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当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 1501 - 1520 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1501 | 2025-10-05 |
Computational pathology annotation enhances the resolution and interpretation of breast cancer spatial transcriptomics data
2025-Sep-09, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-025-01104-3
PMID:40925915
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研究论文 | 本研究开发了一种计算病理学图像分析流程，用于增强乳腺癌空间转录组数据的解析和解释 | 提出计算组织注释(CTA)流程，利用机器学习算法在Visium平台数据中精确映射肿瘤、基质和免疫区室，提高数据分析分辨率 | 研究样本量较小(仅4名患者的23个肿瘤切片)，且空间转录组技术尚未达到单细胞分辨率 | 开发计算病理学方法以增强乳腺癌空间转录组数据的解析能力 | 乳腺癌肿瘤组织切片 | 计算病理学 | 乳腺癌 | 空间转录组学，机器学习 | 机器学习算法 | 图像，空间转录组数据 | 4名患者的23个乳腺癌肿瘤切片 | 10x Genomics | 空间转录组学 | Visium | Visium空间转录组平台 |
| 1502 | 2025-10-05 |
Dynamic interaction of oligodendrocyte precursor cells with other cell types in the central nervous system
2025-Sep-08, Neurochemistry international
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.neuint.2025.106050
PMID:40930164
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综述 | 系统梳理少突胶质前体细胞与中枢神经系统其他细胞类型的动态相互作用及其功能多样性 | 突破传统仅关注髓鞘形成功能的认知，通过单细胞测序和活体成像技术揭示OPCs在神经发育、稳态维持和病理重塑中的多模态功能 | NA | 整合OPCs非髓鞘形成功能的现有证据，探讨神经再生医学的治疗靶点 | 少突胶质前体细胞与神经元、星形胶质细胞、小胶质细胞、血管内皮细胞的相互作用 | 神经科学 | 多发性硬化症, 脑缺血 | 单细胞测序, 活体成像 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1503 | 2025-10-05 |
Single-cell and spatial transcriptomics identify dihydrolipoic acid succinyltransferase as a promoter of tumor invasion via vascular pathways in cutaneous melanoma
2025-Sep-07, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.147504
PMID:40925436
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研究论文 | 本研究通过单细胞和空间转录组学技术揭示了二氢硫辛酸琥珀酰转移酶通过血管途径促进皮肤黑色素瘤侵袭的新机制 | 首次发现DLST通过调控组蛋白去甲基化酶KDM4C活性，影响H3K9和H3K27去甲基化，从而促进黑色素瘤进展 | DLST与KDM4C相互作用的具体分子机制仍需进一步验证 | 探究DLST在黑色素瘤进展中的作用机制及其临床意义 | 皮肤黑色素瘤患者样本和黑色素瘤细胞 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序,空间转录组学,生物信息学分析,siRNA沉默,免疫共沉淀,免疫荧光 | NA | 单细胞转录组数据,空间转录组数据,蛋白质相互作用数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 1504 | 2025-10-05 |
DNA methylation subtypes dictate metastatic heterogeneity of osteosarcoma via distinct tumor-stromal interactions: Multi-omics profiling and decitabine validation
2025-Sep-05, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.147473
PMID:40915448
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研究论文 | 通过整合DNA甲基化分析和单细胞RNA测序，揭示骨肉瘤转移异质性的表观遗传机制 | 首次发现DNA甲基化亚型通过不同的肿瘤-基质相互作用决定骨肉瘤转移异质性，并验证了地西他滨的治疗潜力 | NA | 阐明骨肉瘤转移异质性的表观遗传驱动机制 | 骨肉瘤细胞和肿瘤微环境中的基质细胞 | 表观遗传学 | 骨肉瘤 | DNA甲基化分析, 单细胞RNA测序, 加权基因共表达网络分析, 假时间轨迹分析 | NA | 甲基化数据, 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 批量DNA甲基化分析 | NA | NA |
| 1505 | 2025-10-05 |
FmH2ST: foundation model-based spatial transcriptomics generation from histological images
2025-Sep-05, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf865
PMID:40923764
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研究论文 | 提出基于基础模型的FmH2ST方法，从组织学图像预测空间基因表达 | 采用预训练基础模型和双分支框架，结合多级特征提取和双图策略解决切片间异质性和切片内复杂性 | NA | 从组织学图像预测空间转录组数据 | 组织学图像和空间转录组数据 | 空间转录组学 | 癌症 | 空间转录组学 | 基础模型, Transformer, 图神经网络, 多尺度卷积 | 图像, 基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1506 | 2025-10-05 |
Persistent and progressive acute lung allograft dysfunction is linked to cell compositional and transcriptional changes in small airways
2025-Sep, The Journal of heart and lung transplantation : the official publication of the International Society for Heart Transplantation
DOI:10.1016/j.healun.2025.03.010
PMID:40293382
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析急性肺移植物功能障碍患者小气道的细胞组成和转录变化 | 首次将急性肺移植物功能障碍的临床进展与单细胞水平的细胞组成和转录变化相关联 | 样本量较小（总样本20例），属于初步研究 | 识别急性肺移植物功能障碍进展为慢性肺移植物功能障碍的分子标志物 | 肺移植受者的小气道细胞 | 单细胞测序分析 | 肺移植相关并发症 | 单细胞RNA测序 | PERMANOVA统计模型 | 单细胞转录组数据 | 20例肺移植受者（8例对照组，4例恢复组，5例持续组，3例进展组） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1507 | 2025-10-05 |
Global transcriptome characterization of peripheral blood mononuclear cells in individuals with chronic HIV infection
2025-Sep, Genomics
IF:3.4Q2
DOI:10.1016/j.ygeno.2025.111082
PMID:40639496
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析HIV感染者外周血单个核细胞的免疫代谢特征 | 首次在HIV感染不同临床进展群体中系统比较PBMCs的代谢谱差异，发现免疫无应答者存在显著的代谢紊乱 | 样本量较小（仅18例），且为横断面研究无法确定因果关系 | 探究不同HIV感染群体外周血单个核细胞的免疫代谢差异 | HIV感染者的外周血单个核细胞，包括免疫应答者、免疫无应答者、典型进展者和精英控制者 | 单细胞组学 | HIV感染/艾滋病 | RNA-seq，单细胞测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 18例HIV感染者（4例IRs，5例INRs，5例TPs，4例ECs） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1508 | 2025-10-05 |
Pericytes change function depending on glioblastoma vicinity: emphasis on immune regulation
2025-Sep, Molecular oncology
IF:5.0Q1
DOI:10.1002/1878-0261.70095
PMID:40674254
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了胶质母细胞瘤微环境中壁细胞的空间异质性及其免疫调节功能 | 首次发现壁细胞在肿瘤内部和边界区域具有不同的转录组特征和免疫调节功能 | 研究样本量有限，需要进一步验证功能机制 | 探究胶质母细胞瘤微环境中壁细胞的空间异质性及其免疫调节作用 | 小鼠和人类胶质母细胞瘤样本中的壁细胞（包括周细胞和平滑肌细胞） | 单细胞测序分析 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠和人类胶质母细胞瘤样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1509 | 2025-10-05 |
Exploring the mechanism of action of trastuzumab-induced cardiomyocyte atrophy based on the FN1/PI3K/AKT-mediated mTOR-independent signaling pathway
2025-Sep, Genomics
IF:3.4Q2
DOI:10.1016/j.ygeno.2025.111087
PMID:40683573
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序和生物信息学方法探索了曲妥珠单抗通过FN1/PI3K/AKT介导的mTOR非依赖性信号通路诱导心肌细胞萎缩的机制 | 首次发现免疫细胞来源的FN1通过细胞外基质机制激活PI3K/AKT介导的mTOR非依赖性信号通路在曲妥珠单抗诱导的心肌毒性中的作用 | NA | 研究曲妥珠单抗诱导心肌毒性的潜在靶点和信号通路 | 心肌细胞和免疫细胞 | 生物信息学 | 乳腺癌相关心肌病 | 单细胞转录组测序,生物信息学分析,Western blot,RT-PCR,免疫荧光,透射电镜 | NA | 单细胞转录组数据,蛋白质表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1510 | 2025-10-05 |
Oxidative Stress Links Thyroid Autoimmunity to Cancer: Peroxiredoxin 2 Protection via Genomic and Single-Cell Insights
2025-Sep, Cancer biotherapy & radiopharmaceuticals
DOI:10.1177/10849785251360744
PMID:40735789
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研究论文 | 本研究通过整合多组学方法揭示了桥本甲状腺炎与甲状腺癌之间的共享遗传因素，发现PRDX2是关键保护因子 | 首次结合孟德尔随机化分析、单细胞RNA测序和机器学习分类模型，系统揭示PRDX2在甲状腺自身免疫和癌症中的保护作用机制 | 样本来源相对有限，主要基于FinnGen数据库和单细胞测序数据，需要更多独立队列验证 | 探索桥本甲状腺炎与甲状腺癌之间的遗传联系和分子机制 | 甲状腺细胞和甲状腺疾病患者 | 生物信息学 | 甲状腺癌 | 单细胞RNA测序, 孟德尔随机化分析, 机器学习 | 机器学习分类模型 | 基因组数据, 单细胞转录组数据 | 76,243个甲状腺细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1511 | 2025-10-05 |
Correction to 'Immunopipe: a comprehensive and flexible scRNA-seq and scTCR-seq data analysis pipeline'
2025-Sep, NAR genomics and bioinformatics
IF:4.0Q1
DOI:10.1093/nargab/lqaf126
PMID:40918070
|
更正 | 对先前发表的Immunopipe单细胞数据分析流程文章进行更正 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1512 | 2025-10-05 |
Single-cell Raman and mass spectrometry analysis to probe cellular heterogeneity in tamoxifen uptake and metabolism
2025-Sep, Analytical and bioanalytical chemistry
IF:3.8Q1
DOI:10.1007/s00216-025-06058-w
PMID:40810750
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研究论文 | 本研究结合单细胞拉曼光谱和质谱技术探究他莫昔芬在肝癌细胞中的摄取、代谢异质性 | 首次将单细胞拉曼光谱与质谱技术整合，实现细胞状态与药物代谢的同时评估，并采用三种药物浓度进行系统性分析 | 样本量较小且仅使用单一细胞系，缺乏更广泛的生物学验证 | 探究药物在单细胞水平的摄取、代谢异质性及其对细胞的影响 | HepG2肝癌细胞系 | 单细胞分析 | 肝癌 | 单细胞拉曼光谱, 单细胞质谱 | NA | 光谱数据, 质谱数据 | HepG2肝癌细胞系（具体数量未明确） | NA | 单细胞拉曼光谱, 单细胞质谱 | NA | 拉曼-质谱联合分析平台 |
| 1513 | 2025-10-05 |
The role of APOBEC mutagenesis in the progression and therapeutic guidance of pancreatic cancer
2025-Sep, Genomics
IF:3.4Q2
DOI:10.1016/j.ygeno.2025.111098
PMID:40812519
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研究论文 | 本研究系统分析了APOBEC突变在胰腺癌中的生物学特征和临床意义 | 首次全面揭示APOBEC突变在胰腺癌中的分布特征、微环境改变和临床相关性，并开发了基于机器学习的预后预测模型 | 对APOBEC突变的具体分子机制仍需进一步深入研究 | 探究APOBEC突变在胰腺癌进展和治疗指导中的作用 | 胰腺腺癌(PAAD)患者 | 生物信息学 | 胰腺癌 | 全外显子测序,靶向二代测序,转录组分析,单细胞RNA测序,免疫分析 | 机器学习模型 | 基因组数据,转录组数据,临床数据 | 多个PAAD队列 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 1514 | 2025-10-05 |
Role of immune cell subsets in liver fibrosis through single-cell RNA sequencing and array
2025-Sep, Cancer biomarkers : section A of Disease markers
IF:2.2Q3
DOI:10.1177/18758592251374861
PMID:40938627
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序和数据分析揭示免疫细胞亚群在肝纤维化中的作用 | 首次建立肝纤维化免疫细胞图谱，识别24个不同免疫细胞亚群，发现与不良预后相关的特征基因和细胞间相互作用 | 数据主要来源于公共数据库，缺乏实验验证 | 研究免疫细胞亚群在肝纤维化发病机制中的作用 | 肝纤维化患者 | 生物信息学 | 肝纤维化 | 单细胞RNA测序, ssGSEA, Kaplan-Meier分析 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1515 | 2025-10-05 |
spammR: an R package designed for analysis and integration of spatial multi-omic measurements
2025-Aug-28, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.08.26.672472
PMID:40909542
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研究论文 | 开发了一个用于空间多组学数据分析和整合的R软件包 | 专门针对质谱衍生的空间组学数据集设计，能够处理小样本量、空间稀疏性、大量缺失值且无需先验知识的完全数据驱动分析 | 主要针对质谱平台数据，对其他空间组学技术的适用性可能有限 | 开发空间多组学测量数据的分析和整合工具 | 空间多组学测量数据，特别是质谱衍生的空间组学数据 | 生物信息学 | NA | 质谱分析，空间多组学技术 | NA | 空间多组学数据，质谱数据 | 小样本量数据集 | NA | 空间多组学，质谱分析 | NA | NA |
| 1516 | 2025-10-05 |
Expanding canonical cortical cell type markers in the era of single-cell transcriptomics
2025-Aug-26, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.08.26.672469
PMID:40909566
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研究论文 | 本研究通过分析近50万个单细胞核转录组数据，扩展了大脑皮层细胞类型的经典标记物，并开发了评估标记物表达保真度的统计框架 | 开发了评估细胞标记物表达保真度的统计框架，首次系统量化了标记物在目标细胞类型中的表达保真度和背景表达，并识别出具有改进保真度的新标记物 | 研究主要基于已有研究的单细胞数据，可能受到原始数据质量和注释准确性的限制 | 扩展和优化大脑皮层细胞类型的标记物，提高单细胞转录组数据中细胞类型注释的准确性 | 人类大脑皮层细胞类型 | 单细胞转录组学 | 神经系统疾病 | 单细胞RNA测序 | 统计框架 | 单细胞转录组数据 | 近500,000个高质量单细胞核转录组图谱，来自19项研究 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1517 | 2025-10-05 |
Construction and differential analysis of testicular atlas between 10-week-old and 23-week-old ducks using single-cell RNA sequencing
2025-Aug-22, Poultry science
IF:3.8Q1
DOI:10.1016/j.psj.2025.105715
PMID:40884870
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序构建了10周龄和23周龄鸭睾丸细胞图谱并进行差异分析 | 首次建立了禽类精子发生的高分辨率细胞图谱，发现了新的分子标记物和调控网络 | 研究仅针对两个发育阶段，缺乏更连续的时间序列分析 | 探索鸭睾丸发育过程中的分子调控机制 | 10周龄和23周龄鸭睾丸细胞 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 54,702个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1518 | 2025-10-05 |
Immune dysregulation in the prostates of C57BL/6Aire-/- mice mirrors that seen in human benign prostatic hyperplasia
2025-Aug-15, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.08.12.669857
PMID:40832162
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研究论文 | 本研究通过建立C57BL/6 Aire-/-小鼠慢性前列腺炎症模型，揭示了其免疫失调特征与人类良性前列腺增生相似 | 首次在C57BL/6背景小鼠中建立转录因子缺陷型非消退性慢性炎症模型，并证明其免疫特征与人类BPH高度相似 | 研究仅使用小鼠模型，需要进一步验证在人类中的适用性；样本采集时间点有限（仅21天和35天） | 研究前列腺慢性炎症在良性前列腺增生发病机制中的作用 | C57BL/6 Aire-/-小鼠前列腺组织和人类良性前列腺增生组织 | 单细胞生物学 | 前列腺疾病 | 单细胞RNA测序，流式细胞术，组织学分析 | 动物疾病模型 | 单细胞转录组数据，组织图像数据 | C57BL/6小鼠前列腺组织（21天和35天时间点），人类BPH scRNA-seq数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1519 | 2025-10-05 |
Single-Cell Transcriptome and RNA Sequencing Reveal Immune-Related Markers of Preeclampsia
2025-Aug, Reproductive sciences (Thousand Oaks, Calif.)
DOI:10.1007/s43032-025-01843-5
PMID:40216654
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研究论文 | 通过单细胞转录组和RNA测序技术研究子痫前期胎盘免疫微环境中的关键靶基因 | 首次结合单细胞测序和RNA测序技术系统分析子痫前期胎盘免疫微环境，发现巨噬细胞在疾病中的关键作用及其调控基因 | 研究样本量未明确说明，仅基于两个转录组数据集进行验证 | 探索子痫前期胎盘免疫微环境中的关键调控基因 | 子痫前期和非子痫前期胎盘样本 | 单细胞生物学 | 子痫前期 | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | Scenic包, 伪时序分析, 细胞间通讯分析 | 单细胞转录组数据, bulk RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, RNA测序 | NA | NA |
| 1520 | 2025-10-05 |
Single-cell transcriptomics reveal alveolar macrophages-specific responses in single-hit ozone exposure model in mice
2025-Jul-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.07.11.664370
PMID:40791434
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析臭氧暴露小鼠模型中肺泡巨噬细胞的转录组变化 | 首次在单细胞分辨率下揭示不同浓度臭氧暴露对肺泡巨噬细胞转录组的浓度依赖性影响 | 研究仅使用C57BL/6J雄性成年小鼠，样本多样性有限 | 探究肺泡巨噬细胞对臭氧暴露的分子响应机制 | C57BL/6J雄性成年小鼠的肺泡巨噬细胞 | 单细胞转录组学 | 呼吸系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | C57BL/6J雄性成年小鼠，分为过滤空气组、1 ppm臭氧组和1.5 ppm臭氧组 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |