单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27536 篇文献，本页显示第 15281 - 15300 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 15281 | 2024-08-07 |
Inferring Gene Regulatory Networks and Predicting the Effect of Gene Perturbations via IQCELL
2024, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/7651_2022_465
PMID:36790623
|
研究论文 | IQCELL平台从单细胞RNA测序数据中推断布尔基因调控网络，并模拟正常和扰动条件下的网络行为 | 开发了IQCELL平台，能够从单细胞RNA测序数据中推断布尔基因调控网络，并模拟其在正常和扰动条件下的行为 | NA | 提供使用IQCELL平台从原始数据集推断基因调控网络的详细指南 | 单细胞RNA测序数据中的基因调控网络 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 布尔网络 | RNA测序数据 | NA |
| 15282 | 2024-08-07 |
Single-Cell mRNA-sncRNA Co-sequencing of Preimplantation Embryos
2024, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/7651_2023_487
PMID:37278916
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研究论文 | 本文介绍了一种方法，通过在同一胚胎细胞上同时进行单细胞RNA测序（Smart-Seq2）和单细胞小非编码RNA测序（Small-Seq），来阐明胚胎的细胞动力学 | 本文创新地结合了单细胞RNA测序和小非编码RNA测序技术，以更全面地研究胚胎细胞的多样性和异质性 | NA | 研究胚胎细胞的分子机制和细胞动力学 | 胚胎细胞 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序（Smart-Seq2）和小非编码RNA测序（Small-Seq） | NA | RNA | NA |
| 15283 | 2024-08-07 |
Evaluation of Stem-Cell Embryo Models by Integration with a Human Embryo Single-Cell Transcriptome Atlas
2024, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/7651_2023_492
PMID:37351839
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研究论文 | 本文通过整合人类胚胎单细胞转录组图谱，评估了干细胞胚胎模型的转录组景观 | 利用单细胞RNA测序技术，实现了对早期胚胎分子过程的深入理解，并提供了评估早期胚胎细胞组成的手段 | 不同实验室和不同技术获取的单细胞数据集之间的比较存在挑战 | 通过比较分析胚胎的转录组景观，以更好地理解和改进基于干细胞的胚胎模型 | 人类囊胚模型（blastoids）与人类胚胎数据集及二维体外早期发育模型系统的整合分析 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 具体样本数量未提及 |
| 15284 | 2024-08-07 |
Deep scRNA sequencing reveals a broadly applicable Regeneration Classifier and implicates antioxidant response in corticospinal axon regeneration
2023-Dec-20, Neuron
IF:14.7Q1
DOI:10.1016/j.neuron.2023.09.019
PMID:37848024
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研究论文 | 本研究通过深度单细胞RNA测序分析了再生皮质脊髓束神经元的异质性，并开发了一个广泛适用的再生分类器，揭示了抗氧化应答在皮质脊髓轴突再生中的作用 | 本研究首次通过深度单细胞RNA测序揭示了再生皮质脊髓束神经元的转录组特征，并开发了一个可预测不同神经元类型再生潜力的再生分类器 | 研究仅限于PTEN和SOCS3删除后的再生皮质脊髓束神经元，未来研究需要扩展到其他条件和神经元类型 | 探索促进脊髓损伤后皮质脊髓束再生的生物学机制 | 再生皮质脊髓束神经元及其再生潜力 | 数字病理学 | 脊髓损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 数百个表型确定的神经元 |
| 15285 | 2024-08-05 |
Integrative multi-omic profiling of adult mouse brain endothelial cells and potential implications in Alzheimer's disease
2023-11-28, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2023.113392
PMID:37925638
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研究论文 | 本文生成了成年小鼠脑内皮细胞的综合分子图谱，探讨其在阿尔茨海默病中的潜在影响 | 研究首次整合了多组学数据，以揭示脑内皮细胞的功能异质性及其分子基础 | 该研究主要基于小鼠模型，可能限制了结果在人的适用性 | 研究血脑屏障的分子基础及其在神经疾病中的作用 | 成年小鼠脑内皮细胞及其在阿尔茨海默病中的变化 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | RNA测序和蛋白质组学 | 单细胞RNA测序 | 分子数据 | 涉及成年小鼠和人脑组织 |
| 15286 | 2024-08-05 |
Spatial Mapping of Genes Implicated in SARS-CoV-2 Neuroinvasion to Dorsolateral Prefrontal Cortex Gray Matter
2023-Jan, COVID
DOI:10.3390/covid3010005
PMID:36714172
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研究论文 | 本研究利用空间转录组学方法分析与SARS-CoV-2神经侵犯相关的基因异质性 | 首次对与SARS-CoV-2脑内渗透相关的基因在背外侧前额皮质的空间分布进行表征 | 目前对SARS-CoV-2神经侵犯的基因水平生物学理解仍然很有限 | 探究 SARS-CoV-2 对人类背外侧前额皮质的影响及相关基因的空间分布 | 人类背外侧前额皮质组织样本 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | 组织样本 | 4 |
| 15287 | 2024-08-07 |
Integration of Multiple, Diverse Methods to Identify Biologically Significant Marker Genes
2022-10-15, Journal of molecular biology
IF:4.7Q1
DOI:10.1016/j.jmb.2022.167754
PMID:35868363
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研究论文 | 本文探讨了通过整合多种不同方法来识别生物学上重要的标记基因 | 本文提出了一种集成多种差异表达分析方法的技术，以更稳健地识别标记细胞的基因 | 目前尚未有单一的最佳方法出现，且验证这些分析结果的成本较高 | 利用单细胞RNA测序更好地理解生物学特性 | 识别可靠标记不同细胞类型的基因 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 未具体说明样本数量 |
| 15288 | 2024-08-07 |
Erythroblastic islands foster granulopoiesis in parallel to terminal erythropoiesis
2022-10-06, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2022015724
PMID:35862735
|
研究论文 | 本文通过多光谱成像流式细胞术、体外岛重建和单细胞RNA测序等方法，研究了成年小鼠骨髓中的红细胞岛（EBI）成分细胞，发现EBI中的CD11b+细胞是与骨髓EBI巨噬细胞特异性相关的嗜中性粒细胞前体，表明红细胞（髓细胞）岛是终末粒细胞生成和红细胞生成的场所。 | 首次揭示了红细胞岛在终末粒细胞生成和红细胞生成中的双重作用，并展示了巨噬细胞在优化红细胞或嗜中性粒细胞生产中的适应性。 | NA | 研究红细胞岛在终末粒细胞生成和红细胞生成中的作用及其在不同生理病理状态下的调节机制。 | 成年小鼠骨髓中的红细胞岛成分细胞及其在粒细胞生成和红细胞生成中的作用。 | NA | NA | 多光谱成像流式细胞术、体外岛重建、单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 成年小鼠骨髓中的红细胞岛成分细胞 |
| 15289 | 2024-08-07 |
Don't you forget about me(gakaryocytes)
2022-06-02, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2020009302
PMID:34582554
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综述 | 本文综述了巨核细胞（MKs）在骨髓中的复杂分化过程及其在血小板生成和骨髓稳态中的多重功能 | 文章提出了巨核细胞不仅作为血小板前体，还可能通过细胞膜出芽和在远端器官如肺或肝脏中产生血小板，并参与骨髓稳态的维持 | NA | 探讨巨核细胞在体外和体内形成血小板前体的机制，并批判性地讨论巨核细胞作为免疫调节细胞的假设 | 巨核细胞及其在血小板生成和骨髓稳态中的作用 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 来自成人和胎儿骨髓及肺的巨核细胞 |
| 15290 | 2024-08-07 |
Suppressive neutrophils require PIM1 for metabolic fitness and survival during chronic viral infection
2021-05-25, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2021.109160
PMID:34038722
|
研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序分析了在急性和慢性淋巴细胞性脉络丛脑膜炎病毒（LCMV）感染中髓样细胞的作用，发现抑制性中性粒细胞在慢性感染中富集，并高度表达PIM1基因，该基因编码的激酶促进线粒体适应性和细胞存活。 | 首次揭示了抑制性中性粒细胞在慢性病毒感染中的作用及其依赖PIM1的代谢适应性和生存机制。 | NA | 探讨髓样细胞在慢性病毒感染中的作用及机制。 | 抑制性中性粒细胞和髓样来源的抑制细胞（M-MDSCs）。 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 15291 | 2024-08-07 |
A multi-center cross-platform single-cell RNA sequencing reference dataset
2021-02-02, Scientific data
IF:5.8Q1
DOI:10.1038/s41597-021-00809-x
PMID:33531477
|
研究论文 | 本文介绍了一个多中心跨平台的单细胞RNA测序（scRNA-seq）基准数据集 | 该数据集包括20个scRNA-seq数据集，来自两个生物学上不同的细胞系，且包含多平台的全基因组测序数据，适用于评估各种scRNA-seq分析的生物信息学方法 | NA | 提供一个适用于不同scRNA-seq平台和生物信息学方法基准测试的参考数据集 | 两个生物学上不同的细胞系 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA测序数据 | 20个scRNA-seq数据集 |
| 15292 | 2024-08-07 |
Tumor-intrinsic and -extrinsic determinants of response to blinatumomab in adults with B-ALL
2021-01-28, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2020006287
PMID:32881995
|
研究论文 | 研究了44名复发或难治性B-ALL成年患者在接受blinatumomab治疗后的肿瘤内在和外在反应决定因素 | 发现了CD19 ex2part剪接变体作为预测blinatumomab治疗失败的新的生物标志物 | NA | 确定blinatumomab治疗B-ALL的肿瘤内在和外在反应决定因素 | 复发或难治性B-ALL成年患者 | NA | B-ALL | 单细胞测序 | NA | 转录组数据 | 44名患者 |
| 15293 | 2024-08-07 |
Multimodal Mapping of the Tumor and Peripheral Blood Immune Landscape in Human Pancreatic Cancer
2020-11, Nature cancer
IF:23.5Q1
DOI:10.1038/s43018-020-00121-4
PMID:34296197
|
研究论文 | 本文通过多模态分析方法，揭示了胰腺导管腺癌（PDA）中肿瘤及外周血的免疫景观 | 本文首次结合CyTOF、单细胞RNA测序和多重免疫组化技术，揭示了PDA中复杂的免疫抑制细胞相互作用网络 | NA | 阐明胰腺导管腺癌中的免疫景观，为免疫治疗提供新的策略 | 胰腺导管腺癌患者的肿瘤、匹配的外周血及非恶性样本 | 数字病理学 | 胰腺癌 | CyTOF、单细胞RNA测序、多重免疫组化 | NA | 细胞 | 多个胰腺导管腺癌患者样本 |
| 15294 | 2024-08-07 |
Developmental trajectory of prehematopoietic stem cell formation from endothelium
2020-08-13, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2020004801
PMID:32392346
|
研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序和单细胞转座酶可及染色质测序技术，探索了从小鼠胚胎尾部动脉的血管内皮细胞到造血干细胞前体的发育轨迹 | 首次识别出从内皮细胞到造血干细胞前体的连续发育轨迹，并定义了一个新的中间阶段——pre-HE细胞，该阶段具有特定的染色质可及性和转录因子富集 | NA | 探究造血干细胞前体形成的细胞和分子转变过程 | 小鼠胚胎的尾部动脉（背主动脉、脐动脉、卵黄动脉）中的细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序，单细胞转座酶可及染色质测序 | NA | 细胞 | 约40,000个细胞从小鼠胚胎的9.5天到11.5天 |
| 15295 | 2024-08-07 |
Transcriptional dynamics of pluripotent stem cell-derived endothelial cell differentiation revealed by single-cell RNA sequencing
2020-03-01, European heart journal
IF:37.6Q1
DOI:10.1093/eurheartj/ehz351
PMID:31242503
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术揭示了人胚胎干细胞衍生的内皮细胞在定向分化过程中的转录动态 | 发现了内皮细胞和间充质细胞谱系的分化过程中的转录分支以及新的转录特征 | NA | 探索从多能干细胞到内皮细胞分化的转录景观和细胞动态 | 人胚胎干细胞衍生的内皮细胞及其与成熟内皮细胞的比较 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 总共105,727个细胞进行了单细胞RNA测序分析 |
| 15296 | 2024-08-07 |
Therapy-induced mutations drive the genomic landscape of relapsed acute lymphoblastic leukemia
2020-01-02, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2019002220
PMID:31697823
|
研究论文 | 研究急性淋巴细胞白血病（ALL）复发机制，通过全基因组测序和超深度测序分析复发特异性体细胞变异 | 发现了两种新的复发特异性突变特征，其中一种与硫嘌呤治疗有关，这些特征在非ALL的复发样本和泛癌诊断样本中未见 | 研究主要集中在特定基因和突变特征上，可能未涵盖所有影响ALL复发的因素 | 探究急性淋巴细胞白血病复发机制及其与治疗诱导突变的关系 | 急性淋巴细胞白血病患者的诊断-复发-胚系三联体和连续样本 | 数字病理学 | 急性淋巴细胞白血病 | 全基因组测序，超深度测序 | 数学模型 | 基因组数据 | 103个诊断-复发-胚系三联体和16名患者的208个连续样本 |
| 15297 | 2024-08-07 |
Beyond Fibroblast Heterogeneity: What Single-Cell RNA Sequencing Tells Us
2019-Jul, American journal of respiratory cell and molecular biology
IF:5.9Q1
DOI:10.1165/rcmb.2019-0120ED
PMID:30978296
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 15298 | 2024-08-07 |
A cloning and expression system to probe T-cell receptor specificity and assess functional avidity to neoantigens
2018-11-01, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood-2018-04-843763
PMID:30150207
|
研究论文 | 本文开发了一种简化的方法，通过按需克隆和表达T细胞受体（TCR）并针对候选抗原进行筛选，来匹配TCR序列与相应抗原，以评估发现的TCR的特异性 | 本文提出的系统能够快速评估重建TCR的抗原特异性和功能亲和力，可用于监测抗原特异性T细胞反应，并可能指导基于T细胞的免疫疗法的设计 | NA | 提高对抗原-T细胞受体（TCR）相互作用的理解，以生成强效的抗肿瘤免疫反应 | T细胞受体的特异性和功能亲和力 | 免疫学 | 黑色素瘤，慢性淋巴细胞白血病 | 单细胞测序技术 | NA | TCR序列 | 来自接受个性化新抗原疫苗治疗的黑色素瘤患者的样本 |
| 15299 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptomics is revolutionizing the improvement of plant biotechnology research: recent advances and future opportunities
2024-Mar, Critical reviews in biotechnology
IF:8.1Q1
DOI:10.1080/07388551.2023.2165900
PMID:36775666
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评论 | 单细胞转录组学的现代进展促进了植物生物技术研究 | 提供了单细胞转录组学在植物中的最新进展，并探讨了其未来研究的潜力 | 分析了单细胞技术面临的各种技术障碍和固有限制 | 探讨单细胞转录组学在植物生物技术中的应用和发展 | 植物的单细胞转录组数据 | 植物生物学 | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | 转录组数据 | NA |
| 15300 | 2024-08-05 |
Skin single-cell transcriptomics reveals a core of sebaceous gland-relevant genes shared by mice and humans
2024-Feb-03, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-024-10008-8
PMID:38310227
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研究论文 | 本研究揭示了小鼠和人类皮肤中与皮脂腺相关的基因的核心。 | 首次通过单细胞转录组学方法比较了小鼠和人类皮脂腺相关基因的表达差异，发现种间间存在显著差异。 | 研究中观察到在小鼠和人类样本中，皮脂腺特有转录本的重叠极少，可能限制了其跨物种的比较分析。 | 探索并比较小鼠和人类皮脂腺中特有的基因表达模式。 | 小鼠和人类的皮肤样本，通过单细胞RNA测序进行分析。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠与人类皮肤样本 |