单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27366 篇文献，本页显示第 15301 - 15320 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 15301 | 2024-08-05 |
Integrating TCGA and Single-Cell Sequencing Data for Hepatocellular Carcinoma: A Novel Glycosylation (GLY)/Tumor Microenvironment (TME) Classifier to Predict Prognosis and Immunotherapy Response
2024-Jan-13, Metabolites
IF:3.4Q2
DOI:10.3390/metabo14010051
PMID:38248854
|
研究论文 | 该研究开发了一种基于糖基化相关基因和肿瘤微环境评分的分类器，用于改善肝细胞癌的预后预测和免疫治疗反应 | 提出了一个新的糖基化/肿瘤微环境分类器，能够更好地预测临床结果 | 对驱动肿瘤微环境中免疫细胞变异的分子途径了解不足 | 旨在通过开发GLY/TME分类器来改善肝细胞癌的预后预测 | 研究肝细胞癌中的糖基化相关基因与肿瘤微环境的关系 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞测序 | 分类器 | 基因表达数据 | NA |
| 15302 | 2024-08-05 |
Single-cell data revealed CD14-type and FCGR3A-type macrophages and relevant prognostic factors for predicting immunotherapy and prognosis in stomach adenocarcinoma
2024, PeerJ
IF:2.3Q2
DOI:10.7717/peerj.16776
PMID:38274323
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研究论文 | 该研究通过单细胞测序技术识别了胃腺癌中的关键细胞类型和相关预后因子 | 研究首次构建了用于预测胃腺癌患者免疫疗法反应和预后的单细胞图谱及风险评分模型 | 研究结果基于单细胞数据和公共数据库，可能存在样本偏倚和外部验证不足 | 探讨胃腺癌中的细胞异质性及其与免疫疗法和预后的相关性 | 胃腺癌患者的单细胞数据及免疫微环境中的巨噬细胞 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | LASSO COX模型 | 基因表达数据 | 涉及的样本数量在700个以上的巨噬细胞亚群和其他细胞类型 |
| 15303 | 2024-08-05 |
Hexagonal image segmentation on spatially resolved transcriptomics
2023-12, Methods (San Diego, Calif.)
DOI:10.1016/j.ymeth.2023.11.002
PMID:37931852
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研究论文 | 该文章提出了一种新颖的六边形卷积神经网络用于空间转录组的图像分割 | 引入了六边形卷积网络和监督学习方法，以提高空间转录组数据中的噪声处理和特征识别 | 文章中未提及数据集的多样性或适用性相关的限制 | 研究空间转录组学中空间域的识别问题 | DLPFC数据集中的空间转录组数据 | 数字病理学 | NA | 卷积神经网络 | 六边形卷积神经网络(hexCNN) | 图像 | NA |
| 15304 | 2024-08-07 |
Late fetal hematopoietic failure results from ZBTB11 deficiency despite abundant HSC specification
2023-11-14, Blood advances
IF:7.4Q1
DOI:10.1182/bloodadvances.2022009580
PMID:37567157
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研究论文 | 本文研究了锌指和宽域、tramtrak、bric-a-brac结构域包含11（ZBTB11）转录因子在哺乳动物造血中的作用，发现Zbtb11基因缺失导致胚胎在胚胎日18.5时出现造血失败。 | 首次揭示了ZBTB11在维持造血干细胞和前体细胞成熟能力中的细胞内在需求，以及其在细胞周期调控和增殖中的作用。 | 研究主要集中在小鼠模型上，尚未探讨ZBTB11在人类造血系统中的具体作用。 | 探讨ZBTB11转录因子在哺乳动物造血系统中的作用及其对造血干细胞的影响。 | ZBTB11基因缺失的小鼠造血干细胞（HSCs）及其在胚胎发育中的表现。 | 血液学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | Zbtb11基因缺失的小鼠胚胎及对照组 |
| 15305 | 2024-08-07 |
A single-cell atlas of the aging murine ovary
2023-Sep-06, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.04.29.538828
PMID:37162983
|
research paper | 本研究通过单细胞RNA测序分析了年轻和老年小鼠卵巢组织的转录组变化，揭示了卵巢衰老过程中的细胞和分子机制 | 首次提供了衰老小鼠卵巢的单细胞图谱，识别了卵巢衰退的早期驱动因素 | 研究仅限于小鼠模型，结果的临床相关性需进一步验证 | 填补关于衰老卵巢转录组变化的综合细胞图谱的空白 | 年轻和老年小鼠的卵巢组织 | digital pathology | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 年轻（3个月大）和老年（9个月大）小鼠的卵巢组织 |
