组织样本 | 来自进行同步切除的患者的样本 |
| 15527 | 2024-08-05 |
Placental Inflammation Leads to Abnormal Embryonic Heart Development
2023-03-21, Circulation
IF:35.5Q1
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研究论文 | 本研究探讨了胎盘炎症如何导致异常的胚胎心脏发育 | 发现中性粒细胞驱动的胎盘炎症会导致胎盘发育不良和心脏功能障碍 | 未涉及更大样本量或不同物种的验证 | 探讨胎盘发育不良与先天性心脏病间的机制关系 | 使用小鼠模型研究妊娠期间的胎盘和胚胎心脏发育 | 数字病理学 | 先天性心脏病 | 流式细胞术、组织学、RNA测序 | NA | 组织样本 | 小鼠胚胎14.5天和出生后5天及28天的样本 |
| 15528 | 2024-08-07 |
Losartan controls immune checkpoint blocker-induced edema and improves survival in glioblastoma mouse models
2023-02-07, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2219199120
PMID:36724255
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研究论文 | 本文研究了免疫检查点抑制剂（ICBs）在胶质母细胞瘤小鼠模型中引起的脑水肿问题，并发现洛沙坦能够控制这种水肿并提高生存率。 | 首次发现洛沙坦能够预防ICB诱导的脑水肿，并重新编程肿瘤微环境，提高小鼠生存率。 | 研究主要在动物模型中进行，需要在临床试验中进一步验证。 | 探讨洛沙坦与ICBs联合使用在胶质母细胞瘤治疗中的效果及机制。 | 胶质母细胞瘤小鼠模型及脑水肿的控制。 | NA | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序、活体成像、CD8 T细胞阻断研究 | NA | 图像、基因表达数据 | 小鼠模型，具体数量未详细说明 |
| 15529 | 2024-08-04 |
A cellular hierarchy of Notch and Kras signaling controls cell fate specification in the developing mouse salivary gland
2023-01-23, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2022.12.009
PMID:36693323
|
研究论文 | 该文章探讨了小鼠唾液腺发育中Notch和Kras信号通路如何控制细胞命运规范。 | 研究首次揭示了在小鼠唾液腺发育过程中，Notch和Kras信号如何通过不同的表达影响细胞谱系的分离和管状模式的形成。 | 该研究主要专注于小鼠模型，尚需验证其在其他物种或人类中的适用性。 | 理解Notch和Kras信号在小鼠唾液腺发育中的作用及其对细胞命运的影响。 | 小鼠唾液腺发育中的细胞谱系及其信号通路。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 三维重构和细胞谱系追踪 | NA |
| 15530 | 2024-08-05 |
Spatial Transcriptomics in Kidney Tissue
2023, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-3179-9_17
PMID:37423994
|
研究论文 | 本文介绍了在肾脏组织中应用空间转录组测序(ST-seq)的方法 | 结合组织学与RNA测序，提供组织内转录组表达的空间背景信息 | 未提及具体的局限性 | 探索空间转录组测序在肾脏组织中的应用 | 小鼠和人类肾脏组织 | 数字病理学 | NA | 空间转录组测序 | NA | 组织样本 | 小鼠和人类肾脏组织样本 |
| 15531 | 2024-08-07 |
Imipridones affect tumor bioenergetics and promote cell lineage differentiation in diffuse midline gliomas
2022-09-01, Neuro-oncology
IF:16.4Q1
DOI:10.1093/neuonc/noac041
PMID:35157764
|
research paper | 研究伊米普利酮类药物对弥漫中线胶质瘤的肿瘤生物能量学和细胞谱系分化的影响 | 首次详细描述了ONC201及其衍生物ONC206在弥漫中线胶质瘤中的抗癌机制，包括对肿瘤细胞代谢和线粒体损伤的影响，以及诱导细胞谱系分化的能力 | NA | 探究伊米普利酮类药物ONC201和ONC206在弥漫中线胶质瘤中的抗癌机制 | 弥漫中线胶质瘤的细胞和动物模型，以及患者样本 | digital pathology | 脑癌 | Seahorse XF Cell Mito Stress Test, MitoSOX, TMRM assay, 电子显微镜成像, bulk和单细胞RNA-seq | NA | 细胞, 动物模型, 患者样本 | 体外模型18个, 体内模型包括小鼠和斑马鱼, 患者样本20个 |
| 15532 | 2024-08-07 |
Targeting macrophages for enhancing CD47 blockade-elicited lymphoma clearance and overcoming tumor-induced immunosuppression
2022-06-02, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2021013901
PMID:35134139
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研究论文 | 本研究通过高通量筛选发现紫杉醇能增强巨噬细胞对非霍奇金淋巴瘤的吞噬能力，从而提高CD47阻断疗法的疗效 | 首次发现紫杉醇能直接增强巨噬细胞的吞噬能力，并通过单细胞RNA测序揭示了其作用机制 | 研究主要基于实验模型，尚未在临床试验中验证 | 探索通过调节肿瘤微环境增强淋巴瘤治疗效果的新策略 | 非霍奇金淋巴瘤及其相关巨噬细胞 | 肿瘤学 | 非霍奇金淋巴瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 15533 | 2024-08-07 |
Workflow Optimization for Identification of Female Germline or Oogonial Stem Cells in Human Ovarian Cortex Using Single-Cell RNA Sequence Analysis
2022-05-27, Stem cells (Dayton, Ohio)
DOI:10.1093/stmcls/sxac015
PMID:35263439
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研究论文 | 本文通过优化单细胞RNA测序分析的工作流程参数，在成人人类卵巢皮质组织中识别出具有OSCs基因表达特征的稀有生殖系细胞，并探讨了PVCs与生殖细胞的区分问题 | 通过优化分析工作流程参数，成功在成人人类卵巢皮质组织中识别出具有OSCs特征的稀有生殖系细胞，并揭示了PVCs与生殖细胞在scRNA-seq中的不同基因表达模式 | NA | 优化单细胞RNA测序分析流程，以准确识别成人人类卵巢皮质组织中的女性生殖系或卵原干细胞 | 成人人类卵巢皮质组织中的女性生殖系或卵原干细胞 | 生殖生物学 | NA | 单细胞RNA测序分析（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 成人人类卵巢皮质组织样本 |
| 15534 | 2024-08-07 |
Cross-tissue immune cell analysis reveals tissue-specific features in humans
2022-05-13, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.abl5197
PMID:35549406
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和VDJ测序技术，分析了来自12名成年捐赠者的16种组织的免疫细胞，揭示了组织特异性特征 | 开发了CellTypist工具，用于快速精确的细胞类型注释，并发现了先前未被重视的组织特异性特征和T细胞及B细胞的克隆结构 | NA | 揭示人体组织中免疫细胞的组织特异性特征 | 16种组织的免疫细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序, VDJ测序 | 机器学习 | 细胞数据 | 约360,000个细胞 |
| 15535 | 2024-08-07 |
Müller Glial Expression of REDD1 Is Required for Retinal Neurodegeneration and Visual Dysfunction in Diabetic Mice
2022-05-01, Diabetes
IF:6.2Q1
DOI:10.2337/db21-0853
PMID:35167652
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研究论文 | 研究探讨了REDD1蛋白在糖尿病小鼠视网膜病变中的作用，特别是在Müller胶质细胞中的表达。 | 首次揭示了Müller胶质细胞中REDD1的表达对糖尿病引起的视网膜病变、神经退行性和视觉功能障碍的关键作用。 | 研究仅限于小鼠模型，需要进一步的人体研究来验证这些发现。 | 探究REDD1在糖尿病视网膜病变中的作用及其机制。 | 糖尿病小鼠的视网膜和人类Müller细胞在高糖条件下的反应。 | NA | 糖尿病 | 单细胞测序 | NA | 蛋白质表达数据 | 包括糖尿病控制小鼠和REDD1-mgKO小鼠的视网膜样本，以及暴露于高糖条件下的人类Müller细胞培养物。 |
| 15536 | 2024-08-07 |
Cellular heterogeneity of human fallopian tubes in normal and hydrosalpinx disease states identified using scRNA-seq
2022-04-11, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2022.02.017
PMID:35320732
