单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 28561 篇文献，本页显示第 15401 - 15420 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 15401 | 2024-08-07 |
Ezrin's role in gastric cancer progression: Implications for immune microenvironment modulation and therapeutic potential
2024-Mar-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e27155
PMID:38449647
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研究论文 | 本研究通过蛋白质组技术分析胃癌细胞系MKN-45和HGC-27之间的差异表达蛋白，筛选出ezrin作为目标蛋白，并探讨了ezrin表达水平与免疫微环境和基因组变化之间的关系。 | 首次探讨了ezrin在胃癌中的免疫调节作用及其与基因组不稳定性的关系，并预测了ezrin与免疫治疗和化疗敏感性的关联。 | 研究主要基于细胞系和数据库分析，未来需要更多临床样本验证ezrin在胃癌中的作用。 | 阐明ezrin在胃癌中的预后、免疫学和治疗价值。 | 胃癌细胞系MKN-45和HGC-27，以及TCGA和GEO数据库中的患者信息。 | 数字病理学 | 胃癌 | 蛋白质组技术 | NA | 蛋白质数据 | 涉及胃癌细胞系和数据库中的患者信息 |
| 15402 | 2024-08-07 |
Bulk anda single-cell transcriptome profiling reveals the molecular characteristics of T cell-mediated tumor killing in pancreatic cancer
2024-Mar-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e27216
PMID:38449660
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研究论文 | 本文通过批量和单细胞转录组分析，揭示了胰腺癌中T细胞介导的肿瘤杀伤的分子特征 | 开发了TRGscore评分系统，有效预测胰腺癌患者对化疗或免疫治疗的反应及总体生存率 | NA | 探索胰腺癌中T细胞介导的肿瘤杀伤的分子机制，并识别可能从免疫检查点阻断治疗中获益的患者亚群 | 胰腺癌患者的T细胞介导的肿瘤杀伤机制 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 转录组分析 | NA | 基因表达数据 | 涉及胰腺癌患者的样本，分为两个亚群进行分析 |
| 15403 | 2024-08-07 |
Loss of chromosome Y in regulatory T cells
2024-Mar-05, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-024-10168-7
PMID:38443832
|
研究论文 | 研究探讨了染色体Y在调节性T细胞中的缺失情况及其对T淋巴细胞分化的影响 | 首次发现调节性T细胞中染色体Y的缺失显著增加，并影响淋巴细胞分化 | 研究样本量有限，需要进一步的大规模研究验证 | 探究染色体Y在特定CD4+ T淋巴细胞亚群中的缺失情况及其对疾病风险的影响 | 调节性T细胞及其他T淋巴细胞亚群 | 免疫学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 23个PBMC样本和32个CD4+ T淋巴细胞富集样本 |
| 15404 | 2024-08-07 |
Targeted knockdown of PGAM5 in synovial macrophages efficiently alleviates osteoarthritis
2024-Mar-04, Bone research
IF:14.3Q1
DOI:10.1038/s41413-024-00318-8
PMID:38433252
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研究论文 | 本研究探讨了磷酸甘油酸变位酶5（PGAM5）在滑膜巨噬细胞中的作用及其对骨关节炎（OA）的影响 | 首次发现PGAM5在OA滑膜巨噬细胞中的显著增加，并通过条件性敲除PGAM5减轻OA症状，促进软骨细胞的合成代谢 | NA | 研究PGAM5在滑膜巨噬细胞中的作用，探索其作为治疗骨关节炎的新策略 | 骨关节炎（OA）中的滑膜巨噬细胞和软骨细胞 | 数字病理学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 人类样本的组织学分析和鼠模型的单细胞RNA测序结果 |
| 15405 | 2024-08-04 |
Drug resistance mechanisms in dopamine agonist-resistant prolactin pituitary neuroendocrine tumors and exploration for new drugs
2024-Mar, Drug resistance updates : reviews and commentaries in antimicrobial and anticancer chemotherapy
IF:15.8Q1
DOI:10.1016/j.drup.2024.101056
PMID:38277755
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研究论文 | 本研究探讨了耐多巴胺激动剂的泌乳素瘤中的耐药机制，并探索了新的潜在药物。 | 本研究首次发现耐多巴胺激动剂的泌乳素瘤与Focal Adhesion信号通路的上调相关，并筛选出了新药Genistein作为潜在的有效治疗药物。 | 研究主要集中在小样本量的组织模型和细胞系上，可能影响结果的普适性。 | 调查泌乳素瘤中的多巴胺激动剂耐药机制并识别新的潜在有效药物。 | 研究对象为27例耐多巴胺激动剂的泌乳素瘤和10例敏感泌乳素瘤的病例。 | 数字病理学 | 泌乳素瘤 | 转录组测序和单细胞测序 | 类器官模型 | 组织样本和细胞系 | 27例耐药泌乳素瘤，10例敏感泌乳素瘤，3例耐药和3例敏感的单细胞 |
