单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27585 篇文献，本页显示第 15461 - 15480 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 15461 | 2024-08-07 |
Identification of Cancer Stem Cell-related Gene by Single-cell and Machine Learning Predicts Immune Status, Chemotherapy Drug, and Prognosis in Lung Adenocarcinoma
2024, Current stem cell research & therapy
IF:2.1Q4
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研究论文 | 本研究旨在基于癌症干细胞相关基因识别肺腺癌的分子类型和预后模型 | 本研究首次构建了一个基于8个基因的预后模型，用于预测肺腺癌的预后和免疫治疗反应 | NA | 识别肺腺癌的分子类型和预后模型 | 肺腺癌的分子类型和预后模型 | 数字病理学 | 肺腺癌 | RNA-seq | LASSO Cox回归分析 | 单细胞RNA测序数据 | 使用了来自TCGA数据库的肺腺癌临床信息和RNA-seq数据，以及来自GEO数据库的scRNA数据集GSE131907和5个GSE数据集 |
| 15462 | 2024-08-07 |
Identification of Stem Cell-related Gene Markers by Comprehensive Transcriptome Analysis to Predict the Prognosis and Immunotherapy of Lung Adenocarcinoma
2024, Current stem cell research & therapy
IF:2.1Q4
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研究论文 | 本研究通过综合转录组分析识别与肺腺癌预后和免疫治疗相关的干细胞相关基因标记 | 开发了一种新的癌症干细胞评估指标和一个4基因标记，用于评估肺腺癌对免疫检查点阻断疗法或抗肿瘤治疗的反应 | NA | 评估肺腺癌细胞的干细胞特性及其对预后和免疫治疗的影响 | 肺腺癌中的癌症干细胞及其相关基因标记 | 数字病理学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | LASSO和COX回归分析 | 基因表达数据 | 4个样本，共3455个恶性细胞 |
| 15463 | 2024-08-07 |
Biallelic COQ4 Variants in Hereditary Spastic Paraplegia: Clinical and Molecular Characterization
2024-Jan, Movement disorders : official journal of the Movement Disorder Society
IF:7.4Q1
DOI:10.1002/mds.29664
PMID:38014483
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研究论文 | 本研究旨在确认双等位COQ4突变在遗传性痉挛性截瘫（HSP）中的致病作用，并阐明COQ4相关HSP的临床、遗传和功能分子特征 | 首次确认了双等位COQ4突变在HSP中的致病作用，并揭示了这些突变与线粒体功能障碍和疾病表型严重性之间的关系 | NA | 确认双等位COQ4突变在HSP中的致病作用，并阐明COQ4相关HSP的临床、遗传和功能分子特征 | 310名原因不明的HSP患者及其临床数据，以及COQ4突变的功能分子特征 | NA | 遗传性痉挛性截瘫 | 全外显子测序、单细胞RNA测序、生物化学细胞系分析、诱导多能干细胞衍生的锥体神经元和斑马鱼模型 | NA | 基因序列、临床数据、细胞和动物模型 | 310名HSP患者，6个无关家族中的7名患者，以及多种细胞和动物模型 |
| 15464 | 2024-08-07 |
Single cell RNA sequencing reveals endothelial cell killing and resolution pathways in experimental malaria-associated acute respiratory distress syndrome
2024-Jan, PLoS pathogens
IF:5.5Q1
DOI:10.1371/journal.ppat.1011929
PMID:38236930
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了实验性疟疾相关急性呼吸窘迫综合征（MA-ARDS）中内皮细胞杀伤和解决途径 | 本研究首次通过单细胞RNA测序分析了MA-ARDS中内皮细胞的杀伤和解决途径，并利用MultiNicheNet交互组分析确定了疾病解决过程中配体-受体交互的重要变化 | 本研究主要基于小鼠模型，其结果在人类中的适用性需要进一步验证 | 研究疟疾相关急性呼吸窘迫综合征的解决机制，以促进内皮细胞增殖和限制炎症 | 疟原虫感染的小鼠模型及其肺部内皮细胞 | 数字病理学 | 疟疾 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | P. berghei NK65感染的C57BL/6小鼠 |
| 15465 | 2024-08-05 |
Single-Cell Transcriptomics and In Vitro Lineage Tracing Reveals Differential Susceptibility of Human iPSC-Derived Midbrain Dopaminergic Neurons in a Cellular Model of Parkinson's Disease
2023-12-18, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells12242860
PMID:38132179
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研究论文 | 本研究生成了一种能够纯化和追踪人类中脑多巴胺前体细胞及其分化后代的iPSC系。 | 使用CRISPR/Cas9技术将蓝色荧光蛋白(BFP)和Cre基因插入安全栖息地位点AAVS1，实现中脑多巴胺谱系标记。 | 未提及其他细胞类型的影响或长时间的体内模型验证，可能限制模型的真实性。 | 研究不同人类iPSC衍生的中脑多巴胺能神经元在帕金森病模型中的易感性。 | 人类诱导多能干细胞（iPSC）衍生的神经细胞。 | 干细胞技术 | 帕金森病 | CRISPR/Cas9 | NA | 单细胞RNA测序 | NA |
| 15466 | 2024-08-07 |
Exploring the Functional Heterogeneity of Directly Reprogrammed Neural Stem Cell-Derived Neurons via Single-Cell RNA Sequencing
2023-12-11, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells12242818
PMID:38132138
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术探索了直接重编程神经干细胞衍生神经元的功能异质性 | 本文首次通过单细胞RNA测序分析了直接重编程神经干细胞及其衍生神经元的功能异质性，并揭示了细胞命运调控因子 | 本文未详细讨论直接重编程神经干细胞在临床应用中的具体挑战和解决方案 | 研究直接重编程神经干细胞衍生神经元的功能异质性，以提高其在神经退行性疾病治疗中的应用质量 | 直接重编程神经干细胞及其衍生神经元 | 数字病理学 | 神经退行性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及人纤维母细胞、直接重编程神经干细胞及其衍生神经元的单细胞RNA测序数据 |
| 15467 | 2024-08-07 |
Effect of stretching on inflammation in a subcutaneous carrageenan mouse model analyzed at single-cell resolution
2023-12, Journal of cellular physiology
IF:4.5Q1
DOI:10.1002/jcp.31133
PMID:37909412
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研究论文 | 研究了拉伸对小鼠皮下卡拉胶炎症模型中单细胞分辨率下炎症反应的影响 | 首次在单细胞水平上分析了拉伸对小鼠皮下卡拉胶炎症模型的影响，揭示了拉伸对炎症反应和细胞间通讯的具体作用机制 | NA | 探索拉伸在细胞和分子水平上对小鼠皮下卡拉胶炎症模型的影响 | 小鼠皮下卡拉胶炎症模型中的炎症反应 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 15468 | 2024-08-05 |
Spatial Transcriptomics Reveals Signatures of Histopathological Changes in Muscular Sarcoidosis
2023-11-30, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells12232747
PMID:38067175
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研究论文 | 本研究通过空间转录组学揭示了肌肉肉芽肿病的组织病理学变化特征 | 首次探索了肉芽肿与骨骼肌之间的相互作用，提供了有关免疫细胞对肌肉影响的新见解 | 研究对象仅包括两名患者，样本量较小，结果的普适性有待验证 | 揭示肉芽肿免疫细胞对骨骼肌的影响及其病理机制 | 研究对象为两名肌肉肉芽肿病患者 | 数字病理学 | 肌肉肉芽肿病 | 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 2名肌肉肉芽肿病患者 |
| 15469 | 2024-08-05 |
Sex and Age Impact CD4+ T Cell Susceptibility to HIV In Vitro through Cell Activation Dynamics
2023-11-23, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells12232689
PMID:38067117
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研究论文 | 本研究探讨了性别和年龄如何通过细胞激活动态影响CD4+ T细胞对HIV的易感性 | 首次在体外验证了性别和年龄对CD4+ T细胞对HIV易感性的影响，并进行了深入的表面标记物表达评估 | 研究中未观察到根据性别区分的细胞亚型富集 | 研究细胞级别的因素如何影响HIV复制，特别是与性别和年龄相关的因素 | 从二十名供体提取的初级CD4+ T细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 20名供体的CD4+ T细胞 |
| 15470 | 2024-08-05 |
Macrophage and neutrophil heterogeneity at single-cell spatial resolution in human inflammatory bowel disease
2023-07-26, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-40156-6
PMID:37495570
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研究论文 | 该文章研究了在人类炎症性肠病中单细胞水平的巨噬细胞和中性粒细胞异质性 | 本研究首次应用单细胞RNA测序结合空间转录组技术揭示了慢性肠病中巨噬细胞和中性粒细胞的亚群及其在组织中的空间定位 | 尚未探讨异质性在治疗反应中的具体影响 | 研究人类炎症性肠病中免疫细胞的异质性 | 聚焦于人类患有溃疡性结肠炎和克罗恩病的患者的免疫细胞 | 数字病理学 | 炎症性肠病 | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | NA | 组织样本 | NA |
| 15471 | 2024-08-07 |
Ribonucleotide reductase regulatory subunit M2 drives glioblastoma TMZ resistance through modulation of dNTP production
2023-05-19, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.ade7236
PMID:37196077
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研究论文 | 研究通过体内单细胞RNA测序分析，探讨了胶质母细胞瘤（GBM）在标准治疗药物替莫唑胺（TMZ）治疗期间细胞可塑性诱导的适应性变化 | 发现了核糖核苷酸还原酶调节亚基M2（RRM2）通过调节dNTP生产在TMZ治疗期间对DNA损伤反应的重要性，并提出了RRM2抑制剂3-AP增强TMZ疗效的新策略 | NA | 探究胶质母细胞瘤在替莫唑胺治疗期间细胞可塑性诱导的适应性变化 | 胶质母细胞瘤（GBM）患者来源的异种移植瘤（PDX）在治疗前、中、后的单细胞转录组 | 数字病理学 | 脑瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组和代谢组数据 | 患者来源的异种移植瘤（PDX）模型 |
| 15472 | 2024-08-07 |
Profiles of Wnt pathway gene expression during tooth morphogenesis
2023, Frontiers in physiology
IF:3.2Q2
DOI:10.3389/fphys.2023.1316635
PMID:38274045
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研究论文 | 本研究通过荧光多重杂交和单细胞RNA测序技术，分析了Wnt信号通路基因在牙齿形态发生过程中的表达模式 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细分析了Wnt信号通路基因在牙齿发育不同阶段的表达模式，并揭示了其在牙本质和牙釉质矿化后的表达变化 | 研究主要集中在小鼠和人类牙齿发育的特定阶段，可能无法完全代表所有牙齿发育过程 | 探讨Wnt信号通路基因在牙齿形态发生中的作用及其表达模式 | Wnt信号通路基因在小鼠和人类牙齿发育中的表达 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠和人类牙齿发育的不同阶段样本 |
| 15473 | 2024-08-07 |
A glycosylation-related gene signature predicts prognosis, immune microenvironment infiltration, and drug sensitivity in glioma
2023, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2023.1259051
PMID:38293671
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研究论文 | 本研究通过分析糖基化相关基因在胶质瘤中的表达，预测患者的预后、免疫微环境浸润及药物敏感性 | 首次利用糖基化相关基因构建预测胶质瘤预后和免疫反应的基因签名，并分析其对药物敏感性的影响 | NA | 研究糖基化相关基因在胶质瘤中的作用，预测患者的预后和免疫反应 | 胶质瘤患者的预后、免疫微环境浸润及药物敏感性 | 数字病理学 | 脑瘤 | RNA测序 | LASSO-regularized Cox模型 | RNA-seq数据 | 使用了来自TCGA、CGGA、GEO和Rembrandt数据库的临床信息、bulk RNA-seq数据和单细胞RNA测序数据，以及来自GTEx数据库的正常脑组织RNA测序数据 |
| 15474 | 2024-08-07 |
Long read single cell RNA sequencing reveals the isoform diversity of Plasmodium vivax transcripts
2022-12, PLoS neglected tropical diseases
IF:3.4Q1
DOI:10.1371/journal.pntd.0010991
PMID:36525464
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研究论文 | 本研究利用Pacific Biosciences化学方法对单细胞寄生虫进行scRNA-seq库测序，以表征全长Plasmodium vivax转录本 | 首次使用长读长测序技术在单细胞水平上表征Plasmodium vivax的转录本多样性 | NA | 旨在揭示Plasmodium vivax转录本的异构体多样性 | Plasmodium vivax转录本的异构体多样性 | 测序技术 | 疟疾 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），Pacific Biosciences（PacBio）化学 | NA | 转录组数据 | 多个单细胞寄生虫样本 |
| 15475 | 2024-08-07 |
Engineering a niche supporting hematopoietic stem cell development using integrated single-cell transcriptomics
2022-03-24, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-28781-z
PMID:35332125
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研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序技术分析了从胚胎动脉血管中的造血内皮细胞向造血干细胞过渡的转录组特征，并识别了支持造血干细胞成熟和自我更新的信号分子。 | 本文通过伪时间排序揭示了造血内皮细胞向造血干细胞过渡过程中的基因表达动态，并识别了特定表达于发育中的造血干细胞的表面受体及其相应的配体。 | NA | 研究造血干细胞发育所需的信号交互作用，并推进造血干细胞在治疗应用中的工程化目标。 | 造血干细胞（HSCs）及其发育过程中的信号分子。 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 胚胎动脉血管区域（AGM）来源的细胞 |
| 15476 | 2024-08-05 |
Comparison of high-throughput single-cell RNA-seq methods for ex vivo drug screening
2024-Mar, NAR genomics and bioinformatics
IF:4.0Q1
DOI:10.1093/nargab/lqae001
PMID:38288374
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研究论文 | 本研究比较了三种高通量单细胞RNA测序方法用于药物筛选的效果 | 该研究展示了一种集成实验系统，能够在一次单细胞测序实验中实现多种药物条件的条形码标记 | 本文未提及不同药物条件下的具体影响以及所使用细胞系的局限性 | 优化基于癌细胞特征的个性化药物选择 | 研究重点为糖皮质激素耐药的急性淋巴细胞白血病E/R+ Reh细胞系 | 数字病理学 | 急性淋巴细胞白血病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 27,327个细胞 |
| 15477 | 2024-08-05 |
DMT-EV: An Explainable Deep Network for Dimension Reduction
2024-Mar, IEEE transactions on visualization and computer graphics
IF:4.7Q1
DOI:10.1109/TVCG.2022.3223399
PMID:36409811
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研究论文 | DMT-EV是一种可解释的深度网络，用于进行维度减少。 | 提出了一种新方法DMT-EV，结合了优秀的结构保持性能和可解释性。 | 未提及具体的局限性 | 探索和改进维度减少技术的性能和可解释性。 | 高维数据的嵌入过程和结构保持。 | 机器学习 | NA | 深度神经网络 | NA | 高维数据 | NA |
| 15478 | 2024-08-07 |
Thrombospondin 2 is a key determinant of fibrogenesis in non-alcoholic fatty liver disease
2024-Feb, Liver international : official journal of the International Association for the Study of the Liver
IF:6.0Q1
DOI:10.1111/liv.15792
PMID:38010940
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研究论文 | 本研究旨在确定非酒精性脂肪肝病（NAFLD）中表达血栓调节蛋白2（THBS2/TSP2）的特定细胞，并探讨THBS2/TSP2上调的潜在机制 | 首次揭示了THBS2/TSP2在NAFLD患者肝星状细胞（HSCs）中的高表达，并发现其与纤维化进程的相关性 | NA | 研究THBS2/TSP2在NAFLD中的表达及其对纤维化的影响 | 非酒精性脂肪肝病（NAFLD）患者的肝细胞和肝星状细胞（HSCs） | NA | 非酒精性脂肪肝病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），定量聚合酶链反应（qPCR） | NA | 基因数据 | 分析了包含1433个可变基因的遗传数据集，使用了来自NAFLD患者的肝脏组织和LX-2细胞 |
| 15479 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing reveals the epithelial cell, fibroblast, and key gene alterations in chronic rhinosinusitis with nasal polyps
2024-01-27, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-52341-8
PMID:38280891
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术揭示了慢性鼻窦炎伴鼻息肉中上皮细胞、成纤维细胞及关键基因的改变 | 首次在单细胞水平上揭示了慢性鼻窦炎伴鼻息肉中上皮细胞和成纤维细胞的动态变化及关键基因WFDC2和CCL26的作用 | NA | 探究慢性鼻窦炎伴鼻息肉发展过程中上皮细胞和成纤维细胞的变化及其关键基因 | 慢性鼻窦炎伴鼻息肉中的上皮细胞、成纤维细胞及关键基因 | 数字病理学 | 慢性鼻窦炎 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 15480 | 2024-08-07 |
A resource of single-cell gene expression profiles in a planarian Dugesia japonica
2024-Jan, Development, growth & differentiation
DOI:10.1111/dgd.12893
PMID:37779230
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研究论文 | 本文收集了Dugesia japonica细胞并进行了单细胞RNA测序分析，通过一种新颖的自动迭代细胞聚类策略，生成了包含3,404个细胞的数据集，这些细胞可根据基因表达谱分为63种细胞类型 | 引入了一种新颖的自动迭代细胞聚类策略，生成了包含3,404个细胞的数据集，并展示了该数据集在功能相关基因表达分析中的应用 | NA | 研究Dugesia japonica中的干细胞和再生机制 | Dugesia japonica的单细胞基因表达 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 3,404个细胞 |