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术分析了来自正常和输卵管积水疾病状态的人类输卵管细胞的异质性 | 首次构建了包含12种主要细胞类型的输卵管细胞图谱，并识别出四种纤毛和六种非纤毛分泌上皮亚型 | 仅分析了四名健康和两名输卵管积水患者的样本，样本量有限 | 探究输卵管稳态在正常发育和疾病中的细胞异质性 | 人类输卵管细胞 | 数字病理学 | 不孕症 | scRNA-seq | NA | 细胞数据 | 59,738个细胞来自四名健康受试者，17,798个细胞来自两名输卵管积水患者 |
| 15537 | 2024-08-07 |
IL-22 Plays a Dual Role in the Amniotic Cavity: Tissue Injury and Host Defense against Microbes in Preterm Labor
2022-04-01, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.4049/jimmunol.2100439
PMID:35304419
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研究论文 | 本研究探讨了IL-22在早产中对母胎免疫的作用，发现IL-22 T细胞在早产妇女的母胎界面富集，并在体内外实验中展示了IL-22在早产中的双重作用：组织损伤和宿主防御。 | 首次展示了IL-22 T细胞在早产妇女母胎界面的富集，并通过体内外实验证实了IL-22在早产中的双重作用。 | 研究主要集中在小鼠模型和体外人系统，可能需要进一步的人体临床研究来验证这些发现。 | 探讨IL-22在晚期妊娠中母胎免疫的作用及其在早产中的作用机制。 | IL-22 T细胞在早产妇女母胎界面的分布及其在早产中的作用。 | 免疫学 | 早产 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 涉及早产妇女和小鼠的母胎组织样本 |
| 15538 | 2024-08-07 |
Neuroinflammation creates an immune regulatory niche at the meningeal lymphatic vasculature near the cribriform plate
2022-04, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-022-01158-6
PMID:35347285
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研究论文 | 研究发现在神经炎症期间，筛板附近的脑膜淋巴管通过淋巴管生成来排出多余液体，并可能获得改变的表型以调节免疫。 | 首次报道了神经炎症期间，筛板附近的脑膜淋巴管上调与抗原呈递相关的基因，如主要组织相容性复合体II类、粘附分子和免疫调节分子，形成一个免疫调节微环境。 | NA | 探讨神经炎症期间脑膜淋巴管在免疫调节中的作用。 | 健康和实验性自身免疫性脑脊髓炎（EAE）小鼠模型中筛板附近的脑膜淋巴管。 | NA | 神经炎症 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 健康和EAE小鼠模型的脑膜淋巴管样本 |
| 15539 | 2024-08-07 |
Differential assembly diversifies GABAA receptor structures and signalling
2022-04, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-022-04517-3
PMID:35355020
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研究论文 | 本文使用低温电子显微镜研究了由α4、β3和δ亚基组装的外突触GABAA受体的结构，以及包含γ2亚基的对应物，发现两种具有不同化学计量和排列的受体亚型，这些亚型与先前观察到的突触α1-包含受体不同 | 本文首次提供了结构和功能证据，表明选定的GABAR排列可以作为同时响应GABA和组胺两种神经递质的巧合检测器 | NA | 探讨GABAA受体的组装原理及其对GABA能信号传导的影响 | GABAA受体的结构和功能 | 神经科学 | NA | 低温电子显微镜 | NA | 结构数据 | NA |
| 15540 | 2024-08-07 |
Using topic modeling to detect cellular crosstalk in scRNA-seq
2022-04, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1009975
PMID:35395014
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研究论文 | 本文介绍了一种基于隐狄利克雷分配（LDA）的新方法，用于检测scRNA-seq数据中的细胞间相互作用相关基因变化 | 该方法不依赖于现有的生物学知识数据库，而是通过分析物理相互作用的细胞数据来检测基因表达变化 | 文章未明确提及该方法的局限性 | 开发一种新的方法来检测scRNA-seq数据中的细胞间相互作用 | 研究细胞间相互作用对基因表达的影响 | 单细胞测序 | NA | scRNA-seq | LDA | 基因表达数据 | 涉及两个物理相互作用细胞的数据集和一个标准液滴法生成的数据集 |