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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1521 | 2026-03-19 |
Macrophage SLC9A1 Links Endocytic Trafficking to Innate Immune Activation in Myocardial Injury
2026-Mar-10, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.02.27.708643
PMID:41847017
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研究论文 | 本研究揭示了巨噬细胞中的钠氢交换体SLC9A1通过调节巨胞饮作用,连接膜离子转运与心肌损伤后先天免疫激活的新机制 | 首次发现SLC9A1作为连接膜离子转运与炎症信号传导的桥梁,并证实巨噬细胞巨胞饮作用是心肌梗死后先天免疫激活的关键调节器 | 研究主要基于小鼠模型,尚未在人体中得到验证;SLC9A1抑制剂EIPA的特异性可能影响其他细胞功能 | 探究心肌梗死后巨噬细胞感知缺血危险信号的上游机制,特别是巨胞饮作用和SLC9A1在先天免疫激活中的作用 | 心肌梗死小鼠模型中的巨噬细胞,特别是梗死相关巨噬细胞 | 心血管疾病研究 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序,药理学抑制,基因敲除技术 | NA | 基因表达数据,功能表型数据 | 使用单核细胞和单核细胞来源巨噬细胞特异性敲除小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1522 | 2026-03-19 |
Crohn's disease under single-cell map: from INFLARE metaplastic cells to rare immune cell subpopulations
2026-03-05, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2026.153347
PMID:41610714
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综述 | 本文综述了利用单细胞测序技术在克罗恩病中发现的多种新型免疫细胞亚群及其在疾病发病机制中的作用 | 系统总结了单细胞测序揭示的克罗恩病相关新型免疫细胞亚群,如INFLAREs、CAITs等,并探讨了它们作为未来治疗靶点的潜力 | 这是一篇综述文章,主要整合现有研究发现,未提供新的原始实验数据 | 总结克罗恩病中通过单细胞测序技术鉴定的关键免疫细胞亚群,并探讨其病理作用与治疗潜力 | 克罗恩病患者样本中的免疫细胞 | 单细胞组学 | 克罗恩病 | 单细胞测序 | NA | 单细胞基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1523 | 2026-03-19 |
Spatial transcriptomics reveals mechanism of autoimmunity driven by internalized autoantibodies
2026-Mar-05, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.64898/2026.02.14.26346329
PMID:41757163
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研究论文 | 本研究利用空间转录组学揭示了自身抗体内化作为多种自身免疫性疾病共享的致病机制 | 首次通过空间转录组学证明抗体分泌细胞将细胞质物质(如免疫球蛋白RNA)转移到邻近受影响的细胞中,并揭示了自身抗体诱导的转录程序与细胞损伤和特异性炎症反应相关 | NA | 探究自身抗体内化在自身免疫性疾病发病机制中的作用及其普遍性 | 抗Mi2皮肌炎、抗PM/Scl硬化性肌炎、抗U1RNP混合性结缔组织病、抗Ku重叠综合征和抗Scl70系统性硬化症患者的肌肉活检组织和其他组织样本 | 数字病理学 | 自身免疫性疾病 | 空间转录组学、bulk RNA测序、直接免疫荧光 | NA | 转录组数据、图像数据 | 多个独立队列的患者肌肉活检样本 | NA | 空间转录组学、bulk RNA-seq | NA | NA |
| 1524 | 2026-03-19 |
Epitope-spanning antigenic variation reprograms immunodominance and broadens immunity in sequential influenza vaccination
2026-Mar-02, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-70202-y
PMID:41771913
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研究论文 | 本研究探讨了通过靶向改变流感病毒血凝素头部多个位点的抗原变异,以重新编程免疫优势表位,从而增强流感疫苗的广谱性和持久性保护 | 提出了“表位层次重塑”概念,通过靶向抗原变异重定向免疫记忆至保守表位,拓宽了免疫反应并增强了交叉保护 | 研究基于雪貂模型,可能不完全反映人类免疫反应的复杂性,且未在多种病毒株或长期保护中进行验证 | 研究旨在克服免疫印记对流感疫苗广谱性和持久性保护的限制,通过抗原变异策略增强疫苗效果 | A(H3N2)流感病毒的血凝素(HA)头部位点(A、B和D)以及雪貂模型中的免疫反应 | 免疫学 | 流感 | 单细胞转录组学、ELISpot检测、表位映射和结构分析 | NA | 转录组数据、免疫学检测数据 | 雪貂模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1525 | 2026-03-19 |
Systematic analyses uncover endocrine-disrupting chemical-responsive genes linked to endometriosis
2026-03, Reproductive toxicology (Elmsford, N.Y.)
DOI:10.1016/j.reprotox.2025.109148
PMID:41443441
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研究论文 | 本研究通过整合孟德尔随机化、贝叶斯共定位和单细胞RNA测序,识别了与内分泌干扰物反应相关并可能影响子宫内膜异位症风险的基因 | 首次将孟德尔随机化、贝叶斯共定位与单细胞RNA测序整合,系统性地揭示了内分泌干扰物通过特定基因影响子宫内膜异位症风险的分子通路 | 研究主要基于遗传学和转录组学数据,需要进一步的实验验证来确认这些基因在EDC暴露下的功能机制 | 识别内分泌干扰物反应基因,并探究它们如何影响子宫内膜异位症的发病风险 | 与内分泌干扰物反应相关的基因及其在子宫内膜异位症中的潜在作用 | 生物信息学 | 子宫内膜异位症 | 单细胞RNA测序, 孟德尔随机化, 贝叶斯共定位分析, 全基因组关联研究 | NA | 基因表达数据, 遗传变异数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1526 | 2026-03-19 |
Cross-scale causal inference integrated with single-cell profiling and molecular simulations reveals a macrophage CSF1R-CD68-LYZ axis linking benzo[a]pyrene to erectile dysfunction
2026-03, Reproductive toxicology (Elmsford, N.Y.)
DOI:10.1016/j.reprotox.2026.109169
PMID:41548764
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研究论文 | 本研究通过整合孟德尔随机化、网络毒理学、分子模拟和单细胞RNA测序,揭示了苯并[a]芘暴露通过巨噬细胞CSF1R-CD68-LYZ轴导致勃起功能障碍的分子机制 | 首次采用跨尺度因果推断方法,结合单细胞分析和分子模拟,系统阐明了环境污染物苯并[a]芘诱发勃起功能障碍的巨噬细胞特异性分子通路 | 研究结果主要基于计算分析和单细胞数据,未来需要通过实验验证靶点并探索针对巨噬细胞驱动炎症的治疗策略 | 探究环境污染物苯并[a]芘暴露与勃起功能障碍之间的因果关系及分子机制 | 巨噬细胞及相关基因(CSF1R、CD68、LYZ)在苯并[a]芘诱导勃起功能障碍中的作用 | 计算生物学 | 勃起功能障碍 | 孟德尔随机化、网络毒理学、分子模拟、单细胞RNA测序、虚拟基因敲除 | NA | 基因组数据、单细胞转录组数据、分子相互作用数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1527 | 2026-03-19 |
Correction to 'Integrating Bulk RNA and Single-Cell RNA Sequencing Identifies and Validates Lactylation-Related Signatures for Intervertebral Disc Degeneration'
2026-Mar, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.71061
PMID:41845558
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1528 | 2026-03-19 |
Mapping kinase-dependent tumor immune adaptation with multiplexed single-cell CRISPR screens
2026-Feb-28, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.01.08.698516
PMID:41542636
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研究论文 | 本文介绍了一种集成的高通量单细胞CRISPR筛选框架,用于绘制胶质母细胞瘤中T细胞驱动免疫压力的肿瘤内在调控机制 | 结合了CRISPR干扰与激活技术、免疫匹配的肿瘤-T细胞共培养以及大规模单细胞转录组学,系统量化遗传扰动对肿瘤状态和适应性反应的影响 | 研究主要针对胶质母细胞瘤,可能不适用于其他癌症类型;且依赖于体外共培养模型,可能无法完全模拟体内肿瘤微环境 | 绘制肿瘤免疫适应的激酶依赖性调控网络,并识别潜在的免疫逃逸靶点 | 胶质母细胞瘤细胞与T细胞的相互作用 | 单细胞组学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞CRISPR筛选、单细胞转录组学、CRISPR干扰与激活 | 深度生成模型 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1529 | 2026-03-19 |
Inhibition of CDC25C attenuates IL-17A-driven keratinocyte hyperproliferation and psoriasis progression
2026-02-26, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2026.153342
PMID:41587503
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研究论文 | 本研究探讨了CDC25C在IL-17A驱动的角质形成细胞过度增殖和银屑病进展中的作用,并验证了其作为治疗靶点的潜力 | 首次将CDC25C鉴定为非经典IL-17信号通路中的关键效应因子,并证明其选择性抑制可减轻角质形成细胞过度增殖而不影响经典炎症因子表达 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验,尚未在人体临床试验中验证CDC25C抑制剂的疗效和安全性 | 探索银屑病治疗的新靶点,以克服现有抗IL-17生物制剂疗效不完全和疾病复发的问题 | 银屑病患者皮肤样本、角质形成细胞、IMQ诱导的银屑病样小鼠模型 | 数字病理学 | 银屑病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、组织病理学图像 | 银屑病患者单细胞RNA-seq数据集、体外培养的角质形成细胞、IMQ诱导的小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1530 | 2026-03-19 |
A non-canonical role of Myc in programming basal cells as sentinels of upper airway immunity during influenza infection
2026-Feb-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2025.12.22.696065
PMID:41509430
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研究论文 | 本研究探讨了流感感染期间,Myc在编程基底细胞作为上呼吸道免疫哨兵中的非经典作用 | 揭示了基底细胞作为上皮哨兵,通过MYC依赖的CXCL10-CXCR3轴协调急性修复并招募细胞毒性效应细胞的新机制 | 研究主要基于小鼠模型,人类上呼吸道感染后的区域特异性机制仍需进一步验证 | 阐明流感病毒感染后上呼吸道的损伤与修复机制,特别是基底细胞在免疫协调中的作用 | 小鼠上呼吸道(声门下和气管)的假复层上皮细胞,包括纤毛细胞、分泌细胞、神经内分泌细胞和基底细胞 | 数字病理学 | 流感感染 | 单细胞转录组学、成像技术 | NA | 转录组数据、图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1531 | 2026-03-19 |
MANTIS: Analytics toolkit for spatial metabolomics with matching spatial transcriptomics data
2026-Feb-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.01.20.700581
PMID:41648596
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研究论文 | 介绍MANTIS,一个用于分析空间代谢组学与空间转录组学数据的统计框架工具包 | 首个统一空间代谢组学、空间转录组学、细胞类型信息和空间域的工具包,强调空间统计、假设检验和混杂因素校正 | NA | 开发一个统计框架,用于分析共注册的空间代谢组学和空间转录组学数据,以发现代谢物空间模式和基因-代谢物关系 | 空间代谢组学和空间转录组学数据,涵盖不同空间技术、组织和物种 | 空间组学 | NA | 空间代谢组学,空间转录组学 | 统计框架 | 空间代谢组学和空间转录组学数据 | NA | NA | 空间代谢组学,空间转录组学 | NA | NA |
| 1532 | 2026-03-19 |
Tumor cell villages define the co-dependency of tumor and microenvironment in liver cancer
2026-02-21, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-69797-z
PMID:41723121
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研究论文 | 本研究通过空间单细胞成像和单细胞RNA测序技术,揭示了肝癌中肿瘤细胞“村庄”与微环境之间的分子共依赖性及其对患者预后的影响 | 开发了基于深度学习的策略来空间映射肿瘤细胞状态及其周围环境结构,首次提出肿瘤细胞“村庄”概念,并揭示了村庄特异性分子共依赖性 | 研究主要聚焦于肝癌,结论在其他癌症类型中的普适性有待验证 | 探究肿瘤空间景观的形成机制及其对肿瘤适应性的影响 | 肝癌肿瘤样本 | 数字病理学 | 肝癌 | 空间单细胞成像, 单细胞RNA测序 | 深度学习 | 图像, 转录组数据 | 50个肿瘤生物样本(超过200万个细胞),740名肝癌患者的验证数据 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1533 | 2026-02-21 |
Integrated single-cell and spatial transcriptomics uncover SPP1⁺ and HLA-DRB5⁺ macrophages as key modulators of the immune microenvironment in colorectal cancer liver metastasis
2026-Feb-19, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-026-07853-4
PMID:41715121
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1534 | 2026-03-19 |
High-resolution spatial multi-omics enables prognostic scoring in intrahepatic cholangiocarcinoma
2026-Feb-18, Molecular therapy : the journal of the American Society of Gene Therapy
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.ymthe.2026.02.029
PMID:41709577
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研究论文 | 本研究通过整合空间多组学技术,开发了一种用于肝内胆管癌预后评分的新型空间多模态评分系统 | 首次结合图像质谱流式细胞术、扩展凝胶空间蛋白质组学、单细胞RNA测序等技术,实现了肿瘤微环境的高分辨率空间多组学映射,并开发了基于毫米级分辨率的预后评分系统 | 研究样本量相对有限(训练队列155例,验证队列214例),且未在更广泛的多中心队列中进行外部验证 | 开发肝内胆管癌的预后工具,以进行精确风险分层和治疗优化 | 肝内胆管癌患者的肿瘤组织样本 | 数字病理学 | 肝内胆管癌 | 图像质谱流式细胞术、扩展凝胶空间蛋白质组学、单细胞RNA测序、批量蛋白质组学、多重免疫荧光 | 空间多模态评分系统 | 图像、蛋白质组数据、转录组数据 | 训练队列155例患者,独立验证队列214例患者 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间蛋白质组学, 批量蛋白质组学 | NA | NA |
| 1535 | 2026-03-19 |
Vitamin D deficiency alters prostate epithelial differentiation and increases prostate cancer aggressiveness in ex vivo and in vivo models
2026-Feb-18, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.02.16.700850
PMID:41756925
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研究论文 | 本研究通过体外和体内模型探讨了维生素D缺乏对前列腺上皮分化和前列腺癌侵袭性的影响 | 首次结合单细胞RNA测序技术,揭示了维生素D缺乏在前列腺发育和癌症进展中的关键作用,并验证了其作为激素的生物学功能 | 研究主要基于小鼠模型和特定人类癌细胞系,可能无法完全反映人类前列腺癌的复杂性 | 探究维生素D缺乏作为前列腺癌侵袭性风险因素的作用机制 | 小鼠前列腺类器官、MDA-PCa-2b人类前列腺癌细胞 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序,RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1536 | 2026-03-19 |
Deciphering epileptogenic and activity-dependent gene programs in the human brain
2026-Feb-18, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.02.18.706645
PMID:41757101
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研究论文 | 本研究通过单核和空间转录组学技术,解析了人类大脑中癫痫发生和活动依赖性基因程序,揭示了神经元脆弱性和炎症特征 | 首次在人类药物抵抗性癫痫患者中,结合单核与空间转录组学,系统分析了癫痫发生与急性刺激下的基因表达程序,并识别了细胞类型特异性反应和代谢适应缺陷 | 研究样本来源于特定癫痫患者群体,可能无法完全代表其他类型癫痫或神经系统疾病;且空间转录组学分辨率有限,可能影响细胞间相互作用的精确解析 | 探究人类大脑中神经元活动依赖性基因程序,特别是在癫痫发生和急性刺激下的转录变化,以理解癫痫的病理机制 | 药物抵抗性癫痫患者的癫痫发生、非癫痫发生及术中刺激的非癫痫发生皮质组织 | 数字病理学 | 癫痫 | 单核转录组学, 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 来自药物抵抗性癫痫患者的皮质组织样本,涉及26种细胞类型 | NA | 单核RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1537 | 2026-03-19 |
Single-cell RNA Sequencing-Based analysis of diverse ion-channel transcripts across human CD4+ T-cell subsets
2026-02-12, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2026.153265
PMID:41547301
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了人类CD4+ T细胞亚群中离子通道转录本的多样性 | 首次在单细胞分辨率下系统描绘了人类CD4+ T细胞亚群中离子通道和转运蛋白的转录组图谱,并识别了亚群特异性表达模式 | 研究基于体外极化模型,可能无法完全反映体内T细胞亚群的复杂性;样本来源仅限于外周血,未涵盖组织驻留T细胞 | 揭示人类CD4+ T细胞亚群中离子通道和转运蛋白的转录组表达模式,为免疫调节机制研究提供基础 | 人类外周血单核细胞来源的初始CD4+ T细胞及其体外极化产生的Th1、Th2、Th17和调节性T细胞亚群 | 单细胞转录组学 | 自身免疫性疾病和过敏性疾病 | 单细胞RNA测序 | 无监督聚类分析 | 单细胞转录组数据 | 未明确指定样本数量,但涉及人类外周血来源的CD4+ T细胞及其体外极化亚群 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1538 | 2026-03-19 |
Spatial immune hubs defined by conserved activated dendritic cells are remodeled by immunotherapy
2026-Feb-11, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.02.10.703136
PMID:41726948
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研究论文 | 本研究通过整合跨物种的单细胞转录组数据和空间成像技术,揭示了肿瘤微环境中树突状细胞的保守激活状态及其空间组织,并展示了免疫疗法如何重塑这些细胞的空间生态位 | 首次构建了跨物种(小鼠和人类)的肿瘤浸润树突状细胞整合图谱,结合单细胞转录组学和空间多组学成像技术,揭示了两种保守的DC激活状态(CCR7 DCs和ISG DCs)及其在肿瘤微环境中的空间组织模式,并发现免疫疗法能重塑这些DC-T细胞生态位而无需改变DC的转录状态 | 研究主要基于已发表数据集和新生成的小鼠模型数据,人类样本的空间转录组分析可能受样本量限制;免疫疗法重塑机制的具体分子通路尚未完全阐明 | 阐明肿瘤微环境中树突状细胞的表型多样性、空间动态及其在免疫治疗中的重塑机制 | 小鼠肿瘤模型和人类癌症数据集中的肿瘤浸润树突状细胞 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞转录组测序, 空间转录组学, 多重组织成像 | NA | 转录组数据, 空间成像数据 | 12项小鼠肿瘤研究 + 28个已发表人类癌症数据集 + 新生成的小鼠模型数据 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1539 | 2026-02-12 |
Integrating single-cell RNA-seq and bulk RNA-seq to identify hub pathways and diagnostic biomarkers in active pulmonary tuberculosis
2026-Feb-10, BMC infectious diseases
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12879-026-12805-w
PMID:41667975
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1540 | 2026-03-19 |
A novel integrative machine learning-based prognostic model reveals lactylation regulation in hepatocellular carcinoma progression
2026-Feb-10, Cancer cell international
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s12935-026-04203-8
PMID:41668073
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研究论文 | 本研究构建了一个基于乳酸化相关代谢基因的预后模型,用于预测肝细胞癌的进展和治疗效果 | 首次开发了一个整合机器学习框架的代谢相关乳酸化指数(MRLI),并验证其在多个独立队列中的预后准确性,揭示了乳酸化在肿瘤微环境重塑中的作用 | 研究主要基于公共数据集和体外实验,需要进一步在更大规模的临床队列中进行验证 | 构建肝细胞癌的预后预测模型,并探索乳酸化在肿瘤进展中的调控机制 | 肝细胞癌(HCC)患者 | 机器学习 | 肝细胞癌 | RNA-seq, 蛋白质组学, 单细胞分析, 空间转录组学 | 整合机器学习框架 | RNA-seq数据, 蛋白质组学数据, 单细胞数据, 空间转录组学数据 | 四个独立HCC队列,包括40个HCC样本的验证队列 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |