单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27621 篇文献，本页显示第 15221 - 15240 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 15221 | 2024-08-07 |
The efficient generation of functional human hepatocytes from chemically induced pluripotent stem cells
2024-Feb, Cell proliferation
IF:5.9Q2
DOI:10.1111/cpr.13540
PMID:37814474
|
研究论文 | 本文开发了一种模拟肝母细胞两阶段发育的分化协议，从化学诱导的多能干细胞（hCiPSCs）高效生成肝前体细胞 | 首次通过模拟肝母细胞的两阶段发育过程，实现了从hCiPSCs高效生成肝前体细胞和肝细胞 | NA | 探索从多能干细胞中高效生成功能性人肝细胞的方法 | 化学诱导的多能干细胞（hCiPSCs）及其分化生成的肝前体细胞和肝细胞 | 细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | NA |
| 15222 | 2024-08-07 |
Antibody dependent cell-mediated cytotoxicity selection pressure induces diverse mechanisms of resistance
2023-12-31, Cancer biology & therapy
IF:4.4Q2
DOI:10.1080/15384047.2023.2269637
PMID:37878417
|
研究论文 | 本研究探讨了抗体依赖性细胞介导的细胞毒性（ADCC）选择压力下肿瘤细胞的抗性机制 | 揭示了ADCC选择压力下肿瘤细胞的共享和独特抗性机制，并利用单细胞RNA测序和蛋白质组筛选探究了分子抗性机制 | ADCC抗性无法通过组合治疗策略逆转 | 研究ADCC选择压力下的肿瘤细胞抗性机制 | ADCC抗性机制及肿瘤细胞的免疫逃逸策略 | NA | NA | 单细胞RNA测序，蛋白质组筛选 | NA | RNA，蛋白质 | 多个ADCC选择压力模型中的细胞 |
| 15223 | 2024-08-07 |
FGFR3 Alterations in Bladder Cancer Stimulate Serine Synthesis to Induce Immune-Inert Macrophages That Suppress T-cell Recruitment and Activation
2023-12-15, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-23-1065
PMID:37768887
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研究论文 | 本文研究了膀胱癌中FGFR3突变如何通过增加丝氨酸合成诱导免疫惰性巨噬细胞，从而抑制T细胞招募和激活 | 发现FGFR3突变通过增加丝氨酸合成在膀胱癌细胞中诱导免疫惰性巨噬细胞，为改善治疗反应提供了新策略 | NA | 探讨FGFR3突变在膀胱癌中的免疫抑制机制，并评估联合治疗策略的有效性 | 膀胱癌中的FGFR3突变、巨噬细胞和T细胞 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 15224 | 2024-08-05 |
CellNeighborEX: deciphering neighbor-dependent gene expression from spatial transcriptomics data
2023-Nov-09, Molecular systems biology
IF:8.5Q1
DOI:10.15252/msb.202311670
PMID:37815040
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研究论文 | 提出了一种新方法CellNeighborEX，用于研究细胞邻域依赖的基因表达 | 通过空间转录组数据揭示了细胞邻里对基因表达的影响，超越了传统的配体-受体共表达分析 | 未提供特定的限制信息 | 探讨细胞微环境对基因表达的影响 | 不同组织中细胞类型及其邻近细胞的基因表达 | 数字病理学 | 肝癌 | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 多个小鼠胚胎及肝癌样本 |
| 15225 | 2024-08-04 |
Targeting TREM1 augments antitumor T cell immunity by inhibiting myeloid-derived suppressor cells and restraining anti-PD-1 resistance
2023-11-01, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI167951
PMID:37651197
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研究论文 | 该研究探讨了靶向TREM1在抑制免疫抑制微环境中增强抗肿瘤T细胞免疫的潜力 | 开发了一种新的TREM1小分子抑制剂VJDT，并证明其能显著延缓肿瘤生长和增强抗PD-1治疗的效果 | 研究主要基于小鼠模型，需要更多临床研究验证结果 | 探讨TREM1在肿瘤免疫中的作用以及其抑制机制 | 使用Trem1缺失的小鼠和新开发的TREM1抑制剂 | 肿瘤学 | 黑色素瘤 | RNA-Seq | 小鼠模型 | 生物检测数据和基因表达数据 | 使用了B16F10和MCA205小鼠模型 |
| 15226 | 2024-08-07 |
90K/LGALS3BP expression is upregulated in COVID-19 but may not restrict SARS-CoV-2 infection
2023-Nov, Clinical and experimental medicine
IF:3.2Q2
DOI:10.1007/s10238-023-01077-2
PMID:37162650
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研究论文 | 研究分析了90K/LGALS3BP在COVID-19患者中的表达情况及其对SARS-CoV-2感染的影响 | 首次详细探讨了90K/LGALS3BP在SARS-CoV-2感染中的表达及其潜在的抗病毒作用 | 实验仅限于体外细胞实验，未涉及动物模型或更广泛的临床样本 | 探究90K/LGALS3BP在COVID-19中的表达及其对SARS-CoV-2感染的潜在影响 | COVID-19患者的血清、外周血单个核细胞（PBMCs）以及呼吸道样本 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | mRNA | 44名COVID-19住院患者 |
| 15227 | 2024-08-07 |
E2F1 Mediates SOX17 Deficiency-Induced Pulmonary Hypertension
2023-11, Hypertension (Dallas, Tex. : 1979)
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research paper | 本研究探讨了SOX17基因缺陷在特发性肺动脉高压（PAH）发病机制中的作用，并发现E2F1信号通路在其中起关键作用。 | 首次报道了SOX17基因变异在PAH发病机制中的具体作用，并揭示了E2F1信号通路在SOX17缺陷引起的肺动脉高压中的关键作用。 | NA | 研究SOX17基因缺陷在特发性肺动脉高压发病机制中的作用。 | SOX17基因在肺动脉高压中的表达及功能。 | NA | 肺动脉高压 | 单细胞RNA测序、RNA测序分析、荧光素酶 assay | NA | RNA | 包括患者的肺和肺内皮细胞，以及经过基因编辑的小鼠模型。 |
| 15228 | 2024-08-07 |
DNA-binding protein PfAP2-P regulates parasite pathogenesis during malaria parasite blood stages
2023-Nov, Nature microbiology
IF:20.5Q1
DOI:10.1038/s41564-023-01497-6
PMID:37884813
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研究论文 | 本文研究了DNA结合蛋白PfAP2-P在疟原虫红细胞阶段发育中的作用及其对病原性的调控 | 首次详细描述了PfAP2-P在疟原虫红细胞阶段发育中的两个表达高峰期，并揭示了其在trophozoite发育、var基因调控、merozoite发育和寄生虫出胞中的关键作用 | NA | 探讨PfAP2-P在疟原虫红细胞阶段发育中的分子调控机制 | Plasmodium falciparum中的PfAP2-P蛋白及其在疟原虫红细胞阶段的作用 | NA | 疟疾 | 染色质免疫沉淀测序, 单细胞RNA测序, 荧光激活细胞分选 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 15229 | 2024-08-05 |
Single-cell profiling coupled with lineage analysis reveals vagal and sacral neural crest contributions to the developing enteric nervous system
2023-10-25, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.79156
PMID:37877560
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研究论文 | 本研究揭示了迷走和骶神经嵴对发育中的肠神经系统的贡献 | 首次结合单细胞转录组学与特定轴水平的谱系追踪比较了鸡胚中两种神经嵴细胞的贡献 | 研究集中于鸟类胚胎，可能无法直接推导到其他物种 | 研究迷走神经嵴和骶神经嵴在肠神经系统中的贡献 | 鸡胚胎中的迷走和骶神经嵴细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 细胞 | NA |
| 15230 | 2024-08-04 |
Cell-intrinsic and -extrinsic effects of SARS-CoV-2 RNA on pathogenesis: single-cell meta-analysis
2023-10-24, mSphere
IF:3.7Q2
DOI:10.1128/msphere.00375-23
PMID:37737611
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序对人类COVID-19进行高分辨率元分析，探索了SARS-CoV-2 RNA对病理的细胞内和细胞外影响 | 研究报告了在多种细胞类型中病毒RNA的传播，以及K18-hACE2小鼠模型最接近人类COVID-19的创新发现 | 某些预临床模型如雪貂和猕猴对人类疾病的模拟效果较差 | 评估预临床模型是否成功模拟严重COVID-19的细胞内外效应 | 五种动物模型以及人类COVID-19患者的单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | 新冠肺炎 | 单细胞RNA测序 | K18-hACE2小鼠模型 | 基因表达数据 | 六个公开的单细胞RNA-seq数据集 |
| 15231 | 2024-08-04 |
Itaconate-producing neutrophils regulate local and systemic inflammation following trauma
2023-Oct-23, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.169208
PMID:37707952
|
研究论文 | 这篇文章探讨了生产异羟酸的中性粒细胞在创伤后的局部和系统性炎症中的调节作用 | 发现了在创伤后主要由成熟的中性粒细胞产生异羟酸，并展示了异羟酸对创伤愈合的潜在治疗效果 | 尚未讨论异羟酸在其他类型创伤中的作用 | 评估异羟酸在肌腱损伤愈合中的作用及其机制 | 关注创伤后免疫反应与细胞代谢之间的关系 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 代谢组数据 | NA |
| 15232 | 2024-08-07 |
Single-cell Mayo Map (scMayoMap): an easy-to-use tool for cell type annotation in single-cell RNA-sequencing data analysis
2023-10-20, BMC biology
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s12915-023-01728-6
PMID:37858214
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为scMayoMap的单细胞RNA测序数据分析工具，用于细胞类型注释 | 开发了一个全面的细胞标记数据库scMayoMapDatabase和一个易于使用的R包scMayoMap，提供快速准确的细胞类型注释 | NA | 开发一个用户友好且精确的单细胞RNA测序数据注释工具 | 单细胞RNA测序数据中的细胞类型注释 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 48个独立的单细胞RNA测序数据集 |
| 15233 | 2024-08-07 |
CRISPR/Cas9-based depletion of 16S ribosomal RNA improves library complexity of single-cell RNA-sequencing in planarians
2023-Oct-20, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-023-09724-4
PMID:37864134
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研究论文 | 本文研究了使用CRISPR/Cas9技术去除16S核糖体RNA对扁形动物单细胞RNA测序文库复杂性的影响 | 首次证明了物理去除16S核糖体RNA能有效提高单细胞RNA测序文库的复杂性，并优于计算机方法去除 | NA | 探讨物理去除16S核糖体RNA对单细胞RNA测序文库复杂性的影响 | 扁形动物的单细胞RNA测序文库 | 基因组学 | NA | CRISPR/Cas9, 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 30个单引导RNA |
| 15234 | 2024-08-05 |
GoM DE: interpreting structure in sequence count data with differential expression analysis allowing for grades of membership
2023-10-19, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-023-03067-9
PMID:37858253
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研究论文 | 本研究提出了一种新的差异表达分析方法，用于从单细胞测序数据集中识别结构 | 引入了允许细胞部分归属多个组的差异表达分析方法，称为GoM DE | 对单个部分的解释仍然是一个挑战 | 旨在改善单细胞RNA-seq和ATAC-seq数据集中的结构识别和注释 | 单细胞RNA-seq和ATAC-seq数据集中的细胞 | 数字病理学 | NA | 非负矩阵分解和主题建模 | NA | 序列计数数据 | 多个单细胞数据集 |
| 15235 | 2024-08-07 |
High-dimensional deconstruction of pancreatic cancer identifies tumor microenvironmental and developmental stemness features that predict survival
2023-Oct-19, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-023-00455-z
PMID:37857854
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析胰腺导管腺癌（PDAC）的肿瘤微环境（TME），揭示了与患者生存相关的肿瘤微环境和发育干细胞特征 | 首次通过高维基因表达分析，结合单细胞RNA测序和批量RNA测序数据，揭示了PDAC中与预后特别差的恶性细胞、促肿瘤的SPP1+巨噬细胞和肌成纤维细胞性癌症相关成纤维细胞相关的肿瘤微环境社区，以及存在于恶性细胞和癌症相关成纤维细胞中的发育干细胞连续体 | NA | 旨在通过高维基因表达分析，揭示胰腺导管腺癌的肿瘤微环境和发育干细胞特征，以改善患者的风险分层和个性化临床决策 | 胰腺导管腺癌（PDAC）的肿瘤微环境和发育干细胞特征 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 25个未经治疗的PDAC诊断时内镜超声引导下细针穿刺（EUS-FNB）样本，6个手术切除样本，以及80个公开可用样本，共计268个批量RNA-seq样本 |
| 15236 | 2024-08-05 |
A spatial sequencing atlas of age-induced changes in the lung during influenza infection
2023-10-18, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-42021-y
PMID:37852965
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研究论文 | 本研究揭示了老年小鼠在流感感染过程中肺部的年龄诱导变化. | 通过单细胞RNA测序和空间转录组学，识别了与年龄相关的新型纤维化和抗纤维化标记. | 研究仅使用了女性小鼠, 可能限制了结果的普遍适用性. | 研究年龄相关的免疫反应变化如何影响老年人对流感病毒的反应. | 年轻和老年雌性小鼠的肺组织. | 数字病理学 | 老年疾病 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 整体RNA测序 | NA | 组织样本 | 多组小鼠样本, 包括年轻和老年的肺组织 |
| 15237 | 2024-08-07 |
Mycobacterium tuberculosis infection drives differential responses in the bone marrow hematopoietic stem and progenitor cells
2023-10-17, Infection and immunity
IF:2.9Q2
DOI:10.1128/iai.00201-23
PMID:37754680
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研究论文 | 研究了结核分枝杆菌感染对骨髓造血干细胞和祖细胞的不同反应 | 首次揭示了耐药突变对结核分枝杆菌感染后造血系统反应的影响 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类中验证 | 探讨结核分枝杆菌感染对造血干细胞和祖细胞的影响 | 骨髓中的造血干细胞和祖细胞 | NA | 结核病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠模型中的造血干细胞和祖细胞 |
| 15238 | 2024-08-07 |
The mycosis fungoides cutaneous microenvironment shapes dysfunctional cell trafficking, antitumor immunity, matrix interactions, and angiogenesis
2023-10-09, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.170015
PMID:37669110
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，全面分析了晚期蕈样肉芽肿皮肤肿瘤的肿瘤微环境（TME）中的转录组，揭示了恶性T淋巴细胞与皮肤微环境中的非恶性免疫和基质细胞、细胞因子及其他免疫调节因子的相互作用。 | 研究首次通过单细胞RNA测序技术，详细描绘了蕈样肉芽肿皮肤肿瘤微环境中的细胞类型组成、细胞功能及细胞间的相互作用，这些发现与健康皮肤及良性皮肤病有显著差异。 | 研究主要集中在晚期蕈样肉芽肿的皮肤肿瘤微环境，可能不适用于疾病早期或其他阶段的分析。 | 探索蕈样肉芽肿中恶性T淋巴细胞与皮肤肿瘤微环境之间的相互作用，并识别具有治疗潜力的候选分子。 | 蕈样肉芽肿的皮肤肿瘤微环境及其中的免疫和基质细胞。 | 数字病理学 | 皮肤癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 多个晚期蕈样肉芽肿患者样本 |
| 15239 | 2024-08-07 |
Single-cell allele-specific expression analysis reveals dynamic and cell-type-specific regulatory effects
2023-10-09, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-42016-9
PMID:37813843
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研究论文 | 本文介绍了DAESC方法，用于分析单细胞RNA测序数据中的差异等位特异性表达，并通过模拟和实际数据验证了其统计行为。 | DAESC方法能够处理来自同一个体的细胞间的非独立性，并整合隐式单体型分相，为单细胞等位特异性表达分析提供了一种强大的工具。 | NA | 研究单细胞水平上的差异等位特异性表达，揭示基因表达调控的动态和细胞类型特异性效应。 | 单细胞RNA测序数据中的差异等位特异性表达。 | 基因组学 | 2型糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 105个诱导多能干细胞（iPSC）系和2型糖尿病患者及对照组的胰腺内分泌细胞。 |
| 15240 | 2024-08-04 |
Lineage commitment of dermal fibroblast progenitors is controlled by Kdm6b-mediated chromatin demethylation
2023-10-04, The EMBO journal
DOI:10.15252/embj.2023113880
PMID:37602956
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研究论文 | 本研究阐明了真皮成纤维细胞前体的分化机制 | 首次揭示了Kdm6b介导的染色质去甲基化在真皮成纤维细胞前体分化中的作用 | 尚未探讨其他潜在的表观遗传机制对DFP分化的影响 | 定义真皮成纤维细胞前体状态及其分化潜力的调控机制 | 真皮成纤维细胞前体及其分化 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA-seq, ChIP-seq, 同种异体移植 | 小鼠 | 基因表达数据 | 多个小鼠样本，具体数量未提及 |