单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27648 篇文献，本页显示第 15381 - 15400 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 15381 | 2024-08-05 |
Integrating spatial and single-cell transcriptomics to characterize the molecular and cellular architecture of the ischemic mouse brain
2024-Feb-07, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.adg1323
PMID:38324639
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研究论文 | 本研究利用空间转录组学研究小鼠缺血半球的分子和细胞结构 | 本研究首次揭示了缺血大脑中非神经元细胞的分子和空间特征，以及细胞类型间的相互作用 | 对缺血大脑中其他细胞类型的研究较为有限 | 研究缺血后小鼠大脑的分子和细胞架构 | 小鼠缺血半球及其相关细胞类型 | 数字病理学 | 缺血性脑卒中 | 空间转录组学 | NA | 转录组 | 19777个点 |
| 15382 | 2024-08-05 |
The unfolded protein response pathway as a possible link in the pathogenesis of COVID-19 and sepsis
2024-Jan-08, Archives of virology
IF:2.5Q3
DOI:10.1007/s00705-023-05948-7
PMID:38191819
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研究论文 | 本研究揭示了在单细胞水平上COVID-19和脓毒症的发病机制中未折叠蛋白反应（UPR）通路的重要性 | 提供了COVID-19与脓毒症之间的共同发病机制的新分子视角 | 未在研究中提及具体的生物标志物或临床数据的长时间追踪 | 探讨COVID-19与脓毒症之间的潜在联系及其共同的发病机制 | COVID-19和脓毒症病例的单细胞RNA-seq数据及转录组数据 | 数字病理学 | 脓毒症 | 单细胞RNA-seq | 机器学习模型 | 转录组数据 | NA |
| 15383 | 2024-08-05 |
Single-Cell Suspension Preparation from Nile Tilapia Intestine for Single-Cell Sequencing
2023-02-10, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/64688
PMID:36847395
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研究论文 | 本研究展示了一种优化的鲤鱼肠道单细胞悬浮液制备协议 | 提出并优化了针对尼罗河罗非鱼肠道的单细胞悬浮液制备方法 | 该方法主要针对特定鱼类的肠道，其他组织或鱼种可能需要进一步优化 | 开发高质量单细胞悬浮液制备方案以支持单细胞层级研究 | 尼罗河罗非鱼的肠道细胞 | 数字病理学 | NA | 胶原酶/解聚酶 | NA | 细胞悬浮液 | NA |
| 15384 | 2024-08-07 |
Characterizing allele- and haplotype-specific copy numbers in single cells with CHISEL
2021-02, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-020-0661-6
PMID:32879467
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research paper | 本文介绍了一种名为CHISEL的方法，用于在单细胞和细胞亚群中推断等位基因和单体型特异性的拷贝数 | CHISEL方法通过聚合数百或数千个单个细胞的稀疏信号，能够推断出等位基因和单体型特异性的拷贝数，这在低序列覆盖率的情况下尤为重要 | NA | 研究目的是开发一种方法来推断单细胞中的等位基因和单体型特异性拷贝数，特别是在低序列覆盖率的情况下 | 研究对象是乳腺癌患者的单细胞序列数据 | digital pathology | breast cancer | single-cell sequencing | NA | genome | 约2,000个细胞，来自两名乳腺癌患者 |
| 15385 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptome analysis reveals intratumoral heterogeneity in lung adenocarcinoma
2024-Mar, Environmental toxicology
IF:4.4Q1
DOI:10.1002/tox.24048
PMID:38133212
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研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序技术分析了肺腺癌中的肿瘤内异质性，并开发了一个有效的预后指数。 | 本文首次在单细胞水平上分析了肺腺癌的肿瘤内异质性，并开发了一个跨多个队列的有效预后指数。 | NA | 探索肺腺癌的肿瘤内异质性，并开发个性化治疗策略。 | 肺腺癌的肿瘤内异质性及其对预后的影响。 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 共分析了1458个样本，包括TCGA-LUAD（503个），GSE68465（442个），GSE72094（398个）和GSE26939（115个）。 |
| 15386 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing reveals the impact of mechanical loading on knee tibial cartilage in osteoarthritis
2024-Feb-15, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2024.111496
PMID:38224628
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术探讨了机械负荷对膝骨关节炎患者膝关节胫骨软骨中软骨细胞亚群的影响 | 首次识别出一种新的软骨细胞亚群HTC-C，并分析了其在不同机械负荷条件下的功能和细胞间相互作用 | 研究仅限于KOA患者的膝关节胫骨软骨，且样本量未具体说明 | 探究机械负荷对膝骨关节炎发展中软骨细胞亚群的影响及其分子机制 | 膝骨关节炎患者的膝关节胫骨软骨 | 数字病理学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 具体样本量未提及 |
| 15387 | 2024-08-07 |
Elevated enteric putrescine suppresses differentiation of intestinal germinal center B cells
2024-Feb-15, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2024.111544
PMID:38266445
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研究论文 | 本研究探讨了外源性腐胺对肠道微环境中B细胞分化的影响 | 发现腐胺通过影响B细胞受体信号通路和脂肪酸氧化相关基因，抑制肠道B细胞分化，并揭示了腐胺在不同癌症中的免疫调节作用 | NA | 研究腐胺与B细胞成熟和代谢失调之间的因果关系及其机制 | 肠道微环境中的B细胞分化 | 免疫学 | NA | bulk RNA测序和单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA测序数据 | NA |
| 15388 | 2024-08-07 |
Understanding the cell fate and behavior of progenitors at the origin of the mouse cardiac mitral valve
2024-Feb-05, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2023.12.006
PMID:38198889
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序和回顾性多色克隆分析，探讨了小鼠心脏二尖瓣起源的前体细胞的命运和行为 | 首次详细描述了二尖瓣前体细胞的代谢过程和其在阀叶形成中的特定贡献 | NA | 揭示小鼠心脏二尖瓣前体细胞的身份、命运决策及其在阀叶中的行为和分布 | 小鼠胚胎和新生儿的二尖瓣前体细胞 | 数字病理学 | 先天性心脏畸形 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因数据 | 涉及小鼠胚胎和新生儿的二尖瓣前体细胞样本 |
| 15389 | 2024-08-07 |
Autoreactive T cells target peripheral nerves in Guillain-Barré syndrome
2024-Feb, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-023-06916-6
PMID:38233524
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研究论文 | 本文通过结合体外T细胞筛选、单细胞RNA测序和T细胞受体（TCR）测序，研究了Guillain-Barré综合征（GBS）中自身反应性T细胞的作用 | 首次鉴定出具有细胞毒性T辅助1（T1）样表型的自身反应性记忆CD4细胞和针对周围神经髓鞘抗原的稀有CD8 T细胞，并揭示了多克隆TCR谱系、短CDR3β长度、偏好HLA-DR限制和识别免疫优势表位 | NA | 揭示Guillain-Barré综合征中自身反应性T细胞的免疫机制 | Guillain-Barré综合征患者中的自身反应性T细胞 | NA | Guillain-Barré综合征 | 单细胞RNA测序、T细胞受体测序 | NA | RNA | 超过1,000个自身反应性单T细胞克隆 |
| 15390 | 2024-08-07 |
The Gut Microbiome Controls Liver Tumors via the Vagus Nerve
2024-Jan-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.01.23.576951
PMID:38328040
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研究论文 | 本文探讨了肠道微生物群通过迷走神经影响肝脏肿瘤的机制 | 首次揭示肠道微生物群通过迷走神经调节肝脏肿瘤的机制，并发现迷走神经通过乙酰胆碱影响CD8+ T细胞活性 | 研究主要集中在小鼠模型上，需要进一步在人体中验证 | 研究肠道微生物群与迷走神经在肝脏肿瘤发展中的相互作用 | 肝脏肿瘤、肠道微生物群、迷走神经、CD8+ T细胞 | NA | 肝脏肿瘤 | scRNA-seq | NA | 微生物群数据 | 涉及Rag1KO小鼠和无肿瘤小鼠 |
| 15391 | 2024-08-05 |
Identification of type 2 diabetes- and obesity-associated human β-cells using deep transfer learning
2024-Jan-23, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.01.18.576260
PMID:38328172
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研究论文 | 本研究利用深度迁移学习识别与2型糖尿病和肥胖相关的人类β细胞。 | 创新之处在于应用DEGAS工具，将疾病关联映射到单细胞RNA-seq数据上，以识别为2型糖尿病病理提供关键的β细胞亚群。 | 本研究没有涉及与其他潜在影响因素的交互作用。 | 本研究旨在优先识别与疾病相关的β细胞亚群，以更好理解2型糖尿病的发病机制。 | 研究对象为与2型糖尿病和肥胖相关的不同β细胞亚群。 | 数字病理学 | 2型糖尿病 | 单细胞RNA-seq | 深度迁移学习模型 | 基因表达数据 | 涉及来自健康和2型糖尿病供体的人类胰腺切片 |
| 15392 | 2024-08-05 |
Cancer stem cells: Recent insights and therapies
2023-03, Biochemical pharmacology
IF:5.3Q1
DOI:10.1016/j.bcp.2023.115441
PMID:36720355
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综述 | 本篇综述讨论了癌症干细胞的最新特征、标记和机制研究进展。 | 探讨了单细胞测序和空间转录组分析在癌症干细胞研究中的应用，提出新的治疗策略。 | NA | 深入了解癌症干细胞在癌症生物学中的基本角色。 | 癌症干细胞及其与肿瘤微环境中其他细胞的相互作用。 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序、空间转录组分析 | NA | NA | NA |
| 15393 | 2024-08-05 |
Molecular functional characterization of the setdb1 and its potential target gene sox5 illuminate the histone modification-mediated orchestration of gonadal development in Chinese tongue sole (Cynoglossus semilaevis)
2024-Apr-05, Gene
IF:2.6Q2
DOI:10.1016/j.gene.2024.148199
PMID:38253299
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研究论文 | 该研究揭示了setdb1在中国舌鳎性别分化和生殖细胞发育中的作用 | 首次在中国舌鳎中详细描述了setdb1及其潜在靶基因sox5在性别发育调控中的分子机制 | 缺乏对setdb1在其他发育阶段的功能研究 | 探讨setdb1如何通过调控sox5的转录影响性别分化和生殖细胞发育 | 中国舌鳎的setdb1基因及其靶基因sox5 | 数字病理学 | NA | qRT-PCR, 单细胞RNA测序 | NA | 基因序列, RNA数据 | NA |
| 15394 | 2024-08-05 |
Spatial transcriptomics and the anatomical pathologist: Molecular meets morphology
2024-Mar, Histopathology
IF:3.9Q1
DOI:10.1111/his.15093
PMID:37991396
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小型综述 | 本文概述了空间转录组学方法及其在解剖病理学实践中的应用 | 本研究强调了与福尔马林固定石蜡包埋组织（FFPE）兼容的空间转录组学技术的进展 | 目前这些技术仍主要在研究实验室中使用，对于在常规解剖病理学实践中的整合还需进一步发展 | 探讨空间转录组学在解剖病理学中的应用与潜力 | 空间转录组学技术及其与解剖病理学实践的关系 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
| 15395 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptomics reveals the role of antigen presentation in liver metastatic breast cancer
2024-Feb-16, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.108896
PMID:38318373
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研究论文 | 这篇文章深入分析了11例晚期乳腺癌患者的肝转移转录组特征 | 揭示了肝转移相关的抗原呈递功能障碍与肿瘤浸润T细胞的关系 | 样本量较小，仅为11例，可能影响结果的普遍性 | 研究肝转移乳腺癌中抗原呈递的作用 | 11例患有继发性肝癌的乳腺癌患者 | 数字病理 | 乳腺癌 | 单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据 | 11例 |
| 15396 | 2024-08-07 |
Compartmentalization and synergy of osteoblasts drive bone formation in the regenerating fin
2024-Feb-16, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.108841
PMID:38318374
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序、谱系追踪、靶向成骨细胞消融和电子显微镜技术，探讨了斑马鱼再生鳍中表皮、成骨细胞和非成骨细胞的谱系关系及其在再生过程中的作用 | 研究揭示了再生鳍中成骨细胞的来源及其在再生过程中的分工和协同作用，以及再生受损时的检测和补偿机制 | NA | 探讨斑马鱼再生鳍中细胞的谱系关系及其在再生过程中的作用 | 斑马鱼再生鳍中的表皮细胞、成骨细胞和非成骨细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序、谱系追踪、靶向消融、电子显微镜 | NA | RNA | NA |
| 15397 | 2024-08-07 |
Comparative transcriptomic analysis of bovine mesenchymal stromal cells reveals tissue-source and species-specific differences
2024-Feb-16, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.108886
PMID:38318381
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术比较了来自脂肪组织、骨髓和外周血的牛间充质干细胞的转录组特征，并探讨了其与马和人类间充质干细胞的异同 | 首次系统比较了不同来源的牛间充质干细胞的转录组特征，并揭示了其与人类间充质干细胞的相似性，为牛作为非传统动物模型用于间充质干细胞研究提供了依据 | NA | 探讨牛间充质干细胞的转录组特征及其与人类和马间充质干细胞的异同 | 牛间充质干细胞及其与人类和马间充质干细胞的转录组特征 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 来自脂肪组织、骨髓和外周血的牛间充质干细胞，以及来自相同组织的马间充质干细胞和人类及小鼠的骨髓间充质干细胞 |
| 15398 | 2024-08-07 |
Delivery of Interferon β-Encoding Plasmid via Lipid Nanoparticle Restores Interferon β Expression to Enhance Antitumor Immunity in Colon Cancer
2024-Feb-06, ACS nano
IF:15.8Q1
DOI:10.1021/acsnano.3c10972
PMID:38319978
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研究论文 | 本文研究通过脂质纳米颗粒递送干扰素β编码质粒，以恢复干扰素β表达并增强结直肠癌的抗肿瘤免疫 | 利用脂质纳米颗粒递送干扰素β编码质粒，增强肿瘤免疫原性和T细胞效应功能，抑制结直肠癌生长 | NA | 测试通过阳离子脂质纳米颗粒递送干扰素β编码质粒至肿瘤，恢复干扰素β表达以抑制肿瘤免疫逃逸的效果 | 结直肠癌细胞及肿瘤微环境中的免疫细胞 | 数字病理学 | 结直肠癌 | RNA-Seq, scRNA-Seq | NA | RNA | 涉及人类结直肠肿瘤组织和细胞，以及小鼠模型 |
| 15399 | 2024-08-05 |
Gut microbiota-derived LCA mediates the protective effect of PEDV infection in piglets
2024-Feb-05, Microbiome
IF:13.8Q1
DOI:10.1186/s40168-023-01734-4
PMID:38317217
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研究论文 | 本研究探讨了肠道微生物群与仔猪对PEDV感染的抵抗力之间的关系 | 发现LCA在炎症中发挥保护作用，并通过影响肠道T细胞群体来增强抗病毒效果 | 实验主要集中在猪的模型上，缺乏对其他动物或人类的广泛适用性研究 | 调查肠道微生物群在猪仔对PEDV感染抵抗力中的作用 | 猪仔的肠道微生物群及其对猪流行性腹泻病毒（PEDV）感染的反应 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学，16S扩增子测序，宏基因组学，非靶向代谢组学 | NA | NA | NA |
| 15400 | 2024-08-05 |
Timing and precision of rattlesnake spinal motoneurons are determined by the KV72/3 potassium channel
2024-01-22, Current biology : CB
IF:8.1Q1
DOI:10.1016/j.cub.2023.11.062
PMID:38157862
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研究论文 | 该文章探讨了响尾蛇运动神经元的生理特性及其对新型行为的影响 | 研究表明，响尾蛇体部和尾部的运动神经元具有根本不同的生理特性，这对于超快速肌肉的高时间精度控制是至关重要的 | 单细胞RNA测序未能揭示KV7通道表达的差异，可能限制了对其在生理学影响中的理解 | 探讨响尾蛇运动模式发生改变的生物机制 | 响尾蛇的运动神经元及其在体部和尾部的不同特性 | 数字病理学 | NA | 补丁钳记录电生理学 | NA | NA | NA |