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当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 1521 - 1540 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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| 1521 | 2025-10-05 |
Response to anti-angiogenic therapy is affected by AIMP protein family activity in glioblastoma and lower-grade gliomas
2025-Mar-14, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.03.13.643116
PMID:40161601
|
研究论文 | 本研究探讨AIMP蛋白家族在胶质瘤血管生成中的作用及其作为抗血管生成治疗反应预测生物标志物的价值 | 首次揭示AIMP蛋白家族与胶质瘤血管生成的关联，发现AIMP2可作为抗血管生成治疗反应的预测生物标志物 | 回顾性研究设计，需要前瞻性验证 | 研究AIMP蛋白家族在胶质瘤血管生成中的作用及其治疗预测价值 | 胶质母细胞瘤和低级别胶质瘤患者样本 | 生物信息学 | 胶质瘤 | 单细胞转录组测序，多组学分析，甲基化分析 | Cox比例风险模型，Kaplan-Meier分析 | 转录组数据，表观遗传数据，蛋白质组数据 | 多个队列的胶质瘤样本（TCGA、CGGA、Rembrandt、Gravendeel、BELOB和REGOMA试验） | NA | 单细胞RNA-seq，bulk RNA-seq | NA | NA |
| 1522 | 2025-10-05 |
Ocular immune privilege in action: the living eye imposes unique regulatory and anergic gene signatures on uveitogenic T cells
2025-Mar-06, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.03.01.640701
PMID:40297507
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学揭示了眼睛对葡萄膜炎原性T细胞的独特调控机制 | 首次在分子水平揭示了眼内T细胞分化为调节性T细胞和无能细胞的平行分化路径 | 研究基于体内免疫特权模型，临床转化需要进一步验证 | 探究眼内免疫特权对T细胞命运的调控机制 | 视网膜特异性T细胞 | 免疫学 | 自身免疫性葡萄膜炎 | 单细胞转录组测序 | 轨迹分析 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1523 | 2025-10-05 |
Decoding neuronal wiring by joint inference of cell identity and synaptic connectivity
2025-Mar-04, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.03.04.640006
PMID:40093165
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序数据和电子显微镜连接组数据，开发了ConnectionMiner计算工具来解析果蝇腿部运动神经回路发育机制 | 开发了ConnectionMiner工具，首次将scRNAseq数据与电子显微镜连接组数据整合，通过概率方法优化细胞类型注释并识别与突触连接强度相关的基因表达特征 | 研究仅聚焦于果蝇腿部运动神经系统，尚未验证其他神经系统的普适性 | 解析运动神经回路在发育过程中的建立机制 | 果蝇腿部运动神经元和前置运动神经元 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序, 电子显微镜 | 概率模型 | 基因表达数据, 连接组数据 | 多个时间点的腿部运动神经元单细胞数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1524 | 2025-10-05 |
Single Cell Spatial Transcriptomics of the Murine Embryonic Palate Links Pax9 to Patterning and Organization of Extracellular Matrix Components
2025-Feb-19, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-5969552/v1
PMID:40034445
|
研究论文 | 本研究首次在小鼠腭裂模型中应用单细胞空间转录组学技术，揭示了Pax9基因与细胞外基质成分模式化和组织的关联 | 首次在腭裂模型中实施单细胞空间RNA测序研究，采用新兴的Visium HD平台实现真正的单细胞分辨率空间转录组分析 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类样本中验证 | 探索腭裂的基因组基础，识别关键分子靶点以开发有效治疗方法 | 小鼠胚胎腭部组织，在多个发育时间点进行研究 | 空间转录组学 | 腭裂 | 单细胞空间RNA测序，原位mRNA空间分析，RNAscope多重检测 | NA | 空间基因表达数据 | 多个发育时间点的小鼠胚胎腭部组织样本 | 10x Genomics | 单细胞空间转录组学，空间转录组学 | Visium HD, Xenium | Visium HD平台使用2×2 μm空间基因表达数据的自定义分箱，Xenium原位mRNA空间分析 |
| 1525 | 2025-10-05 |
SpaIM: Single-cell Spatial Transcriptomics Imputation via Style Transfer
2025-Jan-27, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.01.24.634756
PMID:39975319
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研究论文 | 提出一种通过风格迁移学习利用单细胞RNA测序数据增强空间转录组数据的新方法 | 首创将风格迁移学习应用于空间转录组数据插补，通过分离数据无关内容和数据特定风格实现跨技术数据整合 | 未明确说明方法对特定组织类型或技术平台的适用性限制 | 解决空间转录组技术中基因信号稀疏和检测能力有限的问题 | 空间转录组数据和单细胞RNA测序数据 | 空间转录组学 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组技术 | 风格迁移学习模型 | 基因表达数据 | 53个不同的空间转录组数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | 涵盖测序基和成像基空间技术 |
| 1526 | 2025-10-05 |
Isotope Encoded Spatial Biology Identifies Amyloid Plaque-Age-Dependent Structural Maturation, Synaptic Loss, and Increased Toxicity
2025-Jan-22, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-5829037/v1
PMID:39975899
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研究论文 | 本研究通过同位素编码空间生物学技术追踪阿尔茨海默病中淀粉样斑块的形成与成熟过程 | 首次结合质谱成像与稳定同位素标记技术对淀粉样斑块进行时间标记，实现斑块老化的空间追踪 | 研究基于Aβ敲入小鼠模型，结果向人类疾病的转化需进一步验证 | 阐明阿尔茨海默病中Aβ斑块形成与成熟导致神经毒性的机制 | Aβ敲入小鼠模型中的淀粉样斑块 | 空间生物学 | 阿尔茨海默病 | 质谱成像、稳定同位素标记、空间转录组学、高光谱共聚焦显微镜 | NA | 质谱成像数据、空间转录组数据、显微镜图像 | 10至18月龄小鼠脑切片 | NA | 空间转录组学、质谱成像 | NA | NA |
| 1527 | 2025-10-05 |
Rethinking large scale phylogenomics with EukPhylo v1.0, a flexible toolkit to enable phylogeny-informed data curation and analyses of diverse eukaryotic lineages
2025-Jan-21, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.08.19.607962
PMID:39416055
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研究论文 | 介绍EukPhylo v1.0工具包，用于真核生物系统发育基因组学数据管理和分析 | 开发了模块化、用户友好的流程，通过系统发育信息指导的污染去除和改进的同源基因家族估计方法 | 未明确说明样本来源限制或特定技术局限性 | 解决真核生物系统发育基因组学分析中的数据污染和可重复性问题 | 真核生物、细菌和古菌的多样化谱系 | 生物信息学 | NA | 系统发育基因组学、单细胞测序、同源基因家族分析 | NA | 基因组序列数据、多序列比对、基因树 | 1,000种真核生物、细菌和古菌物种，分析500个保守基因家族 | NA | 单细胞测序、基因组学分析 | NA | NA |
| 1528 | 2025-10-05 |
TrimNN: Characterizing cellular community motifs for studying multicellular topological organization in complex tissues
2025-Jan-17, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-5584635/v1
PMID:39877090
|
研究论文 | 提出TrimNN方法用于识别空间转录组和蛋白质组数据中的细胞群落基序，研究复杂组织中多细胞拓扑结构 | 采用自下而上的图神经网络方法识别保守的细胞组织模式，将细胞生态位区分为可计数的拓扑块，具有可解释性和通用性 | NA | 研究不同细胞类型在组织空间模式中的拓扑协调规则 | 复杂组织中的细胞空间排列 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学，空间蛋白质组学 | 图神经网络 | 空间组学数据 | NA | NA | 空间转录组学，空间蛋白质组学 | NA | NA |
