单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27366 篇文献，本页显示第 15221 - 15240 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 15221 | 2024-08-05 |
Decoding leukemia at the single-cell level: clonal architecture, classification, microenvironment, and drug resistance
2024-Jan-30, Experimental hematology & oncology
IF:9.4Q1
DOI:10.1186/s40164-024-00479-6
PMID:38291542
|
review | 本文综述了单细胞测序技术在白血病研究中的应用 | 通过单细胞测序技术揭示了白血病的克隆结构、亚型分类、肿瘤微环境及耐药机制 | 传统的批量测序技术无法有效揭示个体肿瘤细胞之间的异质性 | 探讨白血病的发生机制和耐药性 | 白血病相关的单细胞研究 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序技术 | NA | NA | NA |
| 15222 | 2024-08-05 |
Screening of Candidate Inflammatory Markers of Epithelial Cells in Hepatocellular Carcinoma Based on Integration Analysis of TCGA/ICGC Databases and Single-cell Sequencing
2024-Jan-30, Recent patents on anti-cancer drug discovery
IF:2.5Q3
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研究论文 | 该研究旨在通过综合分析TCGA、ICGC和单细胞测序数据，筛选肝细胞癌中上皮细胞的炎症标记物 | 首次识别出在肝细胞癌中与炎症反应相关的12个差异表达基因，并揭示了它们对患者生存预后的影响 | 该研究的实验重复性和临床验证尚未充分阐明 | 研究肝细胞癌中上皮细胞在炎症刺激下的表达特征及其潜在治疗药物 | 主要研究对象为在肝细胞癌微环境下的上皮细胞 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞测序, 转录组测序 | NA | 基因表达数据, 药物筛选数据 | 分析了来自TCGA和ICGC的HCC转录组数据及单细胞数据 |
| 15223 | 2024-08-05 |
Single-cell RNA-seq mapping of chicken peripheral blood leukocytes
2024-Jan-29, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-024-10044-4
PMID:38287279
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研究论文 | 本研究评估了单细胞RNA-seq作为识别鸡外周血白细胞的工具 | 首次识别出具有高SOX5表达的鸡外周B细胞亚群，并提供了TCRγ/δ + T细胞亚群的新见解 | 该方法在一定程度上受限于鸡基因组的不完全注释，且某些细胞类型的解读较为复杂 | 研究单细胞转录组学在鸡外周血白细胞中的应用 | 来自4只临床健康母鸡的纯化脱 thrombocyte 的白细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞3' RNA-seq | NA | 转录组数据 | 4只母鸡的白细胞 |
| 15224 | 2024-08-05 |
Semi-supervised integration of single-cell transcriptomics data
2024-Jan-29, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-45240-z
PMID:38287014
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研究论文 | 本文提出了一种名为STACAS的单细胞RNA-seq数据批量修正方法 | STACAS通过利用细胞类型的先验知识来保持生物变异性，表现优于现有的无监督和有监督方法 | 未提及具体的局限性 | 研究单细胞RNA-seq数据的批量效应修正 | 单细胞RNA-seq数据 | 数字病理学 | NA | RNA-seq | NA | 单细胞数据 | NA |
| 15225 | 2024-08-07 |
Characterization of CD90/Thy-1 as a crucial molecular signature for myogenic differentiation in human urine-derived cells through single-cell RNA sequencing
2024-01-28, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-52530-5
PMID:38282008
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析，揭示了CD90/Thy-1在人尿源细胞中作为肌源性分化的关键分子标志的作用 | 首次发现CD90/Thy-1在人尿源细胞中高度表达，并与高肌源性潜能的亚群细胞相关，对肌源性分化有重要影响 | CD90的过表达并未增强非CD90阳性细胞的肌源性分化，表明其作用可能有限 | 探究CD90/Thy-1在人尿源细胞肌源性分化中的作用及其机制 | 人尿源细胞（UDCs）及其肌源性分化能力 | NA | Duchenne肌营养不良（DMD） | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 有限亚群的人尿源细胞 |
| 15226 | 2024-08-07 |
Trajectory inference across multiple conditions with condiments
2024-Jan-27, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-44823-0
PMID:38280860
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研究论文 | 本文介绍了一种名为condiments的方法，用于在多条件下推断和解释细胞轨迹 | condiments方法能够在多条件下整合数据集，并比较不同条件下的细胞轨迹、细胞群和基因表达水平 | NA | 研究如何在多生物组或条件下处理细胞轨迹推断和比较 | 单细胞RNA测序数据中的细胞轨迹 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-Seq) | NA | 基因表达数据 | NA |
| 15227 | 2024-08-05 |
Analysis of the potential biological value of pyruvate dehydrogenase E1 subunit β in human cancer
2024-Jan-15, World journal of gastrointestinal oncology
IF:2.5Q3
DOI:10.4251/wjgo.v16.i1.144
PMID:38292838
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研究论文 | 本研究通过生物信息学方法综合分析了丙酮酸脱氢酶E1亚单位β（PDHB）在不同癌症中的潜在生物价值。 | 本研究首次系统性探讨了PDHB在各种癌症中的诊断、预后及免疫相关性，并发现其在肝癌细胞中的调节作用。 | 该研究大部分分析依赖于现有数据库，缺乏广泛的临床实验验证。 | 研究PDHB在癌症中的生物学作用及其作为肿瘤标志物的潜力。 | 本研究的对象主要为不同类型的癌症样本和肝癌细胞。 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及多种癌症的大量样本，具体数字未提供 |
| 15228 | 2024-08-05 |
DiSignAtlas: an atlas of human and mouse disease signatures based on bulk and single-cell transcriptomics
2024-Jan-05, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkad961
PMID:37930831
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研究论文 | DiSignAtlas是一个基于转录组学的人类和小鼠疾病特征图谱 | 本研究提供了一个综合性的疾病特征库，涵盖了广泛的疾病类型和转录组特征 | 没有提到具体的局限性 | 建立全面的疾病特征数据库 | 涵盖1836种非冗余疾病类型的人类和小鼠转录组数据 | 数字病理学 | NA | 转录组学 | NA | 转录组数据 | 181434个转录组特征，包含10306个比较数据集 |
| 15229 | 2024-08-05 |
SCAN: Spatiotemporal Cloud Atlas for Neural cells
2024-Jan-05, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkad895
PMID:37930842
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研究论文 | 本文提出了一种新的数据库SCAN，旨在系统性地解析神经系统的细胞异质性和空间位置 | 创新点在于整合了大量的单细胞RNA测序和空间转录组学数据，提供了新的交互式数据探索平台 | 数据整合和分析的效率仍然是一个挑战 | 研究目标是解密神经系统的细胞异质性并促进神经疾病的诊断策略发展 | 研究对象包括10679684个神经系统细胞以及900多种生物的多组学数据 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病，帕金森病，唐氏综合症等神经疾病 | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | NA | 细胞数据，组学数据 | 10679684个细胞 |
| 15230 | 2024-08-05 |
TFAP2 paralogs regulate midfacial development in part through a conserved ALX genetic pathway
2024-Jan-01, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.202095
PMID:38063857
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研究论文 | 这篇文章展示了TFAP2家族成员在脊椎动物中调控中面部发育的作用 | 研究首次揭示了TFAP2家族成员通过激活ALX转录因子基因表达来参与中面部发育的调控 | 在晚期迁移阶段进行的实验可能未能捕捉到更早期基因调控网络的变化 | 探究TFAP2家族成员如何影响中面部发育的机制 | 小鼠和斑马鱼的神经嵴细胞 | 数字病理学 | NA | RNA-seq, ChIP-seq | NA | 基因表达数据 | 包括小鼠和斑马鱼的多样本 |
| 15231 | 2024-08-05 |
Potential to Enhance Large Scale Molecular Assessments of Skin Photoaging through Virtual Inference of Spatial Transcriptomics from Routine Staining
2024, Pacific Symposium on Biocomputing. Pacific Symposium on Biocomputing
PMID:38160301
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研究论文 | 本研究探讨了通过常规染色的组织切片推断空间转录组学信息，以增强对皮肤光老化的大规模分子评估 | 创新点在于利用常规H&E染色切片推断空间转录组学信息，克服了当前方法的局限性 | 当前方法依赖于10x Genomics空间转录组学实验的高成本和患者间的变异性，限制了大规模分子流行病学研究的范围 | 研究皮肤光老化的空间转录组学特征，以改进评估和疗法发展 | 研究对象为来自261个皮肤样本的四名患者的组织切片 | 数字病理学 | 皮肤癌 | 空间转录组学 | 机器学习模型 | 基因表达数据 | 四名患者的261个皮肤样本 |
| 15232 | 2024-08-07 |
Identification of Cancer Stem Cell-related Gene by Single-cell and Machine Learning Predicts Immune Status, Chemotherapy Drug, and Prognosis in Lung Adenocarcinoma
2024, Current stem cell research & therapy
IF:2.1Q4
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研究论文 | 本研究旨在基于癌症干细胞相关基因识别肺腺癌的分子类型和预后模型 | 本研究首次构建了一个基于8个基因的预后模型，用于预测肺腺癌的预后和免疫治疗反应 | NA | 识别肺腺癌的分子类型和预后模型 | 肺腺癌的分子类型和预后模型 | 数字病理学 | 肺腺癌 | RNA-seq | LASSO Cox回归分析 | 单细胞RNA测序数据 | 使用了来自TCGA数据库的肺腺癌临床信息和RNA-seq数据，以及来自GEO数据库的scRNA数据集GSE131907和5个GSE数据集 |
| 15233 | 2024-08-07 |
Identification of Stem Cell-related Gene Markers by Comprehensive Transcriptome Analysis to Predict the Prognosis and Immunotherapy of Lung Adenocarcinoma
2024, Current stem cell research & therapy
IF:2.1Q4
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研究论文 | 本研究通过综合转录组分析识别与肺腺癌预后和免疫治疗相关的干细胞相关基因标记 | 开发了一种新的癌症干细胞评估指标和一个4基因标记，用于评估肺腺癌对免疫检查点阻断疗法或抗肿瘤治疗的反应 | NA | 评估肺腺癌细胞的干细胞特性及其对预后和免疫治疗的影响 | 肺腺癌中的癌症干细胞及其相关基因标记 | 数字病理学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | LASSO和COX回归分析 | 基因表达数据 | 4个样本，共3455个恶性细胞 |
| 15234 | 2024-08-07 |
Biallelic COQ4 Variants in Hereditary Spastic Paraplegia: Clinical and Molecular Characterization
2024-Jan, Movement disorders : official journal of the Movement Disorder Society
IF:7.4Q1
DOI:10.1002/mds.29664
PMID:38014483
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研究论文 | 本研究旨在确认双等位COQ4突变在遗传性痉挛性截瘫（HSP）中的致病作用，并阐明COQ4相关HSP的临床、遗传和功能分子特征 | 首次确认了双等位COQ4突变在HSP中的致病作用，并揭示了这些突变与线粒体功能障碍和疾病表型严重性之间的关系 | NA | 确认双等位COQ4突变在HSP中的致病作用，并阐明COQ4相关HSP的临床、遗传和功能分子特征 | 310名原因不明的HSP患者及其临床数据，以及COQ4突变的功能分子特征 | NA | 遗传性痉挛性截瘫 | 全外显子测序、单细胞RNA测序、生物化学细胞系分析、诱导多能干细胞衍生的锥体神经元和斑马鱼模型 | NA | 基因序列、临床数据、细胞和动物模型 | 310名HSP患者，6个无关家族中的7名患者，以及多种细胞和动物模型 |
| 15235 | 2024-08-07 |
Single cell RNA sequencing reveals endothelial cell killing and resolution pathways in experimental malaria-associated acute respiratory distress syndrome
2024-Jan, PLoS pathogens
IF:5.5Q1
DOI:10.1371/journal.ppat.1011929
PMID:38236930
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了实验性疟疾相关急性呼吸窘迫综合征（MA-ARDS）中内皮细胞杀伤和解决途径 | 本研究首次通过单细胞RNA测序分析了MA-ARDS中内皮细胞的杀伤和解决途径，并利用MultiNicheNet交互组分析确定了疾病解决过程中配体-受体交互的重要变化 | 本研究主要基于小鼠模型，其结果在人类中的适用性需要进一步验证 | 研究疟疾相关急性呼吸窘迫综合征的解决机制，以促进内皮细胞增殖和限制炎症 | 疟原虫感染的小鼠模型及其肺部内皮细胞 | 数字病理学 | 疟疾 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | P. berghei NK65感染的C57BL/6小鼠 |
| 15236 | 2024-08-05 |
Single-Cell Transcriptomics and In Vitro Lineage Tracing Reveals Differential Susceptibility of Human iPSC-Derived Midbrain Dopaminergic Neurons in a Cellular Model of Parkinson's Disease
2023-12-18, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells12242860
PMID:38132179
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研究论文 | 本研究生成了一种能够纯化和追踪人类中脑多巴胺前体细胞及其分化后代的iPSC系。 | 使用CRISPR/Cas9技术将蓝色荧光蛋白(BFP)和Cre基因插入安全栖息地位点AAVS1，实现中脑多巴胺谱系标记。 | 未提及其他细胞类型的影响或长时间的体内模型验证，可能限制模型的真实性。 | 研究不同人类iPSC衍生的中脑多巴胺能神经元在帕金森病模型中的易感性。 | 人类诱导多能干细胞（iPSC）衍生的神经细胞。 | 干细胞技术 | 帕金森病 | CRISPR/Cas9 | NA | 单细胞RNA测序 | NA |
| 15237 | 2024-08-07 |
Exploring the Functional Heterogeneity of Directly Reprogrammed Neural Stem Cell-Derived Neurons via Single-Cell RNA Sequencing
2023-12-11, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells12242818
PMID:38132138
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术探索了直接重编程神经干细胞衍生神经元的功能异质性 | 本文首次通过单细胞RNA测序分析了直接重编程神经干细胞及其衍生神经元的功能异质性，并揭示了细胞命运调控因子 | 本文未详细讨论直接重编程神经干细胞在临床应用中的具体挑战和解决方案 | 研究直接重编程神经干细胞衍生神经元的功能异质性，以提高其在神经退行性疾病治疗中的应用质量 | 直接重编程神经干细胞及其衍生神经元 | 数字病理学 | 神经退行性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及人纤维母细胞、直接重编程神经干细胞及其衍生神经元的单细胞RNA测序数据 |
| 15238 | 2024-08-07 |
Effect of stretching on inflammation in a subcutaneous carrageenan mouse model analyzed at single-cell resolution
2023-12, Journal of cellular physiology
IF:4.5Q1
DOI:10.1002/jcp.31133
PMID:37909412
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研究论文 | 研究了拉伸对小鼠皮下卡拉胶炎症模型中单细胞分辨率下炎症反应的影响 | 首次在单细胞水平上分析了拉伸对小鼠皮下卡拉胶炎症模型的影响，揭示了拉伸对炎症反应和细胞间通讯的具体作用机制 | NA | 探索拉伸在细胞和分子水平上对小鼠皮下卡拉胶炎症模型的影响 | 小鼠皮下卡拉胶炎症模型中的炎症反应 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 15239 | 2024-08-05 |
Spatial Transcriptomics Reveals Signatures of Histopathological Changes in Muscular Sarcoidosis
2023-11-30, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells12232747
PMID:38067175
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研究论文 | 本研究通过空间转录组学揭示了肌肉肉芽肿病的组织病理学变化特征 | 首次探索了肉芽肿与骨骼肌之间的相互作用，提供了有关免疫细胞对肌肉影响的新见解 | 研究对象仅包括两名患者，样本量较小，结果的普适性有待验证 | 揭示肉芽肿免疫细胞对骨骼肌的影响及其病理机制 | 研究对象为两名肌肉肉芽肿病患者 | 数字病理学 | 肌肉肉芽肿病 | 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 2名肌肉肉芽肿病患者 |
| 15240 | 2024-08-05 |
Sex and Age Impact CD4+ T Cell Susceptibility to HIV In Vitro through Cell Activation Dynamics
2023-11-23, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells12232689
PMID:38067117
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研究论文 | 本研究探讨了性别和年龄如何通过细胞激活动态影响CD4+ T细胞对HIV的易感性 | 首次在体外验证了性别和年龄对CD4+ T细胞对HIV易感性的影响，并进行了深入的表面标记物表达评估 | 研究中未观察到根据性别区分的细胞亚型富集 | 研究细胞级别的因素如何影响HIV复制，特别是与性别和年龄相关的因素 | 从二十名供体提取的初级CD4+ T细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 20名供体的CD4+ T细胞 |