单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 40024 篇文献，本页显示第 15341 - 15360 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 15341 | 2025-10-06 |
Protocol to identify proteins as regulators of gene expression noise
2025-Jun-20, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2025.103763
PMID:40220303
|
研究论文 | 介绍一种识别基因表达噪声调控蛋白的实验方案 | 开发了整合单细胞RNA测序和质谱分析的数据整合方法，用于系统识别新型噪声调控蛋白 | 方案依赖于已知的调控因子-靶点相互作用数据库，可能受限于数据库的完整性 | 建立识别基因表达噪声调控蛋白的系统方法 | 细胞系中的蛋白质调控因子 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序，液相色谱-串联质谱(LC-MS/MS)，翻译抑制 | NA | 单细胞RNA测序数据，质谱数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq，质谱分析 | NA | NA |
| 15342 | 2025-10-06 |
Protocol for characterizing craniopharyngioma subtypes and their microenvironments using single-cell RNA sequencing and immunohistochemistry
2025-Jun-20, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2025.103760
PMID:40238632
|
研究论文 | 本文提供了一个分析颅咽管瘤亚型及其肿瘤微环境的单细胞分辨率综合实验方案 | 开发了结合单细胞RNA测序和免疫组织化学的综合方案，用于在单细胞水平表征颅咽管瘤亚型及其微环境 | NA | 建立分析颅咽管瘤亚型和肿瘤微环境的实验方案 | 颅咽管瘤组织样本 | 数字病理学 | 颅咽管瘤 | 单细胞RNA测序, 免疫组织化学 | NA | 单细胞RNA测序数据, 图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 15343 | 2025-10-06 |
Protocol for preparing fresh frozen soybean tissues for spatial transcriptomics
2025-Jun-20, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2025.103790
PMID:40272979
|
研究论文 | 本文提出了一种用于空间转录组学的新鲜冷冻大豆组织制备方案 | 针对植物组织在空间转录组学应用中的组织制备难题，首次开发了专门适用于大豆新鲜冷冻组织的标准化操作流程 | NA | 解决植物组织在空间转录组学研究中的技术障碍，建立标准化的组织制备方法 | 大豆新鲜冷冻组织 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 15344 | 2025-10-06 |
Protocol for the imputation of stimulus-induced single-cell gene expression trajectories from time-series scRNA-seq data
2025-Jun-20, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2025.103811
PMID:40343799
|
研究论文 | 提出一种从时间序列单细胞RNA测序数据中估算单细胞基因表达轨迹的计算方法 | 开发了首个能够从破坏性单细胞RNA测序数据中估算单细胞基因表达动态轨迹的计算流程 | NA | 研究细胞对刺激的异质性响应动态过程 | 癌细胞对药物的响应、免疫细胞对病原体的响应 | 生物信息学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | 降维、转移概率矩阵计算、样条插值、反卷积 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 15345 | 2025-10-06 |
Protocol for isolating and characterizing human vitreous immune cell infiltrates by flow cytometry and single-cell transcriptomic studies
2025-Jun-20, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2025.103830
PMID:40382772
|
方法论文 | 本文提出了一种通过流式细胞术和单细胞转录组学分离和表征人类玻璃体免疫细胞浸润的定制方案 | 开发了包含手术改良的定制方案，以最大化人类玻璃体样本中免疫细胞的产量 | NA | 建立分离和表征玻璃体免疫细胞浸润的实验方案 | 人类玻璃体免疫细胞浸润 | 单细胞分析 | 眼科疾病 | 流式细胞术, 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序数据, 流式细胞数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 15346 | 2025-10-06 |
Protocol for high-quality RNA sequencing, cell surface protein analysis, and genotyping in single cells using TARGET-seq
2025-Jun-20, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2025.103832
PMID:40408252
|
研究论文 | 本文介绍了一种改进的单细胞多组学技术TARGET-seq+，可同时进行RNA测序、细胞表面蛋白分析和基因分型 | 开发了TARGET-seq+技术，提高了单细胞RNA测序的灵敏度，并首次在单细胞水平整合转录组、蛋白表达和基因分型分析 | NA | 优化单细胞多组学分析技术，以更好地研究癌前和癌变组织中的体细胞突变 | 单细胞 | 单细胞测序技术 | 癌症 | RNA测序，细胞表面蛋白分析，基因分型 | NA | RNA测序数据，蛋白表达数据，基因型数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序，单细胞多组学 | TARGET-seq+ | TARGET-seq+单细胞多组学分析平台 |
| 15347 | 2025-10-06 |
Protocol to decipher complex spatial transcriptomics data using STMiner
2025-Jun-20, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2025.103838
PMID:40411788
|
方法论文 | 介绍使用STMiner工具解析复杂空间转录组数据的标准化操作流程 | 提出无需参考数据即可适用于不同分辨率和平台的通用分析协议 | NA | 解决空间转录组数据分析中的采样不均、数据稀疏和组织边界模糊等挑战 | 空间转录组数据 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | NA | 空间基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 15348 | 2025-10-06 |
Regulation of cGAS-STING pathway with inhalable nanozyme in acute lung injury
2025-Jun-20, Biomaterials
IF:12.8Q1
|
研究论文 | 本研究开发了一种可吸入的纳米酶材料，通过调节cGAS-STING通路缓解急性肺损伤 | 首次发现CAL纳米片能与受损DNA结合并有效抑制cGAS-STING通路介导的炎症反应 | NA | 开发针对急性肺损伤/急性呼吸窘迫综合征的新型治疗方法 | 急性肺损伤和急性呼吸窘迫综合征的病理机制 | NA | 急性肺损伤 | 转录组分析，单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | single-cell sequencing | NA | NA |
| 15349 | 2025-10-06 |
Integrated Multiomics Analysis and Machine Learning Approaches in Bladder Cancer: Unveiling the Impact of Immunogenic Cell Death and Its Key Gene SLC2A3 on Prognosis and Personalized Treatment Strategies
2025-Jun-17, ACS omega
IF:3.7Q2
DOI:10.1021/acsomega.5c01496
PMID:40547707
|
研究论文 | 本研究通过多组学分析和机器学习方法，揭示了免疫原性细胞死亡在膀胱癌中的作用，并识别出关键基因SLC2A3作为预后标志和治疗靶点 | 首次构建基于免疫原性细胞死亡的风险特征，并通过101种组合机器学习算法识别出关键基因SLC2A3在癌症相关成纤维细胞中的高表达 | 研究主要基于TCGA和GEO数据库的回顾性数据，需要进一步实验验证 | 探索免疫原性细胞死亡在膀胱癌中的作用机制，开发预后标志物和个性化治疗策略 | 膀胱癌患者样本和正常对照样本 | 机器学习 | 膀胱癌 | 多组学分析，单细胞测序 | 组合机器学习算法，单机器学习算法 | 基因表达数据 | 来自TCGA和GEO数据库的膀胱癌和正常样本 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 15350 | 2025-10-06 |
Liver metastasis or peritoneal metastasis: single-cell RNA sequencing reveals the organotropism in colorectal cancer is driven by distinct partial-EMT processes
2025-Jun-17, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2025.217880
PMID:40553883
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示结直肠癌肝转移和腹膜转移中不同的部分上皮间质转化状态驱动器官趋向性 | 首次在单细胞水平比较结直肠癌肝转移和腹膜转移的肿瘤细胞部分上皮间质转化状态差异 | 未明确验证这些差异如何具体导致器官特异性转移 | 探索结直肠癌转移器官趋向性的分子机制 | 结直肠癌肝转移和腹膜转移患者的肿瘤样本 | 单细胞组学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 15351 | 2025-10-06 |
Application of single-cell sequencing in the study of immune cell infiltration in inflammatory bowel disease and colorectal cancer
2025-Jun-15, World journal of gastrointestinal oncology
IF:2.5Q3
DOI:10.4251/wjgo.v17.i6.107382
PMID:40547160
|
综述 | 本文综述了单细胞测序技术在炎症性肠病与结直肠癌免疫细胞浸润研究中的应用 | 利用单细胞测序技术揭示肠道微环境中免疫细胞的浸润模式及其在疾病进展中的作用 | NA | 探讨炎症性肠病与结直肠癌之间的相互关系及免疫细胞浸润特征 | 炎症性肠病和结直肠癌中的免疫细胞 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞测序 | NA | 单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 15352 | 2025-10-06 |
Highly sensitive and scalable time-resolved RNA sequencing in single cells with scNT-seq2
2025-Jun-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.06.03.657745
PMID:40502146
|
研究论文 | 开发了一种高灵敏度和可扩展的时间分辨单细胞RNA测序方法scNT-seq2 | 通过系统优化第二链cDNA合成步骤，显著提高了读段比对率、降低了背景突变并增强了文库复杂性 | NA | 解析单细胞分辨率下新合成RNA与预存在RNA池的基因表达动态 | 4sU标记的K562细胞 | 单细胞测序技术 | NA | 时间分辨单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | scNT-seq2 | 时间分辨单细胞RNA测序技术，优化了第二链cDNA合成步骤 |
| 15353 | 2025-10-06 |
SenSkin™: a human skin-specific cellular senescence gene set
2025-Jun, GeroScience
IF:5.3Q1
DOI:10.1007/s11357-025-01568-y
PMID:39998731
|
研究论文 | 开发并验证了一个人类皮肤特异性衰老基因集SenSkin™ | 创建了首个专门针对人类皮肤的衰老基因集，解决了现有通用衰老基因集在皮肤组织中敏感性和特异性不足的问题 | 研究主要基于文献回顾和现有数据集验证，缺乏实验验证 | 开发组织特异性衰老基因集以提高皮肤衰老细胞检测的准确性 | 人类皮肤组织及皮肤细胞类型 | 生物信息学 | 皮肤衰老 | RNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 多个RNA-seq数据集（包括bulk RNA-seq和单细胞RNA-seq数据集） | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 15354 | 2025-10-06 |
Recent Neuropathology Concepts
2025-Jun, Toxicologic pathology
IF:1.4Q4
DOI:10.1177/01926233251320056
PMID:40079493
|
综述 | 介绍2024年欧洲毒理病理学会大会上关于神经病理学新概念的专题会议内容 | 聚焦人工智能在毒理病理学中的应用、新型组织可视化分析技术以及特定病例报告 | 仅涵盖会议报告内容，未涉及原始研究数据 | 探讨新兴技术对药物筛选和开发的当前及潜在影响 | 毒理病理学家、神经病理学技术、临床前物种 | 数字病理学 | 神经系统疾病 | 人工智能、冷冻荧光断层扫描、血脑屏障类器官、空间转录组学 | NA | 组织图像、转录组数据、病例报告 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 15355 | 2025-10-06 |
Mini Review: Spatial Transcriptomics to Decode the Central Nervous System
2025-Jun, Toxicologic pathology
IF:1.4Q4
DOI:10.1177/01926233251325204
PMID:40119776
|
综述 | 本微型综述探讨空间转录组学在中枢神经系统研究中的应用与影响 | 系统评述空间转录组学如何通过提供空间分辨的基因表达数据革新对中枢神经系统的理解 | 面临数据解读和分辨率限制等挑战 | 探索空间转录组学对中枢神经系统研究的影响 | 中枢神经系统及神经退行性疾病（阿尔茨海默病、帕金森病、多发性硬化症、肌萎缩侧索硬化症） | 空间转录组学 | 神经退行性疾病 | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 15356 | 2025-10-06 |
Bi-level identification of governing equations for nonlinear physical systems
2025-Jun, Nature computational science
IF:12.0Q1
DOI:10.1038/s43588-025-00804-x
PMID:40346196
|
研究论文 | 提出一种双层级方程识别框架，用于从观测数据中发现和验证非线性物理系统的控制方程 | 利用强化学习的策略梯度算法实现双层级优化，同时进行方程发现和验证 | NA | 从观测数据中识别非线性物理系统的控制方程 | 非线性物理系统，包括湍流、三体系统以及单细胞测序数据中的RNA和蛋白质速度方程 | 机器学习 | NA | 强化学习，策略梯度算法 | 双层级优化框架 | 观测数据，单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 15357 | 2025-10-06 |
Sparse deconvolution of cell type medleys in spatial transcriptomics
2025-Jun, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1013169
PMID:40505018
|
研究论文 | 提出一种名为WISpR的机器学习算法，用于空间转录组学数据中细胞类型的稀疏反卷积 | 引入权重诱导稀疏回归算法，整合位点特异性超参数和稀疏驱动建模，在非匹配数据集中仍能保持生物学一致性 | 未明确说明算法计算复杂度或在大规模数据集上的可扩展性 | 开发能够准确预测空间转录组学中细胞类型分布的新方法 | 空间转录组学数据中的细胞类型分布 | 空间转录组学 | 癌症 | 空间转录组学，单细胞RNA测序 | 权重诱导稀疏回归(WISpR) | 空间转录组学数据，单细胞参考数据 | 十个数据集 | NA | 空间转录组学，单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 15358 | 2025-10-06 |
Single cell sequencing and spatial multiomics of diabetic kidney segmentation insights zonation-specific therapeutic metabolic pathways
2025-Jun, Cell insight
DOI:10.1016/j.cellin.2025.100252
PMID:40547113
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研究论文 | 通过整合空间多组学和单细胞转录组学技术，揭示了糖尿病肾病肾脏区域特异性代谢失调的分子机制 | 首次建立了糖尿病肾病的空间分辨代谢图谱，将分子分区与肾脏组织解剖定位联系起来，识别了GPX3作为成纤维细胞富集的生物标志物 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证相对有限 | 阐明糖尿病肾病中空间代谢异质性及其在疾病进展中的作用机制 | 糖尿病肾病小鼠模型和人类患者样本 | 空间多组学 | 糖尿病肾病 | 空间多组学, 单细胞转录组学, 空间代谢组学, 空间蛋白质组学 | NA | 空间多组学数据, 单细胞转录组数据 | 糖尿病小鼠模型和人类DN患者样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 空间代谢组学, 空间蛋白质组学 | NA | NA |
| 15359 | 2025-10-06 |
Calbindin 2 as a Novel Biomarker and Therapeutic Target for Abdominal Aortic Aneurysm: Integrative Analysis of Human Proteomes and Genetics
2025-May-06, Journal of the American Heart Association
IF:5.0Q1
DOI:10.1161/JAHA.124.039195
PMID:40314374
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研究论文 | 本研究通过整合人类蛋白质组学和遗传学分析，发现CALB2作为腹主动脉瘤的新型生物标志物和治疗靶点 | 首次将CALB2鉴定为腹主动脉瘤的因果风险因子，并通过多组学分析揭示其在脂肪组织间皮细胞中的特异性表达 | 研究主要基于遗传学证据和小鼠模型，需要在人类临床试验中进一步验证 | 识别腹主动脉瘤的新型生物标志物和治疗靶点 | 人类遗传数据、小鼠腹主动脉瘤模型 | 生物医学 | 腹主动脉瘤 | 蛋白质组范围孟德尔随机化、遗传相关性分析、共定位分析、多组学数据分析、bulk RNA测序、单细胞/单核RNA测序、空间转录组学 | NA | 遗传数据、蛋白质组数据、RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学,bulk RNA测序 | NA | NA |
| 15360 | 2025-10-06 |
Candidate Biomarkers for Hard-to-Heal Wounds Revealed by Single-Cell RNA Sequencing of Wound Fluid in Murine Wound Models
2025 May-Jun, Wound repair and regeneration : official publication of the Wound Healing Society [and] the European Tissue Repair Society
IF:3.8Q1
DOI:10.1111/wrr.70038
PMID:40444294
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研究论文 | 通过小鼠伤口模型中伤口液的单细胞RNA测序揭示难愈合伤口的候选生物标志物 | 首次使用伤口液细胞进行单细胞RNA测序分析，识别不同延迟愈合伤口模型中的共同生物标志物 | 样本收集困难，研究仅限于小鼠模型，尚未在临床环境中验证 | 探索不依赖单一病理学的因素，填补当前伤口管理空白 | 小鼠伤口模型中的伤口液细胞 | 单细胞组学 | 伤口愈合障碍 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 三种代表性延迟伤口模型（老年、糖尿病和脂多糖诱导炎症模型）与正常年轻小鼠的比较 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |