单细胞与空转测序相关文章

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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量
15261 2024-08-07
Elevated enteric putrescine suppresses differentiation of intestinal germinal center B cells
2024-Feb-15, International immunopharmacology IF:4.8Q1
研究论文 本研究探讨了外源性腐胺对肠道微环境中B细胞分化的影响 发现腐胺通过影响B细胞受体信号通路和脂肪酸氧化相关基因,抑制肠道B细胞分化,并揭示了腐胺在不同癌症中的免疫调节作用 NA 研究腐胺与B细胞成熟和代谢失调之间的因果关系及其机制 肠道微环境中的B细胞分化 免疫学 NA bulk RNA测序和单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA RNA测序数据 NA
15262 2024-08-07
Understanding the cell fate and behavior of progenitors at the origin of the mouse cardiac mitral valve
2024-Feb-05, Developmental cell IF:10.7Q1
研究论文 本研究使用单细胞RNA测序和回顾性多色克隆分析,探讨了小鼠心脏二尖瓣起源的前体细胞的命运和行为 首次详细描述了二尖瓣前体细胞的代谢过程和其在阀叶形成中的特定贡献 NA 揭示小鼠心脏二尖瓣前体细胞的身份、命运决策及其在阀叶中的行为和分布 小鼠胚胎和新生儿的二尖瓣前体细胞 数字病理学 先天性心脏畸形 单细胞RNA测序 NA 基因数据 涉及小鼠胚胎和新生儿的二尖瓣前体细胞样本
15263 2024-08-07
Autoreactive T cells target peripheral nerves in Guillain-Barré syndrome
2024-Feb, Nature IF:50.5Q1
研究论文 本文通过结合体外T细胞筛选、单细胞RNA测序和T细胞受体(TCR)测序,研究了Guillain-Barré综合征(GBS)中自身反应性T细胞的作用 首次鉴定出具有细胞毒性T辅助1(T1)样表型的自身反应性记忆CD4细胞和针对周围神经髓鞘抗原的稀有CD8 T细胞,并揭示了多克隆TCR谱系、短CDR3β长度、偏好HLA-DR限制和识别免疫优势表位 NA 揭示Guillain-Barré综合征中自身反应性T细胞的免疫机制 Guillain-Barré综合征患者中的自身反应性T细胞 NA Guillain-Barré综合征 单细胞RNA测序、T细胞受体测序 NA RNA 超过1,000个自身反应性单T细胞克隆
15264 2024-08-07
The Gut Microbiome Controls Liver Tumors via the Vagus Nerve
2024-Jan-25, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文探讨了肠道微生物群通过迷走神经影响肝脏肿瘤的机制 首次揭示肠道微生物群通过迷走神经调节肝脏肿瘤的机制,并发现迷走神经通过乙酰胆碱影响CD8+ T细胞活性 研究主要集中在小鼠模型上,需要进一步在人体中验证 研究肠道微生物群与迷走神经在肝脏肿瘤发展中的相互作用 肝脏肿瘤、肠道微生物群、迷走神经、CD8+ T细胞 NA 肝脏肿瘤 scRNA-seq NA 微生物群数据 涉及Rag1KO小鼠和无肿瘤小鼠
15265 2024-08-05
Identification of type 2 diabetes- and obesity-associated human β-cells using deep transfer learning
2024-Jan-23, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究利用深度迁移学习识别与2型糖尿病和肥胖相关的人类β细胞。 创新之处在于应用DEGAS工具,将疾病关联映射到单细胞RNA-seq数据上,以识别为2型糖尿病病理提供关键的β细胞亚群。 本研究没有涉及与其他潜在影响因素的交互作用。 本研究旨在优先识别与疾病相关的β细胞亚群,以更好理解2型糖尿病的发病机制。 研究对象为与2型糖尿病和肥胖相关的不同β细胞亚群。 数字病理学 2型糖尿病 单细胞RNA-seq 深度迁移学习模型 基因表达数据 涉及来自健康和2型糖尿病供体的人类胰腺切片
15266 2024-08-05
Cancer stem cells: Recent insights and therapies
2023-03, Biochemical pharmacology IF:5.3Q1
综述 本篇综述讨论了癌症干细胞的最新特征、标记和机制研究进展。 探讨了单细胞测序和空间转录组分析在癌症干细胞研究中的应用,提出新的治疗策略。 NA 深入了解癌症干细胞在癌症生物学中的基本角色。 癌症干细胞及其与肿瘤微环境中其他细胞的相互作用。 数字病理学 NA 单细胞测序、空间转录组分析 NA NA NA
15267 2024-08-05
Molecular functional characterization of the setdb1 and its potential target gene sox5 illuminate the histone modification-mediated orchestration of gonadal development in Chinese tongue sole (Cynoglossus semilaevis)
2024-Apr-05, Gene IF:2.6Q2
研究论文 该研究揭示了setdb1在中国舌鳎性别分化和生殖细胞发育中的作用 首次在中国舌鳎中详细描述了setdb1及其潜在靶基因sox5在性别发育调控中的分子机制 缺乏对setdb1在其他发育阶段的功能研究 探讨setdb1如何通过调控sox5的转录影响性别分化和生殖细胞发育 中国舌鳎的setdb1基因及其靶基因sox5 数字病理学 NA qRT-PCR, 单细胞RNA测序 NA 基因序列, RNA数据 NA
15268 2024-08-05
Spatial transcriptomics and the anatomical pathologist: Molecular meets morphology
2024-Mar, Histopathology IF:3.9Q1
小型综述 本文概述了空间转录组学方法及其在解剖病理学实践中的应用 本研究强调了与福尔马林固定石蜡包埋组织(FFPE)兼容的空间转录组学技术的进展 目前这些技术仍主要在研究实验室中使用,对于在常规解剖病理学实践中的整合还需进一步发展 探讨空间转录组学在解剖病理学中的应用与潜力 空间转录组学技术及其与解剖病理学实践的关系 数字病理学 NA 空间转录组学 NA 转录组数据 NA
15269 2024-08-05
Single-cell transcriptomics reveals the role of antigen presentation in liver metastatic breast cancer
2024-Feb-16, iScience IF:4.6Q1
研究论文 这篇文章深入分析了11例晚期乳腺癌患者的肝转移转录组特征 揭示了肝转移相关的抗原呈递功能障碍与肿瘤浸润T细胞的关系 样本量较小,仅为11例,可能影响结果的普遍性 研究肝转移乳腺癌中抗原呈递的作用 11例患有继发性肝癌的乳腺癌患者 数字病理 乳腺癌 单细胞转录组学 NA 基因表达数据 11例
15270 2024-08-07
Compartmentalization and synergy of osteoblasts drive bone formation in the regenerating fin
2024-Feb-16, iScience IF:4.6Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序、谱系追踪、靶向成骨细胞消融和电子显微镜技术,探讨了斑马鱼再生鳍中表皮、成骨细胞和非成骨细胞的谱系关系及其在再生过程中的作用 研究揭示了再生鳍中成骨细胞的来源及其在再生过程中的分工和协同作用,以及再生受损时的检测和补偿机制 NA 探讨斑马鱼再生鳍中细胞的谱系关系及其在再生过程中的作用 斑马鱼再生鳍中的表皮细胞、成骨细胞和非成骨细胞 NA NA 单细胞RNA测序、谱系追踪、靶向消融、电子显微镜 NA RNA NA
15271 2024-08-07
Comparative transcriptomic analysis of bovine mesenchymal stromal cells reveals tissue-source and species-specific differences
2024-Feb-16, iScience IF:4.6Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序技术比较了来自脂肪组织、骨髓和外周血的牛间充质干细胞的转录组特征,并探讨了其与马和人类间充质干细胞的异同 首次系统比较了不同来源的牛间充质干细胞的转录组特征,并揭示了其与人类间充质干细胞的相似性,为牛作为非传统动物模型用于间充质干细胞研究提供了依据 NA 探讨牛间充质干细胞的转录组特征及其与人类和马间充质干细胞的异同 牛间充质干细胞及其与人类和马间充质干细胞的转录组特征 NA NA 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 来自脂肪组织、骨髓和外周血的牛间充质干细胞,以及来自相同组织的马间充质干细胞和人类及小鼠的骨髓间充质干细胞
15272 2024-08-07
Delivery of Interferon β-Encoding Plasmid via Lipid Nanoparticle Restores Interferon β Expression to Enhance Antitumor Immunity in Colon Cancer
2024-Feb-06, ACS nano IF:15.8Q1
研究论文 本文研究通过脂质纳米颗粒递送干扰素β编码质粒,以恢复干扰素β表达并增强结直肠癌的抗肿瘤免疫 利用脂质纳米颗粒递送干扰素β编码质粒,增强肿瘤免疫原性和T细胞效应功能,抑制结直肠癌生长 NA 测试通过阳离子脂质纳米颗粒递送干扰素β编码质粒至肿瘤,恢复干扰素β表达以抑制肿瘤免疫逃逸的效果 结直肠癌细胞及肿瘤微环境中的免疫细胞 数字病理学 结直肠癌 RNA-Seq, scRNA-Seq NA RNA 涉及人类结直肠肿瘤组织和细胞,以及小鼠模型
15273 2024-08-05
Gut microbiota-derived LCA mediates the protective effect of PEDV infection in piglets
2024-Feb-05, Microbiome IF:13.8Q1
研究论文 本研究探讨了肠道微生物群与仔猪对PEDV感染的抵抗力之间的关系 发现LCA在炎症中发挥保护作用,并通过影响肠道T细胞群体来增强抗病毒效果 实验主要集中在猪的模型上,缺乏对其他动物或人类的广泛适用性研究 调查肠道微生物群在猪仔对PEDV感染抵抗力中的作用 猪仔的肠道微生物群及其对猪流行性腹泻病毒(PEDV)感染的反应 数字病理学 NA 单细胞转录组学,16S扩增子测序,宏基因组学,非靶向代谢组学 NA NA NA
15274 2024-08-05
Timing and precision of rattlesnake spinal motoneurons are determined by the KV72/3 potassium channel
2024-01-22, Current biology : CB IF:8.1Q1
研究论文 该文章探讨了响尾蛇运动神经元的生理特性及其对新型行为的影响 研究表明,响尾蛇体部和尾部的运动神经元具有根本不同的生理特性,这对于超快速肌肉的高时间精度控制是至关重要的 单细胞RNA测序未能揭示KV7通道表达的差异,可能限制了对其在生理学影响中的理解 探讨响尾蛇运动模式发生改变的生物机制 响尾蛇的运动神经元及其在体部和尾部的不同特性 数字病理学 NA 补丁钳记录电生理学 NA NA NA
15275 2024-08-07
Single-cell profiling of the pig cecum at various developmental stages
2024-Jan-18, Zoological research IF:4.0Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序技术,对不同发育阶段的猪盲肠细胞进行了全面的转录组分析 首次揭示了猪盲肠在不同发育阶段的单细胞基因表达图谱,并发现了多种细胞类型及其特异性基因和转录因子 NA 探究猪盲肠在不同发育阶段的细胞异质性和功能 猪盲肠在不同发育阶段的细胞 NA NA 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 45,572个细胞,来自7个不同发育阶段的猪盲肠样本
15276 2024-08-05
Construction and validation of a mitochondria-associated genes prognostic signature and immune microenvironment characteristic of sepsis
2024-Jan-05, International immunopharmacology IF:4.8Q1
研究论文 本文研究了与脓毒症相关的线粒体基因预后模型及其免疫微环境特征 建立了脓毒症的线粒体预后模型,并探讨了其与免疫微环境的关系 尚未明确线粒体与脓毒症免疫微环境之间的所有交互机制 旨在构建线粒体相关基因的预后模型来预测脓毒症患者的预后 研究对象为脓毒症患者的临床血样和线粒体相关基因 数字病理学 脓毒症 单细胞测序 NA 临床血样 5个与脓毒症相关的线粒体基因
15277 2024-08-05
Identifying the critical oncogenic mechanism of LDHA based on a prognostic model of T-cell synthetic drivers
2024-Jan-05, International immunopharmacology IF:4.8Q1
研究论文 本研究揭示了与T细胞合成驱动因子相关的预后模型在肺腺癌中的重要性 首次展示了LDHA在肺腺癌恶性进展中的关键作用,并开发了一个相关的预后模型 缺乏对其他类型肿瘤的综合分析,可能对广泛应用有所限制 改善肺腺癌的免疫疗法效果 关注肺腺癌患者的T细胞合成驱动因子 数字病理学 肺癌 单细胞测序 Lasso Cox回归模型 临床数据 NA
15278 2024-08-07
Single-cell RNA sequencing indicates cordycepin remodels the tumor immune microenvironment to enhance TIGIT blockade's anti-tumor effect in colon cancer
2024-Jan-05, International immunopharmacology IF:4.8Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析,探讨了虫草素与TIGIT阻断疗法联合使用在结肠癌中的抗肿瘤效果及其对肿瘤免疫微环境的重组作用 发现虫草素治疗能显著增强Cd226基因的表达,从而提高TIGIT阻断疗法的效果,并通过单细胞RNA测序证实了这一联合疗法在肿瘤免疫微环境中对NK细胞和CD8 T细胞的积极影响 NA 研究虫草素与TIGIT阻断疗法联合使用在结肠癌中的抗肿瘤效果 结肠癌肿瘤模型中的免疫细胞 数字病理学 结肠癌 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 使用了MC38肿瘤模型中的免疫细胞进行分析
15279 2024-08-07
Transcriptomic and genomic profiling of multiple primary colorectal cancers reveals intratumor heterogeneity and a distinct immune microenvironment
2024-Jan-05, International immunopharmacology IF:4.8Q1
研究论文 本研究报告了单一患者多发性原发性结直肠癌(MPCC)不同肿瘤病变的肿瘤内基因组和免疫学异质性 首次通过全外显子测序和单细胞RNA测序揭示了MPCC中肿瘤病变的分子和微环境特征,特别是发现了横结肠肿瘤病变中黏膜相关不变T细胞(MAIT)的富集 研究样本量较小,仅基于单一患者的数据,可能限制了结果的普遍性 探索MPCC患者不同原发部位肿瘤病变的分子和微环境特征 来自同一72岁男性MPCC患者的三个肿瘤病变,分别位于横结肠肝曲、乙状结肠和直肠 数字病理学 结直肠癌 全外显子测序(WES)、单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 基因组数据、转录组数据 三个肿瘤样本
15280 2024-08-07
Corrigendum to "Single-cell RNA sequencing in double-hit lymphoma: IMPDH2 induces the progression of lymphoma by activating the PI3K/AKT/mTOR signaling pathway" [Int. Immunopharmacol. 125(Part A) (2023) 111125]
2024-Jan-05, International immunopharmacology IF:4.8Q1
NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
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