单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27435 篇文献，本页显示第 15521 - 15540 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 15521 | 2024-08-05 |
Personalized Immunotherapy of Patients: Defining by Single-cell RNA-seq with Artificial Intelligence
2023-Aug, Medical research archives
DOI:10.18103/mra.v11i8.4293
PMID:37736242
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研究论文 | 这篇文章探讨了使用单细胞RNA测序和人工智能来个性化患者的免疫疗法 | 结合机器学习模型的单细胞RNA测序数据，用于评估个体患者的最佳免疫疗法和药物组合 | 研究中可能缺乏与其他疗法直接比较的长期临床数据 | 旨在提高临床免疫疗法的有效性，降低不良反应和临床应用成本 | 研究了肿瘤浸润淋巴细胞的基因组学，包括详述的单细胞RNA-seq数据 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | 机器学习模型 | 基因组数据 | 包括多种免疫细胞治疗相关的数据和临床试验数据 |
| 15522 | 2024-08-05 |
Spatial Omics Driven Crossmodal Pretraining Applied to Graph-based Deep Learning for Cancer Pathology Analysis
2023-Jul-31, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.07.30.551187
PMID:37577686
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研究论文 | 本文探讨了空间组学数据与图基深度学习在癌症病理分析中的结合 | 提出了一种对比性交叉模态预训练机制，利用空间转录组学数据来生成深度学习模型 | 未提及具体的样本数量和数据来源限制 | 旨在改善图基深度学习模型在病理切片分析中的表现 | 利用空间转录组学数据与组织学成像数据进行癌症分期和预后预测 | 数字病理学 | 癌症 | 空间转录组学 | 图基深度学习 | 图像 | NA |
| 15523 | 2024-08-05 |
A spatially resolved single cell genomic atlas of the adult human breast
2023-Apr-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.04.22.537946
PMID:37163043
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研究论文 | 本文构建了一个成人人的乳腺单细胞基因组图谱 | 首次以单细胞和空间分辨率构建了全面的人类乳腺细胞图谱 | 对非上皮细胞类型的研究仍然相对不足 | 研究成人正常乳腺组织，以了解乳腺生物学和相关疾病状态 | 535,941个细胞和120,024个细胞核的数据来自62名和20名女性 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞转录组测序 | NA | 细胞数据 | 535,941个细胞和120,024个细胞核 |
| 15524 | 2024-08-07 |
Gastric Stem Cell Biology and Helicobacter pylori Infection
2023, Current topics in microbiology and immunology
DOI:10.1007/978-3-031-47331-9_1
PMID:38231213
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研究论文 | 研究幽门螺杆菌感染对胃干细胞生物学的影响及其在胃癌发展中的作用 | 利用细胞系追踪、类器官和单细胞RNA测序技术，深入了解正常稳态和感染状态下上皮和间质细胞亚型的分子“身份”，并揭示了幽门螺杆菌感染下干细胞（微环境）行为的原理 | NA | 探讨幽门螺杆菌感染如何影响胃干细胞行为及其在胃癌发展中的作用 | 胃干细胞、幽门螺杆菌感染、胃癌发展 | 数字病理学 | 胃癌 | 细胞系追踪、类器官、单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | NA |
| 15525 | 2024-08-07 |
Targeting epigenetic modifiers to reprogramme macrophages in non-resolving inflammation-driven atherosclerosis
2021-Sep, European heart journal open
DOI:10.1093/ehjopen/oeab022
PMID:35919269
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综述 | 本文综述了表观遗传修饰在非消退性炎症驱动下的动脉粥样硬化中重编程巨噬细胞的作用 | 探讨了表观遗传修饰在动脉粥样硬化和相关炎症中的作用，并提出了针对这些修饰的潜在抗炎治疗策略 | 对表观遗传修饰在动脉粥样硬化中的研究仍处于初级阶段 | 探讨表观遗传修饰在动脉粥样硬化发病和进展中非控制性炎症的机制 | 动脉粥样硬化中的巨噬细胞及其表观遗传修饰 | 心血管疾病 | 心血管疾病 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 15526 | 2024-08-05 |
Spatial transcriptomic interrogation of the tumour-stroma boundary in a 3D engineered model of ameloblastoma
2024-Feb, Materials today. Bio
DOI:10.1016/j.mtbio.2023.100923
PMID:38226014
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研究论文 | 本文研究了在3D设计的肿瘤-基质模型中，肿瘤-基质边界的空间转录组学特征 | 首次展示了肿瘤细胞基因表达如何受到不同基质细胞存在的影响 | 研究可能限制在特定类型的基质细胞与肿瘤细胞之间的相互作用 | 研究肿瘤微环境中基质细胞对肿瘤行为的影响 | 使用工程化的多腔肿瘤体进行研究，以探讨不同基质对肿瘤细胞的影响 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | 多腔肿瘤体 | 基因表达数据 | 多个工程化肿瘤模型样本 |
| 15527 | 2024-08-05 |
SORCS2 activity in pancreatic α-cells safeguards insulin granule formation and release from glucose-stressed β-cells
2024-Jan-19, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2023.108725
PMID:38226160
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研究论文 | 研究了SORTS2在胰腺α细胞中的作用，保护胰腺β细胞在葡萄糖压力下的胰岛素颗粒形成和释放 | 首次揭示SORTS2在胰腺中的作用及其对胰腺β细胞的保护机制 | 研究仅限于SORCS2缺失小鼠，可能无法完全代表人类胰腺功能 | 探讨SORTS2在胰腺尤其是胰岛α细胞中的生理功能 | SORCS2缺失小鼠及其胰腺组织 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组分析 | NA | 胰腺组织 | SORCS2缺失小鼠的胰腺组织 |
| 15528 | 2024-08-05 |
Bisphenol A Analogues Induce Neuroendocrine Disruption via Gut-Brain Regulation in Zebrafish
2024-Jan-16, Environmental science & technology
IF:10.8Q1
DOI:10.1021/acs.est.3c05282
PMID:38165294
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研究论文 | 本研究探讨了双酚A及其类似物通过肠脑调节导致神经内分泌干扰的机制 | 揭示了双酚G和双酚AF对神经内分泌系统的不同影响机制 | 尚未充分了解这些物质在更复杂生物系统中的长期影响 | 揭示双酚化合物对神经内分泌功能的影响机制 | 斑马鱼胚胎和转基因斑马鱼 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 生物学数据 | 斑马鱼胚胎和幼鱼，具体数量未说明 |
| 15529 | 2024-08-07 |
Single-cell insights into development of the bovine placenta†
2024-Jan-13, Biology of reproduction
IF:3.1Q2
DOI:10.1093/biolre/ioad123
PMID:37707543
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析（scRNA-seq）探索了牛胎盘发育的细胞和分子机制 | 首次通过单细胞转录组分析揭示了牛胎盘发育过程中的细胞类型及其发育轨迹，并识别了调控胎盘发育的关键转录因子 | 研究仅限于特定发育阶段的样本，可能无法全面反映整个胎盘发育过程 | 揭示牛胎盘发育的细胞和分子机制 | 牛胎盘的细胞类型及其发育轨迹 | 数字病理学 | NA | scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | 17天、24天、30天和50天的牛胚胎样本，每组3-4个样本 |
| 15530 | 2024-08-05 |
CROST: a comprehensive repository of spatial transcriptomics
2024-Jan-05, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkad782
PMID:37791883
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研究文章 | 本文介绍了CROST，一个综合的空间转录组数据库 | 建立了一个包括182个空间转录组数据集的数据库，并提供在线工具供用户分析数据 | 当前数据库的可用性有限，可能无法涵盖所有相关数据 | 旨在提供一个全面的平台来访问和分析空间转录组数据 | 涉及来自不同物种、器官和疾病的高质量空间转录组样本 | 数字病理学 | 肿瘤 | 空间转录组测序 | NA | 转录组数据 | 包含182个空间转录组数据集和1033个子数据集 |
| 15531 | 2024-08-07 |
scPlantDB: a comprehensive database for exploring cell types and markers of plant cell atlases
2024-Jan-05, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkad706
PMID:37638765
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research paper | 本文介绍了一个名为scPlantDB的植物单细胞数据库的构建方法 | scPlantDB整合了来自17种植物的67个高质量数据集，约250万个细胞的单细胞转录组数据，提供了单细胞水平的基因表达交互可视化 | NA | 构建一个全面的植物单细胞数据库，以探索植物细胞图谱中的细胞类型和标记 | 植物细胞类型和标记 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 约250万个细胞 |
| 15532 | 2024-08-05 |
Single-Cell Sequencing Combined with Transcriptome Sequencing Constructs a Predictive Model of Key Genes in Multiple Sclerosis and Explores Molecular Mechanisms Related to Cellular Communication
2024, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S442684
PMID:38226354
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研究论文 | 本研究结合单细胞测序和转录组测序构建了多发性硬化症中关键基因的预测模型，并探索了与细胞通信相关的分子机制 | 创新点在于通过单细胞分析与转录组数据相结合，发现新的关键基因并构建了有效的预测模型 | 本研究的样本数量和数据来源可能限制了结果的普遍性 | 研究旨在为多发性硬化症的早期诊断和治疗提供新的生物标志物和机制理解 | 研究对象是多发性硬化症患者的基因表达和免疫细胞 | 数字病理学 | 多发性硬化症 | 单细胞测序和转录组测序 | LASSO回归 | 基因表达数据 | 从基因表达综合数据库中获取的多发性硬化症患者基因表达谱 |
| 15533 | 2024-08-05 |
Exploring the efficacious constituents and underlying mechanisms of sini decoction for sepsis treatment through network pharmacology and multi-omics
2024-Jan, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology
IF:6.7Q1
DOI:10.1016/j.phymed.2023.155212
PMID:38029626
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研究论文 | 本研究通过网络药理学分析探讨了传统中药处方四逆汤在治疗脓毒症的治疗机制 | 研究首次识别CX3CR1作为影响脓毒症预后的关键分子，并揭示了四逆汤活性成分通过相关途径调节血红素代谢、减少炎症和改善免疫功能的机制 | 研究可能存在个体差异对四逆汤效果的影响，且未完全阐明所有机制 | 探讨四逆汤在治疗脓毒症中的治疗机制 | 以脓毒症患者为研究对象，分析其基因表达和免疫细胞相互作用 | 数字病理学 | 脓毒症 | 网络药理学，单细胞测序 | 无监督聚类分析 | 基因表达数据，药物成分数据 | 脓毒症患者的多个基因模块和免疫细胞群体 |
| 15534 | 2024-08-05 |
Targeting neuropilin-1 abolishes anti-PD-1-upregulated regulatory T cells and synergizes with 4-1BB agonist for liver cancer treatment
2023-11-01, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1097/HEP.0000000000000320
PMID:36811396
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研究论文 | 本研究探讨了神经元细胞膜蛋白-1对抗PD-1上调的调节性T细胞的影响，并与4-1BB激动剂协同用于肝癌治疗 | 揭示了抗PD-1治疗通过神经元细胞膜蛋白-1调节肝细胞癌中的调节性T细胞积累的潜在机制 | 研究可能未对所有肝癌模型进行广泛验证，可能限制了结果的普遍性 | 探讨调节性T细胞在肝细胞癌治疗中的作用及其与抗PD-1和4-1BB激动剂的协同效果 | 主要研究肝细胞癌（HCC）中的调节性T细胞及其与抗PD-1治疗的相互作用 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞转录组学 | 人源化肝细胞癌模型 | 基因组数据 | NA |
| 15535 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing of liver fine-needle aspirates captures immune diversity in the blood and liver in chronic hepatitis B patients
2023-11-01, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1097/HEP.0000000000000438
PMID:37158243
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，通过肝细针穿刺获取慢性乙型肝炎患者的血液和肝脏样本，比较了两种单细胞RNA测序技术（Seq-Well S3和10× Chromium）在捕捉肝脏细胞多样性方面的效果，并分析了不同细胞类型在血液和肝脏中的转录组差异。 | 本研究首次通过单细胞RNA测序技术，系统比较了慢性乙型肝炎患者血液和肝脏的免疫细胞多样性，并发现Seq-Well S3技术能有效捕捉到10× Chromium技术未能捕捉到的中性粒细胞。 | 研究主要依赖于两种特定的单细胞RNA测序技术，可能存在技术偏倚；此外，样本量未在摘要中明确提及，可能影响研究结果的普遍性。 | 克服肝脏采样的实际障碍，通过细针穿刺和单细胞RNA测序技术，全面比较慢性乙型肝炎患者血液和肝脏的免疫细胞多样性。 | 慢性乙型肝炎患者的血液和肝脏样本。 | 数字病理学 | 肝炎 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 具体样本量未在摘要中提及 |
| 15536 | 2024-08-07 |
Identification and characterization of a hepatic IL-13-producing ILC3-like population potentially involved in liver fibrosis
2023-09-01, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1097/HEP.0000000000000350
PMID:37029085
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研究论文 | 本文详细研究了人体肝脏中的固有淋巴细胞（ILCs）在健康和纤维化肝脏中的组成及其在慢性肝病中的潜在作用 | 发现了一种先前未被描述的IL-13产生型ILC3样细胞亚群，该细胞在人体肝脏中富集，可能参与调节慢性肝病 | NA | 研究肝脏中固有淋巴细胞的组成及其在慢性肝病中的作用 | 肝脏中的固有淋巴细胞（ILCs） | NA | 肝纤维化 | 流式细胞术和单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 总共分析了50个肝脏样本（非纤维化=22，纤维化=29），以及结肠和扁桃体组织（各14个）和外周血（32个） |
| 15537 | 2024-08-07 |
A neuroepithelial wave of BMP signalling drives anteroposterior specification of the tuberal hypothalamus
2023-02-10, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.83133
PMID:36718990
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研究论文 | 本研究结合实验和生物信息学方法，探讨了胚胎期鸡的管状下丘脑前-后方向的生成机制 | 首次揭示了神经上皮来源的BMP信号波在胚胎发育中驱动管状下丘脑前-后方向特化的过程 | NA | 阐明管状下丘脑在胚胎发育中的细胞和信号通路特化机制 | 管状下丘脑的生成过程及其调控机制 | NA | NA | scRNA-Seq | NA | 基因表达数据 | 胚胎期鸡 |
| 15538 | 2024-08-07 |
Development and Optimization of a Prognostic Model Associated with Stemness Genes in Hepatocellular Carcinoma
2022, BioMed research international
IF:2.6Q3
DOI:10.1155/2022/9168441
PMID:36246969
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研究论文 | 本研究旨在开发一种基于干细胞相关基因的预测模型，用于评估肝细胞癌（HCC）患者的预后，以优化治疗方案 | 本研究通过单细胞测序数据筛选与干细胞相关的差异表达基因，并利用LASSO回归分析构建了一个包含18个干细胞相关基因的预测模型，该模型能有效预测HCC患者的总体生存率 | NA | 开发和优化与干细胞基因相关的肝细胞癌预后模型 | 肝细胞癌（HCC）患者的预后评估 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞测序 | LASSO回归 | 基因表达数据 | 使用了TCGA和GSE14520两个队列的数据 |
| 15539 | 2024-08-05 |
Single-cell multi-omics in the study of digestive system cancers
2024-Dec, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2023.12.007
PMID:38223343
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review | 本文全面回顾了单细胞组学技术在消化系统癌症研究中的进展 | 文章创新性地总结了单细胞多组学技术在消化系统肿瘤研究中的应用及其未来发展趋势 | 文章未提及具体的实验数据或样本量 | 研究消化系统癌症的单细胞组学技术的应用 | 消化系统癌症 | 数字病理学 | 消化系统癌症 | 单细胞测序 | NA | NA | NA |
| 15540 | 2024-08-07 |
T proliferating cells derived autophagy signature associated with prognosis and immunotherapy resistance in a pan-cancer analysis
2024-Jan-19, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2023.108701
PMID:38222108
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研究论文 | 本研究通过手动整理自噬基因集，并在TCGA队列中比较恶性组织和正常组织，定义了一个泛癌自噬特征，该特征源自T增殖细胞，并通过多个单细胞RNA测序数据集进行验证 | 首次揭示了泛癌自噬特征与免疫治疗抵抗和预后之间的关系，并探讨了其在肿瘤微环境中的细胞间相互作用 | NA | 探讨自噬特征在泛癌中的免疫治疗预测作用及其机制调控 | 泛癌自噬特征及其与免疫治疗抵抗和预后的关联 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组和蛋白质组数据 | 涉及转移性肾细胞癌、非小细胞肺癌、膀胱癌和黑色素瘤等多个队列 |