单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 28135 篇文献，本页显示第 15401 - 15420 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 15401 | 2024-08-04 |
Glycogen metabolism-mediated intercellular communication in the tumor microenvironment influences liver cancer prognosis
2024, Oncology research
IF:2.0Q3
DOI:10.32604/or.2023.029697
PMID:38361757
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研究论文 | 本研究揭示了糖原代谢在肝细胞癌微环境中介导细胞间通信的作用 | 首次揭示了糖原代谢在肝细胞癌微环境中介导细胞间通信的机制 | 暂无该研究的局限性信息 | 探讨糖原代谢在肝细胞癌微环境中的功能及其对预后的影响 | 肝细胞癌肿瘤样本中的69个细胞簇和65个糖原代谢基因 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 10个HCC肿瘤样本，共计64,545个细胞 |
| 15402 | 2024-08-07 |
Single-cell profiling reveals the trajectory of FOLR2-expressing tumor-associated macrophages to regulatory T cells in the progression of lung adenocarcinoma
2023-08-02, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-023-06021-6
PMID:37532692
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了肺腺癌（LUAD）中免疫抑制微环境的形成机制，揭示了FOLR2表达的肿瘤相关巨噬细胞向调节性T细胞的转变轨迹。 | 首次通过单细胞转录组图谱揭示了从癌前到侵袭性LUAD的免疫抑制微环境形成的潜在轨迹，包括ARM-RETN/TAM-FOLR2/DCs/CD4NR4A3/CD4FOXP3的转变。 | 研究样本量较小，仅包括12个LUAD样本和3个正常肺样本，可能影响结果的普遍性。 | 探究肺腺癌中免疫抑制微环境的细胞机制。 | 肺腺癌样本和正常肺样本中的细胞成分和转录组。 | 数字病理学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 12个肺腺癌样本和3个正常肺样本 |
| 15403 | 2024-08-07 |
Cell Layers: uncovering clustering structure in unsupervised single-cell transcriptomic analysis
2022, Bioinformatics advances
IF:2.4Q2
DOI:10.1093/bioadv/vbac051
PMID:35967929
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研究论文 | 本文开发了一种名为Cell Layers的交互式Sankey工具，用于在不同聚类分辨率下定量研究基因表达、共表达、生物过程和聚类完整性 | Cell Layers工具通过链接分子数据和聚类评估指标，增强了单细胞聚类的可解释性，并提供了对细胞群体的新见解 | NA | 开发一种新的工具来提高单细胞转录组无监督聚类的解释性 | 单细胞转录组数据及其聚类结果 | 生物信息学 | NA | 单细胞转录组分析 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 15404 | 2024-08-04 |
scRNA-seq revealed high stemness epithelial malignant cell clusters and prognostic models of lung adenocarcinoma
2024-02-14, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-54135-4
PMID:38355636
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研究论文 | 本研究结合单细胞RNA-seq分析识别肿瘤干细胞相关的预后模型，以预测肺腺癌的预后、化疗药物及免疫治疗效果 | 本研究提出了一种基于干细胞相关基因的模型，以预测肺腺癌的预后和免疫微环境 | 该研究的样本量及数据来源可能限制了结论的广泛适用性 | 研究肺腺癌的预后因素及干细胞特征 | 样本包括高干细胞特征的恶性上皮细胞和肺腺癌患者的肿瘤样本 | 数字病理 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | CoxBoost + RSF模型 | 转录组数据 | NA |
| 15405 | 2024-08-07 |
Hybrid Oncocytic Tumors (HOTs) in Birt-Hogg-Dubé Syndrome Patients-A Tale of Two Cities: Sequencing Analysis Reveals Dual Lineage Markers Capturing the 2 Cellular Populations of HOT
2024-Feb-01, The American journal of surgical pathology
DOI:10.1097/PAS.0000000000002152
PMID:37994665
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研究论文 | 本研究通过综合分析批量和单细胞RNA测序数据，揭示了Birt-Hogg-Dubé综合征相关混合性嗜酸性肿瘤（HOT）中的两个细胞系标记物L1CAM和LINC01187，这些标记物在HOT中以独特的棋盘模式相互排斥表达，有助于区分HOT与其他肾细胞癌亚型。 | 本研究首次揭示了L1CAM和LINC01187作为HOT的独特标记物，能够区分HOT与其他肾细胞癌亚型，并捕捉到HOT中两种不同的肿瘤上皮细胞群体。 | NA | 研究Birt-Hogg-Dubé综合征相关混合性嗜酸性肿瘤（HOT）的分子标记物，以提高其诊断准确性。 | Birt-Hogg-Dubé综合征患者的混合性嗜酸性肿瘤（HOT）及其与其他肾细胞癌亚型的区分。 | 数字病理学 | 肾细胞癌 | RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 涉及肾肿瘤和正常肾组织样本 |
| 15406 | 2024-08-04 |
An aging-related immune landscape in the hematopoietic immune system
2024-Jan-02, Immunity & ageing : I & A
IF:5.2Q1
DOI:10.1186/s12979-023-00403-2
PMID:38169405
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研究论文 | 本文描述了年轻和老年小鼠的脾脏和骨髓的造血免疫图谱 | 研究揭示了老化过程中造血干细胞的功能和组成发生了重大变化 | 未提及具体的样本数量和多样性 | 探讨老龄化对造血免疫系统的整体影响 | 年轻和老年小鼠的造血免疫系统 | 数字病理 | 老年疾病 | 单细胞测序和流式细胞术 | NA | 细胞 | NA |
| 15407 | 2024-08-07 |
leptin b and its regeneration enhancer illustrate the regenerative features of zebrafish hearts
2024-Jan, Developmental dynamics : an official publication of the American Association of Anatomists
IF:2.0Q3
DOI:10.1002/dvdy.556
PMID:36495292
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研究论文 | 本研究利用leptin b及其组织再生增强子元素（TREE）分析了斑马鱼心脏再生过程中非心肌细胞（CMs）的异质性 | 通过单细胞RNA测序（scRNA-seq）分析，揭示了损伤后内皮/心内膜（EC）的激活及其在再生过程中的作用 | NA | 探讨斑马鱼心脏再生过程中的细胞类型和因子 | 斑马鱼心脏再生过程中的非心肌细胞（CMs） | 生物学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | NA |
| 15408 | 2024-08-07 |
GAS6 attenuates sepsis-induced cardiac dysfunction through NLRP3 inflammasome-dependent mechanism
2024-01, Free radical biology & medicine
|
研究论文 | 本研究探讨了GAS6在脓毒症引起的心脏功能障碍中的心肌调节作用及其通过NLRP3炎症小体的机制 | 首次揭示了GAS6通过调节NLRP3炎症小体减轻脓毒症引起的心脏功能障碍 | NA | 研究GAS6在脓毒症中的心肌保护作用及其机制 | GAS6在脓毒症中的作用及其对心脏功能的影响 | NA | 脓毒症 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 包括脓毒症患者和脓毒症小鼠模型 |
| 15409 | 2024-08-07 |
Localizing Hormone Receptor Expression to Cellular Compartments in Idiopathic Subglottic Stenosis
2023-12, The Laryngoscope
DOI:10.1002/lary.30856
PMID:37382162
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，定位了特发性声门下狭窄（iSGS）患者中雌激素受体（ESR1和ESR2）和孕激素受体（PGR）在特定细胞亚群中的表达 | 首次通过单细胞RNA测序技术，详细分析了iSGS患者中激素受体在不同细胞亚群中的表达模式 | 研究样本量较小，且仅限于iSGS患者，可能影响结果的普遍性 | 探究雌激素和孕激素受体在iSGS病理发生中的作用机制 | 特发性声门下狭窄（iSGS）患者的气道瘢痕和健康黏膜组织 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNAseq） | NA | RNA | 25,974个单独测序的细胞，来自7例声门下瘢痕和3例匹配的无影响黏膜的iSGS患者 |
| 15410 | 2024-08-07 |
A gain-of-function variation in PLCG1 causes a new immune dysregulation disease
2023-11, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2023.06.020
PMID:37422272
|
研究论文 | 本文研究了一种新的免疫调节疾病，由PLCG1酶的获得性功能变异引起 | 首次报道了人类疾病中的生殖系PLCG1突变，并揭示了PLCG1激活变异在免疫失调中的关键作用 | NA | 探究PLCG1激活变异在免疫失调中的分子发病机制 | PLCG1激活变异对蛋白质功能和免疫信号的影响 | NA | 免疫调节疾病 | 全外显子测序, 批量RNA测序, 单细胞RNA测序, 定量PCR, 飞行时间流式细胞术, 免疫印迹, 流式细胞术, 荧光素酶测定, IP-One ELISA, 钙通量测定 | NA | RNA, 蛋白质 | 一名早期发病的免疫失调疾病患者, COS-7和Jurkat细胞系 |
| 15411 | 2024-08-07 |
ScRNA-seq expression of IFI27 and APOC2 identifies four alveolar macrophage superclusters in healthy BALF
2022-11, Life science alliance
IF:3.3Q1
DOI:10.26508/lsa.202201458
PMID:35820705
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了健康和未发炎的囊性纤维化患者的支气管肺泡灌洗细胞，识别出四种肺泡巨噬细胞超级集群 | 首次通过ScRNA-seq技术识别出四种肺泡巨噬细胞超级集群，并揭示了它们在不同个体中的功能特化和比例保守性 | 研究样本仅包括健康个体和未发炎的囊性纤维化患者，可能限制了结果的普遍性 | 探究肺泡巨噬细胞的异质性和多样性角色，以更好地治疗呼吸道疾病 | 肺泡巨噬细胞、间质巨噬细胞和招募的单核细胞 | 数字病理学 | 囊性纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 113,213个支气管肺泡灌洗细胞 |
| 15412 | 2024-08-07 |
A deep learning adversarial autoencoder with dynamic batching displays high performance in denoising and ordering scRNA-seq data
2024-Mar-15, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.109027
PMID:38361616
|
研究论文 | 本文提出了一种动态批量对抗自编码器（DB-AAE），用于提高单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据的去噪效果和生物信号保留 | DB-AAE能够直接从输入数据中捕获最优特征，并增强特征保留，包括细胞类型特异性基因表达模式 | NA | 提高scRNA-seq数据分析的质量和可靠性 | scRNA-seq数据的去噪和生物信号保留 | 机器学习 | NA | scRNA-seq | 对抗自编码器（AAE） | 基因表达数据 | NA |
| 15413 | 2024-08-04 |
Biomarkers and prognostic factors of PD-1/PD-L1 inhibitor-based therapy in patients with advanced hepatocellular carcinoma
2024-Feb-14, Biomarker research
IF:9.5Q1
DOI:10.1186/s40364-023-00535-z
PMID:38355603
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综述 | 本文总结了PD-1/PD-L1抑制剂在晚期肝细胞癌患者中的生物标志物和预后因素。 | 首次通过评估单细胞测序和空间转录组学的最新进展，揭示肿瘤异质性以及其生物标志物与预后的关系 | 可能缺乏关于某些预后因素和生物标志物的具体临床应用示例 | 探讨晚期肝细胞癌患者中使用PD-1/PD-L1抑制剂的生物标志物与预后因素 | 晚期肝细胞癌患者及其肿瘤微环境中的相关标志物 | 数字病理学 | 肝癌 | NGS, 单细胞测序, 空间转录组学 | NA | 临床数据, 生物标志物分析 | NA |
| 15414 | 2024-08-07 |
Glycosylation-related genes mediated prognostic signature contribute to prognostic prediction and treatment options in ovarian cancer: based on bulk and single‑cell RNA sequencing data
2024-Feb-14, BMC cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12885-024-11908-4
PMID:38355446
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研究论文 | 本研究通过单细胞和批量RNA测序数据，识别与卵巢癌相关的糖基化相关基因，构建预测预后和免疫治疗的基因签名 | 首次基于单细胞和批量RNA测序数据构建糖基化相关基因签名，用于卵巢癌的预后预测和治疗策略 | NA | 识别卵巢癌中的主要糖基化相关基因，并构建有效的基因签名以预测预后和免疫治疗 | 卵巢癌患者的糖基化相关基因及其在预后和免疫治疗中的作用 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | COX回归, LASSO回归 | RNA测序数据 | 1187个糖基化相关基因, 16个基因签名 |
| 15415 | 2024-08-07 |
Fine particulate matter 2.5 induces susceptibility to Pseudomonas aeruginosa infection via expansion of PD-L1high neutrophils in mice
2024-Feb-14, Respiratory research
IF:4.7Q1
DOI:10.1186/s12931-023-02640-x
PMID:38355515
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研究论文 | 本研究探讨了细颗粒物PM2.5暴露如何通过扩张表达PD-L1的高中性粒细胞导致小鼠对铜绿假单胞菌感染的易感性增加 | 首次揭示了PM2.5暴露通过扩张PD-L1高表达的中性粒细胞，影响其吞噬功能，从而增加对铜绿假单胞菌感染的易感性 | 研究主要在动物模型中进行，未来需在人体中验证相关发现 | 探讨PM2.5暴露对呼吸系统健康的影响及其分子机制 | 小鼠模型中的中性粒细胞和铜绿假单胞菌感染 | NA | 呼吸系统疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、流式细胞术、免疫荧光染色 | NA | 基因表达数据 | 多只小鼠 |
| 15416 | 2024-08-04 |
Integrated transcriptomics uncovers an enhanced association between the prion protein gene expression and vesicle dynamics signatures in glioblastomas
2024-Feb-13, BMC cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12885-024-11914-6
PMID:38347462
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研究论文 | 本研究揭示了朊蛋白基因表达与胶质母细胞瘤中的囊泡动力学特征之间增强的关联。 | 本研究首次展示了PrPC作为胶质母细胞瘤中囊泡生物学调节因子的潜在角色，并且引入了一种新的研究工具GBMdiscovery。 | 本研究主要依赖于公开的RNA测序数据，可能存在数据偏倚和适用性限制。 | 研究PRNP/PrPC在胶质母细胞瘤生物学中的作用及其分子机制。 | 以患者来源的胶质母细胞瘤为研究对象，分析其RNA测序数据。 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | RNA测序 | NA | 转录组数据 | 涉及来自四项独立研究的患者来源胶质母细胞瘤的公开RNA测序数据 |
| 15417 | 2024-08-04 |
Residual ANTXR1+ myofibroblasts after chemotherapy inhibit anti-tumor immunity via YAP1 signaling pathway
2024-Feb-12, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-45595-3
PMID:38346978
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研究论文 | 这篇文章探讨了化疗后残留的ANTXR1+肌成纤维细胞如何通过YAP1信号通路抑制抗肿瘤免疫。 | 首次揭示了高分级浆液性卵巢癌中化疗对CAF群体的影响及其与抗肿瘤免疫的关系，特别是YAP1信号通路的作用。 | 研究主要集中在高分级浆液性卵巢癌，可能不适用于其他类型的癌症。 | 研究化疗对癌症相关成纤维细胞群体的影响，并探讨其对抗肿瘤免疫的作用。 | 针对在高分级浆液性卵巢癌中发现的不同CAF群体进行研究，特别是CAF-S1群体。 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞分析、空间转录组学和免疫组化 | NA | 生物组织样本 | NA |
| 15418 | 2024-08-04 |
Hypoblast from human pluripotent stem cells regulates epiblast development
2024-Feb, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-023-06871-2
PMID:38052228
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研究论文 | 本文报告了利用人类多能干细胞生成真实的原始膜细胞的方法及其在胚胎发育中的作用 | 提出了利用人类多能干细胞生成的原始膜细胞在体外自组织模型中的创新应用 | 受伦理和法律限制，后植入阶段的研究受到限制 | 研究人类胚胎发育过程中的原始膜细胞及其机制 | 人类多能干细胞及其衍生的原始膜细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | 三维双层结构模型 | 细胞 | NA |
| 15419 | 2024-08-07 |
Sstr2 Defines the Cone Differentiation-Competent Late-Stage Retinal Progenitor Cells in the Developing Mouse Retina
2024-Jan-12, Stem cells translational medicine
IF:5.4Q1
DOI:10.1093/stcltm/szad073
PMID:37935630
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，分析了C57BL/6J小鼠发育中视网膜的转录组，发现生长抑素受体2（Sstr2）在具有光感受器分化潜能的晚期视网膜祖细胞（RPCs）中特异性表达，并验证了Sstr2+细胞在体内分化为视锥细胞、无长突细胞和水平细胞的能力。 | 首次揭示了Sstr2在晚期RPCs中的特异性表达，并证明了Sstr2+细胞具有分化为视锥细胞的能力，为视网膜退行性疾病的治疗提供了新的生物标志物。 | NA | 旨在识别和富集能够分化为视锥细胞的视网膜祖细胞，以用于视网膜退行性疾病的干细胞治疗。 | C57BL/6J小鼠的发育中视网膜及其祖细胞。 | NA | 视网膜退行性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 15420 | 2024-08-07 |
High migratory activity of dermal sheath cup cells associated with the clinical efficacy of autologous cell-based therapy for pattern hair loss
2024-Jan, Journal of dermatological science
IF:3.8Q1
DOI:10.1016/j.jdermsci.2023.11.003
PMID:38016881
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研究论文 | 本文研究了真皮鞘杯细胞（DSC）在自体细胞疗法中治疗男性及女性脱发的效果及其机制 | 首次揭示了ITGA6阳性DSC细胞的高迁移活性可能通过促进细胞迁移到附近的毛囊来增强细胞疗法的效果 | NA | 探究DSC细胞在细胞疗法中的有效性及其作用机制 | DSC细胞的基因表达及其在细胞疗法中的效果 | NA | 脱发 | bulk转录组分析、定量聚合酶链反应、单细胞转录组分析、活细胞成像结合免疫染色 | NA | 基因表达数据、细胞图像 | NA |