| 1529 | 2025-10-05 |
GraphVelo allows for accurate inference of multimodal omics velocities and molecular mechanisms for single cells
2025-Jan-15, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-5613372/v1
PMID:39877092
|
研究论文 | 提出基于图的机器学习方法GraphVelo，用于从单细胞高通量数据中准确推断多组学速度和分子机制 | 利用现有方法推断的RNA速度作为输入，在单细胞数据形成的低维流形切空间中推断速度向量，保留向量大小和方向信息 | 需要依赖现有RNA速度推断方法的结果作为输入 | 扩展RNA速度分析方法到多模态数据，揭示基因、病毒与宿主细胞以及不同基因调控层之间的定量非线性调控关系 | 单细胞多组学数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序，多组学分析 | 图神经网络 | 单细胞多模态组学数据 | 多个合成和实验scRNA-seq数据集 | NA | 单细胞RNA-seq，多组学 | NA | NA |
| 1530 | 2025-10-05 |
Prognostic model construction and immune microenvironment analysis of pyroptosis-related genes in hepatocellular carcinoma based on single-cell RNA sequencing
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1595539
PMID:40918134
|
研究论文 | 基于单细胞RNA测序构建肝细胞癌焦亡相关基因的预后模型并分析免疫微环境 | 首次在单细胞分辨率下系统研究焦亡相关基因在肝细胞癌中的预后意义，并构建了结合肿瘤分期和焦亡特征的临床预测工具 | 样本量相对有限，需要更多独立队列验证模型的普适性 | 构建肝细胞癌焦亡相关基因的预后模型并分析其与免疫微环境的关系 | 肝细胞癌患者肿瘤组织和配对癌旁组织 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序，RT-PCR，免疫组化分析 | LASSO-Cox回归模型 | 单细胞RNA测序数据，临床数据 | 10例HCC肿瘤及配对癌旁组织（60,496个细胞），TCGA-LIHC队列365例，ICGC队列231例 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1531 | 2025-10-05 |
STmiR: A Novel XGBoost-based framework for spatially resolved miRNA activity prediction in cancer transcriptomics
2025, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0322082
PMID:40924781
|
研究论文 | 开发了一种基于XGBoost的空间miRNA活性预测框架STmiR，用于分析癌症转录组中的miRNA空间动态 | 首次将XGBoost模型应用于空间转录组数据中的miRNA活性预测，整合bulk RNA-seq和空间转录组数据建模非线性miRNA-mRNA相互作用 | 依赖于现有空间转录组技术的限制，可能无法完全捕捉miRNA的复杂空间动态 | 开发空间分辨的miRNA活性预测方法以解析癌症中miRNA介导的调控机制 | 多种癌症类型（乳腺癌、肺癌、卵巢癌、前列腺癌等）的肿瘤微环境 | 空间转录组学 | 癌症 | 空间转录组学，bulk RNA-seq | XGBoost | 转录组数据，空间表达数据 | 九种癌症的10X Visium ST数据集，涵盖四种主要癌症类型 | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10X Visium | 10X Visium空间转录组平台 |
| 1532 | 2025-10-05 |
Updates on Parkinson's Disease
2025, Neuropsychiatric disease and treatment
IF:2.5Q2
DOI:10.2147/NDT.S540718
PMID:40926796
|
综述 | 本文综述了帕金森病的最新研究进展，包括发病机制、诊断方法和治疗策略 | 整合α-突触核蛋白种子扩增检测与多模态神经影像技术实现92%的前驱期诊断准确率；开发闭环深部脑刺激系统实现63%的优效症状控制；利用单细胞空间转录组学识别多巴胺能神经元脆弱特征 | 生物标志物在不同种族队列中存在30%的α-突触核蛋白阈值变异性；非运动症状管理仍是当前挑战 | 推动帕金森病从对症治疗向精准靶向干预的转变 | 帕金森病患者及疾病机制 | 神经科学 | 帕金森病 | 单细胞空间转录组学，数字表型分析，神经影像技术 | NA | 生物分子数据，影像数据，临床数据 | NA | NA | 单细胞空间转录组学 | NA | NA |
| 1533 | 2025-10-05 |
Identification of Potential Targets for EGFR-Regulated Nucleus Pulposus Degeneration Using Single-Cell RNA Sequencing and Machine Learning
2025, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S530776
PMID:40927356
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和机器学习方法识别了EGFR调控椎间盘髓核细胞退变的关键下游靶点 | 首次结合单细胞RNA测序和多种机器学习算法识别EGFR在髓核细胞退变中的下游调控靶点JAK1 | 样本量有限，仅包含6个严重椎间盘退变样本 | 识别EGFR在髓核细胞退变过程中的关键下游调控分子 | 椎间盘髓核细胞 | 机器学习 | 椎间盘退变 | 单细胞RNA测序，基因集富集分析，加权基因共表达网络分析 | Lasso，XGBoost，随机森林 | 单细胞RNA测序数据 | 6个严重椎间盘退变样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1534 | 2025-10-05 |
Integrated Single-Cell and Transcriptome Analysis with Experimental Validation Reveals PANoptosis-Related Gene Signatures in the Immune Microenvironment of Autoimmune Thyroiditis
2025, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S525270
PMID:40927355
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研究论文 | 通过整合单细胞和转录组分析结合实验验证，揭示自身免疫性甲状腺炎免疫微环境中PANoptosis相关基因特征 | 首次在自身免疫性甲状腺炎中研究PANoptosis的作用，识别了5个关键PANoptosis相关基因并验证其诊断价值 | 研究样本量有限，需要更大规模验证 | 阐明PANoptosis基因与自身免疫性甲状腺炎免疫微环境的关系 | 自身免疫性甲状腺炎患者和动物模型 | 生物信息学 | 自身免疫性甲状腺炎 | scRNA-seq, bulk RNA-seq, RT-qPCR, 免疫组织化学染色, ELISA | WGCNA, ssGSEA | 基因表达数据, 单细胞数据 | 公共数据库中的AIT数据及临床样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 1535 | 2025-10-05 |
PRMT1-Mediated PARP1 Methylation Drives Lung Metastasis and Chemoresistance via P65 Activation in Triple-Negative Breast Cancer
2025, Research (Washington, D.C.)
DOI:10.34133/research.0854
PMID:40927753
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研究论文 | 本研究揭示PRMT1通过甲基化PARP1激活P65，驱动三阴性乳腺癌肺转移和化疗耐药的新机制 | 首次发现PRMT1通过甲基化PARP1调控NF-κB信号通路，增强肿瘤细胞干性并诱导肿瘤微环境免疫抑制 | PRMT1在肺转移和化疗耐药中的具体作用机制仍需进一步验证 | 探究PRMT1在三阴性乳腺癌肺转移和化疗耐药中的作用机制 | 三阴性乳腺癌细胞 | 癌症生物学 | 三阴性乳腺癌 | 单细胞RNA测序, 生物信息学分析, 质谱分析, 免疫共沉淀, ELISA | NA | 基因表达数据, 蛋白质相互作用数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1536 | 2025-10-05 |
Multi-Omics and Clinical Validation Identify Key Glycolysis- and Immune-Related Genes in Sepsis
2025, International journal of general medicine
IF:2.1Q2
DOI:10.2147/IJGM.S539158
PMID:40927774
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研究论文 | 本研究通过多组学分析和临床验证识别了脓毒症中关键的糖酵解和免疫相关基因 | 整合多组学数据、孟德尔随机化和机器学习算法识别脓毒症中与免疫重塑相关的五个关键糖酵解基因 | 研究样本量有限，需要更大规模的临床验证 | 阐明脓毒症中糖酵解重编程与免疫功能障碍的分子机制 | 脓毒症患者外周血样本和转录组数据 | 生物信息学 | 脓毒症 | 转录组测序, ssGSEA, WGCNA, 孟德尔随机化, 机器学习, RT-qPCR, scRNA-seq, CIBERSORT | LASSO, SVM-RFE, Boruta | 基因表达数据, 临床数据 | 临床脓毒症队列的外周血样本 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 1537 | 2025-10-05 |
Epitranscriptomic regulation of cardiac fibrosis via YTHDF1-dependent PIEZO2 mRNA m6A modification
2024-12-31, Cardiovascular research
IF:10.2Q1
DOI:10.1093/cvr/cvae239
PMID:39498803
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研究论文 | 本研究揭示了YTHDF1通过m6A修饰调控PIEZO2表达的转录后机制在心脏纤维化中的作用 | 首次发现YTHDF1通过识别PIEZO2 mRNA的m6A修饰位点peak_26355调控其翻译，并影响心脏成纤维细胞自噬和纤维化的新表观转录组机制 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人类临床样本中验证 | 探究机械敏感性离子通道Piezo家族在心脏纤维化中的分子机制 | 小鼠心脏成纤维细胞和实验性心脏纤维化模型 | 分子生物学 | 心血管疾病 | RNA-seq，单细胞测序，组织学分析，生化分析 | NA | 基因表达数据，组织学图像，生化数据 | 实验小鼠模型 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 1538 | 2025-10-05 |
Molecular and spatial analysis of ganglion cells on retinal flatmounts: diversity, topography, and perivascularity
2024-Dec-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.12.15.628587
PMID:39763751
|
研究论文 | 本研究通过空间转录组学和免疫组化方法分析了视网膜神经节细胞的多样性、空间分布及其与血管的关联 | 首次结合MERFISH空间转录组学和免疫组化共染技术，系统揭示了视网膜神经节细胞在二维空间中的非均匀分布模式及其与血管微环境的关联 | 研究主要基于小鼠视网膜，人类样本验证有限，且机制研究有待深入 | 探索视网膜神经节细胞的空间分布规律及其与血管微环境的关系 | 小鼠和人类视网膜神经节细胞 | 空间转录组学 | 神经退行性疾病 | MERFISH空间转录组学，免疫组化共染 | 计算配准方法 | 空间转录组数据，图像数据 | 45种视网膜神经节细胞类型中的34种 | NA | 空间转录组学 | MERFISH | 成像基础的空间转录组学技术 |
| 1539 | 2025-10-05 |
Fibroblast-specific TGF-β signaling mediates cardiac dysfunction, fibrosis, and hypertrophy in obese diabetic mice
2024-12-14, Cardiovascular research
IF:10.2Q1
DOI:10.1093/cvr/cvae210
PMID:39373248
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研究论文 | 本研究探讨了成纤维细胞特异性TGF-β信号在肥胖糖尿病小鼠心脏功能障碍、纤维化和肥厚中的关键作用 | 首次在肥胖糖尿病模型中证明成纤维细胞特异性TGF-β/Smad3信号通路是心脏病理变化的核心机制 | 体外实验显示血栓反应蛋白-4对心脏成纤维细胞无显著激活作用，与预期结果存在矛盾 | 研究TGF-β诱导的成纤维细胞活化在糖尿病心肌病发病机制中的作用 | 肥胖db/db糖尿病小鼠模型，特别是成纤维细胞特异性TbR2缺失和Smad3破坏的小鼠 | 心血管疾病研究 | 糖尿病心肌病 | 转录组学研究，单细胞RNA测序，体外实验，Ingenuity通路分析 | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据，功能评估数据 | db/db小鼠模型及相关基因修饰小鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1540 | 2025-10-05 |
Restoring Mitochondrial Quantity and Quality to Reverse Warburg Effect and Drive Tumor Differentiation
2024-Dec-13, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-5494402/v1
PMID:39711563
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研究论文 | 本研究通过联合使用视黄酸和线粒体解偶联剂恢复肿瘤线粒体功能，诱导神经母细胞瘤分化并抑制增殖 | 首次提出通过协同增强线粒体生物合成和呼吸作用来恢复肿瘤线粒体数量和质量，从而逆转Warburg效应并驱动肿瘤分化 | 研究主要聚焦于神经母细胞瘤模型，在其他肿瘤类型中的适用性需要进一步验证 | 探索通过恢复线粒体功能诱导肿瘤分化的治疗策略 | 神经母细胞瘤细胞和原位异种移植模型 | 癌症生物学 | 神经母细胞瘤 | 单细胞RNA测序，U-C-葡萄糖/谷氨酰胺同位素示踪，线粒体功能分析 | NA | 基因表达数据，代谢数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |