单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27536 篇文献，本页显示第 15461 - 15480 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 15461 | 2024-08-05 |
A rat liver cell atlas reveals intrahepatic myeloid heterogeneity
2023-Nov-17, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2023.108213
PMID:38026201
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研究论文 | 这项研究使用单细胞转录组学来了解大鼠肝脏的复杂细胞网络 | 该文章揭示了不同大鼠品系之间的肝脏转录组差异 | 没有提及关于样本的长期跟踪研究和功能验证的局限性 | 的本研究旨在解开大鼠肝脏中细胞和分子来源的变异 | 该研究对象为健康的暗黑阿古提和刘易斯大鼠品系 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 健康的暗黑阿古提和刘易斯大鼠品系的肝脏样本 |
| 15462 | 2024-08-05 |
DNA-GPS: A theoretical framework for optics-free spatial genomics and synthesis of current methods
2023-10-18, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2023.08.005
PMID:37751737
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研究论文 | 本文提出了一种名为DNA-GPS的理论框架，用于无光学的空间基因组学 | 提出DNA-GPS这一新框架，结合数学制图和位置索引的思路，实现了大规模的无光学空间基因组学 | 讨论了当前空间基因组学技术在分辨率和规模上的权衡及其局限性 | 旨在为大规模无光学空间基因组学提供理论基础 | 对现有空间基因组学技术进行分类并进行分析 | 数字病理学 | NA | NA | 数学制图 | 分子特征数据 | NA |
| 15463 | 2024-08-07 |
Landscape of mast cell populations across organs in mice and humans
2023-10-02, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20230570
PMID:37462672
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research paper | 本文通过结合全组织成像和单细胞RNA测序数据，对小鼠和人类在稳态下的MCs进行了跨器官分析 | 首次在全器官水平上分析了小鼠和人类的MCs亚型，并揭示了不同亚型的转录组核心特征 | NA | 研究小鼠和人类不同器官中肥大细胞（MCs）的分布和特征 | 小鼠和人类的肥大细胞（MCs）及其亚型 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及小鼠和人类的多个器官 |
| 15464 | 2024-08-07 |
Proteomic and transcriptomic screening demonstrates increased mast cell-derived CCL23 in systemic mastocytosis
2023-07, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2023.01.033
PMID:36813186
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研究论文 | 本研究通过血浆蛋白质组学筛选和单细胞转录组分析，鉴定了系统性肥大细胞增多症（SM）中由肥大细胞衍生的CCL23蛋白，可能作为血液生物标志物。 | 首次发现CCL23在SM中的表达与疾病严重程度正相关，并可能作为SM的特异性生物标志物。 | NA | 旨在识别肥大细胞衍生的蛋白质，作为SM的血液生物标志物。 | 系统性肥大细胞增多症（SM）患者和健康个体的血浆蛋白质和单细胞转录组。 | NA | 系统性肥大细胞增多症 | 血浆蛋白质组学筛选，单细胞转录组分析 | NA | 蛋白质，RNA | SM患者和健康个体的血浆样本 |
| 15465 | 2024-08-07 |
Type 2 inflammation reduces SARS-CoV-2 replication in the airway epithelium in allergic asthma through functional alteration of ciliated epithelial cells
2023-07, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2023.03.021
PMID:37001649
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研究论文 | 本文研究了过敏性哮喘患者气道中2型炎症如何通过改变纤毛上皮细胞的功能来减少SARS-CoV-2的复制 | 发现了过敏性哮喘患者对SARS-CoV-2的固有保护机制，这种机制与纤毛上皮细胞的功能下调有关 | NA | 旨在识别2型炎症在气道中保护免受严重急性呼吸综合征冠状病毒2（SARS-CoV-2）的机制 | 从过敏原敏感的哮喘儿童和健康非敏感儿童中获取的支气管气道上皮细胞（AECs） | 数字病理学 | 过敏性哮喘 | RNA测序 | NA | 细胞样本 | 来自过敏性哮喘儿童和健康非敏感儿童的支气管气道上皮细胞样本 |
| 15466 | 2024-08-05 |
Unraveling the timeline of gene expression: A pseudotemporal trajectory analysis of single-cell RNA sequencing data
2023, F1000Research
DOI:10.12688/f1000research.134078.2
PMID:37994351
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研究论文 | 本研究展示了一种对小鼠乳腺单细胞RNA测序数据进行伪时间轨迹分析的全面工作流程 | 提出了一种新的分析方法，利用伪时间轨迹推断细胞分化和发育过程 | 主要集中在小鼠乳腺样本上，可能对其他生物体的适用性有限 | 旨在通过单细胞RNA测序分析细胞的发育和分化轨迹 | 小鼠乳腺中的细胞群体 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 多个小鼠乳腺样本 |
| 15467 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing reveals cancer stem-like cells and dynamics in tumor microenvironment during cholangiocarcinoma progression
2023, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2023.1250215
PMID:38020927
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了胆管癌进展过程中肿瘤微环境中癌症干细胞样细胞的转录特征和动态变化 | 首次在YAP/AKT小鼠模型中通过单细胞RNA测序揭示了胆管癌进展过程中癌症干细胞样细胞及其微环境的动态变化 | NA | 深入理解胆管癌进展过程中癌症干细胞样细胞和肿瘤微环境的转录特征 | 胆管癌中的癌症干细胞样细胞及其肿瘤微环境 | 数字病理学 | 胆管癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 从YAP/AKT小鼠模型的三个不同肿瘤发生时间点收集的细胞样本 |
| 15468 | 2024-08-07 |
Bioengineered hydrogels enhance ex vivo preservation of patient-derived tumor explants for drug evaluation
2024-Mar, Biomaterials
IF:12.8Q1
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研究论文 | 本文展示了生物工程水凝胶如何通过识别关键的基质参数，显著提高患者来源肿瘤组织切片（PDTS）的体外存活率，并维持肿瘤微环境中的细胞间通讯网络。 | 利用生物工程水凝胶增强PDTS的存活率，并维持肿瘤微环境中的细胞组成和细胞间通讯网络。 | NA | 研究如何通过生物工程水凝胶提高患者来源肿瘤组织切片在体外培养中的存活率，并维持其生物学特性。 | 患者来源的肿瘤组织切片（PDTS）及其在体外培养中的存活率和生物学特性。 | 生物工程 | 头颈癌 | 单细胞RNA测序，高维流式细胞术 | NA | 细胞 | NA |
| 15469 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptome analysis reveals keratinocyte subpopulations contributing to psoriasis in corneum and granular layer
2024-Feb, Skin research and technology : official journal of International Society for Bioengineering and the Skin (ISBS) [and] International Society for Digital Imaging of Skin (ISDIS) [and] International Society for Skin Imaging (ISSI)
IF:2.0Q3
DOI:10.1111/srt.13572
PMID:38279596
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析，揭示了角质形成细胞亚群在银屑病发病中的作用及其分子机制 | 首次详细描述了角质形成细胞在银屑病中的特定亚群及其相关的信号通路 | NA | 揭示与银屑病相关的角质形成细胞亚群及其分子机制 | 正常和银屑病皮肤组织中的角质形成细胞 | 数字病理学 | 皮肤疾病 | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 正常和银屑病皮肤组织的单细胞转录组数据 |
| 15470 | 2024-08-07 |
The activator protein-1 complex governs a vascular degenerative transcriptional programme in smooth muscle cells to trigger aortic dissection and rupture
2024-Jan-27, European heart journal
IF:37.6Q1
DOI:10.1093/eurheartj/ehad534
PMID:37992083
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研究论文 | 本文研究了激活蛋白-1复合体在平滑肌细胞中调控血管退行性转录程序，从而触发主动脉夹层和破裂的机制 | 首次揭示了激活蛋白-1复合体在主动脉夹层发展中的动态作用，并提出了通过调节肿瘤坏死因子-氧化磷酸化-激活蛋白-1轴来干预主动脉重塑的新策略 | 研究主要基于单细胞RNA测序和动物模型，需要进一步的人体临床试验验证 | 探讨激活蛋白-1复合体在主动脉夹层中的作用机制，并寻找潜在的治疗干预策略 | 主动脉夹层患者和心脏移植患者的升主动脉组织，以及平滑肌细胞 | 心血管疾病 | 主动脉夹层 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞转录组 | 9名升主动脉置换患者和5名心脏移植患者的升主动脉组织，以及93,397个细胞 |
| 15471 | 2024-08-05 |
Glomerular spatial transcriptomics of IgA nephropathy according to the presence of mesangial proliferation
2024-01-26, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-52581-8
PMID:38278877
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研究论文 | 本研究探讨了根据系膜增生的存在，IgA肾病（IgAN）肾小球的基因表达谱 | 使用空间特异性转录组分析，揭示了M1-IgAN与对照之间基因表达的显著差异 | 研究仅涵盖了12个病例，且各病例仅分析了三个肾小球 | 研究IgAN中系膜增生对肾小球基因表达的影响 | IgAN患者及供体控制样本的肾小球组织 | 数字病理学 | 肾病 | GeoMx数字空间分析 | NA | 基因表达数据 | 12个病例，分析每个病例的3个肾小球 |
| 15472 | 2024-08-07 |
Multi-omics reveals the role of ENO1 in bladder cancer and constructs an epithelial-related prognostic model to predict prognosis and efficacy
2024-01-25, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-52573-8
PMID:38273010
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研究论文 | 研究探讨ENO1在膀胱癌中的作用，并通过多组学分析构建了一个与上皮细胞相关的预测模型，用于预测膀胱癌的预后和治疗反应 | 通过多组学分析揭示了ENO1在膀胱癌中的高表达及其与不良预后、CD8+ T细胞耗竭和上皮异质性的关联，并构建了一个新的预测模型 | NA | 探索ENO1在膀胱癌中的作用，并构建一个预测膀胱癌预后和治疗反应的模型 | ENO1在膀胱癌中的表达及其对预后和治疗反应的影响 | 数字病理学 | 膀胱癌 | IHC, RNA-seq, scRNA-seq | LASSO分析 | 组织样本, 细胞样本 | 249个关键基因 |
| 15473 | 2024-08-07 |
Identification of gene signatures and molecular mechanisms underlying the mutual exclusion between psoriasis and leprosy
2024-01-25, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-52783-0
PMID:38273053
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研究论文 | 本研究旨在揭示牛皮癣和麻风病相互排斥的分子机制，通过分析差异表达基因和富集分析，识别出关键的相互排斥基因并探讨其与免疫细胞浸润的关系。 | 本研究首次识别出APOE, CYP27A1, 和SOAT1作为牛皮癣和麻风病相互排斥的关键基因，并通过胆固醇代谢途径解释了两者之间的负相关机制。 | 本研究主要基于数据库中的数据进行分析，未来需要更多的实验验证和临床数据支持。 | 揭示牛皮癣和麻风病相互排斥的分子机制 | 牛皮癣和麻风病的差异表达基因及相互排斥机制 | NA | 牛皮癣, 麻风病 | DEseq2, 单样本基因集富集分析 (ssGSEA) | 蛋白质-蛋白质相互作用 (PPI) 网络 | 基因表达数据 | 1098个差异表达基因在麻风病数据集中，3839个差异表达基因在牛皮癣数据集中 |
| 15474 | 2024-08-07 |
Exploring Immune Cell Diversity in the Lacrimal Glands of Healthy Mice: A Single-Cell RNA-Sequencing Atlas
2024-Jan-19, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms25021208
PMID:38279208
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序和生物信息学分析，探索了正常小鼠泪腺中的免疫细胞多样性及其分子特征 | 首次详细描述了泪腺中18种不同细胞簇和26种免疫细胞亚群的多样性及其细胞间相互作用 | NA | 深入了解泪腺中的免疫系统及其与相关疾病的关系 | 小鼠泪腺中的免疫细胞及其分子特征 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | Seurat聚类 | 细胞 | 34,891个细胞 |
| 15475 | 2024-08-05 |
Application of Single-Cell Sequencing Technology in Research on Colorectal Cancer
2024-Jan-18, Journal of personalized medicine
IF:3.0Q1
DOI:10.3390/jpm14010108
PMID:38248808
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综述 | 本文概述了单细胞测序技术在结直肠癌研究中的应用 | 文章聚焦于单细胞测序在揭示肿瘤异质性和新药靶点方面的创新应用 | NA | 加强对结直肠癌发展和肿瘤微环境的理解 | 结直肠癌的肿瘤异质性、循环肿瘤细胞及新药靶点 | 数字病理 | 结直肠癌 | 单细胞测序 | NA | 基因组、转录组和表观遗传数据 | NA |
| 15476 | 2024-08-05 |
Integrating TCGA and Single-Cell Sequencing Data for Hepatocellular Carcinoma: A Novel Glycosylation (GLY)/Tumor Microenvironment (TME) Classifier to Predict Prognosis and Immunotherapy Response
2024-Jan-13, Metabolites
IF:3.4Q2
DOI:10.3390/metabo14010051
PMID:38248854
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研究论文 | 该研究开发了一种基于糖基化相关基因和肿瘤微环境评分的分类器，用于改善肝细胞癌的预后预测和免疫治疗反应 | 提出了一个新的糖基化/肿瘤微环境分类器，能够更好地预测临床结果 | 对驱动肿瘤微环境中免疫细胞变异的分子途径了解不足 | 旨在通过开发GLY/TME分类器来改善肝细胞癌的预后预测 | 研究肝细胞癌中的糖基化相关基因与肿瘤微环境的关系 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞测序 | 分类器 | 基因表达数据 | NA |
| 15477 | 2024-08-05 |
Single-cell data revealed CD14-type and FCGR3A-type macrophages and relevant prognostic factors for predicting immunotherapy and prognosis in stomach adenocarcinoma
2024, PeerJ
IF:2.3Q2
DOI:10.7717/peerj.16776
PMID:38274323
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研究论文 | 该研究通过单细胞测序技术识别了胃腺癌中的关键细胞类型和相关预后因子 | 研究首次构建了用于预测胃腺癌患者免疫疗法反应和预后的单细胞图谱及风险评分模型 | 研究结果基于单细胞数据和公共数据库，可能存在样本偏倚和外部验证不足 | 探讨胃腺癌中的细胞异质性及其与免疫疗法和预后的相关性 | 胃腺癌患者的单细胞数据及免疫微环境中的巨噬细胞 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | LASSO COX模型 | 基因表达数据 | 涉及的样本数量在700个以上的巨噬细胞亚群和其他细胞类型 |
| 15478 | 2024-08-05 |
Hexagonal image segmentation on spatially resolved transcriptomics
2023-12, Methods (San Diego, Calif.)
DOI:10.1016/j.ymeth.2023.11.002
PMID:37931852
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研究论文 | 该文章提出了一种新颖的六边形卷积神经网络用于空间转录组的图像分割 | 引入了六边形卷积网络和监督学习方法，以提高空间转录组数据中的噪声处理和特征识别 | 文章中未提及数据集的多样性或适用性相关的限制 | 研究空间转录组学中空间域的识别问题 | DLPFC数据集中的空间转录组数据 | 数字病理学 | NA | 卷积神经网络 | 六边形卷积神经网络(hexCNN) | 图像 | NA |
| 15479 | 2024-08-07 |
Late fetal hematopoietic failure results from ZBTB11 deficiency despite abundant HSC specification
2023-11-14, Blood advances
IF:7.4Q1
DOI:10.1182/bloodadvances.2022009580
PMID:37567157
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研究论文 | 本文研究了锌指和宽域、tramtrak、bric-a-brac结构域包含11（ZBTB11）转录因子在哺乳动物造血中的作用，发现Zbtb11基因缺失导致胚胎在胚胎日18.5时出现造血失败。 | 首次揭示了ZBTB11在维持造血干细胞和前体细胞成熟能力中的细胞内在需求，以及其在细胞周期调控和增殖中的作用。 | 研究主要集中在小鼠模型上，尚未探讨ZBTB11在人类造血系统中的具体作用。 | 探讨ZBTB11转录因子在哺乳动物造血系统中的作用及其对造血干细胞的影响。 | ZBTB11基因缺失的小鼠造血干细胞（HSCs）及其在胚胎发育中的表现。 | 血液学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | Zbtb11基因缺失的小鼠胚胎及对照组 |
| 15480 | 2024-08-07 |
A single-cell atlas of the aging murine ovary
2023-Sep-06, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.04.29.538828
PMID:37162983
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research paper | 本研究通过单细胞RNA测序分析了年轻和老年小鼠卵巢组织的转录组变化，揭示了卵巢衰老过程中的细胞和分子机制 | 首次提供了衰老小鼠卵巢的单细胞图谱，识别了卵巢衰退的早期驱动因素 | 研究仅限于小鼠模型，结果的临床相关性需进一步验证 | 填补关于衰老卵巢转录组变化的综合细胞图谱的空白 | 年轻和老年小鼠的卵巢组织 | digital pathology | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 年轻（3个月大）和老年（9个月大）小鼠的卵巢组织 |