| 15306 | 2024-08-07 |
A single-cell CRISPRi platform for characterizing candidate genes relevant to metabolic disorders in human adipocytes
2023-09-01, American journal of physiology. Cell physiology
DOI:10.1152/ajpcell.00148.2023
PMID:37486064
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研究论文 | 本文利用CROP-Seq技术，结合CRISPR干扰和单细胞RNA测序，研究了人类脂肪细胞中的脂肪形成和脂肪细胞生物学 | 开发了一种强大的无假设工具，用于识别与代谢疾病相关的脂肪形成、前脂肪细胞和脂肪细胞功能的新调节因子 | 确定因果基因及其在代谢中的作用机制是一个耗时的过程 | 研究与代谢疾病相关的候选基因在人类脂肪细胞中的作用 | 人类前脂肪细胞SGBS细胞系和脂肪细胞 | 基因组学 | 代谢疾病 | CRISPR干扰、单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 超过400个差异表达基因在至少一个时间点被识别 |
| 15307 | 2024-08-07 |
deCS: A Tool for Systematic Cell Type Annotations of Single-cell RNA Sequencing Data among Human Tissues
2023-04, Genomics, proteomics & bioinformatics
DOI:10.1016/j.gpb.2022.04.001
PMID:35470070
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研究论文 | 本文介绍了一种名为deCS的自动细胞类型注释方法，该方法结合了人类细胞类型表达谱和标记基因，用于单细胞RNA测序数据的系统细胞类型注释 | deCS显著减少了计算时间并提高了注释准确性，能够集成到标准的单细胞RNA测序分析流程中，增强细胞类型注释 | NA | 构建一个全面的人类细胞类型参考图谱，并开发一种自动细胞类型注释方法 | 单细胞RNA测序数据中的细胞类型注释 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 51个人类复杂性状 |
| 15308 | 2024-08-07 |
ESR1 mutant breast cancers show elevated basal cytokeratins and immune activation
2022-04-19, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-29498-9
PMID:35440136
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 15309 | 2024-08-05 |
scSID: A lightweight algorithm for identifying rare cell types by capturing differential expression from single-cell sequencing data
2024-Dec, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2023.12.043
PMID:38274993
|
研究论文 | 提出了一种单细胞相似性划分算法(scSID)用于识别稀有细胞类型 | scSID通过分析细胞间和细胞内的相似性，捕捉稀有细胞类型的相似性差异 | 未提及具体的局限性 | 识别稀有细胞类型并改善现有识别方法 | 稀有细胞类型的识别 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 数据集 | 多个数据集，包括68K PBMC和肠道样本 |
| 15310 | 2024-08-05 |
scIALM: A method for sparse scRNA-seq expression matrix imputation using the Inexact Augmented Lagrange Multiplier with low error
2024-Dec, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2023.12.027
PMID:38274995
|
研究论文 | 提出了一种名为scIALM的方法，用于稀疏单细胞RNA表达矩阵的插补恢复 | 使用不准确的增广拉格朗日乘子法来恢复矩阵中的未知条目，表现出极低的错误率 | 未提供明显的样本量和数据特征的限制 | 旨在改善单细胞RNA测序数据中矩阵的格式，以增强下游分析的准确性 | 原始的稀疏单细胞RNA表达数据矩阵 | 数字路径学 | NA | NA | NA | 矩阵 | 四个数据集 |
| 15311 | 2024-08-07 |
Intracellular and extracellular synergistic therapy for restoring macrophage functions via anti-CD47 antibody-conjugated bifunctional nanoparticles in atherosclerosis
2024-Apr, Bioactive materials
IF:18.0Q1
DOI:10.1016/j.bioactmat.2023.12.024
PMID:38274294
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研究论文 | 本研究开发了一种双功能纳米粒子，通过抗CD47抗体偶联，实现对巨噬细胞功能的细胞内和细胞外协同治疗，用于治疗动脉粥样硬化 | 本研究创新性地使用了双功能纳米粒子，结合抗CD47抗体和NLRP3抑制剂CY-09，实现了对巨噬细胞内外信号的有效调控 | NA | 研究旨在通过调控巨噬细胞功能，有效减少动脉粥样硬化斑块的形成，从而降低心血管疾病的风险 | 研究对象为动脉粥样硬化中的巨噬细胞及其功能 | 心血管疾病 | 心血管疾病 | 纳米技术 | NA | RNA序列 | 研究使用了Apoe小鼠模型 |
| 15312 | 2024-08-07 |
A multidimensional atlas of human glioblastoma-like organoids reveals highly coordinated molecular networks and effective drugs
2024-Jan-26, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-024-00500-5
PMID:38273014
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研究论文 | 本研究利用先进的人类胶质母细胞瘤样类器官模型，通过单细胞转录组、DNA甲基化组、代谢组、脂质组、蛋白质组和磷酸化蛋白质组分析，全面表征了这些模型，并发现了遗传异质性对功能异质性的影响，以及NF1突变驱动的间质特征。 | 首次全面表征了人类胶质母细胞瘤样类器官模型，并发现了甘油脂质重编程是胶质母细胞瘤的标志，同时基于这些模型提供了基因型基础的药物参考图谱。 | NA | 旨在提供新的人类胶质母细胞瘤模型，并为有效的胶质母细胞瘤治疗提供研究路径。 | 人类胶质母细胞瘤样类器官模型及其分子网络和有效药物。 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞转录组、DNA甲基化组、代谢组、脂质组、蛋白质组和磷酸化蛋白质组分析 | NA | 多组学数据 | NA |
| 15313 | 2024-08-07 |
Single cell multi-omics of fibrotic kidney reveal epigenetic regulation of antioxidation and apoptosis within proximal tubule
2024-Jan-25, Cellular and molecular life sciences : CMLS
IF:6.2Q1
DOI:10.1007/s00018-024-05118-1
PMID:38270638
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研究论文 | 本研究利用单细胞多组学技术探讨了纤维化肾脏中近端小管的表观遗传调控机制 | 首次揭示了在纤维化过程中，近端小管中Sod1和Sod2 mRNA表达减少的表观遗传调控机制，并验证了Nfix转录因子促进Ifi27表达与细胞凋亡的关系 | 研究主要基于单细胞测序数据和体外实验，需要进一步的体内实验验证 | 探索纤维化肾脏中近端小管的转录动态和表观遗传调控机制 | 纤维化肾脏中的近端小管细胞 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和单核转座酶可及染色质测序（snATAC-seq） | NA | 基因表达数据 | 使用来自GEO数据库的数据和人类活检样本 |
| 15314 | 2024-08-07 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals the Cellular Landscape of Longissimus Dorsi in a Newborn Suhuai Pig
2024-Jan-18, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms25021204
PMID:38256277
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，构建了新生苏淮猪背最长肌的细胞图谱，并分析了细胞间的相互作用及其在肌肉发育中的作用 | 首次在单细胞水平上揭示了新生苏淮猪背最长肌的细胞组成和细胞间相互作用，并探讨了成纤维脂肪前体细胞的异质性及其在肌肉发育中的潜在作用 | NA | 研究新生苏淮猪背最长肌的细胞组成和细胞间相互作用，以及这些细胞在肌肉发育和肉质控制中的分子特征 | 新生苏淮猪背最长肌的细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 16,018个细胞 |
| 15315 | 2024-08-05 |
Harnessing the Stem Cell Niche in Regenerative Medicine: Innovative Avenue to Combat Neurodegenerative Diseases
2024-Jan-12, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms25020993
PMID:38256066
|
综述 | 该文章探讨了干细胞微环境在再生医学中治疗神经退行性疾病的应用 | 文章整合了关于干细胞微环境的新见解，揭示了调节微环境功能的潜在治疗新方法 | 文章未提及具体的临床试验或数据支持 | 旨在理解干细胞微环境对神经再生和修复的影响 | 研究对象为内源性神经干细胞及其微环境 | 再生医学 | 神经退行性疾病 | 单细胞转录组学、类器官技术、微流控技术、人工智能、计算建模、转分化 | NA | NA | NA |
| 15316 | 2024-08-05 |
Establishment and Validation of Novel Prognostic Subtypes in Hepatocellular Carcinoma Based on Bile Acid Metabolism Gene Signatures Using Bulk and Single-Cell RNA-Seq Data
2024-Jan-11, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms25020919
PMID:38255993
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研究论文 | 本研究基于胆汁酸代谢基因特征建立并验证了肝细胞癌的预后亚型 | 首次将胆汁酸代谢相关基因与肝细胞癌分类为四种亚型，并提出亚型C2a与更高生存几率相关 | 本研究为初步分析，尚需更多验证研究以阐明胆汁酸代谢与肝癌的具体机制 | 探索胆汁酸代谢在肝细胞癌发生发展中的作用及其对肿瘤微环境的影响 | 肝细胞癌样本及其与胆汁酸代谢相关的基因 | 数字病理学 | 肝癌 | RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 包含多种数据集的肝细胞癌样本 |
| 15317 | 2024-08-05 |
Single-Cell Transcriptome Analysis Reveals Development-Specific Networks at Distinct Synchronized Antral Follicle Sizes in Sheep Oocytes
2024-Jan-11, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms25020910
PMID:38255985
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研究论文 | 该文章通过单细胞转录组分析揭示了羊卵母细胞不同同步的窦卵泡大小下的发育特异网络 | 为羊卵母细胞在窦卵泡发育过程中的转录组特征提供了全面的描绘，填补了羊卵子发生分子图谱的空白 | 未提及研究的具体限制 | 理解羊卵母细胞的成熟和卵泡发育 | 不同大小的羊卵母细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学 (SmartSeq2) | NA | 转录组数据 | 通过不同大小的羊卵母细胞进行分析 |
| 15318 | 2024-08-07 |
Metabolomics, Transcriptome and Single-Cell RNA Sequencing Analysis of the Metabolic Heterogeneity between Oral Cancer Stem Cells and Differentiated Cancer Cells
2024-Jan-05, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers16020237
PMID:38254728
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研究论文 | 本研究通过代谢组学、转录组学和单细胞RNA测序分析，探讨口腔癌干细胞与分化癌细胞之间的代谢异质性 | 首次综合运用代谢组学、转录组学和单细胞RNA测序技术，深入分析口腔癌干细胞与分化癌细胞的代谢差异 | 研究仅限于细胞系和多细胞肿瘤球体模型，未涉及更多临床样本 | 理解癌干细胞的独特代谢特征，以应对与之相关的临床挑战 | 口腔癌干细胞与分化癌细胞的代谢特征 | 数字病理学 | 口腔癌 | 代谢组学、RNA测序、单细胞RNA测序 | NA | 代谢物、基因表达数据 | 使用CAL27和HSC3细胞系及六个口腔癌患者的单细胞RNA测序数据 |
| 15319 | 2024-08-07 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals Alterations in Patient Immune Cells with Pulmonary Long COVID-19 Complications
2024-Jan-02, Current issues in molecular biology
IF:2.8Q3
DOI:10.3390/cimb46010029
PMID:38248331
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，探讨了患有长期COVID-19并发症患者的免疫细胞变化 | 首次详细分析了长期COVID-19患者免疫细胞的动态变化，特别是幼稚中性粒细胞和CD8+ NKT样细胞的增加 | 研究样本量较小，仅包括一名患者，可能影响结果的普遍性 | 深入研究长期COVID-19患者的免疫景观 | 长期COVID-19患者的免疫细胞 | 数字病理学 | 肺部疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 一名71岁COVID-19患者及对照组 |
| 15320 | 2024-08-07 |
Single-Cell Transcriptome Analysis of Acute Myeloid Leukemia Cells Using Methanol Fixation and Cryopreservation
2023-Dec-20, Diseases (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/diseases12010001
PMID:38275564
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研究论文 | 本研究通过甲醇固定和低温保存的方法，对急性髓系白血病细胞进行单细胞转录组分析 | 提出甲醇固定法作为常规临床使用的替代方法，用于获取难以活检的细胞进行单细胞RNA测序 | 观察到甲醇固定超过一年后会出现遗传性退化 | 探讨甲醇固定法在急性髓系白血病细胞单细胞转录组分析中的应用及其效果 | 急性髓系白血病细胞 | 数字病理学 | 白血病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 两个急性髓系白血病样本 |