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当前共找到 34772 篇文献，本页显示第 1501 - 1520 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1501 | 2025-12-12 |
Integrating Graph Convolutional Networks for Missing Gene Expression Imputation
2025 Nov-Dec, IEEE transactions on computational biology and bioinformatics
DOI:10.1109/TCBBIO.2025.3605719
PMID:40892650
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研究论文 | 本文提出了一种名为GCNgene的新方法，通过整合空间转录组学和单细胞RNA测序数据，预测未检测RNA转录本的空间分布 | 利用图卷积网络嵌入空间转录组学数据，并结合参考单细胞数据与计算出的细胞类型比例来重建基因表达，实现基因表达水平的准确预测 | NA | 预测基因的空间分布，以解决空间转录组技术中基因通量不足的问题 | 空间转录组学和单细胞RNA测序数据集 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | 图卷积网络 | 基因表达数据，空间信息数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq，空间转录组学 | NA | NA |
| 1502 | 2025-12-12 |
Knowledge-Guided Gene Panel Selection for Label-Free Single-Cell RNA-Seq Data: A Reinforcement Learning Perspective
2025 Nov-Dec, IEEE transactions on computational biology and bioinformatics
DOI:10.1109/TCBBIO.2025.3609721
PMID:40953430
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研究论文 | 本文提出了一种结合集成知识与强化学习的基因面板选择方法，用于无标记单细胞RNA测序数据 | 通过集成现有基因选择算法建立先验知识引导初始搜索空间，并引入基于专家行为的强化学习奖励函数进行动态优化，减少了传统方法的偏差 | 未明确说明方法在特定疾病类型或大规模数据集上的泛化能力 | 提高无标记单细胞RNA测序数据中基因面板选择的准确性和效率 | 单细胞RNA测序数据中的基因表达特征 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 强化学习 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1503 | 2025-12-12 |
scTECTA: Asymmetric Deep Transfer Learning for Cross-Patient Tumor Microenvironment Single-Cell Annotation
2025 Nov-Dec, IEEE transactions on computational biology and bioinformatics
DOI:10.1109/TCBBIO.2025.3618727
PMID:41056164
|
研究论文 | 本文提出了一种名为scTECTA的基于图神经网络的方法，用于跨患者肿瘤微环境单细胞注释，通过迁移学习解决数据稀疏性和批次效应问题 | scTECTA采用非对称神经网络架构和领域对抗学习框架，结合图卷积网络进行分布偏移校正，显著提升了细胞类型分类的精度和鲁棒性 | NA | 开发一种高效的跨患者肿瘤微环境单细胞注释方法，以克服现有方法在数据稀疏性、生物异质性和批次效应方面的限制 | 肿瘤微环境中的单细胞RNA测序数据，涉及六种癌症类型和34名患者 | 机器学习 | 肺癌, 前列腺癌, 心血管疾病, 老年病 | 单细胞RNA测序 | 图神经网络, 图卷积网络 | 单细胞RNA测序数据 | 34名患者的多个数据集，涵盖六种癌症类型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1504 | 2025-12-12 |
scMID: A Deep Multi-Omics Integration Framework for Comprehensive Single-Cell Data Analysis
2025 Nov-Dec, IEEE transactions on computational biology and bioinformatics
DOI:10.1109/TCBBIO.2025.3624040
PMID:41124064
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研究论文 | 本文提出了一种基于单细胞多组学数据整合和dropout模式的深度多组学集成框架（scMID），用于全面的单细胞数据分析 | 利用组学独立的深度自编码器进行多组学数据对齐，采用GCN算法进行数据整合，并结合二值化dropout模式获得的基因相似性计算基因重要性，提出双策略特征基因筛选方法 | 未在摘要中明确说明 | 提高单细胞聚类分析的准确性，突破传统特征选择方法的限制，为解码复杂生物信息提供更优的分析框架 | 单细胞多组学数据 | 机器学习 | NA | 单细胞多组学测序 | 深度自编码器, GCN | 多组学数据（转录组学、表观基因组学、蛋白质组学） | NA | NA | 单细胞多组学 | NA | NA |
| 1505 | 2025-12-12 |
Single-cell RNA-seq using UltraMarathonRT expands the known transcriptome
2025-Oct-06, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.10.06.680646
PMID:41278799
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研究论文 | 本研究首次将II型内含子逆转录酶UltraMarathonRT应用于单细胞RNA测序，揭示了传统方法无法捕获的转录组特征 | 首次在单细胞RNA测序中使用II型内含子逆转录酶uMRT，相比传统鼠白血病病毒来源的逆转录酶，能够捕获更多基因和基因组特征 | NA | 开发新型逆转录酶技术以提升单细胞转录组测序的覆盖度和准确性 | 单细胞转录组 | 单细胞测序技术 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、代谢RNA标记、核苷转换 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1506 | 2025-12-12 |
Streamlining single-cell spatial transcriptomics for human kidney tissue
2025 Sep-Oct, BioTechniques
IF:2.2Q4
DOI:10.1080/07366205.2025.2591484
PMID:41324332
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研究论文 | 本文介绍了一种新的细胞区域归一化方法和流程，用于从NanoString CosMx单细胞空间转录组平台数据中注释15种肾脏细胞类型，并比较健康与疾病样本 | 开发了一种新颖的细胞区域归一化方法，提高了空间转录组数据分析的敏感性，并将流程集成到BioTuring SpatialX平台，使无生物信息学背景的用户也能进行空间数据分析 | 未明确说明样本量是否足够大以代表更广泛的疾病群体，且可能依赖于特定平台（CosMx）的数据 | 简化单细胞空间转录组学分析流程，以促进人类肾脏组织的研究和疾病比较 | 人类肾脏组织样本，包括两个健康肾脏活检和两个疾病样本（糖尿病肾病） | 数字病理学 | 糖尿病肾病 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | 4个样本（2个健康肾脏活检，2个疾病样本） | NanoString | 单细胞空间转录组学 | CosMx | NanoString CosMx单细胞分辨率空间转录组平台 |
| 1507 | 2025-12-12 |
Cancer-associated fibroblast-derived fibulin-5 promotes radioresistance in non-small-cell lung cancer
2025-Aug-26, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.116018
PMID:40711881
|
研究论文 | 本研究揭示了癌症相关成纤维细胞（CAFs）通过分泌Fibulin-5促进非小细胞肺癌放疗抵抗的机制 | 首次发现CAFs来源的Fibulin-5通过整合素αVβ5受体激活Src-STAT3通路，下调ACSL4，抑制辐射诱导的铁死亡，从而介导放疗抵抗 | NA | 鉴定预测放疗疗效的CAFs表达分子并阐明非小细胞肺癌的放疗抵抗机制 | 非小细胞肺癌 | 数字病理学 | 肺癌 | 空间转录组学，单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学，单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1508 | 2025-12-12 |
Super-resolution imaging informed scRNA sequencing analysis reveals the critical role of GDF15 in rejuvenating aged hematopoietic stem cells
2025-Jun, Blood science (Baltimore, Md.)
DOI:10.1097/BS9.0000000000000236
PMID:40416726
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研究论文 | 本研究通过结合超分辨率成像与单细胞RNA测序，揭示了GDF15在调控衰老造血干细胞线粒体形态与功能中的关键作用 | 首次将活细胞超分辨率显微镜与单细胞RNA测序技术整合，建立了线粒体形态与分子特征之间的直接关联，并发现了GDF15在衰老造血干细胞中线粒体信号传导的新功能 | 研究样本量相对较小（约200个细胞），且仅限于小鼠模型，尚未在人类样本中验证 | 探究衰老造血干细胞中线粒体形态变化的分子机制及其对细胞命运的影响 | 年轻与衰老小鼠的造血干细胞 | 单细胞组学 | 衰老相关疾病 | 单细胞RNA测序, 超分辨率显微镜 | 生物信息学分析流程 | 图像数据, 基因表达数据 | 约200个来自年轻和衰老小鼠的造血干细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1509 | 2025-12-12 |
STAT3 signaling enhances tissue expansion during postimplantation mouse development
2025-Apr-22, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.115506
PMID:40188437
|
研究论文 | 本研究探讨了STAT3信号在小鼠胚胎植入后发育过程中对组织扩张的增强作用 | 揭示了STAT3在胚胎发育时间控制中的新角色，特别是在需要快速细胞分裂的组织中，如植入后外胚层和造血谱系 | 研究主要基于小鼠模型，人类相关性仅通过STAT3突变与身材矮小的关联间接暗示 | 探究STAT3信号在胚胎植入后发育过程中的功能 | 小鼠胚胎、Stat3敲除胚胎干细胞、野生型细胞 | 发育生物学 | NA | RNA测序、单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 小鼠外胚层组织、Stat3敲除胚胎干细胞 | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 1510 | 2025-12-12 |
Heterogeneity of tertiary lymphoid structures predicts the response to neoadjuvant therapy and immune microenvironment characteristics in triple-negative breast cancer
2025-Feb, British journal of cancer
IF:6.4Q1
DOI:10.1038/s41416-024-02917-y
PMID:39658606
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序、多重免疫荧光染色和影像组学技术，评估了三阴性乳腺癌患者新辅助治疗前后三级淋巴结构的异质性及其与肿瘤微环境和治疗反应的关系 | 首次系统评估了三阴性乳腺癌中三级淋巴结构的异质性，并开发了基于影像的生物标志物评分系统来预测其状态和新辅助治疗效果 | 未明确说明样本量大小，且研究可能受限于单中心数据 | 探究三级淋巴结构在三阴性乳腺癌新辅助治疗中的免疫调节作用及其预测价值 | 三阴性乳腺癌患者样本 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序, 多重免疫荧光染色, 影像组学 | NA | RNA序列数据, 图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1511 | 2025-12-12 |
Deciphering the Complexities of Pulmonary Hypertension: The Emergent Role of Single-Cell Omics
2025-Jan, American journal of respiratory cell and molecular biology
IF:5.9Q1
DOI:10.1165/rcmb.2024-0145PS
PMID:39141563
|
综述 | 本文综述了单细胞组学技术在肺动脉高压研究中的应用，探讨了其如何推动对该疾病复杂性的理解 | 强调了单细胞转录组学在揭示肺动脉高压中细胞生态系统、识别新型治疗靶点以及通过连接组分析阐明细胞相互作用方面的创新作用 | 面临单细胞RNA测序分辨率需提升、人体组织样本处理存在物流障碍以及需要整合多种组学方法以全面理解疾病分子基础的挑战 | 探讨单细胞组学技术在肺动脉高压研究中的角色，以促进精准医疗目标的实现 | 肺动脉高压中的细胞类型，包括内皮细胞、平滑肌细胞、周细胞和免疫细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1512 | 2025-12-12 |
Scalable spatial single-cell transcriptomics and translatomics in 3D thick tissue blocks
2024-Aug-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.08.05.606553
PMID:39149316
|
研究论文 | 本文开发了Deep-STARmap和Deep-RIBOmap技术，用于在200微米厚的组织块中进行三维空间单细胞转录组和翻译组量化 | 首次实现了在厚组织块（200微米）中进行三维空间单细胞转录组和翻译组分析，突破了现有技术仅限于薄切片（5-20微米）的限制 | NA | 揭示基因在三维组织环境中如何塑造组织结构和功能，以理解健康与疾病状态 | 小鼠大脑组织、人类皮肤癌组织 | 数字病理学 | 皮肤癌 | 空间单细胞转录组学、空间单细胞翻译组学、多色荧光蛋白成像 | NA | 图像、转录组数据、翻译组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq、空间转录组学 | NA | NA |
| 1513 | 2025-12-12 |
Cytotoxic CD4+ tissue-resident memory T cells are associated with asthma severity
2023-12-08, Med (New York, N.Y.)
DOI:10.1016/j.medj.2023.09.003
PMID:37865091
|
研究论文 | 本文通过单细胞转录组分析，揭示了严重哮喘患者气道中CD4+组织驻留记忆T细胞的异质性及其与疾病严重性的关联 | 首次在严重哮喘患者气道中发现CD103+ CD4+ TRM细胞显著增加，并揭示其具有细胞毒性和促炎非TH2细胞因子表达特征 | 样本量相对较小（30例患者），且未明确这些TRM细胞的具体功能机制或治疗靶点 | 探究严重哮喘中除TH2细胞外的其他CD4+ T细胞亚群在气道炎症和重塑中的作用 | 从30名轻度和严重哮喘患者的支气管肺泡灌洗样本中分离的CD4+ T细胞 | 单细胞转录组学 | 哮喘 | 单细胞RNA-seq | NA | 单细胞转录组数据 | 30例患者（轻度和严重哮喘），超过50,000个气道CD4+ T细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1514 | 2025-12-12 |
Decreased oxidative stress response and oxidant detoxification of skin during aging
2023-12, Mechanisms of ageing and development
IF:5.3Q1
DOI:10.1016/j.mad.2023.111878
PMID:37827221
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序和微阵列转录组数据，探讨了皮肤细胞在衰老过程中氧化应激反应和氧化剂解毒能力的变化，并筛选出可能调控皮肤衰老的关键氧化应激相关基因 | 首次在单细胞水平上系统比较了年轻与老年皮肤中不同类型细胞的氧化应激反应和解毒能力差异，并识别出ANXA1和APOE作为潜在的关键调控基因 | 研究主要基于转录组数据分析，缺乏蛋白质水平和功能实验验证；样本量可能有限；未考虑环境因素（如紫外线）的交互影响 | 阐明皮肤衰老过程中氧化应激反应和氧化剂解毒能力的变化机制，识别关键调控基因 | 人类皮肤细胞（包括角质形成细胞、黑色素细胞、血管内皮细胞、成纤维细胞、淋巴管内皮细胞和免疫细胞） | 单细胞组学 | 皮肤衰老 | 单细胞RNA测序, 微阵列转录组分析 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 1515 | 2025-12-12 |
Single-cell mapping reveals several immune subsets associated with liver metastasis of pancreatic ductal adenocarcinoma
2023-10-13, Med (New York, N.Y.)
DOI:10.1016/j.medj.2023.07.010
PMID:37633269
|
研究论文 | 本研究通过单细胞质谱流式技术绘制了胰腺导管腺癌（PDAC）的免疫图谱，揭示了与肝转移相关的特定免疫细胞亚群 | 首次在PDAC中结合多部位（原发灶、血液、淋巴结）样本进行高维单细胞分析，并识别出与肝转移潜能相关的CD103+PD-1+CD39+ T细胞减少和CD73+巨噬细胞增加的免疫特征 | 样本量相对较小（26个样本来自11名患者），且为观察性研究，需要更大队列验证 | 探究晚期PDAC肿瘤微环境中与转移相关的免疫细胞动态变化，以寻找免疫治疗新策略 | 胰腺导管腺癌（PDAC）患者的不同阶段组织样本（原发肿瘤、血液、淋巴结） | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞质谱流式技术（CyTOF）、单细胞RNA测序（scRNA-seq）、多重荧光免疫组化 | NA | 单细胞蛋白质表达数据、单细胞转录组数据、组织图像数据 | 26个样本（11个原发肿瘤组织、10个血液样本、5个淋巴结样本），来自11名PDAC患者 | NA | 单细胞蛋白质组学、单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1516 | 2025-12-12 |
Single-cell transcriptomics reveal a hyperacute cytokine and immune checkpoint axis after cardiac arrest in patients with poor neurological outcome
2023-07-14, Med (New York, N.Y.)
DOI:10.1016/j.medj.2023.05.003
PMID:37257452
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学揭示了心脏骤停后神经系统预后不良患者中存在的超急性细胞因子和免疫检查点轴 | 首次在单细胞分辨率下定义了临床心脏骤停诱导的先天免疫网络，并识别了与不良预后相关的Nectin-2+单核细胞和Tim-3+自然杀伤细胞亚群 | 研究样本量未明确说明，且结论主要基于观察性数据，需要进一步实验验证 | 探究心脏骤停后系统性炎症反应与神经系统损伤之间的关联 | 心脏骤停住院患者 | 单细胞组学 | 心血管疾病 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1517 | 2025-12-11 |
ESR1 Expression Negatively Correlates with Immune Cell Infiltration and Response to Immune Checkpoint Inhibitors in Estrogen Receptor-Positive/HER2-Negative Breast Cancer
2026-Jan, Annals of surgical oncology
IF:3.4Q1
DOI:10.1245/s10434-025-18260-2
PMID:40956534
|
研究论文 | 本研究探讨了ESR1基因表达与雌激素受体阳性/HER2阴性乳腺癌中免疫细胞浸润及免疫检查点抑制剂反应的关系 | 首次在单细胞水平揭示ESR1表达与免疫检查点抑制剂反应的负相关关系，并证明ESR1的预测性能优于PDL1 | 研究基于回顾性队列分析，需要前瞻性临床试验验证ESR1作为生物标志物的临床实用性 | 评估ESR1作为ER+/HER2-乳腺癌免疫检查点抑制剂反应的预测生物标志物 | 雌激素受体阳性/HER2阴性乳腺癌患者 | 癌症免疫学 | 乳腺癌 | RNA测序，单细胞RNA测序，免疫组织化学 | NA | 转录组数据，单细胞转录组数据 | 多个乳腺癌队列（具体数量未在摘要中说明） | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 1518 | 2025-12-11 |
Harnessing Machine Learning and Multiomics to Construct a Tumor-Specific T Cell Signature for Prognostic Assessment and Precision Medicine in Lung Adenocarcinoma
2026-Jan, Annals of surgical oncology
IF:3.4Q1
DOI:10.1245/s10434-025-18330-5
PMID:40976828
|
研究论文 | 本研究利用机器学习和多组学数据构建了一个肿瘤特异性T细胞特征，用于肺腺癌的预后评估和精准医疗 | 结合单细胞RNA测序和空间转录组学，开发了一个新的T细胞相关基因预后指标（TRGPI），并识别出TPI1作为关键预后基因 | 研究基于公开数据库的回顾性数据，需要进一步的前瞻性验证 | 开发肺腺癌的预后评估工具并预测免疫治疗反应 | 肺腺癌患者 | 机器学习 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 加权基因共表达网络分析 | RSF + Ridge模型 | 转录组数据, 临床数据 | 来自TCGA和GEO数据库的多个队列 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1519 | 2025-12-11 |
Inhibition the MAP3K20-mediated ribotoxic stress response pathway downregulates M1 macrophage polarization in ulcerative colitis
2026-Jan-01, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2025.115759
PMID:41192115
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研究论文 | 本研究通过多模态分析方法，揭示了MAP3K20介导的核糖毒性应激反应通路在溃疡性结肠炎中驱动M1巨噬细胞极化的关键作用，并验证了其抑制剂Vemurafenib的治疗潜力 | 首次将MAP3K20鉴定为协调核糖毒性应激反应介导的M1巨噬细胞极化的关键激酶，并证实其抑制剂在溃疡性结肠炎模型中的治疗作用 | 研究主要基于动物模型和计算分析，尚未在人类临床试验中验证Vemurafenib的治疗效果 | 探究核糖毒性应激反应通路在溃疡性结肠炎中驱动M1巨噬细胞极化的机制，并寻找潜在治疗靶点 | 溃疡性结肠炎患者的肠道组织、DSS诱导的溃疡性结肠炎动物模型 | 生物信息学与单细胞组学 | 溃疡性结肠炎 | 单细胞RNA测序、基因集变异分析、加权基因共表达网络分析 | NA | 基因表达数据、单细胞转录组数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1520 | 2025-12-11 |
HMOX1 expression influence the role of macrophage in EGFR-TKI resistance of lung adenocarcinoma
2026-Jan-01, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2025.115795
PMID:41205382
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析，探讨了HMOX1表达如何影响巨噬细胞在肺腺癌EGFR-TKI耐药中的作用 | 首次利用单细胞RNA测序技术，揭示了EGFR-TKI耐药肿瘤中HMOX1巨噬细胞的富集及其通过SPP1和FN1信号与肿瘤细胞的广泛通讯，为理解肿瘤微环境中非肿瘤细胞在耐药机制中的角色提供了新视角 | 样本量相对较小（12名患者），且研究主要基于观察性数据，未进行深入的体内或体外功能验证实验 | 研究肺腺癌中EGFR-TKI耐药的机制，特别是肿瘤微环境中巨噬细胞的作用 | 肺腺癌患者肿瘤组织中的细胞，包括肿瘤细胞和免疫细胞 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 12名肺腺癌患者的7458个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |