单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27536 篇文献，本页显示第 15501 - 15520 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 15501 | 2024-08-07 |
PIM kinases regulate early human Th17 cell differentiation
2023-12-26, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2023.113469
PMID:38039135
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研究论文 | 本研究探讨了PIM激酶家族在人类Th17细胞分化早期的转录基因调控中的作用 | 首次全面研究了PIM1、PIM2和PIM3在人类Th17细胞分化早期的分子功能 | NA | 探讨PIM激酶在人类Th17细胞分化中的作用及其与自身免疫表型的关联 | PIM激酶家族及其在Th17细胞分化中的调控作用 | 免疫学 | 自身免疫病 | scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | NA |
| 15502 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing uncovers the cell type-dependent transcriptomic changes in the retrosplenial cortex after peripheral nerve injury
2023-12-26, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2023.113551
PMID:38048224
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术研究了外周神经损伤后后侧皮质（RSC）的细胞类型依赖性转录组变化 | 首次揭示了RSC在疼痛调节中的作用，并展示了通过化学遗传学方法减少特定神经元活动可以缓解神经损伤引起的疼痛 | NA | 探究外周神经损伤后RSC在疼痛调节中的作用及其分子机制 | 小鼠的RSC在神经损伤后的转录组变化 | 数字病理学 | 神经病理性疼痛 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | NA |
| 15503 | 2024-08-07 |
SPIDE: A single cell potency inference method based on the local cell-specific network entropy
2023-12, Methods (San Diego, Calif.)
DOI:10.1016/j.ymeth.2023.11.006
PMID:37952704
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研究论文 | 本文提出了一种基于细胞特异性网络熵的单细胞潜能推断方法SPIDE，通过引入局部加权细胞特异性网络来保持细胞异质性，并结合基因表达与网络结构计算熵值 | SPIDE方法通过引入局部加权细胞特异性网络，有效解决了现有方法中由于scRNA-seq数据不准确交互和噪声导致的推断不准确问题 | NA | 旨在准确推断单细胞RNA-seq数据中的细胞分化潜能 | 单细胞RNA-seq数据中的细胞分化潜能 | 生物信息学 | 结直肠癌 | scRNA-Seq | NA | 基因表达数据 | 八个scRNA-Seq数据集 |
| 15504 | 2024-08-05 |
Hypoxia-sensitive cells trigger NK cell activation via the KLF4-ASH1L-ICAM-1 axis, contributing to impairment in the rat epididymis
2023-11-28, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2023.113442
PMID:37952156
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研究论文 | 该研究探讨了缺氧对大鼠附睾细胞的影响及其在不孕症中的作用 | 首次识别了缺氧敏感的附睾细胞，并阐明了通过KLF4-ASH1L-ICAM-1轴激活自然杀伤细胞的机制 | 研究主要在大鼠模型中进行，未必能完全适用于人类 | 探讨缺氧环境对附睾功能和不孕症的影响 | 大鼠附睾细胞在不同氧气条件下的变化 | 数字病理学 | 不孕症 | 单细胞转录组学 | NA | 细胞数据 | NA |
| 15505 | 2024-08-05 |
Single-cell analysis of multiple invertible promoters reveals differential inversion rates as a strong determinant of bacterial population heterogeneity
2023-08-04, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adg5476
PMID:37540747
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研究论文 | 本文研究了细菌种群异质性的一个重要机制，即可逆启动子的差异反转率。 | 揭示了通过组合性启动子反转生成的显著种群异质性，并表明反转率的差异在种群动态中起主要作用。 | 研究中可能未涵盖所有类型的微生物，局限于特定的细菌种群及其环境。 | 研究细菌种群异质性的机制及其对细菌适应性的影响。 | 以人类肠道共生细菌为研究对象，分析启动子反转对种群异质性的影响。 | 微生物学 | NA | 单细胞高通量测序 | 随机计算模型 | 基因组数据 | NA |
| 15506 | 2024-08-05 |
A novel protein encoded by circKANSL1L regulates skeletal myogenesis via the Akt-FoxO3 signaling axis
2024-Feb, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2023.128609
PMID:38056741
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研究论文 | 该文章报道了一种新型蛋白质circKANSL1L在骨骼肌生成中的作用 | 发现了由circKANSL1L编码的新型蛋白质及其在肌生成中的潜在功能 | 研究主要集中在猪的肌肉，可能不适用于其他物种 | 探究circKANSL1L如何通过Akt-FoxO3信号通路调控骨骼肌生成 | Lantang和Landrace猪的长背肌肉样本 | 数字病理学 | NA | circRNAome-seq和Ribo-seq | NA | 代谢组学和单细胞转录组学数据 | 来自Lantang和Landrace小猪的长背肌肉样本 |
| 15507 | 2024-08-05 |
Cellular and molecular mechanisms of highly active mesenchymal stem cells in the treatment of senescence of rhesus monkey ovary
2024-01-08, Stem cell research & therapy
IF:7.1Q1
DOI:10.1186/s13287-023-03631-x
PMID:38191526
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研究论文 | 这篇文章研究了高活性间充质干细胞在猴子卵巢抗衰老中的细胞和分子机制 | 这项研究首次揭示了高活性间充质干细胞对卵巢衰老的多种细胞和分子机制 | 该研究主要在猕猴卵巢进行，可能无法直接推广到人类 | 探讨高活性间充质干细胞在猴子卵巢衰老治疗中的作用机制 | 猕猴卵巢的老化细胞群和高活性间充质干细胞 | 数字病理学 | 衰老相关疾病 | 单核转录组测序 | NA | 基因表达数据 | 使用了不说明数量的猕猴卵巢样本和高活性间充质干细胞 |
| 15508 | 2024-08-07 |
Comparative single-cell analysis reveals heterogeneous immune landscapes in adenocarcinoma of the esophagogastric junction and gastric adenocarcinoma
2024-01-05, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-023-06388-6
PMID:38182569
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了食管胃结合部腺癌（AEG）和胃腺癌（GAC）的肿瘤微环境（TME），揭示了AEG中异质性恶性细胞和肿瘤相关成纤维细胞（CAFs）的特征 | 首次全面解析了AEG的TME，识别了具有多样生物功能和内在恶性特性的异质性AEG恶性细胞，并揭示了AEG中T细胞的转录特征和TCR谱系 | NA | 旨在深入理解食管胃结合部腺癌（AEG）的肿瘤微环境（TME） | 食管胃结合部腺癌（AEG）和胃腺癌（GAC）的肿瘤和邻近正常组织 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 四名AEG患者和公开的GAC单细胞数据集 |
| 15509 | 2024-08-05 |
Exploring distinct properties of endometrial stem cells through advanced single-cell analysis platforms
2023-12-20, Stem cell research & therapy
IF:7.1Q1
DOI:10.1186/s13287-023-03616-w
PMID:38124100
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综述 | 本研究综述了先进的单细胞分析技术在子宫内膜干细胞研究中的应用 | 介绍了单细胞RNA测序、单细胞ATAC测序和空间转录组学等新技术在识别和表征子宫内膜干细胞群体方面的创新 | 现有技术仍存在许多需要改进的技术局限性 | 探索子宫内膜干细胞在相关疾病中的重要性 | 子宫内膜干细胞及其在月经周期和分化过程中的动态变化 | 数字病理 | 子宫内膜疾病 | 单细胞RNA测序，单细胞ATAC测序，空间转录组学 | NA | NA | NA |
| 15510 | 2024-08-07 |
PD-L1 expression levels in mesenchymal stromal cells predict their therapeutic values for autoimmune hepatitis
2023-12-18, Stem cell research & therapy
IF:7.1Q1
DOI:10.1186/s13287-023-03594-z
PMID:38111045
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研究论文 | 本研究探讨了间充质基质细胞中PD-L1表达水平对其治疗自身免疫性肝炎疗效的预测作用 | 首次揭示了PD-L1表达水平与间充质基质细胞治疗自身免疫性肝炎疗效之间的正相关关系 | 研究仅限于从58个人类供体中分离的Wharton's jelly衍生的间充质基质细胞，且使用小鼠模型进行验证 | 探索间充质基质细胞中PD-L1表达水平作为选择治疗自身免疫性肝炎最佳细胞的指标 | 间充质基质细胞（MSCs）及其在自身免疫性肝炎治疗中的应用 | NA | 自身免疫性疾病 | 转录组和单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 58个不同供体来源的Wharton's jelly衍生的间充质基质细胞 |
| 15511 | 2024-08-05 |
Imputation for Single-cell RNA-seq Data with Non-negative Matrix Factorization and Transfer Learning
2023-Dec, Journal of bioinformatics and computational biology
IF:0.9Q4
DOI:10.1142/S0219720023500294
PMID:38248911
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研究论文 | 提出了一种集成非负矩阵分解和迁移学习的单细胞RNA-seq数据插补方法 | 该方法通过结合额外的数据集借用基因表达信息，并在分解矩阵中添加图正则化项，有效提升了表达值的估计准确性 | NA | 探索单细胞RNA-seq数据中的稀疏性问题并改进数据插补方法 | 单细胞RNA-seq数据 | 数字病理学 | NA | 非负矩阵分解和迁移学习 | NA | RNA-seq数据 | NA |
| 15512 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptomics of human traumatic brain injury reveals activation of endogenous retroviruses in oligodendroglia
2023-11-28, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2023.113395
PMID:37967557
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研究论文 | 本研究揭示了创伤性脑损伤中寡突胶质细胞内源性逆转录病毒的激活。 | 本研究首次展示了在创伤性脑损伤后寡突胶质细胞在神经炎症中的重要作用和内源性逆转录病毒的转录上调。 | 该研究的限制包括其结果基于急性样本，可能无法完全代表长期的神经反应。 | 本研究旨在探讨创伤性脑损伤后神经炎症反应的启动事件。 | 研究对象为人类脑组织中不同细胞群体的转录组变化。 | 数字病理学 | NA | 单核RNA测序 (snRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | 人类脑组织样本，具体数量未提及 |
| 15513 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptomics identifies a WNT7A-FZD5 signaling axis that maintains fallopian tube stem cells in patient-derived organoids
2023-11-28, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2023.113354
PMID:37917586
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研究论文 | 该研究揭示了WNT7A-FZD5信号轴在患者衍生的类器官中维持输卵管干细胞的作用 | 研究首次通过优化的类器官培养条件深入表征了输卵管干细胞及其自我更新的分子要求 | 研究中对输卵管干细胞的知识仍有限，且模型可能无法完全模拟生理状态 | 揭示输卵管干细胞的功能及其在健康和疾病中的作用 | 输卵管干细胞及其在类器官中的表现 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
| 15514 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing-guided fate-mapping toolkit delineates the contribution of yolk sac erythro-myeloid progenitors
2023-11-28, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2023.113364
PMID:37922312
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研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序技术分析了卵黄囊中的红系髓系前体细胞（EMPs）的异质性，并建立了多种命运图谱工具来追踪不同EMP亚群的贡献 | 首次详细描述了卵黄囊EMPs的异质性，并利用单细胞RNA测序技术建立了命运图谱工具来追踪其贡献 | NA | 阐明卵黄囊EMPs在胚胎发育至成年阶段的贡献 | 卵黄囊中的红系髓系前体细胞（EMPs）及其亚群 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 多个卵黄囊EMP亚群 |
| 15515 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptomics of the ocular anterior segment: a comprehensive review
2023-11, Eye (London, England)
DOI:10.1038/s41433-023-02539-3
PMID:37138096
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综述 | 本文全面回顾了眼前节的单细胞转录组学，探讨了相关技术和应用 | 提供了眼前节相关的单细胞RNA测序数据集的概述，并强调了其在靶向治疗中的重要性 | 技术限制及目前大部分研究集中在视网膜组织上 | 阐明眼组织的细胞和遗传组成，以揭示眼病的病理生理机制 | 主要研究眼前节相关的单细胞转录组数据 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 15516 | 2024-08-07 |
miR-126 identifies a quiescent and chemo-resistant human B-ALL cell subset that correlates with minimal residual disease
2023-10, Leukemia
IF:12.8Q1
DOI:10.1038/s41375-023-02009-5
PMID:37640845
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研究论文 | 研究探讨了微小RNA-126（miR-126）在B细胞急性淋巴细胞白血病（B-ALL）中的作用，发现miR-126高表达的细胞亚群具有化疗抵抗和静止状态的特征，与最小残留病相关。 | 首次揭示了miR-126在B-ALL中的作用，及其与化疗抵抗和疾病持续的关系。 | 研究主要基于患者来源的异种移植模型，可能与临床实际情况存在差异。 | 探究miR-126在B-ALL中的作用及其与化疗抵抗和疾病持续的关系。 | B细胞急性淋巴细胞白血病细胞及其亚群。 | 数字病理学 | 白血病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 8/9个患者来源的异种移植模型，多个成人和儿童B-ALL队列。 |
| 15517 | 2024-08-05 |
Single-cell brain organoid screening identifies developmental defects in autism
2023-Sep, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-023-06473-y
PMID:37704762
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研究论文 | 本研究开发了CRISPR人类类器官单细胞RNA测序系统，以筛查自闭症相关的发育缺陷 | 提出了一种新的系统用于高通量表型特征分析，揭示了自闭症谱系障碍基因对细胞命运决定的影响 | 研究主要集中在特定的基因突变，可能未涵盖所有自闭症相关的遗传变异 | 探讨自闭症谱系障碍的发育缺陷及其与基因调控网络的关系 | 聚焦于与自闭症谱系障碍相关的36个高风险基因的功能筛查 | 数字病理学 | 自闭症 | CRISPR-Cas9, 单细胞RNA测序 | 类器官模型 | 单细胞转录组数据 | NA |
| 15518 | 2024-08-07 |
A Single-Cell Taxonomy Predicts Inflammatory Niche Remodeling to Drive Tissue Failure and Outcome in Human AML
2023-09-01, Blood cancer discovery
IF:11.5Q1
DOI:10.1158/2643-3230.BCD-23-0043
PMID:37470778
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术，研究了人类急性髓系白血病（AML）中组织驻留造血干细胞/祖细胞（HSPC）与其肿瘤对应物及其原生微环境之间的预测信号相互作用 | 识别了LEPR+基质细胞作为造血作用的核心调节因子，并预测炎症微环境重塑和关键HSPC调节因子的剥夺会抑制NPM1突变AML中的高输出造血干细胞亚群 | NA | 揭示人类AML中细胞间信号传导，预测炎症微环境重塑对组织抑制和克隆选择的影响 | 人类急性髓系白血病（AML）中的造血干细胞/祖细胞（HSPC）及其微环境 | 数字病理学 | 急性髓系白血病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 15519 | 2024-08-05 |
Acquisition of drug resistance in basal cell nevus syndrome tumors through basal to squamous cell carcinoma transition
2023-Jul-27, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.07.26.550719
PMID:37546976
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研究论文 | 本文报道了在戈尔林综合症患者中，基底细胞癌如何通过基底到鳞状细胞癌的转变获得药物抗性。 | 本研究首次系统性地研究了戈尔林综合症患者肿瘤中抗SMO的遗传机制，并提出了新的遗传抑制因子。 | 相对少见病例的研究可能限制了结论的广泛适用性，且抗性机制的普遍性还有待进一步验证。 | 探讨基底细胞癌在戈尔林综合症患者中获得药物抗性的机制。 | 研究了戈尔林综合症患者的SMO抗性肿瘤克隆。 | 数字病理学 | 基底细胞癌 | 多组学和空间转录组学 | NA | 细胞和组织层面的肿瘤群体数据 | 一例戈尔林综合症患者的肿瘤样本 |
| 15520 | 2024-08-07 |
Vision-Dependent and -Independent Molecular Maturation of Mouse Retinal Ganglion Cells
2023-01-01, Neuroscience
IF:2.9Q2
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研究论文 | 本文通过高吞吐量的单细胞RNA测序技术，研究了小鼠视网膜神经节细胞在胚胎期和出生后不同阶段的分子成熟过程，并探讨了视觉依赖和独立的影响因素。 | 首次全面分析了视觉依赖和独立对小鼠视网膜神经节细胞分子成熟的影响，并揭示了视觉活动在细胞类型特异性表达和成熟过程中的作用。 | 研究主要集中在分子层面，未来研究可以进一步探讨这些分子变化如何在细胞和组织层面影响视网膜神经节细胞的功能和连接。 | 探讨视网膜神经节细胞的发育和连接过程中，活动依赖和活动独立转录程序的分子相关性。 | 小鼠视网膜神经节细胞在不同发育阶段的分子成熟过程。 | 分子生物学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 45种不同转录组特征的视网膜神经节细胞类型 |