单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27536 篇文献，本页显示第 15321 - 15340 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 15321 | 2024-08-07 |
Nuclear MYH9-induced CTNNB1 transcription, targeted by staurosporin, promotes gastric cancer cell anoikis resistance and metastasis
2020, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.46001
PMID:32685004
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研究论文 | 本文通过多种技术手段研究了MYH9在胃癌细胞中的表达及其对细胞凋亡抵抗和转移的影响，并探讨了staurosporin对其的抑制作用。 | 首次揭示了核定位的MYH9通过促进CTNNB1转录来增强胃癌细胞的凋亡抵抗和转移能力，并发现staurosporin可以作为潜在的治疗药物。 | NA | 探讨MYH9在胃癌转移中的作用及其潜在的治疗策略。 | 胃癌细胞及胃癌患者的转移组织。 | 数字病理学 | 胃癌 | 2-DIGE, MALDI-TOF/TOF MS, 单细胞转录组, 免疫荧光, 免疫透射电子显微镜, 染色质分离, 共免疫沉淀, 染色质免疫沉淀, 双荧光素酶报告, 琼脂糖-寡核苷酸拉下, 流式细胞术, 细胞凋亡检测 | NA | 蛋白质, 转录组 | 包括正常胃黏膜、原发性胃癌及腹膜转移组织，以及胃癌细胞系和裸鼠模型。 |
| 15322 | 2024-08-07 |
Bulk RNA-sequencing, single-cell RNA-sequencing analysis, and experimental validation reveal iron metabolism-related genes CISD2 and CYP17A1 are potential diagnostic markers for recurrent pregnancy loss
2024-Apr-05, Gene
IF:2.6Q2
DOI:10.1016/j.gene.2024.148168
PMID:38244949
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研究论文 | 本研究通过批量RNA测序和单细胞RNA测序分析，结合实验验证，发现铁代谢相关基因CISD2和CYP17A1可能是复发性流产的潜在诊断标志物 | 首次揭示CISD2和CYP17A1基因在复发性流产中的作用，并验证了它们作为诊断和治疗标志物的潜力 | NA | 探索复发性流产的潜在诊断和治疗标志物 | 复发性流产患者的铁代谢相关基因 | 数字病理学 | 生殖系统疾病 | RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及520个铁代谢相关基因，具体样本数量未详细说明 |
| 15323 | 2024-08-05 |
Can uric acid affect the immune microenvironment in bladder cancer? A single-center multi-omics study
2024-Mar, Molecular carcinogenesis
IF:3.0Q2
DOI:10.1002/mc.23664
PMID:38018692
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研究论文 | 本研究探讨尿酸在膀胱癌免疫微环境中的作用 | 建立了与尿酸相关的11基因特征，并开发了用于预测膀胱癌患者生存率的命名图 | 仅在单中心进行研究，样本量有限 | 探索尿酸在膀胱癌代谢和免疫治疗中的影响 | 39名接受PD-1治疗的膀胱癌患者和169名接受根治性膀胱切除术的患者 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞测序，流式细胞术 | 小鼠模型 | 基因组数据，免疫细胞数据 | 39名膀胱癌患者和169名接受根治性膀胱切除术的患者 |
| 15324 | 2024-08-07 |
Revealing PPP1R12B and COL1A1 as piRNA pathway genes contributing to abdominal aortic aneurysm through integrated analysis and experimental validation
2024-Mar-01, Gene
IF:2.6Q2
DOI:10.1016/j.gene.2023.148068
PMID:38070790
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研究论文 | 本研究通过综合生物信息学方法发现并验证了piRNA通路基因PPP1R12B和COL1A1作为腹主动脉瘤的生物标志物，并探讨了其可能的分子机制 | 首次揭示了piRNA通路基因在腹主动脉瘤中的作用，并验证了PPP1R12B和COL1A1作为诊断标志物的潜力 | 需要进一步的临床试验来验证这些基因作为诊断标志物的有效性 | 探索piRNA通路基因在腹主动脉瘤中的作用及其作为生物标志物的潜力 | 腹主动脉瘤及其相关piRNA通路基因 | 生物信息学 | 心血管疾病 | qRT-PCR, 免疫组织化学, 蛋白质印迹, scRNA-seq | 多因素逻辑回归, 极端梯度提升, 人工神经网络 | 基因表达数据 | 涉及腹主动脉瘤和正常血管组织的样本，以及小鼠腹主动脉瘤模型 |
| 15325 | 2024-08-07 |
T-cell infiltration and its regulatory mechanisms in cancers: insights at single-cell resolution
2024-Feb-02, Journal of experimental & clinical cancer research : CR
IF:11.4Q1
DOI:10.1186/s13046-024-02960-w
PMID:38303018
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综述 | 本文综述了利用单细胞RNA测序技术研究肿瘤浸润T细胞及其调控机制的最新进展 | 采用单细胞RNA测序技术进行高分辨率分析，揭示了不同表型免疫细胞及其微环境因素的精确组成 | NA | 探讨影响T细胞浸润的因素，以理解肿瘤免疫并提高癌症免疫治疗的效果 | 肿瘤浸润T细胞及其调控机制 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | NA |
| 15326 | 2024-08-07 |
A single cell RNAseq benchmark experiment embedding "controlled" cancer heterogeneity
2024-Feb-02, Scientific data
IF:5.8Q1
DOI:10.1038/s41597-024-03002-y
PMID:38307867
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研究论文 | 本文介绍了一个基于10X Genomics平台的单细胞RNA测序实验，通过使用表达七种不同驱动基因的肺癌细胞系，创建了一个受控的癌症异质性环境 | 本研究提供了一个全面的框架，用于开发和验证通过单细胞RNA测序分析癌症异质性的方法 | NA | 旨在解决单细胞RNA测序数据分析中的挑战，特别是细胞注释和肿瘤亚群识别 | 肺癌细胞系，表达七种不同驱动基因（EGFR, ALK, MET, ERBB2, KRAS, BRAF, ROS1） | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 单细胞RNA测序数据 | 使用表达七种不同驱动基因的肺癌细胞系 |
| 15327 | 2024-08-05 |
Cellular heterogeneity in red and melanized focal muscle changes in farmed Atlantic salmon (Salmo salar) visualized by spatial transcriptomics
2024-Feb, Cell and tissue research
IF:3.2Q3
DOI:10.1007/s00441-023-03850-x
PMID:38087072
|
研究论文 | 本文使用空间转录组学技术研究了养殖大西洋鲑鱼的红色和黑色局部肌肉变化的细胞异质性 | 研究揭示了红色和黑色肌肉变色中的相似分子机制，并展示了不同样本类型中基因的独特表达模式 | 本研究未提及具体样本量和实验条件的限制 | 研究养殖大西洋鲑鱼肌肉的病理条件和细胞异质性 | 养殖大西洋鲑鱼的红色和黑色肌肉局部变化 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 15328 | 2024-08-07 |
Correction to: Cellular heterogeneity in red and melanized focal muscle changes in farmed Atlantic salmon (Salmo salar) visualized by spatial transcriptomics
2024-Feb, Cell and tissue research
IF:3.2Q3
DOI:10.1007/s00441-023-03856-5
PMID:38158442
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 15329 | 2024-08-07 |
Vitamin D3 reverses immune tolerance and enhances the cytotoxicity of effector T cells in coal pneumoconiosis
2024-Feb, Ecotoxicology and environmental safety
IF:6.2Q1
DOI:10.1016/j.ecoenv.2024.115972
PMID:38218105
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研究论文 | 本研究探讨了维生素D3在煤工尘肺病中调节淋巴细胞功能的作用机制 | 首次揭示了维生素D3通过调节CD4+ T细胞分化和减少调节性T细胞数量，增强CD8+效应T细胞的细胞毒性，从而减轻肺纤维化和症状 | NA | 阐明维生素D3在煤工尘肺病中调节免疫状态的机制 | 煤工尘肺病中的淋巴细胞 | NA | 职业病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠模型 |
| 15330 | 2024-08-05 |
The origin and structural evolution of de novo genes in Drosophila
2024-Jan-27, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-45028-1
PMID:38280868
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研究论文 | 本研究探讨了果蝇中全新基因的起源、进化和蛋白质结构的变化 | 结合高品质的全基因组比对和计算结构建模方法，识别出555个果蝇特有的全新基因候选者 | 对果蝇中特定族群的研究可能不适用于其他物种 | 研究果蝇中全新基因的起源和结构演变 | 果蝇D. melanogaster的全新基因候选者 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因组序列 | 555个全新基因候选者 |
| 15331 | 2024-08-07 |
Integrative genomic analyses reveal putative cell type-specific targets of the Drosophila ets transcription factor Pointed
2024-Jan-23, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-024-10017-7
PMID:38262913
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研究论文 | 本研究通过整合全基因组单细胞和批量数据，识别了果蝇Ets转录因子Pointed的细胞类型特异性潜在靶点 | 首次通过结合染色质免疫沉淀与高通量测序（ChIP-seq）和单细胞基因组学数据（scRNA-seq和snATAC-seq），揭示了157个潜在的细胞类型特异性Pointed靶点及其功能增强子 | NA | 识别果蝇Ets转录因子Pointed的细胞类型特异性潜在靶点，以深入理解由表皮生长因子受体（Egfr）信号调控的复杂发育过程 | 果蝇Ets转录因子Pointed及其在眼盘发育中的作用 | 基因组学 | NA | ChIP-seq, scRNA-seq, snATAC-seq | NA | 基因组数据 | 6,941个基因 |
| 15332 | 2024-08-05 |
Nephron progenitors rhythmically alternate between renewal and differentiation phases that synchronize with kidney branching morphogenesis
2024-Jan-13, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.11.21.568157
PMID:38045273
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research paper | 该文章研究了肾单位祖细胞在肾脏分支形态发生过程中的自我更新和分化之间的节律性交替 | 创新点在于揭示了肾单位祖细胞的分化与更新之间的节律性模式以及与分支生长的同步关系 | 局限性在于研究主要基于小鼠模型，可能与人类有差异 | 研究肾单位祖细胞在肾脏发育中的动态变化与分支形态发生的关系 | 肾单位祖细胞及其在肾脏发育过程中的角色 | 数字病理 | NA | 空间转录组技术 | NA | 转录组数据 | 使用小鼠和人类干细胞来源的肾单位祖细胞类器官进行实验 |
| 15333 | 2024-08-07 |
FGL2 promotes tumour growth and attenuates infiltration of activated immune cells in melanoma and ovarian cancer models
2024-01-08, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-51217-1
PMID:38191799
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研究论文 | 本文研究了FGL2蛋白在黑色素瘤和卵巢癌模型中的作用，发现FGL2抑制免疫细胞的浸润并促进肿瘤生长 | 首次证明了FGL2缺失能增强肿瘤微环境中自然杀伤细胞的活性，并延长生存期 | 研究仅限于两种小鼠癌症模型，未来需在更多癌症类型中验证FGL2的作用 | 探讨FGL2在肿瘤微环境中的作用及其作为癌症治疗靶点的潜力 | FGL2蛋白在黑色素瘤和卵巢癌中的作用 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | scRNA-seq | NA | RNA | 使用了Fgl2敲除小鼠进行实验 |
| 15334 | 2024-08-05 |
Single-cell sequencing of head and neck carcinoma: Transcriptional landscape and prognostic model based on malignant epithelial cell features
2024-01, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202301287RR
PMID:38085162
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序分析头颈部鳞状细胞癌的转录组特征及预后模型 | 首次揭示头颈部鳞状细胞癌中恶性上皮细胞特征与肿瘤微环境的相互作用，并开发了一种基于六个基因的预后模型 | 研究样本量较小，仅涉及七名患者及其相邻正常组织，可能影响结果的普适性 | 深入理解头颈部鳞状细胞癌肿瘤细胞及其微环境，以改善预后预测 | 七名头颈部鳞状细胞癌患者的肿瘤组织及一份相邻正常组织 | 数字病理学 | 头颈癌 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 七名头颈部鳞状细胞癌患者的肿瘤组织及一份相邻正常组织 |
| 15335 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing reveals the heterogeneity of epithelial cell and fibroblast cells from non- to metastatic lymph node OTSCC
2024-01, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202301724R
PMID:38169064
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了从非转移性到转移性淋巴结的口腔舌鳞状细胞癌（OTSCC）中的上皮细胞和成纤维细胞的异质性 | 发现了四种不同亚型的癌症相关成纤维细胞（CAFs），并确认了GAS和PTN通路在肿瘤转移进展中的作用 | NA | 旨在全面分析癌症相关成纤维细胞和上皮肿瘤细胞亚群在淋巴结转移性OTSCC中的作用 | 口腔舌鳞状细胞癌（OTSCC）中的上皮细胞和成纤维细胞 | 数字病理学 | 口腔癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 15336 | 2024-08-07 |
Thymic Carcinoma: Unraveling Neuroendocrine Differentiation and Epithelial Cell Identity Loss
2023-12-25, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers16010115
PMID:38201543
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研究论文 | 本文探讨了胸腺癌的神经内分泌分化及上皮细胞身份丧失的基因表达特征 | 发现胸腺癌表现出偏向于簇细胞和离子细胞的神经内分泌表型，并鉴定了HDAC9和NFATC1作为神经内分泌组在成人胸腺上皮细胞和胸腺癌中的特征性表达 | 需要进一步研究HDAC9和NFATC1在胸腺上皮中的作用及其作为胸腺上皮肿瘤治疗靶点的潜力 | 探索胸腺癌的神经内分泌分化及上皮细胞身份丧失的机制 | 胸腺癌的基因表达特征及其与簇细胞、离子细胞和神经内分泌细胞的关系 | 数字病理学 | 胸腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用了来自正常人胸腺的单细胞RNA测序数据集，并分析了公开的胸腺上皮细胞和肺癌的mRNA表达及甲基化状态数据 |
| 15337 | 2024-08-05 |
The origin and structural evolution of de novo genes in Drosophila
2023-Jun-27, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.03.13.532420
PMID:37425675
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研究论文 | 这篇文章研究了果蝇中新基因的起源和结构演化 | 该研究结合高质量全基因组比对、生物信息学分析和计算结构建模，提供了对特定谱系基因的系统性概述 | 对基因结构和功能起源的理解仍然有限，缺乏系统的研究 | 研究果蝇中新基因的起源、演化和蛋白质结构 | 研究特定谱系基因的蛋白质候选者 | 数字病理学 | NA | RNA-seq, Alphafold2, ESMFold, 分子动力学 | NA | 基因组数据 | 分析了555个基因候选者 |
| 15338 | 2024-08-07 |
Single-nuclei RNA-seq on human retinal tissue provides improved transcriptome profiling
2019-12-17, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-019-12917-9
PMID:31848347
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研究论文 | 本研究通过单核RNA测序（snRNA-seq）技术对人类视网膜组织进行了转录组分析 | 本研究展示了单核RNA测序在人类冷冻组织中获取单细胞转录组的能力，相较于人类批量RNA测序或动物模型，提供了更深入的见解 | NA | 通过单核RNA测序技术解析复杂组织中的异质性 | 人类视网膜组织及其细胞类型 | 数字病理学 | NA | 单核RNA测序（snRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 6个样本，来自3名健康捐赠者，共5873个单核 |
| 15339 | 2024-08-07 |
Identification of Cell Type-Specific Effects of DNMT3A Mutations on Relapse in Acute Myeloid Leukemia
2023-Oct-31, Molecules and cells
IF:3.7Q2
DOI:10.14348/molcells.2023.0093
PMID:37853686
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了急性髓系白血病（AML）不同阶段（诊断、完全缓解和复发）的骨髓单个核细胞，以探索DNMT3A突变在细胞类型特异性效应及其对AML复发的影响 | 本研究通过改进R882突变的靶向单细胞RNA测序检测，发现了从完全缓解到复发期间主要残留的突变细胞类型，并揭示了这些细胞与AML和白血病细胞相关的基因特征 | NA | 探索DNMT3A突变在急性髓系白血病中的细胞类型特异性效应及其对复发的影响 | 急性髓系白血病患者的骨髓单个核细胞 | 数字病理学 | 血液病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 来自同一患者在不同AML阶段的骨髓单个核细胞 |
| 15340 | 2024-08-05 |
Integration of Single-Cell RNA-Seq Datasets: A Review of Computational Methods
2023-Feb-28, Molecules and cells
IF:3.7Q2
DOI:10.14348/molcells.2023.0009
PMID:36859475
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综述 | 本文总结了单细胞RNA测序数据集整合方法的概念和优缺点 | 提供了对不同整合方法的全面综述，强调了去除批次效应的方法学进展 | 未能深入探讨所有可能的整合方法和实际应用中的挑战 | 审视和总结单细胞RNA测序数据集整合的计算方法 | 针对公共库中单细胞RNA测序数据集的整合分析方法 | 数字病理 | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | NA | NA |