单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 28135 篇文献，本页显示第 15501 - 15520 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 15501 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptome analysis of aging mouse liver
2024-Feb-29, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202302282R
PMID:38334462
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组分析研究了衰老小鼠肝脏的分子和细胞过程 | 首次全面分析了衰老过程中肝脏的单细胞转录组变化，揭示了衰老相关的细胞组成和基因表达变化 | NA | 探究衰老对小鼠肝脏的分子和细胞影响 | 衰老小鼠肝脏的单细胞转录组 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | NA |
| 15502 | 2024-08-07 |
Integrated Single-Cell Transcriptomic Atlas of Human Kidney Endothelial Cells
2024-Feb-14, Journal of the American Society of Nephrology : JASN
IF:10.3Q1
DOI:10.1681/ASN.0000000000000320
PMID:38351505
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研究论文 | 本文通过重新处理和整合7个关于人类肾脏控制单细胞/单核RNA测序数据集，构建了一个全面的人类肾脏内皮细胞单细胞转录组图谱 | 首次系统地描述了人类肾脏内皮细胞的异质性，并发现了7个具有不同分子特征和生理功能的内皮细胞亚群 | NA | 构建一个全面的人类肾脏内皮细胞单细胞转录组图谱，以理解这些细胞在疾病、衰老和物种间的变化 | 人类肾脏内皮细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞/单核RNA测序 (sc/snRNAseq) | NA | 转录组数据 | 超过200,000个肾脏细胞 |
| 15503 | 2024-08-04 |
vissE: a versatile tool to identify and visualise higher-order molecular phenotypes from functional enrichment analysis
2024-Feb-08, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-024-05676-y
PMID:38331751
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研究论文 | vissE是一个灵活的网络分析和可视化工具，用于从功能富集分析中识别和可视化高阶分子表型 | 本研究提出的vissE工具通过组织信息和提供多种可视化模块，克服了路径分析中结果冗余的问题 | 未提及具体的限制信息 | 旨在增强分子发现过程中的基因集富集和路径分析工作流程 | 应用vissE于三种不同技术的功能分析，包括乳腺癌的空间转录组数据 | 生物信息学 | 乳腺癌 | 转录组测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 15504 | 2024-08-07 |
UPP1 promotes lung adenocarcinoma progression through the induction of an immunosuppressive microenvironment
2024-Feb-08, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-45340-w
PMID:38331898
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研究论文 | 本研究通过综合单细胞RNA测序数据分析，揭示了UPP1通过诱导免疫抑制微环境促进肺腺癌进展的机制 | 首次发现UPP1肿瘤细胞与免疫抑制微环境的关联，并通过多种技术手段验证了UPP1在肺腺癌中的免疫抑制作用 | NA | 深入了解肺腺癌进展的分子机制 | 肺腺癌患者的单细胞RNA测序数据和基因表达数据 | 数字病理学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 单细胞RNA测序数据 | 377,574个细胞来自117名肺腺癌患者样本 |
| 15505 | 2024-08-07 |
Tricarboxylic Acid Cycle Metabolite-Coordinated Biohydrogels Augment Cranial Bone Regeneration Through Neutrophil-Stimulated Mesenchymal Stem Cell Recruitment and Histone Acetylation-Mediated Osteogenesis
2024-Feb-07, ACS applied materials & interfaces
IF:8.3Q1
DOI:10.1021/acsami.3c15473
PMID:38284176
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研究论文 | 本文开发了一种由柠檬酸（NaCit, Cit）协同的三羧酸（TCA）循环代谢物修饰的生物仿生水凝胶，显著促进了颅骨再生 | 首次展示了柠檬酸协同的CGG水凝胶通过调节免疫微环境和间充质干细胞命运，有效促进颅骨再生 | NA | 开发新型生物仿生水凝胶以改善颅骨再生 | 颅骨缺陷的再生 | 生物医学工程 | 颅骨疾病 | RNA测序 | NA | 生物材料 | 涉及大鼠和小鼠的颅骨缺陷模型 |
| 15506 | 2024-08-04 |
KIF20B and MET, hub genes of DIAPHs, predict poor prognosis and promote pancreatic cancer progression
2024-Feb, Pathology, research and practice
DOI:10.1016/j.prp.2023.155046
PMID:38266456
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研究论文 | 这篇文章探讨了KIF20B和MET作为DIAPH基因的中心基因在胰腺癌中的预后和治疗价值 | 研究发现KIF20B和MET的共同下调可以抑制胰腺癌的进展，揭示了其潜在的治疗靶点 | 尚需进一步研究以验证KIF20B和MET联合预后在临床应用中的有效性 | 旨在评估KIF20B和MET在胰腺癌中的预后价值和治疗前景 | 研究对象为胰腺腺癌样本中KIF20B和MET的基因表达 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序，质量谱，Co-IP实验 | NA | 基因组数据 | NA |
| 15507 | 2024-08-04 |
In-Depth Genomic Analysis: The New Challenge in Congenital Heart Disease
2024-Feb-01, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms25031734
PMID:38339013
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研究论文 | 本研究通过深度基因组分析探讨先天性心脏病的成因和机制 | 利用下一代测序技术揭示了先天性心脏病（CHD）相关的基因变异和组织发生的通路 | 未提及具体的样本大小和实验设置限制 | 研究先天性心脏病的遗传成因和机制 | 关注先天性心脏病患者及伴随外部异常的基因类群 | 数字病理学 | 先天性心脏病 | 下一代测序 | NA | 基因组数据 | NA |
| 15508 | 2024-08-07 |
Establishment of ganglioside GD2-expressing extranodal NK/T-cell lymphoma cell line with scRNA-seq analysis
2024-Feb, Experimental hematology
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.exphem.2023.11.006
PMID:38029851
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研究论文 | 本文建立了一种表达神经节苷脂GD2的结外NK/T细胞淋巴瘤细胞系ENKL-J1，并进行了单细胞RNA测序分析 | 首次建立了表达GD2的ENKL细胞系，并通过单细胞RNA测序揭示了其分子和基因组特征 | NA | 研究结外NK/T细胞淋巴瘤的分子和基因组特征，探索新的治疗方案 | 结外NK/T细胞淋巴瘤细胞系ENKL-J1 | 数字病理学 | 淋巴瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 来自ENKL患者的骨髓细胞建立的细胞系ENKL-J1 |
| 15509 | 2024-08-07 |
Environmental and molecular regulation of diapause formation in a scyphozoan jellyfish
2024-Feb, Molecular ecology
IF:4.5Q1
DOI:10.1111/mec.17249
PMID:38133544
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research paper | 本研究旨在揭示温度和食物供应对水母Aurelia coerulea滞育囊形成的关键作用，并利用单细胞RNA测序探索滞育形成的细胞和分子基础 | 研究揭示了细胞类型特异性的转录景观，并发现热休克蛋白编码基因HSC70和HSP90a可能作为调控滞育囊形成的枢纽基因 | NA | 理解滞育形成机制，以深入了解各种物种的适应性生存策略 | 水母Aurelia coerulea的滞育囊形成 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 15510 | 2024-08-07 |
MMP14high macrophages orchestrate progressive pulmonary fibrosis in SR-Ag-induced hypersensitivity pneumonitis
2024-Feb, Pharmacological research
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.phrs.2024.107070
PMID:38218353
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研究论文 | 本研究探讨了MMP14高表达的巨噬细胞在SR-Ag诱导的过敏性肺炎中促进肺纤维化的机制 | 通过单细胞RNA测序分析，首次鉴定出MMP14高表达的巨噬细胞亚群，并揭示了其在促进纤维母细胞向肌纤维母细胞转化中的作用 | 研究主要基于小鼠模型，需要进一步在人类样本中验证 | 探究MMP14高表达的巨噬细胞在过敏性肺炎中的作用及其潜在的治疗靶点 | MMP14高表达的巨噬细胞及其在肺纤维化中的作用 | 数字病理学 | 肺部疾病 | 单细胞RNA测序 | 决策树模型 | 基因表达数据 | 小鼠模型 |
| 15511 | 2024-08-07 |
All-potassium channel CRISPR screening reveals a lysine-specific pathway of insulin secretion
2024-Feb, Molecular metabolism
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.molmet.2024.101885
PMID:38246588
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研究论文 | 本研究使用CRISPR-Cas9介导的钾通道敲除和单细胞RNA测序技术，在胰腺β细胞系中识别与胰岛素分泌相关的基因 | 首次揭示了赖氨酸特异性的胰岛素分泌途径，并确定了Kcnh6作为关键的钾通道 | 研究仅在特定的胰腺β细胞系中进行，可能需要进一步的体内研究以验证结果 | 识别与胰岛素分泌相关的基因，特别是影响钾通道功能的基因 | 胰腺β细胞中的钾通道及其对胰岛素分泌的影响 | NA | NA | CRISPR-Cas9, 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 83个钾通道基因被敲除，使用了胰腺β细胞系 |
| 15512 | 2024-08-04 |
Single-cell transcriptomics reveals colonic immune perturbations during amyloid-β driven Alzheimer's disease in mice
2024-Jan-30, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.01.27.573841
PMID:38352325
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研究论文 | 这篇论文揭示了在阿尔茨海默病小鼠模型中，肠道免疫扰动的单细胞转录组学研究 | 文章首次揭示了阿尔茨海默病与肠道免疫机制之间的关联，特别是CXCR4抗体分泌细胞的显著减少 | 该研究主要基于小鼠模型，可能无法完全反映人类阿尔茨海默病的免疫机制 | 研究肠-脑轴在阿尔茨海默病中的免疫机制 | 使用5XFAD阿米洛β小鼠模型研究肠道免疫活动 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用5XFAD小鼠模型进行实验，样本数量未具体说明 |
| 15513 | 2024-08-07 |
Toward the Identifiability of Comparative Deep Generative Models
2024-Jan-29, ArXiv
PMID:38351930
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研究论文 | 本文提出了一种针对比较深度生成模型（DGMs）的可识别性理论，通过扩展非线性独立成分分析领域的最新进展，展示了在混合函数为分段仿射（如由ReLU神经网络参数化）时模型的可识别性，并探讨了模型误指定的影响。 | 本文通过理论分析和实验验证，提出了一种新的方法来提高比较DGMs的可识别性，特别是在处理多个数据源时通过多目标优化和约束优化调整超参数。 | 文章指出，现有的比较DGMs方法通常依赖于没有理论基础的临时正则化方案，且在实际应用中，DGMs自然推断可解释和模块化的潜在表示是一个问题。 | 研究旨在提高比较深度生成模型的可识别性和实用性。 | 研究对象是比较深度生成模型及其在不同数据集比较中的应用。 | 机器学习 | NA | 深度生成模型（DGMs） | ReLU神经网络 | 单细胞RNA测序数据 | 文章未具体提及样本数量 |
| 15514 | 2024-08-04 |
scCorrector: a robust method for integrating multi-study single-cell data
2024-Jan-22, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbad525
PMID:38271483
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研究论文 | 本文提出了一种基于变分自编码器的模型scCorrector，用于整合来自不同研究的单细胞数据 | scCorrector通过研究特异性自适应归一化来优化不同研究的单细胞数据整合，且在不同条件下表现出竞争力和稳健性 | 暂无明确提及的限制 | 旨在解决多研究单细胞数据整合过程中的技术噪声、样本异质性等挑战 | 整合来自不同研究的单细胞数据 | 数字病理学 | NA | 变分自编码器 | NA | 单细胞数据 | NA |
| 15515 | 2024-08-07 |
Nasopharyngeal neutrophilic-retention signatures could predict disease progression in early SARS-CoV-2 infection
2024-01, Journal of medical virology
IF:6.8Q1
DOI:10.1002/jmv.29328
PMID:38146903
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研究论文 | 本研究通过RNA测序分析了COVID-19患者鼻咽拭子中的中性粒细胞相关基因表达，并发现与疾病严重程度相关的四个基因组成的NSAP可以作为早期诊断严重COVID-19的标志物 | 首次揭示了鼻咽部中性粒细胞的功能特征及其在预测COVID-19疾病进展中的作用，并识别出与疾病进展相关的四个基因组成的NSAP | NA | 探究鼻咽部中性粒细胞在COVID-19早期感染中的动态变化及其预测疾病进展的作用 | COVID-19患者的鼻咽拭子样本 | 数字病理学 | COVID-19 | RNA测序 | NA | RNA | 包括轻度、中度、重度COVID-19患者及健康对照的鼻咽拭子样本 |
| 15516 | 2024-08-07 |
Ivabradine Alleviates Experimental Autoimmune Myocarditis-Mediated Myocardial Injury
2024, International heart journal
IF:1.2Q3
DOI:10.1536/ihj.23-330
PMID:38296563
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研究论文 | 研究伊伐布雷定在实验性自身免疫性心肌炎模型中对心肌损伤的影响及其机制 | 首次探讨伊伐布雷定通过抑制HCNs通道在心肌炎中的抗炎作用 | 研究仅在动物模型中进行，需进一步在人体中验证 | 探究伊伐布雷定在心肌炎中的作用及其机制 | 实验性自身免疫性心肌炎大鼠模型 | 心血管疾病 | 心肌炎 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | RNA | 32只Lewis大鼠 |
| 15517 | 2024-08-07 |
Comprehensive analysis of single cell and bulk data develops a promising prognostic signature for improving immunotherapy responses in ovarian cancer
2024, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0298125
PMID:38346070
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序（scRNA-seq）和批量数据集成的优势，分析卵巢癌的肿瘤异质性，并开发了一种新的预后标志物，以改善卵巢癌患者的免疫治疗反应 | 首次综合利用单细胞和批量数据来解码卵巢癌的肿瘤异质性，并开发了一种稳定的细胞特征基因相关预后标志物（CCIS） | 研究基于公开数据集，可能存在样本选择偏倚；预后标志物的临床应用需要进一步的验证 | 探索卵巢癌的肿瘤异质性，并开发新的预后标志物以改善患者的免疫治疗反应 | 卵巢癌患者的肿瘤异质性及预后标志物 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 随机森林算法 | 基因表达数据 | 包括E-MTAB-8107、TCGA-OV、GSE63885和GSE26193四个队列的公开数据集 |
| 15518 | 2024-08-04 |
FXYD3 functionally demarcates an ancestral breast cancer stem cell subpopulation with features of drug-tolerant persisters
2023-11-15, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI166666
PMID:37966117
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研究论文 | 该文章研究了FXYD3在三阴性乳腺癌干细胞亚群体中的功能及其耐药特征 | 发现了以FXYD3为标志的乳腺癌干细胞亚群，并揭示了其与药物耐受性持久存活者的关系 | 研究主要集中在三阴性乳腺癌，可能不适用于其他类型的癌症 | 探讨肿瘤中癌症干细胞的异质性及其在化疗中的敏感性 | 三阴性乳腺癌（TNBC）中的癌症干细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞转录组分析 | NA | NA | NA |
| 15519 | 2024-08-07 |
Mechanisms underlying the therapeutic effects of cinobufagin in treating melanoma based on network pharmacology, single-cell RNA sequencing data, molecular docking, and molecular dynamics simulation
2023, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2023.1315965
PMID:38348352
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研究论文 | 本研究旨在预测蟾毒灵在黑色素瘤中的潜在作用靶点，通过网络药理学、单细胞RNA测序数据、分子对接和分子动力学模拟等方法进行分析 | 本研究结合多种先进技术，如单细胞RNA测序和分子动力学模拟，以揭示蟾毒灵治疗黑色素瘤的新机制 | 研究结论缺乏相关实验数据支持，需要进一步实验验证 | 预测蟾毒灵在黑色素瘤中的潜在作用靶点 | 蟾毒灵在黑色素瘤中的作用机制 | 分子生物学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序, 分子对接, 分子动力学模拟 | NA | 基因表达数据 | 使用GSE46517和GSE215120数据集中的样本 |
| 15520 | 2024-08-07 |
Scrutinizing the human TEX genes in the context of human male infertility
2024-Mar, Andrology
IF:3.2Q1
DOI:10.1111/andr.13511
PMID:37594251
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研究论文 | 本文通过筛选1305名男性的外显子测序数据，包括1056名隐匿性和无精子症患者，以及分析睾丸特异性单细胞RNA测序数据，研究了人类TEX基因在男性不育中的作用，并验证了先前描述的疾病关联。 | 本文发现了TEX10、ZFAND3（TEX27）和TEX33作为新的潜在候选基因，这些基因可能与非阻塞性无精子症相关。 | NA | 旨在筛选人类TEX基因中的新型潜在候选基因，并验证先前描述的疾病关联。 | 人类TEX基因及其在男性不育中的作用。 | NA | 男性不育 | 外显子测序、单细胞RNA测序 | NA | 基因数据 | 1305名男性，包括1056名隐匿性和无精子症患者 |