| 15406 | 2024-08-07 |
MAFF confers vulnerability to cisplatin-based and ionizing radiation treatments by modulating ferroptosis and cell cycle progression in lung adenocarcinoma
2024-Mar, Drug resistance updates : reviews and commentaries in antimicrobial and anticancer chemotherapy
IF:15.8Q1
DOI:10.1016/j.drup.2024.101057
PMID:38266355
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研究论文 | 本研究探讨了MAFF在肺腺癌中的作用及其对顺铂和电离辐射治疗的影响 | 首次揭示了MAFF通过调节铁死亡和细胞周期进程影响肺腺癌对顺铂和电离辐射治疗的敏感性 | NA | 研究MAFF在肺腺癌中的作用及其对化疗和放疗的影响 | 肺腺癌细胞和肿瘤模型 | 数字病理学 | 肺癌 | CRISPR筛选、单细胞RNA测序、RNA和ChIP测序 | NA | RNA | 细胞和小鼠模型 |
| 15407 | 2024-08-07 |
The role of histone H1.2 in pancreatic cancer metastasis and chemoresistance
2024-Mar, Drug resistance updates : reviews and commentaries in antimicrobial and anticancer chemotherapy
IF:15.8Q1
DOI:10.1016/j.drup.2023.101027
PMID:38290407
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研究论文 | 本研究探讨了胰腺癌（PC）中的化学耐药性和肿瘤转移之间的联系及其分子和细胞机制 | 构建并验证了一个转移和化学耐药性特征（MCS）评分系统，并发现H1-2的高表达与化学耐药性和上皮-间质转化（EMT）相关 | NA | 探索胰腺癌中化学耐药性和肿瘤转移之间的联系及其可能的分子和细胞机制 | 胰腺癌的化学耐药性和肿瘤转移 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 15408 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptome analysis reveals the association between histone lactylation and cisplatin resistance in bladder cancer
2024-Mar, Drug resistance updates : reviews and commentaries in antimicrobial and anticancer chemotherapy
IF:15.8Q1
DOI:10.1016/j.drup.2024.101059
PMID:38295753
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析，揭示了组蛋白乳酸化与膀胱癌顺铂耐药性的关联 | 首次发现H3赖氨酸18乳酸化（H3K18la）在顺铂耐药膀胱癌细胞中的重要作用，并通过靶向抑制H3K18la恢复了顺铂敏感性 | NA | 探讨膀胱癌顺铂耐药的机制，并寻找新的干预靶点 | 膀胱癌顺铂耐药细胞及组蛋白乳酸化 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 特定数量的膀胱癌细胞 |
| 15409 | 2024-08-04 |
ITGAM-mediated macrophages contribute to basement membrane damage in diabetic nephropathy and atherosclerosis
2024-Feb-27, BMC nephrology
IF:2.2Q2
DOI:10.1186/s12882-024-03505-1
PMID:38413872
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研究论文 | 本研究分析了ITGAM介导的巨噬细胞在糖尿病肾病和动脉粥样硬化中的作用 | 发现ITGAM作为关键基因参与了糖尿病肾病和动脉粥样硬化中的基底膜损伤 | 未提供研究中可能存在的具体局限性信息 | 研究糖尿病肾病和动脉粥样硬化中的基底膜损伤及其相关机制 | 糖尿病肾病和动脉粥样硬化患者的转录组特征 | 生物信息学 | 糖尿病相关并发症 | 转录组分析、免疫浸润分析、单细胞测序 | 机器学习模型 | 基因表达数据 | 来源于基因表达综合数据库的糖尿病肾病和动脉粥样硬化患者样本 |
| 15410 | 2024-08-04 |
Connecting genomic results for psychiatric disorders to human brain cell types and regions reveals convergence with functional connectivity
2024-Jan-20, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.1101/2024.01.18.24301478
PMID:38410450
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研究论文 | 本研究整合了精神障碍的基因组结果与人脑细胞类型和区域，揭示了功能连接的汇聚 | 本研究利用人类成年大脑综合图谱，重点关注精神障碍的特定神经元簇，并探讨了其与基因组和转录组数据的结合 | 先前的研究主要依赖于小鼠图谱，可能限制了结果的普遍适用性 | 探讨精神障碍的时间和空间脑区，促进针对性的神经生物研究 | 包括精神分裂症、双相障碍和重度抑郁障碍的神经元簇及其与智力、教育和神经质的关系 | 数字病理学 | 精神障碍 | 单细胞转录组技术 | NA | 基因组、转录组和功能MRI连接数据 | 精神分裂症患者与神经典型对照的功能MRI数据 |
| 15411 | 2024-08-07 |
A mouse model of ZTTK syndrome reveals indispensable SON functions in organ development and hematopoiesis
2023-Nov-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.11.19.567732
PMID:38014320
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研究论文 | 本文开发了ZTTK综合征的小鼠模型，揭示了SON基因在器官发育和造血中的不可或缺的作用 | 首次建立了ZTTK综合征的小鼠模型，并详细研究了SON基因在器官发育和造血中的功能 | NA | 研究SON基因在ZTTK综合征中的作用及其在器官发育和造血中的功能 | ZTTK综合征的小鼠模型 | 遗传学 | 罕见病 | 单细胞转录组分析 | 小鼠模型 | 基因表达数据 | NA |
| 15412 | 2024-08-04 |
Spatial enrichment of the type 1 interferon signature in the brain of a neuropsychiatric lupus murine model
2023-11, Brain, behavior, and immunity
DOI:10.1016/j.bbi.2023.06.021
PMID:37369340
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研究论文 | 本研究在神经精神性狼疮小鼠模型中验证了1型干扰素的空间富集 | 揭示了1型干扰素在中枢神经系统中的信号作用及其与神经精神性症状的关系 | 尚未明确1型干扰素信号在中枢神经系统中如何导致神经精神后遗症 | 探讨1型干扰素在神经精神性狼疮中的作用机制 | 使用神经精神性狼疮小鼠模型进行研究 | 数字病理学 | 系统性红斑狼疮 | 单细胞核测序，图像基础空间转录组学 | 小鼠模型 | 基因组数据 | 小鼠模型样本，具体样本数量未提及 |
| 15413 | 2024-08-07 |
Unraveling the activation process and core driver genes of HSCs during cirrhosis by single-cell transcriptome
2023-08, Experimental biology and medicine (Maywood, N.J.)
DOI:10.1177/15353702231191109
PMID:37674431
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序分析了非肝硬化和肝硬化肝组织样本，深入探索了肝星状细胞（HSCs）的激活过程并发现了更好的治疗靶基因 | 通过单细胞RNA测序和伪时间分析，揭示了HSCs向肌成纤维细胞分化的关键基因，并识别了HSCs从静止到激活状态的主要调控因子 | NA | 深入探索肝星状细胞（HSCs）的激活过程并发现更好的治疗靶基因 | 肝星状细胞（HSCs）及其在肝硬化中的激活过程 | 数字病理学 | 肝硬化 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 13个非肝硬化肝组织样本和10个肝硬化肝组织样本 |
| 15414 | 2024-08-07 |
Establishment of the large-scale longitudinal multi-omics dataset in COVID-19 patients: data profile and biospecimen
2022-Sep, BMB reports
IF:2.9Q3
PMID:35996834
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研究论文 | 本文建立了COVID-19患者的大规模纵向多组学数据集，并提供了数据概况和生物样本信息 | 本研究收集了300名COVID-19患者和120名健康对照的全面生物样本和纵向多组学数据，包括全基因组测序、单细胞RNA测序结合T细胞受体和B细胞受体测序等 | NA | 旨在帮助管理当前和未来的病毒介导的流行病，并促进对COVID-19感染中涉及的生物相互作用的理解 | COVID-19患者的生物样本和多组学数据 | 数字病理学 | COVID-19 | 全基因组测序、单细胞RNA测序结合T细胞受体和B细胞受体测序、批量TCR/BCR测序、细胞因子 profiling | NA | 生物样本和多组学数据 | 300名COVID-19患者和120名健康对照 |
| 15415 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptomic analysis reveals key immune cell phenotypes in the lungs of patients with asthma exacerbation
2021-03, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2020.09.032
PMID:33039479
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析，揭示了哮喘急性发作患者肺部关键免疫细胞表型 | 本研究首次在单细胞水平上识别了与哮喘急性发作强烈相关的候选基因，并揭示了多个细胞簇中共享的复杂分子框架 | NA | 旨在识别与哮喘急性发作在细胞水平上强烈相关的候选基因 | 哮喘急性发作患者及健康对照者的支气管肺泡灌洗液中的细胞 | 数字病理学 | 哮喘 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 哮喘急性发作患者和健康对照者 |
| 15416 | 2024-08-04 |
A dynamical perspective: moving towards mechanism in single-cell transcriptomics
2024-Apr-22, Philosophical transactions of the Royal Society of London. Series B, Biological sciences
DOI:10.1098/rstb.2023.0049
PMID:38432314
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评论 | 本文探讨了单细胞转录组学中从表象描述转向机制理解的重要性 | 提出在单细胞分辨率下捕获动态信息的价值，以获取机制见解 | 未明确指出该研究的具体限制 | 目的在于促进对基因调控的机制理解 | 主要研究单细胞转录组学技术和动态信息 | 数字病理学 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 15417 | 2024-08-04 |
Detecting horizontal gene transfer with metagenomics co-barcoding sequencing
2024-Mar-05, Microbiology spectrum
IF:3.7Q2
DOI:10.1128/spectrum.03602-23
PMID:38315121
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研究论文 | 本文开发了一种新的元基因组共条形码测序系统，以检测水平基因转移 (HGT) | 引入了元基因组共条形码测序（MECOS），实现了长DNA片段提取和综合生物信息学管道 | 传统方法如短读长程元基因组测序和单细胞测序存在片段短、输入DNA量大、测序成本高等限制 | 旨在揭示微生物群落中水平基因转移的机制 | 研究对象为人类和小鼠的肠道微生物群落 | 数字病理学 | NA | 元基因组共条形码测序 | NA | DNA序列 | 超过3000个HGT块，涉及约6000个基因和100个分类组 |
| 15418 | 2024-08-07 |
Identification and validation of RNA-binding protein SLC3A2 regulates melanocyte ferroptosis in vitiligo by integrated analysis of single-cell and bulk RNA-sequencing
2024-Mar-04, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-024-10147-y
PMID:38438962
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研究论文 | 本研究通过综合分析单细胞和批量RNA测序数据，识别并验证了RNA结合蛋白SLC3A2调控黑色素细胞铁死亡在白癜风中的作用。 | 首次确定了与白癜风相关的RNA结合蛋白基因及其潜在的发病机制，特别是在黑色素细胞中SLC3A2的下调促进铁死亡的作用。 | 研究主要集中在细胞实验层面，未来需要进一步的临床研究来验证这些发现。 | 揭示白癜风的发病机制，特别是RNA结合蛋白在其中的作用。 | 白癜风患者的不同细胞亚群及其RNA结合蛋白基因。 | 数字病理学 | 白癜风 | 单细胞转录组测序（scRNA-seq），批量RNA测序（RNA-seq） | NA | RNA | 14种不同细胞类型，28种细胞亚群 |
| 15419 | 2024-08-04 |
Domain generalization enables general cancer cell annotation in single-cell and spatial transcriptomics
2024-Mar-02, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-46413-6
PMID:38431724
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研究论文 | 该文章介绍了一种基于领域泛化的深度学习算法Cancer-Finder，能够快速识别恶性细胞 | 提出了一种新的算法Cancer-Finder，具有95.16%的准确率并能跨多个数据集进行恶性细胞标注 | 目前研究未提及该算法在其他类型癌症样本上的表现 | 研究旨在提高单细胞和空间转录组数据中恶性细胞的注释准确性 | 研究对象为清晰细胞肾细胞癌的空间转录组样本 | 数字病理学 | 肾细胞癌 | 单细胞转录组测序和空间转录组测序 | 深度学习 | 基因表达数据 | 5个清晰细胞肾细胞癌的空间转录组样本 |
| 15420 | 2024-08-04 |
High-throughput mapping of single-neuron projection and molecular features by retrograde barcoded labeling
2024-Feb-23, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.85419
PMID:38390967
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研究论文 | 该文章建立了一种新型的多重追踪方法，同时表征单神经元的投射组和转录组 | 提出了rAAV2-retro条形码的多重追踪方法，能够同时分析神经元投射和转录组特征 | 该研究在复杂脑网络中可能仍面临技术挑战 | 帮助揭示神经电路的组织原则和信息处理机制 | 探究腹内侧前额叶皮层(vmPFC)神经元的投射模式及其分子特征 | 神经科学 | NA | 条形码连接组学 | NA | 转录组数据 | 大量单神经元样本 |