单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27648 篇文献，本页显示第 15461 - 15480 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 15461 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing reveals the heterogeneity of epithelial cell and fibroblast cells from non- to metastatic lymph node OTSCC
2024-01, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202301724R
PMID:38169064
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了从非转移性到转移性淋巴结的口腔舌鳞状细胞癌（OTSCC）中的上皮细胞和成纤维细胞的异质性 | 发现了四种不同亚型的癌症相关成纤维细胞（CAFs），并确认了GAS和PTN通路在肿瘤转移进展中的作用 | NA | 旨在全面分析癌症相关成纤维细胞和上皮肿瘤细胞亚群在淋巴结转移性OTSCC中的作用 | 口腔舌鳞状细胞癌（OTSCC）中的上皮细胞和成纤维细胞 | 数字病理学 | 口腔癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 15462 | 2024-08-07 |
Thymic Carcinoma: Unraveling Neuroendocrine Differentiation and Epithelial Cell Identity Loss
2023-12-25, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers16010115
PMID:38201543
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研究论文 | 本文探讨了胸腺癌的神经内分泌分化及上皮细胞身份丧失的基因表达特征 | 发现胸腺癌表现出偏向于簇细胞和离子细胞的神经内分泌表型，并鉴定了HDAC9和NFATC1作为神经内分泌组在成人胸腺上皮细胞和胸腺癌中的特征性表达 | 需要进一步研究HDAC9和NFATC1在胸腺上皮中的作用及其作为胸腺上皮肿瘤治疗靶点的潜力 | 探索胸腺癌的神经内分泌分化及上皮细胞身份丧失的机制 | 胸腺癌的基因表达特征及其与簇细胞、离子细胞和神经内分泌细胞的关系 | 数字病理学 | 胸腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用了来自正常人胸腺的单细胞RNA测序数据集，并分析了公开的胸腺上皮细胞和肺癌的mRNA表达及甲基化状态数据 |
| 15463 | 2024-08-05 |
The origin and structural evolution of de novo genes in Drosophila
2023-Jun-27, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.03.13.532420
PMID:37425675
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研究论文 | 这篇文章研究了果蝇中新基因的起源和结构演化 | 该研究结合高质量全基因组比对、生物信息学分析和计算结构建模，提供了对特定谱系基因的系统性概述 | 对基因结构和功能起源的理解仍然有限，缺乏系统的研究 | 研究果蝇中新基因的起源、演化和蛋白质结构 | 研究特定谱系基因的蛋白质候选者 | 数字病理学 | NA | RNA-seq, Alphafold2, ESMFold, 分子动力学 | NA | 基因组数据 | 分析了555个基因候选者 |
| 15464 | 2024-08-07 |
Single-nuclei RNA-seq on human retinal tissue provides improved transcriptome profiling
2019-12-17, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-019-12917-9
PMID:31848347
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研究论文 | 本研究通过单核RNA测序（snRNA-seq）技术对人类视网膜组织进行了转录组分析 | 本研究展示了单核RNA测序在人类冷冻组织中获取单细胞转录组的能力，相较于人类批量RNA测序或动物模型，提供了更深入的见解 | NA | 通过单核RNA测序技术解析复杂组织中的异质性 | 人类视网膜组织及其细胞类型 | 数字病理学 | NA | 单核RNA测序（snRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 6个样本，来自3名健康捐赠者，共5873个单核 |
| 15465 | 2024-08-07 |
Identification of Cell Type-Specific Effects of DNMT3A Mutations on Relapse in Acute Myeloid Leukemia
2023-Oct-31, Molecules and cells
IF:3.7Q2
DOI:10.14348/molcells.2023.0093
PMID:37853686
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了急性髓系白血病（AML）不同阶段（诊断、完全缓解和复发）的骨髓单个核细胞，以探索DNMT3A突变在细胞类型特异性效应及其对AML复发的影响 | 本研究通过改进R882突变的靶向单细胞RNA测序检测，发现了从完全缓解到复发期间主要残留的突变细胞类型，并揭示了这些细胞与AML和白血病细胞相关的基因特征 | NA | 探索DNMT3A突变在急性髓系白血病中的细胞类型特异性效应及其对复发的影响 | 急性髓系白血病患者的骨髓单个核细胞 | 数字病理学 | 血液病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 来自同一患者在不同AML阶段的骨髓单个核细胞 |
| 15466 | 2024-08-05 |
Integration of Single-Cell RNA-Seq Datasets: A Review of Computational Methods
2023-Feb-28, Molecules and cells
IF:3.7Q2
DOI:10.14348/molcells.2023.0009
PMID:36859475
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综述 | 本文总结了单细胞RNA测序数据集整合方法的概念和优缺点 | 提供了对不同整合方法的全面综述，强调了去除批次效应的方法学进展 | 未能深入探讨所有可能的整合方法和实际应用中的挑战 | 审视和总结单细胞RNA测序数据集整合的计算方法 | 针对公共库中单细胞RNA测序数据集的整合分析方法 | 数字病理 | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | NA | NA |
| 15467 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptomics shows dose-dependent disruption of hepatic zonation by TCDD in mice
2023-01-31, Toxicological sciences : an official journal of the Society of Toxicology
IF:3.4Q2
DOI:10.1093/toxsci/kfac109
PMID:36222588
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研究论文 | 这篇文章使用单细胞转录组学研究TCDD对小鼠肝区分的剂量依赖性破坏。 | 文章通过单细胞核RNA测序和空间转录组学首次揭示了TCDD引起的剂量依赖性基因表达变化和肝区分的破坏。 | 本研究受限于使用小鼠模型，可能无法完全代表人类的生理和病理状态。 | 研究TCDD对小鼠肝脏细胞特异性和空间分布的影响。 | 研究对象为给药后接受TCDD处理的小鼠肝脏细胞。 | 数字病理学 | NA | 单细胞核RNA测序，空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 131,613个细胞核 |
| 15468 | 2024-08-07 |
The Peripheral Immune Landscape in a Patient with Myocarditis after the Administration of BNT162b2 mRNA Vaccine
2022-Oct-31, Molecules and cells
IF:3.7Q2
DOI:10.14348/molcells.2022.0031
PMID:35904026
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和单细胞T细胞受体测序分析，首次描述了接种BNT162b2 mRNA疫苗后发生心肌炎患者的周围免疫景观变化 | 首次使用单细胞RNA测序和单细胞T细胞受体测序分析来描述接种BNT162b2 mRNA疫苗后心肌炎患者的周围免疫景观变化 | 研究样本仅为单一患者，可能影响结果的普遍性 | 探究BNT162b2 mRNA疫苗接种后心肌炎的发病机制 | 接种BNT162b2 mRNA疫苗后发生心肌炎患者的周围免疫景观 | NA | 心肌炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 单一患者 |
| 15469 | 2024-08-07 |
Transcriptional Heterogeneity of Cellular Senescence in Cancer
2022-Sep-30, Molecules and cells
IF:3.7Q2
DOI:10.14348/molcells.2022.0036
PMID:35983702
|
综述 | 本文综述了单细胞RNA测序（scRNA-seq）技术在解析癌症细胞衰老相关基因表达异质性中的应用 | 利用scRNA-seq技术揭示了癌症细胞中衰老相关基因表达的多样性及其在肿瘤恶性转化中的作用 | NA | 探讨衰老细胞在肿瘤恶性转化中的作用及衰老相关基因在肿瘤微环境中的功能 | 癌症细胞及肿瘤微环境中的基质细胞 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | NA |
| 15470 | 2024-08-07 |
IL-13-programmed airway tuft cells produce PGE2, which promotes CFTR-dependent mucociliary function
2022-07-08, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.159832
PMID:35608904
|
研究论文 | 本文研究了IL-13在慢性2型炎症呼吸道疾病中对气道簇细胞的影响，发现IL-13能扩展和编程气道簇细胞向前列腺素E2代谢，进而促进囊性纤维化跨膜传导调节因子依赖的纤毛功能。 | 首次揭示了气道簇细胞在过敏性气道中调节上皮纤毛功能的作用。 | NA | 探讨IL-13在慢性2型炎症呼吸道疾病中对气道簇细胞的影响及其对纤毛功能的作用。 | 气道簇细胞及其在2型炎症中的作用。 | NA | 呼吸道疾病 | RNA测序 | NA | RNA | 使用大量和单细胞RNA测序分析气道上皮和鼠模型。 |
| 15471 | 2024-08-07 |
Trophoblast Cell Subtypes and Dysfunction in the Placenta of Individuals with Preeclampsia Revealed by Single‑Cell RNA Sequencing
2022-May-31, Molecules and cells
IF:3.7Q2
DOI:10.14348/molcells.2021.0211
PMID:35289305
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，揭示了先兆子痫患者胎盘中滋养层细胞亚型及其功能异常的转录组变化 | 首次在单细胞水平上比较了健康对照组和先兆子痫组胎盘中滋养层细胞的转录组差异，并分析了相关的转录因子调控网络 | 研究主要集中在转录组水平，未涉及蛋白质水平或其他层面的功能验证 | 探究先兆子痫患者胎盘中滋养层细胞亚型的特异性转录组变化及其功能 | 胎盘组织中的滋养层细胞和免疫细胞 | 数字病理学 | 妊娠疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 29,006个细胞，包括11种细胞类型 |
| 15472 | 2024-08-07 |
Gene Expression Profiling of the Habenula in Rats Exposed to Chronic Restraint Stress
2022-May-31, Molecules and cells
IF:3.7Q2
DOI:10.14348/molcells.2022.2257
PMID:35534192
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研究论文 | 本研究通过基因组范围的基因表达分析，研究了暴露于慢性束缚应激下的大鼠缰核的转录组变化 | 本研究首次识别了379个受慢性应激影响的差异表达基因（DEGs），并分析了这些基因在神经活性配体-受体相互作用、cAMP信号通路、昼夜节律同步和突触信号传导中的富集情况 | NA | 探讨慢性应激对大鼠缰核基因表达的影响及其在抑郁症发病机制中的作用 | 大鼠缰核的基因表达 | 神经科学 | 抑郁症 | 基因表达分析 | NA | 基因表达数据 | 14天慢性束缚应激暴露的大鼠缰核样本 |
| 15473 | 2024-08-07 |
RAGE Inhibitors as Alternatives to Dexamethasone for Managing Cerebral Edema Following Brain Tumor Surgery
2022-03, Neurotherapeutics : the journal of the American Society for Experimental NeuroTherapeutics
IF:5.6Q1
DOI:10.1007/s13311-022-01207-w
PMID:35226341
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研究论文 | 研究了RAGE抑制剂在减少脑肿瘤手术后脑水肿中的作用，并比较了其与地塞米松的效果 | 发现RAGE抑制剂在减少神经炎症和血脑屏障破坏方面与地塞米松同样有效，且不会影响抗PD-1免疫疗法的效果 | 研究主要在动物模型和有限的临床样本中进行，需要进一步的人体临床试验验证 | 探索脑肿瘤手术后脑水肿管理的新方法 | RAGE受体及其配体在神经外科损伤后的炎症反应中的作用 | NA | 脑肿瘤 | Nanostring, 流式细胞术, qPCR, 免疫印迹, 单细胞RNA测序, ELISA | NA | 组织, 体液 | 小鼠模型和人类肿瘤组织及体液样本 |
| 15474 | 2024-08-07 |
Single-Cell Toolkits Opening a New Era for Cell Engineering
2021-Mar-31, Molecules and cells
IF:3.7Q2
DOI:10.14348/molcells.2021.0002
PMID:33795531
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序（scRNA-seq）工具包的发展及其在细胞工程中的应用 | 介绍了单细胞RNA测序技术的发展，使得研究人员能够以单细胞分辨率比较转录组，从而更深入地理解细胞功能 | 高吞吐量的单细胞'omics'工具的快速发展需要有效的假设验证策略 | 探讨细胞工程工具包的当前状态及其对单细胞和全基因组数据收集与分析的贡献 | 单细胞RNA测序工具包及其在细胞工程中的应用 | NA | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | NA |
| 15475 | 2024-08-07 |
Single-cell technologies in reproductive immunology
2019-09, American journal of reproductive immunology (New York, N.Y. : 1989)
DOI:10.1111/aji.13157
PMID:31206899
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综述 | 本文综述了单细胞技术在生殖免疫学中的应用，特别是如何通过这些技术来理解母胎界面的复杂免疫环境 | 介绍了单细胞RNA测序与微流控技术结合，以及多色流式细胞术在识别新型细胞类型中的应用 | 生成的数据集具有极高的维度和大小，需要应用新的计算方法进行无偏分析 | 为生殖免疫学界提供关于复杂流式细胞术和RNA测序数据获取及分析的计算工具的概述和简要入门 | 母胎界面的免疫环境及其中的细胞类型 | 生殖免疫学 | NA | 单细胞RNA测序，多色流式细胞术 | tSNE，SPADE，SPICE | 细胞分辨率的数据 | NA |
| 15476 | 2024-08-07 |
Dissecting Cellular Heterogeneity Using Single-Cell RNA Sequencing
2019-Mar-31, Molecules and cells
IF:3.7Q2
DOI:10.14348/molcells.2019.2446
PMID:30764602
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序（scRNA-seq）技术在解析细胞异质性中的应用 | 介绍了scRNA-seq技术如何通过提供来自数万个单个细胞的全基因组分子轮廓来定量和无偏地表征细胞异质性 | NA | 探讨如何利用scRNA-seq数据解释观察到的细胞间变异性 | 细胞异质性 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 数万个单个细胞 |
| 15477 | 2024-08-05 |
Effect of aging on the human myometrium at single-cell resolution
2024-Jan-31, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-45143-z
PMID:38296945
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research paper | 本研究构建了来自186,120个细胞的人类子宫肌层老化细胞图谱 | 首次使用单细胞RNA测序和空间转录组学技术揭示年龄对人类子宫肌层的影响 | 研究仅限于20名围绝经期和绝经后女性的样本 | 研究衰老对人类子宫肌层功能的影响及其对妊娠和分娩的潜在影响 | 针对围绝经期和绝经后女性的人类子宫肌层细胞进行分析 | NA | NA | 单细胞RNA测序和空间转录组学 | NA | 细胞 | 20名围绝经期和绝经后女性的186,120个细胞 |
| 15478 | 2024-08-07 |
A cell atlas of the larval Aedes aegypti ventral nerve cord
2024-Jan-31, Neural development
IF:4.0Q2
DOI:10.1186/s13064-023-00178-8
PMID:38297398
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研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序技术，全面展示了埃及伊蚊幼虫腹神经索（VNC）的细胞组成 | 首次详细描述了埃及伊蚊幼虫VNC中的35种以上细胞类型，并探讨了单胺能和肽能神经元的多样性 | NA | 深入理解影响蚊子宿主寻找行为和病原体传播的发育事件 | 埃及伊蚊幼虫的腹神经索（VNC） | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 超过35种VNC细胞类型 |
| 15479 | 2024-08-07 |
NADase CD38 is a key determinant of ovarian aging
2024-Jan, Nature aging
IF:17.0Q1
DOI:10.1038/s43587-023-00532-9
PMID:38129670
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研究论文 | 本文通过分析年轻和中老年小鼠不同器官的转录组景观，揭示了卵巢早衰的机制，特别是NADase CD38表达增加和NAD水平下降对卵巢衰老的影响。 | 首次揭示了CD38在卵巢早衰中的关键作用，并提供了通过抑制CD38来改善中老年雌性小鼠生育能力的潜在治疗方法。 | NA | 探讨卵巢早衰的机制并寻找潜在的治疗方法。 | 小鼠的卵巢和其他器官。 | NA | 卵巢早衰 | RNA测序 | NA | 转录组数据 | 年轻和中老年小鼠的多个器官 |
| 15480 | 2024-08-05 |
RENGE infers gene regulatory networks using time-series single-cell RNA-seq data with CRISPR perturbations
2023-12-28, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-023-05594-4
PMID:38155269
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research paper | 本研究提出了RENG，利用时间序列单细胞CRISPR数据推断基因调控网络 | RENG能够区分直接和间接调控，超越当前方法在基因调控网络推断的准确性 | 该方法的局限性在于依赖于时间序列单细胞数据 | 研究目的是推断基因调控网络 | 研究对象为人诱导多能干细胞的单细胞RNA-seq数据 | 数字病理 | NA | CRISPR扰动 | NA | 单细胞RNA-seq | 来自人诱导多能干细胞的数据集 |