单细胞与空转测序相关文章

本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!

如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!

Sample Image
添加微信请说明来意
Sample Image
微信赞赏

除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。

当前筛选条件: [分区不过滤] [IF不过滤] [发表日期不过滤] [清除筛选条件]
当前共找到 37547 篇文献,本页显示第 1521 - 1540 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
1521 2026-03-02
Inflammation-Mediated Immune Imbalance in the Pathogenesis of Diabetic Cataracts
2026-Feb-05, Biomedicines IF:3.9Q1
研究论文 本文通过多组学分析探讨了糖尿病如何通过免疫炎症失衡导致白内障的发病机制 首次结合bulk RNA-seq与单细胞RNA-seq,系统揭示了糖尿病状态下外周免疫微环境改变、血-房水屏障破坏及晶状体上皮细胞凋亡在白内障形成中的关键作用 研究主要基于动物模型和患者外周血样本,缺乏直接的人眼晶状体单细胞数据验证 探究糖尿病相关白内障的免疫炎症发病机制 糖尿病患者的外周血单核细胞(PBMCs)和糖尿病大鼠的晶状体组织 数字病理学 糖尿病性白内障 bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq, qRT-PCR, ELISA, 免疫组织化学, 免疫荧光染色 NA RNA序列数据, 蛋白质表达数据, 图像数据 糖尿病患者外周血单核细胞及糖尿病大鼠晶状体组织(具体数量未明确说明) NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
1522 2026-03-02
Comprehensive Analysis of Immune-Related Mitochondrial Genes in Ischemic Stroke Through Integrated Bioinformatics and Validation
2026-Feb-05, Biomedicines IF:3.9Q1
研究论文 本研究通过整合生物信息学方法,识别了与缺血性卒中相关的免疫相关线粒体生物标志物,并评估了其诊断潜力 首次系统性地整合了免疫浸润、线粒体基因数据库(MITOCARTA 3.0)和多种机器学习算法来识别缺血性卒中的新型生物标志物,并进行了单细胞RNA测序验证 研究主要依赖于公共数据库的回顾性数据,外部验证仅使用了一个独立数据集,RT-qPCR验证的样本规模未明确说明 识别与缺血性卒中相关的免疫相关线粒体生物标志物,并探索其在早期诊断和治疗干预中的潜在价值 缺血性卒中患者的基因表达数据 生物信息学 缺血性卒中 RNA-seq,RT-qPCR,单细胞RNA测序 随机森林(RF),支持向量机(SVM),广义线性模型(GLM),极端梯度提升(XGB) 基因表达数据 来自GEO数据库的两个数据集(GSE58294和GSE16561),具体样本数量未明确说明 NA 单细胞RNA-seq,bulk RNA-seq NA NA
1523 2026-03-02
RPS6KA1 Remodels Fatty Acid Metabolism and Suppresses Malignant Progression in Colorectal Cancer
2026-Feb-05, Biomedicines IF:3.9Q1
研究论文 本研究通过多维度分析发现RPS6KA1通过重塑脂肪酸代谢抑制结直肠癌的恶性进展 整合了加权基因共表达网络分析、孟德尔随机化、单细胞转录组学和免疫浸润分析等多种生物信息学方法,并结合细胞和动物实验验证,首次系统揭示了RPS6KA1在结直肠癌脂肪酸代谢重编程中的关键作用及其作为预后生物标志物的潜力 研究主要基于TCGA数据库的结肠腺癌患者数据,样本来源和人群特征可能存在局限性;机制研究虽涉及免疫细胞功能,但具体信号通路细节仍需进一步深入 识别结直肠癌发生发展中关键的脂肪酸代谢相关分子,探索潜在的预后生物标志物和治疗靶点 结肠腺癌患者(基于TCGA数据)、结直肠癌细胞系及动物模型 生物信息学与癌症研究 结直肠癌 加权基因共表达网络分析、Cox回归、LASSO回归、孟德尔随机化、单细胞转录组学、免疫浸润分析、细胞实验、动物实验 统计模型(Cox、LASSO)、生物信息学分析模型 基因表达数据、临床预后数据、单细胞转录组数据 基于TCGA的结肠腺癌患者数据集(具体样本数未明确说明) NA 单细胞转录组学 NA NA
1524 2026-03-02
HIDF: Integrating Tree-Structured scRNA-seq Heterogeneity for Hierarchical Deconvolution of Spatial Transcriptomics
2026-Feb, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 本文提出了一种名为HIDF的层次迭代去卷积框架,用于整合树状结构的单细胞RNA测序异质性,以从空间转录组数据中恢复单细胞空间分布 HIDF通过层次迭代优化机制,结合簇树引导,从粗到细粒度逐步解析细胞异质性,并引入空间邻域和跨层次正则化约束以增强稳定性,超越了现有方法对固定细胞类型标签的依赖 NA 解决主流空间转录组技术因空间分辨率有限而掩盖单细胞信息的问题,通过去卷积方法推断细胞组成 空间转录组数据和单细胞RNA测序参考数据 空间转录组学 NA 单细胞RNA测序,空间转录组学 层次迭代优化框架 转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq,空间转录组学 NA NA
1525 2026-03-02
Distinct sympathetic projections to brown fat regulate thermogenesis and glucose tolerance
2026-Feb, Nature metabolism IF:18.9Q1
研究论文 本研究通过识别小鼠星状神经节中支配肩胛间棕色脂肪组织(iBAT)的不同交感神经元亚群,揭示了它们分别调控产热和血糖耐受的独立功能 首次在体内解析了支配同一脂肪组织的不同交感神经回路的功能特异性,并开发了靶向化学遗传学激活工具包 研究仅在小鼠模型中进行,尚未在人类或其他物种中验证 探究棕色脂肪组织产热与血糖代谢功能如何被不同交感神经回路协调调控 小鼠肩胛间棕色脂肪组织及其支配交感神经元 神经生物学与代谢研究 代谢性疾病 靶向化学遗传学激活、单细胞转录组测序、逆行示踪技术 动物模型(小鼠) 基因表达数据、生理功能数据 NA NA NA NA NA
1526 2026-03-02
Ranitidine protects Müller cells against ferroptosis in diabetic retinopathy by regulating the AKT1/GSK3β pathway
2026-Feb-01, Indian journal of ophthalmology IF:2.1Q2
研究论文 本研究探讨了雷尼替丁通过调控AKT1/GSK3β通路抑制高糖诱导的视网膜Müller细胞铁死亡,从而保护糖尿病视网膜病变的机制 首次结合单细胞测序技术和网络药理学,揭示了雷尼替丁在糖尿病视网膜病变中通过AKT1/GSK3β通路调控铁死亡的保护作用 研究主要基于小鼠细胞模型,尚未在人体或动物模型中进行验证,且机制研究深度有待进一步拓展 探究雷尼替丁对抗糖尿病视网膜病变的主要靶点和可能机制 糖尿病小鼠视网膜Müller细胞及高糖培养的小鼠视网膜Müller细胞系rMC-1 分子生物学与药理学 糖尿病视网膜病变 单细胞测序技术, 网络药理学, Western blotting, CCK-8检测, Edu细胞增殖检测 NA 测序数据, 蛋白质印迹数据, 细胞活性数据 未明确样本数量,使用小鼠视网膜Müller细胞及rMC-1细胞系 NA 单细胞RNA-seq SPIED3平台 NA
1527 2026-03-02
Antitumor Effects of PD-1 Blockade Combined with Mild Hyperthermia in a Murine Osteosarcoma Model
2026-Feb-01, Biomedicines IF:3.9Q1
研究论文 本研究在小鼠骨肉瘤模型中评估了PD-1阻断联合温和热疗的抗肿瘤效果 首次在小鼠骨肉瘤模型中系统评估PD-1阻断与温和热疗联合治疗的抗肿瘤效果,并通过单细胞RNA测序揭示了免疫微环境的转录组重塑 研究基于小鼠模型,结果需在人体临床试验中进一步验证;单细胞RNA测序分析为描述性特征,未深入机制探讨 探索PD-1阻断联合温和热疗在骨肉瘤治疗中的抗肿瘤效果及免疫微环境调控机制 小鼠LM8骨肉瘤细胞系及荷瘤小鼠模型 肿瘤免疫学 骨肉瘤 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 小鼠骨肉瘤模型(具体数量未明确说明) NA 单细胞RNA-seq NA NA
1528 2026-03-02
Integrated Single-Cell and Spatial Transcriptomics Coupled with Machine Learning Uncovers MORF4L1 as a Critical Epigenetic Mediator of Radiotherapy Resistance in Colorectal Cancer Liver Metastasis
2026-Jan-26, Biomedicines IF:3.9Q1
研究论文 本研究通过整合单细胞RNA测序和空间转录组学技术,结合机器学习,揭示了MORF4L1作为结直肠癌肝转移放疗抵抗的关键表观遗传介质 首次将单细胞RNA测序与空间转录组学整合,并应用机器学习框架,在结直肠癌肝转移中系统性地识别出MORF4L1这一关键的获得性放疗抵抗表观遗传调节因子 研究样本量较小(仅3名患者),且为观察性研究,需要更大规模的队列和功能验证实验来确认MORF4L1的因果作用 剖析结直肠癌肝转移肿瘤微环境的动态细胞景观,并识别介导放疗抵抗的关键表观遗传调节因子 来自三名不同结直肠癌肝转移患者的匹配放疗前和放疗后肿瘤组织 数字病理学 结直肠癌 单细胞RNA测序, 空间转录组学 机器学习 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 3名结直肠癌肝转移患者的匹配放疗前和放疗后肿瘤组织 NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
1529 2026-03-02
Host-derived interleukin-1α drives tumor immunosuppression by reprogramming tumor-associated myeloid cells
2026-Jan-17, NPJ breast cancer IF:6.5Q1
研究论文 本研究通过小鼠乳腺癌模型揭示了宿主来源的白细胞介素-1α(IL-1α)通过调控肿瘤相关髓系细胞分化,特别是通过PGE2信号轴驱动免疫抑制性肿瘤微环境的机制 首次在乳腺癌模型中系统阐明IL-1α通过调控CX3CR1⁺巨噬细胞分化和PGE2信号通路塑造免疫抑制性肿瘤微环境的具体机制 研究基于小鼠移植瘤模型,人体内验证尚不充分;机制研究主要聚焦PGE2通路,可能存在其他未探索的调控途径 探究IL-1α在肿瘤免疫抑制微环境形成中的作用机制 小鼠乳腺癌模型中的肿瘤相关髓系细胞(特别是巨噬细胞)和CD8⁺ T细胞 肿瘤免疫学 乳腺癌 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、细胞共培养、信号通路分析 正交移植小鼠乳腺癌模型 单细胞转录组数据、体外实验数据 未明确样本数量的小鼠模型 NA 单细胞RNA测序 NA NA
1530 2026-03-02
CD19 chimeric antigen receptor T-cell therapy for the treatment of a patient with refractory Burkitt lymphoma after kidney transplant
2026-Jan-09, Cytotherapy IF:3.7Q2
研究论文 本文报告了一例肾移植后难治性伯基特淋巴瘤患者在接受CD19 CAR T细胞治疗后使用环孢素A的病例,通过单细胞RNA测序分析,探讨了环孢素A对CAR T细胞活性和移植物排斥风险的影响 首次在肾移植后淋巴增殖性疾病患者中,结合CD19 CAR T细胞疗法与环孢素A使用,并通过单细胞RNA测序进行系列分析,为降低移植物排斥风险提供了初步证据 本研究为单病例报告,样本量小,缺乏对照组,结果需在更大规模研究中验证 评估CD19 CAR T细胞疗法联合环孢素A在移植后淋巴增殖性疾病患者中的可行性和安全性 一名肾移植后难治性伯基特淋巴瘤患者 数字病理学 淋巴瘤 单细胞RNA测序 NA RNA序列数据 1例患者 NA 单细胞RNA-seq NA NA
1531 2026-03-02
Innate Immune-Cloaked Microgel-Coated Mesenchymal Stromal Cells Reverse Persistent Pulmonary Fibrosis via Reparative Macrophages
2026-Jan, Advanced materials (Deerfield Beach, Fla.)
研究论文 本文提出了一种基于先天免疫检查点材料的策略,通过微凝胶包被和CD47激动剂功能化的间充质基质细胞,有效逃避组织驻留巨噬细胞的清除,从而逆转肺部持续性纤维化损伤 结合免疫伪装和凝胶涂层编码的局部信号,设计分泌性细胞用于长期组织重塑,实现慢性组织损伤的“活体药房” NA 治疗复杂慢性疾病如纤维化,通过逃避免疫清除并调节宿主免疫成分 间充质基质细胞、组织驻留巨噬细胞、肺部纤维化组织 单细胞组学 肺部纤维化 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
1532 2026-03-02
Vasculogenic Precedes Neurogenic Differentiation in Dental Pulp Stem Cells
2025-Nov-03, Journal of dental research IF:5.7Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和体内移植实验,揭示了人牙髓干细胞在分化过程中的异质性,并发现血管生成分化先于神经生成分化发生 首次在单细胞水平上展示了人牙髓干细胞的异质性,并明确了在移植后微环境中血管生成分化先于神经生成分化的时间顺序 研究主要基于免疫缺陷小鼠模型,可能无法完全模拟人体内的复杂微环境;样本量相对较小 探究人牙髓干细胞的分化机制,特别是血管生成、成牙本质细胞生成和神经生成分化的顺序与调控 人牙髓干细胞 单细胞组学 NA 单细胞RNA测序,流式细胞术,体内移植实验 NA 单细胞RNA测序数据 未明确具体样本数量,但涉及体外诱导分化及小鼠移植实验 NA 单细胞RNA-seq NA NA
1533 2026-03-02
Single-Cell Sequencing of Human Neural Organoids in a Model of Intracerebral Hemorrhage Reveals Temporally Dynamic Responses to Blood
2025-Nov, Stroke IF:7.8Q1
研究论文 本研究利用人类神经类器官模型,通过单细胞RNA测序分析了脑出血后血液暴露对不同脑细胞类型的时序动态影响 首次在可扩展的人类神经类器官模型中,通过单细胞测序揭示了血液暴露引起的细胞特异性转录组变化及其时间动态性,并识别了潜在的治疗靶点 研究基于体外类器官模型,可能无法完全模拟体内脑出血的复杂微环境;样本量相对有限(18个类器官) 探究脑出血后血液诱导的继发性神经损伤对不同脑细胞类型的影响,以优化手术清除时机 人类神经类器官,包含兴奋性神经元、抑制性神经元、神经祖细胞、星形胶质细胞、内皮细胞和小胶质细胞 单细胞测序 脑出血 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 18个类器官,共96,725个细胞 NA 单细胞RNA-seq NA NA
1534 2026-03-02
Disrupted developmental signaling induces novel transcriptional states
2025-Oct-28, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America IF:9.4Q1
研究论文 本研究提出了一种名为DAISEE的新算法,用于在复杂实验设计下分析单细胞数据中的信号扰动响应,并应用于斑马鱼胚胎的psMEK激活ERK信号通路研究 开发了DAISEE算法,能更有效地从单细胞数据中分离扰动响应与混杂变异,并首次在斑马鱼胚胎中应用psMEK技术揭示ERK信号过激活诱导新型转录状态 研究主要基于斑马鱼胚胎模型,结果可能不直接适用于其他生物系统;算法性能依赖于实验设计,可能受数据质量影响 开发新算法以分析单细胞数据中的信号扰动响应,并探索发育信号通路异常对胚胎细胞状态的影响 斑马鱼胚胎的单细胞转录组数据,特别是表达优化光开关MEK(psMEK)的5小时龄胚胎 机器学习 NA 单细胞RNA测序 非负矩阵分解框架 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
1535 2026-03-02
Single-Cell Analysis of Fibroblast Subpopulations in Skin and Oral Mucosa
2025-Oct-22, Journal of dental research IF:5.7Q1
综述 本文综述了皮肤和口腔黏膜中成纤维细胞亚群的最新研究,重点关注其转录组特征在稳态和疾病条件下的差异及其功能意义 通过单细胞RNA测序技术,首次在皮肤和口腔黏膜这两种屏障组织中系统比较了成纤维细胞的亚群多样性,并关联了功能机制研究 作为综述文章,未提供原始实验数据,且主要基于现有文献,可能受限于已发表研究的覆盖范围和深度 探讨成纤维细胞在组织再生和免疫调节中的组织特异性作用,以支持精准治疗的发展 皮肤和口腔黏膜中的成纤维细胞亚群 数字病理学 慢性炎症性疾病 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
1536 2026-03-02
Single-Cell Transcriptomics Reveals Depletion and Dysregulation of Mycobacterium tuberculosis-Specific Th1 and Th17 Cells Early After Acquisition of Human Immunodeficiency Virus
2025-Oct-15, The Journal of infectious diseases IF:5.0Q1
研究论文 本研究利用单细胞转录组学揭示了HIV感染早期对结核分枝杆菌特异性Th1和Th17细胞的耗竭与功能失调 首次在HIV感染前后对结核分枝杆菌特异性CD4 T细胞进行纵向单细胞RNA测序分析,揭示了早期耗竭模式及转录调控通路的改变 样本量有限,且为观察性研究,无法确定因果关系 探究HIV感染如何影响结核分枝杆菌特异性CD4 T细胞的频率与功能 HIV感染者和未感染者的结核分枝杆菌特异性CD4 T细胞 单细胞组学 结核病 流式细胞术, 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 HIV感染前后个体的结核分枝杆菌特异性CD4 T细胞亚群 NA 单细胞RNA-seq NA NA
1537 2026-03-02
Profibrotic monocyte-derived alveolar macrophages as a biomarker and therapeutic target in systemic sclerosis-associated interstitial lung disease
2025-Oct-08, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文探讨了系统性硬化症相关间质性肺病中促纤维化单核来源肺泡巨噬细胞作为生物标志物和治疗靶点的作用 首次在SSc-ILD患者中通过流式细胞术和单细胞RNA测序分析BAL液中的MoAM和间质巨噬细胞,并发现其丰度与肺纤维化严重程度相关 样本量较小(仅9名SSc-ILD患者和13名健康对照),且为前瞻性研究,需更大规模验证 评估MoAM在SSc-ILD中的生物标志物潜力和治疗靶点价值 SSc-ILD患者和健康对照的BAL液样本及肺移植组织 数字病理学 间质性肺病 流式细胞术, 单细胞RNA测序, 空间转录组学 NA 细胞计数数据, 转录组数据, 空间转录组数据 9名SSc-ILD患者和13名健康对照的BAL液样本,以及SSc-ILD肺移植组织 NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
1538 2026-03-02
Data-driven fine-grained region discovery in the mouse brain with transformers
2025-Oct-07, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本文介绍了一种基于Transformer的自监督工作流程CellTransformer,用于在小鼠脑部空间转录组数据中发现细粒度区域 提出了一种可扩展至数百万细胞数据集的自我监督空间域检测工作流程,使用编码器-解码器架构CellTransformer分层学习组织特征,并耦合GPU加速聚类算法 NA 解决器官尺度空间转录组数据分析中的关键瓶颈,实现细粒度组织域检测 小鼠脑部 空间转录组学 NA 空间转录组学 Transformer, 编码器-解码器架构 空间转录组数据 四只小鼠,超过200个组织切片,九百万个细胞 NA 空间转录组学 MERFISH, Slide-seqV2 多百万细胞MERFISH数据集,全脑Slide-seqV2数据集
1539 2026-03-02
Deconvoluting single-cell transcriptomics reveals cellular programs regulated by cell-cell communication in colorectal cancer
2025-Sep-27, bioRxiv : the preprint server for biology
荟萃分析 本研究通过整合八个单细胞队列数据,开发了一种新颖的分析框架,以揭示结直肠癌中细胞间通讯网络及其调控的细胞程序 采用分层主题建模识别反映单细胞信号状态的基因表达模块,并结合因果发现方法系统揭示可能受配体-受体信号和跨细胞类型通讯调控的模块,通过空间转录组学验证了这些模块在空间域中的共定位 NA 深入理解结直肠癌中细胞间通讯网络的复杂性及其在肿瘤微环境中的作用 结直肠癌患者样本中的单细胞转录组数据 单细胞转录组学 结直肠癌 单细胞RNA测序,空间转录组学 分层主题建模,因果发现方法 单细胞转录组数据,空间转录组数据 153名患者,279个样本 NA 单细胞RNA-seq,空间转录组学 NA NA
1540 2026-03-02
Interferon Epsilon Loss Is Elusive 9p21 Link to Immune-Cold Tumors, Resistant to Immune Checkpoint Therapy, and Endogenous CXCL9/10 Induction
2025-Sep, Journal of thoracic oncology : official publication of the International Association for the Study of Lung Cancer IF:21.0Q1
研究论文 本研究揭示了9号染色体短臂(9p)缺失通过干扰素ε(IFNϵ)信号通路导致免疫冷肿瘤及免疫检查点疗法(ICT)耐药性的机制 首次将9p缺失与IFNϵ信号联系起来,并证明IFNϵ是调控CXCL9/10表达和免疫细胞浸润的关键因子 IFNϵ在肿瘤免疫微环境中的作用具有显著的组织特异性,且部分肿瘤类型中相关性较弱 探究9p缺失导致免疫冷肿瘤和ICT耐药的分子机制 人类肿瘤样本、细胞系及小鼠模型,涵盖头颈鳞癌、非鳞非小细胞肺癌、黑色素瘤等多种癌症类型 肿瘤免疫学 多种癌症(头颈鳞癌、非鳞非小细胞肺癌、黑色素瘤等) 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、拷贝数变异分析、介导分析 小鼠基因工程模型(ΔS与ΔL缺失模型) 基因组数据、转录组数据、单细胞RNA测序数据 13项研究报告、36个ICT队列数据,涵盖多种肿瘤类型 NA 单细胞RNA测序 NA NA
回到顶部